江苏汉族人群杀伤细胞免疫球蛋白样受体及其特异性配体HLA分析

目的:分析杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)及其特异性配体HLAⅠ类分子在江苏地区汉族人群的分布特点。方法:分别利用real-time PCR法和PCR-SSP方法对173例无血缘关系的江苏汉族健康人群进行KIR和HLA-Cw,HLA-Bw4分型,并分析KIR/HLA配对组合的类型和数量。结果:江苏汉族人群中,>92%的个体同时表达四种抑制性KIR(iKIR)(2DL1,2DL2/3,3DL1,3DL2)。2DL2/HLA-C1,2DL3/HLA-C1,2DL1/HLA-C2,3DL1/Bw4的频率分别依次分别为0.243,0.971,0.457,0.590;2DS1/HLA-C2,2DS2/HLA-C1的频率为0.162,0.231。54.3%的个体只表达2DL1而不表达相应的配体HLA-C2,32.9%的个体只表达3DL1而缺乏配体HLA-Bw4,另有5.8%的个体只表达HLA-Bw4而不表达3DL1。27.7%的个体同时表达3种iKIR/HLA,26%的个体同时表达两种iKIR/HLA,25.4%的个体只遗传一个iKIR/HLA配对,未发现3种iKIR/HLA同时缺失的个体。结论:在江苏汉族人群中,存在KIR与HLA表型分离现象,抑制性KIR/HLA配对表达高于刺激性KIR/HLA配对,约1/4个体只表达单个iKIR/HLA配对。     

中国新疆地区维吾尔族人群杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因多态性研究

背景：研究发现,杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因具有遗传多态性,不同个体和NK细胞克隆表达不同的杀伤细胞免疫球蛋白样受体库。 目的：分析新疆维吾尔族人群杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因多态性及基因型和单倍型特点。 方法：采用序列特异性引物PCR方法检测84名新疆维吾尔族志愿者杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因频率,采用Hsu等的标准进行基因型和单倍型分析。 结果与结论：①共检测已知的16个杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因,其中3DL3、2DL4、3DL2基因存在于所有个体;2DL1、3DP1、2DP1、2DL3基因较为常见;其次为2DS4、3DL1、2DL5、2DS2、2DL2、2DS1、 2DS5、3DS1;而2DS3基因频率最低。②共检测19种基因型,其中以 AJ(2,2)、AH(5,2) 和M(2,8)型较常见,频率分别为25.00%,10.71%和10.71%,其次为P(2,17)、AI(1,5)、H(2,4)和C(5,3),频率为9.52%,5.95%。5.95%和4.76%;比对发现U(17,21)、T(8,8)基因型共4例在国内文献汉族人群中未见报道。③共检出11种单倍型,最常见单倍型2占48.7%,其次是单倍型5,占15.8%;另外,发现有3种新基因型,且无法根据现有相关文献标准进行单倍型分析。表明新疆维吾尔族人群具有其独特的杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因频率、基因型频率和单倍型频率分布,并有可能存在新的基因型和单倍型。     

烟台地区汉族无偿献血人群杀伤细胞免疫球蛋白受体基因多态性研究

目的:探讨烟台地区汉族无偿献血人群杀伤细胞免疫球蛋白受体(killer cell immunoglobulin receptor,KIR)基因多态性及基因型的特征。方法:收集2019年6月至2019年12月烟台市中心血站检测合格的无偿献血者外周血样本95例,采用聚合酶链反应序列特异性引物(polymerase chai...     

杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因多态性与不明原因复发性早期自然流产的关联性研究

目的探讨杀伤细胞免疫球蛋白样受体（killer cell immunoglobulin-like receptor，KIR）基因多态性与不明原因的复发性早期自然流产的关联性。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应（PCR-SSP）法，分析我院就诊的100例不明原因的复发性早期自然流产（unexplained recurrent spontaneous abortions，URSA）患者和112例无血缘关系的正常妇女KIR基因位点的多态性。结果URSA病例组KIR2DS1（P=0．003）、KIR2DS2（P=0．008）、KIR2DL5（P=0．003）基因的阳性率较随机对照组显著升高，URSA病例组活化性KIR基因数目较对照组显著增多（P=0．002）。具有3个或3个以下活化性KIR基因的个体在病例组中占40．00％，在对照组中占58．04％；而具有3个以上活化性KIR基因的个体在病例组中占60．00％，在对照组中占41．96％，两者差异具有统计学意义（P=0．009）。结论活化性KIR基因数目增多可能参与不明原因复发性早期自然流产的发病。KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DL5基因频率升高可能是不明原因复发性早期自然流产的原因之一。     

杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)基因多态性与系统性红斑狼疮的关联性研究

目的 探讨杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIR）基因多态性与系统性红斑狼疮（SLE）的关联性。方法 采用序列特异性引物聚合酶链反应（SSP-PCR）法，分析93例SLE患者和123例无血缘关系的健康对照K／R基因位点的多态性。结果 SLE病例组KIR2DS1（P〈0．001）、KIR2DL2（P〈0．001）基因的阳性率较随机对照组显著升高。具有2个或2个以上活化性基因个体在SLE组（80．7％）较对照组（66．7％）明显增多，差异具有统计学意义（P=0．025）。SLE患者狼疮肾炎与非狼疮肾炎组K／R基因分布频率比较差异无统计学意义。按发病年龄分组后，SLE患者中不同发病年龄组间K／R基因频率分布比较差异无统计学意义。结论 KIR2DS1、KIR2DL2基因频率升高可能与SLE发病相关。     

Graves病患者杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因型分析

目的: 探讨杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)基因型在Graves病(GD)患者中的分布规律.方法: 采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP) 的方法,分析96例Graves病患者和96 例正常对照人群的KIR基因型.结果: GD患者中2DS2-,2DL2-,2DL3+,2DL1+,3DL1+,3DS1-,2DL5-,2DS3-,2DS5-,2DS1-,2DS4-基因型频率高于对照组(6.25% vs 0,P<0.05);对照组中,基因频率最高的基因型为2DS2-,2DL2-,2DL3+,2DL1+,3DL1+,3DS1-,2DL5-,2DS3-,2DS5-,2DS1-,2DS4+,该基因型的基因型频率较GD患者组高,且有显著性差异(28.13% vs 10.42%,P<0.01);GD患者组不携带活化性KIR基因的基因型频率较对照组明显升高(10.42% vs 0%,P=0.001).结论: KIR基因型在GD患者与正常人群分布的差异可能与GD的发病有关.     

桥本甲状腺炎患者杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因多态性分析

目的 探讨杀伤细胞免疫球蛋白样受体(killer cell immunoglobulin-like receptor, KIR)基因多态性与桥本甲状腺炎(HT)的关联性.方法 选择100例散发HT患者,260例无血缘关系的正常人作为对照,提取全血基因组DNA,采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)的方法,对KIR2DL1～5、KIR3DL1～3、KIR2DS1～5、KIR3DS1及KIR2DP1共15个KIR基因进行检测,其中除KIR2DS5基因外,每个基因均采用2对不同的特异性引物.结果 HT病例组中KIR2DL5基因的基因频率较对照组显著降低(0.200 vs 0.312,RR=0.64,P<0.01).结论 KIR2DL5基因频率的降低可能与HT的发病相关.     

杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因与骨髓衰竭性疾病的相关性研究

目的 探讨杀伤细胞免疫球蛋白样受体(killer cell immunoglobin-like receptor,KIR)基因多态性与骨髓衰竭性疾病(bone marrow failure syndromes,BMFS)的相关性.方法 采用序列特异性引物聚合酶链反应(sequence specific primer-polymerase chain reaction,SSP-PCR)的方法,对40例骨髓增生异常综合征(myelodysplatic syndrome,MDS)和20例再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)患者以及60例健康对照者的KIR基因进行检测,分析KIR基因与这些疾病发生的遗传学相关性.结果 在对照组及患者组分别检出目前已知的全部16个KIR基因.MDS和AA患者组较健康对照组有多种激活性KIR基因(2DS1、2DS2、2DS3、2DS5及3DS1)频率增加.2DS5的基因频率在AA患者组较MDS组明显减少.结论 骨髓衰竭性疾病患者多种激活性KIR基因频率的增加提示其疾病的发生机制与遗传背景所致的异常免疫因素有一定相关性.

Abstract：

Objective To investigate the correlation of killer immunoglobulin-like receptors(KIR)gene polymorphism with bone marrow failure syndromes(BMFS). Methods SSP-PCR was used to examine the genotypic makeup of KIR in patients with aplastic anemia( AA), myelodysplatic syndrome (MDS) and healthy controls in our department. Results All the 16 KIR genes which had been prescribed were identified. The frequencies of KIR-2DS1, 2DS2, 2DS3, 2DS5 and 3DS1 genes were showed increased in patients with AA, MDS than in healthy controls. The patients with AA had lower frequency of KIR-2DS5 than the patients with MDS. Conclusion The increased frequencies of these activated KiRs in patients with MDS and AA suggest that the abnormal immunogenetic might be related to the pathogenesis of BMFS.     

内蒙古蒙古族人群杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因簇多态性研究

目的 研究中国蒙古族人群杀伤细胞免疫球蛋白样受体(killer cell immunoglobulin-like receptors,KIR)基因的携带频率、KIR基因型及其遗传规律.方法 采集90名内蒙古农牧区蒙古族个体的血样,应用序列特异性引物聚合酶链反应(polymerase chain reaction-sequence specific primer,PCR-SSP)方法分别扩增KIR基因簇16个基因,依据实验结果计算各基因的携带频率并查询样本的基因型,和已报道的24个其他人群的相关数据进行主成分分析、计算Nei氏遗传距离并绘制遗传树.结果 (1)蒙古族人群KIR 2DL2、2DS2携带率高于蒙古利亚人,低于高加索人.(2)蒙古族KIR基因单倍型AA为37.78%,高于高加索人,低于蒙古利亚人.(3)系统进化树显示蒙古利亚人和高加索人分别聚类,蒙古族人群则介于两者之间.结论 蒙古族其成因似与受到高加索人和蒙古利亚人的双重影响有关,表现为介于高加索人和蒙古利亚人之间的中间形式.

Abstract：

Objective To investigate the killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR) gene frequencies and genotypes distributions in the Inner Mongolian population. Methods Ninety genomic DNA samples were extracted from blood samples of randomly chosen Mongolian individuals. Gene-specific PCR amplification was used to identify genes present or absent for 16 KIR loci. KIR genotype distributions were obtained and compared to that of 24 populations published in literatures using principal component analysis by SAS8.0 software. Genetic tree was constructed by the calculate Nei's genetic distance. Results (1) The frequency of KIR 2DL2,2DS2 in Mongolian individual is higher than that in north Mongoloid and less than that in Caucasian. (2) Haplotype AA was identified in 37.78% of individuals, which is higher than that in north Mongoloid and lower than that in Caucasian. (3) Mongolian was considered between north Mongoloid and Caucasian by principal component and genetic tree analysis. Conclusion Mongolian might be affected by the north Mongoloid and Caucasian, and showed intermediate between the two populations.     

人类杀伤细胞免疫球蛋白样受体基因PCR-SSP分型方法的建立及其应用

目的建立PCR-SSP方法检测人类杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIR）基因。方法参照K／R基因数据库，采用计算机软件设计一系列特异性引物建立PCR-SSP方法，以人类生长激素基因特异性引物作为内对照，以Dynal公司的KIR PCR-SSP分型试剂盒作为验证。结果本实验所设计的KIR特异性引物可检测出所有K／R基因，扩增产物条带清晰，特异性强。结论本实验建立的KIR PCR-SSP方法结果准确，具有可行性。     

中国新疆维吾尔族、云南彝族KIR多态性分析

分析中国新疆维吾尔族、云南彝族健康人群的KIR基因多态性及单倍型特点。采用序列特异性引物PCR方法(PCR-sequencespecificprimer,PCR-SSP)对维吾尔族、彝族人群基因多态性进行低分辨率检测和单倍型分析。维吾尔族中共检出15种基因型,以AH(5,2)型最常见,频率为22.7%,其次为AF(1,2)和M(2,8),频率分别为13.7%,9.09%。在彝族中共检出19种基因型,以AJ(2,2)型最常见,频率为33.3%,其次为AF(1,2),频率为17.5%。此外,在维吾尔族、彝族中共发现8种新基因型,提示中国少数民族有着自己独特的KIR基因分布频率、单倍型频率和基因型频率。     

Human leukocyte antigen-C and killer cell immunoglobulin-like receptor gene polymorphisms among patients with syphilis in a Chinese Han population

Syphilis is a sexually transmitted infection caused by the Treponema pallidum subspecies pallidum spirochete bacterium. The killer cell immunoglobulin‐like receptors (KIR), interacting with human leukocyte antigens (HLA), regulate the activations of natural killer (NK) cells and certain T‐cell subsets in response to microbe infection. The objective of this study was to explore whether KIR and HLA‐C gene polymorphisms were associated with syphilis in a Chinese Han population. Polymerase chain reaction with sequence‐specific primers (PCR‐SSP) method was used to genotype KIR and HLA‐C genes in 231 syphilis patients and 247 healthy controls. Framework genes KIR2DL4, KIR3DL2, KIR3DL3 and KIR3DP1 were present in all individuals. The frequencies of KIR2DS3 and KIR3DS1 were higher in syphilis patients than in healthy controls (p = 0.030 and p = 0.038, respectively), while the frequency of KIR2DS5 was higher in healthy controls than in syphilis patients (p = 0.015; OR = 0.575). The homozygote for HLA‐C1 allele (HLA‐C1C1) was more common in controls compared with syphilis patients (p = 0.030; OR = 0.667). The frequency of individuals with HLA‐C1C1 and KIR2DL3 genotype was higher in control group relative to syphilis patient group (p = 0.018; OR = 0.647). These data indicated that KIR2DS3 and KIR3DS1 were more prevalent in syphilis patients than in controls, and that KIR2DS5, HLA‐C1C1 and HLA‐C1C1‐KIR2DL3 were more prevalent in controls than in syphilis patients, respectively. These will require further investigation using functional studies.     

Killer immunoglobulin like receptor gene content diversity among Northern Indian population

Background: Genes encoding KIR receptors are clustered in one of the most variable regions of the human genome. KIR gene frequencies vary in worldwide populations and reveal high probability of individuals differing in their gene content.

Aim: This study aimed to investigate KIR diversity among the northern Indian population who share features with either Western Eurasian or East Asian populations. It sought to decipher how northern Indians are associated phylogenetically with global populations whilst also focusing on differentiation of populations.

Subjects and methods: This paper studied 867 northern Indians using PCR-SSP. Gene and genotypic frequencies were calculated, using statistical analyses. Findings were compared against 76 global populations of differing ethnicities.

Results: This northern Indian population shared characteristics with Western Eurasian or Asian Indian populations, as is evident from genetic distance, clustered heatmap, phylogenetic assessment and principal component analysis. The findings are consistent with the demographic history of northern India, including specific features, such as presence of comparatively high KIR B-haplotype as compared to A-haplotype.

Conclusion: KIR frequencies and profiles of northern Indians were more similar to Western Eurasians, Africans and Asian Indians. This may suggest that KIR genes are under constant evolutionary pressures and selection, which may be linked to different invading pathogens.     

上海地区汉族人HLA-DQB1启动子多态性以及QBP-DQB1连锁分析

为分析上海地区汉族人HLA DQB1启动子 (QBP )多态性 ,以及QBP与DQB1的连锁不平衡 ,我们选用 2 4个序列特异性寡核苷酸探针 (SSO )检测QBP多态性。在目前已知的 12种QBP等位基因中 ,我们仅检测到 10种 (未发现新的QBP类型 ) ,并且发现QBP与DQB1的某些等位基因之间存在一定的连锁格局。我们的结果与高加索人群研究结果比较发现 ,无论是QBP基因频率还是QBP DQB1单元型频率 ,在两种不同人群中都存在明显差异。结果提示 ,由于不同的QBP等位基因功能不同 ,因此QBP DQB1之间不同的单倍型组合可能是HLA与疾病关联的另一个因素。     

浙江汉族人群KIR3DL2等位基因的多态性分析

目的探讨浙江汉族人群KIR3DL2等位基因的多态性分布情况。方法KIR3DL2等位基因分型采用聚合酶链反应寡核苷酸探针杂交方法，利用引物特异性扩增KIR3DL2基因的两个片段，合成21条探针检测KIR3DL2基因的多态性位点，根据探针的格局判断出样本的KIR3DL2等位基因情况。结果样本中共发现17种探针格局，检测到7种等位基因，其中KIR3DL2＊002等位基因占57％。1例样本无法用现有等位基因探针格局进行分析。结论聚合酶链反应寡核苷酸探针杂交方法可有效检测KIR3DL2等位基因，浙江汉族人群KIR3DL2等位基因的分布有其特点。     

上海地区汉族人群KIR2DL5基因多态性及单元型分析

KIR2DL5基因是杀伤细胞免疫球蛋白样受体 (KIR )单元型B的特征性标志 ,至少有 4个变异体 ,其中 2DL5A 0 0 1和2DL5B 0 0 3是表达型 ,统称为KIR2DL5 1;2DL5B 0 0 2和 2DL5B 0 0 4是不表达型 ,统称为KIR2DL5 2。本文用序列特异性引物PCR法 (PCR SSP )分析了KIR2DL5表达型KIR2DL5 1和不表达型KIR2DL5 2在上海地区正常汉族人群的分布及其在KIR单元型的组成。结果发现 (1)在 87名健康汉族人和 14个家族中表达型KIR2DL5 1和不表达型KIR2DL5 2基因频率分别为0 1977和 0 0 4 11;(2 )KIR2DL5基因变异体在不同单元型中分布不同 ,有 5种不同组合 ,其中单元型 1、 2、 3、 4、 11、 12、15和 16不含KIR2DL5及其变异体 ;单元型 5和 14只含有KIR2DL5 1;单元型 13和 17只含有KIR2DL5 2 ;单元型 6含有单一KIR2DL5 1或二者兼有 ;单元型 8和 9同时含有KIR2DL5 1和KIR2DL5 2。     

中国南方汉族人群HLA-Cw座位基因多态性分析

目的 分析中国南方汉族人群HLA－Cw座位基因多态性。方法 采用ARMS／PCR技术对60名随机选择的南方汉族健康个体作HLA－Cw基因分型。结果 共检出12种HLA－Cw等位基因或等位基因组（allele group)，其中HLA－Cw*07、＊01、＊03为该人群最常见HLA－Cw基因，频率之和为0．6932；证实该群体中HLA－Cw＊08频率为0．1056，检出率明显高于血清学分型；检出HLA－Cw*1202、＊1203、＊14、＊15等4种经典血清学分型不能鉴定的HLA－Cw基因，频率之和为0．0673。结论 提供了中国南方汉族人群HLA－Cw座位基因频率正常值，证实ARMS／PCR作HLA－Cw分型具有准确、快捷的优点。     

中国汉族群体RhD阴性个体D基因外显子多态性研究

目的 研究中国汉族RhD阴性[RhD(-)]个体Rh血型系统D基因8个外显子的构成情况。方法 应用聚合酶链反应－序列特异性引物（PCR－SSP）方法,对50名汉族人RhD(-)个体RHD基因及RHCE基因进行了研究。扩增RHD基因的第2,3,4,5,6,7,9,10外显子和内含子4,以及RHCE基因的第1,2,4,5外显子和内含子4。结果 50名RhD(－）供者的Rh表型为ccdee 22人,ccdEe 3 w ,CE3w ,在表型为ccdee或ccdEe的25人中,D基因8个外显子全部缺失,在表型为Ccdee或CcdEe的25人中,RHD基因则表现出多态性：9人存在全部基因8个外显子,7人缺失全部D基因8个外显子,5人存在D基因第2外显子,3人存在D基因第6外显子,1人存在D基因第2,6,10外显子,结论 中国汉族RhD(-)个体D基因外显子具有多态性,Rh表型为cc的个体D基因8个外显子全部缺失,在表型为Cc的个体中观察到5种D基因多态性,中国汉族人D基因结构不同于高加索人,故在应用RHD基因定型结果时,应慎重对待。     

上海地区汉族人群中性粒细胞抗原的基因频率与其分子特征研究

目的:了解上海地区汉族人群人类中性粒细胞抗原(Human neutrophil antigens,HNA)的基因频率分布与其分子特征。方法:使用序列特异性引物聚合酶链反应(Polymerase chain reaction-sequence specific primer,PCR-SSP)对上海地区326名随机健康献血者的HNA-1(-a,-b,-c),HNA-3(-a,-b),HNA-4a(+,-)和HNA-5a(+,-)进行基因分型,测序和PCR-限制性片段长度多态性(PCR-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)验证其分子特征;并使用流式细胞术分析另外91份随机健康样本HNA-2a抗原表达。结果:本研究成功分析HNA-1、3-5各系统基因型。发现3例FCGR3B的变异体,其中2例为FCGR3B*01等位基因发生227 A→G和349 G→A的突变,另1例为一条染色体上的FCGR3B*02等位基因发生277 A→G的突变。HNA-1a、1b、1c、3a、3b基因频率分别为0.620、0.380、0、0.653和0.347,HNA-4a(+)、4a(-)、5a(+)、5a(-)基因频率分别为1、0、0.896和0.104,流式结果证实HNA-2a抗原频率为1,所测个体均具有HNA-2a阳性粒细胞,但不同个体具有不同比例的阳性粒细胞。这些分布与高加索人群相比有非常显著的差异,而与广东人群相比,主要是HNA-3系统分布有差异。结论:中国上海人群HNA具有独特的多态性,需要引起输血实践的注意。