西藏藏族人群骨发育候选基因ERα的多态性

目的:分析西藏藏族人群骨发育相关基因,雌激素受体基因α(ERα)多态性分布及其在不同种族和地区间有无差异.方法:随机抽取世居西藏(拉萨、那曲)地区,父母均为藏族,3代内无族外通婚,彼此间无亲缘关系,经体检证明健康的藏族158例.采用PCR-RFLP及琼脂糖凝胶电泳法检测西藏藏族人群的雌激素受体基因α基因PvuⅡ、XbaⅠ多态性.用基因计数法分别计算基因型频率和等位基因频率.结果:西藏藏族正常人群中的雌激素受体基因以pp、xx基因型和p、x等位基因的分布频率为最高,PP、XX基因型和P、X等位基因最低,且男、女间比较差异无统计学意义.但XX基因型与广东、日本、瑞典地区差异有统计学意义,X等位基因与湖南、日本、瑞典地区差异有统计学意义.结论:雌激素受体基因α在西藏藏族人群的分布可能具有种族及民族差异性,不存在性别差异.     

维吾尔族细胞色素P450c17α酶基因单核苷酸多态性与身高差异的关系

目的:探讨细胞色素P450c17α酶基因(CYP17)多态性与新疆和田地区民丰县成人个体高矮是否具有相关性。方法:收集长期居住同一地区22例高身材组(男性14例,女性8例)和81例矮身材组(男性27例,女性54例)成人的血液标本并提取DNA,设计引物,通过PCR扩增包括基因多态位点的片段,用限制性内切酶MspA1I进行酶切,产物在2%琼脂糖凝胶上电泳,确定CYP17基因的3种基因型,即A1/A1、A1/A2、A2/A2,并经测序证实。结果:在男女高矮个子组间A1/A2、A2/A2、A1/A1基因型频率的分布无差异;男性高矮个子组间A1/A2、A2/A2、A1/A1基因型频率的分布呈显著性差异;A1/A1和A2/A2基因型在高矮个子组间非条件Logistic回归分析,OR值分别为1.128(95%CI 0.925~1.376)和0.778(95%CI 0.442~1.161)。女性高矮个子组间无差异。A1/A2、A2/A2、A1/A1基因型与所有样本生化指标间无差异,但身高间存在差异;维吾尔族与汉族人群基因型之间有差异,而与藏族人群间无差异。结论:CYP17基因MspA1I酶切位点基因多态性与维吾尔族男性成人身材高矮有相关性。CYP17基因MspA1I酶切位点多态性可能是影响维吾尔族成人个体身高差异的基因位点之一。     

南京及周边地区冠心病患者CYP2C19基因多态性分析

目的 探讨南京及周边地区冠心病患者CYP2C19基因多态性的相关分布,分析性别和年龄与CYP2C19基因多态性的关系.方法 选取2015年5月至2016年4月期间在南京市第一医院拟使用氯吡格雷抗血小板治疗的冠心病患者共2997例.男性1963例,女性1034例;患者平均年龄66.3±11.4岁,＜65岁患者1284例,≥65岁患者1713例.采用“等位基因特异PCR”结合荧光探针技术检测CYP2C19基因多态性,并分别统计不同性别和不同年龄与基因多态性发生频率的关系.结果 本研究共检测到CYP2C19六种基因型:CYP2C19*1/*1,*1/*2,*1/*3,*2/*2,*2/*3,*3/*3,其基因频率分别为38.5％、41.1％、6.3％、11.1％、2.7％、0.3％,共对应三种代谢表型:快代谢型(*1/*1),占38.5％;中间代谢型(*1/*2、*1/*3),占47.4％;慢代谢型(*2/*2、*2/*3、*3/*3),占14.1％.等位基因CYP2C19*1、CYP2C19*2、CYP2C19*3的频率分别为62.2％、33.0％和4.8％.不同性别和不同年龄基因多态性差异无统计学意义.结论 南京及周边地区冠心病患者CYP2C19基因多态性分布与中国其他地区人群研究结果基本一致,与性别和年龄无相关性.     

CYP17基因多态性与汉族成人身高差异关系的研究

目的探讨CYP17基因多态性与中国汉族成人身材高低是否具有相关性。方法收集长期居住同一地区101例高身材组(男性56例,女性45例)和80例低身材组(男性43例,女性37例)成年人的血液标本并提取DNA,设计引物,通过PCR扩增包括基因多态位点的片段,用限制性内切酶MspA1I进行酶切,产物在2%琼脂糖凝胶上电泳,确定CYP17基因的3种基因型,即A1/A1、A1/A2、A2/A2,并经测序证实。结果男性高低个子组间基因型A1/A2、A2/A2、A1/A1比较,分布呈显著性差异(χ2=7.339,P=0.025)。A1/A1和A2/A2基因型在高低个子组间非条件Logistic回归分析,OR值分别为2.661(95%CI1.102～6.430)和3.008(95%CI1.202～7.527)。女性高低个子组间差异无显著性(P=0.303)。结论CYP17基因MspA1I酶切位点基因多态性与成人汉族男性身材高低有相关性,但未发现与女性成人身材高低有相关性。CYP17基因MspA1I基因多态性可能是影响中国成人男性身高个体差异的基因位点之一。     

福建畲族成年男性DYS19、DYS389I、DYS393多态性与身高的关系

目的:探讨福建畲族男性DYS19、DYS389I、DYS393多态性与身高之间的关系.方法:调查福建畲族健康男性152例,测量其身高.应用AmpFlSTR(R) YfilerTM荧光标记复合扩增系统及自动测序法,对152例研究对象进行DYS19、DYS389I、DYS393的等位基因分型.结果:福建畲族成年男性的身高在DYS19、DYS389I基因座的不同基因型间差异有统计学意义,在DYS393基因座的不同基因型间无差异.结论:福建畲族DYS19、DYS389I的遗传多态性可能与福建畲族男性身高增长有关,DYS393对福建畲族男性身高影响不明显.     

福建汉族氯吡格雷药物代谢相关基因CYP2C19的多态性分布研究

目的 探讨中国福建汉族人群与氯吡格雷代谢相关的CYP2C19基因多态性的分布.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性检测以及直接测序对1001名无亲缘关系的福建汉族志愿者进行CYP2C19*2、CYP2C19*3以及CYP2C19* 17基因型的检测.结果 在全部对象中,CYP2C19*2、*3和*17的频率分别为32.4％、5.8％和0.4％.根据CYP2C19基因多态位点功能代谢分型,携带CYP2C19*2或*3的中间代谢型(*1/*2和*1/*3)与弱代谢型(*2/*2和*2/*3)分别占47.95％和13.99％.该结果与日本、韩国、新加坡、马来西亚、泰国人群及中国的傣族、蒙古族、黎族和回族相似(P＞0.05),但是与中国的哈萨克族及维吾尔族,以及伊朗、俄罗斯、意大利、波兰、挪威、加拿大印第安人、玻利维亚、埃及、坦桑尼亚等国家的人种差异有统计学意义(P＜0.05).结论 氯吡格雷药物代谢相关基因CYP2C19的分布存在种族(地区)差异.该多态在中国福建汉族人群中的分布与中国傣族、蒙古族、黎族、回族及部分东亚、东南亚人群无明显差异,但与中国哈萨克族和维吾尔族以及部分欧洲、南美洲和非洲人群相比有较多的中间代谢型及弱代谢型(P＜0.05).     

CYP2C19基因多态性与苯妥英钠治疗癫痫疗效的关系

目的探讨CYP2C19基因多态性对苯妥英钠治疗癫痫疗效的影响。方法选取2009年1月至2010年6月在本院神经内科住院治疗的癫痫患者150例为研究对象,均口服苯妥英钠进行治疗。利用聚合酶链式反应．限制性片段长度多态性（PCR．RFLP）方法检测CYP2C19基因型,使用高效液相色谱法（HPLC）检测苯妥英钠的血药浓度,探讨苯妥英钠治疗癫痫疗效与CYP2C19基因多态性的关系。结果150例患者中,苯妥英钠治疗有效患者CYP2C19基因型CYP2C19＊2／＊2、CYP2C19＊3／＊3、CYP2C19＊2／＊3分别为44例、7例、1例,苯妥英钠治疗无效患者CYP2C19基因型CYP2C19＊2／＊2、CYP2C19＊3／＊3、CYP2C19＊2／＊3分别为1例、1例、96例,组间比较差异有统计学意义（P〈0．05）。苯妥英钠治疗有效患者中,各基因型患者血药浓度比较差异无统计学意义（P〉0．05）。结论CYP2C19基因多态性与苯妥英钠的疗效有关。     

北京地区冠心病患者CYP2C19基因多态性检测

目的分析北京地区冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)患者CYP2C19基因多态性分布特点,探讨性别和年龄与CYP2C19基因多态性的关系。方法收集2017年4月至2018年3月于我院心脏内科就诊需服用氯吡格雷进行抗血小板治疗的冠心病患者260例,用实时荧光PCR方法对患者进行CYP2C19基因多态性检测,根据Hardy-Weinberg遗传平衡定律检测样本的群体代表性,计算各基因型、等位基因和代谢型分布的频率,比较年龄、性别与代谢型分布的相关性。结果 260例冠心病患者中,野生型纯合子CYP2C19*1/*1和突变杂合子*1/*2所占比例最多,分别为95例(36.55%)和103例(39.63%);等位基因*1所占比例最多(59. 80%);正常代谢型和中代谢型所占比例最多,分别为95例(36. 54%)和121例(46. 54%);不同性别、不同年龄的各基因代谢型分布差异无统计学意义。结论北京地区冠心病患者CYP2C19的基因分布与中国正常人群相似,性别、年龄与代谢型无相关性。     

武汉地区原发性高血压代谢综合征与CYP11B2-344T/C基因多态性关系的探讨

目的:探讨武汉地区原发性高血压(EH)代谢综合征(MS)与醛固酮合成酶(CYP11B2)基因-344C/T多态性的关系。方法:701例武汉地区汉族人群分为3组,其中血压正常对照组303例,EH伴MS组189例,EH不伴MS组209例。应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测3组人群CYP11B2-344T/C基因多态性。结果:(1)EH不伴MS组CYP11B2基因CC+TC基因型频率明显高于血压正常对照组。(2)CYP11B2TT基因型EH伴MS组的血压水平明显高于其它基因型。结论:EH不伴MS与CYP11B2基因多态性相关;EH伴MS患者血压水平与CYP11B2基因TT基因型明显相关。     

CYP11α基因微卫星多态性与多囊卵巢综合征关系的研究

目的探讨胆固醇侧链裂解酶CYP11α基因启动子中（TTTTA）n多态性和多囊卵巢综合征的关系。方法测定63例PCOS患者和40例正常妇女血清中的性激素水平,同时检测CYP11α基因微卫星多态性及其分布。结果 CYP11α基因在受检人群中存在5种等位基因;各基因型在PCOS患者与正常人之间差异无统计学意义;PCOS患者主要基因型之间血清性激素水平也无统计学差异。结沦CYP11α基因微卫星多态性与PCOS的发病之间无直接相关性,不是P-COS的主要致病因素。     

The high prevalence of the poor and ultrarapid metabolite alleles of CYP2D6, CYP2C9, CYP2C19, CYP3A4, and CYP3A5 in Taiwanese population

Genetic polymorphisms of drug metabolizing enzymes, such as cytochromes P450 (CYPs), play major roles in the variations of drug responsiveness in human. The aim of this study is to identify the high prevalence (minor allele frequencies >1%) of the abnormal metabolite alleles of CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP3A4, and CYP3A5 in the Taiwanese population. The genotyping of the functional single nucleotide polymorphisms (SNPs) of CYPs were conducted by direct exon sequencing in 180 Taiwanese volunteers. Twenty-one unique SNPs including three newly identified SNPs were detected in the Taiwanese population. Six of the 21 SNPs in five genes showed frequencies more than 1%. The results indicated that it could be very useful and important in developing an inexpensive, convenient, and precise genotyping method for the high prevalence of CYPs metabolizing abnormal alleles in the Taiwanese population.     

CYP1A1、CYP2D6基因多态性对白血病发生的影响

目的 分析细胞色素P450 CYP1A1和CYP2D6的多态性基因型在湖南地区白血病患者和健康人群中的分布及其对白血病发生的影响.方法 采用PCR及PCR-RFLP技术分析多态性基因型频率.结果 CYP1A1和CYP2D6基因的野生型、杂合突变型及纯合突变型的分布频率在急性淋巴细胞性白血病、急性非淋巴细胞性白血病、慢性粒细胞性白血病患者组与健康对照组之间无显著性差异;携带一个突变等位基因型的个体患白血病的风险与相应野生型携带者比较均无显著性差异;急性非淋巴细胞性白血病患者组的CYP1A1杂合突变型与CYP2D6杂合突变型的联合基因型频率高于健康对照组.结论 单独的CYP1A1或CYP2D6基因的多态性变异与白血病易感性不相关;CYP1A1杂合突变与CYP2D6杂合突变的联合基因型增加患急性非淋巴细胞性白血病的风险.     

Ah receptor, CYP1A1, CYP1A2 and CYP1B1 gene polymorphisms are not involved in the risk of recurrent pregnancy loss

The etiology of recurrent pregnancy loss (RPL) remains unclear, but it may be related to a possible genetic predisposition together with involvement of environmental factors. We examined the relation between RPL and polymorphisms in four genes, human aryl hydrocarbon (Ah) receptor, cytochrome P450 (CYP) 1A1, CYP1A2 and CYP1B1, which are involved in the metabolism of a wide range of environmental toxins and carcinogens. All cases and controls were women resident in Sapporo, Japan and the surrounding area. The Ah receptor, CYP1A1, CYP1A2 and CYP1B1 genotypes were assessed in 113 Japanese women with recurrent pregnancy loss (RPL) and 203 ethnically matched women experiencing at least one live birth and no spontaneous abortion (control). No significant differences in Ah receptor, CYP1A1, CYP1A2 and CYP1B1 genotype frequencies were found between the women with RPL and the controls [Ah receptor: Arg/Arg (reference); Arg/Lys and Lys/Lys, odds ratio (OR)=0.67; 95% confidence interval (CI)=0.40-1.11, CYP1A1: m1m1 (reference); m1m2 and m2m2, OR = 0.86; 95% CI = 0.53-1.40, CYP1A2: C/C and C/A (reference); A/A, OR = 1.16; 95% CI = 0.71-1.88, CYP1B1: Leu/Leu (reference); Leu/Val and Val/Val, OR = 1.18; 95% CI = 0.68-2.02]. The present study suggests that the Ah receptor, CYP1A1, CYP1A2 and CYP1B1 gene polymorphisms are not major genetic regulators in RPL.     

Distribution of polymorphisms in the CYP2C9 gene and CYP2C19/CYP2C9 haplotypes among Venezuelan populations

Background: Polymorphisms with decreased enzyme activity of their gene products have been reported in region CYP2C with population variations in haplotype structure.

Aim: To estimate the allelic and genotypic frequencies of variants CYP2C9*2 and CYP2C9*3 and of CYP2C9/CYP2C19 haplotypes in Venezuelan populations.

Subjects and methods: Six hundred and thirty-four individuals from nine admixed populations (AP) and the Warao indigenous group were studied. Allelic frequencies, linkage disequilibrium and genetic distances for haplotypes were calculated and compared within Venezuela and with data available in the literature.

Results: Heterogeneity in the distribution of CYP2C9 alleles and CYP2C9/CYP2C19 haplotypes among the AP and the Warao was observed. The joint frequency of haplotypes, with at least one non-functional variant, shows values in AP between 21–41%, while in Warao it reaches 5%. The haplotype that includes the Asian and rare Latin America CYP2C19*3 allele was detected in most AP and in Warao. Pairwise Fst values showed that the Warao was an outlier compared with the AP, while these are closer to European-derived populations. No significant correlation was found between haplotype frequencies and admixture.

Conclusions: These results support the need to understand the distribution of genomic biomarkers related to the metabolism of drugs, for planning national public health strategies.     

药物代谢酶CYP2D6基因多态性及表型的研究进展

CYP2D6是人体内细胞色素P450家族中一种重要的药物代谢酶,其催化的药物种类广泛.多年研究表明,编码该酶的基因存在遗传多态性且该多态性与药物代谢、药物不良反应(adverse drug reaction,ADR)的产生和致癌物的活化关系密切.随着人类基因组计划的完成和基因多态性研究计划的开展,近年来对该基因多态性及其与表型关系的研究再次成为遗传药理学研究的热点.本文从CYP2D6基因多态性及其发生机制,多态性对药物代谢、相关疾病易感性的影响等四个方面对此进行综述.     

药物代谢酶CYP2D6基因多态性及表型的研究进展

CYP2D6是人体内细胞色素P450家族中一种重要的药物代谢酶,其催化的药物种类广泛.多年研究表明,编码该酶的基因存在遗传多态性且该多态性与药物代谢、药物不良反应(adverse drug reaction,ADR)的产生和致癌物的活化关系密切.随着人类基因组计划的完成和基因多态性研究计划的开展,近年来对该基因多态性及其与表型关系的研究再次成为遗传药理学研究的热点.本文从CYP2D6基因多态性及其发生机制,多态性对药物代谢、相关疾病易感性的影响等四个方面对此进行综述.     

AhR途径,CYP1A1、CYP1B1,雌激素代谢及作用过程中的调节

多环芳烃和多卤化烃是环境中广泛分布的有害物质,可通过与细胞芳烃受体结合,从而影响外来化合物代谢酶系如细胞色素氧化酶P450 1A1、1B1的表达,并通过这些酶的催化作用调控雌激素的代谢及作用,进而部分决定了雌激素对机体的作用效应。上述复杂的过程可受到多种因素的影响。     

药物代谢酶CYP2D6和CYP2C19的基因多态性与个体化治疗

药物代谢酶的活性高低是决定药物代谢强度和持久性的主要因素。参与药物代谢的酶主要有细胞色素P450（cytochromep450,CYP450）同工酶、N-乙酰转移酶（N．acefyltransferase,NAT）、醇脱氢酶（alcohol dehydrogenase,ADH）和酯酶（esterase）等,而在众多代谢酶中,CYP450酶起着非常重要的作用,它可代谢降解大约40％～50％的药物。CYP450酶又称混合功能氧化酶或单加氧酶,是一种以血红蛋白为辅基的B族细胞色素超家族蛋白酶,广泛存在于动物、真核有机体、植物、真菌和细菌中,是必不可少的结构酶。     

Analysis of human CYP1A1 and CYP1A2 genes and their shared bidirectional promoter in eight world populations

The human CYP1A1_CYP1A2 locus comprises the CYP1A1 (5,988 bp) and CYP1A2 (7,759 bp) transcribed regions, oriented head‐to‐head, sharing a bidirectional promoter of 23,306 bp. The older CYP1A1 gene appears more conserved and responsible for critical life function(s), whereas the younger CYP1A2 gene might have evolved more rapidly due to environmental (dietary) pressures. A population genetics study might confirm this premise. We combined 60 CYP1A1_CYP1A2 SNPs found in the present study (eight New Guinea Highlanders, eight Samoans, four Dogrib, four Teribe, four Pehuenche, and one Caucasian) with those found in a previous study (six West Africans, four Han Chinese, six Germans, four Samoans, and four Dogrib), yielding a total of 106 SNPs in 106 chromosomes. Resequencing of Oceanians plus Amerindians in the present study yielded 21 New World SNPs (～20%), of which 17 are not previously reported in any SNP database. Various tests revealed selective pressures for both genes and both haploblocks; unfortunately, differences in rates of evolution between the two genes were undetectable. Fay & Wu's H test revealed a “hitchhiking event” centered around four SNPs in the CYP1A1 3′‐UTR; a study in silico identified different microRNA‐binding patterns in the hitchhiked region, when the mutations were present compared with the mutations absent. Hum Mutat 30:1–14, 2009. © 2009 Wiley‐Liss, Inc.