微小RNA在心肌重塑中的作用及研究现状

<正>miRNA是一类由18～25个核苷酸(nt)组成的小分子非编码RNA(non-coding RNAs),miRNAs前体由RNA聚合酶Ⅱ转录合成,有数千个碱基对。miRNAs前体在细胞核内经RNase Drosha加工成70-100nt的发卡状前体,之后被运输至胞浆经RNase Dicer剪切加工成成熟miRNA。miRNA多通过与靶基因mRNA特定序列互补结合抑制靶基因转录后翻译和修饰[1]。     

竞争性内源RNA调控在肝癌发生发展中的作用及中药干预相关研究现状

阐述竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控在肝癌发生发展中的作用机制,并探讨中药治疗肝癌与ceRNA调控作用的关系。ceRNA的调控以miRNA为核心,在miRNA反应元件(miRNA response element, MRE)的作用下,mRNA、假基因转录本、lncRNA、circRNA等竞争性地与miRNA结合,构成ceRNA调控网络。ceRNA的调控模式在肿瘤的发生发展、转移侵袭等过程中都发挥着重要的作用。目前有关ceRNA调控肝癌机制的研究还在探索阶段,其可提高靶向预测的准确性,有效筛选潜在治疗靶点和预后生物标志物。ceRNA调控机制也是中药治疗肝癌的重要调控方式,中药有效成分干预在肿瘤治疗方面有着非常广阔的前景,而基于ceRNA调控的中医药抗肿瘤机制研究也为肿瘤的诊断和治疗提供了新的研究方向。     

竞争性内源RNA调控肝癌及中医药干预机制研究进展

长链非编码RNA(LncRNA)是长度大于200个核苷酸的非蛋白质编码转录物,近几年来的研究表明,LncRNA上具有结合microRNA(miRNA)的部分互补序列,这些互补序列通过竞争性结合miRNA,从而抑制miRNA对靶基因mRNA的表达作用。也就是说,LncRNA能够作为一种竞争性内源RNA(ceRNA),通过海绵吸附的方式与miRNA竞争性结合,从而阻止miRNA同其靶mRNA结合,进而调控蛋白质的表达水平。在临床上,肝细胞癌(HCC,简称肝癌)通常被诊断为最致命的恶性肿瘤之一,其在全球癌症相关死亡中居于前列,肝癌因其发病机制的复杂性以及对化疗药物的耐药性,使得HCC的诊断和治疗以及预后仍然不能令人满意。随着研究的不断进展,人们发现LncRNA除了可以直接参与基因的表达调控外,还能够作为一种竞争性内源RNA(ceRNA)与miRNA相互作用,从而在HCC的进展中参与调控细胞增殖、死亡以及侵袭与转移等过程。该文从LncRNA海绵吸附miRNA发挥生物学功能这个方面,归纳总结相关LncRNA在肝癌发生发展中的作用及其与中医药干预机制的研究进展,以此为肝癌的诊断与治疗提供新思路。     

甘草水提物中miRNA对人免疫细胞基因表达的影响

微小RNA(micro RNA,miRNA)是一类在转录后水平调节基因表达的非编码小分子RNA,其调控基因表达、影响细胞活性的功能已为人们所重视。近年来miRNA的跨界调控成为新的研究方向,为人们更全面地认识和了解miRNA的功能提供了新的视角。植物miRNA由于通常经过了甲基化修饰,因此较为稳定,不易降解。前期研究表明,甘草干燥药材的水煎剂中存在着丰富的小分子RNA,这为了解甘草的作用机制提供了新的思路。在本研究中,利用从甘草水煎剂中提取的小分子RNA以及合成的miRNA模拟物(mimic)作用于分离自健康人的外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC),然后利用RT-PCR对其模式识别受体(PRR)基因以及部分转录因子、信号分子和细胞因子的基因表达变化进行了分析。结果表明甘草miRNA对人免疫细胞的基因表达具有明显的调节作用,能够显著抑制T细胞分化相关基因的表达,以及炎症和凋亡相关基因的表达。这为进一步更全面地了解甘草的作用机制以及中药新药的研制带来了新的思路。     

miRNA 在宫颈癌中的研究进展

〔摘 要〕 微小 RNA（miRNA）是一类小分子的非编码调控的单链 RNA。研究发现 miRNA 泛参与细胞生长、分化发育、 增殖、凋亡、代谢等过程，与人类的多种疾病密切相关。目前，miRNA 在宫颈癌的研究尚处于初级阶段，本研究对 miRNA 与宫颈癌的发生、分化、转移、预后的相关性及其机制的研究予以综述。     

微RNA与中医药抗肿瘤研究

微RNA(MicroRNA,miRNA)是一类含量丰富的非编码蛋白(non-protein-coding)小RNA,其功能为负调控基因的表达,进而调节细胞的代谢、增殖、分化和凋亡等基本的生理过程.研究表明,miRNA的表达水平在肿瘤中发生异常改变,参与肿瘤的发生发展,具有抑癌基因或癌基因作用.miRNAs可用于某些肿瘤的诊断、分期、判断预后及治疗.在中医药抗肿瘤研究中,miRNA的调控机制能够用于中医基本理论的诠释,而且它在证候基因组研究、中药作用的靶标或阐明中药抗肿瘤的作用机制研究等方面都有重要的应用前景.     

RNAi药物与中药现代化的思考

通过梳理RNA干扰(RNAi)药物的发展历程,分析首个RNAi药物的作用机制,并结合植物药miRNA的研究进展,阐述其给中药现代化带来的启示。认为中药来源的miRNA有可能成为一类新的天然的具有生物活性的RNA干扰药物,需要予以重视和研究。     

miRNA在中医药防治肿瘤机制研究中的应用前景及意义

miRNA是一类非编码蛋白小RNA分子;近年来,大量研究已证实miRNA在肿瘤的发生、发展、转移中存在着广泛而重要的作用。利用miRNA的特性,以及中医学整体观、恒动观的思想方法,开展中医药miRNA的相关研究,对中医药防治肿瘤的研究具有重要意义和应用价值。     

非酒精性脂肪性肝病中微小RNA调控肝脂肪变性机制的研究进展

非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)与机体细胞内脂质代谢的紊乱有关,即肝细胞中脂质获取与去除之间的不平衡导致细胞质中甘油三酯(triglyceride,TG)的聚积.微小RNA(miRNA)是1类长度约为22个核苷酸片段的非编码小分子RNA,在转录后水平通...     

基于lncRNA相关ceRNA网络预测冠心病血瘀证分子调控轴

目的 通过长链非编码RNA(lncRNA)相关竞争性内源RNA(ceRNA)网络构建及分析,探讨冠心病血瘀证发生发展机制。方法 通过HMDD、DisGeNET、OMIM、GeneCards、TTD、lncRNADisease数据库查找冠心病血瘀证相关基因,并通过starBase平台构建lncRNA相关ceRNA网络,采用MCODE、MCL、GLay方法识别功能模块,基于最小结构熵确定最优模块识别方法,筛选包含lncRNA、miRNA、mRNA的模块,通过文献预测模块中潜在的调控轴。结果 ceRNA网络共有283个节点,由72个miRNA、182个mRNA、29个lncRNA和4 990个调控关系组成,共划分为11个功能模块,发现UCA1-miR-1-G6PD调控轴,其中miR-1抑制G6PD表达导致冠状动脉疾病的发生,而UCA1能够解除miR-1的抑制从而恢复G6PD正常表达。结论 UCA1-miR-1-G6PD分子调控轴与冠心病血瘀证相关;可通过ceRNA网络的模块化分析开展病证相关研究。     

人参中miRNA的提取和鉴定分析

[目的]通过Northern印迹杂交(Northern blot)验证人参中微小核糖核酸(miRNA)的存在。[方法]根据已知人参miRNA序列设计合成2条特异LNA反义寡核苷酸探针,并用地高辛标记。采用通用植物miRNA提取试剂盒提取新鲜人参Total RNA,15%变性PAGE电泳分离小RNA并检测。[结果]Northern blot表明,人参miR482和miR1439等2种miRNA均有表达。[结论]验证了人参中miRNA的存在,为研究人参的疗效机制、临床应用和剂型开发等提供新思路。     

微小RNA与妊娠的研究进展

正微小RNA(miRNA)是近年来发现的一类内源性非编码的小分子单链RNA,具有调控基因表达、稳定性好、进化高度保守的特点;miRNA普遍存在于动植物体内,其大小通常为18~25个核苷酸,可通过碱基配对的方式与靶基因上特异的碱基相结合,从而参与基因表达的转录后调节[1]。现有研究充分表明miRNA在细胞的增殖与凋亡、早期胚胎发育、脂肪代谢、神经细胞功能分化及自身免疫调节等生物过程中发挥     

急性缺血性中风阴阳类证的血清转录组学特征分析

目的:筛选急性缺血性中风阴类证、阳类证患者血清的差异表达长链非编码核糖核酸(lncRNA),微小RNA(miRNA),信使RNA(mRNA),获取基因间调控关系,从转录组学层面探讨急性缺血性中风阴类证、阳类证形成的物质基础与生物学机制。方法:使用lncRNA,mRNA及miRNA芯片微阵列,分别检测急性缺血性中风阴类证、阳类证与非中风受试者(各10例)血清中lncRNA,miRNA与mRNA的表达情况,通过联合分析,筛选出阴类证、阳类证相关的差异表达谱。对获得的差异基因进行反义lncRNA与mRNA共表达分析、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能通路分析,获取基因间调控关系,预测lncRNA的靶基因。对40例(阳类证10例,阴类证30例)样本中部分差异基因进行实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)验证。结果:227个lncRNA,54个mRNA,4个miRNA的表达与阳类证密切相关,394个lncRNA,206个mRNA的表达和阴类证密切相关。阳类证组中反义lncRNA RP11-647P12. 1和RP11-677M14. 2可能通过上调表达水平,分别调控神经元衍生神经营养因子(NDNF)和神经颗粒素(NRGN)的基因表达。通路富集显示,阴类证、阳类证之间转录组表达谱差异主要与血压调节、神经递质受体活性调节、内分泌激素调节、炎症反应、肾素-血管紧张素系统等通路相关。结论:急性缺血性中风阴类证、阳类证的lncRNA,miRNA,mRNA表达谱存在差异,阴、阳类证的表型差异可能由血压调节、肾上腺素能受体调节、肾素-血管紧张素系统以及γ-氨基丁酸(GABA)等多个通路的共同参与。转录组学特征为研究急性缺血性中风阴类证、阳类证的生物学基础提供了一定的科学依据。     

补阳还五汤对脑缺血大鼠海马组织circRNA-miRNA-mRNA转录网络的影响

目的 研究补阳还五汤对脑缺血大鼠海马组织环状RNA (circular RNA,circRNA)-微小RNA (microRNA,miRNA)-mRNA转录网络的影响,探讨其治疗脑缺血的作用机制.方法 运用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱联用仪(UPLC-Q-TOF/MS)分析补阳还五汤化学成分;SD大鼠随机分为对...     

微小RNA(miRNA)在溃疡性结肠炎研究及中医治疗中的应用

微小RNA(miRNA)是一种存在于体内、长度约为20~25个碱基,广泛参与机体生物调节的短链非编码RNA,通过与靶基因特异性结合而抑制靶基因表达,从而发挥生物学效应。溃疡性结肠炎(UC)被认为是一种慢性自身免疫性疾病,机制尚未完全阐明。近年来,越来越多的文献表明,miRNA的特异性表达与UC的致病机制存在密切的关系。本文阐述了miRNA的特异性表达与人体免疫系统,UC的发病机制及UC的临床诊断和中医治疗方面之间的最新进展。参考文献33篇。     

MicroRNA调控药用植物萜类生物合成研究进展

萜类化合物是药用植物中一类重要的次生代谢产物,对癌症、心血管疾病、疟疾和阿尔茨海默病等多种疾病有效。微RNA (microRNA,miRNA)是一种非编码单链小分子RNA,在转录后水平通过降解目标mRNA或阻断翻译发挥作用。miRNA可以通过作用于萜类生物合成途径的结构基因或转录因子调控药用植物萜类的生物合成。目前,萜类生物合成途径的上游部分研究比较清楚,很多关键酶的编码基因已经被克隆,有的酶分子的空间结构也已被解析,针对参与基因表达调控的转录因子也有一些研究,但对非编码RNA,特别是miRNA参与萜类生物合成的研究较少。对国内外近10年有关miRNA参与萜类生物合成的研究进行综述,以期为高效获取萜类活性成分和阐明萜类药效物质的生物合成提供参考。     

非编码RNA调控糖尿病肾病细胞焦亡的研究进展

糖尿病肾病（diabetes kidney disease,DKD）是糖尿病的主要并发症之一,是慢性肾脏病和终末期肾病的主要原因,其患病率在全球范围内不断上升。细胞焦亡（pyroptosis）是一种程序性细胞死亡,其特征是细胞肿胀、细胞内容物泄漏和释放炎症因子。细胞焦亡与糖尿病肾病密切相关,而其调控机制尚不明确。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),如微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circRNA)在细胞焦亡的生物学调控中起重要作用。研究发现,ncRNA可直接或间接调控细胞焦亡通路,也可形成竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)网络调控细胞焦亡,进而影响DKD的发展。该文总结了ncRNA在DKD细胞焦亡中的调控作用以及中医药通过调控细胞焦亡相关通路延缓DKD的研究进展,可为DKD的发病机制和临床治疗提供研究方向和思路。     

microRNA与肺癌关系的研究进展

微小核糖核酸(microRNA,miRNA)是一类由大小为19~24个核苷酸(Nucleotide,NT)构成的非编码小分子RNA,广泛存在于真核生物中。研究发现,miRNA通过调控相应靶基因的表达等多种途径参与肿瘤的发生发展过程。研究发现miRNA在肿瘤的能量代谢方面也有重要的作用,如参与葡萄糖、脂肪及氨基酸等的代谢。随着研究进展,越来越多的miRNA被人类发现,其功能也在不断的被发现,不同的miRNA在同一肿瘤细胞内发挥不同的作用,如作为抑癌基因或者癌基因;同一miRNA在不同细胞也会有相反的作用。这些作用的发现为人类治疗疾病,尤其是肿瘤,如肺癌的治疗提供了更多的途径。目前中医药及中药提取物的研究发展迅速,它们在治疗肿瘤中也同样发挥重要的作用。本文就不同miRNA在肺癌中所发挥作用的研究进展作一综述。     

糖尿病肾脏病竞争性内源RNA网络构建及潜在中药预测研究

目的 基于生物信息学构建糖尿病肾病（diabetic nephropathy,DN）竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ce RNA)网络，预测治疗DN潜在有效中药。方法 利用GEO数据库与R语言获取DN差异表达长链非编码RNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA)及差异表达信使RNA(differentially expressed mRNA,DEmRNA)，借助miRcode、Target Scan、miRTarBase、mi RDB数据库整合“DElncRNA-微小RNA(microRNA,miRNA)”与“miRNA-DEmRNA”调控关系，通过Cytoscape 3.7.2软件构建ce RNA调控网络，采用Metascape平台分析ce RNA调控网络主要涉及生物过程及信号通路，借助String数据库与Cytoscape 3.7.2软件获取关键基因，并将其映射到Coremine Medical数据库中，预测治疗DN潜在中药，通过TCMSP、PubChem、UniProt、SwissTargetPre...     

补肾活血方导法治疗薄型子宫内膜-肾虚血瘀证模型大鼠的全转录测序分析

目的：通过全转录组测序技术从基因层面探讨补肾活血方导法治疗薄型子宫内膜-肾虚血瘀证（KDBS-TE）的作用机制。方法：应用雷公藤多苷片灌胃联合肾上腺素皮下注射造模及干预处理后，观察各组大鼠子宫内膜病理变化，每组随机选取3个子宫组织进行全转录组测序，筛选差异表达基因，构建疾病相关的特异性内源竞争RNA(ceRNA)调控网络，并对ceRNA调控网络中的信使RNA(mRNA)进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：与空白组比较，模型组大鼠子宫内膜发育不良，子宫内膜厚度及内膜/全子宫壁厚度比值显著降低（P<0.01），模型组中18个环状RNA(circRNA)、410个长链非编码RNA(lncRNA)及7个微小RNA(miRNA)有差异表达；与模型组比较，中药导法组及补佳乐组子宫内膜形态改善，子宫内膜厚度及内膜/全子宫壁厚度值均明显增加（P<0.05），中药导法组中21个circRNA、518个lncRNA及17个miRNA有差异表达。疾病相关的特异circRNA-miRNA-mRNA调控网络包括2个circRNA、34个miRNA、593个m...