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1.
兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1等位基因多态性分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的分析兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1位点等位基因多态性特点。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应技术对兰州地区200名健康无血缘关系的汉族个体HLA-A、B和DRB1基因座进行分型,并与西北、北方和南方汉族、西北回族、维吾尔族和藏族人群进行比较。结果兰州汉族人群中HLA-A基因座共检出14个等位基因,以A*02,A*11,A*24,A*33,A*30,A*01和A*31基因最常见;HLA—B基因座共检出32个等位基因,以B*40,B*15,B*46,B*13,B*51,B*60,B*58和B*44基因最为常见;HLA-DRB1基因座共检出13个等位基因,最多见的基因依次为DRB1*09.DRB*15,DRB1*12,DRB1*04,DRB1*11,DRB1*07,DRB1*08和DRB1*14,接近北方汉族而与南方汉族有差异,与西北回族无明显差异,但与西北维吾尔族和藏族差异有统计学意义。结论兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1位点等位基因多态性与南、北汉族人群存在不同程度的差异,与西北维吾尔族和藏族差异显著。  相似文献   

2.
西宁地区汉族人群HLA-A、B和DRB1等位基因多态性分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的:分析西宁地区汉族人群mA-A、B和DRB1位点等位基因多态性特点。方法:采用序列特异性引物聚合酶链反应技术对西宁地区73名健康无血缘关系的汉族个体mA-A、B和DRBl基因座进行分型,并与国内其他地区汉族人群进行比较。结果:西宁汉族人群中mA-A基因座共检出11个等位基因,以A02、A11、A30、A33基因最常见;mA-B基因座共检出20个等位基因,以B13、B15、B37、1740、1346、B58基因最为常见;mA-DRB基因座共检出17个等位基因,最多见的基因为DRB1*03、DRB1*04、DRB1*09、DRB1*12、DRB1*13、DRB3、DRB4。结论:青海汉族HLA有不同于其他地区汉族的独特性。  相似文献   

3.
目的:分析青海土族人群HLA-DRB1位点等位基因多态性特点。方法:采用序列特异性引物聚合酶链反应技术,对青海互助地区50名健康无血缘关系的土族个体HLA-DRB1基因座进行分型,并与国内其他地区少数民族人群进行比较。结果:青海土族人群中HLA-DRB基因座共检出16个等位基因,其中DRB1*04、DRB1*08、DRB1*14、DRB1*15、DRB3*、DRB4*基因频率较高;DRB1*06、DRB1*07、DRB1*09、DRB1*13、DRB1*16、DRB1*23基因频率较低。结论:青海土族HLA有独特性。青海土族基因频率与蒙古族有相似之处。  相似文献   

4.
山西汉族人群HLA-A、-B、-DRB1基因多态性研究   总被引:5,自引:0,他引:5  
目的 调查山西汉族人群HLA-A、-B、DRB1基因多态性,获得完整准确的遗传学数据。方法 应用聚合酶链反应,序列特异性引物方法对7440名健康、无血缘关系的山西汉族个体进行HLA—A、-B、-DRB1基因型检测,并与不同人群等位基因进行比较。结果 检出A等位基因18个,B等位基因40个,DRB1等位基因13个,其中A*02、A*24、A*11、A*01、A*03、B*13、B*51、B*15、B*40、B*35、DRB1*15、DR*09、DR*1:2、DR*04、DR*07等位基因频率分布较高。结论 山西汉族人群HLA—A,-B,-DRB1基因具有中国北方汉族人群共有的遗传特征,但也有其自身的分布特点。  相似文献   

5.
目的调查北京人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、B、DRB1的基因多态性,获得完整准确的遗传学数据。方法应用聚合酶链反应-直接测序分型(polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR-SBT)法对北京地区人群中618名健康无关个体进行HLA-A、B、DRB1基因座高分辨分型。结果检出HLA-A、B、DRB1的基因型数和等位基因数分别为199和84、366和143、286和122,这3个基因座分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P〉0.05)。结论从基因水平分析了北京地区HLA-A、B、DRB1基因座的群体分布特征,提供了一套比较完整准确的HLA-A、B、DRB1等位基因频率、基因型频率,为器官移植的供体选择、法医学个体认定、HLA与疾病相关性及人类学等研究提供了重要的参考数据。  相似文献   

6.
目的 分析济南地区汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigens,HLA)-A、B、DRB1座位等位基因的高分辨多态性.方法 采用PCR-测序分型(PCR-sequence-based typing,PCR-SBT)对鲁南地区483名无血缘关系的汉族健康个体进行HLA-A、B、DRB1座位高分辨基因分型,采用Arlequin3.5软件计算等位基因频率、单倍型频率,并就常见等位基因与其他人群进行比较.结果 济南汉族HLA-A、B、DRB1座位分别检出27、56和41个等位基因,其中等位基因频率分布最高的分别是A* 11∶01 (0.1615)、B*13∶02(0.1163)和DRB1* 07∶01 (0.1763);最常见的A*-B*-DRB1*单倍型是A*30∶01-B* 13∶02-DRB1* 07∶01 (0.0867).结论 济南地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因和单倍型具有较高的多态性.  相似文献   

7.
目的:分析人类白细胞抗原基因频率在山东省威海、莱芜地区健康人群中的遗传特征及其人群间分布的差异。方法:采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法对300名健康献血者进行HLA-A、B、DRB1分型。结果:共检出14个HLA-A等位基因,34个B等位基因,13个DRB1等位基因。比较威海和莱芜地区HLA人群基因频率差异为威海地区A*32基因频率显著高于莱芜地区(P<0.05),莱芜地区HLA-B*27基因频率显著高于威海地区(P<0.05)。结论:威海、莱芜地区人群很好的体现了中国北方人群的HLA基因型分布特点,同时也具有其自身的特殊性。这些比较数据为寻找HLA相合的无亲缘关系造血干细胞供者提供了重要的遗传学信息。  相似文献   

8.
西藏门巴族人群HLA-A、B和DRB1基因座多态性   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的 分析西藏门巴族HLA-A、B和DRB1 3个基因座的遗传特征,并研究其民族起源。方法应用序列特异性寡核苷酸探针反向斑点杂交技术对西藏自治区门巴族居住区47名门巴族无关个体HLA-A、B和DRB1基因座进行分型。对门巴族和我国其他11个群体(民族)的HLA-DRB1基因频率采用Neighbor-Joining(NJ)方法进行聚类分析。结果 在西藏门巴族人群中HLA-A基因座共检出23个等位基因,其中HLA-A*1101,A*2402,A*02011,A*0206基因最常见;HLA-B基因座共检出39个等位基因,其中HLA-B*3802,B*4001,B*4002,B*51011基因最常见;HLA-DRB1基因座共检出33个等位基因,其中HLA-DRB1*12021,DRB1*0403,DRB1*0701,DRB1*1201基因最常见,频率最高的等位基因分别是HLA-A*1101(0.2128),HLA-B*3802(0.1064)和HLA-DRB1*12021(0.0851)。结论 西藏门巴族人群HLA基因座具有高度遗传多态性,聚类分析门巴族与西藏藏族遗传关系较近。  相似文献   

9.
目的 检测浙江地区汉族人群HLA-DPA1和HLA-DPB1等位基因及单倍型频率.方法 应用PCR-直接测序分型法对100名健康、无血缘关系的浙江汉族人外周血标本进行HLA-DPA1和HLADPB1等位基因分析.结果 在100份标本中检出8个HLA-DPA1等位基因和19个HLA-DPB1等位基因.HLA-DPA1等位基因频率较高的依次为DPA1*020202(47.0%)、DPA1*010301(38.5%)和DPA1*020101(10.5%).HLA-DPB1等位基因中,频率较高的依次为DPB1*0501(39.5%)、DPB1*020102(13.5%)和DPB1*040101(13.0%).连锁分析发现共有44个HLA-DPA1-DPB1单倍型,单倍型频率最高为DPA1*020202-DPB1*0501(29.5%).结论 浙江地区汉族人群HLA-DPA1和DPB1基因座等位基因具有丰富的多态性,2个基因座呈现连锁不平衡.  相似文献   

10.
目的检测江苏地区汉族人群HLA-DQA1和DQB1等位基因及单倍型的频率,分析该人群DQA1、DQB1基因多态性和DQA1-DQB1单倍型特点。方法应用聚合酶链反应-直接测序分型法(PCR-sequence-based typing ,PCR-SBT)方法对100名健康、无血缘关系的江苏汉族人群的HLA-DQA1和DQB1进行基因分型。结果共检出7个DQA1等位基因和13个DQB1等位基因。DQA1等位基因中,DQA1*0301/02/03的基因频率最高(29.5%),其次为DQA1*0501(18.5%)、DQA1*0102(17.0%)、DQA1*0201(12.5%);DQB1等位基因中,DQB1*0201/02(21.5%)、DQB1*0301/09(14.5%)、DQB1*0303(13.5%)和DQB1*0603(11.5%)最为常见。分析得出30种DQA1-DQB1单倍型,DQA1*0301/02/03-DQB1*0303(12.5%)、DQA1*0201.DOB1*0201/02(10.5%)、DQA1*0501-DQB1*0201/02(9.5%)、DQA1*0501-DQB1*0301/09(7.0%)为常见的单倍型。结论江苏汉族人群HLA-DQA1和DQB1基因具有较为丰富的多态性,基因频率分布具有中国北方群体的特征且具有一定的独特性。  相似文献   

11.
目的研究湖北五峰县土家族190名无亲缘关系健康个体HLA-A、B等位基因及单倍型频率的分布,为进一步研究HLA基因多态性与疾病的关联奠定基础。方法采用序列分型(sequence-baaed typing,SBT)法对最具多态性的HIA-A、B基因2、3外显子进行了基因型分析,采用Arlequin软件对群体基因、单倍型频率进行最大估计值的计算。结果HLA-A、B等位基因符合Hardy-Weinberg平衡定律(P〉0.05),无显著的连锁不平衡现象,共检测出26个HLA-A等位基因及41个HLA-B等位基因,其中频率最高的为A*0201(0.16053),A*110101(0.14737),A*24020101(0.14211),B*4001(0.14737),B*4601(0.13947),其次为A*0207(0.08947),A*0206(0.08158),B*1301(0.07632),B*5801(0.08947),B*1501(0.09737),而大于0.05%的为A*330301(0.05526),B*1502(0.05526),B*3501(0.05263),单倍型分布较普遍的为A*0202-B*4001(0.04196),A*0201-B*4601(0.03625)。结论采用高分辨测序分型法对土家族人群HLA-A、B等位基因进行分型的实验结果可做为湖北土家族人HLA-A、B等位基因、单倍型频率的群体资料,对进一步开展群体遗传学、临床器官移植、疾病关联、HLA遗传学特征、法医学、人类学等研究具有重要意义。  相似文献   

12.
青海土族、撒拉族HLA-DQA1和-DQB1基因多态性探讨   总被引:5,自引:0,他引:5  
目的 :检测青海土族和撒拉族健康个体HLA DQA1和 DQB1等位基因频率 ,了解和分析这两个民族的HLA DQA1和 DQB1基因多态性。方法 :用PCR SSO方法检测 132名土族和 80名撒拉族健康个体的HLA DQA1和 DQB1的基因多态性 ,并将所得结果与国内其他民族的同类资料进行比较。结果 :土族和撒拉族在HLA DQA1和 DQB1高频率等位基因分布上有共同点 ,也有一定的独特性。这两种民族HLA DQA1 0 10 2和 0 5 0 1以及DQB1 0 2 0 1、 0 30 1、 0 4 0 2和 0 6 0 2基因分布频率上具有显著性差异。结论 :土族和撒拉族与北方诸民族的等位基因频率接近 ,而与其他南方诸民族的差异相对较大。  相似文献   

13.
乙肝后肝硬化患者HLA-A、DRB1等位基因多态性研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的:了解乙肝后肝硬化患者的HIA-A、DRB1等位基因多态性。方法:用基因芯片分型方法分析比较61例慢性乙肝后肝硬化患者与146例正常人HLA-A、DRB1等位基因的多态性。结果:HLA-A位点中的HIA-A02、11、24与HLA-DRB1位点中的HIA-DRB1*12、09、04为正常人群常见等位基因。乙肝后肝硬化患者组HnA02(43.4%vs29.1%,OR:1.87,P=0.005,95%CI:1.21-2.89)与HLA-DRB1*07(13.9%vs5.1%,OR:3.00,P=0.002,95%CI:1.48-6.07)、HIA-DRB1*08(16.4%vs6.8%,OR:2.67,P=0.003,95%CI:1.40L5.08)、HLA-DRB1*11(12.3%vs5.8%,OR:2.27,P=0.025,95%CI:1.11-4.64)的出现频率较正常对照组明显升高。在HIA-A位点中,乙肝后肝硬化患者组的纯合子比例较正常组有升高趋势,但无统计学意义。结论:HLA-A02与HLA-DRBl*07、08、11可能是乙肝后肝硬化的易感基因。  相似文献   

14.
目的探讨中国北方汉族人中HLA-A、B、DRB1等位基因与肺癌遗传易感性间的关系。方法采用测序分型技术(sequence-based typing,SBT)技术,对无血缘关系的籍贯为中国北方的140名肺癌患者及483名健康志愿者的HLA-A、B、DRB1基因进行检测。arlequin软件(ver2.000)及SPSS软件进行统计分析。结果 A*2601、B*1518、B*3802、DRB1*0401、DRB1*0402、DRB1*1201在肺癌病人中频率显著性高于正常对照,P值分别为0.021、0.001、0.015、0.021、0.010和0.046,OR值分别为3.513、3.842、2.715、3.512、13.986、1.828;HLA-DRB1*1001、DRB1*1302在肺癌病人中频率显著性低于正常对照,P值分别为0.017和0.014,OR值分别为0.135和0.122。单倍型HLA-A*0207-B*4601-DRB1*0901、HLA-A*0206-B*5101在肺癌病人中频率显著性高于正常对照,P值分别为0.034和0.006,OR值分别为2.348和3.969;单倍型HLA-A*110...  相似文献   

15.
目的 分析山东省烟台和威海地区汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、B、DRB1等位基因的多态性分布特征,并探讨该人群与其他人群的亲缘关系.方法 应用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针方法(polymerase chain reaction-sequence specific olignucleotide probe,PCR-SSOP)对山东省烟台和威海地区4062名无亲缘关系的汉族健康个体进行HLA-A、B、DRB1基因分型.采用Arlequin3.5软件计算HLA等位基因频率、单倍型频率和连锁不平衡参数,按内氏公式计算出不同人群之间的遗传距离,并利用Mega5.0软件构建系统发生树.结果 该人群HLA-A、B、DRB1等位基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.1).3个基因座分别检出18、33和13个等位基因,其中等位基因频率分布最高的分别是A* 02 (0.2935)、B* 15 (0.1485)和DRB1* 15 (0.1621);最常见的单倍型为A* 30-B* 13-DRB1* 07(0.0649),A* 33-B* 58、A*66-DRB1* 13、B*08-DRB1* 03呈现最强的连锁不平衡;山东省烟台和威海汉族人群与吉林省汉族人群遗传距离最小,为0.0034.结论 山东省烟台和威海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因和单倍型具有较高的遗传多态性,该人群与吉林汉族人群亲缘关系最近.  相似文献   

16.
目的 从基因高分辨水平,分析中国汉族人群供-受者人类白细胞抗原(human leukocyte antigens,HLA)-A、B、Cw、DRB1、DQB1各位点等位基因频率和分布的多态性;及供-受者等位基因匹配情况.方法 采用基因测序分型(sequence based typing,SBT)、序列特异性寡核苷酸探针法(sequence specific oligonueleotide probe,SSOP)和序列特异性引物法(sequence specific primer,SSP),对2540名中国汉族人的(其中1168名受者,1372名供者)DNA标本进行HLA高分辨基因分型,并作统计学处理.结果 2540份样本中共检测到44种HLA-A等位基因,频率高于0.05的A*1101、A*2402、A*0201、A*0207、A*3303、A*0206、A*3001共占80.4%;81种HLA-B等位基因,频率高于0.05的B*4001、B*4601、B*5801、B*1302、B*5101共占43.0%;44种HLA-Cw等位基因,频率高于0.05的Cw*0702、Cw*0102、Cw*0304、Cw*0801、Cw*0602、Cw*0303、Cw*0302、Cw*0401共占80.3%;61种HLA-DRB1等位基因,频率高于0.05的DRB1*0901、DRB1*1501、DRB1*1202、DRB1*0803、DRB1*0701、DRB1*0405、DRB1*0301、DRB1*1101共占70.1%;22种HLA-DQB1等位基因,频率高于0.05的DQB1*0301、DQB1*0303、DQB1*0601、DQB1*0602、DQB1*0202、DQB1*0302、DQB1*0401、DQB1*0502、DQB1*0201共占87.4%.这5个位点均处于杂合子缺失状态,其中A、B、DRB1位点符合HardyWeinberg平衡(Hardy-Weinberg equi1ibrium,HWE)(P>0.05);Cw、DQB1位点偏离HWE(P<0.05);排除个别基因型观察值与期望值偏差较大外,这5个位点均符合HWE.在供-受者数据的比较中,HLA全相合(10/10)的比例仅22.4%;单个等位基因错配(9/10)的比例为24.6%;两个等位基因错配(8/10)的比例为26.3%.结论 中国汉族人群高分辨水平HLA-A、B、Cw、DRB1,DQB1等位基因频率及分布特点,对非亲缘造血干细胞移植供者检索有重要参考价值;并为中华骨髓库数据入库和利用提供遗传学依据.
Abstract:
Objective To analyze the allele frequencies and polymorphism of human leukocyte antigens (HLA) -A, B, Cw, DRB1 and DQB1 between donors-recipients on high-resolution typing; and to analyze the matching and mismatching proportion between donors and recipients. Methods HLA highresolution types were determined by sequence based typing (SBT), sequence specific oligonucleotide probe (SSOP) and sequence specific primer (SSP) on 2540 unrelated Chinese Han individuals including 1168 recipients and 1372 donors, then statistical analyses were carried out. Results Forty-four HLA-A alleles were detected, and among them the frequencies of A * 1101, A * 2402, A * 0201, A * 0207, A * 3303, A *0206 and A * 3001 exceeded 0.05, and accounted for 80.4%. Eighty-one HLA-B alleles were detected, and frequencies of B * 4001, B * 4601, B * 5801, B * 1302 and B * 5101 exceeded 0. 05, and accounted for 43. 0% of total. There were 44 HLA- Cw alleles, among them the frequencies of Cw * 0702, Cw * 0102,Cw * 0304, Cw * 0801, Cw * 0602, Cw * 0303, Cw * 0302 and Cw * 0401 exceeded 0.05, and were 80.3 %of total. There were 61 HLA-DRB1 alleles, the frequencies of DRB1 * 0901, DRB1 * 1501, DRB1 * 1202,DRB1 * 0803, DRB1 * 0701, DRB1 * 0405, DRB1 * 0301 and DRB1 * 1101 exceeded 0. 05, and were 70. 1% of total. Finally, 22 HLA-DQB1 alleles were detected, the frequencies of DQB1 * 0301, DQB1 *0303, DQB1 * 0601, DQB1 * 0602, DQB1 * 0202, DQB1 * 0302, DQB1 * 0401, DQB1 * 0502 and DQB1 *0201 exceeded 0. 05, and they were 87.4% of total. All the five loci were of heterozygote deficiency. The HLA-A, B and DRB1 loci conformed to Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) (P>0. 05); but HLA-Cw and HLA-DQB1 loci did not (P<0.05). Except several particular genotypes, all the five loci conformed to HWE. After comparing data between donors and recipients, only 22.4% of recipients found HLA matched donors (10/10); 24. 6% of recipients found single HLA allele mismatched donors (9/10); 26. 3% of recipients had two HLA alleles mismatched donors (8/10). Conclusion The characteristics of allele frequencies and polymorphism of HLA-A, B, Cw, DRB1 and DQB1 on high-resolution typing in Chinese Han population is valuable for donor searching in unrelated hematopoietic stem cell transplantation, and it provides genetic basis for donor registry and usage of donor resource for Chinese Marrow Donor Program.  相似文献   

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