STR图谱用于生物制品生产用人源细胞鉴别的研究

目的 研究短串联重复序列(STR)图谱鉴别方法在生物制品生产用人源细胞质量控制中的应用.方法 采用PCR-毛细管电泳分析方法,分别建立检测9个和16个人STR位点的方法鉴别人源细胞,并对来自不同生物制品生产单位、不同传代水平的病毒性疫苗生产用人二倍体细胞株及基因治疗制品生产用的293细胞进行STR图谱的检测和比较.结果 建立人源细胞株的STR图谱分析方法.13个单位提供的病毒疫苗生产用21株人二倍体细胞中,除1株细胞并非MRC-5细胞外,其他细胞均可认定为本细胞,且未发现交叉污染现象.而8个单位提供的12株基因治疗用293细胞的STR图谱则存在明显差异,提示该类细胞可能存在来源、基因修饰改造背景不清及传代过程中遗传特性不稳定的因素.结论 STR图谱分析灵敏度高、特异性强,可用于生产用人源细胞株/系间的鉴别.     

细胞培养实验中细胞系鉴定及质量控制重要性探讨

目的 以脑胶质瘤细胞系(U87)为例,探讨对在细胞培养实验中所使用的细胞系进行鉴定和质量控制的重要性.方法 对三株不同来源的U87细胞系进行STR分型检测,并结合显微镜下形态学特征,判断所测细胞系是否为真正的U87细胞系及是否发生交叉污染.结果 通过细胞STR分型结果与ATCC、DSMZ中STR数据库对比,得出U87-1细胞分型与ATCC中U-87 MG Glioblastoma-Astrocytoma Humanl00％匹配;U87-2细胞分型与DSMZ数据库中U-87MG100％匹配;U87-3未得到扩增产物,不能进行分型,原因是该细胞株为非人源细胞.结论 细胞培养实验中所使用细胞系的鉴定对于后续研究具有重要意义,可使用STR分型检测技术在细胞系培养过程中进行质量控制,对其进行准确鉴定,并排查是否存在细胞交叉污染.     

国内建立的人肿瘤细胞系的身份认证问题及对策

目的 为国内建立的人肿瘤细胞系进行身份认证，确认这些细胞系使用的可靠性。 方法 收集、整理国内实验室建立的人肿瘤来源细胞系，提取细胞的基因组DNA，PCR扩增其中的多个短串联重复序列（STRs）位点后进行毛细管电泳，分析获得细胞的STR图谱作为细胞系的DNA指纹，然后与原始组织或国际数据库中已有细胞的STR谱进行比对，通过匹配度的高低判断该细胞是否被其他细胞交叉污染。对怀疑HeLa细胞污染的肿瘤细胞，检测其基因组中是否有人乳头瘤病毒18型（HPV-18）病毒插入片段。对怀疑T细胞白血病细胞污染的，则检测T细胞的各种特性（表面标志），根据表面标志表达情况判断是否为错误细胞。 结果 本研究共收集了37种国内建立的肿瘤细胞系46个样品。本中心建立的6株细胞系均STR正确。其他单位建立的细胞系中有8株系正确，有23（62.2%）株系认定为错误细胞，人宫颈癌细胞HeLa是主要污染源；另外发现有些国内自建的细胞系被人结直肠癌细胞HCT-8、宫颈鳞癌细胞SiHa、T细胞白血病细胞CCRF-CEM及大鼠细胞污染。 结论 国内建立的肿瘤细胞很高比例地发生了细胞间的交叉污染，科研人员在实验前一定要首先进行细胞身份认定，或者从国家实验细胞资源共享服务平台选择细胞。另外，建立细胞系时保留原始组织用于后续细胞系的身份认证。     

CCC-HPF-2细胞基因组DNA可作为STR分型标准物质

目的 检测细胞培养传代过程中的基因稳定性,筛选符合中国人遗传特性的DNA标准物质,建立DNA标准细胞库.方法 通过显微镜下观察、免疫组织化学、核型分析检测细胞传代过程中形态、分子表达及核型是否稳定；应用PCR方法检测细胞的外源微生物及种属来源；STR检测验证细胞在传代过程中STR表达谱的平衡性及稳定性.结果 CCC-H...     

用短串联重复序列诊断唐氏综合征

目的　建立一种准确、快速、简便的唐氏综合征 (Down's syndrome,DS)基因诊断技术。方法选择 10个位于 2 1号染色体上唐氏综合征关键区域内 (2 1q2 2 .1～ 2 1q2 2 .2 )或附近的短串联重复序列 (shrottandem repeats,STR)位点 ,应用 PCR与聚丙烯酰胺凝胶电泳或荧光 PCR(ABI 310 )进行 STR分型 ,根据STR位点出现 3条带图谱诊断 DS,荧光半定量的 2∶ 1带型可辅助诊断 ,并用细胞遗传学染色体核型分析进行证实。结果　在 2 0例可疑患者外周血中有 5例 DS阳性结果 ,其中 1～ 6个 STR位点呈 3条带图谱 ,其余为强度 2∶ 1的两条带型。 2 6例 DS的高危孕妇羊水细胞均未检出 3条带图谱和 2∶ 1图谱。基因诊断结果与细胞染色体核型分析一致。结论　联合进行 2 1号染色体上 10个 STR位点的基因分型 ,可准确、快速、简便地作出 DS的基因诊断 ,促进 DS产前诊断的开展 ,降低发病率。     

携带usp基因的尿道致病性大肠杆菌强毒株诱导HeLa细胞快速早期凋亡的研究

目的 了解致病基因在尿液分离大肠杆菌中的分布情况,分析由携带usp致病基因的尿道致病性大肠杆菌介导的HeLa细胞快速凋亡.方法 采用PCR检测6种尿道致病性大肠杆菌相关致病基因在28株尿液分离的大肠杆菌的分布;通过黏附试验和锥虫蓝染色对尿液分离的大肠杆菌进行初步致病表型筛选;采用Annexin V/PI法进一步检测大肠杆菌引起HeLa细胞早期凋亡的能力;电子显微镜观察细胞凋亡特征.结果 在28株尿液分离的大肠杆菌中,检测到usp基因阳性6株.通过致病表型筛选试验筛选到2株强致病性大肠杆菌(6N和27N),其中6N菌株携带usp基因,而27N除了没有检测到usp基因,其他致病基因与6N相同.它们可以在4 h破坏大量HeLa细胞,使HeLa死亡;流式细胞仪检测凋亡结果 显示,6N菌株在1.5 h可以诱导20.75%的HeLa细胞发生早期凋亡,而27N只有1.55%的HeLa细胞发生早期凋亡.电镜结果 从形态学证实6N菌株可以快速引起HeLa细胞发生早期凋亡.结论 携带usp基因的尿道致病性大肠杆菌可以诱导HeLa发生快速早期凋亡.     

应用微卫星DNA基因分型技术进行双生子卵型鉴定

目的 用微卫星DNA基因扫描和分型技术建立双生子卵型鉴定法。方法 选取69对同性别双生子、6对异性别双生子和17对同胞对,抽提基因组DNA,单盲设计,随机编号后,采用9对荧光标记的,在中国人群中具有高度杂合度的短串联重复序列（short tandem repeat,STR)引物,进行基因扫描和分型分析。根据这9个STR基因型的一致性来鉴别卵型。结果 9个STR基因型完全一致的63对受检者全部为同性别双生子,6对异性别双生子和17对同胞对的STR基因型均不完全一致,另有6对同性别双生子的STR基因型也不完全一致,经计算采用6个或5个STR位点判定同性别同卵双生的可信性分别大于99.6%和99%,采用全部9个位点判定同性别同卵双生的可信性大于99.95%。结论 STR基因扫描和分型技术为在基因组水平上直接判别双生子卵型,提供了一种准确,可靠的鉴定方法,它还有快速,简便等优点。     

表达HIV Vpr细胞株的建立及其促细胞凋亡作用的研究

目的 建立稳定表达人免疫缺陷病毒(HIV)Vpr蛋白的细胞株,观察Vpr蛋白促进感染细胞凋亡的特性,以及Vpr变异后对其致凋亡作用的影响.方法 以携带野生株HIV Vpr基因和突变株HIV vpr-FS基因的质粒分别转染HeLa细胞,建立稳定表达HIV Vpr蛋白的细胞株,以流式细胞仪和细胞内DNA片段分析法检测细胞凋亡效果,观察Vpr蛋白促细胞凋亡的特性,以及两者致凋亡作用的区别.结果 重组质粒pcDNA3.1-vpr和pcDNA3.1-vpr-FS经酶切后均可获得342bp产物,DNA测序结果与目的 基因已知序列完全一致;上述质粒转染的HeLa细胞,RT-PCR检测到目的 基因vpr或vpr-FS的表达,Western blot检测到明显Vpr或Vpr-FS蛋白的表达.流式细胞仪和细胞内DNA片段分析法分别检测细胞凋亡,显示野生株HeLa pcDNA3.1-vpr组的凋亡率明显高于对照组,而变异株HeLa pcDNA3.1-vpr-FS的凋亡率与对照组无明显差别.结论 成功建立了表达HIV Vpr和HIVVpr-FS蛋白的感染细胞株.实验显示HIV Vpr蛋白能促进感染细胞的凋亡,而Vpr蛋白的变异可能使其促进细胞凋亡作用减弱.实验结果为下一步研究提供了基础资料.     

CCC-HPF-2细胞基因组DNA可作为STR分型标准物质

目的检测细胞培养传代过程中的基因稳定性,筛选符合中国人遗传特性的DNA标准物质,建立DNA标准细胞库。方法通过显微镜下观察、免疫组织化学、核型分析检测细胞传代过程中形态、分子表达及核型是否稳定;应用PCR方法检测细胞的外源微生物及种属来源;STR检测验证细胞在传代过程中STR表达谱的平衡性及稳定性。结果 CCC-HPF-2细胞呈成纤维细胞样;波形蛋白表达阳性,CK阴性;无外源微生物污染;细胞来源于人;所有15个STR基因座都得到扩增,呈现较好的扩增平衡性,各代细胞STR表达谱一致,表现了高度稳定性。结论 CCC-HPF-2细胞来源于人,30代内的该细胞DNA可作为STR分型标准物质。     

Hsa-miR-218靶向调控LASP1对宫颈癌HeLa细胞生长的影响

目的:探讨人微小RNA-218(Homo sapiens microRNA-218,hsa-miR-218)对宫颈癌HeLa细胞生长的影响及分子机制。方法:构建hsa-miR-218的重组慢病毒表达载体pmiR-218,并将pmiR-218感染至HeLa细胞,台盼蓝拒染法检测细胞数量的变化,WST-8法检测细胞活力,构建萤光素酶报告基因载体验证miR-218与LIM和SH3蛋白1(LASP1)的相互结合作用,real-time PCR检测LASP1的mRNA相对表达水平,Western blot检测LASP1蛋白的表达水平。结果:经DNA测序证实与设计完全一致,测序结果显示成功构建了重组慢病毒表达载体pmiR-218。pmiR-218转染HeLa细胞72 h后HeLa细胞存活数量为176±9,对HeLa细胞活力的抑制率具有时间效应关系,较空白对照组比较,差异显著(P0.05);萤光素酶活性结果显示,克隆LASP1-3’UTR的质粒与miR-218 mimics共转染293T细胞,引起萤光素酶活性的减低;real-time PCR结果显示转染pmiR-218后,miR-218表达水平增加;过表达miR-128能下调LASP1 mRNA及蛋白的相对表达水平,与空白对照组及阴性对照组比较,差异显著(P0.01)。结论:pmiR-218有效抑制HeLa细胞的生长,并具有时间-效应关系,其机制可能是miR-218通过靶向结合LASP1的3’UTR,从而下调其在HeLa细胞的表达有关。     

Examination of HeLa cell contamination of human cell lines derived from primary hepatomas using glucose-6-phosphate dehydrogenase and lactate dehydrogenase isozymes

Isozyme patterns of glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) and lactate dehydrogenase (LDH) in human cell lines derived from primary hepatomas were compared with those in HeLa cells. Some cell lines derived from primary hepatomas having type B G6PD showed one or two isozymes of LDH. On the other hand, HeLa cells having type A G6PD showed four LDH isozymes. These findings suggest that not only G6PD, but also LDH may be useful for the detection of HeLa cell contamination of a culture in some cases.     

Paternity pseudo-exclusion caused by tetragametic chimerism in a gestational surrogacy case

Chimerism is a condition when an organism is composed of two or more populations of genetically distinct cells. Chimerism often produces curious results of medical and genetic investigations and could be a major cause of false negative conclusions in parentage testing. Here we describe a paternity pseudo-exclusion due to tetragametic chimerism in a gestational surrogacy case originated in a fertility clinic. Initial analysis using a buccal swab from the child and a peripheral blood sample from the father showed paternity exclusion at 6 STR loci. To find out the reason for observed paternal discrepancy father's semen sample used for IVF and samples from other tissues were genotyped. Buccal swabs, semen, hair follicles, nail clippings and cerumen showed identical mixed autosomal STR profiles originated from two genetically different cell lines and for all the 24 informative loci contain paternal obligate alleles. Results of Y-STR profiling of all paternal sample types showed a DNA profile originated from a single man. The mixed profiles obtained for different tissue types suggest that two genetically different cell lines contributed to formation of both the endoderm and the ectoderm of the father. The mesoderm seems to be monoclonal having originated from a genetically homogenous cell line as evidenced by the STR profile of peripheral blood. Such allelic pattern for various tissues suggests that the clonal origin happened at the very early stage of embryonic development. Approaches to minimise the rate of false exclusions in DNA parentage tests due to chimerism are discussed.     

基于测序的人类白细胞抗原分型和PCR短串联重复序列技术在人胚胎干细胞鉴定中的应用

目的 探讨基于测序的人类白细胞抗原分型(HLA-sequencing-based typing,HLA-SBT)和PCR短串联重复序列(short tandem repeat,STR)技术在人胚胎干细胞(human embryonic stem cell,hESC)应用前检测中的运用,建立人胚胎干细胞系的基因型档案.方法 人胚胎干细胞系SYSU-I、SYSU-3,分别培养到20代、40代,应用PCR寡核苷酸特异测序探针(sequence specific olignucleotide probe,SSO)技术检测两株细胞系的HLA-A、-B、-DR位点的低分辨分型,再利用HLA-SBT技术检测两株细胞系的HLA-A、-B、-DR位点的高分辨分型.应用PCR-STR技术检测两株细胞系的基因遗传标记.结果 获得两株hESC细胞系的HLA高分辨分型和STR基因型.结论 可以运用HLA-SBT和PCR-STR技术建立人胚胎干细胞应用前的基因型档案.     

Tissue Typing of Cells in Culture. III. HLA Antigens of Established Human Cell Lines. Attempts at Typing by the Mixed Hemadsorption Technique

Thirty established cell lines from solid human tumors were typed by the mixed hemadsorption technique with respect to the HLA-A and HLA-B and partly also the HLA-C series. All cultures exhibited unique antigenic patterns. The discriminatory potential was further increased very much taking into consideration one as yet undefined antigen series tentatively named Ek-1 to Ek-11. Sixteen cell lines not designated as HeLa cells but on various non-immunological indications suspected to be HeLa cell contaminants, all gave, with our present test, the same antigenic composition as HeLa cells or clones thereof. The mixed hemadsorption reaction is a highly sensitive and convenient method for immunological typing of cells in monolayer cultures. Some important implications of this are discussed.