2013年度贵州省发热呼吸道症候群病毒感染状况调查

摘要:目的　了解贵州省发热呼吸道症候群病毒性疾病的感染状况。方法　调查贵州省2013年度发热呼吸道症候群病例432例,采集呼吸道标本421份,通过相应试剂盒提取核酸,进行实时荧光定量（Real-Time）PCR检测流感病毒、副流感病毒、冠状病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、博卡病毒,鼻病毒及偏肺病毒。结果　从421份标本中检测出阳性标本128份,阳性率为30.41%。其中流感病毒60份,阳性率为14.25%;冠状病毒8份,阳性率为1.90%;博卡病毒3份,阳性率为0.71%;腺病毒10份,阳性率为2.38%;偏肺病毒9份,阳性率为2.14%;鼻病毒38份,阳性率为9.03%;未检出呼吸道合胞病毒和副流感病毒。检出3例流感病毒和鼻病毒混合感染。结论　呼吸道病毒是导致发热呼吸道症候群的重要病原体,其中以流感病毒最为常见,鼻病毒其次,腺病毒、偏肺病毒等检出率较低。     

台州地区2378例流感样病例呼吸道感染病毒病原学分析

目的了解台州地区流感样病例(ILI)呼吸道病毒的病原特征及流行趋势,为临床诊疗和防控策略的制订提供病原学依据。方法采用多重实时荧光定量RT-PCR法同时检测2 378份咽拭子标本人流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、副流感病毒、鼻病毒、人偏肺病毒、人博卡病毒、人冠状病毒等常见呼吸道病毒核酸并分析。结果 2 378份标本中共检出阳性标本644份,流感病毒检出率最高,其次为鼻病毒;台州地区各年龄段患者流感病毒、鼻病毒、人偏肺病毒、副流感病毒3型、呼吸道合胞病毒以及人偏肺病毒的阳性率有显著差异,且病毒流行呈现一定的季节性。结论台州地区流感样病例呼吸道病毒感染以流感病毒和鼻病毒为主,并呈现季节性和年龄段偏好性。快速发现呼吸道感染的病原体,不仅对流感样病例的早期诊断有指导价值,同时可以为掌握疾病的流行特征提供依据。     

一起因饮水污染所致的学校诺如病毒感染性腹泻暴发调查

目的 了解新晃侗族自治县某学校诺如病毒感染性腹泻疫情暴发的流行特征,查找学校群体性感染性腹泻的原因,为制定防控措施提供科学依据。 方法 对2014年8月31日-9月5日新晃县某学校感染性腹泻暴发疫情的腹泻病例进行个案调查和现场流行病学调查,采用SPSS17.0对罹患率进行检验,并对采集的标本进行实验室检测。 结果 此次疫情累计报告病例63人,罹患率9.14%;住校生与非住校生(χ²=8.765,P=0.003)、男生与女生(χ²= 5.344,P=0.021)、饮用学校自备水与未饮用者(χ²=101.861,P＜0.001)之间罹患率差异均有统计学意义;共采集病例粪便标本12份, 4份标本诺如病毒核酸阳性, 其中2份为诺如病毒GⅠ型,2份为诺如病毒GⅡ型。 结论 本次事件是学校水源水受污染引起的一起诺如病毒感染性腹泻疫情。     

深圳地区2011年流感样病例的病毒病原学调查

目的:了解深圳地区流感样病例的病毒病原学现况,为呼吸道传染病的诊断和预防控制提供病原学依据。方法:采用实时荧光定量PCR法,对269份咽拭子样本同时检测流感病毒、腺病毒、鼻病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒和人偏肺病毒共7种15个亚型常见呼吸道病毒。结果:2011年深圳流感样病例的病毒阳性检出率为50.2%(135/269),在检出的呼吸道病毒中鼻病毒检出最多,其次是流感病毒、冠状病毒和腺病毒。夏季和秋季都是鼻病毒占优势,分别为57.6%(19/33)和52.6%(20/38);冬季则以流感病毒为优势,占60.5%(23/38)。儿童中鼻病毒检出率最高,青少年和成人中流感病毒检出率最高。结论:鼻病毒、流感病毒、冠状病毒和腺病毒是深圳地区流感样病例的主要病原体,随着季节、月份的不同和年龄的不同而具有一定的流行规律。     

2012—2021年重庆市长寿区外环境禽流感病毒监测结果分析

目的 了解2012—2021年重庆市长寿区外环境禽流感病毒阳性及分布情况,为防控辖区人感染禽流感疫情提供数据支撑。方法 采集2012—2021年重庆市长寿区外环境4种场所的5种类型外环境标本,采用荧光定量PCR方法对标本进行流感病毒甲型通用、H5、H7和H9亚型流感病毒检测。率的比较采用χ²检验,P<0.05为差异有统计学意义。结果 2012—2021年重庆市长寿区采集禽流感外环境标本1 074份,检出甲型流感病毒阳性标本202份,阳性率为18.81%,各年度均有阳性标本检出,阳性率差异无统计学意义(χ²=6.835,P=0.650);阳性样本中H5亚型占30.69%,H9亚型占51.98%、H5+H9混合型占13.37%,其他型别(甲型非H5、非H9、非H7型别)占3.96%;4类场所中仅城乡活禽市场中检出阳性,阳性率为29.28%;5种类型外环境标本阳性率差异有统计学意义(χ²=89.561,P<0.001),其中清洗禽类污水禽流感病毒检出阳性率最高(35.09%),其次为宰杀或摆放禽肉案板表面擦拭(30...     

2010-2012年南京流感样病例部分呼吸道病毒流行特征分析

目的了解南京流感样病例9种呼吸道病毒流行特征。方法 2010-2012年采集两个流感哨点医院流感样病例(ILI)咽拭子标本1 367份,荧光定量PCR检测流感病毒(甲型、乙型、丙型)、副流感病毒(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型)、鼻病毒与人博卡病毒等9种常见呼吸道病毒。结果 1 367份ILI咽拭子标本中,检测出374份阳性,检出率为27.36%。以乙型流感病毒检出率最高(8.49%),其次是甲型流感病毒(7.53%),Ⅳ型副流感检出率最低(0.22%)。不同季节中,以夏季病毒检出率最高(31.50%),秋季最低(22.10%)。检出混合感染19例,以鼻病毒与其他病毒混合感染最多,共15例,占所有混合感染的78.95%。结论南京市2010-2012年流行呼吸道病毒以甲、乙型流感病毒、鼻病毒为主,间或有丙型流感流行,偶有个别4型副流感病毒与人博卡病毒感染病例出现。     

成都市发热呼吸道症候群患者病毒感染调查

目的了解成都市发热呼吸道感染病例常见病毒的感染状况,探讨发热呼吸道症候群的病原谱构成情况。方法 2010-07/2011-03,采集成都市3家哨点医院具备发热、咳嗽以及胸部X线片提示肺部炎性改变等临床症状的呼吸道感染病例标本302份;采用多重RT-PCR方法,对302份呼吸道标本同时进行流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒、人偏肺病毒、人博卡病毒、人腺病毒、人鼻病毒和肠道病毒等常见呼吸道病毒核酸检测。结果 302份标本中检出阳性标本72份,核酸阳性率为23.84%（72/302）,其中两种病毒混合感染6份,占阳性标本的8.33%（6/72）;5岁以下儿童患者标本病毒核酸阳性检出率为39.33%（59/150）,其中偏肺病毒的检出率最高;6～18岁患者标本病毒核酸阳性检出率为15.15%（5/33）,其中呼吸道合胞病毒检出率最高;18岁以上患者标本阳性检出率为11.76%（14/119）,其中流感病毒检出率最高。3月份病毒核酸检出率最高为74.36%（29/39）,不同性别患者之间病毒核酸检出率差异无统计学意义。结论成都市发热呼吸道病毒感染病例的病原体以偏肺病毒、鼻病毒和呼吸道合胞病毒为主。     

天津市儿童流感样病例变化趋势与呼吸道病毒病原的灰色关联分析

目的探讨天津市儿童流感样病例(ILI)呼吸道病毒病原体构成,分析ILI变化趋势以及引起ILI动态变化主要的病原。方法每周统计天津市儿童医院的流感样病例数据,并采集部分流感样病例的呼吸道标本采用多重RTPCR方法检测腺病毒(ADV)、副流感病毒(PIV)、流感病毒(Flu)、鼻病毒(RhinoV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、人偏肺病毒(HMPV)、冠状病毒(CoV)、肠道病毒(HEV)以及博卡病毒(HBoV)。分别对流感季与非流感季每周检出的病毒病原数与ILI数据做灰色关联分析。结果呼吸道病毒的阳性检出率为56.49%,其中Flu占比最高39.15%,流感季的周ILI%变化与Flu的关联度最大(γ=0.871);非流感季与周ILI%关联度最大的是全部病毒阳性数(γ=0.884)。结论天津市儿童流感样病例中多种病毒均有检出,流感病毒仍是引起流感季ILI%变化的主要病毒病原。     

门诊发热患者秋冬季呼吸道病毒感染的病原学分布与快速诊断

目的了解门诊发热患者秋冬季呼吸道病毒感染的病原构成,建立门诊发热患者呼吸道病毒的快速诊断方法,提高呼吸道传染病病原快速检测能力。方法收集医院2013年11月-2014年1月205例患者咽拭子,采用荧光定量RT-PCR法对流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、人冠状病毒、人偏肺病毒、腺病毒、人博卡病毒和鼻病毒等进行核酸检测。结果 205份标本中有70份标本病毒阳性,阳性检出率为34.1%;病毒阳性标本中,流感病毒检出率最高,以甲型流感病毒为主、鼻病毒位居第2、冠状病毒位居第3;5份标本检出两种病毒混合感染,以冠状病毒混合感染为主;性别与病毒检出差异无统计学意义;75~89岁患者病毒检出率最高为57.1%,乙型流感病毒在不同年龄段感染差异有统计学意义(P<0.05);各种病毒引起的上呼吸道感染和肺炎差异均无统计学意义;患者体温37~37.9℃时病毒检出率最高。结论甲型流感病毒是秋冬季引起呼吸道感染的主要病原体,荧光定量RT-PCR可快速明确呼吸道感染病毒。     

某部急性呼吸道感染病原谱的流行特征

目的调查了解某部队急性呼吸道感染病原体流行情况,为疫情防控提供依据。方法采集该部队急性呼吸道症候群病例咽拭子、血清等标本,采用荧光定量PCR检测呼吸道常见病毒。结果 2年共检测呼吸道感染病例标本801份,阳性299份,阳性率为37.3%。其中2014年检测536份,阳性率为39.9%,病原体主要为季节性H3N2病毒(占57.5%)、腺病毒55型(占40.6%)和乙型流感病毒(占1.9%)。2015年检测265份,阳性率为32.08%,病原体主要为乙型流感病毒(占30.1%)、腺病毒7型(占27.1%)和甲型H1N1病毒(占23.5%),其他为冠状病毒OC43型(占16.5%)和NL63型(占1.2%)。结论当前该部急性呼吸道感染病原体以甲、乙型流感病毒、腺病毒为主,也有冠状病毒检出。做好部队呼吸道病原监测工作,对部队传染病的防控有重要意义。     

深圳市龙岗区活禽市场外环境流感病毒污染监测及休市措施效果评价

目的 通过对活禽市场外环境监测,评估不同管理措施对控制禽流感病毒污染的效果。 方法 2014年12月-2015年2月,在深圳市统一休市前后,采集龙岗区8个街道16个活禽市场的外环境标本,采用RT-PCR法进行A型、H5亚型、H9亚型、H7亚型和H7N9流感病毒核酸检测;并对深圳市休市后一个月内全市人感染H7N9禽流感病例发病情况与广东省其他地区进行比较。 结果 共检测215份活禽市场外环境标本,检出A型流感病毒核酸阳性138份(64.19%);其中H9、H5、H7亚型流感病毒核酸阳性分别为37份(17.21%)、24份(11.16%)和3份(1.40%,含1份H7N9禽流感病毒核酸阳性);不同类型的外环境标本中不同的A型(χ²=23.354,P=0.000)及H5(χ²=10.609,P=0.005)亚型流感病毒核酸检出率有所不同;统一休市10 d后,深圳市1月内新发病例构成(6.67%)显著低于同期广东其它未休市地区的新发病例构成(46.55%)(χ²=8.018,P=0.005),活禽市场外环境中A型流感(χ²=48.337,P=0.000)和H9亚型(χ²=6.509,P=0.011)污染率显著下降; “活禽零存栏”措施可以有效降低活禽市场外环境中A型流感病毒的污染率(χ²=5.465,P=0.019)。 结论 龙岗区活禽市场外环境存在一定的禽流感病毒污染,“禁止活禽过夜和统一休市”作为现阶段防控人感染H7N9禽流感疫情的主要措施是科学、有效的。     

一起呼吸道多病原体混合感染聚集性疫情调查分析

目的调查分析中山市某小学一起由呼吸道多病原体混合感染引起的呼吸道症状聚集性疫情的流行病学特征,为预防类似聚集性疫情提供科学依据。方法采用现场流行病学调查、个案调查和访谈调查三种方法;收集16例有典型呼吸道感染症状病例的咽拭子,制备成8份混合样品采用荧光PCR方法进行多种呼吸道病毒检测。结果共搜索到19例病例,涉及3个班级,罹患率分别为16.67%、8.16%和14.00%,总体差异无统计学意义(χ^(2)=1.64,P>0.05)。病例年龄在7~8岁,男女生的罹患率分别为17.81%、8.11%,差异无统计学意义(χ^(2)=3.07,P>0.05)。检出多种呼吸道病原体,其中2种病原体组合:人鼻病毒与肺炎链球菌组合为最高,检出率为100.00%;其次是3种病原体组合:人鼻病毒、肺炎链球菌和流感嗜血杆菌,检出率为87.50%。结论该起发热聚集性疫情是呼吸道多病原体混合感染导致呼吸道感染,传播途径可能以密切接触为主。     

急性呼吸道感染患者220例非细菌性病原体流行特征分析

目的了解2011年3月—2012年2月北京市丰台区急性呼吸道感染非细菌性病原谱构成及其流行特征,为该区呼吸道传染病的预防控制以及临床诊断、治疗提供实验室依据。方法随机采集哨点医院发热门诊就诊的急性呼吸道感染病例咽拭子标本220例,利用多重实时-聚合酶链反应、聚合酶链反应(RT-PCR、PCR)方法进行流行性感冒(流感)病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、肠道病毒、博卡病毒、偏肺病毒、冠状病毒、鼻病毒和腺病毒9种病毒性病原体的检测和支原体检测,并进行统计分析。结果从220份咽拭子标本中共检出125份阳性标本,阳性率为56.82%。其中有6份标本为双重感染,阳性率较高的为流感病毒(65/131,49.62%)、支原体和副流感病毒(均为26/131,19.85%)。其他病原体的检出率均小于5%。不同病原体检出在季节分布上存在差异:流感病毒冬季检出率最高,支原体秋季检出较多,而副流感病毒感染的高峰期发生在夏季,病原体检出率在季节分布上总体呈现冬季(12—2月)较高,夏季较低的特点。不同性别间病原体检出率无统计学差异。发病3 d内采集的标本流感病毒检出率高于3 d后采集的标本,而支原体相反。结论北京市丰台区急性呼吸道感染非细菌性病原体主要为流感病毒、支原体和副流感病毒。在对急性呼吸道感染病例的诊断治疗中应考虑到不同病原体的高发季节。     

深圳市罗湖区急性呼吸道感染病毒病原谱分析

目的对深圳市罗湖区急性呼吸道病毒感染病例样本进行病原学检测,分析呼吸道病毒的流行特征,为呼吸道感染的预防控制提供科学依据。方法收集辖区哨点医院呼吸道感染病例鼻咽拭子标本,采用RT-PCR方法检测7种常见的呼吸道病毒共计15个亚型:流感病毒(flu A、flu B)、呼吸道合胞病毒(RSVA、RSVB)、鼻病毒(HRV)、腺病毒(ADV)、副流感病毒(PV1~PV3)、人偏肺病毒(hm PVA、hm PVB)、冠状病毒(Co V-HKU1、Co V-229E、Co V-OC43、Co V-NL63)。结果 281份呼吸道感染病例样本,病毒检出阳性率为48.04%(135/281),其中以流感病毒检出率最高(28.11%),其次是鼻病毒(7.83%),2月-5月为呼吸道病毒感染的高峰期,0岁~病毒检出率最高。结论流感病毒是罗湖区最常见的呼吸道病原体,其他呼吸道病原体多样化特征不明显。婴幼儿对呼吸道病毒最为敏感,是防治工作的重点。     

住院重症肺炎患者368例呼吸道病原体检测结果及影响因素分析

目的 了解住院重症肺炎患者呼吸道病原体感染情况及影响因素,为临床治疗提供指导和依据。方法 收集368例住院重症肺炎患者的病例资料及呼吸道19种病原体的检测情况进行分析,组间比较分析采用χ²检验或Fisher确切概率法,多因素分析使用logistic回归分析。结果 检出病原体感染阳性患者124例,阳性率为33.70%,其中16例为混合病原体感染。不同年龄组新型冠状病毒(SARS-CoV-2)检出率差异有统计学意义(χ²=24.679,P<0.05),肺炎支原体(MP)、鼻病毒(HRV)、人偏肺病毒(HMPV)检出率差异均有统计学意义(Fisher确切概率法,P均<0.05),甲型流感病毒(IFA)在≤14岁年龄组中检出率最高,为7.88%,SARS-Co V-2在≥61岁年龄组中检出率最高,为18.52%,MP在>14～<61岁年龄组中检出率最高,为9.02%。16例混合病原体感染患者中,婴幼儿患者12例,占75.00%;男性患者11例,占69.75%;HRV感染者9例,占56.25%。多因素logistic分析结果显示...     

荧光定量PCR检测急性呼吸道感染患者常见呼吸道病毒的研究

目的分析2011年8月至2012年8月期间惠州市急性呼吸道感染病毒性病原谱的构成及流行特征,为临床诊断、治疗和呼吸道传染病的预防控制提供病原学依据。方法应用荧光定量PCR方法,对485例鼻咽拭子样本同时进行甲型流感病毒、乙型流感病毒、腺病毒、博卡病毒、副流感病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒、人偏肺病毒、人冠状病毒的检测,并进行统计学分析。结果 485份样本中检出228份呼吸道病毒阳性的样本,阳性率为47.01%,其中混合感染20份,占阳性样本的8.77%。病毒病原谱构成前三位为乙型流感病毒、鼻病毒和甲型流感病毒。病毒检出阳性率的时间分布有一定规律性：1月至次年2月阳性率较高,不同月份检出的优势病毒不同。各年龄组病毒阳性率差异有统计学意义（χ2=19.414,P〈0.05）,不同年龄组病毒感染的病原谱构成也不同：0～5岁年龄组以鼻病毒为主;5岁以上各年龄组均以流感病毒为主。不同性别患者之间病毒核酸检出率差异无统计学意义（χ2=0.522,P〉0.05）。结论乙型流感病毒、鼻病毒和甲型流感病毒是惠州市急性呼吸道感染主要病原体。部分病原体的感染与年龄和季节有一定的关联;ARTI患者中部分合并感染其他呼吸道病毒,应长期监测呼吸道病毒的活动水平。     

绵阳市一起肺炎支原体肺炎聚集性疫情调查分析

目的 调查一起以发热、咳嗽为主要症状的聚集性疫情的病例临床特征和流行病学特征,分析原因并评价控制措施,为类似聚集性疫情防控提供参考依据。方法 分析2021-04-15-2021-08-04北川县人民医院来自A和B2所小学的学生及与其有共同居住史或有密切接触史等流行病学关联的病例资料。对搜集到的病例开展个案调查,采集标本进行呼吸道多种病原体检测。采用描述性研究方法对其临床和流行病学资料进行分析,组间比较采用χ²检验。结果 此次疫情共报告病例89例。临床症状以咳嗽、发热为主,肺炎支原体抗体检测阳性率67.42%(60/89)。年龄0～11岁,中位年龄8岁。疫情主要涉及A、B 2所小学,A小学罹患率为2.19%(59/2 697),各年级罹患率差异有统计学意义,χ²=64.312,P<0.001。B小学罹患率为0.82%(15/1 837),各年级罹患率差异无统计学意义,χ²=8.696,P=0.122。病例从发病到就诊间隔与时间呈负相关,r=-0.497,P<0.001。结论 此次疫情为肺炎支原体感染引起的聚集性...     

2018-2021年深圳市光明区哨点医院呼吸道病毒感染监测结果分析

目的 分析2018-2021年深圳市光明区哨点医院呼吸道病毒感染监测结果。方法 以2018年1月-2021年12月中国科学院大学深圳医院(光明区)1 183例流感样患者为研究对象，采用实时荧光定量PCR法检测咽拭子标本呼吸道病毒，分析患者感染情况。结果 1 183例流感样患者的咽拭子标本中呼吸道病毒阳性率为45.48%(538/1 183),538份阳性样品中单一感染533份、混合感染5份，其中流感病毒感染417例(占比77.51%)高于其他呼吸道病毒[腺病毒(6.51%)、呼吸道合胞病毒(1.30%)、人偏肺病毒(1.67%)、鼻病毒(6.88%)、冠状病毒(1.86%)、副流感病毒(3.16%)、博卡病毒(0.19%),P<0.05]感染；冬季呼吸道病毒感染发生率高于春、夏、秋季(P<0.05),其中各季节流感病毒感染占比高于其他病毒感染(P<0.05);流感病毒感染病例发病年龄主要集中在26～40岁中青年人群，感染率高于其他年龄段(P<0.05)。除冠状病毒以感染26～40岁的中青年为主外，其他呼吸道病毒感染情况主要以15岁以下儿童发病为主，鼻病毒感染病例...     

上海市静安区小学一起甲型流感暴发疫情分析

目的 了解上海市某小学一起甲型流感暴发疫情的流行病学资料,为探索针对性防控措施提供参考。方法 采用现场流行病学方法,通过现场随访和电话回访卫生老师及病例的方式,调查收集2022年11月8日至12月6日静安区某小学甲型流感暴发疫情资料,采用描述流行病学方法分析疫情的分布特征。结果 首发病例于2022年11月8日上午出现咳嗽、咽痛、发热症状,体温最高达38.6℃。本起暴发疫情累计报告流感样病例99例,其中学生92例,教师7例,总罹患率为9.45%。所有病例的临床症状均有发热、咽痛及咳嗽,经医院快诊试剂诊断为甲流病例27例。二年级学生病例罹患率最高(24.46%),不同年级学生病例罹患率差异有统计学意义(χ²=48.28,P<0.01);教学楼二楼病例罹患率最高(23.47%),不同楼层病例罹患率差异有统计学意义(χ²=52.38,P<0.01)。病原学检测显示,导致该次暴发的流感病毒为甲型H3N2病毒。结论 该次疫情是一起由甲型H3N2流感病毒引起的校园聚集性疫情。卫生与教育部门之间应加强合作,有效落实传染病防控措施,及时找出传染源,...     

2013—2022年抚州市流感病原学监测情况

目的 了解近10年抚州市流感病毒分离情况。方法 从流感监测信息系统收集2013—2022年抚州市流感监测数据，进行描述和统计分析。结果 2013年1月—2022年9月共检测标本11 396份，分离毒株536份，病毒分离率为4.70%。核酸阳性率(28.82%)和分离率(15.26%)2022年均为最高，2020年均为最低(0.90%和0),10年间差异有统计学意义(χ²=553.08、376.34,P值均<0.05)。病毒分离率以1季度(7.27%)最高，3季度(2.99%)最低，不同季度差异有统计学意义(χ²=72.48,P<0.05)。分离株主要为B-Victoria型(占44.59%),其次为季H3型(占29.29%)、B-Yamagata型(占13.25%)、新甲1型(占12.87%)。共监测暴发疫情17起，检测标本391份，分离病毒37株，暴发疫情优势毒株为季H3型(占78.38%)。非暴发疫情标本核酸阳性率(10.77%)和病毒分离率(4.53%)均低于暴发疫情(分别为67.00%和9.46%),差异均有统计学意义(χ...