基于炎症反应相关基因构建结肠癌预后模型及验证

目的应用生物信息学方法筛选结肠癌预后相关的炎症反应相关差异表达基因, 构建并验证结肠癌预后模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中检索472例结肠癌患者及41名健康人正常结肠组织的RNA测序和临床数据。从国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库中检索结肠癌预后相关基因表达及临床数据。检索时间均为建库至2022年11月。通过基因集富集分析(GSEA)数据库获取200个与炎症反应相关的基因, 将其与TCGA数据库中获得的结肠癌和正常结肠组织的RNA测序基因数据集进行对比, 获得炎症反应相关的差异表达基因。采用Cox比例风险模型分析评估TCGA数据库中与预后相关的差异表达基因, 炎症反应相关的差异表达基因与预后相关的差异表达基因取交集, 获得预后相关的炎症反应相关差异表达基因。通过LASSO Cox回归构建结肠癌预后模型。计算风险评分, 按风险评分的中位值将TCGA数据库结肠癌患者分为低风险(<中位值)和高风险(≥中位值)两组。对两组患者进行主成分分析(PCA), 采用Kaplan-Meier法进行生存分析。基于R软件timeROC程序包分析风险评分预测TCGA数据库结肠癌患者总生存...     

基于生物信息学筛选的结肠癌细胞焦亡相关基因的分析及预后模型的构建

目的探讨应用生物信息学筛选的结肠癌细胞焦亡相关基因特点, 对基于差异表达的细胞焦亡相关基因构建的结肠癌预后模型予以验证。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载结肠癌患者RNA测序的基因数据和临床数据。通过检索文献确定52个与细胞焦亡相关基因, 将其与TCGA数据库中获得的结肠癌和正常结肠组织的RNA测序基因数据集进行对比, 获取差异表达的临床样本细胞焦亡基因, 应用STRING网站和R软件分析这些基因蛋白质互作网络。依据TCGA数据库临床样本中细胞焦亡基因的差异表达情况, 将TCGA数据库中结肠癌患者分为焦亡组和未焦亡组, 根据基因表达量, 以P<0.05筛选两组间差异表达明显的基因;基于这些差异表达基因, 采用LASSO Cox回归构建细胞焦亡相关的结肠癌预后模型。按照模型计算的风险评分的中位值将从TCGA数据库中收集的患者分为高风险(≥中位值)和低风险(<中位值)两组, 通过Kaplan-Meier生存函数分析两组总生存, 采用R软件的timeROC程序包分析应用风险评分预测TCGA数据库结肠癌患者生存不同时间的效能。采用多因素Cox回归分析临床病理因素及模型风险评...     

胃癌内质网应激特征相关基因的筛选及预后风险模型的构建

目的基于生物信息学方法筛选胃癌内质网应激(ERS)特征相关差异表达基因并构建预后风险模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取375例胃癌和32例癌旁组织样本的转录组测序数据(RNA-seq)及相应临床信息作为训练集样本;从基因表达综合(GEO)数据库中下载387例胃癌患者数据(GSE84437)作为验证集样本;数据获取时间均为2021年12月25日。从GeneCards数据库中获取785个ERS特征相关基因(ERS-RG)。分析TCGA数据库中胃癌组织与癌旁组织之间差异表达基因。将鉴定出的胃癌差异表达基因与GeneCards数据库中ERS-RG取交集, 得到胃癌ERS特征相关差异表达基因, 对其进行基因本体功能(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用单因素Cox比例风险模型筛选具有预后价值的胃癌ERS特征相关差异表达基因, 进行LASSO回归分析, 构建多基因预后风险模型, 计算预后风险评分。根据预后风险评分的中位数(2.369), 将训练集和验证集中患者分别分为高风险组与低风险组;采用Kaplan-Meier生存分析比较两组患者总生存(OS), 并绘制时...     

基于TCGA数据库构建胃癌免疫相关基因的预后风险模型

目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,通过分析差异表达的免疫相关基因构建胃癌患者的预后风险模型。方法 从TCGA数据库下载胃癌及癌旁组织的RNA测序数据和配对的患者临床资料,从Imm Port数据库中下载免疫相关基因的数据。通过比较肿瘤组织和癌旁组织,筛选出差异表达的免疫相关基因,采用Cox风险比例回归模型构建差异表达免疫相关基因的预后风险模型,通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)评价模型的预测性能,再对模型风险评分进行独立预后分析。结果 从TCGA数据库下载了包括375例胃癌组织和32例癌旁组织的RNA测序数据,共筛选出349个差异表达的免疫相关基因,通过多因素Cox回归分析得到9个(IL1A、APOH、CGB5、GRP、TNFSF18、LGR6、MC1R、NPR1、CTLA4)与胃癌预后相关的免疫相关基因,并以此构建预后风险模型。根据模型风险评分的中位值将所有样本分为高、低风险两组,Kaplan-Meier生存分析结果显示,低风险组的总生存率高于高风险组,差异有统计学意义(P<0.001)。ROC曲线下面积为0.719,独立...     

胰腺癌组织中细胞分裂周期相关蛋白5的表达及其预后意义

目的基于生物信息学方法分析胰腺癌组织中细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)的表达及其与预后的相关性。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载2021年1月至2021年12月168例胰腺癌样本RNA测序数据(HTSeq-FPKM)和相应的临床信息, 从GEPIA2数据库中下载2021年1月至12月179例胰腺癌患者数据, 同时整合TCGA和GTEx数据库中的171个正常胰腺组织样本。分析GEPIA2数据库中胰腺癌患者CDCA5 mRNA相对表达量及其与患者总生存(OS)和无病生存(DFS)的关系;结合患者临床资料, 采用单因素和多因素Cox比例风险模型分析胰腺癌患者OS的影响因素;使用基因集富集分析(GSEA)探讨CDCA5在胰腺癌中可能参与的信号通路。结果在GEPIA2数据库中, 胰腺癌组织中CDCA5 mRNA相对表达量较正常胰腺组织升高, 差异有统计学意义(P<0.05)。根据CDCA5 mRNA相对表达量的中位值将胰腺癌患者分为高表达组(89例)和低表达组(89例)(等于中位值者未分组), CDCA5 mRNA高表达的胰腺癌患者较低表达患者OS(P=0.024)和DFS...     

基于单细胞RNA测序的膀胱癌预后风险模型的构建与验证

目的基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)生物信息学分析的预后相关的差异表达基因构建膀胱癌预后风险模型并验证。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载膀胱癌scRNA-seq数据集GSE135337、GSE129845, 数据更新时间分别为2022年、2019年;下载常规转录组数据集GSE13507(数据更新时间为2020年)中165例膀胱癌样本的表达谱及其生存信息。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载414例膀胱癌样本和19例癌旁样本的表达谱数据及405例膀胱癌患者的临床信息。采用R 4.1.2软件对GEO数据库中的10例膀胱癌单细胞样本进行质量控制及降维聚类并对其进行细胞注释;采用CellChat分析GEO数据库中单细胞数据的细胞间通信。采用单因素Cox比例风险模型分析筛选与膀胱癌预后相关的差异表达基因, 并使用LASSO-Cox回归分析构建预后风险模型, 计算风险评分。根据中位风险评分, 以TCGA数据集中膀胱癌患者为训练集, 将患者分为低风险组和高风险组;采用GEO数据库GSE13507数据集为验证集进行验证, 通过Kaplan-Meier分析比较训练集、验证集低风险组...     

胃癌自噬相关长链非编码RNA预后模型的建立与分析

背景与目的胃癌是常见的胃肠道肿瘤之一,其预后较差。大量研究表明自噬失调影响胃癌的发生与发展,本研究构建了胃癌自噬相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)预后风险模型,并分析了胃癌自噬相关lncRNA潜在的临床预后价值。方法从癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载443例胃癌患者的年龄、性别、生存时间、生存状态、肿瘤分期以及分级等临床相关资料,及其中375例胃癌患者的肿瘤组织和32例癌旁组织对照样本的转录组数据(mRNA和lncRNA)。从人类自噬数据库(Human Autophagy Database,HADb)下载自噬相关基因,采用Pearson相关性分析筛选出胃癌中与自噬基因相关的LncRNA。通过Kaplan-Meier法、单因素和多因素Cox回归分析筛选出具有独立临床预后价值的胃癌自噬相关LncRNA,并构建预后模型。然后,通过多因素Cox回归系数计算风险评分,将胃癌患者分为低风险组和高风险组,分析风险评分与胃癌患者的临床特征和总生存率的相关性。结果共筛选和鉴定出26个具有临床预后价值的胃癌自噬相关...     

肺腺癌m6A甲基化调控因子相关预后风险模型的构建及临床意义

目的 构建基于N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)甲基化调控因子的肺腺癌预后风险模型,为肺腺癌的预后评估提供科学依据。方法 从TCGA数据库下载mRNA表达和临床数据。使用R软件对24种m6A甲基化调控因子进行差异表达分析。利用单因素Cox回归分析初步筛选出与生存相关的m6A调控因子,在此基础上通过Lasso回归进一步筛选纳入模型的变量,将Lasso回归得到的m6A调控因子用于构建Cox回归模型并计算每个样本的风险评分。qRT-PCR检测模型基因HNRNPC及IGF2BP1在正常肺上皮细胞(REAS-2B)及肺腺癌细胞株(A549、H1299、PC9)中的表达。采用TCGA数据库中配对组织的差异分析检测模型基因在肺腺癌及正常肺组织的差异表达。使用Kaplan-Meier生存曲线及ROC曲线对模型效能进行评估。通过热图分析不同风险组的临床特征,并结合其他临床参数进行单因素和多因素Cox回归分析对风险模型的独立预后性进行检验。结果 19个m6A甲基化调控因子在肺腺癌和正常组织中显著差异表达。单因素Cox回归分析发现4个肺腺癌生存显著相关的m6A调控因子(P＜0.01),进一步采用Lasso回归联合Cox回归算法构建了包含2个基因(IGF2BP1、HNRNPC)的预后风险模型。qRT-PCR结果显示HNRNPC和IGF2BP1相对表达量在肺腺癌细胞株A549、H1299和PC-9中高于正常肺上皮细胞REAS-2B,差异具有统计学意义(P＜0.01)。TCGA数据库的59对肺腺癌及相邻的正常肺组织的匹配差异分析发现HNRNPC和IGF2BP1在肺腺癌中表达高于正常肺组织,差异具有统计学意义(P＜0.001)。生存曲线分析显示相比低风险组患者,高风险患者总体生存期明显降低(P＜0.01)。ROC曲线结果表明模型可以较好地预测肺腺癌患者预后(AUC=0.724)。多因素Cox回归分析显示该预后风险模型可作为独立预后因素(HR=2.357,P＜0.001)对肺腺癌患者的预后进行预测。结论 本研究构建了基于m6A甲基化调控因子的预后风险评估模型,且该模型具有较好的预测能力,对制定合理及有效的个体化治疗方案具有潜在的参考价值。     

蛋白酶活化受体2在卵巢上皮性癌中的表达及意义

目的探讨蛋白酶活化受体2(PAR2)在卵巢上皮性癌中的表达及意义。方法收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库(410例卵巢上皮性癌患者)和组织基因型表达(GTEx)数据库(88例正常人)中PAR2 mRNA的表达水平。收集2009—2019年于中国医学科学院肿瘤医院接受手术治疗卵巢癌患者(149例)的癌组织及临床病理资料, 对患者肿瘤组织进行PAR2蛋白免疫组化染色, 分析PAR2 mRNA及蛋白表达与临床病理特征及预后的关系, 通过富集分析研究PAR2参与的基因功能及相关信号通路。生存分析采用Kaplan-Meier法和Log rank检验, 影响因素分析采用Cox比例风险回归模型。结果 TCGA和GTEx数据库结果显示, 卵巢上皮性癌组织中PAR2 mRNA的表达水平(3.05±0.72)高于正常卵巢组织(0.33±0.16, P=0.004)。149例患者的免疫组化结果显示, PAR2呈强阳性19例, 阳性77例, 弱阳性21例, 阴性32例。初始手术减瘤效果及初始治疗效果与PAR2 mRNA及PAR2蛋白的表达有关(均P<0.05)。PAR2 mRNA高表达组(PAR2 m...     

基于生物信息学分析肾透明细胞癌中植物同源结构域指蛋白6的表达及临床意义

目的 基于生物信息学分析肾透明细胞癌（KIRC）中植物同源结构域指蛋白6(PHF6)的表达及临床意义,进而推断PHF6在KIRC中的作用。方法 通过癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载535例KIRC组织及72例正常肾组织的表达数据和临床数据,从基因型-组织表达（GTEx）数据库下载28例正常肾组织的表达数据和临床数据。比较TCGA、GTEx数据库中正常肾组织与KIRC组织中PHF6的表达情况,并比较不同临床特征KIRC患者KIRC组织中PHF6的表达情况。依据PHF6表达水平的中位数,将TCGA数据库中535例KIRC患者分为PHF6高表达组和PHF6低表达组,比较两组患者的总生存期（OS）、无进展生存期（PFS）、疾病特异性生存期（DSS）。对PHF6高表达组和PHF6低表达组差异表达的基因进行基因本位（GO）分析,并对PHF6高表达组的基因进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;选取相关基因进行相关性分析,并通过免疫组化法验证PHF6表达与核糖体蛋白S6激酶A6(RSK4)表达的相关性。结果 与正常肾组织相比,PHF6在KIRC组织中表达下调,PHF6高表达组KIR...     

铜死亡相关差异长链非编码RNA评分公式在肾透明细胞癌中的临床价值

目的探讨基于生物信息学方法构建的肾透明细胞癌(ccRCC)预后相关的铜死亡相关差异长链非编码RNA(lncRNA)评分公式在患者临床诊断、预后预测以及治疗抉择中的价值。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取ccRCC患者的基因矩阵和临床数据(数据更新至2022年3月29日)。基因矩阵收录539例ccRCC组织和72例癌旁正常组织表达数据;临床数据收录530例ccRCC患者资料。采用Pearson相关性分析、Wilcoxon符合秩检验和单因素Cox比例风险模型分析筛选预后相关的铜死亡相关差异lncRNA。采用R软件将530例包含生存资料的ccRCC患者以近似1∶1的比例随机抽样分组, 分为训练集(266例)和验证集(264例)。采用LASSO回归构建铜死亡相关差异lncRNA评分公式并进行交叉验证。采用受试者工作特征(ROC)曲线评估铜死亡相关差异lncRNA评分公式的特异度和灵敏度, 计算曲线下面积(AUC)。根据中位风险值将ccRCC患者分为低风险组和高风险组, 采用Kaplan-Meier法分析高、低风险组患者总生存(OS)的差异。采用t检验分析不同临床病理特征患者的风险值差异...     

基于免疫核心基因的喉鳞状细胞癌风险评分模型的建立

目的筛选喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)预后相关免疫核心基因并构建预后风险评分模型。方法利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中LSCC转录组测序信息,筛选差异表达基因,并与已知免疫相关基因取交集,筛选LSCC中预后相关免疫核心基因。利用单因素Cox回归构建风险评分模型并采用Kaplan-Meier法验证风险评分模型与LSCC患者预后的关系,同时绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线验证该模型准确度。结果 LSCC组织和癌旁组织中共有6 800个差异表达基因,通过单因素Cox分析并与已知免疫相关基因取交集,从差异表达基因中筛选出34个预后枢纽基因。基于免疫核心基因构建风险评分模型,高危险组患者总生存期短于低危险组患者(P<0.01),风险评分模型预测LSCC患者预后的ROC曲线下面积为0.930。结合临床病理学参数分析发现,患者性别是LSCC预后的保护因素,N分期晚期和高风险评分为LSCC预后的危险因素(均P<0.05),而患者年龄和T分期与LSCC预后无关(均P>0.05)。结论 LSCC中存在多个免疫核心基因异常表达,且与患者预后相关,基于其构建的风险评分模型可较好预测患者预后。     

整合铁死亡和免疫相关基因建立胃癌预后风险评估模型

目的 探讨铁死亡相关基因(FRGs)和免疫相关基因(IRGs)在胃癌中的预后价值并构建预后风险模型预测患者总生存期(OS)。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库中下载胃癌转录组数据和临床数据，从FerrDb和Immport数据库中提取FRGs和IRGs。将TCGA表达谱基因与FRGs和IRGs取交集获得胃癌FRGs和IRGs,使用差异分析和预后相关性分析进行筛选并通过Venn图取交集获得具有预后价值的差异FRGs和IRGs,使用LASSO-Cox回归进一步筛选构建铁死亡相关基因风险评分(FRG risk-score)和免疫相关基因风险评分(IRG risk-score)模型，运用Kaplan-Meier生存分析、受试者工作特征曲线(ROC)、主成分分析(PCA)和t-分布领域嵌入算法(t-SNE)、单变量与多变量Cox回归分析评估FRG risk-score和IRG risk-score模型，并构建结合临床病理学特征和FRG risk-score、IRG risk-score的列线图和校准曲线。同时，GSE84437数据集用于验证模型。运用CIBERSORT...     

基于铁死亡相关基因骨肉瘤预后模型的构建与验证

目的 基于铁死亡相关基因（FRG）构建骨肉瘤（OS）预后模型,探讨FRG在OS中的表达及与患者预后的关系。方法 通过生物信息学方法从UCSC Xena数据库中获取88例OS患者的转录组测序数据和其中85例患者的临床资料,与基因型-组织表达（GTEx）数据库中获取的396例正常骨组织样本合并,从FerrDb数据库中获取FRG,从合并后的数据中进行差异分析并提取差异表达的FRG。采用基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析探索OS中FRG的生物学功能。采用单因素Cox与Lasso回归模型筛选预后相关基因并构建预后预测模型。采用受试者工作特征（ROC）曲线分析预后模型的预测价值。采用单因素及多因素Cox回归模型分析OS患者预后的独立影响因素。采用实时荧光定量聚合酶链反应（qPCR）检测预后相关FRG在人成骨细胞hFOB1.19与OS细胞系U2OS、MG63中的表达情况。结果 共获得57个差异表达的FRG。GO与KEGG富集分析发现这些差异基因主要富集在缺氧反应、线粒体外膜、铁离子结合等生物学反应和线粒体自噬、化学致癌-活性氧以及铁死亡等途径。应用单因素Cox及Lasso...     

基于免疫相关基因构建肝细胞癌患者的预后模型及效果分析

目的:构建基于免疫相关基因的预测肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的预后模型.方法:所有的组织样本均从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)项目下载.我们在R软件中对50例正常肝脏组织和373例HCC组织的所有免疫相关基因进行了差异表达分析....     

基于TCGA数据库的胶质母细胞瘤LncRNA风险预测模型的建立

 目的 利用TCGA数据库建立胶质母细胞瘤患者预后的LncRNA风险评分模型。方法 下载TCGA数据库中胶质母细胞瘤及正常神经组织的基因表达谱数据、临床相关数据，筛选差异表达LncRNA，采用单因素和多因素Cox风险回归模型筛选和建立LncRNA预后模型。 结果 从TCGA数据库中得到169份胶质母细胞瘤组织和5份正常神经组织的基因表达谱，使用R语言edgeR包进行差异基因分析（logFC≥2或≤-2，FDR<0.05）得到差异基因7 978个，其中差异LncRNA 1 643个。单因素Cox分析及多因素Cox回归分析得到基于4个LncRNA的多因素预后风险模型：风险评分=0.59×NDUFB2-AS1－0.41×ZEB1-AS1＋0.31×AL139385.1＋0.21×AGAP2-AS1。模型的ROC曲线下面积AUC=0.864。患者风险评分结果提示高评分患者预后较低评分患者差。结论 NDUFB2-AS1、ZEB1-AS1、AL139385.1和AGAP2-AS1的风险预测模型可有效预测胶质母细胞瘤患者的预后，有望用于指导临床治疗。     

miR-139在肺鳞癌组织中的表达及临床意义

目的：分析miR-139在肺鳞癌组织中的表达及临床意义，预测与肺鳞癌预后相关的miR-139的靶基因。方法：从癌症基因组图谱（TCGA）数据库收集肺鳞癌数据集，下载患者临床特征、基因表达谱及预后随访信息。分析miR-139表达与肺鳞癌临床特征的相关性及对预后的影响。利用生物信息学方法预测miR-139的靶基因并进行生存分析。结果：在45对肺鳞癌和配对癌旁正常组织中，癌组织miR-139表达低于正常组织，且差异具有统计学意义（P<0.001）。在Ⅰ/Ⅱ期肺鳞癌组织中，miR-139相对高表达组的总生存较miR-139相对低表达组的差，其中位生存期分别为1713天和3253天，差异具有统计学意义（P<0.001）。多因素Cox回归分析发现，miR-139是肺鳞癌的独立预后因子，高表达患者的死亡风险是低表达患者的2.768倍（P<0.001）。结论：在肺鳞癌组织中，miR-139相对高表达是一种预后不良因素，经独立验证之后有望作为预测肺鳞癌患者预后的潜在生物标志物。     

基于生物信息学分析筛选和鉴定肝细胞癌预后相关的代谢基因

目的:寻找与肝癌发病机制和预后相关的潜在代谢基因并构建预测肝细胞癌(hepatocellular carcino-ma,HCC)患者预后模型.方法:通过GSEA数据库获得所有与代谢途径相关的基因,从TCGA数据库下载肝癌和正常组织的基因表达数据.将二者的基因相映射,分析这些代谢差异表基因(DEGs)在肝癌标本中的表达情...     

基于TCGA数据库分析泛凋亡相关基因构建肺腺癌预后模型的预测价值及其对肿瘤免疫微环境的影响

摘 要：［目的］ 探讨泛凋亡（PANoptosis）对肺腺癌（lung adenocarcinoma，LUAD）患者预后及免疫微环境的预测价值。［方法］ 从TCGA数据库下载LUAD样本与正常样本的基因表达谱及临床数据，从已发表的文献中获取PANoptosis相关基因并分析其在肿瘤组和对照组间的差异表达基因。通过单变量Cox分析和LASSO-Cox回归分析构建生存预后模型，将患者按风险评分划为高、低风险组。通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲线下面积（area under the curve，AUC）评价模型的预测性能，再对模型风险评分进行独立预后分析。GO和KEGG富集分析探索生物功能和潜在的信号通路。采用TIMER数据库ESTIMATE算法综合分析PANoptosis相关基因与免疫微环境相关性。通过qRT-PCR验证PANoptosis预后相关基因在LUAD组织和正常肺组织间的差异表达。［结果］ 共有15个PANoptosis相关基因在LUAD组和正常组间存在差异性表达，从中筛选出4个PANoptosis预后相关基因（RIPK3、NLRP3、FADD、MLKL）。在LASSO-Cox回归模型中，高风险组的生存率低于低风险组（P<0.001）。单变量和多变量Cox分析显示该评分模型是LUAD的独立预后因素（HR=2.179，95%CI：1.347～3.524，P=0.001），而GO和KEGG分析显示差异表达基因主要富集于与免疫相关的通路。高低风险组之间免疫微环境、免疫细胞差异和免疫检查点基因表达差异显著。此外，qRT-PCR实验也证实PANoptosis相关基因FADD（P=0.007）和NLRP3（P<0.001）在LUAD组和正常组之间表达存在差异。［结论］ 本研究构建的PANoptosis相关基因的生存预后模型可以预测LUAD患者的预后及免疫微环境。     

生物信息学分析甲状腺癌免疫基因构建预后评估模型及对免疫细胞浸润的影响

目的 基于生物信息学方法构建甲状腺癌免疫基因预后评估模型及危险分层系统,分析模型评分对免疫细胞浸润的影响和免疫调控网络.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库及ImmoPort Resources数据库下载甲状腺癌患者临床、转录组及免疫基因数据,筛选出差异表达的免疫相关...