新疆地区汉族和维吾尔族部分人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因多态性与单倍型的比较

目的了解中国新疆维吾尔自治区汉族和维吾尔族人类白细胞抗原DRB1(HLA-DRB1)、HLA-DQB1、HLA-DPB1高分辨分型基础上的基因多态性和单倍型分布的特点。方法应用聚合酶链反应-直接测序基因分型(PCR-SBT)法对新疆地区188例汉族人群与90例维吾尔族人群进行HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因分型,直接计数法计算基因频率,应用Arlequin3.5软件以最大似然法获得单倍型频率。结果汉族人群频率最高的HLA-Ⅱ类基因分别是DRB1*09∶01(12.8%)、DQB1*03∶01(20.3%)和DPB1*05∶01(33.5%);三位点组成的单倍型频率最高的分别是DRB1*09∶01-DQB1*03∶03(8.8%)、DRB1*09∶01-DPB1*05∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*05∶01(9.6%)和DRB1*09∶01-DQB1*03∶03-DPB1*05∶01(6.3%)。维吾尔族人群频率最高的HLA-Ⅱ类基因分别是DRB1*07∶01(18.3%)、DQB1*03∶01(18.9%)和DPB1*04∶01(30.0%);三位点组成的单倍型频率最高的分别是DRB1*07∶01-DQB1*02∶02(16.1%)、DRB1*07∶01-DPB1*04∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*04∶01(7.3%)、DRB1*07∶01-DQB1*02∶02-DPB1*04∶01(7.4%)。两组人群中等位基因有显著差异的是∶DRB1*04∶04、DRB1*07∶01、DRB1*08∶03、DRB1*11∶04、DRB1*12∶02、DRB1*13∶01、DRB1*15∶01、DQB1*02∶02、DQB1*06∶01、DPB1*04∶01和DPB1*05∶01。结论中国新疆汉族与维吾尔族人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1等位基因频率、单倍型频率分布均有自己的多态性特征。     

内蒙古汉族人群多发性硬化与HLA-DRB1基因型的相关性研究北大核心CSCD

目的:探讨内蒙古汉族人群人类白细胞抗原(HLA)-DRB1基因多态性与多发性硬化(MS)的关系。方法:采用基因测序法(SBT)检测40例内蒙古汉族MS患者和40例健康对照者的HLA-DRB1等位基因,并比较两组之间等位基因型频率的差异。结果:共检测到25个HLA-DRB1等位基因片段,其中MS组(45.0%)的DRB1*15:01等位基因频率显著高于健康对照组(12.5%)(P=0.001,Pc=0.011,RR=1.591);DRB1~04:05等位基因频率高于正常对照组,但差异无统计学意义(P>0.05)。对照组中DRB1*11:01等位基因和DRB1*12:02等位基因频率均高于MS组,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论:我国内蒙古汉族人群MS与HLA-DRB1*15:01等位基因之间存在相关性。     

烟台地区汉族人群HLA-Ⅱ类基因区五个基因位点多态性分析

目的探讨烟台地区汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)-DPA1、-DPB1、-DQA1、-DQB1、-DRB1五个位点基因分布多态性及基因型。方法收集2020年6月至2020年12月烟台市中心血站检测合格的汉族无偿献血者外周血样本135例, 利用下一代测序(next-generation sequencing, NGS)技术对入组人群进行HLA-DPA1、-DPB1、-DQA1、-DQB1、-DRB1五个位点基因检测和基因型分析, 统计分析HLA-DPA1、-DPB1、-DQA1、-DQB1、-DRB1基因频率特点, 并与其它地区人群基因分布进行比较。结果在HLA-DRB1、DQA1、DQB1、DPA1、DPB1五个位点检出分布频率最高的等位基因分别是DRB1*09:01、DQA1*01:02、DQB1*03:01、DPA1*02:02、DPB1*05:01; 五个位点等位基因中, 发现98种HLA-DRB1基因型, 频率高于1.48%的有7种;66种HLA-DQB1基因型, 频率高于1.48%的有14种;68种HLA-DQA1基因型, 频...     

江苏7地市汉族人群HLA-DRB1等位基因多态性分析

目的 分析江苏7地市汉族造血干细胞捐献志愿者人类白细胞抗原(HLA)-DRB1位点的基因频率,研究比较该7地市人群HLA-DRB1基因多态性.方法 采用聚合酶链反应-直接测序分型(PCR-SBT)和聚合酶链反应-反向序列特异性寡核苷酸探针(PCR-rSSOP)基因分型技术,对中华骨髓库江苏分库2787名无关供者的HLA-DRB1位点进行高分辨分型,分别计算并比较各地市HLA-DRB1基因频率.结果 淮安、徐州、泰州、宿迁、南京、常州、扬州HLA-DRB1位点分别检出等位基因38、33、26、36、37、31、26个.在淮安、徐州、宿迁,频率最高的HLA-DRB1等位基因分别是DRB1*07:01、09:01、15:01、12:02.在南京,频率最高的HLA-DRB1等位基因分别是DRB1*09:01、07:01、15:01、12:02.在扬州,频率最高的HLA-DRB1等位基因分别是DRB1*09:01、07:01、15:01、08:03.在泰州,频率最高HLA-DRB1等位基因是DRB1*09:01、07:01、04:05、15:01;在常州,频率最高的HLA-DRB1等位基因是DRB1*09:01、07:01、12:02、08:03.结论 本资料反映了江苏7地市汉族人群HLA-DRB1基因分布,具有丰富的多态性,其中南京、扬州基因频率相近最接近中国北方群体的特征.淮安、徐州、宿迁、常州、泰州5地市相近,除了DRB1*09:01、07:01两高频基因频率有所差异外也接近中国北方.本研究为HLA与疾病相关研究和我国人群群体遗传学研究等提供有意义的基础性资料.

Abstract：

Objective To investigate the frequencies of human leukocyte antigen ( HLA)-DRB1 alleles of Chinese Marrow Donor Program (CMDP) donors in seven markets of Jiangsu Han population. Methods 2787 donors from CMDP Jiangsu Branch were typed in HLA-DRB1 locus using polymerase chain reaction-sequence-based typing (PCR-SBT) method or polymerase chain reaction-reverse sequence specific oligonucleotide probes (PCR-rSSOP) method. Frequencies of HLA-DRB1 were separately calculated in seven markets and a comparison was made among them. Results A total of 38,33,26,36,37,31,26 alleles in DRB1 locus were separately found in Huai-an, Xuzhou, Taizhou, Suqian, Nanjing, Changzhou, Yangzhou population. The most frequent HLA-DRB1 alleles in Huai-an, Xuzhou, Suqian respectively were DRB1 * 07:01, 09:01, 15:01,12:02; In Nanjing and were DRB1 * 09:01,07:01, 15:01, 12:02; In Yangzhou were DRB1 * 09:01,07:01,15:01,08:03; In Taizhou were DRB1 *09:01, 07:01, 04:05, 15:01; In Changzhou were DRB1 *09:01,07:01, 12:02, 08:03. Conclusion The above results reflected the distribution of HLA-DRB1 alleles in seven markets of Jiangsu Han population, which held abundant polymorphism, and a certain uniqueness in every market. The HLA-DRB1 allele distribution of Nanjing, Yangzhou were the closest groups to northern China, Huaian, Xuzhou, Suqian, Changzhou, Taizhou were close to northern China except DRB1 * 09:01,07:01 in different frequencies. These findings could guide the selection of future donor in CMDP Jiangsu Branch. It also could serve as foundation for HLA related disease research, studies of population genetics and anthropology in Chinese Han population.     

HLA-DRB1*12:01:01G和HLA-DRB1*14:01:01G组内等位基因频率的统计分析

目的 区分并计算人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA) HLA-DRB1* 12:01:01G(HLA-DRB1* 12:01:01/12:06/12:10/12:17)和HLA-DRB1* 14:01:01G(DRB1* 14:01:01/14:54)组内等位基因及其相对频率,并分析其与HLA-DRB3和HLA-DQB1的连锁情况.方法 收集115例HLA-DRB1*12:01:01G组和108例HLA-DRB1*14:01:01G组标本,采用单核苷酸序列分析(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)方法检测HLA-DRB1* 12:01:01G组等位基因的第1～3外显子序列和HLA-DRB1* 14:01:01G组的第2、3外显子序列.HLA-DRB3和HLA-DQB1基因分型采用PCR-SBT方法.结果 115例HLA-DRB1* 12:01:01G组标本中,101例(87.8％)为HLA-DRB1* 12:01:01,14例(12.2％)为HLA-DRB1* 12:10,未发现HLA-DRB1* 12:06和HLA-DRB1* 12:17. 108例HLA-DRB1*14:01:01G组标本全部为HLA-DRB1*14:54. HLA-DRB1*12:01:01与HLA-DRB3* 01:01:02和HLA-DQB1* 03:01连锁,HLA-DRB1* 12:10则与HLA-DRB3* 02:02:01和HLA-DQB1* 03:01连锁.HLA-DRB1* 14:54与HLA-DRB3* 02:02:01和HLA-DQB1* 05:02、*05:03连锁.结论 HLA-DRB1* 12:01:01G组中HLA-DRB1* 12:01:01频率最高,而HLA-DRB1* 14:01:01G组则以HLA-DRB1* 14:54频率最高.     

云南昆明彝族和汉族儿童HLA-DRB1等位基因的多态性研究

目的研究昆明彝族和汉族儿童HLA-DRB1基因的多态性,探讨其在昆明彝族和汉族人群中的遗传特征。方法应用PCR-SSP基因分型技术,对云南昆明地区70名彝族和72名汉族健康儿童进行了HLA-DRB1位点的基因分型。结果昆明彝族儿童HLA-DRB1位点共检出了12种等位基因,其中以HLA-DRB1*12(33.57％)、DRB1*0901(11.43％)、DRB1*04(11.43％)较常见,其它基因频率大于5％的等位基因还有HLA-DRB1*01(8.57％)、DRB1*11(7.86％)、DRB1*14(7.14％)、DRB1*15(7.14％)、DRB1*08(5％);昆明汉族儿童HLA-DRB1位点共检出了12种等位基因,其中以HLA-DRB1*12(20.14％)、DRB1*0901(19.44％)、DRB1*04(18.06％)较常见,其他基因频率大于10％的等位基因还有HLA-DRB1*08(11.11％)、DRB1*15(10.42％);与北方汉族人群、南方汉族人群HLA-DRB1等位基因分布进行了比较,均有显著性差异(P<0.001)。结论昆明彝族和汉族HLA基因多态性分布有其特点,他们既不同于北方汉族人群也不同南方汉族人群,有其独特性。可能与复杂的民族迁移历史和民族融合及云南独特的地理环境有关。     

广西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1高分辨等位基因和单倍型多态性的初步分析

目的分析广西汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型的分布特征。方法采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对广西地区1 644名汉族无关个体进行HLA-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型多态性的分型,使用Arlequin软件(3.5.2.2)计算HLA等位基因频率、单倍型频率和连锁不平衡参数。使用MEGA v6.0软件构建系统发生树,并与其他部分中国汉族人群的基因频率进行比较。结果该人群HLA-A、-B、-DRB1等位基因分布均偏离Hardy-Weinberg平衡(P0.05),3个位点分别检出37种HLA-A,70种HLA-B和37种HLA-DRB1等位基因。其中,等位基因频率分布最高的分别是A~*11∶01(28.86%)、B~*46∶01(14.26%)和DRB1~*15∶01(13.32%),最常见的单倍型是A~*33:03-B~*58∶01-DRB1~*03∶01(6.12%),A~*02∶07-B~*46∶01、A~*11∶01-DRB1~*15∶01和B~*58∶01-DRB1~*03∶01呈现最强的连锁不平衡。该人群与广西壮族人群亲缘关系最近,其多态性最接近的汉族是中国南方汉族。结论广西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1等位基因和单倍型有较高的遗传多态性,将为中国人群在临床寻找HLA匹配的无关亲缘供者、法医学研究以及人类学研究等提供有价值的遗传学依据。     

济南汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因高分辨多态性分析

目的 分析济南地区汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigens,HLA)-A、B、DRB1座位等位基因的高分辨多态性.方法 采用PCR-测序分型(PCR-sequence-based typing,PCR-SBT)对鲁南地区483名无血缘关系的汉族健康个体进行HLA-A、B、DRB1座位高分辨基因分型,采用Arlequin3.5软件计算等位基因频率、单倍型频率,并就常见等位基因与其他人群进行比较.结果 济南汉族HLA-A、B、DRB1座位分别检出27、56和41个等位基因,其中等位基因频率分布最高的分别是A* 11∶01 (0.1615)、B*13∶02(0.1163)和DRB1* 07∶01 (0.1763);最常见的A*-B*-DRB1*单倍型是A*30∶01-B* 13∶02-DRB1* 07∶01 (0.0867).结论 济南地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因和单倍型具有较高的多态性.     

福建汉族人群HLA-DRB1等位基因多态性研究

目的调查福建汉族人群HLA-DRB1等位基因的多态性。方法应用寡核苷酸基因芯片分型技术对福建地区620名汉族人群进行HLA-DRB1位点的基因分型。结果在HLA-DRB1位点共检出了14种等位基因,基因频率较高的依次为DRB1*09、12、15、04、08。结论福建汉族HLA-DRB1等位基因多态性与南方汉族人群相近,但也有其独特的特点。     

HLA-DRB1基因多态性与新疆汉族人群结核病易感性的研究

目的 探讨HLA-DRB1基因的多态性与新疆汉族人群结核病发生发展的关联.方法 采用PCR-SSP技术对228例新疆塔城地区和石河子地区的汉族肺结核患者及231例汉族健康志愿者的HLA-DRB1的13个等位基因分型,比较各等位基因的频率(GF),统计学分析采用χ2检验,研究不同等位基因与新疆汉族人群结核病易感性的关联.结果 结核病例组HLA-DRB1*12基因频率为9.92%,明显高于对照组的2.85%,两者差异有统计学意义(χ2=18.76,Pc＜0.01);而结核病例组中的HLADRB1*11等位基因的基因频率低于健康对照组(χ2=9.513,Pc＜0.05),差异有统计学意义.结论 HLA-DRB1*12基因可能是新疆汉族人群的结核病易感基因,HLA-DRB1*11可能是新疆汉族人群与结核病相关的保护性基因.     

昆明彝族人群HLA-DRB1、DQB1基因多态性

目的　调查昆明彝族 HL A- DRB1、DQB1基因的多态性。方法　应用聚合酶链反应 -序列特异性引物基因分型技术 ,对昆明地区 70名彝族健康儿童进行了 HL A- DRB1、DQB1位点的基因分型。结果在 HL A- DRB1位点共检出了 12种等位基因 ,其中等位基因频率大于 10 %的依次为 HL A- DRB1* 12 (33.5 7% )、DRB1* 0 90 1(11.4 3% )、DRB1* 0 4 (11.4 3% ) ,等位基因频率大于 5 %而小于 10 %的依次为 DRB1* 0 1(8.5 7% )、DRB1* 11(7.86 % )、DRB1* 14 (7.14 % )、DRB1* 15 (7.14 % )、DRB1* 0 8(5 % ) ,等位基因频率小于 5 %依次为 HL A- DRB1* 0 3(2 .86 % )、DRB1* 13(2 .14 % )、DRB1* 0 7(1.4 3% )、DRB1* 16 (1.4 3% )。在 HL A- DQB1位点共检出了 7种等位基因 ,其中等位基因频率大于 10 %的依次为 HL A- DQB1*0 30 1(45 % )、DQB1* 0 5 (2 2 .14 % )、DQB1* 0 30 3(12 .14 % ) ,等位基因频率大于 5 %而小于 10 %的依次为DQB1* 0 4 (6 .4 3% )、DQB1* 0 6 (6 .4 3% ) ,等位基因频率小于 5 %的依次为 DQB1* 0 2 0 1(4.2 9% )、DQB1* 0 30 2 (3.5 7% )。结论　昆明彝族 HL A基因多态性分布不同于北方汉族人群 ,也不同于南方汉族人群 ,有其独特性。     

慢性乙型肝炎病毒感染与HLA-DRB1基因的相关性研究

目的： 研究HLA-DRB1等位基因与HBV感染慢性化的相关性。 方法： 用PCR-SSP 方法对陕西地区汉族乙肝患者108例与正常对照108人以及慢性乙型肝炎表面抗原携带者32人，进行HLA-DRB1等位基因分型比较，并进行HLA-DRB1等位基因分型与HBV不同复制状态相关性分析。 结果： 陕西地区汉族人HLA-DRB1等位基因以DRB1*04（16.2%），DRB1*09（12.5%），DRB1*12（11.6%）, DRB1*15（13.4%）最为常见；病例组HLA－DRB1*03 的等位基因频率(10.6%)明显高于健康对照组(3.7%)，(OR=3.10; P<0.05)；HLA-DRB1*07等位基因频率病例组(17.6%)明显高于健康对照组(9.3%)(OR=2.09; P<0.05)；DRB1*07 基因位点在HBV高复制状态多见（OR=2.22; P<0.05）; HLA-DRB1*15对照组等位基因频率13.4%, 明显高于病例组6.9% (OR=0.48; P<0.05)。 结论： HLA－DRB1*03、HLA-DRB1*07与陕西地区汉族人HBV感染后的慢性化相关联，HLA-DRB1*15为陕西地区汉族人乙肝感染的抗性基因。本研究提示HLA-Ⅱ类基因是决定HBV感染后临床转归的重要因素。     

Nomenclature for factors of the HLA system, update May 2009

Major histocompatibility complex class I chain-related gene A ( MICA ) is located 46 kb centromeric to HLA-B locus and encodes a stress-inducible protein. MICA allelic variation is thought to be associated with disease susceptibility and immune response to transplants. In this study, polymerase chain reaction sequence-based typing (PCR-SBT) method for MICA alleles has been established. Genomic DNAs from 100 healthy Chinese Han individuals were typed for MICA alleles by this method. The microsatellite polymorphism in the exon 5 of MICA gene, MICA * Del allele, and human leukocyte antigen-B alleles was also detected by the polymerase chain reaction–GeneScan, polymerase chain reaction sequence-specific primer, and PCR-SBT methods, respectively. Fourteen MICA alleles were found in the population, with MICA * 00801/04 having the highest frequency of 27.0%. MICA * A4 , * A5 , * A5.1 , * A6 , and * A9 microsatellites were identified. Two samples with HLA-B * 4801 were MICA * Del positive, with the frequency of 1.0%. The data showed that the new PCR-SBT method for MICA alleles was reliable and Chinese Han population was distinct in distribution of MICA alleles.     

HLA-DRB1 and -DQB1 alleles in mestizo patients with Vogt-Koyanagi-Harada's disease in Southern California

We evaluated human leukocyte antigen (HLA)-DRB1 and -DQB1 alleles as genetic markers for Vogt-Koyanagi-Harada (VKH) disease in Mestizo patients in Southern California. Mestizo individuals with VKH disease (n = 29) at two institutions were evaluated. Typing of HLA-DRB1 and DQB1 genes was performed using DNA-based techniques. Gene frequencies were compared to Mestizo individuals living in Southern California. All patients had HLA-DRB1*01, DRB1*04, DQB1*03 or DQB1*05, or a combination of these genes. The gene frequency of combined HLA-DR4 alleles was increased when compared to controls. The frequencies of HLA-DRB1*0404 and DRB1*0407 were increased compared to controls, but were not significant after Bonferroni correction. Three patients had the HLA-DRB1*0410 allele; this allele was not found in controls. All HLA-DRB1*01 positive patients had the DRB1*0102 subtype. No HLA-DQB1 allele was significantly increased compared to controls. This study is the first to identify a possible association between HLA-DRB1*0404 and VKH disease, as well as to find DRB1*0102 and DRB1*0410 in Mestizo patients.     

用聚合酶链反应-直接测序分型法研究江苏汉族人群HLA-DQA1和DQB1基因多态性

目的检测江苏地区汉族人群HLA-DQA1和DQB1等位基因及单倍型的频率，分析该人群DQA1、DQB1基因多态性和DQA1-DQB1单倍型特点。方法应用聚合酶链反应-直接测序分型法（PCR-sequence-based typing ，PCR-SBT）方法对100名健康、无血缘关系的江苏汉族人群的HLA-DQA1和DQB1进行基因分型。结果共检出7个DQA1等位基因和13个DQB1等位基因。DQA1等位基因中，DQA1＊0301／02／03的基因频率最高（29．5％），其次为DQA1＊0501（18．5％）、DQA1＊0102（17．0％）、DQA1＊0201（12．5％）；DQB1等位基因中，DQB1＊0201／02（21．5％）、DQB1＊0301／09（14．5％）、DQB1＊0303（13．5％）和DQB1＊0603（11．5％）最为常见。分析得出30种DQA1-DQB1单倍型，DQA1＊0301／02／03-DQB1＊0303（12．5％）、DQA1＊0201．DOB1＊0201／02（10．5％）、DQA1＊0501-DQB1＊0201／02（9．5％）、DQA1＊0501-DQB1＊0301／09（7．0％）为常见的单倍型。结论江苏汉族人群HLA-DQA1和DQB1基因具有较为丰富的多态性，基因频率分布具有中国北方群体的特征且具有一定的独特性。     

青海土族人群HLA-A、B、DRB1基因多态性分析

目的:分析青海土族人群人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA)A、B、DRB1的基因多态性特点。方法:应用聚合酶链反应-直接测序分型(Polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR-SBT)法对土族人群中47名健康无血缘关系的个体进行HLA-A、B、DRB1基因座高分辨分型。并将青海土族人群的HLA-DRB1基因与国内其它少数民族人群进行比较。结果:检出HLA-A、B、DRB1的基因型数和等位基因数分别为34、41、42和17、28、30。这3个基因座分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。且HLA-DRB1基因座等位基因频率分布与蒙古族有相似之处,表现在基因频率较高的DRB1*04,DRB1*07,DRB1*09,DRB1*12等位基因。结论:青海土族人群具有独特的HLA-A、B、DRB1基因频率分布特征,且青海土族HLA-DRB1等位基因频率分布与蒙古族有相似之处。     

江浙沪汉族人群HLA-DRB1基因座遗传特征及不同人群频率分布比较

目的 调查江浙沪汉族人群HLA—DRBl基因座的遗传多态性，分析不同人群HLA-DRBl基因频率分布特征。方法 利用聚合酶链反应—序列特异寡核苷酸探针反向杂交和聚合酶链反应—序列特异引物技术对江浙沪地区626名健康无关汉族人进行HLA—DRBl基因分型，可检出DRBl*0101-1001，DRB3，DRB4，DRB5等等位基因，计算HLA—DRBl等位基因频率并与不同人群HLA—DRBl基因的多态性进行比较。结果 在江浙沪汉族人群中检出HLA—DRBl*0101、0301、0701、09012、1001、1201、1202、1301／02、1303／04、1401／04／05、1402／03／1305、1501／02、16021以及04xx、08xx等等位基因，其中DRBl*09012(17．97％)、04xx(12．53％)、1202(11．42％)及1501／02(11．02％)基因频率分布较高。江浙沪汉族人群无偏倚期望杂合性为0．9634，多态性信息含量为0．9024。结论 江浙沪汉族人群HLA-DRBl基因具有中国汉族人群共有的遗传特征，但也有其自身的分布特点，频率分布介于南、北汉族之间。在所比较的不同人群中中国汉族人群HLA—DRBl多态性较为丰富。     

HLA-DRB1等位基因多态性与食管癌遗传易感性研究

目的:从基因水平探讨湖北地区汉族人食管癌HLA-DRB1等位基因的遗传易感性。方法:运用序列特异性引物聚合酶链反应结合基因序列分析等技术, 检测无亲缘关系湖北汉族健康人136例、食管癌组42例患者的HLA-DRB1等位基因。SAS统计软件数据处理。结果:湖北地区汉族人食管癌患者与正常人比较, HLA-DRB10.901基因频率显著增高(0.2500vs0.1397, P=0.028, OR=2.053, 病因分数=0.1282);两者间其余HLA-DRB1等位基因分布频率差别均无显著。结论:HLA-DRB10.901等位基因与湖北地区汉族人食管癌正相关, 为其易感基因, 该等位基因测序结果与其基因库第2外显子序列吻合。     

Investigation of killer cell immunoglobulin-like receptors gene KIR3DL2 diversity and confirmation of KIR3DL2*015 in a Chinese population

Human killer cell immunoglobulin-like receptors (KIRs) are a subfamily of the immunoglobulin superfamily. Here, we established polymerase chain reaction-sequence-based typing (PCR-SBT) procedure to identify alleles of KIR3DL2 gene. The method was designed around the specific amplification of exon 3 to exon 4 and exon 8 to exon 9 of the KIR3DL2 gene. Genomic DNA from 104 healthy, unrelated Chinese Han individuals was typed for KIR3DL2 alleles. Each sample was assigned to the putative allele combination according to the sequences of all KIR3DL2 alleles. We observed 18 different genotypes and eight KIR3DL2 alleles in the population, with KIR3DL2*002 having the highest frequency of 0.558, and confirmed the new KIR3DL2*015 allele. Our data showed that the established PCR-SBT methods for KIR3DL2 allele typing were reliable, and Chinese Han population is distinct in KIR3DL2 allele frequencies.