Shigella and Salmonella strains isolated from children under 5 years in Gaborone, Botswana, and their antibiotic susceptibility patterns

We isolated Shigella from 43/221 (21%) and Salmonella 8/221 (3%) rectal swabs from children under 5 years with diarrhoea, and found Shigella in two of 100 specimens from children without diarrhoea. Sh. boydii (13%) was the most prevalent Shigella species followed by Sh. flexneri (6%) and Sh. sonnei (2%). The prevalence of various types of Sh. boydii was type 7, 5%; type 9, 3%; type 12 and 16, 2%; and type 18, 1%. Other Shigella serotypes encountered were Sh. flexneri type 6 (4%), type 4 (2%), with Sh. sonnei phase II isolated from 2% of the specimens. The Salmonella species were S. typhimurium and S. paratyphi. The high rate of isolation of Shigella species from children with diarrhoea is indicative of a definite role of this enteropathogen in causing endemic diarrhoea in Gaborone, Botswana. Antibiograms of the predominant isolates showed that most Shigella species were resistant to ampicillin but susceptible to chloramphenicol, and with the exception of Sh. flexneri type 6, also susceptible to gentamicin. The Salmonella species were susceptible to chloramphenicol, collistin-sulphate, gentamicin, cotrimoxazole, and ampicillin.     

无锡市腹泻病人沙门菌的病原学特征及分子分型研究

目的分析无锡市腹泻人群中分离的沙门菌的流行特征;同时比较主要血清型菌株间的脉冲场凝胶电泳(PFGE)带型差异,为沙门菌感染的防控提供实验数据。方法收集2015年无锡市腹泻病人的粪便标本,分别进行沙门菌的分离鉴定、药敏试验、血清型分型以及PFGE分型分析。结果 756份粪便标本中共分离到32株沙门菌,阳性率为4.23%;检出时间主要集中在5~10月份,感染人群以老年人为主。药敏试验说明无锡地区的沙门菌对氨苄西林的耐药率最高,达56.25%;对环丙沙星和头孢他啶的耐药率最低,均为6.25%。32株沙门菌共鉴定出11种血清型,以肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,分别占31.25%和21.88%。对这2种血清型的沙门菌进行PFGE分析,显示肠炎沙门菌所有带型的相似度均在85%以上,鼠伤寒沙门菌的带型各不相同。结论无锡市沙门菌的感染具有明显季节和年龄分布差异性,流行的优势血清型为肠炎沙门菌。无锡市需同时加强对食品和环境中沙门菌的监测。     

广西宋内志贺菌药敏特性及ESBLs基因检测分析

目的了解广西地区宋内志贺菌的药敏特性及携带超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)基因与型别特征,为临床合理用药和控制耐药性的传播提供科学依据。方法采用微量肉汤稀释法对宋内志贺菌分离株进行药物敏感试验;采用PCR方法和毛细管电泳方法检测菌株携带相关ESBLs基因;采用近邻相接法构建系统进化树,分析菌株CTX-M型基因型别;对菌株携带ESBLs基因与特定抗菌药物耐药性的关系进行统计学分析。结果90株宋内志贺菌对环丙沙星敏感率为86.67%,无耐药现象;头孢曲松耐药率为96.67%,阿奇霉素耐药率为96.67%,多重耐药率为98.89%。90株宋内志贺菌中50株检出blaCTX-M-9 group基因,检出率为55.56%,经系统发育分析均为CTX-M-14亚型;1株检出blaTEM基因,检出率为1.11%;未检出blaCTX-M-1 group,blaCTX-M-2 group,blaCTX-M-8 group,blaCTX-M-25 group和blaOXA,blaSHV,blaNDM,blaVIM等β-内酰胺酶基因。blaCTX-M-14基因阳性菌株与blaCTX-M-14基因阴性菌株对头孢噻肟的耐药率差异无统计学意义(χ²=0.000,P>0.05);携带blaTEM基因的菌株对头孢他啶不耐药。结论广西地区的宋内志贺菌对主要治疗药物头孢曲松高度耐药,且多重耐药现象严重;菌株普遍携带ESBLs基因,主要为CTX-M-14亚型;携带单一型别的ESBLs基因与菌株对特定β-内酰胺类抗菌药物耐药无明显关联。     

Distribution and antibiotic susceptibility of Shigella isolates in Bangui, Central African Republic

We conducted a prospective study in four urban health care centres between January 2004 and November 2005 to determine the distribution and susceptibility patterns of Shigella strains causing invasive diarrhoea in Bangui, Central African Republic. Of the 155 Shigella isolated, Shigella flexneri (51%) and Shigella dysenteriae (30%) were the most common and the most resistant to usual antibiotics, including amoxicillin, sulphamethoxazole-trimethoprim and chloramphenicol. Though multi-drug resistance was common, no strains were resistant to quinolone and fluoroquinolones. We conclude that short-course treatments with ciprofloxacin can be recommended in Bangui for treatment of invasive diarrhoea.     

深圳市腹泻患者沙门菌感染状况和耐药性分析

目的 分析2014-2017年深圳地区腹泻患者沙门菌的感染特征和耐药性情况,为沙门菌感染的防控提供科学依据。方法 从深圳市3家哨点医院腹泻门诊收集患者粪便标本,进行沙门菌的分离鉴定、血清分型及药敏试验;对7家医院上送的住院病人分离的沙门菌进行血清分型和药敏试验。结果 4 847份门诊患者的粪便标本中,分离出192株沙门菌,检出率为4.0%。5-10月是沙门菌检出的高峰, 5岁以下儿童和6-17岁是感染的主要人群,检出率分别为6.2%和5.3%。192株沙门菌中鉴定出18种血清型,其中鼠伤寒沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌变种和肠炎沙门氏菌是最常见的3种血清型,另有19株未能分型。77株住院病人分离的沙门菌中鉴定出20种血清型,其中肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌变种、甲型副伤寒沙门氏菌占比分别为33.8%、13.0%和11.7%,另有3株未能分型。45株沙门菌对氨苄西林、环丙沙星和左旋氧氟沙星的耐药最为严重,自2015年开始出现对喹诺酮类药物的耐药和多重耐药菌株,10株鼠伤寒沙门氏菌中多重耐药率为50.0%。结论 深圳市腹泻患者的沙门菌感染以17岁以下儿童为主,5-10月份为感染的高峰期,沙门菌的血清型分散,其中肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌变种是主要的血清型,多重耐药自2015年开始日趋严重,临床上应合理规范用药并且加强耐药监测。     

志贺菌群及其血清型14年的变化和耐药趋势

目的监测我院1993—2006年与腹泻有关志贺菌群及其血清型14年的变化和耐药趋势,为本地区的流行病学研究、疫苗的制备及临床合理用药提供依据。方法通过常规大便培养,筛出致病菌后经生化及血清学进一步鉴定到种、群或血清型,并以纸片扩散法测定了抗菌药物的敏感性。结果14年分离到志贺菌6739株,患者以男性青年为主,6~9月份为腹泻发病高峰。共检测到志贺菌的4个群23个血清型。B群最多,占75.86%;D群占23.82%,有明显增多的趋势;F2a、F4和Fx分别占73.5%、5.6%和4.5%。各菌种及不同的血清型对抗菌药物的敏感率有差异,B群多重耐药较多。结论志贺菌群及血清型种类多,随时间的变迁变化明显,耐药性不同,应重视监测。     

天津地区福氏志贺菌整合子携带及耐药性研究

目的了解天津地区不同年份福氏志贺菌血清型分布,整合子携带情况,耐药性及其变化趋势。方法采用血清学方法对天津地区不同年份分离的56株福氏志贺菌进行分型;PCR扩增整合子整合酶及可变区,并测序;采用K-B法测定其对16种抗菌药物的敏感性。结果 1981~1983年分离株福氏志贺菌1类整合酶阳性率为87.50%(28/32),其中27株可变区含氨基糖苷类药物耐药基因aadA;2009~2011年分离株福氏志贺菌1类整合酶阳性率为91.67%(22/24),可变区及3’末端扩增均阴性。1981~1983年分离株福氏志贺菌2类整合酶均阴性;2009~2011年分离株福氏志贺菌2类整合酶阳性率79.17%(19/24),可变区含dfrA1、sat1、aadA1,介导对甲氧苄啶、链丝菌素和链霉素耐药。有17株福氏志贺菌1、2类整合酶均阳性。1981~1983年分离株福氏志贺菌对四环素、链霉素、氯霉素及甲氧苄啶/磺胺甲噁唑耐药率高,多重耐药率为65.63%;2009~2011年分离株福氏志贺菌对氨苄西林、链霉素、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑、哌拉西林和四环素耐药率高,多重耐药率为83.33%。结论 1、2类整合子广泛存在于天津地区福氏志贺菌中,其中1类整合子3’保守末端可能缺失或存在变异。2009~2011年分离株福氏志贺菌对抗菌药物耐药性较1981~1983年分离株增强,多重耐药率增高。福氏志贺菌优势血清型发生转变,血清型分布呈现多样化。     

山东生猪屠宰环节沙门氏菌血清型及耐药性测试

目的了解山东省生猪屠宰感染沙门氏菌耐药状况,指导临床用药。方法利用沙门氏菌血清型快速分型试剂盒鉴定血清型,微量肉汤稀释法对298株沙门氏菌进行8大类13种药物的药敏试验。结果鉴定出9种血清型,以德尔卑、鼠伤寒沙门氏菌为主;298株沙门氏菌对13种药物的耐药状况不同,对四环素类药物多西环素、四环素的耐药率较高,分别为97.99%(292/298)、80.20%(239/298),对粘杆菌素E最为敏感,耐药率仅为2.01%(6/298),其次为奥格门丁和氧氟沙星,耐药率分别为2.35%(7/298)和4.03%(12/298),多重耐药率为81.88%(244/298),优势耐药谱型为四环素-多西环素。结论山东省生猪屠宰环节沙门菌优势血清型为德尔卑沙门氏菌,对不同药物的耐药情况不同,不同屠宰环节的耐药性存在显著差异,多重耐药现象严重,耐药谱型种类繁多。     

Serovar distribution and antibiotic susceptibility of nontyphoidal Salmonella isolated from pediatric patients in Jakarta, Indonesia

A study was conducted during January 2003 through August 2005, at two community health centers in south Jakarta, Indonesia, to detect nontyphoidal Salmonella infections in children with diarrhea. A total of 814 rectal swab samples were collected, of which 56 (6.9%) were positive for Salmonella. Among the serovars detected, Salmonella enterica serovar Typhimurium was found most frequently in 32.1% of all Salmonella isolates. Antimicrobial susceptibility testing using eight antibiotics showed 5.6% to 66.7% of Salmonella serovars resistant to ampicillin, trimethoprim-sulfamethoxazole, chloramphenicol, tetracycline, and nalidixic acid. However, all serovars were susceptible to norfloxacin, ciprofloxacin, and ceftriaxone.     

1 831株宋内志贺菌耐药性调查及其产ESBLs的研究

目的了解分离自腹泻患者的1831株宋内志贺菌的流行趋势及耐药情况,探讨宋内志贺菌多重耐药机制。方法采用志贺菌及沙门菌琼脂培养基培养及K—B法检测14种抗生素的耐药率。多重耐药菌用纸片确认试验检测产超广谱β内酰胺酶（extended-spectrum β-laetamases,ESBLs）,改良三维试验检测ESBLs和AmpC β内酰胺酶（AmpC β-lactamase,AmIpC酶）。结果1831株宋内志贺菌感染腹泻患者中,男女比例为1．25：1。高发季节为7～9月。1～20岁发病人数占总发病人数的71．0％。宋内志贺菌对复方磺胺甲嗯唑、氨苄西林和头孢曲松的耐药率较高,分别达87．7％、23．0％和9．5％,且增高趋势明显;对氟喹诺酮类,头孢吡肟、头孢美唑、氯霉素、磷霉素和庆大霉素的耐药率较低,明显低于头孢曲松、头孢噻肟（P〈0．05）。43株多重耐药菌均为ESBLs阳性株,未发现产AmpC酶株。结论在北京地区,宋内志贺菌感染腹泻患者发病年龄以青少年为主。其存志贺菌属感染的比例中有增高的趋势,对头孢曲松、头孢噻肟、复方磺胺甲嗯唑、氨苄西林的耐药率较高且有上升趋势。宋内志贺菌耐头孢菌素者以产ESBLs为主。     

青藏高原牦牛携带屎肠球菌及其毒力基因和耐药性检测

目的 了解青藏高原牦牛携带屎肠球菌(Enterococcus faecium)情况,以及耐药性和毒力基因。方法 使用链球菌培养基分离细菌;使用生化反应和16s rDNA序列分析方法鉴定;采用PCR方法检测从牦牛粪便中分离的屎肠球菌携带细胞溶血素(cytolysin,cylA)、明胶酶E(gelatinase, gelE)、表面蛋白(enterococcal surface protein, esp)、胶质蛋白粘附素collagen-binding-adhesin of Enterococcal faecium,acm)、聚集物质(aggregation substance, asa1)及透明质酸酶(hyalronidase,hyl)6种毒力基因的情况;应用K-B纸片法对屎肠球菌分离株进行16种抗生素的敏感性分析;参照PulseNet 脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis, PFGE)实验方法对屎肠球菌分离株进行PFGE分型分析。结果 我们从320份牦牛粪便分离到33株屎肠球菌。这些菌株中毒力基因asa1的阳性率最高,为6.1%,acm和hyl次之,均为3.0%,其他毒力基因皆未检出。33株牦牛屎肠球菌中,有19株菌株具有抗生素耐药性,包括4株多重耐药菌株和15株单耐菌株。牦牛屎肠球菌对利福平耐药率最高,为48.5%;对其他抗生素的耐药率从高到低依次为青霉素G15.2%、四环素12.1%、强力霉素12.1%、红霉素9.1%、环丙沙星6.1%、氨苄西林6.1%、高浓度庆大霉素6.1%、磷霉素6.1%、左氧氟沙星6.1%。所有菌株对万古霉素、替拉考宁和氯霉素均敏感。细菌染色体DNA酶切片段的PFGE分析发现,33株屎肠球菌分离株共产生30种PFGE带型,可分为A-H 8个聚类群,耐药菌株分布在6个聚类群中。结论 青藏高原牦牛携带屎肠球菌,呈现高度遗传多态性,部分菌株携带毒力基因,对多种抗生素耐药。研究提示,屎肠球菌可能会通过牦牛相关食品传播。     

临床痢疾志贺菌整合子检测及耐药基因盒序列分析

目的 检测印度东部1988、1995和2002年部分临床分离痢疾志贺菌中细菌耐药关系密切的1、2、3类整合酶基因及整合子携带的耐药基因盒的分布,分析整合子系统对志贺菌耐药的影响.方法 纸片扩散法检测实验菌株对药物的敏感性;应用PCR方法对16株临床耐药菌株进行1、2、3类整合酶基因(intI)筛选,对阳性样本可变区基因盒序列进行鉴定分析.结果 所有16株菌均耐4种及4种以上药物,包括β-内酰胺类、氨基糖苷类、四环素类、磺胺类、氯霉素类和喹诺酮类.13株菌检出1类整合酶基因,全部菌株含2类整合酶基因,即发现同时存在两种整合子结构菌株,未检测到3类整合酶基因.1类整合酶插入基因盒以blaara30-aadAl基因家族为主,分别对β-内酰胺类抗生素、链霉素、壮观霉素耐药;2类整合酶插人基因盒以dfrAl-satl组合为主,分别对甲氧苄氨嘧啶、链丝菌素耐药,同时在4株菌中发现dfrAl-satl-aadAl基因盒组合.结论 2类整合子普遍存在于临床志贺菌中.整合子与志贺菌的多重耐药具有密切相关性.     

84株沙门菌耐药特征及分子分型结果分析

目的分析广东省第二人民医院2012-2014年临床常见沙门菌耐药特性及分子分型特征。方法对分离的84株沙门菌进行血清分型、药物敏感试验。选取不同菌株来源、血清型和耐药谱的51株沙门菌,按照美国PulseNet标准进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。应用BioNumerics软件对电泳图谱进行分析,确定菌株间的相关性。结果84株菌分为20种血清型,沙门菌前3位血清型构成比从高到低分别为:鼠伤寒沙门菌占42.86%(36/84)、肠炎沙门菌占15.48%(13/84)、斯坦利沙门菌占8.33%(7/84)。本次分离沙门菌对头孢类抗生素敏感率达84.21%以上,对于环丙沙星与氯霉素的敏感性在66.67%以上,对于甲氧苄啶与庆大霉素的敏感性在50.88%以上,但仍存在多株多重耐药现象。51株沙门菌经过聚类分析可分为 42个PFGE型,表现为较大的遗传多样性。结论临床治疗时,应根据药敏试验结果指导临床,合理使用抗生素,以提高治疗效果。沙门菌耐药谱与 PFGE分型无明显关联。     

猪2型链球菌安徽分离株的毒力基因、溶血性及耐药性分析

目的 了解猪2型链球菌(S. suis 2)安徽分离株的毒力基因分布特征以及溶血性和耐药性。方法 对19株S. suis 2安徽分离株,采用PCR方法检测cps2J、mrp、epf、sly 4种毒力基因,PA法和micro-ELISA法检测溶血类型和溶血价,K-B法检测对25种抗生素的敏感性。结果 11株毒力基因型为cps2J+/mrp+/epf+/sly+,占总菌株的57.9%,为毒力优势基因型;19株均呈α或β溶血,溶血价为1∶4～1∶128;对利福平、头孢他啶、氟苯尼考、头孢唑啉的敏感率较高,平均为84.2%,对强力霉素、四环素、杆菌肽和磺胺异恶唑的耐药率较高,平均为82.9%,且对该4种抗生素的多重耐药率为63.2%。结论 安徽猪群中流行的S. suis 2毒力基因的分布特征与国内相似,与国外存在一定差异,CPS、MRP、EPF和SLY是重要的毒力因子;S. suis 2的溶血类型与其SLY有关,但sly基因的不完整性并不一定改变S. suis 2的溶血性;S. suis 2安徽分离株的多重耐药性严重,耐药谱与其他地区存在一定差异。     

泰安市感染性腹泻非伤寒沙门菌耐药监测及分型研究

目的分离鉴定泰安市腹泻病沙门菌的血清型分布、耐药性及PFGE分子分型和同源性特点。方法对分离自泰安市腹泻病人的粪便标本中的31株沙门菌进行生化鉴定和血清分型,采用微量肉汤稀释法对其进行16种抗生素敏感试验,利用PFGE进行分子分型及聚类分析。结果 31株沙门菌分属于10种血清型,肠炎沙门菌占35.5%(11/31)为优势血清型;31株沙门菌对头孢西丁和亚胺培南100%敏感,对磺胺异唑的耐药率为77.42%(24/31);31株沙门菌按照100%的相似度可分为17个PFGE型。结论药敏显示所检测样本存在较为严重的多重耐药性,肠炎沙门菌遗传变异在该地区相对较为保守,且存在散发流行的可能,提示应做好肠炎沙门菌传染病的早期预警及防控。     

Nalidixic acid resistance in Salmonella strains with decreased susceptibility to ciprofloxacin isolated from humans in Turkey

The aim of this study was to evaluate the value of nalidixic acid resistance as an indicator of decreased susceptibility to ciprofloxacin (MIC = 0.125 - 1 mg/L) in Salmonella isolates from humans (n = 620) in Turkey. One isolate was found to be resistant, and the remaining isolates were susceptible to ciprofloxacin with the Clinical and Laboratory Standards Institute breakpoints; however, 75 isolates (12.1%) had decreased susceptibility. Resistance to nalidixic acid was observed in 76 (12.3%) isolates in the disk diffusion test. Seventy-four of these isolates had decreased susceptibility, one was fully resistant, and one isolate was susceptible to ciprofloxacin. One isolate with decreased susceptibility to ciprofloxacin was intermediate to nalidixic acid. Screening with 30-microg nalidixic acid disks had a sensitivity of 98.6% and a specificity of 99.8% for determination of decreased susceptibility to ciprofloxacin.     

2008-2010年住院患者不发酵糖菌分布及耐药性分析

目的 了解福建医科大学附属第一医院2008年1月1日至2010年12月31日临床分离不发酵糖菌分布及其对所测抗菌药物的耐药性,以引起临床医师和医院感染管理部门的关注,指导临床合理用药.方法 收集2008年1月1日至2010年12月31日我院住院患者临床分离的不发酵糖菌,采用法国生物梅里埃公司VITEK 2全自动细菌鉴定仪器检测,采用纸片扩散法(Kirby-Bauer法)进行抗菌药物的药敏试验,并对数据进行统计分析.结果 3年临床分离的不发酵糖菌共2 651株,其中铜绿假单胞菌1 268株,不动杆菌属1119株,嗜麦芽窄食单胞菌264株.铜绿假单胞菌对碳青霉烯类抗生素的耐药率在上升,达到19.5％～28.8％.不动杆菌耐药性更强,目前仅有米诺环素、头孢哌酮/舒巴坦、阿米卡星的耐药率＜30％,碳青霉烯类、喹诺酮类及氨苄西林/舒巴坦等抗菌药物的耐药率已经超过50％.嗜麦芽窄食单胞菌耐药率变化不大,对哌拉西林/他唑巴坦、复方新诺明、米诺环素等敏感率超过90％.结论 3年来我院住院患者临床分离不发酵糖菌占总的临床分离菌的比例波动于36.9％～40.6％,铜绿假单胞菌、不动杆菌属始终占据临床分离菌的前两位,不动杆菌耐药性逐年上升,铜绿假单胞菌对碳青霉烯类抗生素敏感性在下降,值得临床医师高度重视,定期开展细菌分布及耐药性监测,了解其动态变化,对合理应用抗菌药物有重要指导意义,同时院感部门应加强消毒隔离工作,防止耐药菌医院内传播.