鼠疫耶尔森氏菌Pla蛋白单克隆抗体的制备与鉴定

目的:利用原核表达的鼠疫耶尔森氏菌Pla蛋白(rPla),通过杂交瘤细胞技术制备单克隆抗体(mAb),为相关研究工作奠定基础.方法:大肠杆菌表达的Pla蛋白,包涵体经尿素反复洗涤纯化后免疫BALB/c小鼠,取血清抗体效价高的小鼠脾细胞与Sp2/0骨髓瘤细胞进行细胞融合,以表达Pla、表达GST、天然提取Pla 3种蛋白为抗原物,采用间接ELISA法筛选阳性杂交瘤细胞,并结合Western blot对所获取mAb的特异性进行鉴定.结果:经间接ELISA筛选,获得3株能稳定分泌抗天然Pla蛋白mAb的杂交瘤细胞株,命名为15B8、14H4、19A4,亚类测定分别为IgG2a和IgG1,轻链均为κ链;腹水经间接ELISA法检测效价可达1:106:Western blot实验证实该3株mAb能特异性识别天然Pla蛋白.结论:成功获得了抗鼠疫耶尔森氏菌天然Pla抗原的特异性mAb,为进一步研究Pla蛋白及研发诊断试剂奠定了基础.     

PCR指纹图技术筛选鼠疫耶尔森菌种特异性探针的研究

目的 利用PCR指纹图技术筛选细菌种特异性探针，探索利用PCR指纹图技术实现病原菌通用检测的可能性。方法 以鼠疫耶尔森菌为实验对象，利用REP－1和REP－2引物对在非严谨的条件下进行PCR指纹图扩增；将所有扩增片段纯化后，克隆至pGEM-T载体，转化大肠杆菌JM109；用生物素化的载体引物扩增克隆化片段，进行末端标记；在硝酸纤维素膜上固定鼠疫杆菌的染色体DNA以及相应对照菌株的染色体DNA，以末端标记的扩增产物进行杂交，通过生物素－链霉亲和素－辣根过氧化物酶系统显色，判断扩增片段的特异性。结果 经杂交筛选，发现1个长度约为900bp的扩增具有较好的杂交特异性片段，将序列与鼠疫耶尔森菌已完成的基因组序列比较，仅发现4个核苷酸的差异；根据这段序列设计的引物对可以特异性地扩增鼠疫耶尔森菌的模板。结论 利用PCR指纹图技术成功筛选到一段鼠疫耶尔森菌的种特异性探针，为细菌通用检测技术的研究开辟了新的思路。     

Genotyping of strains of Yersinia pestis from Marmota baibacina-Spermophilus undulates Plague Focus of Tianshan Mountains in China

Themainreservoirsoftheplaguebaccilusare MarmotabaibacinaandCitellusundulatesin PlagueFocusofTianshanMountainsinChina.BotharepartofRodentiaSciuridae,butdonot belongtothesamegenus(MarmotaandSper mophilusrespectively).Themainvectorsare OropsyllasiantiewiandCallopsylladorablis.Threecounties,Wusu,JingheandNilekein NorthernTianshanMountainsareMarmotabaiba cina SpermophilusundulatesPlagueFocus.Five counties,Changji,HutubiandManasiinEasternTianshanMountainsandAheqiandAtushiin SouthernTia…     

鼠疫耶尔森菌F1抗原的纯化方法改进及其免疫原性的评价

目的 建立从减毒鼠疫菌培养物中提取天然F1抗原的方法,评价F1抗原对鼠疫的免疫保护效果.方法 通过用玻璃珠裂解菌体替代有机溶剂的方法,结合饱和硫酸铵沉淀和凝胶过滤的方法从鼠疫菌培养物中纯化出天然F1抗原.将F1抗原吸附到25%氢氧化铝佐剂中,肌肉注射免疫BALB/c小鼠,于初次免疫后第18周皮下攻毒104 CFU活鼠疫菌141强毒株.结果 一次免疫的两个剂量组之间产生的抗体滴度差异无统计学意义,而加强免疫的两个剂量组中,F1-40 μg剂量组产生的抗体滴度明显高于F1-20μg剂量组.F1抗原免疫的小鼠全部存活,而且健康状况良好,对照组小鼠全部死亡.结论 本研究提供了一种简单、有效和便于大规模提取F1抗原的方法.提取的F1抗原具有较高的免疫原性,可作为鼠疫亚单位疫苗的重要抗原组分用于鼠疫亚单位疫苗的研制.     

西藏地区鼠疫菌生物学特性的分析

目的：通过对西藏地区29个县（市），不同宿主分离的116株鼠疫菌生化，毒力，毒力因子，质粒及外膜蛋白的分析，了解该疫源地内鼠疫病原体间的群落关系及遗传变异的规律性。方法：各项检查均按常规方法进行。结果：目前该地区仅有岗底斯山型和青藏高原型两种生态型菌株，二者分别占据一定的地理区域，以念青唐古拉山脉为天然屏障，从藏北地区分离的菌株为青藏高原型，藏南地区及其西南部所分离的菌株均为岗底斯山型。结论：西藏地区是以喜玛拉雅旱獭为主要宿主的鼠疫自然疫源地，就其鼠疫菌生物学特性分析表明，藏北高原疫源地可能是青藏高原喜玛拉雅旱獭疫源地的延伸，而藏南谷地可能是由于有天然屏障的存在，形成了自己特定的地理环境，从而表现为相对独立的一块鼠疫自然疫源地。     

Real‐time multiplex PCR assay for detection of Yersinia pestis and Yersinia pseudotuberculosis

A multiplex real‐time polymerase chain reaction (PCR) assay was developed for the detection of Yersinia pestis and Yersinia pseudotuberculosis. The assay includes four primer pairs, two of which are specific for Y. pestis, one for Y. pestis and Y. pseudotuberculosis and one for bacteriophage λ; the latter was used as an internal amplification control. The Y. pestis‐specific target genes in the assay were ypo2088, a gene coding for a putative methyltransferase, and the pla gene coding for the plasminogen activator. In addition, the wzz gene was used as a target to specifically identify both Y. pestis and the closely related Y. pseudotuberculosis group. The primer and probe sets described for the different genes can be used either in single or in multiplex PCR assays because the individual probes were designed with different fluorochromes. The assays were found to be both sensitive and specific; the lower limit of the detection was 10–100 fg of extracted Y. pestis or Y. pseudotuberculosis total DNA. The sensitivity of the tetraplex assay was determined to be 1 cfu for the ypo2088 and pla probe labelled with FAM and JOE fluorescent dyes, respectively.     

准噶尔盆地鼠疫耶尔森菌的基因组型分析

目的 对我国新发现的准噶尔盆地大沙鼠鼠疫自然疫源地的鼠疫菌株进行基因组差异性区段的比较分析,确定该鼠疫疫源地鼠疫菌株的基因组类型.方法 按常规方法提取鼠疫菌染色体DNA,依据已证实的鼠疫菌22个差异性区段(DFR)设计引物,采用PCR技术检测鼠疫菌基因组差异性基因片段的构成.结果 准噶尔盆地鼠疫菌株的差异性区段结构类型为缺失DFRO1、04、06、07、10、13和DFR15～18,不同于其他鼠疫疫源地鼠疫菌株的结构类型.为我国新的鼠疫菌基因组型.结论 准噶尔盆地大沙鼠鼠疫疫源地鼠疫菌株的基因组结构类型为我国新的基因组类型.     

tPA信号肽和鼠疫杆菌保护性抗原V融合基因的构建及免疫效果鉴定

获得含有鼠疫杆菌V抗原编码基因以及tPA信号肽编码序列的重组质粒,并测定其诱导特异性免疫应答的能力。采用PCR扩增鼠疫菌杆菌V基因构建到pVAX1质粒中产生pVAX1/V重组质粒,PCR扩增tPA信号肽编码序列片段并将其插入到pVAX1/V中V基因的上游,构建tPA-pVAX1/V重组质粒;转染COS-7细胞,免疫细胞化学方法鉴定V蛋白的表达;二重组质粒分别加mGM-CSF质粒免疫BALB/c小鼠,观察免疫应答反应;以400个LD50强毒鼠疫杆菌皮下攻击免疫小鼠观察保护效率。结果显示,tPA-pVAX1/V在COS-7细胞中表达了V蛋白;免疫小鼠血清产生了特异性抗体和细胞免疫应答;攻毒保护率达80%。成功构建了分泌型V蛋白的真核表达质粒载体,具有诱导特异性细胞免疫和体液免疫应答的能力,对强毒鼠疫杆菌攻毒有一定的保护效力,为鼠疫杆菌新型疫苗研制奠定了基础。     

鼠疫耶尔森菌重组质粒pVAX1/Fl-V的构建及其免疫效果的研究

目的获得含有鼠疫F1和V抗原编码基因的重组真核表达质粒pVAX1／F1-V，并测定其诱导特异性免疫应答的能力。方法PCR扩增鼠疫菌Fl和V编码基因，分别与pGEM-T连接测序，构建pVAX1／F1-V融合重组质粒，转染Cos-7细胞，用Western blot方法鉴定目的蛋白的表达，重组质粒pVAXI／F1．V加GM．CSF佐剂免疫BALB／c小鼠，观察免疫效果，400个半数致死量（uk）强毒鼠疫菌皮下攻毒观察保护率。结果pVAX1／F1-V在Cos-7细胞中表达，免疫鼠体内产生特异性抗体，通过抗体亚型分析、细胞因子等指标的测定表明所构建DNA疫苗以诱发TH1型免疫为主，攻毒保护率达60％。结论成功构建F1-V融合蛋白真核表达载体，具有诱导特异性细胞免疫和体液免疫应答的能力，对强毒鼠疫菌皮下攻毒有一定的保护效力，为鼠疫菌新型疫苗研制奠定了基础。     

Characterisation of Yersinia pestis isolates from natural foci of plague in the Republic of Georgia, and their relationship to Y. pestis isolates from other countries

Forty Yersinia pestis isolates from endemic foci of plague in the Republic of Georgia, and six Y. pestis isolates from neighbouring former Soviet Union countries, were analysed for their biochemical and phenotypic properties, and their genetic relatedness was compared with Y. pestis strains KIM and CO92 by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). In addition, 11 Y. pestis isolates from the USA, together with published nucleotide sequences from Y. pestis strains KIM, CO92 and 91001, were compared with the 46 isolates in the present collection using multilocus sequence typing (MLST), based on sequence data for the 16S rRNA, hsp60, glnA, gyrB, recA, manB, thrA and tmk loci. Four virulence gene loci (caf1, lcrV, psaA and pla) were also sequenced and analysed. Two sequence types (ST1 and ST2), which differed by a single nucleotide, were identified by MLST. With the exception of a single isolate (771G), all of the Georgian Y. pestis isolates belonged to ST2. PFGE also grouped the Georgian Y. pestis isolates separately from the non-Georgian isolates. Overall, PFGE discriminated the Y. pestis isolates more effectively than MLST. The sequences of three of the four virulence genes (lcrV, psaA and pla) were identical in all Georgian and non-Georgian isolates, but the caf1 locus was represented by two allele types, with caf1 NT1 being associated with the non-Georgian isolates and caf1 NT2 being associated with the Georgian isolates. These results suggest that Georgian Y. pestis isolates are of clonal origin.     

鼠疫F1蛋白原核分泌性表达及鉴定

目的构建重组质粒,在大肠杆菌中表达鼠疫菌F1抗原。方法用PCR方法扩增出带有信号肽的F1基因,将其克隆到表达载体pET30a(+)上,转化大肠杆菌BL21(DE3);用IPTG诱导目的基因表达,层析方法纯化F1蛋白,测定其分子量、等电点、N末端氨基酸序列,用Westernblot法检测其抗原性。结果根据双酶切和DNA测序结果显示,F1基因成功连接到表达载体pET30a(+)中,F1蛋白主要为分泌性可溶表达。测定纯化后F1蛋白的相对分子量约为15.6kD,等电点为4.15,N末端氨基酸序列与理论序列一致。经Westernblot鉴定,能被兔抗鼠疫菌EV株血清识别。结论成功克隆并构建了F1蛋白分泌性原核表达系统,所表达的重组F1蛋白具有较好的抗原性,为新型鼠疫疫苗研制提供基础。     

鼠疫耶尔森菌中国分离株菌体脂肪酸成分分析

目的 探讨利用脂肪酸组织对中国鼠疫耶尔森菌菌株进行分型的可能性,获得中国鼠疫耶尔森菌菌株脂肪酸组成的本底资料。方法 选择历年来从我国不同疫源地分离到的58株鼠疫耶尔森菌进行了菌体脂肪酸成分分析。并利用STATISTICA统计软件进行实验菌株的聚类分析。结果 中国鼠疫耶尔森菌菌株的主要脂肪酸分为16：0酸,环式17：0酸,3-羟基14：0酸和ω7c16:1酸以及十八碳单烯酸,与MIDI公司Sherlock系统的菌库中的数据存在一些差异。结论 实验菌株的脂肪酸成分极为接近,聚类图不能充分体现分离株在分离时间,地点以及生物型别上的差异。表明脂肪酸分析目前不适于鼠疫耶尔森菌的分型,根据实验结果,建立了中国鼠疫耶尔森菌菌株的脂肪权组成数据库。     

应用抑制削减杂交技术进行鼠疫耶尔森菌的比较基因组研究

目的确定古典型鼠疫耶尔森菌的特有序列，为建立和完善该菌基因组分型系统提供可靠数据。方法通过抑制削减杂交技术发现差异片段并应用PCR验证。结果发现了5个在不同生物型鼠疫菌问存在差异的DNA片段，其中一个383bp的片段在来自天山山地灰旱獭、长尾黄鼠鼠疫自然疫源地的30株鼠疫菌全部阳性，而来自其它鼠疫自然疫源地的菌株全部阴性，5株假结核耶尔森菌中有2株(生物Ⅰ型和Ⅱ型)阳性。结论该383bp片段为天山山地灰旱獭、长尾黄鼠鼠疫自然疫源地的鼠疫菌所特有，此疫源地的菌株可能是我国较古老的鼠疫菌。     

准噶尔盆地大沙鼠鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌质粒谱的研究

目的 了解和掌握准噶尔瓮地大沙鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌质粒谱类型.方法 提取新疆地区不同鼠疫自然疫源地及青藏高原喜玛拉雅旱獭鼠疫自然疫源地、昆仑山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和内蒙古长爪沙鼠鼠疫自然疫源地的39株鼠疫菌质粒DNA,采用琼脂糖凝胶电泳法对其进行质粒谱图型分析.结果 在检测的26株准噶尔盆地大沙鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌中,有23株质粒谱为6×106、45×106、65×106,3株为6×106、45×106和72×106.结论 准噶尔盆地大沙鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌质粒谱分为两个类型:一为6×106、45×106、65×106质粒谱型,是该疫源地的主要质粒谱型,与邻近的北天山灰旱獭.长尾黄鼠鼠疫自然疫源地及内蒙占长爪沙鼠鼠疫自然疫源地、昆仑山喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地和青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地的鼠疫菌主要质粒谱型一致;二为6×106、45×106和72×106质粒谱型,为少数型,在我国系首次发现.     

鼠疫耶尔森菌与表面抗体相互作用的原子力显微镜观测研究

目的 以原子力显微镜(atomic force microscopy,AFM)观察比较鼠疫耶尔森菌EV76株与正常兔血清以及兔抗F1抗体反应后微观形态变化,探讨以原子力显微镜为工具的鼠疫耶尔森菌的免疫检测方法.方法 用兔抗F1抗体及正常兔血清处理鼠疫耶尔森菌菌液,并与对照菌一起制样后在原子力显微镜下观察鼠疫耶尔森菌的表面结构的改变,并对其主要指标,包括Ra、Rq改变进行测量比较.结果 正常菌体组细胞呈椭圆形,两端钝圆,长为1.1～1.3 μm,宽为0.8～1.0 μm,阶高为0.04～0.06 μm,细胞形状规则,表面相对比较光滑;对照抗体及F1抗体加入组,细菌阶高均明显增高;F1抗体结合株菌体形状不规则,表面粗糙度明显增加.结论 获得原子力显微镜下的鼠疫耶尔森菌形态特征;表面抗体与鼠疫耶尔森菌结合后,对鼠疫耶尔森菌的表面超微结构有显著的影响,其中粗糙度可以作为原子力显微镜免疫检测的指标.     

S系统及时序布尔网络模型构建鼠疫耶尔森菌基因调控网络的初步研究

目的应用S幂率系统构建鼠疫耶尔森菌小尺度基因调控网络。方法收集鼠疫耶尔森菌基因时间序列表达数据,数据经预处理后,分别用布尔网络模型和S幂率系统网络模型构建小尺度基因调控网络,并对两个网络结构进行比较。结果应用布尔网络模型构建的小尺度基因调控网络中存在2种基因调控模式,而应用S幂率系统网络模型构建的小尺度基因调控网络中存在4种基因调控模式。结论 S幂率系统可用于构建基因调控网络模型。     

44株中国田鼠型与24株非田鼠型鼠疫菌的DFR检测分析

目的比较我国两个田鼠鼠疫自然疫源地的44株田鼠型鼠疫菌的基因组组成，研究中国田鼠型鼠疫菌的遗传稳定性。方法根据已经证实的22个差异区段(I)FR)设计引物，每株鼠疫菌的每个DFR都采用PCR技术进行验证。结果22个DFR在两种田鼠型鼠疫菌的分布状态完全一致，即均同时缺失了DFR6、DFR11、DFR12、DFR13、DFR18、DFR19和DFR20，与来源于其他鼠疫自然疫源地非田鼠型鼠疫菌的基因组成有显著差别。结论锡林郭勒高原型鼠疫菌和青藏高原青海田鼠型鼠疫菌在基因组组成上高度一致，田鼠型鼠疫菌的基因缺失可能与其对人不致病有关。     

甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫疫源地鼠疫菌的基因分型研究

目的 研究我国甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫疫源地鼠疫菌的基因分型。方法 根据已经证实的22个DFR（差异区段）设计引物，每株鼠疫菌的每个DFR都采用PCR技术进行验证。结果 17株甘宁黄土高原疫源地鼠疫菌株共包括3个基因型，即7、11和13型。7、11和13型所占比例分别为5．9％（1／17）、5．9％（1／17）和88．2％（15／17）。结论 我国甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫疫源地鼠疫菌的基因型主要为13型，而且13型是该疫源地鼠疫菌所特有的基因型。