湖北省汉族人群MICA基因外显子2～4的多态性分析

目的 了解湖北省汉族正常人群中MICA等位基因的分布,为研究MICA基因与疾病的关系提供实验基础.方法 采用PCR-SSP方法对193例湖北地区汉族正常人群MICA基因外显子2～4的多态性进行分析.结果 MICA各等位基因分布频率存在差异,其中以MICA*00801/02等位基因频率最高(33.7%),其次为MICA*010(18.4%)、MICA*00201/020(13.9%)和MICA*01201/02(9.6%),频率最低的是MICA*005(0.5%)和MICA*027(0.5%).结论 湖北地区汉族人群MICA等位基因的构成与其他人群之间存在差异,有自己的分布特征.     

广东汉族人群MICA基因多态性分析

目的获得广东汉族人群MICA基因第2~5外显子多态性分布特点。方法采用直接测序法(se-quence-based typing,SBT)对118名广东籍汉族无偿献血者的MICA基因进行多态性分析。结果 MICA各等位基因分布频率存在差异,其中MICA*010等位基因频率最高(25%),其次为MICA*019(16.5%)、MICA*008∶01(15.3%)和MICA*002∶01(15.3%),频率比较低的是MICA*033、MICA*009∶02、MICA*007∶02及MICA*004.与该基因在其他地区人群进行比较,存在显著差异。结论广东汉族人群MICA等位基因的分布有其自身特点。     

MICA第5外显子微卫星多态性与大肠癌易感相关性研究

目的研究MHC-Ⅰ类链相关基因A(MICA)第5外显子微卫星多态性与大肠癌之间的相关性。方法应用荧光PCR微卫星分型技术分析103名大肠癌患者和100名正常人群MICA基因第5外显子微卫星等位基因频率。结果 MICA*A6基因频率在患者组(23.3%)高于对照组(14.5%),相对风险(OR)为1.791 4(P0.05);其余各基因频率在患者组与对照组之间的差异无统计学意义(P0.05)。结论 MICA-STR MICA*A6等位基因多态性与大肠癌相关,MICA*A6是人群个体中1个大肠癌遗传易感标记。     

MICA基因多态性与结直肠癌的易感关联性研究

目的研究MICA等位基因多态性与结直肠癌易感性之间的关联性。方法采用PCR-SSP和PCR-SBT方法对样本MICA等位基因的多态性进行检测。结果结直肠癌患者中检出7种MICA等位基因;和对照组相比较,结直肠癌患者组中MICA*010等位基因分布频率更高,可能是结直肠癌的易感基因(30.0%vs 6.2%,OR=6.43,95%CI:3.51-11.76,Pc0.05),MICA*008和MICA*045等位基因分布频率更低,可能是保护基因(MICA*008:14%vs 25.4%,OR=0.48,95%CI:0.29-0.78,Pc0.05;MICA*045:2%vs 12.9%,OR=0.14,95%CI:0.05-0.40,Pc0.05)。结论 MICA等位基因多态性与结直肠癌的易感性间存在关联性。     

用PCR-SSP方法分析南方汉族人群MICA基因多态性

目的调查南方汉族人群MICA基因外显子2~6的多态性。方法采用聚合酶链反应/序列特异性引物(PCR-SSP)方法,调查113例江苏省扬州地区汉族正常人群MICA等位基因的分布情况。结果共检测出18个MICA等位基因,最常见的3种等位基因分别是MICA*008(23.0%),MICA*010(17.6%)和MICA*002/020(11.2%),最罕见的3种等位基因是MICA*042(0.4%),MICA*045(1.3%)和MICA*044(1.3%)。结论中国南方汉族人群MICA等位基因分布频率具有自己的种族特异性。     

山东地区汉族人群MICA基因多态性分析

目的分析山东地区汉族人群MICA基因外显子2~6多态性,并与国内外其他地区人群进行比较。方法用聚合酶链反应-测序分型法(PCR-SBT)对100例山东地区汉族骨髓库捐献志愿者MICA基因外显子2~6进行多态性分析。结果共检出18个MICA等位基因,基因频率最高的前3位依次为MICA*008:01(35%),MICA*002:01(14%),MICA*010:01(12%)。与南方多地区汉族人群比较,MICA*004*,*019,*008,*010,*027分布差异均有统计学意义(P均0.05);与内蒙古地区汉族人群比较MICA*008,*012,*004差异有统计学意义(P均0.05);与韩国人群比较MICA*008,*010,*019差异有统计学意义(P均0.05);与美国高加索人种比较,只有MICA*045差异有统计学意义(P0.05);与非洲裔美国人比较差异有统计学意义的等位基因达10个。结论山东地区汉族人群MICA基因多态性有高加索人群特征,且与国内外其他地区人群存在较大差异。     

MICA基因多态性与乳腺癌的相关性研究

目的研究主要组织相容性复合体I类链相关蛋白A(MICA)基因多态性与乳腺癌的相关性。方法采用PCR-SBT方法分别对85例确诊为乳腺癌的患者和100例健康献血者的MICA基因外显子2-6的多态性进行分析,采用SPSS17.0软件对病例组与对照组的MICA等位基因分布频率进行差异的统计学分析。结果乳腺癌患者MICA*010∶01基因频率((27.6%vs12%,Pc0.05,OR=2.802[CI:1.628-4.823])和MICA*049基因频率(10%vs2.0%,Pc0.05,OR=5.444,[CI:1.795-16.513])明显高于健康对照组,差异有统计学意义;而MICA*008∶01频率明显低于对照组(17.1%vs36%,Pc0.05,OR=0.366,[0.223-0.599]),差异有统计学意义。结论 MICA基因多态性与乳腺癌的发病存在相关性,MICA*010∶01,MICA*049可能是乳腺癌的易感基因,而MICA*008∶01则可能是保护性基因。     

人组织相容性复合体I类相关基因多态性及医学意义

人组织相容性复合体I类相关基因A（MICA）基因位于人6号染色体的MHC-I类区域,属非经典MHC-I类基因家族,具有高度多态性,其多态性主要集中在3个区域：外显子2~4、外显子5和第129位密码子。MICA基因与多种疾病之间存在关联,包括自身免疫病、肿瘤和感染等。不同人群之间MICA等位基因的分布频率存在差异,MICA＊008与其它等位基因所编码的蛋白分子在结构和功能上的差异可能是导致MICA＊008在多数人群中分布频率较高的原因之一。     

中国南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1及-DQA1基因多态性的研究

目的调查中国南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1等位基因多态性。方法 2017年6月-12月应用PCR-SBT测序分型法对1 000名健康无血缘关系的南方汉族人群外周血样(于2016年8月-2017年5月收集)进行HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1基因测序分型。HLA-DPA1和-DPB1基因采用自行设计的引物同步扩增检测第2、3外显子,HLA-DQA1检测第1～4外显子。电泳序列导入uTYPE 7.2 HLA分析软件判定基因型。采用直接计数法计算等位基因的分布频率。结果在1 000人份南方汉族无关个体HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1测序分型所获的序列中,无背景信号和杂峰。共检出6种HLA-DPA1等位基因,频率由高到低依次为DPA1~*02∶02 (0.541)>DPA1~*01∶03 (0.340)>DPA1~*02∶01 (0.095)>DPA1~*04∶01 (0.021)>DPA1~*02∶07 (0.003)>DPA1~*01∶04 (0.002);共检出HLA-DPB1等位基因33种,频率较高的前4种等位基因依次为DPB1~*05∶01(0.401)、DPB1~*02∶01(0.165)、DPB1~*04∶01(0.085)、DPB1~*02∶02(0.071);共检出19种HLA-DQA1等位基因,频率较高的前4种等位基因依次为DQA1~*01∶02(0.196)、DQA1~*03∶02(0.144)、DQA1~*01∶03(0.087)和DQA1~*06∶01(0.085)。结论本文获得了南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1基因多态性数据,可为人类学、群体遗传学、疾病关联研究等提供重要参考数据。     

四川骨髓库四川籍汉族人群MICA等位基因分布

目的研究四川骨髓库四川籍汉族志愿者MICA等位基因分布特点。方法采用PCR-SBT和PCR-SSP方法,对四川骨髓库119名无关汉族志愿者标本作MICA等位基因分型和MICA基因缺失型分析。结果共检测到13种已知MICA等位基因和2种新MICA等位基因,频率依次为MICA*010(25.2%)、MICA*008:01/04(23.1%)、MICA*002:01(16.0%)、MICA*019(10.5%)、MICA*012:01(8.8%)、MICA*049(4.2%)和MICA*009:01(3.8%),这7种等位基因占所有MICA等位基因的91.6%。与浙江汉族相比,仅MICA*027分布的差异有统计学意义(P<0.05);与内蒙古汉族、韩国人、美国白人及非洲裔美国人相比,MICA*004和MICA*019分布的差异有统计学意义(P<0.05)。所发现的3例2种MICA新等位基因,已被世界卫生组织HLA因子命名委员会分别命名为MICA*064N和MICA*010:02。连锁不平衡分析发现,四川骨髓库汉族人群中B*1301-MICA*045,B*4801-MICA*Del紧密连锁;最常见的4位点单体型是A*0207-B*4601-MICA*010-DRB1*0901。结论四川籍汉族人群MICA等位基因表现出较丰富的多态性,具有其自身的特点。     

皖籍汉族人群MICA等位基因多态性的分布

目的了解皖籍汉族正常人群中MICA（major histocompatibility complex class I chain—related gene A）等位基因的分布,为进一步研究MICA关联疾病的发病机制奠定基础。方法采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针杂交（polymerase chain reaction and sequence—specific oligonucleotide probing。PCR—SSOP）技术对112例正常人群进行MICA基因外显子2、3、4的多态性分析。结果本研究人群的MICA基因多态性以MICA＊008等位基因频率最高,达30．36％,其次为＊010（16．96％）、＊002（13．84％）和＊009（12．05％）。单倍型分析显示。MICA基因与多个HLA—B位点间存在连锁不平衡现象,有统计学意义的有MICA＊008-B40、B07、B13,MICA＊010-B46、B15,MICA＊002-B35、B15和MICA＊009-B52。结论皖籍汉族正常人群的MICA等位基因分布具有其基本特点,MICA基因与HLA—B位点间存在广泛连锁不平衡。     

鼻咽癌高发区非癌人群HLA-A~* 02分子多态性及分布

目的了解中国南方鼻咽癌高发区非癌人群HLA-A*02等位基因多态性及其分布特点。方法采用PCR-SSOP方法对来源于广西鼻咽癌高发区的342例非癌对照标本作HLA-A基因分型;等位基因频率统计采用直接计数法,并应用卡方检验将其与已报道的中国南方及北方汉族群体HLA-A*02等位基因频率作比较。结果所检测的广西鼻咽癌高发区非癌人群的HLA-A*02等位基因分布频率为33.77%(231/684),共检测出5种HLA-A*02等位基因亚型,检出比例依次为:A*02∶03占48.92%(113/231)、A*02∶07占33.77%(78/231)、A*02∶01占9.52%(22/231)、A*02∶06占7.36%(17/231)和A*02∶11占0.05%(1/231);对比分析显示A*02∶01、A*02∶03、A*02∶06及A*02∶07在不同地区汉族人群中呈现出明显的分布差异(P<0.05)。结论中国南方鼻咽癌高发区非癌人群HLA-A*02等位基因中以A*02∶03最为常见、A*02∶07次之,其HLA-A*02等位基因亚型与中国其地域的汉族人群相比存在明显的差异分布特征,提示该等位基因亚型是人群分析中较好的多态性标志。     

吉林汉族人群HLA-A高分辨基因的多态性分析

背景:HLA与免疫遗传学、免疫生物学密切相关,其分型对于器官移植和非感染性疾病的易感性有重要意义。目的:调查吉林汉族人群HLA-A位点基因多态性,分析不同人群HLA-A等位基因频率分布特征。方法:采用基因测序技术检测2196名吉林汉族人HLA-A位点第2、3、4外显子序列,软件分析得到分型结果,计算各等位基因频率并与不同人群进行比较。结果与结论:共检测到42种HLA-A等位基因,其中3种等位基因频率≥5%,分别是HLA-A*02:01(8.5%),HLA-A*11:01(8.2%)和HLA-A*24:02(7.3%),这3种等位基因频率合计为24.0%。同时,检测到39种等位基因频率<0.5%的HLA-A等位基因,这39种等位基因频率合计为76.0%。吉林汉族人群HLA-A等位基因频率分布与美国亚裔人群、中国香港华人、日本人相比存在一定差异。提示吉林汉族人群HLA-A基因的分布有地域特征。     

深圳地区人群乙型肝炎病毒携带者HLA-DRB1 等位基因多态性及关联性分析

目的　研究深圳地区人群乙型肝炎病毒携带者人类白细胞抗原（human leukocyte antigen,HLA）DRB1 的等位 基因多态性分布特征,探讨乙型肝炎病毒携带与HLA-DRB1 等位基因之间的关联性。方法　采用聚合酶链反应- 直接 测序分型技术（PCR-SBT）对163 例深圳地区乙型肝炎病毒携带者（携带组）和314 例健康人群（对照组）进行HLADRB1 等位基因的检测,运用统计学方法比对分析两组人群的基因分型结果。结果　对照组检出的HLA-DRB1 等位基 因有32 种,其中占比大于5% 的基因型有6 种,分别为HLA-DRB1*09:01（16.40%）,12:02（11.15%）,15:01（9.87%）, 08:03（8.91%）,11:01（6.05%）和04:05（5.10%）;携带组中检出的HLA-DRB1 等位基因有28 种,其中占比大于5% 的基因型有6 种,分别为HLA-DRB1*09:01（20.55%）,12:02（14.72%）,15:01（9.20%）,03:01（7.06%）、08:03（5.52%） 和11:01（5.21%）。其中,携带组中HLA-DRB1*03:01 检出率高于对照组,差异有统计学意义（P=0.010）。结论　深 圳地区人群感染乙肝病毒的机会与HLA-DRB1*03:01 呈正相关。     

MICA基因第5外显子与乙肝后肝硬变的相关性研究

目的研究MICA基因多态性、sMICA分子与乙肝后肝硬化（livercirrhosis,LC）的相关性。方法采用MICA—STR微卫星基因分型技术检测101例HBsAg阳性LC患者和141例健康对照者MICA基因第5外显子的基因多态性,并进行统计学分析。结果在101例湖南汉族HBsAg阳性LC患者中检测到5种MICA基因第5外显子等位基因,频率分别为：MICA＊A4（10．9％）,MICA＊A5（37．1％）,MICA＊A5．1（34．2％）,MICA＊A6（7．4％）,MICA＊A9（10．4％）。15种基因型分别为MICA＊A4／A4,MICA＊A4／A5．MICA＊A4／A5．1．MICA＊A4／A6,MICA＊A4／A9,MICA＊A5／A5,MICA＊A5／A5．1,MICA＊A5／A6．MICA＊A5／A9,MICA＊A5．1／A5．1,MICA＊A5．1／A6,MICA＊A5．1／A9,MICA＊A6／A6,MICA＊A6／A9,MICA＊A9／A9。MICA＊A5．1基因与LC发病正相关（P=0．042）,OR值为1．398,与患者性别无关（χ^2=0．08,P=0．778）。结论MICA＊A5．1基因与乙肝后LC发病正相关,提示该基因可能是乙肝后出现LC的重要易感基因。     

中国汉族人群HLA-DM多态性与强直性脊柱炎疾病关联分析

目的比较中国汉族人群强直性脊柱炎(AS)与健康对照HLA-DMA/HLA-DMB各SNP位点及等位基因多态性,分析可能的AS疾病易感位点及基因。方法选取110名AS患者和1 000名健康无关献血者,利用Taq-Man PCR技术对7个DMA和DMB SNPs(single nucleotide polymorphisms)位点进行了基因分型,运用SPSS软件及Arlequin3.1软件统计基因频率和单体型相关参数。结果 AS组DMA*01∶02基因频率(19.55%)显著低于对照组(28.05%),AS组DMA*01∶02-DMB*01∶01单体型频率(17.51%)也显著低于对照组(26.87%);AS组与对照组DMA p496和DMB p590 SNP位点多态性、DMA*01∶02等位基因以及DMA*01∶02-DMB*01∶01单体型分布差异有统计学意义(P0.05)。结论 DMA*01∶02等位基因和DMA*01∶02-DMB*01∶01单体型可能对于AS疾病具有保护性作用,未来有必要在其他人群中进一步确认并研究其基因功能。     

深圳地区汉族人群人类主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因B基因多态性及其分布特征分析

目的 探讨深圳地区汉族人群人类主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因(MIC)B等位基因多态性及分布特征.方法 选择2012年8月至2014年12月,于广东省深圳市血液中心献血的202例无血缘关系的深圳地区汉族健康献血者为研究对象.根据自行设计的MICB基因聚合酶链反应(PCR)扩增引物及测序引物,采用PCR-直接测序(SBT)法对献血者MICB基因第2～4外显子进行序列测定,并采用统计学方法对本组深圳地区汉族人群等位基因频率及基因多态性结果与不同地区人群进行比较.本研究遵循的程序符合深圳市血液中心人体试验委员会制定的伦理学标准,得到该委员批准,征得受试对象知情同意,并于采血前与之签订相关伦理学文件.结果 本组202例深圳地区汉族人群中,共检出的MICB等位基因10种,基因型24种.本组人群的MICB基因多态性以MICB* 00502基因型等位基因频率最高,占51.2％,其次为MICB* 00201 (19.8％),MICB* 00401 (8.7％),MICB* 014(5.7％)及MICB* 008(5.2％).MICB基因型以MICB* 00502-MICB* 00502频率最高,占35.6％.MICB* 013为威尔士人群特有基因,在深圳地区汉族、韩国、西班牙人群中均未检出.MICB* 018等位基因在德国健康人群、奥地利、摩洛哥、澳大利亚及其他亚洲人群中均未检出,在深圳地区汉族人群却有较高的等位基因频率,等位基因频率达1.5％.结论 深圳地区汉族人群的MICB等位基因分布与其他不同地区人群相比,具有高度的遗传多态性且有其自身分布特点.     

四川骨髓库汉族人群HLAD-RB1~*14等位基因分布

目的研究四川骨髓库中四川籍汉族人群HLAD-RB1*14等位基因分布。方法在四川骨髓库8934名四川汉族造血干细胞捐献志愿者中随机筛选107例中低分辨为DRB1*14的样本,以PCR-SBT分型技术检测DRB1位点的第2外显子以鉴定HLAD-RB1*14等位基因。结果共检出6种DRB1*14等位基因,包括DRB1*140101/1454(56.0%),DRB1*1403(1.8%),DRB1*1404(11.0%),DRB1*140501(27.5%),DRB1*140701(1.8%)和DRB1*1425(1.8%);其中最主要的DRB1*140101/1454频率与美国亚裔/太平洋岛民接近,而与高加索人、非洲裔美国人、西班牙裔及韩国人和中国北方汉族中的分布有显著性差异;DRB1*140501和DRB1*1404则与中国北方汉族分布类似;本研究未检到的等位基因在四川汉族DRB1*14阳性个体中的频率低于3%。结论四川汉族人群HLA-DRB1*14等位基因呈现多样性并存在自身特点。