短期丰富生存环境对中老年大鼠空间学习能力的作用及性别差异

目的:探讨短期丰富生存环境对中老年大鼠空间学习能力的作用及性别差异.方法:将14月龄的Sprague-Dawley(SD)大鼠分雌、雄性后再随机分为丰富生存环境组与空白对照组,前者在丰富生存环境条件下饲养,后者在普通环境下饲养,4个月后分别测试在Morris水迷宫中的成绩.结果:短期丰富生存环境下,雌性大鼠的空间学习能力显著强于空白对照组,而同样条件干预的雄性大鼠空间学习能力与空白对照组相比无显著性差异.另外,在普通环境中饲养4个月的雄性大鼠空间学习能力明显强于雌性大鼠,而丰富生存环境条件下雌、雄性大鼠空间学习能力相比无显著性差异.结论:中老年雄性大鼠空间学习能力强于雌性大鼠,但中老年雌性大鼠大脑功能的可塑性可能要强于雄性大鼠,短期丰富生存环境的干预对于中老年雌性大鼠空间学习能力有显著性影响.本研究结果为将来寻找延缓大脑衰老过程的行为学手段提供了重要的理论依据.     

短期丰富生存环境干预下中老年大鼠海马结构有髓神经纤维的性别差异

目的研究短期丰富生存环境干预下正常中老年大鼠海马结构有髓神经纤维的性别差异。方法将20只14月龄的SD大鼠(雌雄各10只)随机均分为丰富生存环境组与普通环境组,前者在丰富生存环境条件下饲养4个月,后者在普通环境中饲养4个月,运用透射电子显微镜和体视学方法对两组大鼠海马结构有髓神经纤维进行定量研究。结果普通环境组雌性大鼠海马结构内有髓神经纤维的总体积、平均直径均显著大于雄性大鼠(P<0.05),而海马结构总体积、海马结构内有髓神经纤维的总长度雌雄两组之间不存在显著性差异(P>0.05)。丰富生存环境组雌性大鼠海马结构内有髓神经纤维的平均直径显著小于雄性大鼠(P<0.05),而海马结构总体积、海马结构内有髓神经纤维的总体积、总长度雌雄两组之间不存在显著性差异(P>0.05)。结论普通环境组和丰富环境组中老年大鼠海巴结构有髓神经纤维存在的性别差异,提示雌、雄性中老年大鼠对短期丰富生存环境干预的反应不同。     

肿瘤转移相关基因的表达谱研究

目的：运用基因表达谱芯片技术对肿瘤转移相关基因的表达谱进行研究。方法：对临床切除的肝癌和胰腺癌组织及相应的对照正常组织进行总ＲＮＡ抽提,纯化后的ｍＲＮＡ进行逆转录制备杂交探针,应用ＢｉｏＤｏｏｒ４０９６和ＢｉｏＤｏｏｒ１２８００的全长基因ＤＮＡ芯片筛选与肝癌和胰腺癌转移相关的基因。杂交后的信号用ＳｃａｎＡｒｒａｙ３０００扫描,结果用ＩｍａＧｅｎｅ３．０软件分析。结果：对肝癌和胰腺癌基因表达谱进行分     

肾透明细胞癌肿瘤相关基因的研究

目的 研究肾透明细胞癌组织与癌旁正常肾组织的基因表达谱差异,揭示和发现肾透明细胞癌的肿瘤相关基因。方法 应用Agilent Human 1B寡核苷酸基因芯片,检测3例肾透明细胞癌患者的癌组织和1例肾透明细胞癌的癌旁正常肾组织的基因表达谱差异。结果 在检测的20 173个基因中,共筛选出差异表达基因204个,其中共同上调基因31个,共同下调基因173 个,包括6个尚未被GenBank收录的人类新基因。结论 肾透明细胞癌的发生与染色体基因结构异常相关,异常基因有相对集中区域,如3p、14q和5q等。     

肿瘤转移相关基因cDNA芯片的制备与应用

目的：建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法，并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法：选择了399个已知转移相关基因克隆，经PCR扩增纯化后，以Cartesian Pixsys5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上；采用Gy3-dUTP和Cy5-dUTP双重荧光标记人大肠癌和肺癌细胞、正常组织、大肠癌和肺癌组织总RNA并与阵列进行杂交。结果：经ScanArrayTM4000共聚焦荧光扫描仪检测，图像背景均匀，信号清晰，效果满意。对大肠癌细胞系和组织标本及肺癌标本表达基因扫描结果行联合聚类分析发现：两种癌的基因表达大多数相同，仅少数有差别，有30种在两种转移癌中呈持续上调或下调的基因，包括运动因子基因、粘附分子、蛋白水解酶、癌基因、抑癌基因、抑制或促进凋亡基因以及诱导血管增生和信号转导的基因等。结论：优化的cDNA基因芯片制备技术用于基因表达分析有较高的效率和可靠的实用性能。检测的肿瘤转移相关基因的表达在两种癌无明显差别，表明不同癌其浸润和转移的分子机制大致相同。     

肾上腺腺瘤相关基因的筛选及生物信息学分析

目的根据高通量基因表达谱数据,采用数据挖掘技术识别肾上腺腺瘤相关的特征基因与功能,进一步探讨G-蛋白偶联受体（GPCR）在肾上腺腺瘤中的表达情况,为临床药物治疗肾上腺腺瘤提供了依据。方法应用GeneSifter在线分析软件对5个正常肾上腺（NA）和10个肾上腺腺瘤（APA）基因芯片数据分成两组进行分析。结果筛选得到2370个差异表达基因,其中G-蛋白偶联受体41个,其中38个上调,3个下调。MC2R和HTR4已经被确认在APA病人中过表达,并在临床中作为药物作用靶点应用于治疗APA。而谷氨酸受体和GPR37还没有人研究它们在肾上腺中的作用机制。结论APA中醛固酮的生成与过表达的GPCR有潜在的关系,这些GPCR还需要被进一步研究。     

应用基因芯片筛查宫颈癌的相关基因

目的;应用基因芯片研究子宫颈癌相关基因群的表达和功能,探讨基因芯片技术在筛查宫颈癌相关基因中的应用价值。方法:①标本的收集和处理;②总RNA的提取和质量判定;③制备探针;④芯片杂交;⑤检测与分析。结果:3例标本共同差异表达的基因共12条,表达上调3条,表达下调9条。这些基因主要涉及细胞凋亡、肿瘤转移、信号传递等多个方面。结论:①宫颈癌的发生和发展是多个基因的结构和功能异常改变的结果;②运用基因芯片技术可以快速、高通量、高敏度的筛查子宫颈癌的相关基因。基因芯片技术在宫颈癌的分子机制的研究中有着很高的应用价值。     

胶质瘤中分化相关基因的表达研究

目的利用半定量RT-PCR检测了从胶质瘤恶性进展和诱导分化两个基因表达谱中利用生物芯片和生物信息学技术筛选出来的7条基因在胶质瘤组织中的表达情况,一方面验证以前的基因芯片数据的可靠性;另一方面通过对基因表达水平的半定量,进行横向的对比,希望能够找出这些基因在不同级别胶质瘤中的表达规律,为进一步的功能研究提供依据.方法按照7条基因的GenBank登录号,检索GenBank得到这些基因的全长cDNA序列,然后设计相应的PCR引物,针对22例恶性胶质瘤病人的肿瘤组织作检测,22例胶质瘤按照WHO分级其中I 级3例,II级8例,III级7例,IV级4例,最后利用SmartView电泳图像分析软件对各个基因在不同组织中的表达进行半定量.结果这些基因在这些肿瘤中的表达差异是有规律性的,和以前的基因芯片结果基本一致.如X54304（肌球蛋白轻链）、AI264216（胆碱转运因子2）都是随着恶性程度的进展而表达升高,而NM_019896（DNA多聚酶p12亚基）、NM_015962（CGI-35蛋白）、AB037886（NESH蛋白）、D38305（Tob蛋白）、M87507（半胱天冬酶1,Caspase1）都是随着恶性程度的进展而表达降低.结论我们对于基因芯片和生物信息学技术筛选到的7条基因作半定量RT-PCR分析,证实我们使用的基因芯片是可靠的;同时显示这些基因在胶质瘤的恶性进展过程中都发生了规律性的改变,信息学检索提示其中有些基因可能是肿瘤恶变的重要调控因子.     

人鼻咽癌组织中转录因子相关基因的差异表达分析

目的 用cDNA微阵列膜比较鼻咽癌组织及正常组织的基因表达谱,研究鼻咽癌组织中转录因子相关基因的差异表达,为进一步探讨差异表达基因的调控机制奠定基础.方法 24例鼻咽癌组织总RNA和正常对照总RNA(24例正常鼻咽组织RNA等质量混合)分别经逆转录探针标记与微阵列膜杂交.然后用Pathway4.0软件分析杂交结果,并用RT-PCR反应验证微阵列杂交结果.结果 在1625个鼻咽癌差异表达基因中,共有转录因子相关基因35个,12个基因表达上调,23个基因表达下调.结论 在鼻咽癌组织中,多个转录因子相关基因的表达水平发生了变化,这些转录因子在鼻咽癌组织的基因表达调控中发挥重要作用.     

肺癌相关基因的表达谱研究

目的：通过研究人肺癌组织和正常组织中差异表达的基因,寻找肺癌相关基因以用于肺癌的诊断和治疗。方法：以包含４０９６个ｃＤＮＡ基因表达谱芯片研究一组肺癌组织样本的基因表达谱。结果：共筛选出差异表达的基因３７０条,包含已知基因１４６条,未知基因２２４条,其中１０７条表达增加,２６３条表达降低。结论：基于ｃＤＮＡ微矩阵技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选与肺癌发生密切相关的基因。     

Stanford A型主动脉夹层差异表达基因生物学通路分析

 目的  通过对急性Stanford A型主动脉夹层患者主动脉组织差异表达基因的通路分析,探讨主动脉夹层的发病机制。方法  应用人类全基因组表达谱微阵列芯片检测急性Stanford A型主动脉夹层患者与器官捐献者主动脉组织的基因表达,GenomeStudio Gene Expression Module v1.0软件进行数据结果分析。采用荧光定量real time PCR验证芯片结果。以KEGG数据库对差异表达基因进行通路分析。结果  筛选出差异表达基因数1 309个,real-time PCR验证结果与芯片检测结果一致。通路分析发现两组之间黏着斑通路的基因表达发生显著变化,同时血管平滑肌收缩通路和肌动蛋白细胞骨架调节通路的基因表达也有显著差异。结论  差异基因通过黏着斑通路、血管平滑肌收缩通路和肌动蛋白细胞骨架调节通路相互作用,可能在急性Stanford A型主动脉夹层的发病机制中发挥了重要作用。     

肿瘤转移相关基因cDNA芯片的制备与应用

目的建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法,并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法选择了399个已知转移相关基因克隆,经PCR扩增纯化后,以Cartesian Pixsys 5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上;采用Cy3-dUTP和Cy5-dUTP双重荧光标记人大肠癌和肺癌细胞、正常组织、大肠癌和肺癌组织总RNA并与阵列进行杂交。结果经ScanArrayTM 4000共聚焦荧光扫描仪检测,图像背景均匀,信号清晰,效果满意。对大肠癌细胞系和组织标本及肺癌标本表达基因扫描结果行联合聚类分析发现:两种癌的基因表达大多数相同,仅少数有差别,有30种在两种转移癌中呈持续上调或下调的基因,包括运动因子基因、粘附分子、蛋白水解酶、癌基因、抑癌基因、抑制或促进凋亡基因以及诱导血管增生和信号转导的基因等。结论优化的cDNA基因芯片制备技术用于基因表达分析有较高的效率和可靠的实用性能。检测的肿瘤转移相关基因的表达在两种癌无明显差别,表明不同癌其浸润和转移的分子机制大致相同。     

人脑胶质瘤恶性进展相关基因表达谱中凋亡相关基因的分析

目的 探讨细胞凋亡相关基因的异常变化在人脑胶质瘤恶性进展相关基因谱中的作用。方法 采用cDNA芯片检测同一患者初发和两次复发的胶质瘤组织与其正常脑组织中差异基因的表达，建立胶质瘤恶性进展相关基因表达语。根据GeneBank检索的资料分析其中细胞凋亡相关基因的变化。结果 三份肿瘤组织和正常脑组织两两相比，确立与细胞凋亡相关的差异基因31条，其中包括凋亡抑制基因和凋亡促进基因。结论 多种与细胞凋亡相关的基因表达异常参与了人脑胶质瘤的恶性进展。     

芹菜素对肿瘤抑制作用研究进展

芹菜素是一种植物黄酮类化合物,具有多种生物学活性和药理作用,它具有抗肿瘤、抗氧化、抗炎、镇静等作用,尤其在抗肿瘤方面,能抑制肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移,干扰肿瘤细胞的信号转导,诱导肿瘤细胞凋亡,抗氧化等.本文就其抗肿瘤方面的实验及作用机制研究进展进行综述.     

黑斑息肉综合征肿瘤相关基因初步筛选

目的 探索黑斑息肉综合征(PJS)肿瘤特异性相关基因.方法 用基因芯片技术研究PJS息肉的基因表达谱,筛选出差异表达基因,建立和研究PJS与肿瘤相关的差异基因表达.结果 大肠PJS息肉411个基因差异表达,其中上调的有197个基因,下调表达的有214个.在基因芯片总共144个癌基因与抑癌基因中,共有13个基因发生差异表达,其中PTTG1、LCN2、LATS2、MADH4、RALB、HRAS、APC、USP4为高表达;IGF2R、ELF3、EGFR、MCAM 、ERBB2为低表达.结论 这些肿瘤相关基因的差异表达,可能与PJS容易发生恶性肿瘤的潜能有关.     

应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因

目的：应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因。方法：利用CapitalBio公司基因芯片,对肝细胞癌组织和正常组织基因表达谱进行检测,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果：按差异显著性标准,从16000条基因中筛选出在肝细胞癌组织中共同差异表达基因326个,其中已知基因194个,新基因132个。在筛选出的已知基因中,表达上调113个,表达下调81个,包括原癌基因和抑癌基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架相关基因、细胞凋亡相关基因、DNA合成和修复相关基因等。结论：基因表达谱芯片技术可以筛选出肝细胞癌表达异常的相关基因群,并高效对基因功能进行研究。基因表达谱的分析有助于研究肝细胞癌发病机制。     

应用cDNA芯片技术筛选胰腺癌相关基因

目的应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因。方法将14 000种人类基因PCR产物用CartesianP ix-sys7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片。按一步法抽提4例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织的总RNA,将等量的RNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cDNA一链做探针,混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,每点上两种荧光信号的强度分别代表Cy5-dCTP和Cy3-dCTP的量,获得的荧光信号图像用计算机分析。结果按差异显著性标准,从14 000条基因中筛选出在胰腺癌组织中共同差异表达基因189条,其中已知基因101条,新基因88条。在筛选出的已知基因中,有50条表达上调,51条表达下调,包括原癌及抑癌基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架和运动蛋白相关基因、细胞凋亡和应激反应相关基因、DNA合成和修复相关基因、转录因子类基因、细胞受体相关基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因等。结论基因芯片技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选胰腺癌相关基因,并高效对基因功能进行研究。胰腺癌基因表达谱的分析有助于认识肿瘤发病机制。     

用全基因芯片技术对金黄地鼠口腔颊黏膜癌前病变相关基因的筛选和分析

目的:利用全基因芯片技术筛选口腔颊黏膜癌前病变发生发展的相关致病基因.方法:用9、10-二甲基;1,2-苯并蒽(Dimethylbenzanthracene,DMBA)诱导建立金黄地鼠颊鳞癌模型,分别提取正常颊黏膜和癌前病变组织的总RNA并合成用Cy3荧光标记的cRNA,分别与含有41 000个基因/ESTs序列的Agilent大鼠全基因芯片杂交,以Log2Ratio≥2.5和Log2Ratio≤-2.5为阈值来确定差异表达基因,然后用Gene Ontology对差异表达基因行功能分类分析,最后用RT-PCR对部分差异表达基因进行验证.结果:金黄地鼠颊黏膜自正常黏膜到癌前病变发展过程中,共得到1 331条差异表达基因,其中上调基因747条,下调基因584条.Gene Ontology分析发现这些差异基因主要涉及到大分子代谢、信号传导等8大功能分类.对上调基因Atp6vOd2和下调基因Sfrp2行RT-PCR验证结果与芯片结果相符.结论:口腔颊黏膜癌前病变的发生涉及众多基因表达的改变,通过对这些基囚的进一步研究,将对探索口腔黏膜癌前病变的发病机制、有效的干预防止癌前病变的发生或逆转癌前病变具有重要意义.     

DASL分析技术及其在肿瘤研究中的应用前景

DASL分析技术是针对部分降解RNA样品设计的表达谱分析新技术,可用于长达10年之久的石蜡标本的基因表达研究,在基础研究和临床应用方面都有重要意义。现就DASL分析技术的原理、特点及其在肿瘤研究领域中的应用作一综述。     

一条全长胰腺癌相关新基因的初步研究

目的 对应用cDNA芯片技术筛选出的一条全长胰腺癌相关新基因进行鉴定.方法 对应用cDNA芯片技术筛选出的一条全长胰腺癌相关新基因进行测序和生物信息学分析,应用RT-PCR和Northern blot检测该基因在12例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织以及4种胰腺癌细胞株中的表达情况.结果 生物信息学分析显示新基因定为于染色体4p15,有一包含501 bp的ORF,拟编码由166个氨基酸组成的蛋白质,其理论分子量为18 293.23,等电点为8.57.BLASTp分析发现,该蛋白与一种人类假想蛋白FLJ90013同源性大于90%,可能为该假想蛋白家族新成员.RT-PCR显示新基因在12例胰腺癌组织和4种胰腺癌细胞株中均表达,而在正常胰腺组织中未见表达.Northern blot分析得到相同的结果.结论 新基因与胰腺癌的发生、发展密切相关,可作为胰腺癌诊断和基因治疗的分子靶标.