多重定量PCR法同步检测HBV、HCV和HIV-1在血液筛查中的优化及应用

目的 初步探讨多重定量聚合酶链反应（PCR）同步检测乙型肝炎病毒（HBV） DNA,丙型肝炎病毒（HCV） RNA及人类免疫缺陷病毒（HIV）-1 RNA在血液筛查中的应用前景.方法 选择2012年8月至12月,于孝感市中心血站志愿献血的合格献血者血样中,经2次酶联免疫吸附法（ELISA）检测HBV表面抗原（HBsAg）、抗HCV及抗HIV-1,检测结果均呈阴性的4 800份血样为研究对象.采用全自动核酸混合提取仪对该4 800份血样进行核酸提取,然后利用多重定量PCR方法对血样中HBV、HCV及HIV-1进行同步扩增检测.采用中国药品和生物制品检定所提供的HBV DNA、HCV RNA及HIV-1 RNA标准参考品,检测多重定量PCR的灵敏度,并与单重定量PCR的灵敏度进行比较.在HBV、HCV及HIV-1 3者中任意1种病毒基因组浓度较高的条件下,对多重定量PCR检测另2种低浓度病毒基因组的能力进行评估.结果 增加多重定量PCR中c-MMLV逆转录酶和Hot Taq酶的用量,并适量加入单链结合蛋白（SSB）,可使其扩增效率提升至单重定量PCR扩增水平.本组4 800份血样中,经多重定量PCR检测出3份HBV DNA阳性样品,ELISA漏检率为0.062 5％,未发现HCV RNA和HIV-1 RNA阳性样品;多重定量PCR检测HBV DNA、HCV RNA及HIV-1 RNA在95％置信区间的灵敏度浓度分别为115 IU/mL、376 IU /mL和232 IU /mL;单重定量PCR检测HBV DNA、HCV RNA和HIV-1 RNA在95％置信区间的灵敏度浓度分别为51 IU /mL、94 IU /mL和78 IU/mL.结论 本研究初步建立了对献血者血液同时进行HBV DNA、HCV RNA及HIV-1 RNA检测的多重定量PCR检测方法;该检测体系经过进一步优化后,有望应用于临床大规模血液病毒筛查.     

全自动血液核酸筛查及阳性献血员追踪的研究

目的 建立献血者全自动核酸检测方法，探讨在我国血液筛查中引进全自动核酸筛查方法的可行性。方法 在酶联免疫吸附实验（ELISA）筛查血液基础上，选用全自动汇集仪进行血样汇集（24人份），在全自动核酸提取仪上提取样本核酸，应用聚合酶链反应（PCR），在COBAS AMPLICOR进行扩增和检测结果，用国际标准核酸质控品考评检出限量，对阳性献血者追踪检测。结果经考评及常规应用表明，全自动汇集、全自动核酸提取及扩增和检测95％的检出限量HBV DNA、HCV RNA和HIV-1 RNA分别为38．9、17．4IU／ml和20．6拷贝／ml，95％的可信限分别为[21，323]、[10．5，342]和[12，300]。通过对16512个样本共688汇集池分析，HBVDNA阳性8例，阳性率为0．048％，其中7例为Anti-HBc阳性，其余1例亦转换为阳性。HCV RNA和HIV-1 RNA未检出阳性，6例HBV DNA阳性样本追踪发现，3例发生了血清转换现象。结论本实验结果认为全自动血样汇集，全自动核酸提取扩增和检测方法可应用于血液的筛查工作。     

核酸扩增检测技术在血液筛查中的应用

目的探讨核酸扩增检测技术在血液筛查中的应用价值。方法用酶联免疫吸附试验(ELISA)常规筛查血液,对免疫指标合格的血液采用美国Roche Cobas Amplicor全自动PCR诊断系统检测HBV DNA、HCV RNA和HIV-1 RNA,样本混合采用48人份×50μL汇集,采用汇集池阳性的再分拆检测。结果 70 953份无偿献血标本中,HBV DNA阳性10份(1.4/10 000),未发现HCV RNA和HIV-1 RNA阳性样本。结论血站系统采用微量标本混合方式使用核酸扩增检测技术筛查血液是可行的,能有效提高临床用血的安全。     

核酸检测技术在献血人员血液筛查中的应用

目的：采取核酸检测（NAT ）技术进行血液筛查,减少由献血者感染“窗口期”及隐匿感染献血引起的疾病传播。方法采用酶联免疫吸附法（ELISA）对54358份献血者标本进行乙型肝炎表面抗原（HBsAg）、人类免疫缺陷病毒抗体（抗-HIV）、丙型肝炎病毒抗体（HCV-Ab）检测,同时用转录介导扩增技术（TMA）进行 HBV-DNA 、HCV-RNA 检测,人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）RNA 核酸检测。结果 NAT 检测阳性 ELISA 检测阴性标本共51份。51份标本有鉴别试验结果的33份,其中32份 HBV-DNA 阳性,1份 HIV-1 RNA 阳性,HIV-1 RNA 阳性的献血者经南京市疾病预防控制中心免疫印迹法确认为 HIV-1疑似阳性（gp160和 p24±）。半年后再次回访该献血者,抽取血样送南京市疾控中心经免疫印迹法确认为 HIV-1阳性（gp160、gp120、p66、p51、gp41、p31、p24、p17＋）。结论 NAT 技术可以减少由献血者感染“窗口期”及隐匿感染献血引起的疾病传播,从而减少输血风险。     

核酸检测在血站血液筛查中的初步应用及特点

目的对酶联免疫检测阴性的样本进行核酸检测,探讨其应用特点。方法将酶联免疫检测阴性的样本按不同试剂厂家的要求进行汇集并进行核酸筛查,不同时段应用不同的核酸检测试剂,并参加卫生部临检中心和澳大利亚国家实验室的核酸检测室间质评。结果在筛查的55 543人份样本中,检出HBsAg阴性而核酸HBVDNA阳性的样本2份,未检出丙型肝炎病毒抗体和艾滋病毒抗体阴性而其相应核酸阳性的样本。卫生部临检中心室间质评结果与预期结果完全相符,国际室间质评结果HIV-1RNA完全相符,HBVDNA和HCVRNA分别有1个和2个未检出。结论我国目前核酸检测试剂的灵敏度还有待进一步提高,核酸检测还需进一步扩大检测规模。核酸检测在血站和医院应用的不同。     

p73β基因对肝癌细胞的影响

目的扩增及鉴定包含人类p73基因TAp73β转录本蛋白编码区的cDNA片段,将此片段克隆入真核表达载体,转染肝癌细胞,观察其对肝癌细胞生物活性的影响。方法从手术活体组织中提取总RNA,采用RT-PCR技术扩增TAp73β基因全长编码序列CDS（full-length coding sequence）,目的片段回收纯化后用限制性内切酶酶切及测序两种方法鉴定目的片段正确与否并检测其纯度、浓度;并转染肝癌Hep3B细胞,用MTT法进行细胞凋亡检测。结果该扩增片段经限制性核酸内切酶酶切图谱分析,与预期结果吻合,转染的肝癌Hep3B细胞出现凋亡。结论包含人类p73基因TAp73β转录本蛋白编码区的cDNA片段被成功扩增且末端带有限制性核酸内切酶XbaⅠ、KpnⅠ识别序列,它对肝癌细胞有抑制作用,从而为临床上肝癌的治疗提供了新思路。     

核酸检测技术(NAT)在献血者人类免疫缺陷病毒筛查中的应用

目的应用核酸扩增检测(Nucleic Acid Amplification Testing,NAT)技术对人类免疫缺陷病毒(human im-munodeficiency virus,HIV)酶联免疫吸附测定(Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay,ELISA)合格的献血者血液标本进行核酸检测,探讨NAT技术对缩短ELISA检测HIV感染"窗口期"的作用。方法对献血者血液标本进行HIV抗原抗体、乙型肝炎病毒表面抗原、丙型肝炎病毒抗体、梅毒螺旋体抗体2遍ELISA检测,将检测结果合格的血液标本进行核酸检测。结果在177229例ELISA检测合格的献血者标本中发现HBV DNA阳性献血者24例,HIV-1RNA阳性献血者1例,未发现HCV RNA阳性献血者。对HIV-1RNA阳性献血者追踪调查并在献血后的d4、d11、d16、d37采样检测,d4病毒载量由献血时的4.61×102copy/ml上升至5.10×104copy/ml,P24抗原和抗体仍为阴性;d11P24抗原检测阳性,HIV抗体检测仍为阴性。d16HIV抗体检测结果阳性,免疫印迹法(Western blot,WB)确证试验结果为HIV抗体不确定;d37WB确证试验结果为HIV-1抗体阳性。结论 HIV-1RNA阳性献血者,经追踪调查及对不同时间采集的标本采用各种方法学检测,证实该献血者为HIV感染早期ELISA法漏检的"窗口期"献血者。因此,NAT检测技术比ELISA检测能更进一步地缩短HIV检测的"窗口期"。     

核酸扩增技术在献血者血液筛查中的应用分析

目的探讨核酸扩增技术在献血者血液筛查中的应用价值。方法采用HBV/HCV/HIV核酸检测试剂对血站常规ELISA筛查阴性的献血者标本进行HBV DNA、HCV RNA和HIV-1RNA 3个项目的8人份汇集检测,阳性汇集池再拆分检测。结果 33 714份ELISA筛查阴性标本中,检出HBV DNA阳性标本5例,阳性检出率为0.015%,未检出HCV RNA阳性标本和HIV-1RNA阳性标本。结论核酸扩增技术应用于无偿献血者血液筛查,有助于提高献血者的血液质量,保证输血安全。     

人类免疫缺陷病毒HIV-1基因分型方法的初步构建

目的 建立一种合理、详尽、可行的HIV-1基因分型方法。方法 采集南昌地区部分男性性接触人群(MSM)人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者血浆,测量HIV病毒载量。提取其病毒RNA,设计引物并对HIV的Env区和Gag区进行反转录-聚合酶链反应。对扩增后的cDNA进行测序,比对序列并分别构建Env区和Gag区的分子进化树,确定样本的基因亚型,并分析p V3环氨基酸序列特征。结果 本研究的3例样本中,1例样本的HIV病毒载量为43.9 copies/ml,其余2例均20 copies/ml。3例样本经核酸序列分析,均鉴定为CRF01_AE亚型。结论 此HIV-1基因分型方法合理、详细,可为国内HIV分子流行病学研究提供一些参考。     

人类免疫缺陷病毒感染抗体检测窗口期血清的检出

目的　搜索高危人群中HIV抗体“窗口期”样品。方法　使用HIV抗体检测、HIV 1 p2 4抗原检测和病毒载量检测等多种方法对 1 580份高危人群血清和血浆进行筛查。结果　发现 1份样品抗体检测为阴性 ,p2 4抗原检测为阳性 ,病毒载量HIV 1RNA含量极高 ,拷贝数为每毫升 41万 (RT PCR法 )和 76万 (NASB法 )。结论　该份样品HIV抗体水平极低 ,用国内目前使用的进口和国产HIV抗体检测试剂均不能检出 ,确定其为 1份处于HIV感染抗体窗口期的样品     

Unexpected detection of DNA by nucleic acid sequence-based amplification technique

Nucleic acid sequence-based amplification (NASBA) is a technique that has been previously shown to selectively mediate the detection of RNA in microbial cells. In a series of tests, nucleic acids were extracted from Salmonella enterica serotype Typhimurium and Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, and subjected to four enzymatic treatments prior to NASBA. These enzymatic treatments were DNase, RNase, S1 nuclease, and RNase/S1 nuclease. The results obtained were different for the two bacteria. With S. enterica serotype Typhimurium, RNase and RNase/S1 nuclease abolished the NASBA signal, as expected. But with M. avium subsp. paratuberculosis RNase, S1 nuclease, and RNase/S1 nuclease had no effect on the NASBA signal, whereas DNase treatment abolished it. This indicates that in the latter bacterium, NASBA can detect DNA, and demonstrates the necessity of verifying the nucleic acid origin of a NASBA signal if detection of RNA is objective.     

拟输血手术患者混合血清样本丙型肝炎病毒核酸检测分析

目的 探讨不同数量混合血清样本丙肝病毒核酸(HCV RNA)检测在拟输血手术患者中的临床应用.方法 用酶联免疫吸附试验(enzyme linkedimmunosorbent assay,ELISA)检测单份血清样本抗-HCV,聚合酶链反应技术(polymerase chin reaction,PCR)检测单份血清样本、...     

大理市HIV感染者中HCV感染状况的研究

目的探讨人类免疫缺陷病毒(HIV)-1感染者中丙型肝炎病毒(HCV)的混合感染率,并了解HCV对HIV-1感染者CD4+T细胞计数的影响。方法采用横断面研究方法,在云南大理市招募HIV-1感染者,分别采用血清学和核酸方法检测HCV混合感染。结果在526例HIV-1感染者中,静脉吸毒者占94.3%,其余为性途径感染。86.9%(457/526)为HCV血清学检测抗体阳性,其中HCV核酸阳性者占78.3%。在HCV血清学阴性的69例中,24例HCV RNA>1 000 IU/mL。由于引入HCV核酸检测方法,现场HCV混合感染的发现率增加了4.6%(24/526),所调查的HIV-1感染者中HCV混合感染率为91.4%。HCV混合感染者的CD4+T细胞计数明显低于HIV-1单纯感染者。结论在HCV感染的高流行区或髙危人群中,HCV与HIV-1共感染率较高。筛查HIV-1感染时应加强对HCV的检测,有助于对HCV感染进行早期诊断并开展HCV的早期治疗,减少HCV对HIV-1感染者的不利影响。     

丙型肝炎病毒抗体联合核酸定量检测对丙型肝炎患者的早期诊断价值研究

目的：探讨在丙型肝炎患者早期诊断中丙型肝炎病毒抗体联合丙型肝炎病毒核酸（HCV RNA）检测的临床价值。方法对116例鼓楼医院住院及门诊丙型肝炎患者采用实时荧光定量聚合酶链反应（FQ-PCR）测定HCV RNA、酶联免疫吸附试验（ELISA）和金标法测 HCV抗体、速率法测丙氨酸氨基转移酶（ALT ）。结果116例丙型肝炎患者中,ELISA HCV抗体阳性97例（占83．6％）,HCV RNA阳性85例（占73．3％）,HCV 金标阳性77例（占66．4％）,ALT阳性69例（占59．5％）,HCV抗体和 HCV RNA联合检测总阳性率（指任-指标阳性即为阳性）为100．0％。结论 HCV抗体和HCV RNA联合检测扩大了丙型肝炎检测范围,降低了丙型肝炎的漏诊率,有利于丙型肝炎的早期诊断。     

磁珠法测定痕量肝炎病毒的研究

目的寻求灵敏而简便的肝炎病毒临床检测新方法。方法采用氧化硅包覆的磁珠同时提取肝炎病毒的DNA及RNA,结合荧光实时定量聚合酶链反应(PCR)检测乙型肝炎病毒(HBV)及丙型肝炎病毒(HCV)。结果磁珠法可以同时提取HBV-DNA和HCV RNA,磁珠法提取HBV-DNA的效率高于离心柱法和煮沸法,磁珠法提取HCV RNA的效率与离心柱法相近,但提取效率都高于煮沸法。结论将磁珠的富集分离与高灵敏度的检测手段相结合,可显著提高检测的特异性和灵敏度,且方法简便可自动化操作,可以满足大批样品肝炎病毒筛选检测的要求,适用于血液中心筛查及医院检测等领域。     

一种KRAS基因突变检测方法的建立及初步应用

目的建立一种KRAS基因实时荧光定量PCR-Sanger测序突变检测方法,并初步探讨其临床应用价值。方法以KRAS基因热点突变区域12、13密码子为研究位点设计特异性扩增、测序引物,利用已知野生型、突变型样品以TA克隆技术构建相应质粒作为标准品,建立KRAS基因实时荧光定量PCR—Sanger测序突变检测方法,并进行方法学和应用评估。结果成功构建了KRAS基因12、13密码子野生型、突变型质粒。建立了KRAS基因实时荧光定量PCR—Sanger测序突变检测方法,该方法灵敏度高（9．39×10^1copies／uL）,重复性好（实时荧光定量PCR部分批内、批间变异系数分别为1．60％、2．54％）。该法与传统Sanger测序法同时检测40例临床样品,结果符合率为100％。结论本研究成功建立了可用于临床样品检测的KRAS基因实时荧光定量PCR—Sanger测序突变检测方法。