人胃癌组织DNA甲基化酶、去甲基化酶与肿瘤相关基因的表达

目的 探讨胃癌组织中甲基化酶、去甲基化酶基因与肿瘤相关癌基因和抑癌基因的关系。方法 取28例胃癌手术标本的癌区、癌旁、正常组织，分别以RT—PCR法和定量RT—PCR法检测DNA甲基化酶1(DNMT1)、去甲基化酶mbd2、甲基化结合蛋白MeDP2和p16^INK4A、c—myc等基因的转录水平，以相关分析等统计学处理研究各基因表达之间及分别与病理组织学之间的关系。结果 癌组织平均DNMT1和mbd2 mRNA分别明显高于和低于正常组织。胃癌组织中c—myc的表达增强，而MeCP2和p16^INK4A无明显变化。在正常组织中，MeCP2与mbd2，p16^INK4A与MeCP2、mbd2，c—myc与MeCP2的转录水平表现出一定的相关性，而当肿瘤发生后仅发现c—myc与mbd2的表达呈负相关。以上各基因与肿瘤生物学行为均无相关性。结论 肿瘤相关基因mRNA的表达与甲基化酶DNMT1无关，而与甲基结合蛋白有关。     

胃癌组织中肿瘤相关基因甲基化及其表达与叶酸和代谢酶MTHFR基因多态性的关系

目的:探讨人胃癌组织中癌基c-myc,抑癌基因p16INK4A,p21WAF1,错配修复基NhMLH1和hM2SH2的甲基化状态及其表达与叶酸、MTHFR基因多态性的关系．方法:胃癌38例手术切除标本的癌区、癌旁和外周正常黏膜组织,运用FOL ACS:180自动化学发光系统测定叶酸含量,PCR-RFLP技术检测MTHFR基因677(C→T)和1298(A→C)两个常见多态,并分别以Real—time RT-PCR和甲基化特异性PCR (MSP)技术检测肿瘤相关基因的表达和甲基化状态．结果:c-myc表达升高,p16INK4A,hMLH1和hMSH2表达降低的胃癌黏膜组织其基因启动子区异常甲基化．p21WAF1,hMSH2表达降低, p16INK4A高甲基化者叶酸水平明显降低,c-myc低甲基化和表达升高者中均存在低叶酸水平．MTHFR 677CC基因型的胃癌黏膜组织p16INK4A甲基化升高且表达降低,而其余肿瘤相关基因的甲基化及其表达与MTHFR两个常见多态均无明显相关性．结论:DNA甲基化在胃癌的发生、发展中具有重要作用,叶酸水平和MTHFR基因多态性通过影响部分肿瘤相关基因的甲基化状态而调控其表达．     

DNA甲基转移酶1蛋白在人胃癌黏膜组织中的表达及其临床意义

背景：肿瘤组织存在DNA甲基化紊乱．包括与细胞增殖周期密切相关的癌基因低甲基化和抑癌基因高甲基化等。DNA甲基转移酶（Dnmt）参与甲基化的形成（主要是Dnmt3a和Dnmt3b）和维持（主要是Dnmt1），但目前对胃癌Dnmt蛋白的表达情况仍知之甚少，更缺乏其与肿瘤生物学行为和临床参数关系的研究。目的：探讨癌区、癌旁和外周正常黏膜组织中Dnmt1蛋白表达的差异及其临床意义。方法：收集38例胃癌患者标本，取癌区、癌旁和外周正常黏膜组织各1．2块，应用免疫组化SP法分析各黏膜组织中Dnmt1蛋白的表达．并探讨其与胃癌浸润和转移的关系。结果：在38例胃癌黏膜组织中，Dnmt1蛋白的表达阳性率为81．6％，显著高于相应癌旁（39．5％）和正常黏膜组织（10．5％）（P〈0．001）。阳性切片中可见Dnmt1蛋白表达弥散分布于肿瘤或腺体的细胞质和细胞核，染色较均匀。Dnmt1蛋白表达与胃癌患者的年龄、肿瘤分化程度和有无淋巴结转移无明显相关性（P〉0．05），与性别呈一定的相关性（P=0．007）。结论：Dnmtl蛋白过表达在人胃癌的发生和发展中起一定作用。     

Folate levels in mucosal tissue but not methylenetetrahydrofolate reductase polymorphisms are associated with gastric carcinogenesis

INTRODUCTION Methylation of gene regulatory elements is a well-documented epigenetic change that can lead to gene inactivation. Human gastric carcinogenesis is suggested to be associated with the decrease of total genomic DNA methylation, hypomethylation …     

胃癌和癌旁组织中hMSH2和p27蛋白的表达及其意义

背景:错配修复(MMR)基因是保证DNA复制高保真度的重要基因,与消化道肿瘤的发生密切相关。抑癌基因p27可阻止细胞周期G1/S期转换,p27表达下调在肿瘤的进展、转移过程中起有一定作用。目的:探讨MMR基因hMSH2和p27在胃癌和癌旁组织中的表达及其意义。方法:以免疫组化方法检测93例胃癌患者癌组织和癌旁组织中hMSH2和p27蛋白的表达。结果:胃癌组织中hMSH2蛋白的阳性表达率为65.6%,显著高于癌旁组织的38.7%(P<0.01);p27蛋白的阳性表达率为46.2%,显著低于癌旁组织的80.6%(P<0.01)。胃癌组织中hMSH2蛋白的表达与肿瘤临床病理特征无相关性;p27蛋白的表达与肿瘤分化程度、浸润深度、淋巴结转移和TNM分期相关。hMSH2和p27蛋白在胃癌组织中的表达呈负相关。结论:MMR基因hMSH2表达异常和抑癌基因p27表达下调可能与胃癌的发生有关。     

人胃癌,肝癌的c—myc癌基因甲基化的研究

目的：了解人胃癌和肝癌相关癌基因的甲基化情况。材料与方法：将22例进展期胃癌的癌区、癌旁和外周正常区组织和33例原发性肝癌的癌区、癌旁区及10例正常肝组织的DNA，以限制性内切酶Hpall／Mspl消化、Southernblot分析其c－myc癌基因片段的甲基化情况。结果：发现47％（10／22）的胃癌区、59％（13／22）的胃癌旁和30％（10／33）的肝癌区、13％（4／33）的肝癌旁组织的c－myc癌基因呈低甲基化状态。结论：在消化系常见的恶性肿瘤的发生中，某些癌基因甲基化水平降低。     

alkB基因在胃癌和萎缩性胃炎黏膜组织中的表达改变

背景:DNA或RNA分子异常甲基化导致的抑癌基因沉默、突变或其他功能性障碍是胃癌发生的关键机制之一。最近研究发现alkB基因产物具有修复DNA和mRNA碱基异常甲基化、纠正基因突变、复制转录障碍等功能,但对其在胃癌及其癌前病变组织中的表达情况尚不了解。目的:探讨alkB基因在胃癌及其癌前病变组织中的表达改变。方法:收集11例胃癌、癌旁和远离癌灶正常黏膜组织以及107例慢性萎缩性胃炎和121例非萎缩性胃炎患者的内镜活检黏膜,应用基因表达谱芯片实验评估alkB基因在各组织中的表达。以逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检验上述结果。结果:与远离癌灶正常黏膜组织相比,alkB基因在胃癌中的表达降低(Ratio值为0.208);与非萎缩性胃炎黏膜组织相比,alkB基因在萎缩性胃炎黏膜组织中的表达降低(Ratio值为0.378);而alkB基因在癌旁和远离癌灶正常黏膜组织中的表达无显著差异(Ratio值为0.726)。结论:alkB基因在胃癌和萎缩性胃炎黏膜组织中的表达下调,可能参与了胃癌发生过程中基因甲基化紊乱的机制。alkB基因是有潜在研究价值的分子靶标。     

MEK通路抑制剂对人胰腺癌细胞生长及细胞周期相关抑癌基因表达的影响

目的 观察细胞外信号调节激酶信号通路(MEK)抑制剂对人胰腺癌细胞生长及细胞周期相关的抑癌基因表达的影响。方法 培养人胰腺癌细胞系CFPAC1、PANC1和MiaPaCa2,应用50μmol/L的MEK抑制剂PD98059处理细胞24h,四甲基偶氮唑蓝(MTT)法检测细胞增殖,流式细胞仪分析细胞周期,实时定量PCR法检测p16INK4a、p21 WAF1和p27KIP1 mRNA的表达,蛋白质印迹法检测DNA甲基化酶(Dnmt)1、3a和3b表达,甲基化特异性PCR(MSP)分析p16INK4a基因启动子甲基化状况。结果 PD98059处理24h后,CFPAC1、PANC1和MiaPaCa2细胞的增殖抑制率分别为69％、78％和45％;G0/G1期细胞比例分别从(68.21±0.73)％、(56.54±0.68)％、(54.89±0.79)％增加到(80.37±0.65)％、(72.05±0.52)％、(79.21±0.93)％(P值均＜0.05);S期和G2/M期细胞比例相应减少。PD98059处理后,CFPAC1、PANC1细胞p27KIP1、p21WAF1和p16INK4a mRNA表达增加,Dnmt1和Dnmt3b蛋白表达减少;p16INK4a启动子甲基化状态被去除。而MiaPaCa2细胞仅p27KIP1 mRNA表达增加;p21WAF1、p16INK4a mRNA和Dnmt表达均无明显变化。结论 MEK通路抑制剂可能通过下调DNA甲基化酶、上调细胞周期相关抑癌基因表达而抑制胰腺癌细胞周期进展和细胞增殖。     

Hypermethylation and aberrant expression of Wnt-antagonist family genes in gastric cardia adenocarcinoma

The canonical Wnt signalling pathway plays a key role during embryogenesis and pathogenesis of various types of tumors. Recently, several studies have shown that the promoter hypermethylation of Wnt-antagonist genes, including sFRP-1, sFRP-2, sFRP-4, sFRP-5, Wif-1 and Dkk-3, have been certified to contribute to the tumorigenesis of several cancers. The aim of this study was to investigate the promoter methylation of Wnt-antagonist genes in gastric cardia adenocarcinoma (GCA) and corresponding adjacent non-cancerous tissues, and to establish the possible relationship between DNA methylation status and the pathogenesis of GCA. MSP, RT-PCR methods were applied respectively to examine the CpG methylation of the Wnt-antagonist genes and its mRNA expression in tumors and corresponding non-cancerous tissues, and immunohistochemistry method was used to determine protein expression of β-catenin(the key factor of the Wnt signalling pathway) and cyclin D1(the target gene of this pathway). The frequency of promoter methylation of sFRP-1, sFRP-2, sFRP-4, sFRP-5, Wif-1 and Dkk-3 genes in GCA tumor tissues were 78.7%(74/94), 76.6%(72/94), 70.2%(66/94), 77.1%(73/94), 61.7%(58/94) and 21.3%(20/94), respectively, which were significantly higher than those in adjacent non-cancerous tissues. Furthermore, the frequencies of silenced mRNA expression of these six genes in GCA tumor tissues were significantly higher than those in adjacent non-cancerous tissues. Methylation levels of these six genes were all correlated with loss of mRNA expression. The ectopic expression of β-catenin and cyclin D1 was significantly more frequent in GCA tumor tissues than that in adjacent non-cancerous tissues and correlated with each Wnt-antagonist genes hypermethylation status. Epigenetic silencing of Wnt-antagonist genes expression by promoter hypermethylation may play an important role in gastric cardia adenocarcinoma.     

胃癌形成过程中p16IN4a、Runx3和O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶基因甲基化及其表达研究

目的 研究胃癌形成过程中p16INK4a、Runx3和O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)基因启动子区的高甲基化状态,同时检测MGMT的蛋白表达情况.探讨抑癌基因启动子区高甲基化与胃癌发生的关系.方法 选择经透明帽法进行首次黏膜病变切除者43例,其中异型增生27例,早期胃癌16例.选择胃镜活检证实为慢性萎缩性胃炎伴肠上皮化生者14例.另取20例正常胃黏膜活检组织作为对照.采用甲基化特异聚合酶链反应(MSP)检测每例组织中p16INK4a、Runx3和MGMT基因启动子区的甲基化状态,对所有甲基化p16INK4a产物进行测序,免疫组化检测MGMT蛋白表达情况.结果 肠上皮化生、异型增生和早期胃癌中p16INK4a基因甲基化率依次为14.3%(2/14)、22.2%(6/27)和37.5%(6/16);Runx3基因甲基化率依次为14.3%(2/14)、48.1%(13/27)和50.0%(8/16);MGMT基因甲基化率依次为7.1%(1/14)、48.1%(13/27)和50.0%(8/16).20名正常对照均未检出基因甲基化,与异型增生和早期胃癌相比差异有统计学意义(P＜0.05).Runx3和MGMT两种基因在异型增生和早期胃癌中的甲基化率显著高于肠上皮化生组(P＜0.05).各组病变中三种基因甲基化联合分析发现,异型增生和早期胃癌中甲基化的基因种类高于肠上皮化生组.差异有统计学意义(P＜0.01).基因甲基化与息者年龄、性别、幽门螺杆菌感染以及病变部位无相关性,但p16INK4a和MGMT基因甲基化与血清癌胚抗原水平升高显著相关(P值分别为0.003和0.039).MGMT基因启动子区高甲基化与其蛋白失表达密切相关(χ2=12.821,P=0.001).结论 抑癌基因启动子区高甲基化是基因失活的主要机制,可能是胃癌发生的早期分子事件.p16INK4a、Runx3和MGMT基因启动子区高甲基化在胃癌形成过程中起着重要的作用.     

胃腺癌组织中Runx3、Smad4与p21的表达及临床意义

目的 研究胃腺癌及非癌组织中Runx3、Smad4和p21的表达及临床意义.方法 收集130例胃腺癌患者手术切除标本制作的石蜡块共378份,其中癌组织130份,癌旁组织和非癌组织248份,每份组织制成4块组织芯片,分别为174点、282点、156点和156点.采用免疫组化法检测其中Runx3、Smad4和p2l的表达.结果 Runx3在胃腺癌中的异常表达率高于非癌组织(P<0.05),Smad4及p2l的异常表达在胃黏膜癌变过程中呈上升趋势(P<0.05).Runx3的异常表达与胃腺癌组织学分化程度和淋巴结转移有关(P<0.05),Smad4和p21的异常表达均与胃腺癌的分化程度相关(P<0.05).胃腺癌中Runx3表达与Smad4和p21表达呈正相关(r=0.387,P<0.05;r=0.840,P<0.05).Runx3、Smad4、p21正常表达患者的3年生存率均大于异常表达患者(P<0.05).多因素分析显示,Runx3和Smad4的表达可作为胃腺癌患者独立的预后因素(P<0.05).结论 Runx3、Smad4和p21在胃腺癌的发生、发展中可能起一定的作用.Runx3和Smad4可作为判断胃腺癌患者预后的指标之一.     

胃癌维甲酸信号通路相关基因启动子区协同高甲基化的研究

背景：启动子区高甲基化与胃癌中多种抑癌基因表达沉默密切相关。目的：探讨维甲酸信号通路相关基因维甲酸受体B（RAR13）、细胞维生素A结合蛋白1（CRBP1）和他扎罗汀诱导基因1（TIG1）启动子区高甲基化与胃癌的关系。方法：以甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测40例胃癌标本、10例正常胃黏膜标本和6株胃癌细胞株的RAR13、CRBPI和TIG1基因启动子区甲基化状态，分析i者甲基化状态的相关性及其与胃癌1晦床病理特征的关系。以逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）检测胃癌细胞株RAR13、CRBP1和TIG1mRNA表达。结果：40例胃癌组织的RAR13、CRBPI和TIG1基因甲基化率分别为45．0％、32．5％和57．5％，10例正常胃黏膜组织均未检测到上述基因甲基化（P〈0．05）。胃癌组织中RAR13的甲基化状态与CRBP1和TIG1的甲基化状态显著相关（P〈0．05），但三者的甲基化状态与胃癌临床病理特征无相关性。启动子区高甲基化胃癌细胞株相应基因mRNA表达缺失或减弱。结论：胃癌组织常发生维甲酸信号通路相关基因RAR13、CRBP1和TIG1启动子区高甲基化，高甲基化可能是相应基因转录失活的重要原因。     

胃癌TIMP3基因启动子甲基化及其蛋白表达的研究

目的:探讨组织金属蛋白酶抑制因子-3(tissue inhibitor of metalloproteinase 3,TIMP3)基因启动子甲基化与其蛋白表达的相关性,并分析 TIMP3基因CpG岛异常甲基化与胃腺癌及其临床病理特征的关联性．方法:应用甲基化特异性PCR(MSP)技术和免疫组织化学方法分别检测78例患者的胃正常黏膜组织、胃癌组织及转移淋巴结中,TIMP3 基因启动子甲基化和蛋白表达情况．结果:胃正常黏膜组织、早期、进展期胃癌组织和转移淋巴结中TIMP3基因启动子均有甲基化修饰,其阳性率分别为35．9％(28／78); 85．0％(17／20),89．7％(52／58);转移淋巴结 100％(78／78)．胃癌组TIMP3基因启动子甲基化率明显高于胃正常黏膜组(尸<0．05)．胃正常黏膜组织TIMP3蛋白表达全部为阳性(100％), 20例早期胃癌中,6例阳性(30％),58例进展期胃癌中,2例阳性(3．4％),在转移淋巴结中全部不表达(0％)．胃癌70例蛋白表达阴性的标本中,64例TIMP3基因启动子甲基化阳性 (91．4％),TIMP3蛋白表达与启动子甲基化呈明显负相关(P<0．01)．结论:启动子区CpG岛高甲基化是胃癌组织中TIMP3基因表达失活的主要机制,可能成为胃癌分子诊断与病期评估的标志之一．     

Expression of CDC25 Phosphatases in Human Gastric Cancer

Background Gastric cancer may be considered the final step of a progressive imbalance between mucosal cell proliferation and apoptosis. CDC25 phosphatases comprise a multigene family, including CDC25A and CDC25B, that plays a crucial role in the control of cell cycle progression and has been linked to the development of human cancers. The role of CDC25 phosphatases in the pathogenesis of gastric cancers is, however, still largely unknown. Material and methods Immunohistochemical expression of CDC25A and CDC25B was investigated in matched normal and cancerous tissues from 70 patients with gastric cancer (52 intestinal and 18 diffuse type). Results In non-cancerous gastric tissues the expression of CDC25A and CDC25B was absent or weak. In gastric cancer tissues, the enhanced immunoreactivity of CDC25 phosphatases was independent of intestinal or diffuse type of gastric cancer. However, the intensity of immunostaining was related to the grade of differentiation of the tumors. Interestingly, c-myc expression was directly correlated with CDC25A and B expression. Conclusions The overexpression of CDC25A and B seems to be a common and very early event in the development of both intestinal and diffuse types of gastric cancer and may play an important role in gastric carcinogenesis.     

LMXlA基因启动子甲基化以及在胃癌发展中的临床意义

目的通过检测胃癌癌旁距离原发灶不同距离组织及胃癌原发灶LMXlA基因启动子区甲基化状态的差异,分析正常胃组织、癌前病变及癌组织中该基因甲基化的动态变化以及LMXlA基因甲基化与胃癌原发灶病理学的关系,探讨LMXlA基因启动子区甲基化在胃癌阶段性发生及进展中的作用及临床意义。方法采用甲基化特异性PCR法（MSP）检测距胃癌癌灶边缘1、3、5cm组织及胃癌原发灶组织中LMXlA基因甲基化状态。结果LMXlA基因启动子区甲基化发生率在胃癌组织及距胃癌灶边缘1、3、5cm组织中分别为46．0％（23／50）、22．O％（11／50）、8．0％（4／50）和4．0％（2／50）,从距癌灶边缘5cm胃组织至胃癌原发灶组织中的表达中随距癌灶边缘距离的减少呈上升趋势,原发灶中甲基化阳性率显著高于距原发灶边缘3cm和5cm组织（x^2=15．42,P〈0．05;x^2=12．63,P〈0．01）。LMXlA基因启动子区甲基化发生率在正常胃组织、癌前病变组织及胃癌原发灶中分别为O％（0／25）、16．0％（4／25）和46．O％（23／50）,三者之间的差异具有统计学意义（×^2=24．85,P〈0．01）。LMXlA基因甲基化发生率在胃癌患者透浆膜组57．6％（19／33）显著高于未透浆膜组14．8％（4／27）（X^2=16．50,P〈0．05）;在转移淋巴结数大于7枚以上组52．9％（9／17）显著高于小于7枚组37．5％（6／16）（X^2=12．74,P〈0．05）。LMXlA基因甲基化在性别、年龄、不同大体类型、生长方式及分化程度上胃癌患者间差异无统计学意义。结论LMXlA基因启动子区异常甲基化可能与胃癌的临床进展有一定的相关性。     

RASSF1A, APC, ESR1, ABCB1 and HOXC9, but not p16INK4A, DAPK1, PTEN and MT1G genes were frequently methylated in the stage I non-small cell lung cancer in China

Purpose

To identify the DNA methylation biomarkers for the detection of the stage I non-small cell lung cancer (NSCLC).

Materials and methods

The methylated state of p16INK4A, ESR1, HOX9, RASSF1A, DAPK1, PTEN, ABCB1, MGMT, APC and MT1G genes that have been reported frequently methylated in lung cancer was determined using methylation-specific PCR in four lung cancer cell lines, 124 cancer tissues of the stage I NSCLC and 26 non-cancerous disease tissues.

Result

The RASSF1A (53/124, 42.74%), APC (49/123, 39.52%), ESR1 (37/124, 29.84%), ABCB1 (31/124, 24.19%, MT1G (25/124, 20.16%) and HOXC9 (17/124, 13.71%) genes were more frequently methylated in the lung tissue from the stage I NSCLC than the non-cancerous lesion patients (2/26, 7.69%, P < 0.01; 2/26, 7.69%, P < 0.01; 2/26, 7.69%, P < 0.05; 1/26, 3.85% P < 0.01; 0/26 0%, P value: <0.01; 0/26, 0%, P < 0.05, respectively). p16INK4A was methylated in 28/124 (22.56%) of cancer tissues and 2/26 (7.69%) of non-cancerous tissues (P value >0.05). No significant association between the methylated state of the genes and the smoking, age or the pathologic types (squamous carcinoma, adenoma and the mixed types) was found. However, p16INK4A methylation was more frequently detected in the male (23/80, 28.75%) than the female (5/44, 11.36%, P > 0.05) patients. MGMT was barely methylated: 1/67, 1.49%), while DAPK1 and PTEN were not at all methylated in the cancer groups.

Conclusions

Methylation analysis in tissue of RASSF1A, APC, ESR1, ABCB1 and HOXC9 genes confirmed 79.8% of the existing diagnosis for the stage I NSCLC at specificity: 73.1%. The insufficiency of predicting disease onset in China, using the previously recommended targets (MGMT, DAPK1 and PTEN) in the United States reflects a potential disease disparity between these two populations. Alternatively, methylated state of this set of genes may be more specific to the late rather than the early stage of NSCLC.