粪便基因甲基化对结直肠肿瘤诊断价值的Meta分析

目的系统评价粪便基因异常甲基化诊断结直肠肿瘤的准确性。方法计算机检索TheCochraneLibrary、PubMed、EMbase、CBM、WebofScience、CNKI和WanFangData,收集粪便基因甲基化诊断结直肠肿瘤的研究,检索时限为1990年1月至2012年2月,同时依据QUADAS条目评价纳入研究质量,采用Meta—Discl．4软件进行数据分析。结果最终共纳入32个研究,3951例患者。Meta分析结果显示：粪便基因甲基化对于检测结直肠肿瘤的合并敏感度（Sen）、特异度（Spe）、诊断比值比（DOR）、SROC曲线下面积（AUC）及Q木值分别为92％195％CI（91％,93％）]、63％[95％CI（61％,65％）]、20．79[95％CI（15．13,28．57）]、O．8619（SE=0．0204圾0．7926（SE=0．0198）;对于检测结直肠癌的合并Sen、Spe及SROCAUC分别为91呱95％CI（89％,92％）]、75％[95％CI（73％,77％）圾0．9007;而对于结直肠腺瘤的合并Sen、Spe及SROCAUC分别为79％[95％CI（76％,83％）]、7596[95％CI（73％,77％）]及0．8457。结论粪便基因异常甲基化对于诊断结直肠肿瘤具有较高的敏感性（92％）和中度特异性（63％）,可作为诊断结直肠肿瘤的无创性初筛方法。     

分子诊断和粪便隐血试验在结直肠癌诊断中的意义

目的探讨联合检测粪便中肿瘤分子标志物和粪便隐血试验对结直肠癌早期诊断的敏感度和特异度。方法检测68例不同结直肠癌患者的粪便标本的粪便隐血和APC、K—ras及p533种肿瘤相关分子标记物的突变。同时检测43名健康体检者的粪便标本。结果35例癌症患者粪便隐血试验呈现阳性[51％；95％可信区间（95％CI）为37％-64％]。45例标本肿瘤分子标志物发生改变（66％；95％CI为51％-77％）。两种方式检测的一致性较弱（Kappa值为0．023），其联合应用的敏感度为94％（95％CI为83％-97％）；特异度为90％（95％CI为76％-95％）。结论粪便隐血试验和分子诊断联合应用的敏感度高于任何一种单独的非创伤性诊断方式，有利于对结直肠癌患者的早期诊断。     

联合检测粪便MGMT基因甲基化和隐血在结直肠癌诊断中的价值

目的探讨粪便O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶基因(MGMT)甲基化和粪便隐血试验(FOBT)联合检测在结直肠癌(CRC)诊断中的价值。方法用甲基化特异性PCR(MSP)及FOBT对56例CRC患者和34例体检健康者进行粪便MGMT基因启动子甲基化联合检测,分析MGMT基因启动子甲基化和FOBT与CRC临床病理特征的关系。结果 CRC患者粪便MGMT基因启动子甲基化率为33.9%,体检健康者为2.9%;联合FOBT检测诊断CRC敏感性为55.4%,明显高于单独MGMT基因甲基化的33.9%(χ2=14.674,P<0.01)和单独FOBT的33.4%(χ2=14.322,P<0.01)。MGMT基因甲基化与CRC患者的肿瘤部位、肿瘤大小、分化程度、Dukes分期均无相关性(P>0.05)。结论联合检测粪便MGMT基因启动子甲基化及隐血可提高CRC的诊断效率,有望成为CRC的非侵入性筛查方法。     

粪便SEPT9基因甲基化检测在结直肠癌早期诊断中的应用研究

目的 探讨粪便SEPT9(Septin9)基因甲基化检测在结直肠癌诊断中的价值.方法 从126例结直肠癌手术切除癌组织、癌旁组织及其术前粪便中提取DNA,应用多重置换扩增(MDA)结合巢式甲基化特异性PCR(nMSP)检测结直肠癌粪便SEPT9基因甲基化水平;以手术后病理诊断为标准,比较结直肠癌组织和粪便中SEPT9甲基化检测在结直肠癌诊断中的敏感性和特异性.结果 在126例结直肠癌中,癌组织SEPT9检出率为84.1%,癌旁组织检出率为7.9%,二者比较有统计学差异(P<0.01),特异性为92.1%;结直肠癌粪便SEPT9基因甲基化检测结果与组织检测结果一致;在各临床分期之间,SEPT9甲基化检出率无统计学差异(P>0.05).结论 结直肠癌组织SEPT9基因甲基化异常发生率高;粪便SEPT9甲基化异常可作为结直肠癌早期诊断的肿瘤标志物.     

DNA甲基化在结直肠癌早期诊断中的应用研究

结直肠癌(CRC)是一种基因病,是常见的消化道恶性肿瘤。欧洲CRC发病率及死亡率居恶性肿瘤的第二位[1]。我国CRC发病率呈逐渐上升趋势[2]。由于饮食和生活习惯变化2007年全世界新增120万CRC病例中有60万人[3]死亡。目前常用诊断方法如粪便隐血试验(fecal occult blood test,FOBT)、结直肠镜检查、影像学检查等存在不足,甚至可导致肠道出血、穿孔、感染等并发症,限制了它们在早期诊     

结直肠癌筛查人群血浆游离DNA浓度及其对甲基化筛检技术的影响

目的 明确结直肠癌筛查人群血浆中游离DNA(cfDNA)浓度的特点,试验cfDNA定量能否提高血浆甲基化标志物筛查结直肠癌的性能。方法 一项基于人群研究从社区招募40～74岁个体。结肠镜检查前进行问卷调查和抽血,纯化血浆cfDNA进行浓度测定,然后用MethyLight检测两种甲基化标志物（SEPT9和C9ORF50）。构建加或不加cfDNA浓度因素的多因素风险预测模型,生成接收操作曲线,比较诊断性能。结果 最终纳入479例,其中进展期肿瘤58例。血浆cfDNA浓度最高的前10位个体平均（139.96±183.10）,cfDNA浓度是其余个体（7.82±4.42）的18倍。cfDNA浓度升高者特征多样,仅与腹痛、高脂血症统计学相关。加或不加血浆cfDNA浓度的风险模型预测进展期肿瘤无显著差异（AUC=0.579和0.591,P=0.466）。对样本设置cfDNA浓度阳性阈值后,甲基化检测对进展期肿瘤敏感性（19.0%,95%CI:8.9～29.1）和特异性（89.1%,95%CI:86.1～92.1）并未提高。结论 社区人群中少数看似正常的个体,由于未知原因,其血浆中cfDNA浓度较高...     

血浆游离DNA甲基化靶向测序在结直肠癌中的应用价值

目的 检测结直肠癌(CRC)患者血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)的甲基化水平,并分析其临床应用价值.方法 收集38例大连大学附属新华医院就诊的CRC患者(Ⅰ～Ⅲ期)及38例体检健康者的血液标本,采用化学发光法检测血清癌胚抗原(CEA)水平;提取CRC组及体检健康者血浆cfDNA,行高通量甲基化靶...     

粪便SDC2基因甲基化检测在结直肠癌筛查中的应用价值

目的 探讨粪便硫酸类肝素蛋白多糖2(SDC2)基因甲基化检测在结直肠癌(CRC)筛查中的临床应用价值。方法 通过荧光聚合酶链反应(PCR)法检测在该院胃肠外科或消化内科就诊的96例患者粪便中SDC2基因甲基化情况,并收集其6种血清肿瘤标志物[血清癌胚抗原(CEA)、糖类抗原(CA)19-9、CA125、铁蛋白(SF)、细胞角蛋白19片段(CYFRA-21)、胃泌素释放肽前体(ProGRP)]的联合检测结果及肠镜、病理检查结果,以肠镜及病理检查结果为“金标准”分析比较粪便SDC2基因甲基化与6种血清肿瘤标志物检测对CRC的诊断效能。同时分析粪便SDC2基因甲基化与TNM分期及癌变部位等临床病理特征的关系。结果 根据肠镜或病理检查结果,将96例就诊者分为CRC组(32例)和对照组(64例),CRC组中粪便SDC2基因甲基化检测阳性率为84%(27/32),6种血清肿瘤标志物联合检测阳性率为44%(14/32);对照组中粪便SDC2基因甲基化检测阳性率为3%(2/64),6种血清肿瘤标志物联合检测阳性率为20%(13/64)。粪便SDC2基因甲基化诊断CRC的特异度(97%)、灵敏度(84%...     

粪便SDC2基因甲基化检测在结直肠癌辅助诊断中的价值

目的 探讨粪便黏结蛋白聚糖2(SDC2)基因甲基化检测在结直肠癌辅助诊断中的价值。方法选取结直肠癌患者51例（结直肠癌组）、结直肠腺瘤患者22例（腺瘤组）、健康体检者39名（正常对照组）,同时收集所有对象的粪便和血清样本,检测粪便SDC2基因甲基化和血清癌胚抗原（CEA）、糖类抗原19-9(CA19-9)水平;其中有26份粪便样本采用P12全自动样本预处理仪和手工法同时进行样本预处理,比较2种方法预处理后检测结果的相关性。采用Peason相关分析评估2种方法之间的相关性,采用kappa检验分析2种方法的一致性。结果 结直肠癌组粪便SDC2基因甲基化阳性率显著高于腺瘤组和正常对照组（P<0.01）。结直肠癌组粪便SDC2基因甲基化阳性率显著高于血清CEA和CA19-9的阳性率（P<0.01）。结直肠癌Ⅰ～Ⅳ期患者之间粪便SDC2基因甲基化阳性率差异均无统计学意义（P>0.05）。结直肠癌Ⅰ～Ⅲ期患者的粪便SDC2基因甲基化阳性率显著高于血清CEA和CA19-9的阳性率（P<0.01）。ROC曲线分析结果显示,粪便SDC2基因甲基化、血清CEA、CA19-9单项检测...     

粪便检测在结直肠癌筛查中的研究进展

粪便是反映消化道病变的一个常见窗口,消化道以外的肿瘤细胞一般不可能从粪便中排出。因此,粪便的检测在消化道疾病的诊断中有重要意义,尤其对结直肠癌的筛查,已成为国内外各学者研究的热点。作者通过查阅国内外文献,将粪便检测在结直肠癌筛查中的研究进展作一综述。     

结直肠癌中p16基因的甲基化改变与蛋白表达的关系

目的 检测结直肠癌患者肿瘤组织中p16基因启动子区异常甲基化改变及蛋白表达情况,探讨其与结直肠癌发生发展与临床的关系。方法 采用甲基化特异PCR(MSP)和免疫组织化学链霉素过氧化物酶(SP)方法,对32份结直肠癌标本p16基因甲基化改变及蛋白表达情况进行检测分析。结果 p16甲基化阳性率为40.6％;p16蛋白表达阳性率75.0％;在病理分期中,DukesC、D期患者肿瘤组织中p16甲基化发生率63.0％,p16蛋白表达发生率为69.0％;DukesA、B期患者p16甲基化发生率为25.0％,p16蛋白表达阳性率为81.0％;在组织分化程度中,低分化癌中的p16甲基化阳性率为100.0％,p16蛋白表达阳性率为20.0％;在高、中分化癌中,p16甲基化的阳性率为30.0％,p16蛋13表达阳性率为85.0％;淋巴结转移癌患者肿瘤组织中p16基因甲基化阳性率为63.0％,淋巴结未转移的阳性率为25.0％;在肿瘤部位中,直肠癌p16蛋白表达阳性率为65.0％,结肠癌的阳性率为100.0％。结论 p16甲基化的改变可能影响p16蛋白的表达;p16甲基化、蛋白表达与结直肠癌的发生发展密切相关,p16甲基化和蛋白表达是结直肠癌患者诊断及预后的候选标志物之一。     

DNA methylation detection methods used in colorectal cancer

Colorectal cancer (CRC) remains a major contributor to the number of cancer-related deaths that occur annually worldwide. With the development of molecular biology methods, an increasing number of molecular biomarkers have been identified and investigated. CRC is believed to result from an accumulation of epigenetic changes, and detecting aberrant DNA methylation patterns is useful for both the early diagnosis and prognosis of CRC. Numerous studies are focusing on the development of DNA methylation detection methods or DNA methylation panels. Thus, this review will discuss the commonly used techniques and technologies to evaluate DNA methylation, their merits and deficiencies as well as the prospects for new methods.     

MS-HRM检测结直肠癌患者外周血AKAP12基因及其临床意义

目的 探讨MS-HRM法定量检测结直肠癌患者外周血中AKAP12基因甲基化程度及其临床意义.方法 采用MS-HRM法定量检测80例结直肠癌患者和20名健康人外周血中AKAP12基因的甲基化水平,并分析评价其与病理分期分级的关系.同时对MS-HRM法的重复性和与传统MSP法检测的灵敏度和检出率进行比较.结果 MS-HRM法从80例结直肠癌患者中检测到38例(47.5%)AKAP12基因启动子区域不同程度的甲基化患者(甲基化1%～20%的24例,20%～60%的12例,60%～100%的2例),20名健康人中仅检测到甲基化<10%的2名.MS-HRM法检测AKAP12基因甲基化的灵敏度(1%)优于传统的MSP法(10%).AKAP12基因甲基化水平与结直肠癌患者的年龄、性别的差异无统计学意义(x2分别为3.13、1.70,P均>0.05),但与结直肠癌的Dukes分期和分化程度的差异均有统计学意义(x2分别为5.93、8.41,P均=0.01).结论 外周血MS-HRM定量检测AKAP12基因甲基化程度的方法比传统MSP法灵敏度更高,AKAP12基因甲基化有望成为结直肠癌进展评估的分子指标.     

Polyunsaturated fatty acids and DNA methylation in colorectal cancer

Colorectal cancer (CRC) has been designated a major global problem, especially due to its high prevalence in developed countries. CRC mostly occurs sporadically (75%-80%), and only 20%-25% of patients have a family history. Several processes are involved in the development of CRC such as a combination of genetic and epigenetic alterations. Epigenetic changes, including DNA methylation play a vital role in the progression of CRC. Complex interactions between susceptibility genes and environmental factors, such as a diet and sedentary lifestyle, lead to the development of CRC. Clinical and experimental studies have confirmed the beneficial effects of dietary polyunsaturated fatty acids (PUFAs) in preventing CRC. From a mechanistic viewpoint, it has been suggested that PUFAs are pleiotropic agents that alter chromatin remodeling, membrane structure and downstream cell signaling. Moreover, PUFAs can alter the epigenome via modulation of DNA methylation. In this review, we summarize recent investigations linking PUFAs and DNA methylation-associated CRC risk.     

Accuracy of early detection of colorectal tumours using stool methylation markers: A meta-analysis

AIM: To evaluate the accuracy of methylation of genes in stool samples for diagnosing colorectal tumours. METHODS: Electronic databases including PubMed, Web of Science, Chinese Journal Full Text Database and Wanfang Journals Full-text Database were searched to find relevant original articles about methylated genes used in diagnosing colorectal tumours. Quality assessment of diagnostic accuracy studies items were used to evaluate the quality of the included articles, and the Meta-disc 1.4 and SPSS 13.0 software programs were used for data analysis. RESULTS: Thirty-four articles met the inclusion criteria, and 4151 patients were included. Pooled diagnostic performances of SFRP2 methylation for colorectal cancer (CRC) provided the following results: the sensitivity was 79% (95%CI: 75%-82%), the specificity was 93% (95%CI: 90%-96%), the diagnostic odds ratio (DOR) was 47.57 (95%CI: 20.08-112.72), and the area under the curve was 0.9565. Additionally, the results of accuracy of SFRP2 methylation for detecting colorectal adenomas were as follows: the sensitivity was 43% (95%CI: 38%-49%), the specificity was 94% (95%CI: 91%-97%), the DOR was 11.06 (95%CI: 5.77-21.18), and the area under the curve was 0.9563. CONCLUSION: Stool-based DNA testing may be useful for non-invasively diagnosing colorectal tumours, and SFRP2 methylation is a promising marker that has great potential in early CRC diagnosis.     

Promoter methylation and expression of SOCS-1 affect clinical outcome and epithelial-mesenchymal transition in colorectal cancer

BackgroundAbnormal DNA methylation can cause gene silencing in colorectal cancer (CRC) patients. A gene that is suspected to have a crucial role in various types of cancers is the suppressor of cytokine signaling 1 (SOCS-1). Thus, this study will analyze the ramifications of SOCS-1 promoter methylation in CRC patients. This study will also test the therapeutic effects of hypomethylation as a possible CRC therapy.MethodsFirst, 97CRC patients’ tumor and adjacent normal tissues were collected. Next, the methylation status of the SOCS-1 promoter region was assessed by methylation-specific polymerase chain reaction (MS-PCR); SOCS-1 protein and mRNA expression were also measured. A 48-month median follow-up period was used for the survival analysis of research participants. Lastly, to analyze the changes in cell invasion and migration in conjunction with protein and mRNA expression, the demethylating agent 5-azacytidine was applied in vitro to human CRC cells.ResultsThe results showed increased SOCS-1 hypermethylation in CRC samples compared to controls. Methylated SOCS-1 was associated with significant suppression of SOCS-1 expression in tumors. Additionally, SOCS-1 hypermethylation was significantly correlated with lymph node metastasis and TNM stage. The study also found a poor overall survival rate to be significantly correlated with reduced expression of SOCS-1. After 5-azacytidine treatment, reduced in vitro DNA methylation and increased SOCS-1 expression were observed, and decreased cell migration and epithelial-mesenchymal transition biomarker expression alteration were further confirmed.ConclusionsIn colorectal cancer tissues, the rate of methylation in the SOCS-1 promoter region is high. Through promoter hypermethylation, the SOCS-1 gene was severely down-regulated in the CRC tissue samples, thereby revealing a plausible therapeutic target for CRC therapy.     

结直肠腺瘤组织的细胞DNA定量分析研究

目的用细胞DNA定量分析的方法比较结直肠腺瘤患者腺瘤组织和正常组织DNA含量的差异,探讨DNA定量分析系统在结直肠腺瘤诊断中的应用。方法选取2013年3至4月于北京大学人民医院行结直肠腺瘤性息肉切除治疗的患者18例,取患者结直肠腺瘤组织和配对的正常结肠黏膜组织制备单细胞悬液,液基细胞保存液固定细胞,制作Feulgen染色片,用全自动细胞图像分析系统(AICM)行扫描处理。结果腺瘤组织18例检出异倍体的有11例,配对正常结肠黏膜组织18例1例检出异倍体细胞(P<0.01)。腺瘤旁的正常结肠黏膜组织中白细胞与上皮细胞的比值比腺瘤组织高(P<0.05)。结论结直肠腺瘤组织异倍体有较高的检出率,全自动细胞DNA分析可用于辅助诊断患者结直肠腺瘤。     

大肠癌和大肠腺瘤组织中端粒酶活性表达及意义

目的:研究大肠癌组织及大肠腺瘤组织中端粒酶活性表达的差异,探讨端粒酶激活在大肠癌发生、发展中的意义.方法:采用端粒重复片段扩增方法研究了37例大肠癌、50例大肠腺瘤、20例正常大肠组织中的端粒酶活性表达.结果:(1)端粒酶活性检出率在大肠癌组织、大肠腺瘤组织分别为86.5%、20.0%,而正常大肠组织中无表达,癌组织中检出率明显高于其他组织(P＜0.001).(2)端粒酶活性与大肠癌的病理分化程度、病理分期、肿瘤大小、部位无显著相关性(P＞0.05).结论:大肠癌组织中端粒酶活性呈高表达,端粒酶在大肠癌发生发展过程中起着重要作用,有希望成为大肠癌诊断和治疗的理想标志.     

大肠癌和大肠腺瘤组织中端粒酶活性表达及意义

目的：研究大肠癌组织及大肠腺瘤组织中端粒酶活性表达的差异，探讨端粒酶激活在大肠癌发生、发展中的意义。方法：采用端粒重复片段扩增方法研究了37例大肠癌、50例大肠腺瘤、20例正常大肠组织中的端粒酶活性表达。结果：（1）端粒酶活性检出率在大肠癌组织、大肠腺瘤组织分别为86．5％、20．0％，而正常大肠组织中无表达，癌组织中检出率明显高于其他组织（P〈0．001）。（2）端粒酶活性与大肠癌的病理分化程度、病理分期、肿瘤大小、部位无显著相关性（P〉0．05）。结论：大肠癌组织中端粒酶活性呈高表达，端粒酶在大肠癌发生发展过程中起着重要作用，有希望成为大肠癌诊断和治疗的理想标志。