HIV-1 CRF01-AE、CRF07/08-BC和B′构造病毒株体外适应性比较

目的构建NL4-3env-EGFP/DsRed2前病毒,观察中国主要流行的HIV-1 CRF01-AE?CRF07/08-BC和B′亚型构造病毒株体外适应性。方法 5份HIV-1B′,CRF07/08-BC,CRF01-AE亚型感染的干血斑样本和1份Zambia C亚型PBMC DNA样本,经单基因组扩增技术获得env全长基因,克隆、亚克隆、转染等步骤构建14个NL4-3env-EGFP/DsRed2前病毒,按顺序进行配对竞争实验,流式细胞仪定量检测被感染细胞的数量。结果 CRF01-AE亚型前病毒适应性最强,适应性值W1,其次为B′,Zambia C,CRF07-BC/CRF08-BC,P0.05。结论可利用NL4-3env-EGFP/DsRed2构造前病毒,通过竞争实验比较流行病毒株的体外适应性,推测env基因对适应性的影响。     

江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统分析

目的:了解江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统.方法:收集42份血清抗-HIV阳性者的血浆标本并提取RNA,逆转录为模版DNA后采用巢式 PCR法扩增env及 pol基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,比对确定基因亚型,分析不同途径感染者的基因亚型,构建系统进化树.结果:42份标本中,扩增出env及pol基因片段27份(64%);共发现5种 HIV-1亚型,其中 CRF01-AE亚型 19份、C亚型 2份、B亚型3份、CRF08-BC 2份、G亚型1份.经静脉药瘾感染者基因型多为CRF01-AE亚型;经性接触感染者HIV-1基因亚型包括检出的全部亚型,经性接触及吸毒感染者基因亚型均为CRF01-AE亚型.两基因构建系统进化树高度一致,主要有CRF-01AE、B-07、G、C和CRF-08BC 5种HIV亚型在流行,而以CRF-01AE为主要流行株.结论:江苏省 HIV-1基因亚型至少有5种,其中 CRF01-AE为主要亚型.     

云南省2006年HIV-1流行毒株的基因测定

目的 为了研究在中国云南流行的艾滋病毒I型(HIV=1)流行毒株的亚型类型与变异特征,进行分子流行病学研究,为艾滋病预防控制工作提供参考.方法 血浆来源于云南省监测系统中的19例HIV-1感染者.采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法,从19例患者血清中扩增HIV-1pol-gag共同拥有区片段并直接进行序列测定,所得序列用BioEdit和Mega软件进行亚型及系统发生树分析.结果 19例标本结果显示,12例为CRF08-BC、3例为CRF07-BC、1例为B型、3例为CRF01-AE型.19例毒株间的基因离散率都比较小,CRF08-BC亚型毒株间的基因离散率为2.45%,CRF07-BE亚型毒株间的基因离散率为2.16%;B亚型毒株为5.00%;CRF01-AE亚型毒株与来自泰国的流行CRF01-AE毒株AB032741、U51189的基因离散率分别为3.12%、3.22%.结论 上述结果表明,云南地区CRF-BC重组亚型已成为HIV-1流行病学优势亚型,结果基本上反映了我国HIV-1分子流行病学现状.     

云南省2006年HIV-1流行毒株的基因测定

目的为了研究在中国云南流行的艾滋病毒Ⅰ型（HIV-1）流行毒株的亚型类型与变异特征，进行分子流行病学研究，为艾滋病预防控制工作提供参考。方法血浆来源于云南省监测系统中的19例HIV-1感染者。采用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）法，从19例患者血清中扩增HIV-1pol—gag共同拥有区片段并直接进行序列测定，所得序列用BioEdit和Mega软件进行亚型及系统发生树分析。结果19例标本结果显示，12例为CRF08-BC、3例为CRF07-BC、1例为B型、3例为CRF01-AE型。19例毒株间的基因离散率都比较小，CRF08-BC亚型毒株间的基因离散率为2．45％，CRF07-BC亚型毒株间的基因离散率为2．16％；B亚型毒株为5．00%；CRF0-1AE亚型毒株与来自泰国的流行CRF01-AE毒株AB032741、U51189的基因离散率分别为3．12％、3．22％。结论上述结果表明，云南地区CRF—BC重组亚型已成为HIV-1流行病学优势亚型，结果基本上反映了我国HIV-1分子流行病学现状。     

近全长序列分析HIV-1独特型CRF01_AE/B''重组病毒基因

目的：对上海市发现的1例独特类型的CRF01_AE／B’重组病毒株进行近全长序列分析，以了解其DNA序列的特征．方法：应用巢式逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法，分段扩增HIV-1近全长基因组相应片段，进行克隆、测序．并分析其遗传进化树和序列断点位置。结果：近全长序列分析提示，该患者所感染的病毒由CRF01_AE和HIV-1B’亚型嵌合组成，两者各占约50％：其多聚酶蛋白基因（Pol）和外膜糖蛋白基因（Env）区均有HIV-1B’亚型片段和CRF01_AE片段嵌合组成：2种亚型病毒DNA片段嵌合点的位置与过去报道的重组病毒株（CRF15_AE／B、CRF33_AE／B和CRF34_AE／B）均不同：结论：在我国常见流行的HIV-1CRF01_AE重组病毒与B’亚型已在HIV-1感染人群中发生重组，其可能是在我国散发流行的独特型重组病毒株。     

2008年河北省不同HIV-1亚型感染者的CD4＋／CD8＋T淋巴细胞检测分析

目的研究河北省新确认的不同亚型HIV-1感染者的CD4＋／CD8＋T淋巴细胞水平,探讨不同亚型人群的cD4＋／CD8＋T淋巴细胞水平有无差异。方法选取2008年1～12月新确认的HIV-1感染者55例,利用分子生物学方法进行分型后,对不同亚型人群的CD4＋／CD8＋检测数据进行分析统计。结果在55例已确定亚型的H1V-1感染者中,B亚型与CRF01-AE亚型、cRF07-BC亚型的CD4＋T淋巴细胞水平之间差异有统计学意义（P〈0．05）。CRF01-AE亚型、CRF07-BC亚型两者的CD4＋T淋巴细胞水平之间差异无统计学意义（P〉0．05）。但是B亚型与CRF01-AE亚型、CRF07-BC亚型三者之间的cD8＋T淋巴细胞水平差异无统计学意义（P〉0．05）。结论在新确认的3种不同亚型HIV-1感染者中,cD4＋T淋巴细胞水平是不同的,以B亚型感染者为最低;三者之间的cD8＋T淋巴细胞水平差异无统计学意义,推测可能与HIV-1感染途径和感染时间有关。     

2011年浙江省台州地区新发现HIV-1感染者分子流行病学调查

目的 了解2011年浙江省台州地区新发现艾滋病病毒（HIV）感染者的基本情况以及不同HIV-1基因亚型的分布情况。方法 选取台州市2011年新发现未经抗病毒治疗的HIV感染者抗凝全血标本140份,提取血浆中的病毒RNA,通过RT-PCR扩增HIV-1 pol 区的蛋白酶基因全序列与反转录酶基因部分序列,使用HIV-Blast软件判定亚型。结果 2011年台州地区新发现的未经抗病毒治疗的HIV感染者男女性别比为3.24:1,感染者中92.86%为性传播感染,3.57%为注射毒品感染;共检测出5种HIV-1基因亚型,分别为CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B和C亚型。性传播感染人群中57.14%为CRF01_AE亚型,注射毒品人群中以CRF07_BC亚型为主。结论 台州地区艾滋病患者以性传播途径感染为主,HIV-1基因亚型呈多样性特点,CRF01_AE亚型流行于性传播感染人群,而CRF07_BC亚型流行于毒品注射感染人群。     

HIV-1基因亚型变化与贵州省艾滋病流行特征分析

目的:研究贵州省HIV-1亚型变化与艾滋病流行特征的关系.方法:分3个时段检测贵州省多个地区190份HIV样本,用套式PCR扩增其env基因片段并测序分析,将实验结果与贵州省艾滋病流行特征进行相关分析.结果:1998年检出B、C/CRF07_BC/CRF08_BC和CRF01_AE 3种HIV-1毒株,此间艾滋病流行以B和C/CRF07_BC/CRF08_BC毒株为主,主要经血液途径传播(占86.4％);2002年检出毒株均为C/CRF07_BC/CRF08_BC亚型毒株,这一时段艾滋病流行以吸毒传播为主(占100％);2007年检出B、CRF01_AE、C/CRF07_BC/CRF08_BC等3种亚型毒株,以CRF01_AE毒株为主(占52.1％),主要经性传播.结论:贵州HIV流行毒株随时间和传播途径变化而发生变化;目前主要流行毒株为CRF01_AE亚型毒株,主要在性接触人群中传播;对HIV-1基因亚型进行及时监测,能够预测艾滋病的流行特征.     

湛江地区献血人群HIV的基因分型及ELISA单试剂阳性者追踪检测的研究

目的了解湛江市无偿献血人群中人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)基因分型,推测湛江市HIV病毒来源,为湛江市防控艾滋病和临床用血安全提供依据。方法从23例经湛江市CDC WB法确认的HIV无偿献血者血液中提取RNA,用RT-PCR进行gag基因扩增,并对扩增产物进行测序和序列分析。对68例ELISA单试剂阳性者献血后每2周采血1次再次检测,检测呈双试剂阳性者通过WB法确认。结果 23例阳性感染者均为HIV-1,其中12例(52.2%)为CRF01_AE重组亚型;10例(43.5%)为CRF07_BC重组亚型;1例(4.3%)为01B型。68例ELISA单试剂检测阳性者中有1例8周后确认为HIV-1 CRF01_AE重组亚型,1例10周后确认为HIV-1 CRF07_BC重组亚型,35例连续追踪6个月后依然为单试剂检测阳性,31例由于多方面的原因无法追踪,最后放弃。结论湛江地区献血人群中HIV-1亚型以CRF01_AE和CRF07_BC为主。35例单试剂阳性者可能与感染了弱病毒株或其体内病毒受体或其他病毒感染相关的基因存在变异有关,需要进一步追踪研究。     

上海市常住人口HIV-1感染者基因亚型和耐药性突变横断面研究

目的:采用分层整群随机抽样原则,对本市95例已确诊的人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)感染者进行基因亚型和耐药性突变研究,以了解上海市HIV-1基因亚型及耐药性HIV-1的流行情况。方法:应用巢式RT-PCR扩增HIV-1聚合酶基因,经DNA测序后进行进化系统树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与国际耐药数据库比对,辨别耐药性突变位点,结合流行病学资料进行分析。结果:①在95例本市HIV感染者中经RT-PCR扩增并获得基因亚型序列70例,基因分型以CRF01_AE重组体30例(42.9%)为主,其余分别为B亚型6例(8.6%)、B’亚型10(4.3%)、G亚型2例(2.9%)、K亚型1例(1.4%)、CRF02_AG3例(4.3%)、CRF07_BC8例(11.4%)和CRF08_BC7例(10.0%),亚型间或重组体间二重重组体(CRF02_AG/CRF01_AE、B/CRF01_AE、K/G)3例(4.3%);②耐药分析结果表明,本组人群的蛋白酶抑制剂(PIs)原发耐药突变率为4.3%。在抗病毒治疗的HIV感染者15例中,11例(73.3%)发生反转录酶抑制剂(RTIs)耐药基因突变,其中核苷和非核苷类反转录酶抑制剂的耐药突变率分别为10例和11例(66.7%和73.3%),远高于未治疗者。结论:本研究分析了上海市HIV-1基因亚型和耐药突变的流行与变迁情况,对HIV-1遗传变异多样性和耐药监测体系的建立及上海市的艾滋病预防和控制工作有重要指导意义。