基于网络药理学探讨岐黄避瘟方预防新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的 基于网络药理学探讨岐黄避瘟方预防新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索岐黄避瘟方中各味中药的有效成分及相关靶点;采用美国国立生物技术信息中心（NCBI）、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、GeneCards数据库检索COVID-19疾病相关靶点;构建岐黄避瘟方相关靶点与疾病相关靶点韦恩图,筛选岐黄避瘟方预防COVID-19的潜在靶点;将潜在靶点导入STRING数据库筛选出关键靶点,并构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图;采用Cytoscape 3.8.0软件构建药物-化学成分-关键靶点网络图;对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。结果 得到岐黄避瘟方预防COVID-19的潜在靶点122个;根据Betweenness Centrality值与Degree值大于中位数筛选出关键靶点45个,包括白细胞介素（IL）-6、IL-4、IL-2、IL-1β、Toll样受体4(TLR4)、Toll样受体2(TLR2)、趋化因子CC配体2(CCL2)等;按Degre...     

基于网络药理学探讨金欣口服液治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制

目的?采用网络药理学方法探究金欣口服液治疗新型冠状病毒肺炎的可能性和潜在作用靶点。方法?利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选金欣口服液的物质组成分,以口服生物吸收度和成药相似性为限制条件筛选类药性成分及其作用靶点。以规范化的MeSH主题词搜索疾病相关的靶点基因,并对靶点进行蛋白交互作用分析。进一步利用DAVID数据库进行基因本体分析,以类药性成分→基因靶点→作用通路的交互网络分析金欣口服液治疗新型冠状病毒肺炎的可能效应成分和潜在作用靶点。结果?金欣口服液中筛选得到129种类药性成分,以苯丙素和脂类成分为主。筛选到类药成分作用于病毒性肺炎相关的靶点基因75个,基因本体分析和交互网络分析结果显示其黄酮类成分和脂质类成分具有抗病毒免疫和抗炎作用。结论?金欣口服液具有潜在的抗新型冠状病毒肺炎的作用。      

基于网络药理学探讨穿心莲治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的 通过网络药理学的方法查找穿心莲重要的活性成分和作用靶点,探讨穿心莲治疗新型冠状病毒性肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 应用TCMSP数据库筛选穿心莲的药物活性成分和作用靶点、GeneCards数据库搜索新型冠状病毒性肺炎的靶点,利用Uniprot数据库将靶点蛋白基因标准化.将药物靶点与疾病靶点取交集靶点得...     

基于网络药理学探讨厚朴-广藿香治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的:基于网络药理学预测厚朴-广藿香药对治疗新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Dis-ease 2019,COVID-19)的作用靶点及信号通路,探讨其作用机制.方法:通过TCMSP,BATMAN-TCM数据库查询和相关文献检索筛选出厚朴-广藿香的活性成分及对应作用靶点,经过Uniprot数据库查询靶点对应的...     

基于网络药理学和分子对接法的化湿败毒方对抗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)分子机制初步研究

目的 《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》第七版中针对新冠肺炎重型疫毒闭肺证推荐使用化湿败毒方.该研究通过网络药理学的方法,筛选化湿败毒方的所含化学成分,构建成分-疾病靶点网络,对其进行抗新型冠状病毒肺炎分子机制的初步研究.方法 通过TCMSP和Drugbank数据库,筛选化湿败毒方所含化学成分,并获取其作用靶点;在Ge...     

基于网络药理学数据挖掘新型冠状病毒肺炎中药预防治疗的潜在靶点

目的:采用网络药理学方法分析预防和治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的中药活性成分及潜在治疗靶点。方法:采集自2019年12月8日官方通报的武汉首例不明原因肺炎发病病例至2020年2月10日国家级及省级卫生与健康委员会、中医药管理局、中医医院以及各中医专家团队根据本次疫情的发病情况确立的预防和治疗方案,纳入预防方剂55首中的高频药材,采用网络药理学在线分析系统(TCMSP)统计分析高频药物活性成分以及治疗靶点。结果:根据比对发现,共有22个化合物可能与COVID-19靶点相结合,22个化合物分别靶向CTSB1,CTSB2,CDK1,NTRK1四个靶点。其中化合物MOL005911同时靶向CTSB1,CDK1,NTRK1三个靶点。化合物MOL000098与CDK1,MOL000006 Cyclin-dependent kinase 1/cyclin B更好的靶点结合可能性。藿香同时含有化合物MOL005911和MOL000098。结论:藿香复方中药可能预防COVID-19。     

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)肾脏损伤的机制探讨

2019年底由新型冠状病毒(SARS-COV-2)感染导致的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情已被世界卫生组织定义为全球大流行.随着相关研究的不断深入,发现除呼吸系统病变外,肾脏损伤是COVID-19的主要并发症之一,危重症患者中急性肾损伤的发生率较高且影响患者预后.文章结合最新研究对COVID-19肾脏损害的可...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨解毒活血汤治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制

目的 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨解毒活血汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)多成分、多靶点、多通路的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索解毒活血汤中除生地黄外9味中药的活性成分及靶点,查阅文献筛选生地黄的活性成分,使用GeneCards数据库获取COVID-19的靶点,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-化合物-靶点网络,通过R软件的ClusterProfiler包对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)3CL水解酶(Mpro)、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)及关键靶点与显著化合物进行分子对接。结果 解毒活血汤包含了10味中药、153个化合物和253个靶点,将解毒活血汤主要活性成分调控的靶点与COVID-19的治疗靶点取交集,得到51个潜在靶点,GO功能富集分析得到82个条目(P<0.05),KEGG通路富集分析筛选得到154条信号通路(P <0...     

基于网络药理学探讨荆防败毒散防治儿童新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的运用网络药理学方法分析荆防败毒散治疗儿童新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的可能作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学在线分析工具(BATMAN-TCM),筛选荆防败毒散各中药的主要化学成分及靶点;采用GeneCards、NCBI、CTD及OMIM数据库检索COVID-19相关靶点;通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;采用Omicshare平台对共有靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;检索多脏器损伤、免疫损伤的疾病靶点,将荆防败毒散与之做映射,计算交集靶点占荆防败毒散靶点的百分比。结果荆防败毒散由12味中药组成,包含599个化合物,相对应的靶点有2290个。荆防败毒散的靶点与COVID-19有12个相同的炎症因子,每个炎症因子对应多个化合物。荆防败毒散与COVID-19有166个交集靶点,40个关键靶点。KEGG信号通路富集分析得到152条信号通路(P0.05); GO分析得到生物过程结果有1906个,细胞组成有32个,分子功能有73个(P0.05)。荆防败毒散与各脏器损伤靶点和免疫损伤靶点的共有靶点较多,且共有靶点占疾病靶点的百分比均高于20%。结论荆防败毒散可能通过抗炎、保护脏器损伤、免疫调节等作用治疗COVID-19。     

基于网络药理学探究益气化痰方治疗新型冠状病毒肺炎的分子机制

目的 应用网络药理学分析并进一步探讨益气化痰方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的分子机制.方法 运用升级的中药系统药理学数据库检索益气化痰方中的活性成分和潜在靶点,构建药物-成分-靶点作用网络.通过GeneCards数据库筛选出COVID-19的相关靶点,取其与药物作用的共同靶点导入String数据库进行靶蛋白...     

基于网络药理学探讨麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎所致发热的分子机制

目的通过网络药理学初步探讨麻黄汤治疗新型冠状病毒肺炎所致发热的可能作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台获得麻黄汤的有效活性成分及其作用靶点,再在UniProt数据库中利用Perl脚本获取药物靶点对应的人类基因。通过OMIM和GeneCards数据库收集与发热相关的疾病靶点。运用Venny平台获取药物-疾病交集的靶点基因后,通过STRING数据库建立蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。运用R×64 3.6.1软件对PPI网络中的30个关键基因进行可视化,并对所有交集靶点基因进行功能富集和通路富集分析。结果获得141个麻黄汤有效活性成分及194个药物-疾病交集的靶点基因,筛选出30个关键基因,包括STAT3、AKT1、JUN、MAPK1、IL-6、CXCL2、VEGFA、IL-1B等。交集靶点基因涉及DNA结合转录激活剂活性、RNA聚合酶Ⅱ特异性、细胞因子受体结合、细胞因子活性、泛素样蛋白连接酶结合、核受体活性等170个生物过程,同时主要涉及胞内磷脂酰肌醇激酶-蛋白激酶B信号通路、低氧诱导因子1信号通路、核因子κB信号通路、环磷酸鸟苷-蛋白激酶G信号通路等46个信号通路。结论麻黄汤缓解新...     

基于网络药理学探讨新型冠状病毒肺炎时方不同治则中药特色机制研究

目的 分析比较新型冠状病毒肺炎(COVID-19)时方中不同治则代表中药的作用机制,以期阐释中药防治新型冠状病毒肺炎不同病程阶段的药理作用机制及主要防治途径.方法 依据国家卫生健康委员会发布的《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第六版)》中临床治疗期的处方中药,总结疾病证候演变中四类基本治则,并且选定各治则高频次及具...     

射麻口服液治疗新型冠状病毒肺炎作用机制的网络药理学探讨

目的 探讨射麻口服液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索射麻口服液的活性成分及靶点;从GeneCards数据库获取COVID-19相关靶点.将药物靶点与疾病靶点进行映射得到射麻口服液治疗COVID-19的潜在作用靶点进行后续分析.通过STRING...     

八角茴香挥发油防治新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术,探讨八角茴香挥发油防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制.方法 选取4个(松油烯、萜品油烯、桉叶油醇、反式茴香脑)具有生物活性的八角茴香挥发油化合物作为研究对象.通过TCMSP和TCMID检索主要活性成分的靶蛋白,再利用UniProt数据库查询靶蛋白对应的人类基因.在Ge...     

宣肺清热方辅助治疗温州地区普通型新型冠状病毒肺炎的临床研究

目的：探讨宣肺清热方辅助治疗温州地区普通型新型冠状病毒肺炎患者的临床疗效和安全性。方法：选择普通型新冠肺炎患者82例,随机分为治疗组和对照组,每组41例,对照组予以西医常规治疗,治疗组在对照组基础上加用宣肺清热方。观察两组患者中医证候积分、中医证候疗效、肺部病灶吸收疗效、实验室指标、症状消失天数、首次痰核酸转阴天数、住院天数、住院费用、发生重型/危重型的比例、不良反应发生情况。结果：经过治疗后,治疗组较对照组咳嗽积分[(0.80±1.35)分比（1.68±1.51）分]、中医证候总积分[（1.17±1.63）分比（3.00±2.77）分]下降明显,差异有统计学意义（P<0.05）。治疗组较对照组发热、咳嗽、乏力、咽痛、胸闷、纳差、腹泻所有症状消失天数[（11.85±3.70）天比（15.00±6.51）天]、首次痰核酸转阴天数[（18.83±5.79）天比（22.41±8.48）天]、住院天数[（22.20±5.21）天比（25.41±7.81）天]、住院费用[（14014.47±5638.39）元比（20267.63±9883.74）元]少,差异均有统计学意义（P<0.05）。治疗组较对照组中医证候有效率[（97.56%）比（78.05%）]、肺部病灶吸收有效率[（97.56%）比（85.37%）]高,差异均有统计学意义（P<0.05）。治疗后,治疗组较对照组C-反应蛋白正常例数[（36）例比（27）例]、谷丙转氨酶正常例数[（37）例比（29）例]、谷草转氨酶正常例数[（40）比（33）例]、血沉正常例数[（18）例比（9）例]高,差异有统计学意义（P<0.05）。治疗组无患者发展为重型,对照组有2例患者发展为重型,两组均无患者发展为危重型,无不良反应,差异无统计学意义(P>0.05)。结论：温州地区普通型新冠肺炎患者辅以宣肺清热方,可改善患者症状,加速肺部病灶吸收,减轻机体炎症反应,改善肝功能,缩短痰核酸转阴天数、住院天数,减少住院费用,无不良反应。     

基于网络药理学探讨安富牛黄丸加味治疗新型冠状病毒作用机制

目的 运用网络药理学技术探寻安宫牛黄丸加味治疗新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的作用机制,为中药在防治新型冠状病毒方面发挥更大的临床作用.方法 通过检索TCMSP数据库、Batman数据库获得安宫牛黄丸加味方药中各药物的有效活性成分及相关靶点,新型冠状病毒的疾病数据通过OMIM和GeneCards数据库获取,运用P...     

基于网络药理学和分子对接探讨宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术,探究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、TCMID数据库筛选宣肺润燥解毒方活性成分,利用有关数据库筛选新冠肺炎相关靶点。以Cytoscape软件构建“药物-化合物-靶点”网络,并用分子对接验证有效成分与靶点亲和力。结果 筛选出宣肺润燥解毒方有效成分3019个,潜在靶点525个。分子对接结果显示活性成分槲皮素、木犀草素、汉黄芩素与关键靶点ATK1、TNF、TP53具有良好亲和力。结论 本研究初步明确宣肺润燥解毒方通过多成分-多靶点-多通路治疗新冠肺炎的作用机制,为深入研究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制提供了前期参考。