2007-2010年河北省卢龙县婴幼儿腹泻患者A组轮状病毒感染监测

目的 了解河北省婴幼儿腹泻患者轮状病毒的感染特点及基因型别的变迁情况.方法 2007 -2010年在河北卢龙县医院和卢龙县妇幼保健院收集5岁以下腹泻住院病例1643例的粪便标本,采用酶联免疫吸附试验( ELISA)检测轮状病毒抗原,阳性标本用多重反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行基因分型.结果 1643例标本中8...     

2007-2012年北京市流感样病例和流感病原学监测

目的 阐明2007-2012年北京市流行性感冒(流感)流行特征和病原学监测结果.方法 使用“北京市医疗机构传染病监测预警系统”中二级以上医院流感样病例数和百分比的周数据以及流感病原学监测周数据,分析流感样病例发病趋势和流感病毒构成情况.结果 2007-2012年,北京市二级以上医院共监测流感样病例3,045,527例,其中流感样病例百分比2.11％.期间共检测标本49,868件,检出阳性标本8,289件,其中甲型H1N1亚型573件(6.91％)、甲型H3N2亚型2,578件(31.10％)、甲型H1N1流感2,021件(24.38％)、B型Victoria系945件(11.40％)、B型Yamagada系681件(8.22％).各年度流感病毒亚型构成不同:2007-2008年度主要为B型Yamagada系(60.36％)和甲型H3N2亚型(23.68％),2008-2009年度为甲型H1N1亚型(78.63％),2009-2010年度为甲型H1N1流感(40.28％)和甲型H3N2亚型(20.29％),2010-2011年度为甲型H3N2亚型(64.34％)和甲型H1N1流感(23.44％),2011-2012年度为B型Victoria系(57.28％)、B型Yamagada系(20.80％)和甲型H3N2亚型(18.66％),2012-2013年度为甲型H3N2亚型(77.40％)和甲型H1N1流感(20.36％).结论 近年来,甲型H1N1亚型、甲型H3N2亚型、甲型H1N1流感、B型Victoria系和B型Yamagada系均有流行,且各年度优势毒株不一.     

广东省2005-2007年麻疹病原学监测

目的 开展有效的麻疹病原学监测,分离麻疹病毒,了解广东省2005-2007年流行的麻疹野病毒分离株基因特征,为控制、消除麻疹提供科学依据.方法 用Veto/Slam细胞从暴发和散发麻疹疑似病例的咽拭子和尿液标本中分离麻疹病毒,并对所有分离到的麻疹病毒通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法,扩增出核蛋白(N)基因碳末端450个核苷酸片段,对其产物测定基因序列以定型.结果 2005-2007年共收到380份标本,包括咽拭子或尿液标本.共分离到82株麻疹野病毒.2005年病毒分离率为23.58%,2006年病毒分离率为17.11%,2007年病毒分离率为39.13%.病毒分离成功率与病例出疹天数和标本的采集质量有密切关系.结论 我省已经掌握了麻疹病毒的分离和分子生物学鉴定技术,分离率较高;我省多年来流行的麻疹毒株均为H1基因型,与国内流行的优势基因型一致.     

北京市2007-2010年手足口病流行特征分析

目的 通过对2007-2010年北京市手足口病流行病学和病原学特征进行分析,为手足口病防控工作提供依据.方法采用描述性流行病学方法,对北京市2007-2010年手足口病监测数据进行分析,率的比较采用x2检验.结果北京市2007-2010年报告病例数分别为11012例、18445例、24483例和45409例,报告死亡例数分别为0例、2例、4例和18例,报告发病率分别为69.65/10万、112.90/10万、144.44/10万、258.74/10万.流动人口聚集区报告发病例数较多;四季均有病例报告,但以夏秋季为主,5-7月份为发病高峰;发病年龄以5岁及以下儿童为主;男性儿童发病高于女性儿童;散居儿童死亡例数高于幼托儿童.EV71和CoxA16为手足口病的主要致病病原体,EV71病毒均为C4基因型.结论北京市报告手足口病病例数早逐年增加趋势.每年夏秋季节,应加强对5岁以下儿童手足口病的防控工作,流动人口聚居区散居儿童是防控的重中之重.     

北京市2007-2010年手足口病流行特征分析

目的 通过对2007-2010年北京市手足口病流行病学和病原学特征进行分析,为手足口病防控工作提供依据.方法采用描述性流行病学方法,对北京市2007-2010年手足口病监测数据进行分析,率的比较采用x2检验.结果北京市2007-2010年报告病例数分别为11012例、18445例、24483例和45409例,报告死亡例...     

2007—2010年河北省卢龙县婴幼儿腹泻患者A组轮状病毒感染监测

目的了解河北省婴幼儿腹泻患者轮状病毒的感染特点及基因型别的变迁情况。方法2007—2010年在河北卢龙县医院和卢龙县妇幼保健院收集5岁以下腹泻住院病例1643例的粪便标本，采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测轮状病毒抗原，阳性标本用多重反转录．聚合酶链反应（RT-PCR）进行基因分型。结果1643例标本中801例轮状病毒抗原阳性，阳性率为48．75％。对轮状病毒抗原阳性标本进行G／P分型，2007—2010年G3型所占比例波动于48．59％-69．92％，G1型由2007年的10．59％下降至2010年的5．79％，G9型则由2007年的2．12％上升至2010年的19．74％。P分型以P[8]最为常见，G／P组合以G3P[8]为主。结论轮状病毒是婴幼儿腹泻的主要病原，G3P[8]为河北省主要流行株，G9型有上升趋势。     

北京市朝阳区2010-2012年麻疹野毒株分子流行特征分析

目的 了解近三年北京市朝阳区流行的麻疹野病毒分子流行特征,为本地区消除麻疹提供科学依据.方法 采集北京市朝阳区2010-2012年麻疹疑似病例的咽拭子和（或）尿液标本接种vero/SLAM细胞,对分离的麻疹病毒用逆转录及聚合酶链反应扩增麻疹病毒核蛋白（N）基因羧基末端676个核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并以羧基末端450个核苷酸片段构建基因亲缘关系树,进行遗传距离及核苷酸、氨基酸同源性分析.结果 分离出18株麻疹病毒,均为H1基因型,H1a亚型.这18株野毒株之间核苷酸同源性为98.2％～100.0％（核苷酸差异为0～8bp）,氨基酸变异范围为0～2.7％（氨基酸差异为0～4AA）.与H1a亚型参考毒株Chin9322相比,核苷酸变异范围为0.7％～1.6％（核苷酸差异为3 ～7 bp）.18株野毒株共有7种基因序列,其中2010年5种、2011年1种、2012年3种基因序列.V2基因序列出现在2010和2012年的病例中,V7序列出现在2010和2011年的病例中.其余5种序列只在单一年份的病例中检出.结论 北京近年来流行的本土麻疹病毒为H1a亚型,当年相同基因序列的一组病例提示有麻疹传播链的存在.北京市朝阳区存在基因序列完全相同的麻疹野毒株在2010、2012年循环出现.     

广州市海珠区2007-2010年麻疹、风疹检测结果分析

目的分析广州市海珠区2007-2010年麻疹、风疹流行特征,为麻疹、风疹的预防和控制提供可靠依据。方法对辖区内2007-2010年的麻疹、风疹病例的实验室检测结果进行统计分析。结果辖区内2007-2010年间麻疹年平均发病率为15.61/10万;风疹年平均发病率为2.57/10万。麻疹病例多集中在婴幼儿及中青年人群;风疹病例以10～25岁青少年为主,且麻疹、风疹的病例发生具有明显的季节性。结论要达到消除麻疹、控制风疹发病率的目标,应继续做好计划免疫工作,提高免疫覆盖率,严密监测,预防暴发。     

北京市2010-2013年急性出血性结膜炎的病原学分析

目的 确定北京市急性出血性结膜炎的病原学及流行病学特征.方法 2010-2013年7月至10月在北京地区所有区县监测点收集急性结膜炎患者眼拭子标本,通过RT-PCR分别鉴定柯萨奇病毒A24变种(CVA24v)和肠道病毒70(EV70).分析急性出血性结膜炎的时间分布、患者性别、年龄及临床症状特征,利用系统发育树分析CA24v的VP1区、3Cpro区基因特征.结果 随机抽取的1144件急性结膜炎样本中,4.5％(52/1144)为CVA24v阳性,未检测到EV70.CVA24v相关急性出血性结膜炎在9月达到高峰.各年龄组发病差异有统计学意义,10-19岁年龄组发病率最高.CA24v和非CA24v急性结膜炎的症状构成比无统计学差异.北京市2007-2012年分离的CA24v株VP1、3Cpro的核苷酸序列同源性分别为95.2％-100％和92.8％-100％.结论 2010-2013年CVA24v是引起北京市急性出血性结膜炎的最主要病原体.     

北京市房山区2014-2015年流感病原学监测结果分析

目的 通过对北京市房山区2014-2015年流感病原学的监测结果进行分析,了解房山区流感病毒的流行特征.方法 采集房山区哨点医院流感样病例的咽拭子标本1 339份,用荧光定量PCR法检测核酸及亚型,同时进行流感病毒分离及血凝实验(HA)检测.结果 2014年1月6日-2015年12月28日,共采集1 339份流感样病例咽拭子,荧光定量PCR法检测核酸阳性数为215例(阳性率为16.06％),其中甲型H1N1流感病毒32株,甲型H3N2流感病毒107株,乙型流感病毒76株.病毒分离阳性数为148例(阳性分离率为11.05％).本年度第2-6周和第48-52周流感阳性率较高,且第2-6周以甲型H1N1和乙型流感病毒为主,第48-52周以甲型H3N2流感病毒为主.结论 房山区2014-2015年流感高发季节为第2-6周和第48-52周,上半年致病病原体以甲型HIN1流感病毒和乙型流感病毒为主,下半年以H3N2流感病毒为主,不同性别之间各亚型流感病毒的阳性率构成比无统计学差异(P＞ 0.05).     

2012-2015年北京市顺义区流感监测结果分析

目的 分析顺义区2012-2015年流感病毒核酸的监测结果,掌握流感流行规律.方法 用实时定量PCR法对采集的流感样病例标本进行核酸检测.结果 2012年9月-2013年8月共检测流感样病例标本1040份,核酸检测阳性标本95例,阳性率为9.13％,高峰出现在12月-次年1月,主要以H3N2和新甲型H1N1流感病毒为主;2013年9月-2014年8月共检测流感样病例标本889份,核酸阳性标本138例,阳性率为15.52％,流行高峰出现在1-3月,以H3N2和甲型H1N1流感、乙型流感病毒为主.在2014年9月-2015年8月共检测流感样病例标本798份,核酸阳性标本151例,阳性率为18.92％,流行高峰出现在2014年11月-2015年4月份,以H3N2和乙型流感为主.检测阳性率最高的为60岁以上人群,其次是5-14岁组.结论 2012-2015年,顺义区新甲型H1N1亚型、H3N2亚型、乙型流感均有流行,且各年度优势毒株不一.     

2010-2012年南京市呼吸道冠状病毒流行病学特征分析

目的 分析2010年11月至2012年10月南京地区4个型别冠状病毒流行病学特征.方法 采集江苏省人民医院与南京医科大学第二附属医院流感样(influenza-like illness,ILI)病例咽拭子标本,并收集患者相关信息,利用RT-PCR方法进行检测,应用SPSS 17.0对数据进行统计分析.结果 1233例标本中,冠状病毒核酸阳性者共有115份(总阳性率9.33％),主要为229E型(36.52％,42/115)、OC43型(29.57％,34/115)与HKU1型(25.22％,29/115).2010-2012年不同年份间,冠状病毒229E型、HKU1型与NL63型阳性率有统计学差异(229E亚型:X2=18.072,P＜0.001;HKU1亚型:X2 =22.091,P＜0.001;NL63亚型:X2 =6.470,P=0.039).结论 南京地区冬季为冠状病毒流行高峰期,夏季为低谷期,春秋季小高峰趋势不明显.2010-2012年南京地区人呼吸道冠状病毒主要流行亚型为229E型、OC43型与HKU1型.不同年份冠状病毒主要流行亚型存在一定差异.     

Use of real-time PCR to measure Epstein-Barr virus genomes in whole blood

The measurement of the Epstein–Barr viral load in peripheral blood has been recognised as an important way of monitoring the response to treatment in patients with Epstein–Barr virus (EBV)-related malignancies. In particular, EBV load in transplant recipients can be used as a predictive parameter for Post-transplant Lymphoproliferative Disorder (PTLD). The aim was to develop a rapid and reliable PCR protocol for the quantification of the cell-associated EBV genome. Real-time PCR using TaqMan methodology was established. This technique was applied to determine the EBV load in various study groups including healthy controls, transplant recipients, patients on haemodialysis, and patients with infectious mononucleosis. The baseline level of EBV genomes in the immunosuppressed renal transplant recipients was significantly different from that in the healthy controls.     

北京市西城区2009-2012年度乙型流感病毒病原学监测分析

目的 分析北京市西城区2009-2012年乙型流感病毒的病原学监测结果,为制定预防控制措施提供依据.方法 由两家哨点医院每周随机采集流感样病例的咽拭子共30 ～40份,提取病毒RNA,应用real-time RT-PCR方法进行检测.结果 2009-2010年度乙型流感病毒总阳性检出率为29.7％,2010-2011年...     

Molecular surveillance of rubella viruses in Taiwan from 2005 to 2011

Rubella has been listed as a mandatory notifiable disease in Taiwan since 1988. Because of high coverage rates with an effective vaccine, rubella cases have decreased dramatically in Taiwan since 1994. However, rubella outbreaks still occur due to imported transmission. Five large clusters were detected in Taiwan from 2007 to 2011. In 2007, one cluster was caused by rubella genotype 1E viruses that were imported from Vietnam, whereas another cluster was caused by genotype 2B viruses and was untraceable. In 2008, two clusters were caused by different lineages of genotype 1E viruses that were imported from Malaysia. In 2009, a cluster that was caused by genotype 2B viruses was associated with imported cases from Vietnam. The rubella viruses from 124 confirmed cases from 2005 to 2011 were characterized, and the data revealed that these viruses were distributed in the following four genotypes: 1E (n = 56), 1h (n = 1), 1j (n = 4), and 2B (n = 63). Of these viruses, 93 (75%) were associated with imported cases, and 43 of 56 genotype 1E viruses were associated with imported cases from China, Vietnam, Malaysia, and Indonesia. One genotype 1h virus was imported from Belarus, and three of four genotype 1j viruses were imported from the Philippines. Of 63 rubella genotype 2B viruses, 46 were imported from Vietnam, Thailand, Malaysia, China, Germany, and South Africa. Molecular surveillance allows for the differentiation of circulating rubella viruses and can be used to investigate transmission pathways, which are important to identify the interruption of endemic virus transmission. J. Med. Virol. 85:745–753, 2013. © 2013 Wiley Periodicals, Inc.     

Antibiotic resistance – from pathogen to disease surveillance

Surveillance is central to defining the epidemiology of antibiotic resistance, developing new strategies for its control, informing disease management, identifying targets for new drugs and vaccines and in turn, evaluating and refining the impact of these interventions. Current surveillance systems often fall short of this ideal. Since antibiotics are prescribed for the treatment of specific disease, surveillance that reliably links diagnosis, pathogen and antibiotic usage is likely to be more informative. By identifying diseases that are readily recognized, and are usually reliably defined microbiologically, and in turn have clear links to public-health issues, a broader ownership of surveillance data should result. The case is argued for a more disease-focused microbiological surveillance approach than exists at present. Examples are provided which reflect a cross-section of community, nosocomial, zoonotic and imported infectious disease challenges, and where new approaches are urgently required to combat the upward spiral of resistance.     

Recovery of human norovirus from water by virus concentration methods

The aim of this study was to evaluate the applicability of virus concentration methods to detect human norovirus (HuNoV) in water. One conventional virus concentration method using an electropositive filter (1MDS-method) and two methods developed by our research group using an electronegative filter (Mg-method and Al-method) were subjected to recovery tests of the HuNoV strain GII.4, which was obtained from a diarrhea patient, and poliovirus (PV) type 1 inoculated into 5 kinds of water samples. The mean recovery yields of HuNoV by the Mg-method, determined by real-time PCR, were 186%, 80%, 167%, 15%, and 39% for MilliQ water, tap water, bottled water, river water, and pond water, respectively (n = 2 each), which were generally comparable to those of PV. A similar trend was observed for the Al-method (n = 8 in total), suggesting that both Mg- and Al-methods can be appropriate for concentrating HuNoVs from water samples. Unlike these two methods, no clear correlation was found between the recovery of HuNoV and PV by the 1MDS-method (n = 6 in total). This study is significant because it provides observations on the use of virus concentration methods for the detection of uncultivable HuNoV in water samples.