首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到18条相似文献,搜索用时 156 毫秒
1.
目的探讨广东地区β-重症地中海贫血患者HLA高分辨多态性及其遗传易感性。方法采用PCR-SSP技术对168名广东籍β-重症地中海贫血患者(病例组)及138名正常无血缘关系广东供者(对照组)作HLA-A、-B和-DRB1基因高分辨分型,并对这2组人群的HLA-A、-B、-DRB1等位基因频率、A-B、B-DRB1和A-B-DRB1单体型频率作统计学分析。结果病例组HLA-A*02∶03、A*11∶02/11∶53、DRB1*16∶02等位基因频率分别为9.27%、4.21%、8.23%,高于对照组的3.70%、1.11%、4.44%(P0.05)。病例组单体型B*38∶02-DRB1*16∶02频率与对照组相比具有统计学差异(P0.05)。结论广东地区β-重症地中海贫血患者HLA高分辨基因多态性广泛,单体型分布分散,其与正常人之间HLA基因多态性和单体型的差异有可能是疾病易感因素。  相似文献   

2.
目的探讨辽宁地区散发性阿尔茨海默病(AD)与HLA相关位点基因遗传多态性的关联性。方法采用特异性寡核苷酸序列探针分析法(SSO)检测辽宁地区44名散发性阿尔茨海默病患者(实验组)和90名健康老人(对照组)HLA-A、HLA-B和HLA-DRB1位点基因遗传多态性。应用Arlequin3.5软件进行Hardy-Weinberg平衡、单体型频率的分析;应用SPSS17.0软件进行卡方检验,比较2组间等位基因和单体型频率的差异。结果实验组和对照组HLA-A、B、DRB1位点的各个等位基因频率的差异均不具统计学意义(P0.05);HLA-A-B单体型频率最高的为A* 30-B* 13、A* 02-B* 46、A* 02-B* 15,2组间高频单体型频率的差异也不具统计学意义(P0.05)。结论辽宁地区散发性阿尔茨海默病与HLA-A、HLA-B和HLA-DRB1位点基因遗传多态性无相关性。  相似文献   

3.
目的研究广西地区人群造血干细胞捐献志愿者的HLA-A、B、DRB1位点在高分辨水平上的等位基因多态性、基因频率及单体型分布特征。方法应用PCR-直接测序法(PCR-SBT)对中国造血干细胞捐献者资料库(CMDP)广西分库,3 431名无个体血缘关系健康供者的HLA-A、B、DRB1等位基因进行高分辨分型。结果共检出HLAA等位基因43个,B等位基因80个和DRB1等位基因42个,HLA-A-B-DRB1单体型检测到1507种。其中频率0.05的常见等位基因,包括5种HLA-A∶A~*11∶01,A~*24∶02,A~*02∶03,A~*02∶07,A~*33∶03;6种HLA-B∶B~*46∶01,B~*40∶01,B~*15∶02,B~*58∶01,B~*13∶01,B~*38∶02;7种HLA-DRB1∶DRB1~*15∶01,DRB1~*16∶02,DRB1~*09∶01,DRB1~*03∶01,DRB1~*12∶02,DRB1~*14∶54,DRB1~*15∶02。487条HLA-A-B单体型中,79条单体型呈现显著的正连锁不平衡(ALD0,HF≥1.09×10-4,χ23.84),5条表现为强连锁不平衡(RLD0.40),18条单体型的频率0.01;597条HLA-B-DRB1单体型中,68条单体型呈现显著的正连锁不平衡(ALD0,HF≥1.09×10-4,χ23.84),8条表现为强连锁不平衡(RLD0.40),16条单体型的频率高于0.01;1 507条HLA-A-B-DRB1单体型中,统计分析三座位单体型最常见的是A~*33∶03-B~*58∶01-DRB1~*03∶01(0.058 8)。结论广西地区人群HLA-A、B、DRB1位点在高分辨水平上获得等位基因频率、单体型分布数据及相关遗传参数,为今后开展临床造血干细胞移植、中国人群CWD表的制订和骨髓库最适库容的评估等研究及相关疾病研究提供本地区信息。  相似文献   

4.
目的探索四川骨髓库人群HLA-DQA1和DQB1等位基因及HLA-DQA1~DQB1单体型分布。方法 2018年2月—2019年2月,四川骨髓库收集664(人)份造血干细胞捐献志愿者样本,利用NGS技术对其进行基因测序,使用Type Stream~(TM )Visual 1.3.0软件对HLA-DQA1和DQB1进行高分辨率分型,使用Arlequin 3.1软件的EM算法计算HLA-DQA1和DQB1等位基因频率和HLA-DQA1~DQB1连锁不平衡参数。结果本组人群检测到16种HLA-DQA1和25种HLA-DQB1,DQA1~*01∶02、DQA1~*03∶02、DQB1~*03∶01∶01G、DQB1~*03∶03、DQB1~*05∶02和DQB1~*06∶01为高频等位基因。与美洲印第安人、非洲黑人和西班牙高加索人相比,四川骨髓库人群HLA-DQA1等位基因种类最多,高频等位基因频率差异较大(P0.05),DQA1~*05∶06、DQA1~*05∶08和DQA1 ~* 06∶01为其特有的等位基因。本研究检测24种可用于人群调查且连锁不平衡差异具有统计学意义的HLA-DQA1~DQB1单体型(P0.05)。结论四川骨髓库人群HLA-DQA1等位基因多态性程度高,高频等位基因分布相对集中,HLA-DQA1~DQB1单体型种类较多。  相似文献   

5.
目的获得广东汉族人群MICA基因第2~5外显子多态性分布特点。方法采用直接测序法(se-quence-based typing,SBT)对118名广东籍汉族无偿献血者的MICA基因进行多态性分析。结果 MICA各等位基因分布频率存在差异,其中MICA*010等位基因频率最高(25%),其次为MICA*019(16.5%)、MICA*008∶01(15.3%)和MICA*002∶01(15.3%),频率比较低的是MICA*033、MICA*009∶02、MICA*007∶02及MICA*004.与该基因在其他地区人群进行比较,存在显著差异。结论广东汉族人群MICA等位基因的分布有其自身特点。  相似文献   

6.
目的探讨HLAⅡ类(-DRB1,-DQB1,-DPB1)等位基因及单体型多态性与北方汉族急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)的易感相关性。方法以824名正常非亲缘造血干细胞捐献者(2016年1月—2019年9月)为对照,应用聚合酶链反应-测序分型(PCR-SBT)、下一代测序(NGS-ION S5~(TM))技术、基于LABScan~? 3D平台的聚合酶链反应-序列特异寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)等方法对308例AML(非M_3型)患者进行HLAⅡ类(-DRB1,-DQB1,-DPB1)基因高分辨分型,用Arlequin 3.5.2.2软件计算HLA基因频率和单体型频率,计算疾病优势比(odds ratio,OR)进行病例对照研究。结果经χ~2检验、连续校正显示非M_3型AML患者的HLA-DRB1~*07∶01(14.61%vs 9.53%,P0.01)、HLA-DQB1~*02∶02(12.82%vs 8.31%,P0.01)、HLA-DQB1~*06∶02(11.53%vs 8.74%,P0.05)和HLA-DPB1~*17∶01(5.84%vs 3.16%,P0.01)基因频率显著高于对照组,经Bonferroni校正后HLA-DRB1~*07∶01(Pc0.05)、HLA-DQB1~*02∶02(Pc0.05)和HLA-DPB1~*17∶01(Pc0.05)频率仍高于对照组,与AML呈强相关,OR分别为1.62(95%CI=1.23~2.14)、1.62(95%CI=1.21~2.18)和1.91(95%CI=1.23~2.94);AML患者的2座位单体型HLA-DRB1~*07∶01-DQB1~*02∶02频率经Bonferroni校正后仍高于对照组(12.66%vs 8.19%,Pc0.05);3座位单体型HLA-DRB1~*07∶01-DQB1~*02∶02-DPB1~*17∶01频率高于对照组,与AML呈强相关,是AML的易感单体型。结论本研究首次获得HLAⅡ(-DRB1,-DQB1,-DPB1)基因及单体型多态性与北方汉族AML相关性的资料,HLA-DRB1~*07∶01、HLA-DQB1~*02∶02、HLA-DPB1~*17∶01及单体型HLA-DRB1~*07∶01-DQB1~*02∶02-DPB1~*17∶01是北方汉族发生AML的风险基因及易感单体型,基于HLA单体型的风险预测可能比基于单个等位基因的风险计算更为精确。  相似文献   

7.
目的 探讨山东半岛地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因与慢性肾衰竭(CRF)的相关性。方法 采用序列特异性寡核苷酸探针-聚合酶链式反应法(PCR-SSO)对山东半岛地区汉族人群880例CRF患者进行HLA-A、B、DRB1等位基因分型,与865名无血缘关系造血干细胞志愿捐献的健康汉族个体等位基因频率进行比较,分析HLA基因多态性与CRF的相关性。结果 CRF患者组共检出HLA-A等位基因33个,HLA-B等位基因76个,HLA-DRB1等位基因39个;DRB1*11∶01(6.70%vs 4.45%)和DRB1*12∶02(8.69%vs 5.90%)等位基因频率显著高于对照组(Pc<0.05);B*15∶11等位基因频率显著低于对照组(1.82%vs 3.64%,Pc<0.05);CRF患者组三座位单体型A*30∶01-B*13∶02-DRB1*07∶01(16.61%vs 7.61%)、A*33∶03-B  相似文献   

8.
目的了解中国南方鼻咽癌高发区非癌人群HLA-A*02等位基因多态性及其分布特点。方法采用PCR-SSOP方法对来源于广西鼻咽癌高发区的342例非癌对照标本作HLA-A基因分型;等位基因频率统计采用直接计数法,并应用卡方检验将其与已报道的中国南方及北方汉族群体HLA-A*02等位基因频率作比较。结果所检测的广西鼻咽癌高发区非癌人群的HLA-A*02等位基因分布频率为33.77%(231/684),共检测出5种HLA-A*02等位基因亚型,检出比例依次为:A*02∶03占48.92%(113/231)、A*02∶07占33.77%(78/231)、A*02∶01占9.52%(22/231)、A*02∶06占7.36%(17/231)和A*02∶11占0.05%(1/231);对比分析显示A*02∶01、A*02∶03、A*02∶06及A*02∶07在不同地区汉族人群中呈现出明显的分布差异(P<0.05)。结论中国南方鼻咽癌高发区非癌人群HLA-A*02等位基因中以A*02∶03最为常见、A*02∶07次之,其HLA-A*02等位基因亚型与中国其地域的汉族人群相比存在明显的差异分布特征,提示该等位基因亚型是人群分析中较好的多态性标志。  相似文献   

9.
目的调查中国南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1等位基因多态性。方法 2017年6月-12月应用PCR-SBT测序分型法对1 000名健康无血缘关系的南方汉族人群外周血样(于2016年8月-2017年5月收集)进行HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1基因测序分型。HLA-DPA1和-DPB1基因采用自行设计的引物同步扩增检测第2、3外显子,HLA-DQA1检测第1~4外显子。电泳序列导入uTYPE 7.2 HLA分析软件判定基因型。采用直接计数法计算等位基因的分布频率。结果在1 000人份南方汉族无关个体HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1测序分型所获的序列中,无背景信号和杂峰。共检出6种HLA-DPA1等位基因,频率由高到低依次为DPA1~*02∶02 (0.541)>DPA1~*01∶03 (0.340)>DPA1~*02∶01 (0.095)>DPA1~*04∶01 (0.021)>DPA1~*02∶07 (0.003)>DPA1~*01∶04 (0.002);共检出HLA-DPB1等位基因33种,频率较高的前4种等位基因依次为DPB1~*05∶01(0.401)、DPB1~*02∶01(0.165)、DPB1~*04∶01(0.085)、DPB1~*02∶02(0.071);共检出19种HLA-DQA1等位基因,频率较高的前4种等位基因依次为DQA1~*01∶02(0.196)、DQA1~*03∶02(0.144)、DQA1~*01∶03(0.087)和DQA1~*06∶01(0.085)。结论本文获得了南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1基因多态性数据,可为人类学、群体遗传学、疾病关联研究等提供重要参考数据。  相似文献   

10.
目的探讨河北汉族人群人类白细胞抗原-DQB1(HLA-DQB1)基因型遗传特性。方法对1914名河北地区汉族人群献血者采用聚合酶链反应-基于测序的分型技术(PCR-SBT)进行HLA-DQB1位点高分辨基因分型,采用直接计数法计算等位基因频率,并与中国其他地区人群基因频率进行比较。结果 1914名河北汉族献血者中共检出21个HLADQB1等位基因,其中频率大于0.0500的常见等位基因共6个,分别为DQB1*03∶01、DQB1*03∶03、DQB1*06∶02、DQB1*02∶02、DQB1*06∶01和DQB1*05∶01。结论河北地区汉族人群DQB1具有丰富的多态性,基因分布有明显的地区特性,了解河北汉族人群HLA-DQB1的分布状况,有利于帮助临床寻找HLA匹配的造血干细胞无关供者,同时为我国人群群体遗传学研究等提供有价值的背景资料。  相似文献   

11.
目的:探讨肝脂酶(hepatic lipase,HL)基因启动子-250G/A、-514C/T、-710T/C和-763A/G4个位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)的分布特征及连锁不平衡关系。方法:应用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性技术,对112名三酰甘油(triglyceride,TG)正常者、103例高三酰甘油血症(hypertriglyceri-demics,HTG)患者的HL基因型和等位基因的分布频率进行分析,运用群体数理遗传学方法分析HL启动子4个基因位点SNP的遗传平衡吻合度及相互间连锁不平衡关系。结果:在HTG组中,-250A和-514T的等位基因频率及基因型频率均显著大于TG正常组(P0.05);-763A/G位点的基因型频率及等位基因频率在两组中则均无差异(P>0.05)。4个SNP相互间均呈强连锁不平衡。对启动子区3个SNP位点两两组合的单倍体型频率分析表明,在HTG和TG正常者中也存在显著差异(P  相似文献   

12.
目的 了解上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1在高分辨分型水平上的等位基因及单体型频率分布特征.方法 采用PCR-测序分型技术(Sequence-based typing,SBT)对4 082名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库上海分库汉族造血干细胞捐献者进行HLA-A、B、DRB1高分辨基因分型,利用计数法和最大似然性原理方法分别计算HLA-A、B 、DRB1等位基因及单体型频率.结果 4082例样本中,共观察到204个HL4等位基因,其中频率>0.1的HLA-A、B、DRB1等位基因分别有A*11:01、A*24:02、A*02:01、B*46:01、DRB1* 09:01、DRB1* 15:01.841条A-B单体型中,70条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD >0,HF≥3.67 ×10-4,x2 >3.84),8条表现为强连锁不平衡(RLD >0.40),17条单体型的频率高于0.01;1 027条B-DRB1单体型中,99条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,x2>3.84),12条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),12条单体型的频率高于0.01;3 344条A-B-DRB1单体型中,681条单体型是“可靠的”(频率≥3.67×10-4),单体型频率高于0.001有135条.结论 获得上海地区汉族人群HLA-A 、B、DRB1高分辨等位基因频率和单体型分布数据及相关遗传参数,为临床移植供者的选择、中国人群CWD表的制订、骨髓库最适库容的评估及人类遗传学研究提供参考数据.  相似文献   

13.
目的 研究安徽省汉族人群HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1等位基因和单体型频率分布特征.方法 PCR-测序分型技术(SBT)对3 169例随机无血缘关系的干细胞捐献者进行HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1基因分型,利用计数法、最大期望算法和PyPop软件计算等位基因频率、单体型频率和连锁不平衡参...  相似文献   

14.
目的了解广东献血者汉族人群HLA-B*15等位基因的多态性。方法从1 691名广东汉族献血者中采用中/低分辨分型获得带有HLA-B*15基因型466例样本,进一步应用PCR-SBT技术进行测序分型,获得广东汉族人群B*15高分辨分型结果。应用PyPop软件计算HLA-B*15各等位基因频率,同时与其他人群资料进行比较。结果共检测到16种已知HLA-B*15等位基因,其中以B*15∶02(64.75%)最常见,其次为B*15∶01(13.26%),B*15∶25(4.554%),B*15∶27(4.158%),B*15∶12(3.960%),这5种等位基因占B*15等位基因家族的90.69%。在B*15等位基因家族中,表达B75抗原的等位基因B*15∶02、B*15∶11和B*15∶21共占67.92%,但表达B62抗原的B*15等位基因多态性最强,共检出6种等位基因。结论广东汉族人群中HLA-B*15等位基因表现出高度的多态性及其特有的分布特征。  相似文献   

15.
目的建立可靠的HLA-DRB1等位基因全长序列的分子克隆和测序方法。方法设计、合成HLA-DRB1基因全长序列PCR引物和探索PCR反应体系,采用长距离PCR技术,对10份经PCR产物直接测序、基因型已知的标本,扩增HLA-DRB1基因5'-UTR区、6个外显子、5个内含子和3'-UTR区,全长约11 kb。PCR产物纯化后作长片段分子克隆,筛选阳性克隆,提取质粒DNA,采用自行设计的测序引物测序。结果 PCR扩增获得了特异性目的片段,克隆测序后获得了全部10种等位基因的全长序列。将HLA-DRB1等位基因全长序列划分为9个亚区,群体遗传学分析发现第2外显子的平均核苷酸变异率(π)8.653%,高于其他外显子,并且非同义突变率(dn)9.029%大于同义突变率(ds)7.846%。第5内含子的平均核苷酸变异率高达13.690%,DRB1*09∶01∶02和DRB1*07∶01∶01∶02这2个等位基因第5内含子的序列与其他等位基因序列差别较大。结论采用HLA-DRB1基因全长序列分子克隆及测序方法获得了HLA-DRB1基因各亚区多态性分布特点等基础资料。  相似文献   

16.
目的 探讨自噬相关基因5( Atg5)基因3个标签单核苷酸多态性(Tag SNP,rs17587319C/G、rs573775C/T、rs9486315C/T)及其单倍体型与帕金森病(PD)发病的关系.方法 采用病例-对照研究,PD患者80例(病例组)和健康体检者87例(对照组)为对象,应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性分析方法(PCR-RFLP)检测Atg5 Tag SNP rs17587319C/G、rs573775C/T、rs9486315C/T,并分析其基因型及等位基因频率在正常人群及PD患者中的分布特点.结果 Atg5 Tag SNP rs17587319C/G的C等位基因频率病例组为89.4% (143/160),对照组为74.7%(130/174),差异有统计学意义(P<0.01);病例组CC基因型频率为78.7% (63/80),对照组为58.6%(51/87),差异有统计学意义(P<0.01).SNP rs573775C/T和rs9486315C/T的等位基因频率及基因型频率在两组问的差异无统计学意义(P>0.05).Logistic回归分析结果SNP rs17587319C/G的CC基因型与PD的发病有独立相关性(P<0.01).单倍体型分析结果病例组中H1、H2单倍体型的频率高于对照组(P<0.05和<0.01).结论 H1,H2单倍体型和Atg5 Tag SNP rs17587319C/G的C等位基因可能是PD的危险因素.  相似文献   

17.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: The drug transporter MDR1 and the drug metabolizing enzyme CYP3A are the two major biological factors determining the pharmacokinetics of many drugs. The functional MDR1 single nucleotide polymorphisms (SNPs) and a prevalent CYP3A5 SNP show marked interethnic variation among Orientals, Caucasians and Africans. In this study, we investigated the distribution of MDR1 and CYP3A5 SNPs among mainland Chinese Han, Uygur and Kazakh ethnic groups. METHODS: Genotypes of the MDR1 C1236T, G2677T/A and C3435T, and CYP3A5*3, CYP3AP1*3 SNPs were determined in 434 unrelated healthy subjects (165 Chinese Han, 161 Chinese Uygur and 108 Chinese Kazakh) using polymerase chain reaction followed by restriction fragment length polymorphism analysis. RESULTS AND DISCUSSION: A significantly higher MDR1 3435T variant frequency was observed in Uygur (52.8%), than in Kazakh (39.8%) and Han (37.9%) Chinese (P < 0.01, Fisher's exact test). There was no significant difference in MDR1 1236T and 2677T/A variant frequencies between Han, Uygur and Kazakh. CYP3A5*3 (G) allele was observed at intermediate frequencies in Uygur (84.8%) and Kazakh (86.6%), relative to Han (72.7%) and values previously reported in Caucasians (91.7%). The CYP3AP1*3 (A) allele was strongly linked to CYP3A5*3 in Chinese Han, Uygur and Kazakh. CONCLUSION: Significant interethnic differences in MDR1 haplotype and CYP3A5 variant frequencies exist between mainland Chinese Han and Caucasians, and the intermediate frequencies observed in Chinese Uygur and Kazakh might be due to the genetic admixture of Eurasians and Orientals.  相似文献   

18.
OBJECTIVE: The aim of this study was to investigate the respective contribution of the different cytochrome P450 (CYP) 2C9 genetic polymorphisms to the interindividual variability of acenocoumarol pharmacodynamic response. METHODS: A total of 263 healthy volunteers were genotyped for CYP2C9*2, CYP2C9*3, CYP2C9*4, and CYP2C9*5 alleles, as well as for the nicotinamide adenine dinucleotide phosphate, reduced, quinone oxidoreductase 1 genetic polymorphism (NQO1*2). Moreover, the 5'-flanking region of the CYP2C9 gene was investigated for new polymorphisms, and haplotype analysis was then performed. Finally, CYP2C9 phenotype was evaluated after a single oral dose of 4 mg of acenocoumarol. Factor VII coagulant activity was measured before and 24 hours after acenocoumarol intake. RESULTS: The CYP2C9*3 allele was the only nonsynonymous single nucleotide polymorphism (SNP) influencing acenocoumarol pharmacodynamics; the percentages of remaining factor VII were 60% +/- 19%, 39% +/- 17%, and 17% for CYP2C9*1/CYP2C9*1, CYP2C9*1/CYP2C9*3, and CYP2C9*3/CYP2C9*3 subjects, respectively (P =.001). Among the white subjects, the CYP2C9 promoter showed the existence of 6 SNPs at positions G-1538A, T-1189C, G-1097A, G-982A, T-640 del, and G-620T with allelic frequencies of 0.085, 0.0398, 0.136, 0.086, 0.005, and 0.0138, respectively. Four major haplotypes could be inferred among white subjects. The haplotype that contains the CYP2C9*3 allele was the only one influencing acenocoumarol pharmacodynamics, explaining 14.3% of its interindividual variability. Body weight explained 5% of acenocoumarol pharmacodynamic variability, whereas the NQO1*2 allele had no significant effect. CONCLUSION: Overall, CYP2C9-related genetic variability accounts for 14% of the interindividual variability in acenocoumarol pharmacodynamic response. The information found by haplotype analysis is mainly related to the CYP2C9*3 SNP.  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号