基于网络药理学探讨真武汤治疗慢性心力衰竭作用机制

目的基于网络药理学探讨真武汤治疗慢性心力衰竭(Chronic Heart Failure,CHF)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)筛选出真武汤的有效成分及作用靶点的相关信息;使用Genecard查找与CHF相关的疾病靶点;使用R及Venn Diagram得到药物与疾病相互作用的靶点;使用Cytoscape 3.6.1软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络图;用String构建PPI蛋白网络互作图;对预测靶点进行基因本体(GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果真武汤的药物有效成分59种,作用于CHF的分子24个,靶标48个,富集到92个基因功能,代谢通路85条。结论真武汤中治疗慢性心力衰竭的主要成分包括甾醇类、芍药苷类、常春藤苷、山奈酚及儿茶酚胺等。主要作用于IL-6、MAPK8、CASP3、Re LA、ESR1等靶点,主要通过辅因子结合(cofactor binding)、核受体活性(nuclear receptor activity)、类固醇激素受体(steroid hormone receptor activity)、神经递质受体活性(neurotransmitter receptor activity)、类固醇结合(steroid binding)等功能作用于流体剪切力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号通路、细胞凋亡、白介素-17、NF-κB、p53、卵巢类固醇生成等相关通路。真武汤通过多有效成分、多靶点、多生物途径及多通路方式协同抗心力衰竭。其结果需要通过实验进一步论证。     

基于网络药理学和分子对接方法探讨黄芪多糖治疗慢性心力衰竭作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接方法分析黄芪多糖治疗慢性心力衰竭的分子生物学机制.方法 利用Swisstarget数据库筛选出黄芪多糖活性成分的作用靶点,利用GeneCards数据库筛选慢性心力衰竭疾病作用相关靶点.利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape构建蛋白互作网络进行可视化分析,利用Da...     

基于网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭的潜在机制

目的:利用网络药理学探讨防己黄芪汤治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在机制.方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索防己黄芪汤的药物活性成分及其相关靶点,并通过全球蛋白质资源(Uniprot)数据库进行基因的标准化处理.通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、基因卡片(GeneCards)数据库检索得到CHF的...     

基于网络药理学的黄芪抗心力衰竭作用机制

目的 基于网络药理学研究黄芪抗心力衰竭的作用机制。方法 采用活性成分筛选与靶点预测技术,结合生物信息学手段,预测黄芪抗心力衰竭的潜在作用靶点,并进行信号通路分析,从而探讨其治疗心力衰竭的分子机制。结果 在TCMSP数据中搜索筛选得到20个相应黄芪化学成分,同时利用靶点预测技术共筛选出相关靶点121个。同时在疾病基因数据库检索得到10 962个与心力衰竭发生、发展有关的已知靶点基因,利用string数据库和Cytoscape软件中的网络拓扑分析共筛选获取关键靶点8个。GO富集分析显示,黄芪可通过参与细胞能量代谢、血管内环境变化、神经活性配受体作用、激素活性等10个生物功能的PI3K/AKT、p38丝裂原活化蛋白激酶(p38MAPK)和MAPK/NF-κB等10条关键信号通路发挥抗心力衰竭的作用。结论 中药黄芪抗心力衰竭的作用具有多成分、多靶点、协同作用的特点。     

基于网络药理学探讨五苓散治疗心力衰竭作用机制

目的根据网络药理学方法对五苓散治疗心力衰竭(HF)的作用机制进行研究探讨。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对五苓散进行活性成分及靶点筛选,检索与疾病靶点有关的数据库TTD、Pharmg KB、Dis Ge NET筛选HF的作用靶点,构建韦恩图得到五苓散治疗HF的作用靶点,使用Cytoscape 3.7.1建立成分-靶点-疾病网络,基于DAVID数据库对靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果基于TCMSP得到五苓散治疗HF的30种活性成分和58个潜在靶点,构建韦恩图得到交集核心靶点26个,GO功能富集分析得到条目163个,其中生物过程条目118个、细胞组成条目15个、分子功能条目30个;KEGG通路富集分析得出条目46个,主要包括细胞凋亡、钙离子信号通路、HIF-1信号通路、PI3K-AKT信号通路等。结论基于网络药理学初步探讨并验证了五苓散治疗HF多成分-多靶点-多通路的整体调节作用特点,预测了五苓散治疗HF的潜在作用机制,以期为其活性成分研究与实验研究提供科学依据。     

基于网络药理学探讨人参治疗心力衰竭的作用机制

目的 运用网络药理学方法预测人参治疗心力衰竭(heart failure,HF)可能的作用机制.方法 通过中药系统网络药理学数据库与分析平台(TCMSP)及文献资料筛选中药人参的有效成分及作用靶点,然后通过GeneCards数据库筛选HF的靶标;使用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用分析网络;再利用Cytos...     

基于网络药理学探索真武汤治疗慢性心力衰竭作用机制研究

目的使用网络药理学的研究方法对真武汤治疗慢性心力衰竭的作用机制进行研究探讨。方法在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选真武汤的活性化合物成分,运用Perl编程语言以及通用蛋白(Universal Protein,uniprot)数据库得到真武汤的基因靶点;在GeneCards数据库检索和筛选慢性心力衰竭相关疾病基因靶点进行检索,使用R语言筛选出共同的靶点并构建韦恩图;应用Cytoscape 3.7.1软件构建"活性成分-靶点"网络图;将共同靶点输入功能蛋白关联网络STRING数据库,获得蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络模型;使用R语言对"活性成分-靶点"相互作用网络图中的核心靶点基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果预测得到真武汤活性化合物成分中51种以及潜在靶点381个;得到慢性心力衰竭疾病相关靶点980个,得到真武汤-慢性心力衰竭共同靶点20个,度值较高的活性成分包括β-谷甾醇(β-sitosterol)、山柰酚(kaempferol)、石防风素(deltoin)等,度值较高的靶点蛋白包括前列腺素内过氧化合物合酶(PTGS1)、核受体亚家族3组C成员2(NR3C2)、毒蕈碱型乙酰胆碱受体亚型3(CHRM3)、乙酰胆碱酯酶(ACHE)等;PPI网络中的核心基因包括白细胞介素-6(IL-6)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-3(CASP3)、丝裂原活化蛋白激酶-8(MAPK8)、细胞间黏附分子-1(ICAM1)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)等;共同作用靶点主要富集于21种生物功能与61条信号通路上。结论通过运用网络药理学的研究方法我们发现真武汤治疗慢性心力衰竭具有多靶点、多通路的特点,从抑制炎症反应、调节免疫功能及调控细胞凋亡等多个机制治疗慢性心力衰竭。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗支气管哮喘的作用机制

目的 采用网络药理学方法探讨黄芪治疗支气管哮喘可能的作用机制.方法 基于中药系统药理学数据库与分析平台获取黄芪活性化学成分及其对应靶点,通过Genecards数据库获取支气管哮喘相关靶点,将黄芪靶点与疾病靶点映射得到黄芪作用于支气管哮喘的潜在靶点.在Cytoscape软件中构建黄芪-化合物-靶点-疾病网络,采用STRI...     

基于网络药理学预测真武汤防治慢性心力衰竭的作用机制

目的:预测真武汤治疗慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)的作用机制。方法:运用中药系统药理学分析平台数据库获取真武汤的主要化学成分及靶标基因,CHF的靶标基因从Gene Card数据库收集,取二者交集构建化合物-靶点网络,网络可视化结果分析通过Cytoscape 3.7.1软件展示,蛋白质间相互作用网络构建使用STRING操作并筛选出核心网络,借助DAVID数据库进行基因本体功能(gene ontology,GO)分析和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,从而探究真武汤治疗CHF的作用机制。结果:检索到真武汤的59个化合物,其中15个靶点与CHF相互关联。GO富集分析得到24条相关条目,真武汤可能是通过调节各种蛋白受体活性、内切酶活性、胆碱能受体活性发挥治疗作用;KEGG富集分析结果表明真武汤共涉及了110条信号通路,表明真武汤可能通过凋亡信号通路、P53信号通路、PI3K-Akt信号通路、NF-kappaβ信号通路、TNF信号通路等干预细胞凋亡、抑制促炎因子的基因表达从而达到治疗CHF的作用。结论:本研究预测结果表明,真武汤对CHF的防治作用为多成分、多靶点、多通路、多选择的复杂过程,且主要通过影响细胞凋亡通路等代谢途径起效。     

基于网络药理学探讨黄芪-黄连药对治疗冠心病作用机制

目的 通过网络药理学方法探讨黄芪-黄连药对治疗冠心病的作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索黄芪-黄连药对的化学成分和作用靶点,通过Cytoscape 3.7.1绘制活性成分-靶点网络图.利用DisGeNET、GeneCards数据库检索冠心病相关靶点,取交集靶点上传至STRING11.0...     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗慢性盆腔炎作用机制

目的基于网络药理学探讨当归芍药散治疗慢性盆腔炎的作用机制。方法利用TCMSP数据库筛选出当归芍药散活性成分及其相关靶标基因;使用Genecards数据库筛选慢性盆腔炎靶标基因;借助STRING在线数据库获取靶标基因相互作用关系;采用David数据库进行GO生物学过程分析和KEGG通路功能富集分析;利用cytoscape软件构建当归芍药散治疗慢性盆腔炎"活性成分-作用靶标-通路"网络。结果当归芍药散的核心活性成分有山示木酚、β-谷甾醇等,核心作用靶标有PTGS2、TNF、JUN等;GO生物学过程分析结果表明当归芍药散活性成分的基因功能主要表现在药物反应、RNA聚合酶II启动子转录的正调节、凋亡过程的负调节、信号转导等生物学过程; KEGG结果表明当归芍药散主要作用与TNF、Toll样受体等信号通路有关。结论当归芍药散活性成分山柰酚、β-谷甾醇等可能通过TNF、Toll样受体等信号通路作用于PTGS2、TNF-α、JUN、IL-6等关键靶标基因进而发挥其临床功效,达到治疗慢性盆腔炎等疾病的目的。     

基于网络药理学分析“黄芪-葶苈子-防己”治疗心力衰竭的作用机制

目的采用网络药理学方法分析泻肺利水法核心药物黄芪-葶苈子-防己治疗心力衰竭(Congestive heart failure,CHF)疾病的主要有效化合物及作用机制。方法通过TCMSP数据库获取黄芪、葶苈子、防己的主要化学成分及其靶点,根据ADME筛选中药活性组分;通过Gencards、OMIM数据库及Disgenet数据库获取CHF主要靶点;利用Cytoscape 3.7.1软件中Bisogenet插件进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络并挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块。利用R 3.6.1中的ClsuterProfiler程序包对关键作用靶点进行GO注释分析和KEGG通路分析。结果 黄芪-葶苈子-防己治疗CHF的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、7-O-甲基异麦芽糖醇、异鼠李素、β-谷甾醇等,核心靶点有MAPKs、JUN、Akt等,生物学通路主要作用于AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等。结论 黄芪-葶苈子-防己药对的核心活性成分槲皮素、山柰酚、7-O-甲基异麦芽糖醇等,可能通过MAPKs、JUN、Akt等靶点及AGE-RAGE、PI3K-Akt、TNF等信号通路改善CHF,为进一步深入研究该药对的作用机制及基础研究提供了科学依据。     

基于网络药理学探讨加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭的潜在靶点及作用机制

【目的】利用网络药理学预测加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭（CHF）的潜在靶点及其作用机制。【方法】通过TCMSP和BATMAN数据库获取加味参附颗粒的相关活性成分和靶点,通过GeneCards、DisGeNET数据库遴选慢性心力衰竭相关的靶点,取交集靶点;运用STRING数据库进行靶蛋白互作分析。运用Metascape数据库对药物-疾病共同靶点进行基因本体论（GO）和京都基因与基因百科全书（KEGG）富集分析。运用Cytoscape 3.9.1软件构建成分-靶点-通路网络图。【结果】筛选出加味参附颗粒中42个活性成分和435个直接作用的蛋白靶点,得到38个药物-疾病交集靶点。GO与KEGG富集分析结果显示,加味参附颗粒在血液循环、清除氧自由基、平滑肌细胞的调节、细胞和基因调控等多生物过程方面,通过IL-6、RELA、TNF、VEGFA、MMP-2、MAPK8、TP53、EDN1、MMP-9等核心靶点,流体剪切应力与动脉粥样硬化途径、AGERAGE、HIF-1、MAPK、IL-17、TNF、cAMP、钙等信号通路治疗慢性心力衰竭。【结论】加味参附颗粒可通过改善心脏供血、抑制炎症反应、抗氧化...     

基于网络药理学探讨何首乌治疗动脉粥样硬化作用机制

目的:基于网络药理学,探讨何首乌治疗动脉粥样硬化(AS)的作用靶点及通路,明确其作用机制。方法:搜索中医药数据库和文献,从中对何首乌有效成分及靶点蛋白进行筛选整合,在TCMSP数据库和Drugbank数据库中检索并获取何首乌有效成分及作用靶点,在Cytoscape软件中构建何首乌的化合物-靶点网络及其相应的蛋白质相互作用(PPI)网络,并在DAVID数据库中进行基因GO功能和KEGG通路富集分析。筛选出何首乌治疗动脉粥样硬化的有效成分及作用靶点,并绘制靶点通路网络模型。结果:预测得出治疗AS的药物活性成分8个和有效靶点109个,并推断奎硫醇、大黄酸、扁蓄苷等成分具有潜在治疗动脉粥样硬化的作用,如钙调蛋白、醛糖还原酶、胰蛋白酶等靶基因可能起着关键性的作用。结论:基于网络药理学探究了何首乌治疗动脉粥样硬化多活性成分-多作用靶点-多联系通路的特点,进行深入研究,以期为系统阐明何首乌治疗动脉粥样硬化作用机制提供科学依据。     

基于网络药理学探讨生脉散治疗心律失常作用机制

目的:基于网络药理学探讨生脉散治疗心律失常的分子机制.方法:使用TCMSP和TCMID数据平台筛选生脉散的有效成分,TCMSP及STITCH数据库筛选药物作用靶点,通过TTD、DRUGBANK及DisGeNET数据库检索心律失常的疾病靶点.制作韦恩图获得相关交集,使用String数据库制作靶点间相互作用网络,并依据置信...     

基于网络药理学探讨麻黄治疗儿童哮喘作用机制

目的:利用网络药理学相关资源研究麻黄治疗儿童哮喘的作用机制,以期为临床研发儿童哮喘药物提供新的思路和方向。方法:利用BATMAN-TCM数据库获取麻黄的活性成分及靶点,于人类基因组注释数据库Gene Cards检索儿童哮喘的靶标基因,筛选出两者共同的靶标基因,视为麻黄治疗儿童哮喘的潜在靶点,运用STRING平台构建这些潜在靶点蛋白之间相互作用的网络模型,使用DAVID数据库进行潜在靶点的GO分析和KEGG通路富集分析。结果:麻黄治疗儿童哮喘的活性成分共有104个活性成分,即麻黄素、麻黄碱、去甲基麻黄碱、毛果碱、伪麻黄碱、乙酸薄荷酯、亚油酸、芹菜素等,潜在作用靶点432个,主要涉及Ras signaling pathway、PI3KAkt[磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B信号通路,Phosphatidylinositol-3kinase(P13K)-protein Kinase B(AKT)]、MAPK(丝裂原活化蛋白激酶信号通路Mitogen-activated protein kinase)、Rap1 signaling pathway、TNF signaling pathway、HIF-1 signaling pathway 6条通路。结论:麻黄治疗儿童哮喘的作用机制可能是通过共同调节Ras、PI3KAkt、MAPK、Rap1、TNF、HIF-1等信号通路,作用于NFKB、IL-2、IL-4,IL-6、IL-9、IL-13、EGFR、AR、BCL2等相关受体,进而促进嗜酸性粒细胞、肥大细胞、中性粒细胞等多种细胞的凋亡,抑制炎症因子释放,降低血管壁通透性,减轻局部组织肿胀,从而进一步抑制炎症反应,避免气道重塑以及气流受限。     

基于网络药理学探讨柴胡治疗动脉粥样硬化作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨柴胡治疗动脉粥样硬化的有效活性成分及靶点的作用机制.方法 该研究运用TCMSP数据库结合筛选条件确定柴胡的主要有效活性成分及其作用靶点,构建主要有效活性成分-靶点网络图.利用GeneCards数据库获取动脉粥样硬化疾病靶点,取柴胡和动脉粥样硬化的交集靶点,对交集靶点进行蛋白质互相作用网络分析...     

基于网络药理学研究丹参干预心力衰竭作用机制

目的 基于网络药理学方法阐明丹参干预心力衰竭的主要活性成分、作用靶点及信号通路,揭示其作用机制.方法 依据中药系统药理学分析平台(TCMSP)挖掘丹参的活性成分与对应靶点,以药动学参数(生物利用度OB≥30％、类药性DL≥0.18、半衰期HL≥4)为条件进行筛选;运用CTD、TTD、Drugbank等数据库收集与疾病相...     

基于网络药理学探讨小青龙汤治疗慢性肾小球肾炎的潜在作用机制

[目的]运用网络药理学方法探讨小青龙汤治疗慢性肾小球肾炎的潜在作用机制.[方法]借助中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)收集小青龙汤的活性化合物及其作...