SELDI蛋白质芯片在肿瘤标志物筛选中的应用进展

随着人类进入后基因组时代,蛋白质组学成为生命科学的一大研究热点.蛋白质芯片作为蛋白质组学研究中一项有前景的技术,被广泛应用于肿瘤的标志物筛选、早期诊断、分期及疗效、预后评价方面.本文就表面增强激光解吸电离(surface enhanced laser desorption /ionization, SELDI)蛋白质芯片的原理及近年来在肿瘤标志物筛选中的应用做一简要综述.     

蛋白质芯片-飞行质谱技术及其在临床医学中的应用

蛋白质组学研究是最终揭示生命现象本质的关键，如今该学科已步入生命科学研究的最前沿。与之相伴随着的生物高新技术发展催生了一项新型生物芯片技术，即蛋白质芯片飞行质谱技术——表面加强激光解析电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption／ionization—time of flight—mass spectra，SELDI-TOF—MS)。该技术将蛋白质芯片和质谱技术相结合，集样品分离、纯化、检测和数据分析为一体，具快速和高通量，成为目前蛋白质表达及蛋白质组学研究的有力工具。其可望为众多疾病的机理阐明及攻克提供理论依据和解决途径，在临床疾病诊断和防治方面发挥重要作用，显示了良好的发展前景和广泛的应用前景。本文对蛋白质芯片-飞行质谱技术的原理、特点及部分疾病的基础和临床研究等进行文献综述。     

表面加强激光解析电离-飞行时间-质谱技术在急性重症胰腺炎预后相关蛋白质谱检测中的应用

目的 应用蛋白芯片表面加强激光解析电离-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测急性重症胰腺炎不同预后相关蛋白质谱,探讨急性重症胰腺炎轻重程度及预后评估的新方法.方法 用SELDI-TOF-MS方法检测浙江省人民医院2008年3月至2010年10月23例急性重症胰腺炎患者的蛋白质谱,按是否发生器官功能衰竭、胰腺脓肿、腹内压异常、死亡将全部患者分组进行蛋白指纹图谱比较.结果 蛋白质峰谱特征显示,在1094 u、2751 u、5904 u处并发胰腺脓肿(13例)的重症胰腺炎患者峰值(13.21±3.73,45.62±10.31,48.37±9.24)明显高于未并发胰腺脓肿组(70例)(4.33±1.79,8.87±3.21,4.45±1.59),差异有统计学意义,均P<0.05.在635 u并发器官功能衰竭组(11例)峰值(8.56±3.21)明显低于未并发器官功能衰竭组(12例)(37.82±12.65);而在4103 u、4187 u处并发器官功能衰竭组(21.63±8.23.9.81±2.32)峰值则高于未并发器官功能衰竭组(3.32±1.29,1.14±0.49).在4173 u处并发腹内压增高组(10例)峰值(8.94±3.58)明显高于无腹内压增高组(13例)(1.97±0.73);而在5635 u处并发腹内压增高组峰值(0.62±0.23)则低于无腹内压增高组(15.78±6.34).2例死亡患者蛋白指纹表现为血清蛋白全面合成功能减退,峰值降低.结论 蛋白指纹图谱技术可筛选出有意义的生物标记蛋白,为急性重症胰腺炎并发症的早期诊断与治疗提供了新的路径,对急性重症胰腺炎预后评估具有重要意义.

Abstract：

Objective To analyze the serum proteomic pattern in different severe acute pancreatitis complication by surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS) for evaluating the stage and prognosis of severe acute pancreatitis. Methods Serum samples were collected from 23 severe a-cute pancreatitis. Serum from organ nonfunction, pancreatic abscess, intra-abdominal hypertension and death were profiled using WCX Proteinchip and analyzed by mass spectrometry. Results Protein peak in the spectrum characteristics showed that at 1094u, 2751u, 5904u, the peak value of concurrent pancreas abscess pancreatitis [13.21 ± 3.73, 45.62±10.31, 48.37±9.24] were significantly higher than those in none-pancreas abscess group [4.33 ± 1.79, 8. 87 ±3.21, 4.45 ±1.59] (P<0.05). At 635u, the peak value of concurrent organ failure group(8.56 ± 3.21) was obviously lower than those in none-organ failure group(37.82 ± 12.65). At 4103u and 4187u, the peak value of in complicated organ failure group [21.63 ±8.23, 9.81±2.32] were higher than those in none-organ failure group [3.32±1.29, 1.14 ±0.49], At4173u, the peak value of concurrent increased intraabdominal pressure group(8.94 ±3.58) was significantly higher than that in none-intraabdominal pressure group(1.97 ±0. 73) , while at 5635u the peak value of concurrent increased intraabdominal pressure groups ( 0. 62 ± 0. 23 ) was lower than that without intraabdominal pressure group (15.78 ±6.34). Two cases died. Protein fingerprints showed that overall serum protein composite function dropped and the peak value reduced. Conclusion Proteomic technology can significantly identify novel significant biomarkers in the serum, which provides a new way to diagnose and treat the different complication of severe acute pancreatitis early and has clinical significance in evaluating the prognosis of severe acute pancreatitis.     

蛋白质芯片SELDI—TOF MS技术在肿瘤蛋白质组学的研究进展

20世纪90年代开始实施的人类基因组计划（Human Genomic Project），完成了大量的基因序列的测定，在基因结构和遗传学以及疾病与基因的关联上取得了很大的进展。随着基因计划的完成，生命科学已进入后基因时代，研究的重点已从揭示生命所有遗传信息转移到从整体水平上对生物功能的研究。而以生命功能的主要执行者和体现者——蛋白质为研究对象的蛋白质组学（proteomics）就显得越来越重要了。其中肿瘤蛋白质组学是从细胞整体水平上认识在肿瘤的发生、发展过程中蛋白表达谱的变化。     

表面增强激光解吸电离—飞行时间—质谱技术在肿瘤早期诊断中的应用进展

基因革命创造了一个关于明确细胞内部运作的基本遗传密码的信息财富。蛋白质是基因表达的最终产物,故了解蛋白质的功能将有利于新型药物靶标的发现,以及崭新的特异性治疗方法。蛋白质组学(proteomics)作为分析化学的一个新领域,主要目标是通过肽类或蛋白类的高表达或低表达,评估那些可以区分健康样本和病患样本,并且可以作为早期诊断的疾病相关肿瘤标志物,同样其可以作为疾病进展的测定指标。蛋     

蛋白质芯片在药学中的应用蛋白质芯片在药学中的应用

随着生物芯片技术的发展，蛋白质芯片的制备和应用技术已获得突破性进展，不仅在蛋白质芯片制作方面引入机器人制作和商品化玻片载体，而且较成功的解决了蛋白质固相表面的固定问题，为蛋白质芯片的进一步发展奠定了基础。UetZ等使用酵母双杂交系统构建蛋白质芯片，首次把蛋白质     

SELDI技术研究白喉毒素对豚鼠肝脏组织蛋白质组的毒理作用

作为蛋白质组学新的研究技术,表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)具有快速、简单和灵敏等优点,它不仅可在肿瘤诊断中用于发现标志物、观察治疗效果,还可用于研究蛋白质的修饰、相互作用、信号传导和酶促调节等[1-3],从而实现在蛋白质水平的大规模功能研究.目前该技术主要应用于肿瘤的早期诊断,而在毒理学方面的应用几乎为空白.白喉毒素(DT)作为融合靶向性抗肿瘤药物[4-6],也是近期的研究热点.为拓展SELDI技术在毒理学的应用,我们使用该技术,研究了DT染毒豚鼠与正常豚鼠肝脏组织蛋白质组的差异,从而探讨DT的毒理作用和可能的作用机制.     

蛋白质芯片及其在蛋白质组研究中的应用

对在蛋白质组研究中发挥巨大作用的新技术蛋白质芯片的基本组成、特点、使用方法及应用等方面做了简要介绍，并展望了今后的发展前景。由于蛋白质芯片的超微量、全自动化的高通量筛选功能的优点，必将成为蛋白质组学研究的强有力的工具。     

应用SELDI—TOFMS技术筛选乳腺癌蛋白标志物

目的：应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术（ SELDI-TOF MS）筛选乳腺癌的特异性蛋白标志物,建立诊断模型。方法用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪及CM10蛋白芯片检测35例乳腺癌患者标本及53例对照组标本（包括35例乳腺良性病变和18例正常人）的血清蛋白指纹图谱,Ciphergen Proteinchip 软件自动采集数据,Ciphergen Biomaker Wizard 软件筛选差异蛋白,Biomarker Pattern软件建立乳腺癌的分类树诊断模型。结果乳腺癌组及对照组血清蛋白质谱图共检测到59个蛋白质峰,其中19个蛋白峰表达差异具有显著性（P＜0．01）。以2个蛋白质峰（质荷比分别为M6636．62,M13889．6）建立的诊断模型,诊断的准确率达到94．3％,灵敏度和特异度分别为80．0％和71．7％。结论 SELDI-TOF MS技术可用于乳腺癌特异性蛋白的筛选,为其快速诊断奠定基础。     

蛋白芯片的研究及其在生物毒素检测方面的应用

随着生物芯片技术的迅猛发展，DNA芯片已被应用于各种已知和未知的核酸序列表达的检测和研究中。虽然DNA芯片的技术已很完善，但这种以核酸为基础的芯片检测只能提供间接的信息。而我们要了解蛋白与蛋白之间，蛋白与DNA之间的相互作用，必须对蛋白质的功能进行更深入的研究。传统方法，如免疫亲和法、液相色谱及电泳分离技术等已成功地用于蛋白质的分析，     

甲壳素及其衍生物在医药敷料中的应用进展

甲壳素，又称甲壳质、几丁质，是天然多糖类高分子物质，化学名为β-1，4-2-乙酰氨基-2-脱氧-D-葡萄糖，分子式（C8H13NO5）a，不溶于水、稀酸、稀碱和一般有机溶剂，具有α、β、γ三种晶型，广泛存在于虾蟹壳、昆虫外壳、真菌细胞壁、植物细胞壁中。甲壳素经脱乙酰基后的产物称为壳聚糖，也称几丁聚糖、脱乙酰甲壳素、可溶性甲壳素、甲壳胺等。     

PCR技术在医学检验中的应用现状

聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction，PCR)又称体外基因扩增技术或DNA扩增技术。自1985年美国PE-Cetus公司的Mullis等首创PCR技术以来，它以惊人的速度被广泛应用于医学及分子生物学等各个领域。现今，PCR技术已成为一种对标本中特定的DNA片段进行分析研究和检测鉴定的重要方法。近20年来PCR技术在生物医学等各个研究领域和临床应用中发挥了重大的作用，在病原体鉴定、遗传病诊断、免疫学研究、癌基因探索及治疗等方面都作出了相应的贡献。     

液相芯片技术在医学检验诊断中的应用

液相芯片技术可以从少量样本中快速得到大量的辅助诊断信息,正逐步从科学研究实验室进入临床实验室,在多种肿瘤标志物联合检测、自身抗体筛查、人类白细胞抗原分型及感染性病原体基因检测等方面具有重要的临床应用价值。现就液相芯片技术在医学检验中的应用做一综述。     

医药学领域量与单位的使用正误

医药学领域使用的量与单位数量大而复杂，在规范化使用方面问题较多，下面就几个常用量与单位的使用进行讨论。 1 使用已废除的单位 1.1 人体液压计量单位mmHg 医学上表示人体液压的计量单位原习惯使用mmHg，cmH2O等。1993年颁布的国家法定量与单位规定：mmHg等表示人体液压的计量单位均应换算为法定计量单位kPa，但在执行过程中遇到了很多困难。许多医学人士对此提出异议。为此，卫生部与国家技术监督局联合发文，对于人体液压计量单位的使用提出以下原则：①在非出版物中可以使用mmHg或kPa；②在出版物中可以使用kPa或mmHg，如使用mmHg，一定给出与kPa之间的换算系数；③用于对外交流的可以使用mmHg或kPa。这意味着mmHg与kPa将会共存一段时间。     

微流控芯片及其在肿瘤研究中的应用进展

微流控芯片具有微型化、集成化、效率高、试剂消耗量小等特点,在细胞水平药物筛选及仿生器官方面的研究取得了一系列成果。本文着重介绍了微流控芯片的加工材料和制作技术,以及在肿瘤研究领域的应用和最新研究进展,并提出了微流控芯片领域存在的问题及解决问题的方法。