离子浓度对肽核酸压电基因传感器杂交效应的影响

目的　探索不同离子浓度的PBS缓冲液对肽核酸压电基因传感器阵列杂交效应的影响。方法　压电基因传感器阵列表面固定上 1 .5 μM的bis PNA探针后 ,分别观察在 1 0、2 0、5 0、1 0 0mM的PBS缓冲液环境中与相应的靶序列杂交 ,记录频率的下降值及反应所需的时间。结果　钠离子浓度从 1 0mM增加至 2 0mM时 ,杂交导致的频率下降值及平衡时间均增加 (P <0 .0 5 ) ;从 2 0mM增加至 5 0、1 0 0mM时 ,杂交导致的频率下降值各组间无显著差异 ,但杂交平衡时间却呈倍数增长。结论　离子浓度极大地影响了杂交反应的时间 ,低盐离子浓度更有利于提高bis PNA和dsDNA的杂交速率 ,高盐离子浓度则会大大降低bis PNA的结合速率。     

缓冲液pH值对LSAW-bisPNA传感器检测系统的影响

目的 探讨PBS缓冲液pH值对LSAW-bisPNA基因传感器检测系统的影响.方法 LSAW-bisPNA基因传感器表面固定终浓度为1.0 μmol/L的bis-PNA探针,然后分别在pH 5.8～8.0的PBS缓冲液中和相应的靶序列杂交,记录相位变化及反应所需时间.结果 在不同pH值缓冲液中,bis-PNA与靶序列反应引起的相位变化有明显差异(P＜0.01),pH 6.6与pH 6.8时传感器响应信号最大,但两者反应所达到的平衡时间有明显差异(P＜0.05),pH值6.6时检测所需时间更短.结论 选择pH 6.6作为bis-PNA和靶序列dsDNA反应的最适pH值,在该pH值条件下传感器响应信号大,反应达平衡时间短.     

探针浓度对肽核酸石英谐振式基因传感器阵列杂交效应的影响

目的探索不同肽核酸(PNA)探针浓度对PNA石英谐振式基因传感器阵列杂交效应的影响.方法石英谐振式基因传感器阵列表面分别固定上0.005、0.01、0.05、0.1、0.5、1.0、1.5、2.0、4.0μM的bis-PNA探针后,观察其固定以及与相应的HBV靶序列杂交时频率的下降值及反应所需的时间.结果探针固定引起的频率变化值先升而后趋于平缓,而与HBV靶序列杂交所引起的频率变化值却是先升后降,以1.5μM探针浓度为分界线;杂交平衡时间上各组间未见明显的变化趋势.结论 1.5μM bis-PNA探针固定浓度最为适宜.     

缓冲液离子浓度对新型PNA-LSAW基因传感器杂交效应的影响

目的 探讨PBS缓冲液的离子浓度对构建的肽核酸(PNA)漏声表面波(LSAw)基因传感器杂交效应的影响.方法 将1.0μmol/L的PNA探针固定在LSAW基因传感器表面,分别加入10、20、50、100mmol/L的PBS缓冲液,观察不同离子浓度的PBS缓冲液对PNA-LSAW基因传感器杂交效应的影响,记录分析传感器相位的变化值及反应所需的时间.结果 当钠离子浓度从10mmol/L增加至100mmol/L时,传感器的相位变化呈先升高后降低的趋势,以20mmol/L为分水岭.而杂交平衡时间增加显著.结论 离子浓度极大地影响了杂交反应的时间,低盐离子浓度更有利于提高PNA和靶序列的杂交速率,高盐离子浓度则会大大降低PNA的结合速率.离子浓度为20mmol/L时杂交最为适宜.     

不同温度对压电传感器基因杂交效应的影响

目的：探讨温度对压电传感器基因杂交效应的影响。方法：在压电传感器阵列上固定20碱基的疏基DNA探针,而后分别在15℃、20℃、25℃、30℃下与同长度的互补靶序列进行杂交,计算机采集并分析传感器频率数据,比较各温度下杂交达到平衡所需时间,杂交前后频率差,并计算杂交动力学参数。结果：随温度增加,杂交时间有缩短趋势,杂交前后的频率差值逐渐减小。结合常数变化不明显,解离常数增大,使平衡常数显著增大。结论：在石英晶体传感器阵列上,基因杂交量随温度增高而减小。     

2种不同类型的核酸探针对压电基因传感器阵列检测特异性的影响

目的探讨用PNA作为探针与普通的DNA探针相比对压电传感器基因杂交的优越性.方法用生物素-亲和素法分别将PNA、DNA两种探针固定在基因传感器的金膜表面,分别与完全匹配、1个碱基错配、2个碱基错配的互补靶序列进行杂交,观察2种不同的探针与靶序列反应所引起的频率变化及所用的时间.结果相对于DNA探针,PNA探针识别碱基错配的能力明显高,且杂交时间更短.结论 PNA与靶序列DNA结合有高度的特异性,选用PNA作探针,可提高压电基因传感器检测的特异性.     

探针浓度对压电传感器基因杂交效应的影响

目的 探讨探针浓度对压电传感器基因杂交效应的影响。方法 9种浓度的探针与同一浓度的靶序列在压电传感器阵列上进行杂交,计算机采集并分析传感器频率数据,比较各探针浓度下固定前后频率差,杂交达到平衡所需时间,杂交前后频率差,同时,根据较低浓度数据得出的杂交动力学参数。计算各浓度下的频率变化理论值。结果 随探针浓度增加,固定引起的频率变化值逐渐增加,杂交时间有缩短趋势,杂交前后的频率差值在探针浓度较低（1nmol/L-0.5μmol/L)时逐渐增大,而探;针浓度较高（1.0-3.5μmol/L)时反而减小,高浓度时杂交前后频率变化理论值与实际值存在明显差异。结论 在石英晶体传感器阵列上,基因杂交效率随探针浓度增加而增大,但探针浓度过高反而抑制杂交,其原因可能主要在于探针之间的空间构象关系和静电排斥。     

碱基匹配程度对压电传感器基因杂交效应的影响

探讨碱基匹配程度对压电传感器基因杂交效应的影响。方法 :在压电传感器阵列上固定 2 0碱基的巯基DNA探针 ,而后分别与有 0 ,1,2 ,3个碱基不匹配的靶序列进行杂交 ,计算机采集分析传感器频率数据 ,比较各匹配程度下杂交达到平衡所需时间 ,杂交前后频率差 ,并计算杂交动力学参数。结果 :随碱基不匹配数增加 ,杂交时间有缩短趋势 ,杂交前后频率差值逐步减小 ,结合常数明显下降 ,解离常数增大 ,使平衡常数显著减小。结论 :在石英晶体传感器阵列上 ,基因杂交效率随碱基不匹配数量增加而减小。     

靶DNA长度对压电传感器基因杂交效应的影响

目的：探讨靶DNA长度对压电传感器基因杂交效应的影响，方法：在压电传感器阵列上固定20碱基的巯基DNA序列作为探针后分别与不同长度的含互补片段的靶序列进行杂交，计算机采集并分析传感器频率数据，比较各靶DNA长度下杂交达到平衡所需时间，杂交前后频率差，并计算杂交动力学参数。结果：随靶DNA长度增加，杂交时间有延长趋势。在靶DNA长度为20－108个碱基时，其频率变化值与碱基数呈线性关系。而225，379，654个碱基时的频率变化反应则明显降低，结合常数变化不明显，而解离常数呈增大趋势变化，使平衡常数逐渐减少，结论：在威武央晶体传感器阵列上，频率变化值随靶序列长度增长而增大但反应效率不一样。     

肽核酸生物传感器检测系统构建时靶序列农度的影响及线性范围的确定

目的探索肽核酸生物传感器检测系统构建时靶序列浓度值对杂交效应的影响,以及靶序列浓度线性范围的确定.方法石英谐振式生物传感器阵列表面先固定上1.5μM的bis-PNA探针,观察终浓度为1pg/L至100μg/L的HBV DNA与探针进行杂交所引起的频率变化及反应所需时间.并对频率下降值与靶序列浓度做线性回归,确定其线性范围.结果靶序列浓度为1 pg/L时,传感器未能检测出任何频率的改变.随着浓度从10 pg/L增加到100μg/L,杂交反应引起的频率下降值呈先增加后趋于缓和的趋势,以10μg/L为分界线,而杂交平衡时间并没有显现出一定的变化趋势.在10pg/L到10μg/L的浓度范围内,浓度与频率下降值的线性回归方程为lgC=-2.745 5 0.069 1×△F,相关系数r=0.992 3.结论随着靶序列浓度的升高,杂交反应引起的频率下降值呈典型饱和曲线趋势,靶序列浓度的线性检测范围为:10 pg/L ～ 10μg/L.     

"RecA蛋白-互补单链DNA探针"生物信号放大系统用于压电基因传感器的研究

目的利用"RecA蛋白-互补单链DNA探针"与固定的肽核酸(bis-PNA)探针相结合,摸索最适的液相反应条件,以提高压电基因传感器基因传感表面的质量负载,从而提高传感器的灵敏度.方法基因传感器阵列固定上针对乙肝病毒的bis-PNA探针,加入靶DNA与之反应,然后加入预先处理过的不同浓度(0.5～6mg/ml)的"RecA蛋白-互补单链DNA探针".结果当RecA蛋白浓度为3mg/ml时,ATPγS浓度为12.5μM,所引起的频率变化最显著.结论在反应体系中加入"RecA蛋白-互补单链DNA探针",有效的提高了压电基因传感器的灵敏度.