一例Smith-Magenis患儿的遗传学诊断与分析

目的 对1例发育迟缓患儿进行遗传学诊断、分析,为临床咨询提供依据.方法 采用常规G显带分析患儿及其父母的外周血染色体核型,利用微阵列比较基因组杂交(aCGH)技术对患儿及其父母外周血进行检测.对检出的拷贝数变异(CNV)致病性采用美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)评分标准进行分类,对患儿基因型与表型关系进行分析....     

一例表现为主动脉瓣狭窄的非典型Williams-Beuren综合征患儿的遗传学诊断及分析

目的对1例主动脉瓣狭窄的患儿进行遗传学诊断,分析其发病机制。方法采用常规G显带染色体分析、微阵列比较基因组杂交(array comparative genomic hybridization,aCGH)及多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)技术分析患儿及其父母的染色体核型和基因组拷贝数变异。结果患儿及其父母的外周血染色体核型均未见异常。aCGH检测显示患儿7q11.23区存在278 kb杂合缺失,与Williams-Beuren综合征(Williams-Beuren syndrome,WBS)关键区部分重叠,涉及WBS的关键致病基因之一ELN。MLPA检测证实患儿存在上述缺失,患儿父母未发现染色体微重复/微缺失。结论患儿7q11.23区杂合缺失为新发突变。ELN基因单倍剂量不足可能是其发生主动脉瓣狭窄的原因,诊断为非典型WBS。     

一例MEF2C缺失变异相关的5q14.3微缺失综合征的遗传学分析CSCD

目的对1例热性惊厥患儿及其父母进行相关基因检测,分析其可能的致病原因和遗传学特征。方法抽取患儿外周静脉血4 mL分别行染色体核型分析以及FMR1基因的变异检测,同时留取患儿及父母外周静脉血各2 mL予神经系统panel针对性进行基因检测和分析,对发育迟缓、智力障碍、语言发育迟缓、癫痫及特殊面容相关基因进行特异性捕获、测序。结果患儿常规染色体核型分析(400条带)显示核型无异常。检测范围内FMR1基因CGG重复序列区域未见异常扩增。基因测序显示患儿MEF2C基因(chr5:88027545)存在c.864+1delG杂合变异,为调控区域的剪切变异。该变异可能导致蛋白质功能受到影响。患儿父母该位点均未检测到变异,提示患儿MEF2C基因变异为新发变异(de novo)。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异标准与指南,MEF2C基因c.864+1delG变异判定为致病性变异(PVS1+PS2+PM2)。结论MEF2C基因是染色体5q14.3缺失综合征的致病关键基因,为常染色体显性遗传方式。患儿染色体5q14.3区段MEF2C基因c.864+1delG变异可能为患儿热性惊厥的原因。     

微阵列比较基因组杂交检测一例左心发育不良胎儿的基因组拷贝数变异

目的 检测1例左心发育不良胎儿的基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs),寻找可能的遗传学病因,并探讨微阵列比较基因组杂交(array-based comparative genomic hybridization,array-CGH)在分子细胞遗传学诊断方面的优越性.方法 对胎儿羊水细胞及其父母的外周血细胞进行常规G显带核型分析.用array-CGH芯片对胎儿进行高分辨率全基因组扫描分析,并用多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)对新发现的CNVs进行验证.结果 胎儿羊水细胞及其父母的外周血细胞常规G显带核型分析未发现显著异常,Array-CGH结果发现胎儿基因组存在两个亚显微结构的拷贝数变异:del(11)(q24.1-ter)(121951443-134449216,-12.50 Mb),dup(15)(q26.3)(96889082-100215359,-3.33 Mb),MLPA结果验证了这两个基因组拷贝数变异的存在.结论 Del(11)(q24.1-ter)很可能是患儿左心发育不良的病因.array-CGH技术具有高分辨率、准确等优点,是临床遗传学的重要技术手段,有助于基因组异常的检测和临床遗传咨询.     

微阵列比较基因组杂交技术分析一例猫叫综合征患儿的基因组拷贝数变异

目的 对1例猫叫综合征患儿进行基因组拷贝数分析,寻找其致病原因.方法 对患儿外周血进行常规G显带分析,应用微阵列比较基因组杂交技术进行全基因组扫描,并应用荧光原位杂交技术对异常拷贝数区域进行验证.结果 患儿染色体核型为46,XY,der(5)(p?).微阵列比较基因组杂交显示其在5p14.2-p15.3处存在23.263Mb的片段缺失,12号染色体12p31区域存在14.602 Mb的片段重复.重复片段连接至5p14.2处,形成5号衍生染色体,即arr cgh 5p15.3p14.2(PLEKHG4B→CDH12)×1 pat,12p13.33p13.1(IQSEC3→GUC Y2C)× 3 pat.荧光原位杂交证实患儿存在5p末端缺失及12p末端重复.结论 5号染色体不平衡易位导致患儿5p末端缺失可能是患儿的病因.微阵列比较基因组杂交技术具有高分辨、高通量和高准确性的优点,适用于全基因组拷贝变异分析.     

一例22部分三体综合征患儿的表型及遗传学研究

目的明确1例发育迟缓伴多发畸形患儿染色体拷贝数变异的性质和来源,分析其与表型的相关性。方法应用G显带染色体核型分析以及单核苷酸多态性微阵列芯片(single nucleotide polymorphism array,SNP array)技术对患儿及其父母进行检测。结果G显带分析提示患儿的染色体核型为46,X,add(Y)(q11.23),其父母核型均未见异常。SNP array检测提示患儿染色体22q12qter区存在21.6 Mb重复,其父母则未见染色体拷贝数异常。结论患儿染色体22q12qter区域微重复为新发突变,可能与其智力障碍、多发畸形等表型相关。     

两例父源性17q12微缺失综合征胎儿的产前诊断和遗传学分析

目的:探讨两例父源性17q12微缺失综合征胎儿的产前诊断和遗传咨询。方法:一名孕妇的两例胎儿的孕中晚期超声检查均提示肾脏异常和羊水过多,应用单核苷酸多态性分析(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)分别对第1胎的脐血样本和第2胎的羊水样本进行产前诊断。发现第1胎染...     

一例8q21.11缺失综合征患儿的临床表型与遗传学诊断

目的:对1例角膜混浊新生儿进行染色体拷贝数变异分析,明确其遗传学病因。方法:应用常规G显带染色体核型分析技术分析患儿及其父母的外周血染色体核型,用全基因组低深度测序及单核苷酸多态性微阵列芯片(single nucleotide polymorphism array, SNP array)对患儿及其父母进行基因组拷贝数变...     

微阵列基因组杂交技术在22q11．21微缺失家系中的应用研究

目的了解反复孕育严重先天性心脏病儿、胎儿父亲患有原发性甲状旁腺功能低下家系的基因组拷贝数变化,确定其发病的遗传学原因。方法对常规染色体核型分析未见异常的法洛氏四联症胎儿及其整个家系中的7人采用微阵列基因组杂交（array—based comparative genomic hybridization,array—CGH）技术进行基因组拷贝数变化的检测分析（copy number variations,CNVs）。结果经过array—CGH分析,在胎儿及其父亲的22q11．21均发现存在2．52Mb的致病性缺失片段,位于18,919,942—21,440,514区段。家系中其他成员未发现同样的片段异常。结论22q11．21微缺失是导致其父亲患原发性甲状旁腺功能减退的遗传学原因,也是该家系多次孕育严重先天性心脏病患儿的原因,同时表明22q11．21微缺失表型多样,临床症状差异大。array—CGH是一种高通量、高分辨率及高准确性的遗传学分析技术,能够发现染色体片段上的亚微结构异常,是临床遗传学研究的重要工具。     

一例2q37微缺失综合征患儿的遗传学分析

目的:对1例2q37微缺失综合征患儿进行诊断和精细定位。方法:对患儿进行染色体G显带、多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)、单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP-a...     

一例合并6q21-q22．31微缺失的锁骨颅骨发育不良患者的遗传学分析CSCD

目的对1例发育迟缓伴多发畸形患儿进行遗传学检测,分析其预后及发生机制,为临床咨询提供依据。 方法采用常规G显带和微阵列比较基因组杂交（array comparative genomic hybridization, aCGH）技术分析患儿及其父母的外周血染色体核型和DNA。结果G显带分析结果显示,患儿染色体核型为46,XX,del（6）（q22）,inv（6）（p21.1q21）,其父母染色体核型未见异常。aCGH检测结果显示患儿6p21.1区存在800 kb杂合缺失,包含RUNX2基因,6q21-q22.31区存在11.79 Mb杂合缺失,其父母未检测到染色体微重复/微缺失。 结论患儿为染色体新发倒位,两处微缺失均为新发突变,具有致病性。6p21.1区域RUNX2基因微缺失导致锁骨颅骨发育不良,6q21-q22.31区域微缺失可能与患儿脑部结构发育异常相关。     

A novel microdeletion at chromosome 2q31.1-31.2 in a three-generation family presenting duplication of great toes with clinodactyly

HOXD gene cluster maps to chromosome 2q31 and plays a key role in embryonic limb morphogenesis. Mutations of the HOXD13 and HOXD10 genes have been found to be associated with digital and limb malformations. In addition, dysregulation of HOXD gene cluster has been proposed to account for the limb abnormalities in patients with chromosome 2q rearrangements. In this report, we investigated a three-generation family presenting clinical phenotypes of duplication of great toes, tapering fingers, and clinodactyly of the fifth finger in both hands, which were transmitted in a dominant fashion in this family. We identified and validated an interstitial microdeletion of ∼3.4 Mb at chromosome 2q31.1-31.2 by array-based comparative genomic hybridization, fluorescence in situ hybridization, and real-time quantitative polymerase chain reaction that cosegregates with the clinical phenotypes in this family. The microdeletion removes 30 labeled genes including the entire HOXD gene cluster, suggesting that the digital abnormalities of this family may be attributed to the haploinsufficiency of the HOXD gene cluster. The delineation of the microdeletion region may contribute to the genotype–phenotype correlation study in patients with genomic rearrangements of the long arm of chromosome 2 and helps to understand the pathogenesis of haploinsufficiency of the HOXD gene cluster.     

5号和18号染色体变异致多发畸形的临床报道和遗传学分析

目的明确一例多发畸形患儿染色体拷贝数变异的性质,分析其染色体变异与表型的相关性。方法首先应用常规G显带分析该例患儿外周血染色体改变,然后应用比较基因组杂交芯片（array comparative genomic hybridization, array CGH ）对该例常规核型分析的结果进行精确定位。结果该患儿常规核型分析为46,XY,inv（9）（p12q13）,Yqh＋。arrayCGH结果为dup（5）（p14．1p15．33）区段（151,737—28,789,424）存在28．64Mb重复;del（18）（q22．1q23）区段（63,993,067—77,982,126）存在13．99Mb缺失。临床表现为面容特殊、眼裂小、牙齿反颌、隐形脊柱裂及脚趾畸形等。结论5号和18号染色体拷贝数变异可导致患儿出现多发畸形;与传统的细胞遗传学分析方法相比,arrayCGH在染色体异常分析中具有更高的分辨率和准确性。     

微阵列比较基因组杂交技术检测先天性心脏畸形胎儿的隐藏基因组拷贝数变异

目的 检测1例先天性主动脉弓离断和室间隔缺损胎儿的基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs),寻找其致病的遗传学证据,探讨微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization,array-CGH)在分子细胞遗传诊断中应用的可行性.方法 对该患儿脐血及其父母外周血进行常规G显带核型分析,发现胎儿核型为46,XX,t(7;9)(q12;q21),双亲核型正常.进而应用array-CGH芯片对患儿进行全基因组高分辨率扫描分析,采用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)对新发现的CNVs进行实验验证.结果 array-CGH分析发现胎儿基因组存在1个病理性亚显微结构的拷贝数变异:del(22)(q11.2)(17 370 128～19 790 009,2.42 Mb).FISH实验结果验证了此22q11.2微缺失的存在.结论 隐藏的22q11.2微缺失可能是此胎儿致病的原因;染色体平衡易位的先天缺陷胎儿可能会含有位于重排断裂点区域之外的亚显微结构基因组拷贝数变异;微阵列比较基因组杂交具有高分辨率、高通量和高准确性等优点,适用于亚显微基因组拷贝数变异的检测.

Abstract：

Objective To detect the copy number variation (CNV) of a fetus with interrupted aortic arch and ventricular septal defect, in order to explore the underlying genetic causes of the congenital malformation, and investigate the feasibility of array-based comparative genomic hybridization (array-CGH)in molecular cytogenetic diagnosis. Methods The whole genome of the fetus with de novo apparently balanced translocations [46, XX, t ( 7 ; 9 ) ( q12 ; q21 ) ] diagnosed by G-banding was scanned and analyzed by array-CGH, and the copy number variation was confirmed by fluorescence in situ hybridization (FISH).Results A pathologic submicroscopic CNV ldel(22) (q11. 2) (17 370 128-19 790 009,-2. 42 Mb)] was identified and mapped by array-CGH. FISH test confirmed the microdeletion detected by array-CGH.Conclusion The cryptic 22q11.2 deletion might be the reason leading to the congenital malformation of the fetus. This study provides evidence that apparently balanced translocations classified by conventional cytogenetic techniques may host additional submicroscopic CNVs which are not located at the breakpoints.Due to the high-resolution, high-throughput and high-accuracy, array-CGH is considered to be a powerful tool for submicroscopic CNVs detection.     

2q23 de novo microdeletion involving the MBD5 gene in a patient with developmental delay, postnatal microcephaly and distinct facial features

We report on a female patient with a de novo interstitial deletion of chromosome region 2q23.1-23.3 identified by array-CGH. She had significant global delay with developmental regression at age 6 years. She developed seizures at age 3 years with progressive difficulties with balance, loss of fine motor skills and aggressive behavior. She had short stature, microcephaly, and distinct facial features. Her speech was dysarthric, and she demonstrated repetitive hand movements. In this article, we compare the clinical features of our patient with previously reported cases with a 2q23.1 deletion.     

微阵列比较基因组杂交技术检测先天性心脏畸形胎儿的隐藏基因组拷贝数变异

目的 检测1例先天性主动脉弓离断和室间隔缺损胎儿的基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs),寻找其致病的遗传学证据,探讨微阵列比较基因组杂交技术(array-based comparative genomic hybridization,array-CGH)在分子细胞遗传诊断中应用的可行性.方法 对该患儿脐血及其父母外周血进行常规G显带核型分析,发现胎儿核型为46,XX,t(7;9)(q12;q21),双亲核型正常.进而应用array-CGH芯片对患儿进行全基因组高分辨率扫描分析,采用荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)对新发现的CNVs进行实验验证.结果 array-CGH分析发现胎儿基因组存在1个病理性亚显微结构的拷贝数变异:del(22)(q11.2)(17 370 128～19 790 009,2.42 Mb).FISH实验结果验证了此22q11.2微缺失的存在.结论 隐藏的22q11.2微缺失可能是此胎儿致病的原因;染色体平衡易位的先天缺陷胎儿可能会含有位于重排断裂点区域之外的亚显微结构基因组拷贝数变异;微阵列比较基因组杂交具有高分辨率、高通量和高准确性等优点,适用于亚显微基因组拷贝数变异的检测.     

Array—CGH技术用于产前诊断可疑胎儿染色体异常

目的探讨微阵列比较基因组杂交技术（array—based comparative genomic hybridization,array—CGH）在产前诊断胎儿染色体异常中的应用价值。方法产前诊断发现4例常规G显带染色体核型分析不能明确的胎儿染色体异常,按照标准的array—CGH操作分析对这些病例进行全基因组检测。结果通过array—CGH技术分析,明确了4例胎儿可疑染色体异常的诊断并且进行精确定位,1例染色体部分缺失,1例正常,1例染色体部分重复,1例不平衡易位。结论array—CGH技术对产前诊断胎儿染色体异常具有高分辨率,能够精确定位异常片段,明确胎儿预后,对产前诊断具有重要应用价值。