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血清SELDI蛋白质指纹图谱在乳腺癌腋淋巴结转移中的应用研究 总被引:2,自引:2,他引:2
目的:应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型,为预测腋淋巴结(axillary lymph nodes,ALN)转移等提供可能的简便易行的方法。方法:应用SELDI—TOF-MS作为蛋白质组学研究平台,采用CM10芯片,对乳腺癌的血清进行了检测,探讨了乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱与是否发生ALN转移的关系,并结合生物信息学方法建立了相应的检测模型。结果:通过对ALN有(无)转移的乳腺癌患者血清蛋白指纹图谱数据的比较,找到了11个差异蛋白质峰(P〈0.05),M/Z为M2164.16,M3269.90和M3272.31的3个蛋白质峰被选择用于构建分类决策树模型,该模型的交叉验证(测试组)总准确率为81.8%,ALN有转移的乳腺癌患者检出率为83.3%,ALN无转移的检出率为80%。结论:构建的分类决策树模型能达到区分ALN是否有转移的最佳效果,SELDI技术在确定乳腺癌患者是否发生腋淋巴结转移方面有一定的意义。 相似文献
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近年来出现的SELDI蛋白芯片技术是一种自动快捷 ,灵敏特异 ,高通量的蛋白组学研究方法。在临床诊断、药物研发及食品卫生等方面有良好的应用前景。综述了该技术的原理、分类及应用范围 ,并对其优势、劣势和前景展望进行了分析 相似文献
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[目的]利用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术和生物信息学方法筛选胰腺癌的血清肿瘤标志物。[方法]用弱阳离子交换芯片(CM10)结合并用SELDI-TOF-MS检测54例胰腺癌样本(22例早期胰腺癌,32例晚期胰腺癌)。用支持向量机(SVM)方法建立辨别模型。[结果]利用筛选出的5个蛋白峰(m/z6667.68、8572.38、2958.76、6441.59、5913.36Da)用于建立区分早、晚期胰腺癌的SVM模型,模型的灵敏度和特异性分别为90.9%和78.1%。[结论]SELDI-TOF-MS技术结合生物信息学方法可找到辨别早期胰腺癌和晚期胰腺癌的标志物,并建立区分模型。 相似文献
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摘 要:[目的] 探讨蛋白质检测技术在乳腺导管内癌患者诊断中的应用价值。[方法] 用SELDI-TOF-MS技术及配套蛋白质芯片检测40例乳腺导管内癌患者及40名健康者的血清蛋白质指纹图谱,建立诊断模型。[结果] 3个蛋白质峰(质/荷比分别为4487.9、6468.1和7575.1)组合构建的诊断模型可鉴别乳腺导管内癌患者和健康者,灵敏度为92.50%(37/40),特异性为90.00%(36/40),阳性预测值为90.24%(37/41),阴性预测值为92.30%(36/39),准确率为91.25%(73/80)。[结论] SELDI-TOF-MS在乳腺导管内乳头状癌诊断尤其是早期诊断以及候选标志物筛选等方面具有一定价值,值得进一步深入研究。 相似文献
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SELDI蛋白芯片技术筛选卵巢癌血清肿瘤标志物的研究 总被引:5,自引:0,他引:5
目的寻找卵巢癌患者血清中新的肿瘤标志物。方法采用表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,选用WXC2蛋白质芯片对53例卵巢癌及50例对照血清标本进行检测以筛选卵巢癌患者血清中差异表达蛋白质。结果在分子量0~50 000 D范围内,检测出275个差异蛋白峰。卵巢癌差异表达明显的蛋白峰6个(P<0.05),其中低表达的5个,相对分子量分别为6 432、6 879、8 554、8 682、13 726 D,高表达的1个,相对分子质量为11 450 D。早期与晚期卵巢癌比较,发现差异表达明显的蛋白峰2个,相对分子量分别为6 190、6 448 D,均在早期卵巢癌中高表达。将发现的差异蛋白峰在Swiss蛋白数据库中搜索,发现11 450 D蛋白峰与S100 Z protein相符。S100 Z protein属于S100蛋白家族,可能通过与S100 P相互作用,促进卵巢癌的发生。其它的差异峰在数据库中没有与之相匹配的蛋白,提示可能为新的蛋白质。结论SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术是1种快速、简单易行、用量少和高通量分析方法,能够直接检测出卵巢癌患者血清中相对特异的肿瘤标志物,其对于卵巢癌的早期诊断具有一定的临床意义。 相似文献
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应用SELDI蛋白质芯片技术筛选肺腺癌血清标志物的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 通过SELDI蛋白质芯片技术筛选肺腺癌特异血清标志物。方法 采用表面增强激光解析离子化一飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS),选用弱阳离子加疏水膜芯片对15例肺腺癌患者,30例健康人血清进行检测,筛选在肺腺癌患者血清中差异表达的蛋白质。结果 在质荷比0—20000范围内,共检测到180个蛋白峰,建立了由8个差异表达蛋白质组成的肺腺癌诊断模型。这8个蛋白质中有6个在肺腺癌中表达上调,2个表达下调。软件分析结果显示在预测组中诊断肺腺癌的敏感性为93.33%(14/15)、特异性为100.00%(30/30);对检测组进行双盲检测,敏感性为73.33%(11/15)、特异性为86.67%(26/30)。结论 由8个差异表达蛋白及其特定组合构成的诊断模型可以区分肺腺癌和健康人。SELDI蛋白质芯片技术能直接筛选出肺腺癌患者血清中相对特异的潜在标志物,具有较好的临床应用价值。 相似文献
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SELDI蛋白质芯片技术及其在肿瘤学中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
随着人类基因组工作草图公布,标志着基因框架已经绘就,生命科学的重点也由基因组学转移到蛋白质组学的研究上来[1].数万个基因负载着大量生命信息,而这些核苷酸序列并不能完全决定基因的功能.蛋白质是基因指导合成的最终产物,它可以直接反映基因给予的信息,后基因组时代便接踵而来.以蛋白质作为研究对象,对整体细胞及变异细胞功能进行分析,从而可以寻找疾病的特异性标志物;并可以通过寻找终末点的方法来对化学制剂和药物毒副作用进行评估[2].要完成这些繁杂的工作,需要高效、快速、准确的技术支持,SELDI蛋白质芯片技术便应运而生,为研究蛋白质的结构、属性、功能提供了可靠的技术平台.我们就SELDI蛋白质芯片技术及其在医学领域的研究状况做一综述. 相似文献
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表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术筛查乳腺癌血清特异性蛋白质及其临床意义 总被引:7,自引:2,他引:7
目的 探讨表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛查乳腺癌血清特异性蛋白质的临床意义。方法 应用SELDI-TOF-MS技术检测38例乳腺癌、33例乳腺良性疾病和43例健康对照者的血清蛋白质指纹图谱,并联合应用BioMarker Wizard 3.01及BioMarker Pattem Software5.01软件分析处理数据,筛选肿瘤标志物并建立诊断模型。结果 质荷比分别为M2077_07、M1827_38、M2650_51和M2060_62的4个蛋白质峰组合构建的诊断模型Ⅰ,鉴别乳腺癌和非乳腺癌的交叉验证敏感性为73.7%(28/38),特异性为73.7%(56/76)。质荷比分别为M2251_62、M3405_56、M3428_16、M4666_98和M16239_8的5个蛋白质峰组合构建的诊断模型Ⅱ,鉴别Ⅰ期乳腺癌和乳腺良性疾病的交叉验证敏感性为84.8%(28/33),特异性为55.6%(5/9)。质荷比分别为M1701_48、M3116_17、M1676_88、M5890_33和M2921_02的5个蛋白质峰组合的诊断模型Ⅲ,鉴别Ⅰ期与Ⅱ~Ⅳ期乳腺癌的交叉验证敏感性为88.9%(8/9),特异性为86.2%(25/29)。结论 SELDI-TOF-MS技术在乳腺癌的筛查、早期诊断及临床分期判定等方面具有一定价值,值得进一步深入研究。 相似文献
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背景与目的:表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术有助于筛选肾细胞癌相关的分子变化.本研究探讨人肾细胞癌患者血清和正常人血清之间蛋白质表达的差异,筛选特异性生物标志物.方法:采用SELDI-TOF-MS技术,选用WCX2蛋白质芯片对28例肾透明细胞癌及28例正常对照组血清标本进行检测以筛选肾癌患者血清中差异表达蛋白质.结果:在分子量1.5×103~30×103(1.5~30 kD)范围内,检测出170个差异蛋白峰.肾透明细胞癌差异表达明显的蛋白峰7个(P<0.01),其中低表达的3个,相对分子量分别为4.098×103、5.917×103、6.643X 103,高表达的4个,相对分子质量为5.572×103、6.344×103、6.529×103、8.518×103.结论:人肾肿瘤血清中特异性蛋白质的发现,对肿瘤临床特异性生物标志物的检测及进一步研究肿瘤发生机制等具有重要意义. 相似文献
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SELDI-TOF-MS筛查乳腺癌患者血清特异性蛋白的探讨 总被引:3,自引:0,他引:3
目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白.方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量.结果:三组样本质荷比在2000~30000 Da间3939.314Da与3960.478Da的2个蛋白峰有显著差异.结论:SELDI-TOF-MS技术对乳腺癌早期诊断和特异性肿瘤标记物的筛选等方面具有一定价值,值得推广. 相似文献
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目的探讨血清Cyfra21-1和SELDI技术联合应用在肺鳞癌患者中的诊断意义。方法应用电化学发光技术对59例病理确诊肺鳞癌患者和60例健康对照者血清进行Cyfra21-1检测, 同时应用SELDI-TOF-MS和CM10芯片检测该血清,分析两种手段的联合诊断价值。结果电化学发光法单项检测Cyfra21-1的敏感度为77.966%、特异性为96.667%。应用SELDI技术以及肺鳞癌诊断模型进行分析,敏感度为83.051%、特异性为65.385%。而联合检测的敏感度为 94.915%、特异性为95.000%。结论与单用电化学发光法检测Cyfra21-1相比,联合SELDI技术检测更能提高肺鳞癌诊断的敏感度。联合检测的特异性也比单独使用SELDI技术有明显提高。 相似文献
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目的 筛选与大肠癌临床分期相关蛋白,为大肠癌分子分期和预后的预测提供依据.方法 将不同临床分期大肠癌组织蛋白进行二维凝胶电泳,选择部分差异表达蛋白进行MALDI-TOF质谱分析和生物信息学分析以鉴定差异表达蛋白;应用免疫组织化学S-P方法验证筛选结果.结果 建立了不同临床分期大肠癌组织的二维凝胶电泳图谱,其中Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期大肠癌组织平均蛋白质点数分别为970.14±41.01、980.21±32.42、1010.23±43.10、1240.57±34.20;以Ⅰ期大肠癌为参照,Ⅱ期大肠癌差异表达蛋白有52.42±12.01,Ⅲ期大肠癌差异表达蛋白42.54±11.20,Ⅳ期大肠癌差异表达蛋白72.00±15.25.通过进行质谱分析和生物信息学查询,鉴定了显著差异表达的19个蛋白点,其中Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期均上调的有3种蛋白,而仅在Ⅳ期中上调的蛋白有1种.AnnexinⅡ和肝型脂肪酸结合蛋白表达的免疫组化检测结果与蛋白质筛选结果基本一致.结论 不同临床分期的大肠癌中存在着差异表达蛋白,这些蛋白可能作为大肠癌分子分期和预后的标志物. 相似文献
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本文测定了32例喉癌患者围手术期血清可溶性白细胞介素2受体(sIL-2R)的浓度。结果表明,喉癌组较对照组明显什高(P<0.01),在喉癌中,声门上型及混合型较声门型为高,临床ⅢⅣ刊期病变较ⅠⅡ期病变显著增高(P<0.05)。手术后1日较术前明显增高,至10日则降至术前水平。部分病人术后10日血清sIL-2R持续增高,与术后1年内复发有明显相关性。 相似文献
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保留喉功能疗法在喉癌 T3期病例中的应用探讨 总被引:4,自引:1,他引:3
目的:探讨在喉癌 T3期病例中 3种保留喉功能的治疗方法的优劣。方法:将保留喉功能的治疗方法分为单纯根治性放疗、根治性放疗失败后挽救性手术切除、部分喉切除术 3种,分析采用此 3种方法治疗的 94例 T3期喉癌病例的总体生存率、原发灶和继发灶复发率、并发症发生率。结果:在声门上型喉癌中部分喉切除术组的生存率优于单纯根治性放疗组 (P=0.0248);在声门型喉癌中部分喉切除术组的生存率与根治性放疗失败后挽救性手术切除组相当,都高于单纯根治性放疗组 (P=0.0075);在根治性放疗失败后挽救性手术切除、部分喉切除术组中,并发症发生率分别为 60%、 16.7%,前组高于后组( P<0.05);放疗组(包括单纯根治性放疗组和根治性放疗失败后挽救性手术切除组)与部分喉切除术组的原发灶复发率分别为 45.8%、 19.4%,差异有显著性( P< 0.05)。结论:在 T3期喉癌病例中,上述 3种保留喉功能的治疗方法以部分喉切除术效果最佳。 相似文献
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应用双抗体夹心ELISA方法测定了30例喉癌患者血清可溶性白细胞介素2受体(SIL-ZR)水平。结果表明:喉癌患者血清SIL-ZR水平明显高于正常人(P<0.01);与临床分期有关,病期越晚,sIL-2R水平越高;sIL-2R水平超过1000U/ml者,多预后不良;9例术后2~8月再次采血检验,6例无癌生存者sIL-2R水平明显下降(P<0.01),3例复发的患者血清sIL-2R升高。提示:喉癌患者血清sIL-2R的测定对预后判断和疗效观察有重要意义。 相似文献
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非小细胞肺癌患者血清蛋白指纹图谱的构建及其临床意义 总被引:1,自引:0,他引:1
目的探讨血清蛋白指纹图谱在非小细胞肺癌诊断中的价值。方法取肺癌患者与年龄、性别匹配的对照组的血清标本进行实验,应用SELDI-TOF-MS技术及WCX2磁珠,检测各血清标本构建血清蛋白指纹图谱,应用Biomarker Wizard和SPSS13.0软件分析数据并建立诊断模型,并评价各诊断模型对肺癌的诊断价值。结果由分子量为4797、2768、3268(m/z)的差异蛋白峰组成的非小细胞肺癌诊断模型Ⅰ,经验证诊断模型Ⅰ的判别准确率为91.3%(158/173),敏感性为89.2%(66/74),特异性为92.9%(92/99),统计学分析结果提示其敏感性高于CYF21-1、SCC、CEA的联合检测。由分子量为2768、3403、9498(m/z)的差异蛋白峰组成的Ⅰ期非小细胞肺癌诊断模型Ⅱ,其判别准确率为88%(44/50),敏感性为90.0%(18/20),经扩大样本量验证,其特异性为83.8%(83/99),统计学分析结果提示其敏感性高于SCC、CYF21—1及CEA的联合检测。分别对23例肺腺癌、51例肺鳞癌患者和30名正常对照组对比分析后,筛选出差异最大的4个标志蛋白,其分子量为3268、2768、3403,9498(m/z),分别组合成的诊断模型Ⅲ、Ⅳ,对肺腺癌及肺鳞癌的诊断均具有较高的敏感性及特异性,统计学分析结果提示其敏感性高于相关肿瘤标志物的检测。结论非小细胞肺癌诊断模型Ⅰ、Ⅱ分别对NSCLC、Ⅰ期NSCLC患者的诊断具有较高的敏感性及特异性,其敏感性高于相关肺癌肿瘤标志物的联合检测;差异蛋白3268、2768、3403、9498(m/z)对于肺腺癌或肺鳞癌的诊断具有较高的敏感性及特异性,有望成为新的肿瘤标志物。 相似文献
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背景与目的:人卵巢浆液性乳头状腺癌细胞株SKOV3及其在裸鼠体内建立的淋巴结定向高转移亚克降第二代SKOV3-pm2、第三代SKOV3-pm3细胞株,为卵巢癌转移分子机制的研究提供了细胞模型.本研究应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片分析筛选卵巢癌淋巴结定向高转移与非定向转移细胞株之间的蛋白质表达差异.方法:采用动物实验测定SKOV3、SKOV3-pm2和SKOV3-pm3三种细胞株的淋巴结转移率.应用表面增强激光解吸离子化-飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption and ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术检测各细胞株提取的胞浆总蛋白和分泌蛋白,每种细胞分别采用CM-10型弱阳离子交换芯片和IMAC-3型固定金属亲和芯片检测.应用Ciphergen Protein Software 3.2.0软件和Biomarker Wizard软件对采集3组细胞的蛋白峰进行比较.峰强度相差0.5倍以上者定义为差异蛋白.结果:动物实验显示.细胞株SKOV3及高转移亚克隆SKOV3-pm2、SKOV3-pm3的淋巴结转移率分别为20%、90%和100%,前者与后二者之间的差异有统计学意义(P<0.05).获得CM-10和IMAC3两种蛋白芯片上SKOV3、SKOV3-pm2、SKOV3-pm3细胞株蛋白质谱图谱,对比发现:质荷比(m/z)为6971、7475、9089、9453、10 103、11 655的胞浆蛋白及质荷比(m/z)为4746的分泌蛋白在上述三种细胞株中存在不同程度差异表达.结论:应用SELDI-TOF-MS技术结合固定金属亲和芯片和弱阳离子交换芯片,可有效筛选卵巢癌淋巴结定向高转移特性细胞株中的特异性表达蛋白;寻找到的差异蛋白与淋巴结定向高转移潜能密切相关. 相似文献
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目的探讨低温等离子射频消融术治疗早期声门型喉癌患者的临床效果。方法选取早期声门型喉癌患者68例,按手术方案不同分为观察组(n=34)和对照组(n=34),对照组予以喉部分切开术治疗,观察组予以低温等离子射频消融术治疗。对比两组围术期情况[手术时间、术中出血量、视觉模拟评分法(VAS)评分、黏膜恢复评分]、术前、术后6个月语音变化情况(基频微扰、振幅微扰)、并发症发生率。结果观察组手术时间、术中出血量、VAS评分、黏膜恢复评分较对照组低(P<0.05);术后6个月,观察组基频微扰、振幅微扰较对照组低(P<0.05);观察组并发症发生率[5.88%(2/34)]与对照组[14.71%(5/34)]对比无显著差异(P>0.05)。结论采用低温等离子射频消融术治疗早期声门型喉癌患者,可缩短手术时间,减少术中出血量,减轻术后疼痛,加快术后黏膜恢复,改善语音功能,且并发症发生率低。 相似文献