基于“质谱分析-网络药理学预测-活性验证”的牛黄解毒丸抗炎作用研究

目的：基于“质谱分析-网络药理学预测-活性验证”整合研究思路,解析牛黄解毒丸抗炎潜在作用机制解析及其活性成分。方法：通过高分辨质谱技术分析牛黄解毒丸化学成分,将分析出的成分;利用中药生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)寻找对应的靶标;以“inflammation”作为关键词利用人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获得炎症相关靶标;取成分靶标与疾病靶标交集,利用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据库(STRING)对共同靶标进行PPI分析,并采用Cytoscape软件对靶标进一步筛选,得到核心靶标;利用生物信息分析工具(DAVID数据库),对核心靶标进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,构建“药物-成分-靶标-通路”网络图;采用AutoDock 4.2.6软件,对关键靶标及相关药物分子进行分子对接验证,并针对前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)这一靶标与其对应化学成分进行体外实验验证。结果：经高分辨质谱技术分析出牛黄解毒丸中236个成分,对应456个靶标,炎症相关靶标158个,二者交集靶标21个,PPI分析及网络拓扑分析后,获得核心靶标11个,活性成分14个,涉及肿瘤...     

基于网络药理学的知母黄柏药对防治糖尿病的作用机制研究

目的探讨知母黄柏药对治疗糖尿病的作用机制。方法通过使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选知母和黄柏的活性化学成分,通过TTD和OMIM搜索糖尿病靶点。采用Cytoscape3.7.1软件构建知母黄柏药对-活性化学成分-靶点网络图,将有交集靶标上传到STRING数据库,构建蛋白互作网络图(PPI),并通过DAVID数据库对靶点进行KEGG PATHWAY通路富集分析和Gene Ontology生物学过程富集分析。结果知母黄柏药对-活性化学成分-靶点网络图得到45个活性化学成分作用于89个靶点,主要作用靶点为PTGS2、TNF、PI3K、TLR4,而靶点主要关联糖尿病胰岛素抵抗、胰岛素信号通路、胰高血糖素信号通路、炎症通路和Ⅰ、Ⅱ型糖尿病通路,这些信号通路揭示了知母黄柏药对治疗糖尿病的潜在作用机制。结论从多成分、多靶点、多途径揭示了知母黄柏药对治疗糖尿病的潜在作用机制,为进一步深入研究知母黄柏药对治疗糖尿病作用机制提供了重要的科学和理论依据。     

基于网络药理学及分子对接探讨脑脉泰胶囊治疗脑梗死的作用机制

目的 运用网络药理学方法和分子对接技术分析脑脉泰胶囊治疗脑梗死（Cerebral infarction,CI）的潜在作用机制。方法 通过TCMSP、TCMIP数据库检索、筛选脑脉泰胶囊的活性成分及其作用靶点,通过DrugBank、OMIM、PharmGkb、TTD、DisGeNET数据库筛选脑梗死疾病相关靶点,获取二者的交集靶点,作为脑脉泰胶囊治疗脑梗死的潜在作用靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-潜在作用靶点”网络,并分析网络中的关键活性成分;将交集靶点导入STRING数据库中进行蛋白互作（PPI）网络分析,筛选出潜在核心靶点;同时使用R 4.0.3软件对交集靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。利用AutoDock Vina软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 共筛选得到140个活性成分及111个潜在作用靶点（交集靶点）;获得槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、白藜芦醇等关键活性成分;筛选得到IL6、TNF、CXCL8、PTGS2、STAT3、JUN、MAPK1等核心靶点;潜在作用靶点主要富集在IL-17、TNF、HIF-1、MAPK...     

探讨药对金银花-连翘干预痤疮的网络药理学机制

目的：基于网络药理学原理探讨药对金银花-连翘干预痤疮的分子通路及作用机制。方法：应用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索金银花、连翘化学成分、作用靶点;通过GeneCards数据库获取痤疮差异性靶点基因,预测中药中痤疮相关的作用靶点;通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,构建“中药-成分-关键靶标-主要通路”的可视化网络图。运用DAVID数据库对筛选出的靶点基因进行基因富集分析,从而获得基因本体论（GO）生物功能及京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路注释结果,进而探究中药干预痤疮的分子作用机制。结果：药对金银花-连翘干预痤疮共预测得到活性成分29个,涉及核心靶点基因97个、GO生物功能103个、KEGG信号通路119个。结论：药对金银花-连翘主要活性成分通过多靶点、多通路干预痤疮,主要涉及核受体的活性、转录因子活性等功能,以及白细胞介素（Interleukin,IL）-17信号通路、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）信号通路和磷脂酰肌醇3激酶（Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K）-丝氨酸...     

温经汤治疗原发性痛经的网络药理学作用机制＊

目的 本文将通过网络药理学结合分子对接对温经汤治疗原发性痛经作用机制进行预测。方法 利用TCMSP、TCMID及BATMAN-TCM数据库，收集温经汤活性成分并预测其作用靶标。通过GeneCards数据库、OMIM数据库筛选原发性痛经的靶标，并运用R软件获取疾病交集靶标，绘制韦恩图。运用Cytoscape软件构建温经汤治疗原发性痛经的成分-靶标网络图，通过STRING数据库构建PPI靶标蛋白互作网络，并进行核心靶标的GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。通过Autodock Vina软件对药物活性成分与疾病核心靶标进行分子对接验证。结果 筛选得到温经汤治疗原发性痛经的124个活性成分和31个药物-疾病共同靶标，并推断其作用机制可能与介导HIF-1、TNF、PI3K-Akt等105条信号通路相关。槲皮素、山柰酚、豆甾醇等活性成分与PTGS1、ESR1、PGR等核心靶标对接结果良好。结论 温经汤活性成分可能通过发挥镇痛、抗炎、调节激素水平、缓解平滑肌痉挛和改善缺氧状态等药理作用来治疗原发性痛经。     

基于网络药理学及分子对接技术研究疏风解毒胶囊治疗新型冠状病毒肺炎的潜在靶标及机制

目的:运用网络药理学及分子对接技术探究疏风解毒胶囊治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在分子机制。方法:检索计算系统生物学实验室数据库和分析平台(TCMSP)获得疏风解毒胶囊所有有效活性成分的干预靶点,并与GeneCards数据库中的新型冠状病毒肺炎疾病基因靶标相映射得到交集靶标;通过Cytoscape3.7.0构建"药物-活性成分-靶标"网络;通过String得到交集靶标的PPI网络;运用数据包进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制。将疏风解毒胶囊中关键有效成分化合物与PPI中核心蛋白进行分子对接。结果:"药物-活性成分-靶标"网络图中涉及交集靶标48个,关键性化合物主要包括槲皮素、木犀草素、山柰酚、汉黄芩素、刺槐黄素,关键靶点涉及CALM1、NOS2、PTGS2、DPP4、PTGS1等。GO富集分析包括1335条生物过程(biological process,BP)、34条细胞组分(cellular component,CC)以及86项分子功能(molecular unction,MF)。18条KEGG相关通路,涉及病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用等。分子对接结果显示槲皮素、山柰酚、木犀草素等核心化合物与核心靶蛋白亲和力较高。结论:疏风解毒胶囊中的化学成分通过与关键靶蛋白IL-6、ALB、MAPK3等结合涉及多种生物学过程及通路治疗COVID-19。     

基于网络药理学研究白及治疗肺癌的潜在靶标及作用机制＊

本研究探讨了中药白及治疗肺癌的潜在靶标及作用机制。在TCMSP、ETCM数据库中基于药代动力学特征筛选白及活性成分,Genecards数据库中收集肺癌靶标,利用Swiss target prediction在线工具预测成分作用靶标。经Cytoscape3.7.0软件及其STRING插件构建“活性成分-作用靶标”、“蛋白质-蛋白质相互作用”网络图,取交集得到白及和肺癌的共同靶标;将共同靶标导入Metascape中进行基因本体和KEGG通路富集分析,利用Cytoscape3.7.0软件构建“成分-潜在靶标互作-信号通路”网络。共获得25个潜在活性成分、20个潜在靶标和5条潜在通路,共确定了16个GO条目。白及治疗肺癌可能与跨膜受体蛋白酪氨酸激酶和一氧化氮合酶调节活性有关;参与了毒性反应、共生过程、肌肉细胞增殖、线粒体膜电位调节、横纹肌组织发育的正向调节等过程。白及可能通过ESR1、PTGS2、ALB、HSP90AA1、HER2、EGFR、ESR2等靶标作用于表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂耐药、PI3K-Akt信号通路、癌症中的转录失调过程等通路,从而发挥治疗肺癌作用。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨实脾固肾化瘀方治疗IgA肾病的作用机制

目的 运用网络药理学方法和分子对接技术分析实脾固肾化瘀方（黄芪、菟丝子、川芎等）治疗IgA肾病（IgA nephropathy,IgAN）的潜在作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选实脾固肾化瘀方的活性成分及作用靶点,通过OMIM、GeneCards、PharmGkb、DrugBank等数据库筛选IgA肾病的疾病相关靶点,获取二者交集靶点,即实脾固肾化瘀方治疗IgA肾病的潜在作用靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-潜在作用靶点”网络,并分析网络中的关键活性成分;将交集靶点导入STRING数据库进行蛋白互作（PPI）网络分析,筛选出潜在核心靶点;运用R 4.0.3软件对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。利用AutoDockVina软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 共筛选得到69个活性成分及97个潜在作用靶点（交集靶点）;获得槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、异鼠李素等关键活性化合物;筛选得到IL6、MMP2、AKT1、HIF1A、TNF、MMP9等核心靶点;潜在作用靶点主要富集在IL-17、TNF、HIF-1、PI3K-Ak...     

基于网络药理学和分子对接探讨清热利胆颗粒治疗胆石症的作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接探讨清热利胆颗粒治疗胆石症的作用机制。方法 通过检索TCMSP数据库获取清热利胆颗粒相关药物的主要活性成分和潜在作用靶点。利用Genecards数据库获得胆石症相关靶点,并筛选出清热利胆颗粒治疗胆石症的潜在靶点。将潜在靶点导入String数据库构建潜在靶点的PPI网络,然后利用Cytoscape 3.9.0软件绘制“药物-成分-靶点”网络图。再对核心靶标进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。最后使用AutoDOCK1.5.6软件对活性成分和相关靶点进行分子对接。结果 经TCMSP数据库筛选后得到清热利胆颗粒活性成份共75种,主要参与成分为槲皮素、山柰酚、β-谷固醇、豆甾醇、柚皮素等,涉及胆石症相关靶点107个,通过PPI网络分析后我们得知AKT1、IL-6、TNF、EGFR、JUN是核心靶点。GO富集分析的结果显示清热利胆颗粒涉及生物过程为1407个,涉及细胞组成67个,而涉及分子功能119个。主要通过脂质结合、氧化还原酶活性、转录因子结合、信号受体调节活性、DNA结合转录因子结合等分子功能发挥作用。KEGG富集分析显示清热利胆颗粒涉及通路160条,主要...     

基于网络药理学和分子对接探讨“黄连-茵陈”治疗慢性萎缩性胃炎机制

目的 基于网络药理学和分子对接研究探讨“黄连-茵陈”药对治慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制。方法 在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中检索获得“黄连-茵陈”药对的活性成分、作用靶点及分子结构，建立数据集，再通过GeneCard、CTD、TTD数据库筛选CAG疾病靶点，与“黄连-茵陈”药对活性化合物作用靶点取交集，利用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络，利用STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，通过聚类分析获取核心成分与核心靶点，利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，最后利用AutoDok Tool、Pymol软件将核心靶点与核心成分进行分子对接验证。结果 经筛选获得“黄连-茵陈”药对活性化合物26种，筛选后活性化合物对应靶点86个，CAG靶点639个，“黄连-茵陈”活性化合物成分与CAG交集靶点38个，核心成分为槲皮素、异鼠李素、β-谷甾醇等，高于平均Degree值的靶点蛋白有白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、Ju...     

基于网络药理学与分子对接技术的“陈皮-山楂”药对治疗高脂血症的作用机制研究※

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨“陈皮-山楂”药对治疗高脂血症（HLP）的作用机制。方法 通过使用TCMSP、ETCM和BATMAN-TCM数据库筛选陈皮、山楂的活性成分和作用靶点;通过Genecards、Disgenet和OMIM数据库获取HLP潜在作用靶点;通过Venny网站获取“陈皮-山楂”药对与疾病的交集靶点;使用Cytoscape软件构建活性“成分-疾病-交集靶点”网络图;使用String数据库和Cytoscape软件构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体（GO）生物功能分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;最后利用AutoDock Vina软件对主要活性成分和关键靶点进行分子对接。结果 得到“陈皮-山楂”药对潜在活性成分71个、潜在作用靶点414个,HPL疾病靶点1056个,其中成分与疾病交集靶点共88个;GO生物过程作用于激素反应、细胞对激素刺激的反应等602个条目,GO细胞组分富集作用于转录调节复合物、囊泡腔等23个条目,GO分子功能富集作用于核受体活性、配体激活转录因子活性等47个条目;KEGG通路分析共得到127条通路,与脂肪细胞因子信号通路、PPAR信号通路和AMPK信号通路等有关;分子对接结果证实主要活性成分槲皮素、柚皮素与关键靶点PPARA、TP53结合能力良好。结论 “陈皮-山楂”药对可通过多成分、多靶点、多途径发挥对高脂血症的治疗作用。     

基于网络药理学探究枸杞子-菊花药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制

目的：基于网络药理学探究枸杞子-菊花药对治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy, DR)的干预机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索枸杞子、菊花的活性成分及相关靶点。利用Cytoscape 3.9.1绘制“药对-活性成分-作用靶点”网络图，并进行拓扑分析筛选枸杞子-菊花药对治疗DR的主要活性成分。利用GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库及药物靶标数据库检索DR相关靶点。将活性成分相关靶点与疾病靶点导入Venny 2.1在线平台，绘制韦恩图，交集靶点即为枸杞子-菊花药对治疗DR的潜在靶点。将潜在靶点上传至STRING数据库构建PPI网络关系，导入Cytoscape 3.9.1软件进行可视化，PPI网络拓扑分析筛选枸杞子-菊花药对治疗DR的核心靶点。将核心靶点输入Metascape在线平台进行基因本体(gene ontology, GO)富集分析及京都基因与基因组百...     

基于网络药理学分析虎骨治疗骨质疏松症的分子机制

目的 预测虎骨治疗骨质疏松症(OP)的靶点,探讨其治疗骨质疏松的分子作用机制。方法 查阅文献,检索虎骨的化学成分和作用靶点,利用GeneCards和NCBI以及其他数据库中检索骨质疏松症相关基因。利用GO数据库和KEGG数据库进行分析富集,采用Cytoscape 3.8.0绘制中药-成分-疾病-途径-靶点网络图,并用分子对接对关键靶点进行验证。结果 成分-靶标关系网络包括19个成分和168个靶标,包括关键靶标PTGS2、EGFR等。GO功能富集分析包括1259个生物过程,147个与分子功能相关,80个与细胞组分相关。通过对KEGG信号通路的富集和筛选,获得了26条信号通路。分子对接结果表明,预测的活性物质成分和关键靶点均具有较好地结合活性。结论 虎骨中的氨基酸类等活性成分主要通过PTGS2和EGFR等靶点调节相关通路治疗骨质疏松症。反映了虎骨“多成分、多靶点、多途径”的功能特点。     

基于网络药理学和分子对接分析白术-茯苓治疗克罗恩病的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接研究白术-茯苓治疗克罗恩病的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）分别检索“白术”“茯苓”,得到活性成分和药物作用靶点,再将蛋白靶点输入UniProt数据库获得相应基因靶点;在GeneCards数据库检索“克罗恩病”作用靶点,药物和疾病作用靶点通过Venny取交集后,借助Cytoscape绘制药物-活性成分-靶点的网络图,通过String、Cytoscape分别进行蛋白质-蛋白质相互作用网络图和筛选核心靶点。通过David和京都基因与基因组百科全书进行富集分析,获得潜在通路和作用靶点的可视化分析。使用AutoDock软件对有效活性成分和关键作用靶点进行分子对接验证。结果：（1）白术-茯苓的有效活性成分共22种,主要成分有苍术酮、白术内酯、常春藤皂苷元、三萜类化合物等;（2）白术-茯苓药对与治疗克罗恩病的共同靶点有15个,关键靶点有前列腺素内过氧化物合酶2(ProstaglandinEndoperoxide Synthase 2,PTGS2)、乙酰胆碱酯酶（Acetylcholinesterase,ACHE）、神经型烟碱乙酰胆碱受体...     

基于网络药理学的“土茯苓-绵萆薢”药对治疗银屑病的作用机制研究

目的 基于网络药理学的方法探讨“土茯苓-绵萆薢”药对治疗银屑病的作用机制。方法 基于中药系统药理学技术平台筛选“土茯苓-绵萆薢”药对的潜在活性成分,通过检索文献补充绵萆薢活性成分,利用SwissADME数据库根据类药五原则评估各成分的药代动力学参数,筛选绵萆薢有效活性成分。通过SwissTargetPrediction数据库预测绵萆薢有效活性成分的作用靶点。检索GeneCards和OMIM数据库获得的银屑病相关靶点,通过Venny 2.1获得“土茯苓-绵萆薢”药对治疗银屑病的潜在作用靶点,构建活性成分-靶点网络。利用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络,并筛选核心靶点和Hub靶点。应用David数据库和OmicShare tools对关键靶点进行GO富集与KEGG分析,并构建“活性成分-核心靶点-通路”网络,应用分子对接技术对重要成分和重要靶点的相互作用进行验证,系统阐释“土茯苓-绵萆薢”药对治疗银屑病的作用机制。结果 共获得“土茯苓-绵萆薢”药对25个潜在活性成分和356个作用靶点,通过与银屑病相关靶点进行映射,获得111个交集靶点。通过构建PPI网络并进一步筛选,获得“土茯...     

连翘治疗痤疮的网络药理学作用机制

目的：运用网络药理学及分子对接技术探讨连翘治疗痤疮的作用机制。方法：利用Gene Cards、OMIM和NCBI数据库收集相关的痤疮靶点,并通过中药系统药理数据库与分析平台（TCMSP）检索连翘的有效成分。利用Swiss Target Prediction数据库获取连翘活性成分的靶点。将痤疮相关靶点与连翘活性成分靶点取交集即为连翘治疗痤疮的潜在靶点,利用STRING数据库构建靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并将结果导入Cytoscape 3.7.1软件进行拓扑分析,提取核心靶点。运用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建“活性成分-核心靶点-通路”网络,并进行拓扑分析,筛选得到核心成分和核心靶点。通过Auto Dock Vina进行分子对接,验证核心成分和核心靶点的相互作用。结果：共获得连翘活性成分19个,对应靶点509个、疾病靶点1 561个、共有靶点89个,经过蛋白质-蛋白质相互作用分析及拓扑分析,得到核心靶点16个,核心靶点涉及681个基因功能条目和160条通路（P <0.05）。对“活性成分-核心靶点-通路”网络图进行拓扑分析,共筛选...     

基于网络药理学探讨黄芪治疗慢传输型便秘的作用机制

目的：借助网络药理学和分子对接技术探讨黄芪治疗慢传输型便秘的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄芪的活性化合物并预测其作用靶点,借助Cytoscape 3.7.2软件构建黄芪活性成分-靶点网络图;以“slow transit contipation”为关键词在OMIM及GeneCards数据库检索慢传输型便秘相关靶点,并与黄芪化合物作用靶点取交集,将共同靶点导入String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,将PPI导入Cytoscape 3.7.2进行拓扑分析;利用R语言进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测其作用机制;通过Swiss Dock在线分子对接工具对关键靶点进行分子对接。结果：黄芪筛选得到20个活性成分,对应作用靶点189个,与慢传输型便秘的共同靶点143个,交集String数据库和Cytoscape 3.7.2拓扑分析度值靠前的靶标为血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝氨酸苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素-6(IL-6)。GO功能富集分析得到生...     

基于网络药理学及分子对接探讨怀牛膝治疗高血压的物质基础和作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨怀牛膝治疗高血压的作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选怀牛膝的有效成分及相应的靶蛋白,通过Genecards、OMIM数据库获取高血压的靶点,利用Venn在线软件获取怀牛膝-高血压交集靶点,运用Cytoscape 3.7.2软件构建“化合物-靶点-疾病”网络图。使用String数据库绘制蛋白互作(PPI)网络,利用David数据库和R语言3.6.3中clusterProfiler包对关键靶点进行GO功能富集及KEGG通路分析,通过分子对接技术将怀牛膝主要活性成分与关键靶点进行对接验证。结果 共筛选出怀牛膝潜在活性成分16个,有效作用靶点183个。通过Venn图获得76个药物疾病共同靶点,PPI网络发现IL6、AKT1、VEGFA、CCL2、MMP9、NOS3、PTGS2等可能是怀牛膝治疗高血压的关键靶点。GO分析共包含396条富集结果,其中生物过程307条,分子功能54条,细胞组成35条。KEGG通路分析发现60个条目。分子对接筛选得到与靶点有结合潜力的化合物。结论 怀牛膝通过“多成分-多靶点-多途径”发挥降压作用,为深入研究其物质基...     

防风-秦艽治疗腰椎间盘突出症的网络药理学研究

目的探讨防风-秦艽治疗腰椎间盘突出症(LDH)的药理学机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选出防风-秦艽的活性成分和作用靶点,并通过Uniprot数据库将获得的靶蛋白名称转换成Gene Symbol;从GeneCards和OMIM数据库对LDH的靶点进行检索及筛选;通过R软件筛选得到药物-疾病共同靶点并进行Venn图的绘制。使用Cytoscape 3.7.0软件,构建药物与疾病有效成分-靶点网络图;使用String数据库构建作用靶标的蛋白互作网络并用R3.6.3软件进行相应分析;使用"clusterProfiler"R包对药物核心靶标进行GO功能分析以及KEGG通路富集分析,通过R软件对结果进行可视化。结果筛选得到药对活性成分20个,药物疾病共有靶点19个;通过药物-疾病成分靶点网络图得到常用中药成分为wogonin、beta-sitosterol、5-O-Methylvisamminol,关键靶点为PTGS2、NOS2、AR、ESR1。共有靶点PPI网络得到度值≥16的节点,为IL-6、AKT1、CASP3、CXCL8及PTGS2 5个潜在靶点;GO分析共得到富集条目811条,其中生物过程771条、分子功能33条及细胞组成7条(P0.05);KEGG富集得到IL-17信号通路、TNF通路、AGE-RAGE信号通路等39条通路(P0.05)。结论防风-秦艽可能通过多成分-多靶点-多通路的途径,发挥抗炎、抗氧化应激、抗细胞凋亡和调节机体免疫等作用,从而达到治疗LDH的目的。     

“乳病消片”抗乳腺癌作用机制研究：基于网络药理学和分子对接技术

目的：通过网络药理学和分子对接方法探讨“乳病消片”治疗乳腺癌的作用机制。方法：通过中药系统药理数据库（TCMSP）筛选乳病消片成分及其靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库筛选乳腺癌潜在靶点。通过Cyktoscape 3.8.0软件构建“化合物-疾病靶点”网络图。通过STRING数据库获取蛋白相互作用数据,再将数据导入Cytoscape 3.8.0软件构建PPI网络,并用得分高的基因建立关键子网络。使用R软件对交集靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。借助Chem3D、Pymol、AutoDock等软件进行分子对接。结果：共筛选出485个药物活性成分,相关靶点2 288个,乳腺癌潜在靶点共1 967个,交集靶点143个。通过PPI分析,发现MDM2、TP53、CDKN1A、RB1、ESR、JUN、FOS和CCND1为核心靶点。GO富集分析与氧化应激相关,核心靶点主要富集在内分泌抵抗通路、脂质和动脉粥样硬化等信号通路。分子对接结果表明药物有效成分与核心靶点MAPK3有较强结合力。结论：研究发现,“乳病消片”可通过调控基因表达、细胞凋亡、...