结直肠癌中miR-31的表达及预测靶基因的生物信息学分析

目的 检测microRNA-31（miR-31）在结直肠癌中的表达及功能,预测其靶基因并进行生物信息学分析,为研究其作用和调控机制奠定基础。方法 采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应（qRT-PCR）检测8种结肠癌细胞株、40例结直肠癌（colorectal cancer, CRC）患者癌组织及匹配的正常黏膜组织及33例结直肠腺瘤组织中miR-31的表达情况,并分析癌组织中miR-31表达与患者临床特征的关系。MTS法观察转染miR-31模拟物（mimics）组、抑制剂（inhibitor）组和对照组（miRControl）及空白细胞组细胞生长的差异,Western blot检测空白细胞组、miR-31 mimics和inhibitor三组细胞PCNA蛋白的表达。TargetScan、DIANA-microT、miRanda等软件预测miR-31的靶基因,并进行KEGG功能和信号通路富集分析。结果 miR-31在8种结肠癌细胞株中高表达,同时CRC患者癌组织中的表达高于腺瘤及正常黏膜组织（P<0.05）。其中癌组织和匹配的正常黏膜相比,miR-31表达明显上调（P=0.035）,但腺瘤和正常黏膜相比,差异无统计学意义（t=0.122, P=0.904）。miR-31的表达与临床病理特征间未见明显关系（P均＞0.05）。转染miR-31 mimics后,miR-31的表达明显上调且和miR-Control组及空白细胞组相比,miR-31 mimics组细胞生长加快;而转染miR-31 inhibitor组miR-31表达显著降低,细胞生长活力明显受抑制。同时转染miR-31 inhibitor组PCNA蛋白表达较miR-31 mimics组和空白细胞组显著降低。生物信息学分析miR-31靶基因功能集中于转录后及翻译水平的调节、细胞连接、迁移及细胞运动等生物学过程。信号通路主要富集于内吞作用、轴突导向、T细胞受体信号通路、Wnt及MAPK信号通路。结论 miR-31在结直肠癌中高表达,且miR-31可以促进细胞生长和增殖,其靶基因可能通过调节多种生物学过程发挥作用。     

miR-3200-3p通过靶向抑制RNF111促进结直肠癌细胞恶性进展的机制研究

目的:探讨miR-3200-3p能否通过靶向抑制RNF111促进结直肠癌细胞恶性进展。方法:选择5株人结直肠癌细胞系,Real-time PCR检测miR-3200-3p、RNF111的表达,Western blot检测RNF111蛋白的表达;利用双荧光素酶实验验证miR-3200-3p与RNF111的靶向抑制;利用miR-3200-3p mimic/inhibitor或利用miR-3200-3p inhibitor与RNF111 siRNA共转染HCT116细胞,Real-time PCR检测miR-3200-3p表达,Western blot检测RNF111、p-SMAD2蛋白表达,MTT检测细胞增殖,划痕实验检测细胞迁移,Transwell检测细胞侵袭,流式细胞术检测细胞凋亡情况。结果:五株人结直肠癌细胞中,HCT116细胞中miR-3200-3p相对高表达,RNF111相对低表达;miR-3200-3p mimic或inhibitor转染后,与各自NC组相比,可显著促进或抑制RNF111蛋白的表达,促进或抑制细胞的增殖、侵袭及迁移,抑制或促进细胞凋亡（均P＜0.05）;与pmirGLO-MUT 3' UTR+mimics转染组相比,pmirGLO-WT 3' UTR+mimics转染组荧光素酶活性显著降低（P＜0.05）;与miR-3200-3p NC组相比,miR-3200-3p inhibitor及miR-3200-3p inhibitor+siRNA NC组RNF111蛋白表达显著升高,p-SMAD2蛋白表达显著降低,细胞增殖、迁移及侵袭被显著抑制,细胞凋亡被显著促进（均P＜0.05）,与miR-3200-3p inhibitor+siRNA NC组相比,miR-3200-3p inhibitor+RNF111 siRNA组细胞RNF111、p-SMAD2蛋白表达、增殖、迁移、侵袭及凋亡被显著逆转（均P＜0.05）。结论:miR-3200-3p可通过靶向抑制RNF111促进结直肠癌细胞增殖、侵袭及迁移,抑制细胞凋亡。     

抑制miR-21表达对结肠癌HCT116细胞生物学行为的影响

目的：探讨抑制 miR-21 表达对结肠癌HCT116细胞增殖、周期、凋亡、侵袭和迁移等生物学行为的影响。方法：实验分为3组,以miR-21抑制剂转染HCT116细胞为转染抑制组（IN）,另设阴性对照组（NC）、空白对照组（MOCK）,以Real-time PCR检测转染后HCT116细胞中miR-21的表达,应用MTT法、流式细胞术、Transwell侵袭和迁移实验检测转染后HCT116细胞的增殖、周期、凋亡、侵袭、迁移;以Western blotting检测转染后HCT116细胞PTEN的表达,荧光素酶报告实验检测转染后HCT116细胞PTEN的活性。结果：miR-21抑制剂转染后,HCT116细胞中miR-21的表达较NC和MOCK组细胞明显降低。下调miR-21后,HCT116细胞的增殖能力明显降低\[72 h时：（1.05±0.45） vs （1.43±0.02）,（1.45±0.01）;t=13.83,P=0000 159;t=14.88,P=0.000 119\],细胞凋亡率显著增加\[（16.30±1.00）% vs（1.87±0.53）%,（1.86±0.12）%;t=25.01,P=0.000 015 2;t=24.985,P=0.000 015 2\],细胞周期阻滞于G0/G1期,细胞的侵袭\[（50±2.0） vs （115±3.0）,（111±3.0）个;t=29.09,P=0.000 008 31;t=31.23,P=0.000 006 27\]和迁移能力\[（22±2.0） vs （52.3±2.5）,（53.0±1.0）个;t=2401,P=0.000 017 8;t=16.34,P=0.000 082 0\]明显下降。miR-21抑制剂转染的HCT116细胞中PTEN的表达及其荧光素酶相对活性均显著增加。结论：miR-21可能通过抑制PTEN进而调控大肠癌细胞生物学行为,PTEN可能是miR-21的靶基因之一。     

miR-145-5p靶向TAGLN2调控结直肠癌SW620细胞侵袭和迁移的机制探讨

目的:探究微小RNA-145-5p（miR-145-5p）在结直肠癌组织和细胞中的表达情况及其靶向调控肌动蛋白凝胶蛋白2（TAGLN2）对结直肠癌细胞侵袭和迁移能力的影响。方法:采用实时荧光定量PCR（qPCR）技术对48例结直肠癌患者癌组织、配对癌旁组织、结直肠癌细胞株（HCT8、SW620、HCT116、HT-29）及结直肠黏膜细胞FHC中的miR-145-5p和TAGLN2 mRNA表达进行定量分析。将SW620细胞设为空白对照组、miR-145-5p mimics组、mimics-NC组、pcDNA3.1-TAGLN2组、pcDNA3.1-Vector组和miR-145-5p mimics+pcDNA3.1-TAGLN2组,采用qPCR检测miR-145-5p和TAGLN2 mRNA表达,采用Transwell法检测细胞侵袭及迁移能力,采用免疫印迹法（Western blot）检测TAGLN2蛋白及EMT相关蛋白表达,采用双荧光素酶报告实验检测miR-145-5p和TAGLN2间的靶向关系。结果:miR-145-5p在结直肠癌组织中的表达水平显著低于癌旁组织（P<0.05）,并与结直肠癌患者的TNM分期和淋巴结转移相关（均P<0.05）;TAGLN2在结直肠癌组织中的表达水平显著高于癌旁组织,并与miR-145-5p表达呈负相关（P<0.05）;miR-145-5p和TAGLN2在结直肠癌HCT8、SW620、HCT116和HT-29细胞中的表达水平显著低于或高于FHC细胞（均P<0.05）。miR-145-5p过表达可降低SW620细胞的侵袭和迁移能力。miR-145-5p靶向调控TAGLN2表达,单独转染TAGLN2阳性质粒可增加SW620细胞的侵袭和迁移能力,与miR-145-5p mimics同时转染后,TAGLN2蛋白、波形蛋白（Vimentin）和神经钙黏素（N-cadherin）表达降低,上皮钙黏素（E-cadherin）表达升高,TAGLN2对SW620细胞侵袭和迁移能力的增强作用被显著抑制。结论:miR-145-5p在结直肠癌中呈低表达状态,其表达水平与结直肠癌患者的TNM分期和淋巴结转移密切相关,miR-145-5p靶向调控TAGLN2抑制结直肠癌细胞的侵袭和迁移能力。     

基于β-catenin/TCF4信号通路探究miR-455-3p对人结肠癌细胞增殖、凋亡及糖酵解的影响

目的 基于β-catenin/TCF4信号通路探究mi R-455-3p对人结肠癌细胞增殖、凋亡及糖酵解的影响。方法HCT116细胞转染mi R-455-3p mimics为mi R-455-3p转染组,HCT116细胞转染mi R-455-3p NC为mi R-NC组,HCT116细胞不转染任何质粒为空白组。MTT法检测各组HCT116细胞增殖情况;流式细胞术检测细胞凋亡情况;检测各组细胞糖酵解葡萄糖摄取量和乳酸生成量; Western blotting检测各组细胞中HK2、β-catenin、TCF4蛋白水平。结果 空白组和mi R-NC组细胞中mi R-455-3p表达量分别为0.99±0.09和1.01±0.10,均低于mi R-455-3p转染组的1.82±0.12,差异具有统计学意义(P<0.05)。空白组和mi R-NC组48 h吸光值(A)分别为0.75±0.05和0.78±0.06,均高于mi R-455-3p转染组的0.32±0.02,差异具有统计学意义(P<0.05)。空白组和mi R-NC组细胞凋亡率分别为(2.35±0.6)%和(2.46±0.5)...     

微小RNA-630对U251神经胶质瘤细胞增殖和凋亡的影响

目的 探讨微小RNA-630(miR-630)对U251神经胶质瘤细胞增殖和凋亡的影响及其调控机制。方法 荧光定量PCR(qPCR)检测人脑胶质瘤组织和细胞的miR-630表达水平。采用脂质体转染法向U251细胞转染miR-630模拟物mimics(miR-630 mimics组)及阴性对照序列(miR-NC mimics组),另选取未转染细胞为空白对照(Control)组，经qPCR验证miR-630 mimics显著增强miR-630基因表达后进一步进行功能研究：CCK-8和Hoechst染色法检测细胞增殖变化，采用流式细胞术、qPCR和Western blot分别检测凋亡细胞百分率和凋亡基因表达，qPCR和双荧光素酶报告基因系统分别检测20S蛋白酶体α1亚基(PSMA1)的表达及其与miR-630靶向关系验证。结果 miR-630在胶质瘤组织和细胞表达下调。与Control组和miR-NC mimics组相比，miR-630 mimics组U251细胞增殖能力下降，细胞凋亡增加，抗凋亡基因Bcl-2表达降低，cleaved caspase-3表达增加。过表达miR-630显著降低...     

水通道蛋白-5对结直肠癌细胞迁移、凋亡的影响及机制研究

目的:探讨短发夹RNA（short hairpin RNA,shRNA）沉默水通道蛋白-5（aquaporin-5,AQP5）对人结直肠癌HT-29细胞和HCT116细胞迁移、凋亡的影响及相关机制。方法:构建pRNA-H1.1-AQP5的干扰质粒和pRNA-H1.1-NC的对照质粒转染HT-29和HCT116细胞,利用Real-time PCR（RT-PCR）、Western blot方法验证AQP5基因敲降效率,划痕试验检测AQP5-shRNA对结直肠癌细胞迁移率的影响,流式细胞术检测各组细胞的细胞凋亡率,Western blot检测凋亡相关蛋白Bax和Bcl-2基因在蛋白水平的表达。选用NF-κB抑制剂BAY 11-7082（BAY）处理转染AQP5-shRNA的HT-29和HCT116细胞,划痕试验检测各组细胞的迁移率,Western blot检测凋亡基因Bax和Bcl-2的表达情况。结果:AQP-shRNA转染HT-29和HCT116细胞中,AQP5表达量明显低于NC-shRNA转染的HT-29和HCT116细胞（P＜0.05）。划痕试验结果表明,对比NC组,AQP5-shRNA明显抑制HT-29和HCT116细胞的迁移（P＜0.05）。流式细胞术结果表明AQP5-shRNA显著提高HT-29和HCT116细胞的凋亡率（P＜0.05）。对比NC-shRNA组,AQP5-shRNA组细胞中Bax蛋白表达明显提高,而Bcl-2蛋白表达显著下降。BAY处理后,AQP5-shRNA所抑制的结直肠癌细胞迁移率显著下降,AQP5-shRNA所促进的细胞凋亡率显著升高,且对比AQP5-shRNA组,AQP5-shRNA与BAY共同处理的细胞中Bax蛋白表达明显升高,Bcl-2蛋白表达明显降低。结论:AQP5-shRNA抑制结直肠癌细胞迁移,促进结直肠癌细胞凋亡受NF-κB信号调控。     

miRNA-34 a对人结肠癌细胞 HCT116增殖及侵袭转移的影响

目的：研究微小RNA-34a（microRNA-34a,miR-34a）在人结肠癌细胞株HCT116中的过表达对细胞增殖和侵袭的影响及其机制。方法设计合成并构建携带绿色荧光蛋白（ GFP）的miR-34a真核表达载体,脂质体法稳定转染HCT116细胞。通过Realtime PCR验证转染后miR-34a的表达变化。 MTT法检测转染前后HCT116细胞增殖能力变化, Transwell法检测转染前后HCT116细胞侵袭能力改变,western blot检测目的蛋白的表达。结果 miR-34a转染HCT116细胞后其表达量增加到（7．32±1．34）倍,而HCT116细胞增殖能力也受到显著抑制,下降到（0．49±0．10）;Bcl-2蛋白受到miR-34a表达的抑制,而BAX的表达则受到miR-34a表达的增强;HCT116细胞侵袭能力在miR-34a过表达后显著增强,相应的MMP-2和MMP-9表达也出现显著增强。阴性对照组与空白对照组比较无显著性差异。结论 miR-34a的过表达能够抑制人结肠癌细胞HCT116的增殖及侵袭转移,与调控Bcl-2／BAX和MMP-2和-9蛋白的表达密切相关。     

miR-16对大肠癌细胞增殖能力的影响

目的研究miR-16在大肠癌组织中的表达及其在大肠癌细胞株HCT116和LoVo细胞增殖中的作用。方法运用Realtime PCR法检测miR-16在33对配对肠癌及癌旁正常组织中的表达。HCT116和LoVo细胞转染miR-16 抑制剂、阴性对照剂和模拟剂;CCK8法检测细胞增殖;流式细胞仪进行细胞周期检测;Western blot法检测细胞中cyclinD1、CDK6和GAPDH蛋白表达。结果（1）Realtime PCR结果显示miR-16在大肠癌组织中低表达（P=0.047）。（2）miR-16过表达可抑制HCT116和LoVo细胞增殖,诱导细胞G₀/G₁期阻滞,降低cyclinD1和CDK6蛋白表达。结论miR-16过表达可以抑制大肠癌细胞的增殖能力。     

ZIC1过表达对结直肠癌HCT-116细胞增殖及对苦参碱类生物碱药物敏感性的影响

目的:检测ZIC1基因在结直肠癌细胞内过表达后对癌细胞增殖能力的影响,以及对苦参碱类生物碱药物敏感性的改变情况。方法:首先从五种结直肠癌细胞株中筛选出ZIC1基因表达最低的一株,对其进行慢病毒转染,使其稳定表达ZIC1基因或空载体,再利用Western blot技术和qRT-PCR技术鉴定ZIC1蛋白/mRNA表达情况。通过CCK-8法和平板克隆形成实验检测过表达ZIC1基因后细胞增殖能力的改变,并利用CCK-8法分析稳转细胞株对苦参碱类生物碱药物敏感性的改变。结果:HCT116细胞株中ZIC1 mRNA/蛋白表达均显著低于其他四株（P<0.001）;慢病毒转染后,含rLV-ZIC1-PGK-Puro的重组慢病毒转染HCT116细胞内ZIC1 mRNA/蛋白表达水平显著高于对照组（P<0.001）。CCK-8实验结果示,ZIC1基因过表达后HCT116细胞增殖能力明显降低（P<0.01）;实验组克隆形成率明显低于对照组（P=0.003）。CCK-8法发现ZIC1过表达后HCT116结直肠癌细胞对苦参碱及槐定碱的药物敏感性得到明显的升高,而对氧化苦参碱及槐果碱的药物敏感性无明显改变。结论:HCT116结直肠癌细胞内ZIC1基因过表达后能有效抑制癌细胞的增殖,并增敏苦参碱及槐定碱对结直肠癌HCT116细胞的药理作用。     

miR-145通过下调OCT4基因抑制肺腺癌干细胞增殖

背景与目的 miR-145是通过miRNA芯片及qPCR验证筛选出的一种潜在肺癌"保护性"miRNA。本研究旨在探讨miR-145与肺癌干细胞之间的关系及分子机制。方法 miRNA芯片对肺腺癌患者瘤旁和正常组织进行表达谱分析;生物信息学软件预测miR-145潜在的靶基因;脂质体2000介导转染miR-145模拟物和阻遏物进入A549细胞株;实时定量PCR检测miR-145表达水平;Western blot检测OCT4蛋白水平;双荧光素酶报告基因验证miR-145是否作用于OCT4mRNA的3’UTR区预测靶位;细胞增殖实验检测miR-145对于A549细胞生长的作用;流式细胞术检测干细胞表型CD133+的表达。结果在肺腺癌组织中miR-145表达明显低于瘤旁正常组织;miRanda软件预测OCT4是miR-145潜在靶基因;与对照组相比,miR-145模拟物组和阻遏物组miR-145表达分别明显上调和下调;miR-145对A549细胞的生长有双向调节作用,过表达miR-145抑制细胞生长;过表达miR-145可明显降低OCT4蛋白水平及干细胞表型CD133百分比,而抑制miR-145表达则明显增加OCT4蛋白水平及CD133百分比。双荧光素酶报告基因检测证明miR-145可作用于OCT4mRNA的3’UTR区预测靶位。结论 miR-145可通过下调OCT4基因表达抑制A549肺腺癌细胞株中干细胞的增殖,是一种潜在的肺癌"保护性"miRNA。     

MicroRNA-320 family is downregulated in colorectal adenoma and affects tumor proliferation by targeting CDK6

AIM: To investigate the microRNA (miRNA) expression during histological progression from colorectal normal mucosa through adenoma to carcinoma within a lesion. METHODS: Using microarray, the sequential changes in miRNA expression profiles were compared in colonic lesions from matched samples; histologically, non-neoplastic mucosa, adenoma, and submucosal invasive carcinoma were microdissected from a tissue sample. Cell proliferation assay was performed to observe the effect of miRNA, and its target genes were predicted using bioinformatics approaches and the expression profile of SW480 transfected with the miRNA mimics. mRNA and protein levels of the target gene in colon cancer cell lines with a mimic control or miRNA mimics were measured using qRT-PCR and Western blotting. The expression levels of miRNA and target gene in colorectal tissue samples were also measured. RESULTS: Microarray analysis identified that the miR-320 family, including miR-320a, miR-320b, miR-320c, miR-320d and miR-320e, were differentially expressed in adenoma and submucosal invasive carcinoma. The miR-320 family, which inhibits cell proliferation, is frequently downregulated in colorectal adenoma and submucosal invasive carcinoma tissues. Seven genes including CDK6 were identified to be common in the results of gene expression array and bioinformatics analyses performed to find the target gene of the miR-320 family. We confirmed that mRNA and protein levels of CDK6 were significantly suppressed in colon cancer cell lines with miR-320 family mimics. CDK6 expression was found to increase from non-neoplastic mucosa through adenoma to submucosal invasive carcinoma tissues and showed an inverse correlation with miR-320 family expression. CONCLUSION: MiR-320 family affects colorectal tumor proliferation by targeting CDK6, plays important role in its growth, and is considered to be a biomarker for its early detection.     

miR-125在甲状腺癌组织中的表达及通过靶向负调控RAB11A促进甲状腺癌细胞活性的研究

目的:探讨miR-125在甲状腺癌组织中的表达及促进甲状腺癌细胞增殖的相关机制。方法:采用RT-PCR法检测26例甲状腺乳头状癌（PTC）标本和4株PTC细胞株中miR-125的表达水平。采用CCK-8法、细胞集落形成实验、Transwell实验以及流式细胞法验证miR-125在PTC细胞中的作用。采用双荧光素酶实验验证RAB11A是否是miR-125的直接靶点。结果:miR-125在甲状腺癌组织中的相对表达水平显著高于癌旁正常组织（P＜0.05）;与Nthy-Ori3-1相比,甲状腺癌细胞株TPC-1、NPA、KTC-1、WRO中的miR-125表达水平显著升高（P＜0.05）。与miRNA NC组相比,miR-125 mimics组的细胞克隆形成数量及侵袭细胞数量明显增多,miR-125 inhibitor组显著减少（P＜0.05）。Transwell实验结果显示,miRNA NC组细胞的迁移速度明显比miR-125 mimics组慢,但显著快于miR-125 inhibitor组。流式细胞检测显示,miRNA NC组、miR-125 mimics组、miR-125 inhibitor组的凋亡细胞比例分别为（5.1±0.08）%、（1.5±0.06）%、（7.8±0.07）%,两两比较后发现,miR-125 mimics组凋亡细胞比例最低,miR-125 inhibitor组最高。荧光素酶报告显示,RAB11A是miR-125的直接靶点。将miR-125模拟物、抑制剂或miRNA NC(100 nmol/L)转染KTC-1细胞后,RAB11A mRNA水平均无明显改变。但Western blot检测显示,与对照组相比,miR-125 mimics组RAB11A蛋白表达显著降低,miR-125 inhibitor组RAB11A蛋白表达显著增加。表明miR-125不影响RAB11A mRNA的稳定性,但在转录后水平调节RAB11A蛋白的表达。结论:miR-125通过在转录后水平负调控RAB11A蛋白的表达而发挥促甲状腺癌的作用。miR-125有望成为PTC患者诊断和治疗的新靶点。     

茯苓酸通过调控AKT/MDM2/p53通路影响结直肠癌HCT116细胞的恶性生物学行为

目的：探究茯苓酸（PA）是否通过AKT/MDM2/p53通路影响结直肠癌HCT116细胞的恶性生物学行为。方法：常规培养HCT116细胞,并将其分为对照组、MK-2206(AKT抑制剂)组、PA低浓度（PA-L）组、PA高浓度（PA-H）组、PA-H+SC79(AKT激活剂)组。CCK-8法、细胞克隆形成实验、流式细胞术、Transwell、qPCR法和WB法实验分别检测各组HCT116细胞的增殖活力,克隆形成能力,细胞凋亡,迁移、侵袭能力,E-cadherin、N-cadherin和vimentin mRNA表达以及AKT/MDM2/p53通路相关蛋白的表达。结果：PA可明显抑制HCT116细胞的增殖活力（P<0.05）、克隆形成能力（P<0.05）、迁移和侵袭能力（P<0.05）,诱导其凋亡（P<0.05）,抑制N-cadherin、vimentin mRNA的表达（P<0.05）,促进E-cadherin mRNA的表达（P<0.05）,抑制AKT、MDM2的磷酸化水平（P<0.05）,促进p53蛋白的表达（P<0.05）;AKT抑...