活血消异方治疗子宫内膜异位症网络药理学研究

采用网络药理学方法探析活血消异方治疗子宫内膜异位症(EMT)的相关靶点及作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)及Swiss Target Prediction网络数据库推测并获取活血消异方组方的药物活性成分及靶点.利用基因卡片(GeneCard)数据库筛选获取EMT的疾病相关靶点,绘制药物成分-药物靶...     

基于药学团-多靶点-多通路补中益气方调控头颈鳞癌网络药理学分析

目的 采用"多成分药学团-多靶点-多通路"网络药理学方法分析补中益气方调控头颈鳞癌的主要活性成分.方法 在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和BATMAN数据库(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)中,以"毒理药物动力学"(ADME)的口服生物利用度(OB),药物相似性(D...     

基于网络药理学和分子对接探讨解毒通利方治疗肝纤维化的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接的方法探讨解毒通利方治疗肝纤维化(HF)的可能作用机制。方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴(HERB)获得解毒通利方所有有效活性成分,通过TCMSP数据库将这些有效活性成分进行成分靶点预测,并与GeneCards数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库、OMIM数据库和DrugBank数据库中HF疾病基因相关靶点使用R语言软件取交集,从而获得解毒通利方治疗HF的靶点;通过STRING绘制交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,筛选核心蛋白;利用Cytoscape 3.8.0软件构建“中药—关键化合物—核心靶点”网络;运用R语言软件进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测核心靶点的作用机制。最后,应用分子对接技术,将关键有效活性成分和PPI中核心蛋白进行分子对接。结果 共筛选解毒通利方药物活性化合物172种,作用靶点4 068个,构建PPI网络,运用“CytoNCA”插件筛选出IL6、AKT1、STAT1、RELA、MYC、FOS、STAT3、MAPK1、CCND1等19个核心蛋白...     

基于网络药理学和分子对接研究金丹健肝胶囊治疗肝纤维化的作用机制

目的 利用网络药理学和分子对接技术阐明金丹健肝胶囊治疗肝纤维化可能的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台（http://tcmspw.com/tcmsp.php）和HERB数据库（http://herb.ac.cn）检索金丹健肝胶囊活性成分和靶点，通过DisGeNET、药物靶点数据库（Therapeutic Target Database, TTD）筛选肝纤维化疾病靶点；将金丹健肝胶囊活性成分的药物靶点与疾病靶点匹配，所得共同靶点导入STRING数据库平台构建蛋白质相互作用（protein protein interaction, PPI）网络；利用Cytoscape3.9.1软件CytoNCA工具进行拓扑分析，筛选关键靶点；应用Cytoscape3.9.1软件构建“中药-关键活性成分-关键靶点”网络图；通过DAVID平台（https://david.ncifcrf.gov）对关键靶点进行KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析；采用LeDock软件对活性成分与靶点进行分子对接验证。结果 筛选获得金丹健肝胶囊180个...     

基于网络药理学的黄芪桂枝五物汤治疗胃溃疡功效研究与初步验证

目的:通过网络药理学方法系统化探究黄芪桂枝五物汤治疗胃溃疡的功效网络,并用分子对接技术进行验证.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取黄芪桂枝五物汤的有效化合物及作用靶点,利用在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、基因疾病关联数据库(DisGeNET)、人类基因数据库(GeneCards)、毒性与基...     

基于网络药理学及分子对接方法分析佩兰治疗2型糖尿病作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接方法分析佩兰治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Drugbamk、UniProt数据库筛选出佩兰的活性成分及靶点;采用GeneCards、CTD及OMIM数据库获取T2DM相关基因,并与药物靶点相互映射,得到共同靶点;采用STRIN...     

基于网络药理学及分子对接探究补肾健脾方治疗慢性乙型肝炎的作用机制

[目的]基于网络药理学和分子对接技术探究补肾健脾方治疗慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)的作用机制。[方法]借助中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、UniProt等数据库筛选活性成分及其对应靶点,利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络图。通过DisGeNET和STRING数据库构建药物-疾病交集靶点的蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络。采用DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。对药物核心活性成分和靶点进行分子对接,以验证预测结果。[结果]补肾健脾方包含槲皮素、山奈酚等188个活性成分,以及白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、血清白蛋白(albumin,ALB)...     

基于网络药理学分析宣肺化浊方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在作用机制

目的 运用网络药理学方法 分析宣肺化浊方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在作用机制,为宣肺化浊方更广泛地应用于COVID-19的治疗提供理论依据.方法 检索TCMSP、UniProt、GeneCards数据库,筛选宣肺化浊方化学成分-作用靶点及COVID-19相关靶点;采用Venn在线平台映射宣肺化浊方治疗...     

康艾注射液干预乳腺癌的网络药理学研究

目的 基于网络药理学探讨康艾注射液治疗乳腺癌的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和SwissTargetPrediction数据库获取康艾注射液中药活性成分及靶点,并利用UniProt数据库规范靶点基因名称;借助GeneCards、OMIM数据库筛选乳腺癌疾病靶点,通过STRING数据库及...     

基于网络药理学探讨当归-菟丝子治疗多囊卵巢综合征的作用靶标和信号通路

目的 采用网络药理学方法筛选当归-菟丝子的活性成分,预测其治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的潜在作用靶标和信号通路,进一步探究其作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选当归-菟丝子的活性成分和候选靶标,利用GeneCards数据库和基因疾病关联数据库(DisGeNET)去重、合并,预测PCOS...     

基于网络药理学和分子对接探讨宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术，探究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、TCMID数据库筛选宣肺润燥解毒方活性成分，利用有关数据库筛选新冠肺炎相关靶点。以Cytoscape软件构建“药物-化合物-靶点”网络，并用分子对接验证有效成分与靶点亲和力。结果 筛选出宣肺润燥解毒方有效成分3019个，潜在靶点525个。分子对接结果显示活性成分槲皮素、木犀草素、汉黄芩素与关键靶点ATK1、TNF、TP53具有良好亲和力。结论 本研究初步明确宣肺润燥解毒方通过多成分-多靶点-多通路治疗新冠肺炎的作用机制，为深入研究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制提供了前期参考。     

抑肝散活性成分治疗阿尔茨海默病伴发抑郁障碍的网络药理学研究

目的:通过网络药理学方法,研究抑肝散治疗阿尔茨海默病伴发抑郁障碍的可能药效机制.方法:通过中药系统药力学分析平台(TCMSP)筛选中药活性成分,通过Swiss Target Prediction数据库进行反向靶点预测,通过GeneCards、OMIM及PharmGKB数据库收集疾病靶标,利用R语言对交集基因进行GO功能...     

基于网络药理学探究黄芩治疗慢性鼻窦炎的潜在作用机制

目的 运用网络药理学探究黄芩治疗慢性鼻窦炎的潜在作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systematic pharmacology database and analysis platform, TCMSP)、中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine, TCMIP)和中药分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine, BATMAN-TCM)筛选出黄芩的活性成分;利用Swiss Target Prediction数据库收集黄芩活性成分的靶点;利用GeneCards、在线人类孟德尔遗传(online Mendelian inheritance in man, OMIM)、gharmGKB和DrugBank数据库筛选“慢性鼻窦...     

益黄散治疗小儿慢性腹泻的网络药理学研究

目的 采用网络药理学探讨益黄散治疗小儿慢性腹泻的分子作用机制,为临床用药提供依据.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘益黄散药物有效成分,导入PubChem、SwissTargetPrediction数据库预测有效成分潜在靶点;在GeneCards数据库中检索小儿慢性腹泻靶点,将有效成分靶点与疾病...     

基于网络药理学探究补骨脂诱导的肝细胞线粒体损伤机制

目的:采用网络药理学方法分析补骨脂中与线粒体损伤有关的作用靶点。方法:补骨脂的活性成分从中医药系统药理学数据库分析平台获取。药物动力学(ADME)筛选标准为:口服生物学吸收性(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.14。利用Drug Bank数据库查找线粒体损伤疾病(MD)相关的靶点和活性化学成分的靶点,利用DAVID数据库进行靶点的通路(KEGG)和功能(GO)分析。结果:网络药理学研究结果显示,补骨脂活性物质的预测靶点与线粒体损伤疾病的靶点有重合,GO生物学过程富集分析可知,靶基因涉及缺氧反应、氧化还原过程、对细胞因子的反应、线粒体膜通透性的调控和线粒体细胞色素c的释放等生物过程。KEGG代谢通路富集分析可知补骨脂潜在毒性成分相关靶点涉及参与神经营养素信号通路、癌症途径、催乳素信号通路等多条信号通路。HepaRG/HepG2表明补骨脂素和异补骨脂素具有显著的肝毒性。结论:补骨脂活性成分通过诱导肝细胞的线粒体结构和功能改变产生肝毒性。     

基于网络药理学分析附子-干姜药对治疗溃疡性结肠炎作用机制

目的 运用网络药理学方法探讨附子-千姜药对治疗溃疡性结肠炎的作用机制.方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选附子-干姜药对活性成分;通过UniProt数据库获取活性成分的可能作用靶点;采用GeneCards数据库获取溃疡性结肠炎疾病靶点;采用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网...     

祖卡木颗粒治疗新型冠状病毒肺炎的潜在物质基础研究

目的 通过网络药理学和分子对接技术探究祖卡木颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在物质基础.方法 在中国知网和中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库检索祖卡木颗粒中十味药材的化学成分与作用靶点,使用GeneCards及NCBI数据库获取COVID-19靶点,UniProt数据库查询靶点对应的基因...     

基于网络药理学探讨中药调控癌基因诱导衰老用药规律研究

目的 探讨中药调控癌基因诱导衰老(OIS)的物质基础及用药规律.方法 检索基因组百科全书数据库(KEGG)、人类基因注释数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、CTD、Drug, Bank数据库获取OIS的作用靶点,以ADME参数与Lipinski规则为条件通过中药系统药理学分析平台(TCM...     

消炎膏外用干预血栓性浅静脉炎作用机制网络药理学研究

目的:利用网络药理学研究方法预测消炎膏外用干预血栓性浅静脉炎的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)挖掘消炎膏组成药物的入血成分及作用靶点,通过DisGeNET、基因卡片(GeneCards)、人类在线孟德尔遗传平台等数据库筛选出血栓性浅静脉炎的相关靶点.运用Cytoscape3.7.1软件构...     

基于网络药理学的芪参益气滴丸治疗心肌梗死机制研究

目的 采用网络药理学的方法 探究芪参益气滴丸治疗心肌梗死(MI)的药理作用机制.方法 使用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)检索芪参益气滴丸中药复方中四味草药的所有活性化合物成分和作用靶点;通过OMIM、TTD、PharmGKB、DisGinNET及DrugBank数据库对MI的相关疾病靶点进行检索,并与药物...