分子药理学中吸附层析模拟系统的研究

目的建立用于分子药理学研究的药物分离吸附层析模拟系统并初步应用。方法提出吸附层析的多室解吸理论模型 ,推导相关公式 ,编制计算机程序。结果与结论该模型可根据实验需要拟合出最佳分离效果的吸附层析解吸曲线 ,并准确描述系统各室浓度随时间的变化规律。介绍了数例有应用价值的特殊解吸曲线 ,并利用此系统对膜整合蛋白进行了分离 ,取得了较传统两室线性解吸法明显好的分离效果     

中药麻黄汤的分子药理学机制研究

目的:为中药麻黄汤的临床研究和应用提供理论依据。方法:采用文献检索和数据分析的方法对麻黄汤的中药组分进行分析,建立其中药组分数据库,利用计算机模拟预测的方法筛选其中的活性化合物,对相关靶点进行预测,探索其治疗伤寒证的分子药理学机制。结果:麻黄汤中约含有723个化合物,其中麻黄约含有236个,桂枝约含有115个,甘草约含有287个,杏仁约含有85个。通过计算机模拟预测共筛选出43个活性化合物,相关的18个作用靶点主要与舒张血管作用、肾上腺素样作用和促进平滑肌收缩作用有关。结论:本研究通过计算机口服生物利用度预测、类药性分析和靶点预测相结合,明确了麻黄汤中的活性化合物是通过舒张血管、促肾上腺素效应和促平滑肌收缩等作用发挥治疗伤寒证的功效。     

细胞周期调控剂的分子药理学研究

调控细胞周期进程的信号途径的发现是医学研究的一个重要里程碑。细胞周期信号途径分子之间功能关系知识的不断增加，为我们提供了理解疾病治疗潜在干预效应靶的框架。研究显示，许多疾病的发生是由于细胞周期调控失衡引起的，如人恶性肿瘤的分子特征是细胞周期调节的失控，导致细胞无限增殖。人们发现了许多与疾病相关的细胞周期分子靶点．这些分子靶点可以作为疾病治疗的基础。     

离子交换层析结合分子排阻色谱法测定注射用尿激酶中分子组分比

目的:建立测定注射用尿激酶分子组分比的离子交换层析样品前处理方法结合分子排阻色谱法的分析方法,以解决长期以来制剂标准中无法控制分子组分比的难题,并对国内6家企业的产品质量进行了考察。方法:根据尿激酶与人血白蛋白等电点的差异,通过离子交换层析去除样品中人血白蛋白辅料的干扰,采用分子排阻色谱法测定。采用TSKgel G2000SWXL色谱柱(300 mm×7.8 mm, 5μm),流动相为0.1 mol·L^-1磷酸二氢钠缓冲液(pH 3.0),流速为0.5 mL·min^-1,柱温为35℃,检测波长为280 nm,进样量为50μL。结果:尿激酶质量浓度在0.05～5.1 mg·mL^-1范围内,高分子量尿激酶与低分子量尿激酶线性关系均良好(r≥0.998 0);检测限分别为1.5μg·mL^-1与5.1μg·mL^-1,定量限分别为5.1μg·mL^-1与16.9μg·mL^-1;精密度、重复性、24 h稳定性试验的RSD均<4.0%;方法的回...     

基于网络药理学和分子对接探讨熊果酸治疗胃癌的分子机制

目的:研究熊果酸治疗胃癌的作用机制。方法:本研究通过TCMSP,SymMap,DrugBank,Uniprot,DisGeNET数据库预测及筛选出熊果酸抗胃癌的潜在靶点。依托STRING数据库构建蛋白互作网络,借助Cytoscape 3.7.1软件绘图。通过生物学信息注释DAVID数据库对靶点进行KEGG及GO的富集分析。使用AutodockVina进行分子对接,预测核心靶点和熊果酸的结合度,利用PyMOL软件绘图。结果:熊果酸治疗胃癌共有48个靶点,核心靶点包括血管内皮生长因子A(VEGFA)、信号转导与转录活化因子3(STAT3)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、白介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)等靶点;筛选出与肿瘤相关的前10个通路,主要的信号通路包括:PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、p53信号通路。结论:本研究通过网络药理学的方法,揭示出熊果酸通过抑制肿瘤细胞增殖、诱导细胞凋亡、增强抗血管生成等通路发挥多靶点和多通路的抗胃癌作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨熊果酸治疗骨质疏松的分子机制

目的:探讨熊果酸治疗骨质疏松症(OP)的潜在分子机制.方法:运用中药系统药理学分析平台数据库、PubMed数据库、UniProt数据库筛选单体化合物熊果酸的作用靶点基因,借助GeneCards数据库检索OP相关靶点基因,并运用Venny 2.1在线作图工具获取成分-疾病的共有靶点基因;运用STRING数据库构建成分-疾...     

三苯氧胺抗癌作用的分子药理学

三苯氧胺抗癌作用的分子药理学李欣，杜光祖（广州军区武汉总医院肿瘤科，武汉４３００７０）中文图书资料分类法分类号Ｒ９７９·１三苯氧胺（ＴＡＭ）是治疗雌激素受体阳性（ＥＲ＋）原发性乳癌患者的一线内分泌治疗药。但几乎所有晚期乳癌患者最终发生ＴＡＭ耐药。了解...     

中枢烟碱样乙酰胆碱受体的分子药理学研究进展

烟碱样乙酰胆碱受体（ｎＡＣｈＲ）是第一个被分离纯化的、具有五聚体的跨膜受体。但由于中枢ｎＡＣｈＲ的多样性和药理学反应的复杂性，至今尚未清楚其在中枢的结构和功能。随着生物基因工程的发展，中枢ｎＡＣｈＲ的研究也发生了突破性进展。仅不到５年的时间，就确定了ｎＡＣｈＲ的基因序列及其结构特点；并从鸡、大鼠、小鼠和人的脑组织中至少提取和克隆了１２个中枢ｎＡＣｈＲ的亚单位，建立了ｎＡＣｈＲ的基因库。随后在体外，     

基于网络药理学及分子对接研究穿心莲抗炎的分子机制

基于网络药理学方法以及分子对接技术,研究了穿心莲抗炎作用的潜在分子机制.利用TCMSP数据库挖掘穿心莲有效活性成分及靶点,DisGeNET、GeneCards数据库挖掘疾病靶点,分别在STRING、Metascape、Reactome网站提交交集基因,进行蛋白质相互作用网络(PPI)、基因本体(GO)及通路(KEGG)...     

基于网络药理学及分子对接的紫草治疗乳腺癌作用机制研究

目的 利用网络药理学分析方法和分子对接探讨紫草多靶点、多通路抗乳腺癌作用机制.方法 通过TCMSP数据库收集紫草的活性成分与靶点,GeneCard与DisGeNET数据库检索与乳腺癌相关的靶点,基于Cytoscape 3.6.1软件及STRING数据库构建活性成分与作用靶点的网络与蛋白相互作用PPI网络,利用David...     

基于网络药理学和反向分子对接的西红花抗肿瘤作用机制研究

目的 运用网络药理学和反向分子对接技术探讨西红花抗肿瘤的作用机制。方法 通过检索文献和从中药系统药理学数据库（TCMSP）获取西红花的主要化学成分,利用PharmMapper服务器预测西红花活性成分的潜在靶点,通过UniProt数据库将西红花潜在靶点转换为对应的靶标基因,与GeneCards、OMIM和TTD数据库获得的肿瘤相关靶点进行映射分析,得到西红花抗肿瘤的潜在作用靶点。采用Cytoscape软件构建西红花“活性成分-靶点-疾病”相互作用网络,通过String数据库进行蛋白-蛋白相互作用分析,并利用Metascape平台进行GO功能和KEGG通路富集分析。使用AutoDock、Pymol软件对活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果 共筛选出西红花中槲皮素、山柰酚、异鼠李素、苦番红花素和西红花苷Ⅰ等9个活性成分,可能作用于AKT1、CCND1、MMP9、EGFR、TP53等37个关键靶点,涉及P53信号通路及TNF信号通路等。分子对接显示可通过氢键、疏水作用等产生稳定结合。结论 初步探讨了西红花抗肿瘤的主要活性成分、关键靶点及通路,提示可通过诱导细胞凋亡等方式发挥抗肿瘤作用,为后...     

基于网络药理学探究山药治疗阿尔茨海默病的分子机制

目的 基于网络药理学方法探究山药治疗阿尔茨海默病的潜在作用机制.方法 通过TCMSP数据库进行山药潜在化学成分获取和靶点预测,运用GeneCards及OMIM数据库预测筛选与阿尔茨海默病相关的基因,采用R软件进行药物靶点与疾病靶点映射匹配.通过Cytoscape软件进行疾病-药物-成分-靶点可视化网络建立,借助Stri...     

基于网络药理学和分子对接探讨厚朴酚治疗胆管癌的分子机制

目的：基于网络药理学和分子对接筛选厚朴酚作用胆管癌的具体靶点,探讨厚朴酚治疗胆管癌的潜在机制。方法：基于TCMSP、Swiss Target Prediction、STITCH、GeneCards和DisGeNET数据库筛选出厚朴酚以及胆管癌的靶点基因,通过Venny 2.1.0平台分析得到两者的共同靶点。利用STRING数据库探索厚朴酚以及胆管癌共同靶点之间的相互作用关系,使用CytoScape3.9.1软件筛选Top10-Hub(核心)靶点。通过DAVID数据库对厚朴酚和胆管癌的共同靶点基因进行GO和KEGG富集分析,使用Auto Dock Tools-1.5.6软件进行分子对接验证结果可信性。结果：厚朴酚治疗胆管癌的交集靶点基因47个,核心靶点为AKT1、IL6、CASP3、CCND1、PTGS2、EGFR、ERBB2、MMP9、MMP2和KDR。GO生物过程富集分析中共得到230条结果,主要包括负调控凋亡过程、正向调节细胞增殖和蛋白质自身磷酸化等。KEGG信号通路分析得到120条,主要涉及癌症信号通路、内分泌耐药和膀胱癌等。分子对接结果显示核心靶点与厚朴酚的结合能均<-5...     

基于网络药理学的中药鸦胆子治疗肺癌的分子机制研究

目的 运用网络药理学的方法构建中药鸦胆子活性成分-靶点网络和蛋白相互作用网络,对靶点涉及的功能和通路进行分析,探讨中药鸦胆子治疗肺癌的分子机制.方法 利用TCMSP数据库结合文献挖掘筛选鸦胆子主要活性成分,利用TCMSP、BATMAN-TCM、GeneCards和OMIM数据库结合文献挖掘筛选活性成分靶点.采用Cyto...     

基于网络药理学和分子对接探讨三七治疗视网膜静脉阻塞的分子机制

目的：探讨三七治疗视网膜静脉阻塞（RVO）的分子作用机制。方法：采用TCMSP数据库及文献补充获得三七的有效成分,并在Swiss Target Prediction收集其作用靶点;使用GeneCards等5个数据库检索RVO疾病靶点,并将三七成分靶点与RVO疾病靶点进行映射;利用STRING、Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图,筛选出核心靶基因,对其进行GO和KEGG富集分析。最后,利用Sybyl-x 2.0软件进行分子对接验证。结果：筛选出三七有效成分10种,涉及354种蛋白。RVO的疾病靶点有181个,其中9个是三七治疗RVO的潜在靶点。“药物-活性成分-疾病-靶蛋白”相互作用网络中,核心作用靶点包括VEGFA、EGFR等;通过GO及KEGG富集分析,筛选出参与RVO主要生物学过程28种,相关信号通路18条。三七治疗RVO潜在的分子机制与纤溶等生物学过程密切相关。关键信号通路包括HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路等。分子对接结果提示,三七主要活性成分DFV、Panaxydol等与VEGFA、EGFR等关键靶点有着较好的结合活性。结论：三七的多成...     

基于网络药理学和分子对接的牵牛子抗肿瘤作用机制研究

目的 借助网络药理学联合分子对接技术,探究牵牛子抗肿瘤作用的潜在药效物质基础、作用靶点以及作用机制。方法 利用TCMSP平台获得牵牛子活性成分及其对应的靶点;整合与肿瘤相关的疾病靶点,与药物靶点取交集获得药物作用于肿瘤的靶点;使用STRING数据库得到PPI网络图;使用Metascape数据库对交集靶点进行GO富集分析以及KEGG富集分析;应用Cytoscape 3.8.2软件构建牵牛子活性成分-肿瘤靶点-作用通路网络图;应用AutoDock vina 1.1.2脚本对预测结果进行对接验证。结果 脱水淫羊藿素、β-谷甾醇、8-异戊烯基山柰酚等可能为牵牛子发挥抗肿瘤作用的核心药效成分;PPI网络显示CASP3、JUN、ESR1等为关键作用靶点;通路分析显示肿瘤靶点主要富集于雌激素信号通路、甲状腺激素信号通路、p53信号通路等;分子对接结果显示：牵牛子的核心药效成分与关键肿瘤靶点具有较好的结合能力。结论 初步探究了牵牛子抗肿瘤作用的潜在药效物质基础、作用靶点及作用机制,为牵牛子治疗肿瘤的临床应用以及抗肿瘤药物研发提供科学依据。     

生化与分子药理学的将来

药理学与分子生物学的结合：自1953年克拉克（Crick）、华生（Watson）及怀京（Wilkins）共同发现DNA之双联结构。1983年默理斯（Mullis）开发之聚合胺连锁反应。2003年，人类基因组解碣。现在则进入“系统生物学”时代。药理学，从药物动力学、药效学、药效或毒性的差异都用基因变异之分子层次去解释。     

天麻素抗偏头痛作用机制的网络药理学与分子对接研究

目的 为天麻素在临床用于抗偏头痛提供理论依据。方法 通过SwissTargetPrediction数据库获取天麻素的作用靶点,GeneCards数据库获取偏头痛的相关靶点,R 3.6.2软件获取天麻素抗偏头痛的靶点,将靶点输入String数据库构建蛋白互作网络,运用R 3.6.2软件对天麻素抗偏头痛靶点进行GO生物过程富集分析和KEGG通路富集分析,经Cytoscape 3.9.1软件构建靶点-通路网络。在AutoDock＿vina 1.1.2分子模拟软件中进行分子对接,验证天麻素与关键靶点的结合力。结果 获取天麻素抗偏头痛的靶点50个。GO生物过程富集分析显示,富集P值较显著的生物过程为内肽酶活性、碳酸盐脱水酶活性、水裂解酶活性等。KEGG通路富集分析显示,富集P值较显著的信号通路为氮代谢（hsa00910）、脂质与动脉粥样硬化（hsa05417）等,其富集的靶点为碳酸酐酶（CA）、基质金属蛋白酶（MMP）、半胱氨酸天门冬氨酸特异性蛋白酶（CASP）等。分子对接结果显示,天麻素与CA1,CA9,MMP-9,CASP1靶点的对接结合能绝对值均高于7.5 kcal/mol。结论 天麻素通...