1976~1990年北京地区腺病毒肺炎的流行特点及分子流行病学研究

对１９７６～１９９０年度１５个冬春２７５７例住院肺炎患儿作了病毒学检查，并对８０～９０年代及部分５０、６０年代分离的３、７型腺病毒（Ａｄ３、Ａｄ７）９９株用１２种ＤＮＡ限制性内切酶作了基因组型分析。研究结果阐明了北京地区腺佟毒（Ａｄｖ）肺炎的流行特点。１９７６年以来北京地区没有出现Ａｄｖ肺炎的爆发流行，仅有小规模的流行。Ａｄ３、Ａｄ７仍是Ａｄｖ肺炎的主要病原，但在不同阶段以一个血清型为主。１９８２     

腺病毒分子流行病学研究

腺病毒引起的儿童肺炎在20世纪50-60年代比较猖獗,发病率和病死率很高,中国报道的病死率达16.6%～33.3%[1].80年代后发病率和病死率有所降低,但近几年腺病毒感染人数义有所回升,甚至出现了腺病毒新的变异株.     

广东地区耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药性及分子流行病学特征

目的 分析广东地区耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药形势及分子流行病学特征。方法 对广东地区2019年收集分离的41株CRKP开展抗菌药物敏感性试验鉴定耐药表型,通过全基因组测序分析确定多位点序列分型(MLST)、耐药基因及毒力因子等分子特征,基于全基因组单核苷酸多态性(wgSNPs)分析菌株同源性及遗传进化关系。结果 41株CRKP均为泛耐药菌。耐药基因及可移动遗传元件(MGEs)种类多样,75.61%(31/41)菌株携带碳青霉烯酶基因,包括bla_KPC-2(18株)、bla_NDM-1(10株)、bla_NDM-5(2株)和bla_IMP-4(1株)四种类型。其中儿童CRKP主要携带bla_NDM-1,而成人则为bla_KPC-2。bla_NDM-1和bla_KPC-2分别主要通过质粒IncX3和IncFII传播。MLST分型共获得16种ST型,以ST11型(51.22%,21/41)为主,且均为非毒力株,而ST...     

广州市1987～1990年婴幼儿轮状病毒感染分子流行病学观察

本文报道广州市1987～1990年193例小儿腹泻患儿轮状病毒感染的分子流行病学检测结果。采用PAGE技术检测粪便中轮状病毒RNA。阳性率53.37％。其中RNA短型(第Ⅰ亚组)20例,占阳性标本的19.42％,长型(第Ⅱ亚组)78例,占75.73％。两亚组病毒进一步分成10个电泳型,其中3个属短型,7个属长型。4年中以RNA长型为主。每年均可检出一个优势的流行电泳型。     

肺炎链球菌分子流行病学监测方法

肺炎链球菌是大多数社区获得性肺炎、化脓性脑膜炎、败血症、中耳炎等的主要病原菌，近年来，耐药肺炎链球菌在世界范围内的广泛流行已引起医学界的普遍关注，尽管耐药性监测和血清分仍是主要的手段，但分子分型具有更好的鉴别力，本文有关肺炎链球菌分子流行病学监测方法及应用作了综述。     

产ESBL肺炎克雷伯菌医院感染分子流行病学研究

目的 明确产ＥＳＢＬ肺炎克雷伯菌医院感染发生率及其流行病学特征。方法 收集,分离菌株,进行药敏实验和ＥＳＢＬ检测;ＰＣＲ扩增ｂｌａＴＥＭ和ｂｌａＳＨＶ基因,等电聚焦测定β－内酰胺酶的等电点,染色体ＤＮＡ的ＰＦＧＥ分型以及进行病例资料分析。结果 共分离到１０４株非重复肺为克雷伯菌,产ＥＳＢＬ株占１３．５％。感染株ＥＳＢＬ阳性率明显高于院外感染株．;ＥＳＢＬ阳性菌对ＣＰＤ,ＣＴＸ,ＣＡＺ,ＣＴＲ,ＡＴ     

风疹病毒的分子流行病学

风疹是由风疹病毒引起的以急性发热、出疹为主要特点的呼吸道传染病。根据世界卫生组织的标准,将风疹病毒分为两个进化枝(分别命名为Clade 1和Clade 2),两个进化枝在核苷酸水平上差异为8%～10%。目前在两个进化支中已确定了7个基因型(1B、1C、1D、E、1F、2A、2B)和3个临时基因型(1a、1g、2c)。不同风疹病毒基因型有各自的地理分布特征,不同地区有本土流行株或优势株,同时风疹病毒流行也和年代有一定的相关性。风疹病毒的分子流行病学研究可以发现新的基因型,了解病毒各基因型在时间、空间上的分布,鉴定传染病,追踪传播途径,阐述特定区域内随着时间推移病毒的变异情况,评估控制风疹策略的效果,对于全球控制乃至消除风疹有着重要意义。该文就风疹病毒的基因划分及其分子流行病学研究现状加以综述。     

狂犬病的分子流行病学研究

狂犬病是一种急性致死性传染病,以往主要用抗血清和单克隆抗体检测进行狂犬病病毒的分型和流行病学调查。近年来,随着对狂犬病病毒分子生物学的认识日益深入,在核酸水平上进行狂犬病的病毒分型和分子流行病学研究已成为国际性的新热点。本文就近年来北美、欧洲和非洲等部分地区狂犬病分子流行病学的研究进展进行了综述。     

福州市人群乙型肝炎分子流行病学研究

[目的]研究福州市人群乙肝流行规律,探讨沿海地区HBV高发的原因,为制定防控策略提供科学依据。[方法]按整群抽样法,以家庭为单位随机抽样,用ELISA方法检测乙肝血清标志物,用荧光定量PCR检测HBV-DNA含量,用型特异性PCR进行乙肝病毒基因分型。[结果]福州市检测结果,人群HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb、HBcAb阳性率分别是13.3%、53.3%、2.3%、17.0%、56.8%;沿海2558份标本阳性率分别是16.8%、45.6%、4.9%、15.8%、53.9%;内陆1635份标本阳性率分别是9.7%、47.2%、2.2%、15.0%、51.5%;沿海HBsAg、HBeAg阳性率高于内陆(P<0.05)。随机抽取323份DNA阳性的样品进行基因分型,B型占49.2%、C型占43.4%、B C型占7.4%,沿海B、C型比重相近,内陆以B型为主。[结论]福州市人群中HBsAg携带率为13.3%,高于全国平均水平。沿海HBsAg携带率高达16.8%,为福州市乙型肝炎高发人群,应加强乙肝的预防与控制。     

呼吸机相关肺炎内源性感染途径的分子流行病学研究

目的用分子流行病学方法研究呼吸机相关肺炎(VAP)内源性感染途径在VAP发病机制中的作用,为探索和发展全新的VAP预防措施提供理论依据. 方法通过前瞻性队列研究,动态采集重症监护病房(ICU)人工气道(artificial airway,AA)包括气管插管或气管切开患者胃腔、口咽部、下呼吸道标本行病原菌培养和药敏试验;筛选VAP患者中下呼吸道、胃液和(或)咽拭子标本中所分病原菌生化反应结果相同并有先后定植次序者;通过PFGE方法分析这些病原菌是否具有同源性. 结果 98例人工气道机械通气患者中52例发生VAP;表型分析52例VAP患者有13例下呼吸道病原菌呈现胃腔→口咽部→下呼吸道的逆向定植次序;3例出现胃腔→下呼吸道的定植次序;病原菌的PFGE同源性分析表明ICU中52例VAP患者有15例(其中14例为晚发性VAP)存在胃腔→下呼吸道逆向内源性感染途径,占VAP发病总数的28.8%;PFGE技术方法为分析病原菌同源性的有效方法. 结论病原菌的PFGE同源性分析表明ICU中VAP患者存在胃腔→下呼吸道逆向内源性感染途径.     

2015-2020年江苏省戊型肝炎病毒流行病学特征及分子进化研究

目的 研究近年江苏省人源与猪源戊型肝炎病毒(HEV)流行病学特征和分子进化特征.方法 对2015-2020年江苏省戊型肝炎病例特征进行描述性分析.收集南通如皋县、盐城东台市、淮安清浦区、无锡宜兴市4个监测点报告的戊型肝炎患者标本和当地猪胆汁标本,采用ELISA法进行HEV-IgM抗体检测,采用荧光定量PCR、巢式PCR...     

重庆地区肺炎链球菌耐药性和分子流行病学调查

目的调查重庆地区肺炎链球菌在社区获得性感染患者中的分离率及对抗生素的敏感性。方法采集社区获得性感染患者的痰、鼻咽拭子标本,培养、分离和鉴定肺炎链球菌。琼脂二倍稀释法测定肺炎链球菌对11种抗生素的耐药性。通过聚合酶链反应(PCR)扩增肺炎链球菌BOX重复元件对其进行分子流行病学分型。结果680份临床标本中,分离出39株肺炎链球菌,阳性率为5.7%。34株(有5株在保存过程中死亡)肺炎链球菌中有2株对青霉素低度耐药(MIC为0.125mg/L),1株青霉素敏感株对左氧氟沙星耐药(MIC为8mg/L)。肺炎链球菌对大环内酯类抗生素和克林霉素表现出较高的耐药率,且均为高度耐药(MIC≥64mg/L),对所测其他β内酰胺类和万古霉素均呈敏感。盒式PCR显示了较高的分辨率,能快速、可靠地检测菌株间的亲缘关系。35株肺炎链球菌共分为25个型,29个亚型,最多见的为A型图谱(3株),2株青霉素低度耐药株分属不同的型。结论重庆地区分离的临床肺炎链球菌对青霉素耐药率较低,但对大环内酯类抗生素和克林霉素耐药却非常普遍。盒式PCR能快速、可靠地对肺炎链球菌进行分子流行病学分型,重庆地区耐药克隆没有明显的优势株。     

肺炎链球菌耐药性与分子流行病学研究

目的 调查南昌地区肺炎链球菌(SPN)的耐药性及分子流行病学特征.方法 用K-B纸片扩散法和E试验检测肺炎链球菌对10种抗菌药物的耐药状况,并采用BOX-PCR对29株临床分离SPN进行基因分析.结果 SPN对红霉素、克林霉素和四环素的耐药率很高(85.7%、79.8%、88.1%);对青霉素不敏感株为48株(57.1%);左氧氟沙星、阿莫西林/克拉维酸对该组细菌有较好的体外活性,敏感率分别为83.3%和88.1%;所有菌株对万古霉素敏感;29株肺炎链球菌共分为14个型,19个亚型,最多见的为A亚型(4株).结论 南昌地区肺炎链球菌对青霉素耐药率较高,BOX-PCR技术对SPN基因分型条带清晰、分辨率高、重复性好,能够快速、可靠地检测SPN及菌株间亲缘关系,适合进行流行病学调查.     

碳青霉烯类抗生素敏感性下降肺炎克雷伯菌耐药机制及分子流行病学研究

目的:研究临床分离对碳青霉烯类抗生素敏感性下降肺炎克雷伯菌的耐药机制及同源性分析。方法:收集对碳青霉烯类抗生素敏感性下降肺炎克雷伯菌25株。E test法测定10种抗菌药物的MIC值;脉冲场凝胶电泳分析菌株同源性;PCR及克隆测序分析耐药基因型。结果:25株菌株对β-内酰胺类抗生素呈多重耐药,但对多黏菌素E和替加环素敏感。PFGE分型除一株外均为同一克隆(暗示医院内感染)。25株菌株均产KPC-2碳青霉烯酶基因,并同时携带CTX-M、SHV、DHA等多种耐药基因。结论:携带KPC-2基因的肺炎克雷伯菌同时携带多种耐药基因。此类菌株对碳青霉烯类抗生素敏感性下降并对除多黏菌素E和替加环素外抗生素多重耐药。     

一起腺病毒感染暴发疫情分子流行特征分析

目的 了解2012年辽宁省某中学暴发的一起腺病毒感染的分子流行特征。方法 收集患病学生个案资料,采用多重聚合酶链反应（PCR）从咽拭子标本中进行腺病毒鉴定并进行病毒分离,扩增腺病毒六邻体（Hexon）基因的 L1 片段进行序列测定,BLAST比较并构建系统发生树。结果 1个月内在3个班级78名学生中累计出现24例发热病例,发病率为30.77%;咽拭子标本中5份标本多重PCR鉴定为腺病毒,同时分离到5株病毒;腺病毒 Hexon基因的 L1 片段测序显示5株腺病毒之间的核苷酸序列100%相同;BLAST比较显示与人腺病毒 14 型参考株高度同源,达100%;系统进化分析中5株腺病毒与人腺病毒 14 型参考株位于同一进化分支。结论 本次暴发疫情是由腺病毒 14 型引起,与之前中国所流行的腺病毒14型相比未发生基因变异。     

肺炎链球菌分子流行病学监测方法

肺炎链球菌是大多数社区获得性肺炎、化脓性脑膜炎、败血症、中耳炎等的主要病原菌。近年来,耐药肺炎链球菌在世界范围内的广泛流行已引起医学界的普遍关注,尽管耐药性监测和血清分型仍是主要的手段,但分子分型具有更好的鉴别力。本文就有关肺炎链球菌分子流行病学监测方法及应用作了综述。     

北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分析

目的了解北京地区流行性腮腺炎病毒流行株基因型分布和变异情况。方法通过SH基因的序列分析，与其他基因型参考株进行同源性比较，构建亲缘进化树。结果17株病毒均属于F基因型，VAC-S79属于A基因型，各流行株间核苷酸最大差异为5．4％，与F基因型代表株Z77158（兰州）、Z77160（上海）核苷酸最大差异分别为4．8％和7．0％；与疫苗株的核苷酸差异为14．6％～15．9％。结论近2年北京地区流行的优势株为F基因型，未发现基因型间变异，但存在较大的型内差异，有变异增大趋势，需进行持续的分子流行病学监测。     

无锡地区2008～2010年儿童肺炎支原体感染流行病学研究

目的 了解无锡地区2008～2010年儿童肺炎支原体感染状况及病原流行病学特点.方法 对2008年1月～2010年12月某院收治的急性下呼吸道感染住院患儿采用被动凝集法测定血清中肺炎支原体抗体;分析儿童肺炎支原体感染的年龄、性别分布特点,对3年监测结果进行流行病学调查.结果 2008～2010年无锡地区急性下呼吸道感染儿童肺炎支原体感染率分别为12.55％、20.78％、30.60％,感染率各年间比较差异具有统计学意义(P＜ 0.000 1).＜1岁组、1～3岁组、3～5岁组、＞5岁组肺炎支原体感染阳性率分别为13.15％、20.09％、26.70％、28.52％,婴儿组低于其他年龄组;女性肺炎支原体感染率高于男性;流行病学调查结果表明,无锡地区2010年肺炎支原体感染率高于其他年份,不同年份肺炎支原体感染率比较差异具有统计学意义(P＜ 0.000 1).3年间春、夏、秋、冬不同季节肺炎支原体感染率比较,差异具有统计学意义(P＜ 0.000 1).每年中不同季节肺炎支原体感染率存在季节差异.结论 儿童肺炎支原体感染存在年龄、性别差异.肺炎支原体是无锡地区3岁以上儿童急性下呼吸道感染的重要病原,病原流行季节为夏、秋季节.