新疆维吾尔族慢性乙型肝炎病毒感染者病毒基因型及亚型分布特点

目的 了解新疆维吾尔自治区(简称新疆)维吾尔族慢性HBV感染者基因型、基因亚型分布情况及其与预后的关系.方法 采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析方法,分析109例新疆维吾尔族慢性HBV感染者感染病毒的基因型及基因亚型.多标本均数比较采用单向方差分析.结果 109例新疆维吾尔族慢性HBV感染者,其中慢性乙型肝炎88例,乙型肝炎肝硬化17例,肝癌4例.13基因型HBV感染者9例,占8.3%,C基因型感染者50例,占45.9%,C/D基因型重组体32例,占29.4%,D基因型感染者18例,占16.5%,C基因型、C/D基因型重组体为主要基因型.经过聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析及测序检测,鉴定9份B基因型HBV,均为Ba亚型.50例C基因型HBV感染者病毒基因亚型分布情况:Cl亚型27例,占54%,C2亚型23例,Cl亚型比C2亚型感染者多.在慢性乙型肝炎、乙型肝炎肝硬化、肝癌患者中,HBV Ba基因亚型感染者分别为8例(9.1%)、1例(5.8%)和0例;C2基因亚型感染者分别为17例(19.3%)、8例(47.5%)和2例(50%);C/D基因型感染者分别为29例(33.0%)、2例(11.9%)和1例(25%),随着病情加重,Ba基因亚型和C/D基因型感染者所占比例呈下降趋势,C2基因亚型感染者所占比例增加.结论 新疆地区维吾尔族慢性HBV感染者以Cl基因亚型为主,新疆维吾尔族慢性HBV感染者存在C/D基因型重组体.C2基因亚型HBV感染预示病情严重,预后差.     

乙型肝炎病毒基因型研究进展

1988年Okamoto等[1]通过对18株不同血清型乙型肝炎病毒(HBV)DNA进行全序列分析,将HBV分为A、B、C、D四种基因型。目前,根据HBV全基因组核苷酸序列差异≥8%或S基因序列差异≥4%,将HBV分为8个基因型,分别命名为A~H。每种基因型又可分为不同亚型,如A基因型可进一步分为A1(Aa)、A2(Ae)、A3(Ac)亚型;B基因型分为B1(Bj)、B2(Ba)、B3、B4和B5亚型;C基因型分为C1(Cs)、C2(Ce)、C3、C4和C5亚型;D基因型分为D1、D2、D3和D4亚型;F基因型分为F1和F2亚型等[2-6]。一、HBV基因型的地域和种族分布HBV基因型的分布具有明显的种族和…     

慢性乙型肝炎患者HBV基因型和亚型分布调查

目的研究慢性乙型肝炎患者HBV基因型和亚型流行情况。方法应用HBV基因型和亚型特异性引物PCR法对北京、长春、大连、西安、石家庄、郑州和合肥7个城市660份HBVDNA阳性慢性乙型肝炎患者血清进行基因型和亚型分析。结果在660份HBVDNA阳性血清中,B基因型、C基因型和B/C混合感染分别为16.67%(110/660)、74.54%(492/660)和8.79%(58/660);在C基因型中,C1亚型6例(1.22%)、C2亚型473例(96.14%)、C1/C2混合基因亚型13例(2.64%);B基因型均为Ba亚型,B基因型和C基因型混合感染者均为Ba与C2亚型混合感染,未发现其他基因型和基因亚型;不同基因型感染患者HBeAg阳性率差异无统计学意义(P=0.153);B基因型和C基因型患者之间血清HBVDNA水平差异无统计学意义(6.37±1.62lgcopies/ml对6.29±1.76lgcopies/ml),但均高于B和C基因型混合感染患者(5.25±1.65lgcopies/ml)。结论这7个城市慢性乙型肝炎患者以B基因型和C基因型感染为主,有部分B/C基因型混合感染。HBV亚型以Ba和C2亚型占优势。     

云南大理白族人群乙型肝炎病毒基因型和亚型的分布

目的调查云南大理地区白族人群乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）基因型和亚型分布情况。方法在大理地区选择100例白族慢性HBV感染者，采用基因型特异性引物分型法和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）方法测定HBV感染者血清HBV基因型和亚型，并用ELISA法测定HBV血清标志物。结果100例HBV感染者中，B型41例（41％），全部为Ba亚型，未发现Bj亚型；C型25例（25％），其中Cs亚型21例（84％），Ce亚型3例（12％），未分型1例（4％）；B＋C混合型34例（34％）。B型感染者与C型感染者比较血清HBeAg阳性率差异有统计学意义（P=0．024）。结论云南大理白族人群HBV感染的基因型主要为B型、B＋C混合型和c型，以Ba和cs亚型为主要流行株，B＋C混合型感染占很大比例。     

泉州地区慢性重型肝炎患者乙型肝炎病毒基因型及亚型分布特点

目前已知,HBV被分为A～H 8种基因型,由于在同一基因型病毒株之间还存在着一定的差异,故依据全基因序列异质性>4%且<8%的原则,进一步将基因型分为不同亚型,如B型分为B1(Bj)、B2(Ba)、B3(Ba)、B4(Ba)等亚型,C型分为C1(Cs)、C2(Ce)、C3、C4、C5等亚型,在基因型亚型之间也存在着地域分布及临床差异[1-3].泉州地区HBV感染引起慢性重型肝炎的基因型以B型为主,其次为C型,亦存在一定比例的B/C基因型混合感染[4].为进一步明确泉州地区重型肝炎HBV基因型、基因亚型的分布特点,我们对慢性重型肝炎患者进行HBV S基因测序,通过HBV S基因进化树图验证了HBV基因型、区分HBV基因亚型.     

135例乙型肝炎病毒感染者基因分型及其临床分布

目的研究乙型肝炎病毒（HBV）感染者中HBV基因分型及其临床分布情况。方法应用基因型和亚型特异性引物聚合酶链反应（PCR）法，对鲁西地区135例HBV感染者血清进行HBV基因型及亚型分型。结果未分型11例，已分型124例。其中C型111例（C2基因亚型87例、非C1／C2亚型24例）；B型11例，其中Ba型8例、Bj型3例；B／C混合型2例均为BaC2亚型混和感染。在肝硬化和重度慢性乙型肝炎中C型所占比例较高，分别为100％、88％；无症状携带者中B型所占比例较高为8．51％；HBV基因型分型与性别无关。结论鲁西地区HBV感染者以C基因型为主，其中C2亚型占优势。     

慢性乙型肝炎患者HBV基因型和哑型分布调查

目的研究慢性乙型肝炎患者HBV基因型和亚型流行情况。方法应用HBV基因型和亚型特异性引物PCR法对北京、长春、大连、西安、石家庄、郑州和合肥7个城市660份HBV DNA阳性慢性乙型肝炎患者血清进行基因型和亚型分析。结果在660份HBV DNA阳性血清中,B基因型、C基因型和B／C混合感染分别为16．67％（110／660）、74．54％（492／660）和8．79％（58／660）;在C基因型中,C1亚型6例（1．22％）、C2亚型473例（96．14％）、C1／C2混合基因亚型13例（2．64％）;B基因型均为Ba亚型,B基因型和C基因型混合感染者均为Ba与C2亚型混合感染,未发现其他基因型和基因亚型;不同基因型感染患者HBeAg阳性率差异无统计学意义（P=0．153）;B基因型和C基因型患者之间血清HBV DNA水平差异无统计学意义（6．37±1．62lg copies／ml对6．29±1．76lg copies／ml）,但均高于B和C基因型混合感染患者（5．25±1．65lg copies／ml）。结论这7个城市慢性乙型肝炎患者以B基因型和C基因型感染为主,有部分B／C基因型混合感染。HBV亚型以Ba和C2亚型占优势。     

慢性乙型肝炎病毒基因型和亚型分布及与临床关系的探讨

目的了解乙型肝炎病毒(HBV)基因型和亚型分布情况,探讨其与临床的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)对2006年1月至4月邯郸市传染病医院收集的108份HBV感染者的血清进行乙型肝炎病毒基因型和亚型分型,分析乙型肝炎病毒基因型与患者临床特点的相关性。结果108例慢性乙型肝炎患者感染的HBV主要以C基因型为主,占93.5%,B基因型占6.5%;B基因型中均为Ba型,C基因型中C2亚型为主,占C基因型的88.1%。不同性别感染基因型和C1、C2亚型分布差异无显著性意义。肝生化指标丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)、总胆红素(TBil)比较提示C基因型患者的肝脏炎症较B基因型患者重,但差异无显著性意义。C基因型患者血清乙型肝炎病毒e抗原(HBeAg)阳性率显著高于B基因型患者。C基因型患者血清HBV-DNA略高于B基因型,但差异无显著性意义。C1、C2亚型间在肝功能、HBeAg阳性率和血清HBV-DNA载量方面差异均无显著性意义。结论慢性乙型肝炎患者感染的HBV主要以C基因型(C2亚型)为主。C基因型的患者血清HBeAg阳性率高于B基因型,C基因型患者与B基因型相比肝脏炎症程度、HBV-DNA载量差异无显著性意义。C1和C2亚型患者的临床特点相似。     

中国广东地区乙型肝炎病毒基因亚型的分布

目的调查中国广东地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型,主要是基因亚型的分布情况.方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法以及序列测定法,对广东地区417例慢性HBV感染者血清进行研究.结果广东地区流行的HBV基因型主要为B型和C型,其中B型为Ba亚型,未发现Bj亚型的存在.C亚型有C1和C2两个亚型,其中C1占63%,C2占37%.结论广东地区流行的HBV基因型以Ba和C1亚型为主,C2亚型较少,Bj亚型极为罕见.     

泉州地区慢性乙型肝炎患者HBV基因型、基因亚型及血清型分布调查

目的调查泉州地区慢性乙型肝炎患者HBV基因型、基因亚型及血清型的分布。方法采用巢式PCR法对48例样本S基因扩增后进行测序,应用Neighbor Joining构建系统进化树并分析其基因型和基因亚型,应用Magnius和Norder法进行血清型分析。结果48例慢性乙型肝炎患者中,检测出B基因型35例（68.8%）,C型13例（31.2%）;B基因型中Ba亚型占97.0%,adw2血清型占93.9%;C基因型中C2亚型占93.3%,adrq+血清型占80.0%。结论泉州地区慢性乙型肝炎患者以B基因型为主,其次是C基因型;B基因型样本中,以Ba亚型和adw2血清型为主,C基因型样本中,以C2亚型和adrq+血清型为主。     

福州市乙肝病毒基因型和基因亚型的分布及其与前C、C基因启动子变异的关系

目的 研究福州市乙肝病毒基因型和亚型分布及其与T1762/A1764、A1896变异的关系,为完善预防、诊断、治疗病毒感染的策略和方法提供科学依据. 方法 应用型特异性引物PCR法检测HBsAg阳性血清的基因型,应用PCR-RFLP方法检测基因亚型、T1762/A1764变异和A1896变异. 结果 282份HBsAg阳性血清样品中103份未能成功分型,其余179份样品中B基因型122份(68.2%),C基因型54份(30.2%),B C型3份(1.7%),未检测到其他基因型.随机选取的100份B基因型样品中,Ba亚型71份(71.0%),Bj亚型8份(8.0%),未能分亚型者21份(21.0%).54份C基因型样品中Ce亚型 31份(57.4%),Cs亚型 14份(25.9%),Ce Cs 1份(1.9%),未能分亚型者8份(14.8%).T1762/A1764变异标本9份(8.7%),Ce亚型变异率最高(29.2%),Ba亚型次之(3.3%),Cs和Bj亚型未检测到变异株,T1762/A1764变异在不同基因型和亚型间的分布差异有统计学意义(P＜0.05).A1896变异标本10份(10.0%),Ba亚型变异率最高(14.0%),Cs亚型次之(10.0%),Ce亚型最低(4.0%),不同基因型和亚型中的变异差异无统计学意义(P＞0.05).HBeAg阳性和阴性样品中的基因型和亚型分布差异无统计学意义(P＞0.05). 结论 福州市乙肝病毒以B、C基因型为主,Ba、Ce亚型占优势,HBV各基因型和亚型发生T1762/A1764、A1896变异的模式不同.     

厦门市乙型肝炎病毒亚基因型分布的初步研究

目的探讨厦门地区乙型肝炎患者血清乙型肝炎病毒（HBV）基因型的分布情况。方法应用混合性型特异性引物聚合酶链反应法结合琼脂糖电泳，根据PCR产物片段大小直接判定HBV基因型；应用PCR扩增全S基因序列-DNA测序-生物信息学分析方法确定部分样本的亚基因型，并探讨前前S区编码的流行情况。结果在217例可以通过混合性型特异性引物聚合酶链反应法确定基因型的感染者中，B型83例（38．2％）、C型71例（32．7％），B／C混合型63例（29．0％）。HBeAg阳性患者中感染B基因型占50％，B／C型混合感染占22％；抗-HBe阳性患者中B／C型混合感染36％，B型38％；在慢性乙型肝炎患者中，以B基因型多见（46％），在肝硬化和肝癌患者中，以C（41％和42％）或B／C混合基因型（38％和33％）感染为主；20例患者血清经过DNA测序-生物信息学分析方法确定了亚基因型，其中B2亚型2例，C2亚型18例，其中混合性型特异性引物聚合酶链反应判断为B型的4例经过测序分析为C2亚型。B2亚型不编码前前S区，18例C2亚型均编码前前S区。结论本研究提示厦门地区乙型肝炎患者群的HBV基因型B、C型的感染率大致相同，亚基因型分析提示C2亚基因型占90％，可能是B／C基因型重组的结果。C2亚基因型病毒株均编码前前S区，提示前前S区的编码可能具有亚基因型特异性。     

Hepatitis B virus genotypes and subgenotypes in China

Eight Hepatitis B virus (HBV) genotypes (A to H) have been identified based on an intergenotype divergence of 8% or more in the entire nucleotide sequence. Subgenotypes have also been identified in different HBV genotypes. As a highly endemic area for HBV infection, the prevalence of chronic HBV infection in China is between 8 and 20% of the general population. Genotypes B and C were identified as the most common HBV strains and account for approximately 95% of Chinese patients. Further study confirmed all genotype B strains belong to subgenotype Ba. Two of genotype C subgenotypes, C1 (Cs) and C2 (Ce), were found in China and they showed different geographic distributions. Genotype A was very rarely found, while genotypes E, F, G and H have not beenreported until now. Two types of HBV C/Drecombinant viruses have been identified in west China and distinct geographic and ethnic distributions were observed. Significant differences were observed ( P  < 0.001) in the prevalence of A1896 and T1762/A1764 mutations among HBV Ba, C1 and C2 subgenotypes in Chinese patients. Accumulating evidence showed the response rate to antiviral therapy in Chinese patients is higher in genotype B than genotype C patients on interferon treatment, but no difference was observed on nucleoside/nucleotide analog treatment.     

A complete genomic analysis of hepatitis B virus genotypes and mutations in HBeAg-negative chronic hepatitis B in China

Summary.  We aimed to study the distribution of hepatitis B virus (HBV) genotypes/subgenotypes in different parts of China and their clinical impact on the severity of hepatitis B e antigen (HBeAg)-negative chronic hepatitis B. Residual serum samples from a cohort of HBeAg-negative chronic hepatitis B patients in Hong Kong, Shanghai and Beijing were studied. Complete HBV genomic sequencing was performed for phylogenetic tree analysis and determination of HBV mutations was carried out. Mutations associated with severe liver fibrosis (Ishak score 4 or more) were selected by computerized information gain criteria. Genotype B (all subgenotype Ba) HBV was present in 19 of 45 (42%), 12 of 31 (39%) and 5 of 25 (20%) patients in Hong Kong, Shanghai and Beijing, respectively ( P  = 0.16). Ninety-seven per cent of genotype C HBV in Shanghai and Beijing belonged to subgenotype Ce whereas 69% of genotype C patients in Hong Kong belonged to subgenotype Cs ( P  < 0.001). Patients infected by subgenotype Cs had the lowest serum albumin and highest alanine aminotransferase levels compared with subgenotype Ce and Ba. Patients infected by subgenotype Cs also had more severe histological necroinflammation than subgenotype Ce. Two HBV mutations were identified to associate with severe liver fibrosis (G2858C and C2289A) and one mutation was protective against severe liver fibrosis (T2201C). The T2201C mutation was found exclusively among patients (21 of 46 patients, 45%) infected by HBV subgenotype Ce. The clinical differences in HBeAg-negative chronic hepatitis B in China may be influenced by different distribution of subgenotype C HBV.     

未经治疗的慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒耐药变异、基因型和血清型研究

目的 研究未经核苷(酸)类似物(NA)治疗的慢性乙型肝炎患者HBV耐药变异、基因型、基因亚型和血清型特点.方法 从北京大学附属医院收集97例未经NA治疗的慢性乙型肝炎患者血清,用半巢式聚合酶链反应-直接测序法获得HBV全长逆转录酶区序列,用生物信息学技术筛查该区内11个经典耐药变异位点并鉴定基因型、基因亚型和血清型.用统计分析软件SPSS11.0进行t检验和χ~2检验. 结果 HBV在11个经典耐药变异位点上均为野生型氨基酸;B基因型和C基因型分别占36.1%(35/97)和63.9%(62/97),前者均属B2亚型,后者C2亚型占91.9%(57/62),C1亚型占6.5%(4/62),1例未能分出亚型.已知出生地的患者中,71.9%(23/32) B基因型感染者出生于我国南方地区,81.6%(40/49) C基因型感染者出生于北方地区,基因型地域分布特点明显,χ~2=23.19,P<0.01.血清型为adr者占60.8%(59/97),与C基因型相关;为adw者占38.1%(37/97),与B基因型相关,χ~2=87.83,P<0.01.结论 未经NA治疗的慢性乙型肝炎患者体内野毒株为优势株,其基因型、基因亚型和血清型与患者出生地有关.     

江西乙型肝炎病毒基因型分布及其与临床的相关性

目的了解江西慢性乙型肝炎患者血清乙型肝炎病毒（HBV）基因型的分布情况及HBV基因型与临床的关系。方法选择HBV DNA阳性的慢性乙型肝炎患者血清150份,患者分别诊断为慢性HBV携带者、慢性肝炎轻度、中度、重度和慢性重型肝炎,每组30例,采用多对型特异性引物巢式PCR法检测HBV基因型。结果本组慢性乙型肝炎患者HBV基因分型结果为B型118例（78．7％）,C型31例（20．7％）,D型1例（0．6％）;在上述5组患者中C型比例分别为0％,16．7％,26．7％,30．0％和30．0％,其中慢性HBV携带者与其他组比,差异有统计学意义（P〈0．05）;B、C两基因型患者HBeAg阳性率分别为83．9％（99／118）和90．3％（28／31）,HBeAb阳性率分别为16．1％（19／118）和9．7％（3／31）,差异均无统计学意义（P〉0．05）。结论江西地区HBV优势基因型以B型为主,C型次之,有少量的D型感染者。