河源地区乙肝病毒分型和耐药突变基因检测的应用

了解河源地区乙型肝炎(HBV)基因分型和耐药基因变异特征,探讨HBV YMDD变异与基因分型、DNA载量和HBe Ag之间的关系。应用实时荧光聚合酶链反应(PCR)技术对60例乙肝患者血清进行基因分型和耐药突变检测及HBV DNA定量检测。60例乙肝患者中B基因型52例(86.6%),C基因型6例(10.0%),B/C混合基因型2例(3.4%)。B基因型在乙肝患者中所占构成比最高,C基因型次之,B/C混合基因型最低,差异有显著性(P0.01)。B基因型、C基因型及B/C基因型之间HBV DNA载量及HBe Ag阳性率差异均无显著性(P0.05)。检出YMDD变异38例,变异率63.3%;各基因型间YMDD变异的差异无统计学意义(P0.05)。HBV YMDD变异的监测对乙肝患者的精准治疗和个体化抗病毒方案的知道具有重要的指导意义,HBV基因分型对病情预测和转归都有重要临床意义。     

铜陵地区乙型肝炎病毒基因型分布及其与临床的相关性研究

目的了解铜陵地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布,分析该地区不同基因型别与肝功能损害、病毒复制水平及血清标志物的关系,探讨不同基因型的临床意义。方法采用聚合酶链反应(PCR)-反向点杂交法(RDB)对铜陵地区228例HBV阳性感染者的血清分别进行HBV基因型分型、HBV载量以及乙型肝炎血清标志物和肝功能等的检测,并结合其指标进行相关性分析。结果在228例患者的血清样本中,226例样本成功分型,其中B型54.4%(124/228)、C型37.3%(85/228)、B/C混合型7.5%(17/228),2例未检出,占0.09%。不同HBV基因型患者间年龄、e抗原(HBeAg)、e抗体(抗HBe)、肝功能的差异无统计学意义(P0.05)。C型HBV载量明显高于B型及B/C混合型(P0.01)。结论铜陵地区HBV基因型的分布以B型为主,其次为C型和少量B/C混合型;C型感染者HBV载量显著高于B型,C型感染者肝脏损害较B型重,提示HBV基因型可能影响患者体内HBV复制并可能引起不同临床类型的慢性肝病。     

昆明地区HBV DNA基因型的分布特征

目的 研究云南省昆明地区乙型肝炎病毒(HBV)的基因分型特征.方法 采用荧光定量PCR及基因型特异性引物PCR方法 ,对云南省昆明地区360例HBV感染血清进行HBV DNA定量及基因分型检测,以ELISA法检测血清乙肝标志物.结果 360例 HBV感染血清中有346例(96.11%)可以直接分型,其中196例(56.65%)为C型,91例(26.30%)为B型,37例(10.69%)为C/B混合型,21例(6.07%)为D型,A型仅1例(0.29%);比较显示,C型基因分布率显著高于其他基因型(P<0.01);C基因及C、B混合基因型患者HBV-DNA定量显著高于B基因及其他基因型患者(P<0.01或P<0.05);另除B型基因在"大三阳"模式中比例显著较低(P<0.05),HBV基因型在其他各血清模式组间的分布差异无统计学意义(P>0.05);14例标本未能直接分型(3.89%),其HBV-DNA定量平均水平为4.136×103IU/mL显著低于其他检样(P<0.05).结论 昆明地区HBV基因型的分布较为丰富,存在C型、B型、C/B混合型及D型和A型,其中以C型和B型为本区域的主要HBV基因型;当C/B混合型和C型的HBV感染时,往往伴随HBV较高水平复制,且HBV感染B基因型与HBeAg的检出呈负相关;本区域内D基因型分布率介于内地低海拔区域和拉萨高原地带之间.这些可能是本区域内HBV基因型分布的流行病学特征.未能直接分型检样的HBV-DNA定量均较低,可能说明HBV基因分型应该在一定的HBV-DNA定量水平基础上进行.     

昆明地区HBV DNA基因型的分布特征

目的 研究云南省昆明地区乙型肝炎病毒(HBV)的基因分型特征.方法 采用荧光定量PCR及基因型特异性引物PCR方法 ,对云南省昆明地区360例HBV感染血清进行HBV DNA定量及基因分型检测,以ELISA法检测血清乙肝标志物.结果 360例 HBV感染血清中有346例(96.11%)可以直接分型,其中196例(56.65%)为C型,91例(26.30%)为B型,37例(10.69%)为C/B混合型,21例(6.07%)为D型,A型仅1例(0.29%);比较显示,C型基因分布率显著高于其他基因型(P<0.01);C基因及C、B混合基因型患者HBV-DNA定量显著高于B基因及其他基因型患者(P<0.01或P<0.05);另除B型基因在"大三阳"模式中比例显著较低(P<0.05),HBV基因型在其他各血清模式组间的分布差异无统计学意义(P>0.05);14例标本未能直接分型(3.89%),其HBV-DNA定量平均水平为4.136×103IU/mL显著低于其他检样(P<0.05).结论 昆明地区HBV基因型的分布较为丰富,存在C型、B型、C/B混合型及D型和A型,其中以C型和B型为本区域的主要HBV基因型;当C/B混合型和C型的HBV感染时,往往伴随HBV较高水平复制,且HBV感染B基因型与HBeAg的检出呈负相关;本区域内D基因型分布率介于内地低海拔区域和拉萨高原地带之间.这些可能是本区域内HBV基因型分布的流行病学特征.未能直接分型检样的HBV-DNA定量均较低,可能说明HBV基因分型应该在一定的HBV-DNA定量水平基础上进行.     

昆明地区HBV DNA基因型的分布特征

目的研究云南省昆明地区乙型肝炎病毒(HBV)的基因分型特征。方法采用荧光定量PCR及基因型特异性引物PCR方法,对云南省昆明地区360例HBV感染血清进行HBV DNA定量及基因分型检测,以ELISA法检测血清乙肝标志物。结果 360例HBV感染血清中有346例(96.11%)可以直接分型,其中196例(56.65%)为C型,91例(26.30%)为B型,37例(10.69%)为C/B混合型,21例(6.07%)为D型,A型仅1例(0.29%);比较显示,C型基因分布率显著高于其他基因型(P0.01);C基因及C、B混合基因型患者HBV-DNA定量显著高于B基因及其他基因型患者(P0.01或P0.05);另除B型基因在"大三阳"模式中比例显著较低(P0.05),HBV基因型在其他各血清模式组间的分布差异无统计学意义(P0.05);14例标本未能直接分型(3.89%),其HBV-DNA定量平均水平为4.136×10~3 IU/mL显著低于其他检样(P0.05)。结论昆明地区HBV基因型的分布较为丰富,存在C型、B型、C/B混合型及D型和A型,其中以C型和B型为本区域的主要HBV基因型;当C/B混合型和C型的HBV感染时,往往伴随HBV较高水平复制,且HBV感染B基因型与HBeAg的检出呈负相关;本区域内D基因型分布率介于内地低海拔区域和拉萨高原地带之间。这些可能是本区域内HBV基因型分布的流行病学特征。未能直接分型检样的HBV-DNA定量均较低,可能说明HBV基因分型应该在一定的HBV-DNA定量水平基础上进行。     

简便HBV基因型S基因PCR-RFLP分型方法的建立

目的 建立简便HBV基因型S基因PCR-限制性片段长度多态性(RFLP)分型方法(以下简称“简便PCR-RFLP法”),并评价其临床应用价值.方法 临床诊断研究.查阅并比较GenBank中128株HBV(基因型A～D型)S基因片段(S区nt253-687),设计限制性内切酶Hinf Ⅰ、Ear Ⅰ、Apo Ⅰ鉴别A～D基因型分型方法,并评价简便PCR-RFLP法检测HBV DNA的最低检测下限、重复性;然后,用该方法检测50例慢性乙型重型肝炎患者的HBV基因型,同时用直接测序法验证简便PCR-RFLP法检测HBV基因型的一致性.结果 建立了简便PCR-RFLP法HBV基因分型的方案,通过限制性内切酶Hinf Ⅰ一次酶切就可分出我国流行的B型、C型、D型等毒株及B/C混合型.随机抽取3份标本,不同稀释浓度下,用简便PCR-RFLP法重复检测HBV基因型,分型结果均与原血清完全一致,且最低检测下限约为7 ～9 IU/ml.经Hinf Ⅰ酶一步酶切后,用简便PCR-RFLP法从50例患者标本中,检出B型23份、C型10份;经直接测序法验证,从PCR产物中检出B型23份、C型10份,2种方法检测B、C型基因结果完全一致(Kappa=1.00,P=0.001),简便PCR-RFLP法检出B/C混合型9份,优于PCR产物直接测序法(0份,x2=18.00,P=0.001).Hinf Ⅰ酶一步酶切后分出的ABD型8份,进一步酶切及应用PCR产物直接测序法检测均为B型变异株.结论 建立的简便PCR-RFLP法对HBV基因分型有较高的灵敏度和重复性,且在检出混合基因型方面具有优势,更为简便.     

温州地区乙型肝炎病毒基因型分布调查及意义

目的调查乙型肝炎病毒(HBV)感染者的HBV基因型分布,探讨HBV基因型与临床的相关性。方法用SP-nPCR法检测469例HBV感染者的HBV基因型,用荧光定量PCR法检测HBVDNA载量,用ELISA法检测HBV血清学标志物。结果469份标本分出基因型430例,HBV基因型分布为:A型2.6%(11/430),B型34.9%(150/430),C型49.8%(214/430),B/C型12.8%(55/430),未检出D、E、F基因型;无症状携带者(ASC)和慢性乙肝患者(CH)以C、B基因型为主,肝硬化(LC)和肝癌(HCC)以C基因型占绝对优势。基因型分布与性别无关。30岁以下人群感染以B基因型为主,30岁以上则以C基因型为优势。结论SP-nPCR法适用于慢性HBV感染者(病人和携带者)的基因分型和流行病学调查。HBV感染以C、B基因型为主,存在B/C混合基因型和A基因型。C基因型感染与肝硬化和肝细胞癌相关。     

寡核苷酸基因芯片检测HBV基因型方法的建立与临床研究

目的 建立寡核苷酸基因芯片检测HBV基因分型的方法并对HBV携带者基因型进行临床分析。方法根据Genbank中已发表的128株HBV全基因组序列系统进化分析结果设计了A-H不同HBV基因型的特异探针及巢式PCR引物。利用反向杂交原理，先将不同HBV基因型特异的寡核苷酸探针固定在芯片上，再与地高辛（Dig）标记的扩增产物杂交从而检测HBV基因型。本研究检测了200例HBVDNA阳性患者，为了验证基因芯片检测的结果，随机选取其中40份样本进行直接测序。结果在200份血清样本中检测到B、C基因型以及BC混合型，依次占11．5％（23／200），80．5％（161／200），8％（16／200）。在与测序方法进行对比的40份样本中，除3份例混合型用测序方法不能检出混合感染外，利用测序结果进行系统发育分析得到的结果与基因芯片检测结果一致。进一步的克隆分析发现这3份样本均为混合感染。结论基因芯片是进行HBV基因分型的方便可靠的工具，并能更好地检测不同基因型混合感染的情况。本研究中，HBV基因型以C型为主，与B型相比，C型HBV感染者病情较为严重。     

国产荧光定量PCR与COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan v 2.0检测HBV DNA结果比较

目的针对不同HBV分型,比较某国产实时荧光定量PCR试剂与Roche公司COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan v 2.0试剂检测HBV DNA的结果。方法根据HBV分型结果,抽取72份慢性乙型肝炎患者血清标本,用Roche公司COBAS AmpliPrep/COBAS TaqMan v 2.0(试剂A)和某国产实时荧光定量PCR(试剂B)对72份慢性乙型肝炎患者血清标本进行HBV DNA定量检测,以分析针对不同HBV分型样本,国产试剂与试剂A的相关性。结果试剂A和B测得的HBV DNA结果 (IU/mL)以10为底数取对数分别为5.67±1.67和5.72±1.75,两者结果差异无统计学意义(P0.05)。共检测72份样本,其中63例A、B两种试剂检测结果有数值。此63例总相关系数(r)为0.94(P0.01),试剂A与试剂B对63例样本中HBV基因型B型、C型和B/C混合型样本检测结果 r分别为0.94、0.95和0.92(P0.05)。对于HBV DNA定量结果 104IU/mL标本,试剂B与试剂A相关性较低(r=0.31,P=0.35)。结论对于不同的HBV基因型,试剂B与试剂A在检测HBV DNA方面有较好相关性,适用于HBV DNA的临床检测,但在低HBV载量时试剂B与试剂A相关性较低。建议结合临床诊治进程和检测的效率及检测费用等因素,选择适当的检测试剂。     

阜阳市慢性乙型肝炎病毒感染者HBV基因型调查

目的了解阜阳市慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染者HBV基因型分布状况。方法选择165例HBVDNA阳性的慢性HBV感染者,采用型特异性聚合酶链反应(PCR)检测HBV基因型。结果 165例慢性HBV感染者中HBV基因型B型46例(27.9%)、B/C混合型29例(17.6%)、C型90例(54.5%),未发现其他基因型。结论阜阳市慢性HBV感染者基因型为B、B/C和C型,其中基因C型是主要流行株。