基于网络药理学对乌药汤治疗原发性痛经作用机制的研究

目的：利用网络药理学方法探讨乌药汤治疗原发性痛经的作用机制。方法：借助中药系统药理学分析平台（TCMSP）筛选乌药汤的活性成分；通过Pharmmapper数据库筛选活性成分潜在靶点基因，使用GeneCards数据库得到原发性痛经相关基因靶点；将活性成分的潜在靶点基因与原发性痛经相关基因进行比对，得到乌药汤治疗原发性痛经的潜在靶点基因；使用KOBAS3.0数据库对靶点基因功能（gene ontology，GO）和KEGG通路进行分析，得到乌药汤治疗原发性痛经的重要调节通路；采用Cytoscape3.6.1软件构建"成分-靶点-通路"网络；将筛选得到的主要活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果：从乌药汤中共筛选出菜蓟苦素、金圣草（黄）素、异黄檀素、甘草素f等31个活性成分，涉及包括ESR1、CASP3、MMP9、HRAS在内的23个基因靶点，影响了内分泌抵抗（Endocrine resistance）、雌激素受体信号传导通路（Estrogen signaling pathway）和催乳激素信号通路（Prolactin signaling pathway）等95条与原发性痛经相关的信号通路。分子对接结果显示，筛选得到的主要活性成分与关键靶点有较强结合，其中菜蓟苦素（cynaropicrin）和关键靶点的结合能力与阳性药接近。结论：本研究通过构建"成分-靶点-通路"网络图，揭示了乌药汤能通过多成分、多靶点、多通路发挥药效，为进一步阐释乌药汤治疗原发性痛经作用机制提供了科学依据。     

基于网络药理学研究钩藤治疗高血压的作用机制

目的基于网络药理学方法研究钩藤治疗高血压的作用机制。方法利用TCMSP数据库筛选钩藤中口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18的化学成分作为潜在药效成分,在TCMSP数据库中检索成分作用靶点。结合GeneCards、TTD、OMIM数据库检索高血压疾病相关靶点,提取成分和高血压疾病的共有靶点作为关键靶点。利用CluGO插件对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建"成分-靶点-信号通路"网络。结果筛选得到11种潜在的药效成分,协同作用于PTGS1、PTGS12、CHRM1、ADRα1B等关键靶点,并参与调节神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、5-羟色胺能突触、唾液分泌、间隙连接和脂肪细胞中的脂肪分解6条信号通路。结论本文应用网络药理学方法预测钩藤治疗高血压的潜在药效成分、作用靶点及信号通路,为钩藤治疗高血压的临床应用提供依据。     

基于网络药理学和分子对接的牵牛子抗肿瘤作用机制研究

目的 借助网络药理学联合分子对接技术,探究牵牛子抗肿瘤作用的潜在药效物质基础、作用靶点以及作用机制。方法 利用TCMSP平台获得牵牛子活性成分及其对应的靶点;整合与肿瘤相关的疾病靶点,与药物靶点取交集获得药物作用于肿瘤的靶点;使用STRING数据库得到PPI网络图;使用Metascape数据库对交集靶点进行GO富集分析以及KEGG富集分析;应用Cytoscape 3.8.2软件构建牵牛子活性成分-肿瘤靶点-作用通路网络图;应用AutoDock vina 1.1.2脚本对预测结果进行对接验证。结果 脱水淫羊藿素、β-谷甾醇、8-异戊烯基山柰酚等可能为牵牛子发挥抗肿瘤作用的核心药效成分;PPI网络显示CASP3、JUN、ESR1等为关键作用靶点;通路分析显示肿瘤靶点主要富集于雌激素信号通路、甲状腺激素信号通路、p53信号通路等;分子对接结果显示：牵牛子的核心药效成分与关键肿瘤靶点具有较好的结合能力。结论 初步探究了牵牛子抗肿瘤作用的潜在药效物质基础、作用靶点及作用机制,为牵牛子治疗肿瘤的临床应用以及抗肿瘤药物研发提供科学依据。     

基于网络药理学的“黄芪—当归”药对抗肾纤维化的作用机制研究

目的 基于网络药理学的方法探讨“黄芪-当归”药对抗肾纤维化(renal fibrosis,RF)的作用机制。方法 基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索并筛选“黄芪-当归”药对的潜在活性成分,结合SwissTargetPrediction数据库,获得潜在活性成分所对应的作用靶点,并与通过GeneCards和OMIM数据库检索获得的RF相关靶点进行映射,获得“黄芪-当归”药对抗RF的潜在作用靶点,对得到的靶点通过STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并筛选核心靶点和Hub靶点;利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体论和KEGG通路富集分析,通过构建“药对-活性成分-核心靶点-通路”网络,并利用分子对接技术对关键靶点和化合物的相互作用进行验证,系统阐释“黄芪-当归”药对抗RF的作用机制。结果 基于TCMSP和SwissTargetPrediction数据库,共获得“黄芪-当归”药对60个潜在活性成分和763个作用靶点,通过与RF相关靶点进行映射,获得352个交集靶点。通过构建PPI网络并进一步筛选,获得“黄...     

基于网络药理学六君子汤治疗胃癌的物质基础与作用机制研究

目的 探讨六君子汤治疗胃癌的药效物质基础与潜在的作用机制。方法 依托TCMSP和TCM-MESH数据库平台对六君子汤中的活性成分进行检索和筛选;利用SwissTargetPrediction,TTD,CTD,GeneCards等数据库对六君子汤活性成分以及胃癌相关靶点进行预测和筛选,进而构建活性成分-靶点网络图。对得到的靶点通过STRING进行蛋白互作（protein-protein interaction,PPI）网络构建并筛选核心靶点,进而通过ONCOMINE数据库分析核心靶点在胃癌中的表达。利用DAVID在线数据库对靶点进行基因本体论（gene ontology,GO）和KEGG通路富集分析以探讨靶点的生物学意义。对于得到的活性成分,作用于胃癌的靶点以及所富集的通路,构建六君子汤成分-靶点-通路网络图。结果 从六君子汤中筛选得到21个活性有效成分和43个作用于胃癌的相关靶点。靶点的PPI网络分析得到6个核心靶点,在ONCOMINE数据库的胃癌样本和正常样本中均存在显著的表达差异。对靶点的GO和KEGG通路富集分析结果显示这些靶点富集在生物过程的条目有74个,细胞组分的有9个,分子功能的有15个,而富集的KEGG通路有78条,涉及肿瘤、信号通路、病毒致癌、凋亡、癌症中的蛋白多糖等多种与胃癌密切相关的通路。六君子汤成分-靶点-通路网络图揭示了六君子汤中的药效物质和作用靶点,以及靶点与疾病通路之间的互作关系。结论 本研究初步明确了六君子汤通过多成分-多靶点-多通路治疗胃癌的作用机制,为深入研究六君子汤的药效物质基础和作用机制奠定基础。     

基于网络药理学的黄精抗肿瘤成分筛选研究

目的 探讨黄精抗肿瘤的药效物质基础及分子作用机制。方法 采用中药网络药理学数据库和分析平台（TCMSP）对黄精的化学成分进行收集，借助计算机辅助预测吸收、分布、代谢和排泄（ADME）性质并结合obioavail 1.1和pre-Caco-2预测模型对活性成分群进行初筛；对所有潜在活性成分进行靶点识别；采用Cytoscape3.6.1软件进行“活性成分-靶标”网络的构建，并利用“network analyzer”插件对网络的拓扑性质进行分析；采用在线分析工具DAVID进行KEGG通路富集分析。结果 黄精中已鉴定的39个化合物，其中18个具有良好的ADME性质的化合物，这些潜在的活性成分中，共有14个活性成分及其对应的19靶标与黄精抗肿瘤的活性密切相关。通过构建“活性成分-靶点”网络及对网络进行分析，共获得个4关键化合物：黄芩素、3’-甲氧基大豆苷元、异甘草素、（2R）-7-羟基-2-（4-羟苯基）-4-苯丙二氢呋喃；2个关键靶标：前列腺素G/H合酶2、热休克蛋白90AA1。在对靶点进行KEGG通路分析时，共获得12条与抗肿瘤相关的通路。结论 黄精可通过多成分、多靶点及多通路的作用机制发挥其抗肿瘤活性。     

基于网络药理学和分子对接技术探究连翘抗顺铂肾毒性作用机制

目的：通过运用网络药理学,并结合分子对接技术,探讨连翘抗顺铂肾毒性可能的物质基础,并进一步分析其潜在的分子机制。方法：首先通过筛选连翘活性成分和作用靶点并构建PPI网络,根据网络拓扑参数筛选核心靶点,确定连翘中抗顺铂肾毒性的重要活性成分。对核心靶点进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析,构建“KEGG通路-关键基因-活性成分关系网络”。然后对筛选后的活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果：药材-化合物-靶点相互作用网络结果显示连翘苷、连翘酯苷A的Degree值分别为20、18,是连翘抗顺铂肾毒性作用的前两位重要活性成分。PPI网络分析发现ALB、EGFR、SRC、HSP90AA1、CASP3、MAPK14、MAPK1、ESR1和KDR的Degree值分别为26、21、20、19、16、15、15、14、13,为PPI网络中的核心靶点基因。GO和KEGG分析发现MAPK信号通路和Rap1信号通路在连翘抗顺铂肾毒性作用中发挥重要作用。分子对接结果显示,连翘酯苷A和连翘苷均与MAPK14及MAPK1有较高的亲和力,二者可能通过作用于MAPK通路来发挥肾脏保护作用。结...     

基于网络药理学的羌活-独活药对抗炎作用机制研究

目的:预测羌活-独活药对抗炎活性成分及其作用机制。方法:根据口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的原则分别筛选羌活、独活的活性成分,通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)对羌活、独活的潜在作用靶点进行预测和筛选,然后以"Anti-inflammatory"为关键词在人类基因数据库Genecards中检索炎症相关靶基因,并与羌活、独活中活性成分靶基因映射筛选出共同靶点,再利用Cytoscape 3.5.1软件建立活性成分-靶点网络。将筛选得到的靶点在相互作用基因/蛋白质搜索工具平台STRING V 10.5构建其靶蛋白相互作用(PPI)网络,并进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路和基因本体(GO)富集分析,以研究其抗炎机制。结果:从羌活、独活药对中共筛选得到香豆素、β-谷甾醇、欧前胡素、紫花前胡苷等15个活性成分,作用于转录因子AP-1、磷脂酰肌醇激酶3r亚基、雌激素受体等49个靶点,主要涉及乙型肝炎、细胞凋亡等19条信号通路,参与炎症反应调节、前列腺素类生物合成等47个生物过程。结论:预测了羌活-独活药对活性成分多靶点、多通路、多生物过程的抗炎机制,为其进一步的抗炎机制研究指明了方向。     

基于网络药理学的山豆根调控白细胞跨内皮迁移通路改善急性咽炎的作用机制

目的 基于网络药理学、动物实验及荧光定量PCR技术阐明山豆根改善急性咽炎的分子机制。方法 利用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)数据库收集山豆根的活性成分和作用靶点。通过GeneCards、OMIM、DrugBank和Disgenet数据库获取急性咽炎相关的靶点。筛选获得两者的共同靶标后,利用STRING数据库进行构建蛋白互作网络,采用Metascape平台进行通路分析。同时应用Cytoscape软件构建“中药-疾病-成分-靶点”网络和“中药-疾病-成分-靶点-通路”网络。建立大鼠急性咽炎模型,研究山豆根水提取物对大鼠急性咽炎的影响。利用荧光定量PCR技术研究山豆根对大鼠急性咽炎模型咽部组织关键通路上的关键基因靶点的影响。结果 该实验获取山豆根活性成分21个的相关作用靶点509个,获取急性咽炎相关的靶点2 167个,山豆根与急性咽炎的共同靶点194个。KEGG通路分析筛选了344条相关信号通路,其中显示IL-17信号通路、...     

基于网络药理学分析防风-乌梅药对治疗荨麻疹的作用机制

目的 基于网络药理学分析防风-乌梅药对治疗荨麻疹的物质基础及分子机制。方法 根据文献报道,结合口服利用度≥ 30%和类药性分析≥ 0.18,在TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库筛选防风-乌梅药对活性成分及靶点,GeneCards数据库筛选荨麻疹靶点,通过靶点映射确定药对活性成分作用的荨麻疹靶点;借助Cytoscape 3.5.1软件构建活性成分-靶点网络图,STRING平台构建靶蛋白互作网络,应用DAVID数据库对靶点进行KEGG通路分析,利用Cytoscape软件中BiNGO和MCODE插件对靶基因进行GO生物过程富集和聚类分析。结果 从防风-乌梅药对中筛选得到槲皮素、山奈酚、汉黄芩素、欧前胡素、升麻素等16个活性成分,作用于IL-6、TNF、SRC、EGFR、IL-8、PTGS2等62个荨麻疹相关靶点,调控TNF信号通路、PI3K/Akt信号通路、NF-kB信号通路、低氧诱导因子1信号通路、NOD样受体信号通路等8条信号通路,参与调节炎症反应、肽-酪氨酸磷酸化、蛋白质分解代谢等生物过程。结论 充分揭示了防风-乌梅药对多成分、多靶点、多通路治疗荨麻疹的科学内涵。     

基于网络药理学的虎杖抗炎活性成分及作用机制研究

目的： 构建虎杖抗炎的"成分-靶点-通路"网络,探究虎杖可能的活性成分及其潜在作用机制。方法： 通过文献和TCMSP数据库查找虎杖化学成分,采用类药性（drug likeness,DL）以及口服生物利用度（oral bioactivity,OB）评估筛选活性成分;通过Drugbank、Pharmmapper数据库筛选虎杖活性成分潜在靶点基因,通过GeneCards和MalaCards数据库得到炎症相关基因靶点;将活性成分的潜在靶点基因与炎症相关基因进行比对,得到虎杖抗炎的潜在靶点基因;使用R语言和KOBAS3.0数据库对靶点基因功能和相关通路进行注释;采用Cytoscape3.6.1软件构建虎杖抗炎作用的"成分-靶点-通路"网络;将筛选得到的部分活性成分和关键靶点进行分子对接。结果： 从虎杖中共筛选出13个活性成分,涉及包括ELANE、PLG、ALB、MMP9等65个基因靶点,影响了Toxoplasmosis、IL-17 signaling pathway、Relaxin signaling pathway、TNF signaling pathway等96条信号通路;分子对接试验结果显示,筛选得到的两个活性成分与关键靶点的结合能力与阳性药物接近。结论： 构建的"成分-靶点-通路"网络图揭示了虎杖通过多成分、多靶点、多通路的形式发挥抗炎作用,分子对接试验间接证实了网络药理学预测结果的可靠性与准确性。研究结果为进一步阐释虎杖抗炎作用机制提供了科学依据。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨当归四逆汤治疗系统性硬化症的作用机制

目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨当归四逆汤治疗系统性硬化症的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索当归四逆汤中的活性成分并以Swiss Target Prediction数据库预测各活性成分的靶点，采用GeneCards数据库收集系统性硬化症疾病靶点，取其中共同靶点作为潜在的作用靶点并导入String数据库建立蛋白相互作用（PPI）网络，以Cytoscape软件进行网络拓扑分析。将PPI靶点导入DAVID数据库进行基因本体（GO）功能和京都基因组百科全书（KEGG）通路富集分析并以OmicShare平台将结果可视化。构建“通路–靶点”网络并筛选其中关键靶点，并采用CB-Dock平台将作用靶点与活性成分进行分子对接以筛选潜在药效成分。结果 收集得到141个当归四逆汤活性成分及1 047个相关靶点，系统性硬化症疾病靶点1 568个。筛选出潜在作用靶点266个，其中关键靶点6个，分别为蛋白激酶B1（Akt1）、血管内皮生长因子受体2（KDR）、V-Ha-Ras肉瘤病毒癌基因同源物（HRAS）、促分裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、促分裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、血管内皮生长因子A（VEGFA）。主要涉及MAPK信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/Akt信号通路、Rap1信号通路、黏着斑、脂质和动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化等通路的调节。分子对接结果显示，水鬼蕉宾碱、芍药苷、酸枣仁皂苷A等活性成分为治疗中的潜在药效成分。结论 当归四逆汤以多组分、多靶点、多通路干预系统性硬化症，其机制涉及免疫、血管损伤和细胞外基质合成等的调节。     

龙眼肉化学成分库构建及其治疗贫血机制的网络药理学研究

目的 构建龙眼肉化学成分库，联合网络药理学初步探讨龙眼肉治疗贫血的作用机制。方法 归纳整理近年来关于龙眼肉药效化学成分的文献并构建成分库，通过SwissTargetPrediction预测龙眼肉中活性成分，利用OMIM、DrugBank、GeneCards等数据库收集贫血病症的靶点基因，筛选成分与疾病之间的交集靶点，进行蛋白互作，建立“龙眼肉-活性成分-靶点-疾病”网络，GO富集以及KEGG分析。结果 共收集化合物256种，包括12种糖类、27种多酚类、147种挥发性成分、2种甾醇类、12种有机酸、13种脂类、11种核苷类、29种氨基酸类、3种其他类有机成分以及多种微量元素。筛选后获得活性成分32个；交集靶点24个，TOP1、TERT、MPO、PARP1等可能为关键靶点；生物功能87个，涉及细胞因子介导的信号通路、基因表达的正向调控、细胞因子活性等；通路15个，癌症通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路、碱基切除修复系统等可能为关键通路。结论 本研究建立了龙眼肉化学成分库，基于网络药理学初步探讨龙眼肉治疗贫血的潜在活性成分、靶点信息和作用机制，为龙眼肉的药理药效研究与资源开发提供有价值的参考...     

基于网络药理学分析麻黄-苦杏仁、辛夷-苍耳子治疗儿童过敏性鼻炎哮喘综合征的作用机制

目的 基于网络药理学分析麻黄-苦杏仁、辛夷-苍耳子药对治疗儿童过敏性鼻炎哮喘综合征（CARAS）的多成分、多靶点、多途径作用机制。方法 结合文献报道,利用TCMSP数据库筛选出麻黄、苦杏仁、辛夷、苍耳子的化学成分和潜在靶标;利用GeneCards、OMIM数据库获取CARAS的疾病靶点;通过R软件获取药物-疾病交集靶基因;利用String数据库构建蛋白互作（PPI）网络图并筛选出核心靶点,利用R语言对核心靶基因进行GO富集分析和KEGG通路分析;利用Sytoscape 3.7.2软件可视化化合物-交集靶点网络、关键通路-关键靶点网络。结果 从麻黄-苦杏仁、辛夷-苍耳子药对中筛选得到槲皮素、山萘酚、木犀草素等52个活性成分,作用于MAPK1、MAPK3、AKT1、JUN等24个儿童过敏性鼻炎哮喘综合征核心靶点,参与调节DNA结合转录因子活性、活性氧、脂多糖等生物过程,调控AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17等信号通路。结论 揭示了麻黄-苦杏仁、辛夷-苍耳子药对多成分、多靶点、多通路治疗CARAS的作用机制。     

基于网络药理学的“苍术-玄参”药对抗2型糖尿病作用机制研究

目的采用网络药理学方法研究苍术-玄参药对抗2型糖尿病的作用机制。方法通过检索中药系统药理数据分析平台(TCMSP),获得苍术、玄参主要活性成分和相关作用靶点,并借助Cytoscape 3.6.1软件构建苍术-玄参药对活性成分-靶点网络图。通过TTD数据库中检索抗2型糖尿病靶点,在STRING数据库进行蛋白质间相互作用分析,构建抗2型糖尿病靶点PPI网络图,利用Cytoscape 3.6.1软件中的Merge功能与活性成分-靶点融合,获得苍术-玄参药对抗2型糖尿病作用靶点。运用DAVID数据库对苍术-玄参药对抗2型糖尿病作用靶点进行KEGG通路富集,进一步研究苍术-玄参药对抗2型糖尿病作用机制。结果获得具有类药性、口服吸收良好的成分27个,苍术-玄参药对抗2型糖尿病作用靶点10个,包括PTGS2、DPP4、PTGS1、NR3C2等。KEGG分析得到与苍术-玄参药对抗2型糖尿病作用有关的通路6条,关键通路包括脂肪细胞脂解调控通路、PPAR信号通路、胰岛素抵抗、AMPK信号通路等。结论苍术-玄参中的活性物质主要通过作用于PTGS2、DPP4、PTGS1、NR3C2等靶点协同治疗2型糖尿病,为深入剖析苍术-玄参药对复杂体系,阐释其治疗2型糖尿病的潜在复杂作用机制提供了新方向。     

黄药子致肝脏损伤的网络毒理学分析及验证

目的 采用网络毒理学方法对黄药子导致肝脏损伤的毒理作用及机制进行预测，并通过动物试验对预测结果进行验证。方法 通过TCMSP结合TOXNET筛选黄药子致肝损伤的毒性成分，利用Pharm Mapper数据库预测黄药子毒性成分作用靶点，应用Gene Cards和CTD筛选肝脏损伤靶点，采用Cytoscape软件构建黄药子“毒性成分-靶点”及“毒性成分-肝脏损伤靶点”网络，利用STRING数据库构建蛋白互作网络，分析黄药子致肝脏损伤的关键靶点。通过DAVID平台对黄药子致肝损伤靶点进行通路富集分析。通过动物试验对黄药子致肝脏损伤的机制进行验证。结果 通过TCMSP获得黄药子63个成分，TOXNET网站筛选出黄药子致肝脏损伤的8个毒性成分，黄药子致肝损伤的关键靶点为Akt1、INS、VEGFA；其机制涉及PI3K/Akt、HIF-1、Ras以及Rap1等信号通路。动物试验结果表明，黄药子水煎液可使血清ALT、AST和ALP水平升高，肝脏组织中MDA含量升高及SOD和GSH活性降低，黄药子可降低肝脏p-Akt与p-PI3K蛋白表达。结论 黄药子导致肝损伤是通过多成分、多靶点作用于多种信号通路的结果，与其下调肝脏组织中PI3K/Akt信号通路有关。     

大黄附子汤治疗慢性肾衰竭的网络药理学研究及初证

目的:本研究采用网络药理学的方法,探讨大黄附子汤治疗慢性肾衰竭的药效物质基础、具体作用靶点及相关通路,构建"成分-靶点-通路"网络阐述大黄附子汤治疗慢性肾衰竭的作用机制。方法:通过文献和数据库查找大黄附子汤化学成分,采用类药性、药物动力学特征及适当的补偿机制对成分进行评估筛选;再依据反向药效团匹配预测大黄附子汤活性成分靶点,将筛选得到的活性成分和潜在靶点进行反向分子对接;通过DAVID数据库对靶点基因及相关通路注释分析,使用Cytoscape软件构建大黄附子汤抗CRF作用的"成分-靶点-通路"网络;最后通过ELISA的方法初步验证本研究结果的科学性和可靠性。结果:从大黄附子汤中共筛选出45个潜在活性化合物,预测存在17个潜在作用靶点。通过一系列的评估分析,最终筛选得到大黄附子汤治疗慢性肾衰竭的16个有效成分,6个作用靶点以及最具研究价值的5个通路;验证结果表明,所筛选成分中大黄素-8-葡萄糖苷、大黄酚-8-O-葡萄糖苷可与EGFR结合,初步证明本研究的意义。结论:大黄附子汤复方的配伍科学严谨,本研究为其治疗慢性肾衰竭提供现代研究支持,为其后续的开发提供科研基础,为中药复方的网络药理学的研究提供新参考。     

基于网络药理学探讨中药逍遥丸治疗失眠的药理机制（英文）

本文旨在基于网络药理学探讨逍遥丸(XYP)治疗失眠症的作用机制。通过TCMSP数据库对XYP的活性成分和靶点进行预测筛选,GeneCards数据库检索失眠的潜在靶点,分析了活性成分靶点与失眠相关靶点之间的重叠基因。我们利用Cytoscape软件和STRING构建了XYP的活性组分-靶点、靶点通路网络,在DAVID中进行GO和KEGG富集分析。从XYP中筛选出161个活性成分,并筛选出与活性成分相关的76个潜在的靶点,活性成分与失眠的重叠基因36个。网络药理学分析显示XYP组方中柴胡、当归和甘草可能对失眠有重要作用,机制可能涉及10个核心靶点(TNF、IL1B、CASP3、TP53、HSP90AA1、PPARG、SLC6A4、ESR1、GSK3B、AChE);主要涉及7个GO富集项和6个相关通路,包括神经活性配体受体相互作用通路、肿瘤通路、钙信号通路等。     

基于网络药理学厚朴姜炙的科学内涵研究

目的 通过网络药理学法构建厚朴姜炙前后的差异成分-靶点-通路网络,探讨厚朴姜炙前后药理作用差异的分子机制,揭示厚朴姜炙的科学内涵。方法 查阅文献筛选出厚朴姜炙前后的差异成分,利用Swiss Target Prediction预测差异成分的潜在靶点。利用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络,然后通过DAVID数据库进行GO注释和KEGG通路富集分析,最后运用Cytoscape 3.8.2软件构建差异成分-靶点-通路网络。结果 通过查阅文献共筛选出8个差异成分并预测得到85个靶点。DAVID数据库筛选出排名前10位的KEGG通路,通过Cytoscape 3.8.2软件得到差异成分-靶点-通路网络。结论 厚朴姜炙后可通过紫丁香苷、厚朴酚、和厚朴酚、木兰花碱、木兰箭毒碱及β-桉叶醇等成分含量的变化来改变厚朴的药效作用。姜炙后,厚朴主要是通过血清素突触、钙信号通路、前列腺癌和膀胱癌等信号通路发挥镇痛、抗胃溃疡、抗肿瘤的作用。     

基于网络药理学的苗药土知母治疗肝硬化的药理机制研究

目的 构建苗药土知母活性成分-作用靶点-肝硬化疾病-通路网络图，对靶点涉及的功能和通路进行分析，探讨苗药土知母治疗肝硬化的作用机制。方法 通过文献挖掘、TCMSP、TCM@Taiwan和TCMID数据库检索苗药土知母主要活性成分，利用Genecards、OMIM、TTD和MalaCards数据库预测和筛选肝硬化的作用靶点，两者取交集得到苗药土知母治疗肝硬化的靶点。采用Cytoscape3.7.1软件构建苗药土知母活性成分-靶点-肝硬化-通路网络互作图。采用ClueGo数据库对靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果 获得苗药土知母23个活性成分，涉及383个靶点。肝硬化涉及3 410个基因，两者交集基因有103个。苗药土知母可能通过介导肝硬化中肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体激活的凋亡信号通路的正调控、铁对翻译起始的正调控和丝裂原活化蛋白激酶K活性失活的靶点，及其参与的肝硬化中的缺氧诱导因子1信号通路、催乳素信号通路和叉形头转录因子O信号通路等25条通路治疗肝硬化(P≤0.01)。结论 网络药理学可用于初步预测苗药土知母治疗肝硬化的潜在靶点，这为进一步的药理机制研究提供科学依据。