兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1等位基因多态性分析

目的分析兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1位点等位基因多态性特点。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应技术对兰州地区200名健康无血缘关系的汉族个体HLA-A、B和DRB1基因座进行分型，并与西北、北方和南方汉族、西北回族、维吾尔族和藏族人群进行比较。结果兰州汉族人群中HLA-A基因座共检出14个等位基因，以A＊02，A＊11，A＊24，A＊33，A＊30，A＊01和A＊31基因最常见；HLA—B基因座共检出32个等位基因，以B＊40，B＊15，B＊46，B＊13，B＊51，B＊60，B＊58和B＊44基因最为常见；HLA-DRB1基因座共检出13个等位基因，最多见的基因依次为DRB1＊09．DRB＊15，DRB1＊12，DRB1＊04，DRB1＊11，DRB1＊07，DRB1＊08和DRB1＊14，接近北方汉族而与南方汉族有差异，与西北回族无明显差异，但与西北维吾尔族和藏族差异有统计学意义。结论兰州地区汉族人群HLA-A、B和DRB1位点等位基因多态性与南、北汉族人群存在不同程度的差异，与西北维吾尔族和藏族差异显著。     

济南汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因高分辨多态性分析

目的 分析济南地区汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigens,HLA)-A、B、DRB1座位等位基因的高分辨多态性.方法 采用PCR-测序分型(PCR-sequence-based typing,PCR-SBT)对鲁南地区483名无血缘关系的汉族健康个体进行HLA-A、B、DRB1座位高分辨基因分型,采用Arlequin3.5软件计算等位基因频率、单倍型频率,并就常见等位基因与其他人群进行比较.结果 济南汉族HLA-A、B、DRB1座位分别检出27、56和41个等位基因,其中等位基因频率分布最高的分别是A* 11∶01 (0.1615)、B*13∶02(0.1163)和DRB1* 07∶01 (0.1763);最常见的A*-B*-DRB1*单倍型是A*30∶01-B* 13∶02-DRB1* 07∶01 (0.0867).结论 济南地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因和单倍型具有较高的多态性.     

西宁地区汉族人群HLA-A、B和DRB1等位基因多态性分析

目的：分析西宁地区汉族人群mA-A、B和DRB1位点等位基因多态性特点。方法：采用序列特异性引物聚合酶链反应技术对西宁地区73名健康无血缘关系的汉族个体mA-A、B和DRBl基因座进行分型，并与国内其他地区汉族人群进行比较。结果：西宁汉族人群中mA-A基因座共检出11个等位基因，以A02、A11、A30、A33基因最常见；mA-B基因座共检出20个等位基因，以B13、B15、B37、1740、1346、B58基因最为常见；mA-DRB基因座共检出17个等位基因，最多见的基因为DRB1＊03、DRB1＊04、DRB1＊09、DRB1＊12、DRB1＊13、DRB3、DRB4。结论：青海汉族HLA有不同于其他地区汉族的独特性。     

中国山东省威海、莱芜地区健康人群HLA-A、B、DRB1等位基因频率多态性调查

目的:分析人类白细胞抗原基因频率在山东省威海、莱芜地区健康人群中的遗传特征及其人群间分布的差异。方法:采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法对300名健康献血者进行HLA-A、B、DRB1分型。结果:共检出14个HLA-A等位基因,34个B等位基因,13个DRB1等位基因。比较威海和莱芜地区HLA人群基因频率差异为威海地区A*32基因频率显著高于莱芜地区(P<0.05),莱芜地区HLA-B*27基因频率显著高于威海地区(P<0.05)。结论:威海、莱芜地区人群很好的体现了中国北方人群的HLA基因型分布特点,同时也具有其自身的特殊性。这些比较数据为寻找HLA相合的无亲缘关系造血干细胞供者提供了重要的遗传学信息。     

山东省烟台和威海地区汉族HLA-A、B和DRB1等位基因多态性及遗传距离分析

目的 分析山东省烟台和威海地区汉族人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)-A、B、DRB1等位基因的多态性分布特征,并探讨该人群与其他人群的亲缘关系.方法 应用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针方法(polymerase chain reaction-sequence specific olignucleotide probe,PCR-SSOP)对山东省烟台和威海地区4062名无亲缘关系的汉族健康个体进行HLA-A、B、DRB1基因分型.采用Arlequin3.5软件计算HLA等位基因频率、单倍型频率和连锁不平衡参数,按内氏公式计算出不同人群之间的遗传距离,并利用Mega5.0软件构建系统发生树.结果 该人群HLA-A、B、DRB1等位基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.1).3个基因座分别检出18、33和13个等位基因,其中等位基因频率分布最高的分别是A* 02 (0.2935)、B* 15 (0.1485)和DRB1* 15 (0.1621);最常见的单倍型为A* 30-B* 13-DRB1* 07(0.0649),A* 33-B* 58、A*66-DRB1* 13、B*08-DRB1* 03呈现最强的连锁不平衡;山东省烟台和威海汉族人群与吉林省汉族人群遗传距离最小,为0.0034.结论 山东省烟台和威海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因和单倍型具有较高的遗传多态性,该人群与吉林汉族人群亲缘关系最近.     

中国汉族人群供-受者HLA-A、B、Cw、DRB1和DQB1高分辨等位基因频率分布及错配比例的研究

目的 从基因高分辨水平,分析中国汉族人群供-受者人类白细胞抗原(human leukocyte antigens,HLA)-A、B、Cw、DRB1、DQB1各位点等位基因频率和分布的多态性;及供-受者等位基因匹配情况.方法 采用基因测序分型(sequence based typing,SBT)、序列特异性寡核苷酸探针法(sequence specific oligonueleotide probe,SSOP)和序列特异性引物法(sequence specific primer,SSP),对2540名中国汉族人的(其中1168名受者,1372名供者)DNA标本进行HLA高分辨基因分型,并作统计学处理.结果 2540份样本中共检测到44种HLA-A等位基因,频率高于0.05的A*1101、A*2402、A*0201、A*0207、A*3303、A*0206、A*3001共占80.4%;81种HLA-B等位基因,频率高于0.05的B*4001、B*4601、B*5801、B*1302、B*5101共占43.0%;44种HLA-Cw等位基因,频率高于0.05的Cw*0702、Cw*0102、Cw*0304、Cw*0801、Cw*0602、Cw*0303、Cw*0302、Cw*0401共占80.3%;61种HLA-DRB1等位基因,频率高于0.05的DRB1*0901、DRB1*1501、DRB1*1202、DRB1*0803、DRB1*0701、DRB1*0405、DRB1*0301、DRB1*1101共占70.1%;22种HLA-DQB1等位基因,频率高于0.05的DQB1*0301、DQB1*0303、DQB1*0601、DQB1*0602、DQB1*0202、DQB1*0302、DQB1*0401、DQB1*0502、DQB1*0201共占87.4%.这5个位点均处于杂合子缺失状态,其中A、B、DRB1位点符合HardyWeinberg平衡(Hardy-Weinberg equi1ibrium,HWE)(P＞0.05);Cw、DQB1位点偏离HWE(P＜0.05);排除个别基因型观察值与期望值偏差较大外,这5个位点均符合HWE.在供-受者数据的比较中,HLA全相合(10/10)的比例仅22.4%;单个等位基因错配(9/10)的比例为24.6%;两个等位基因错配(8/10)的比例为26.3%.结论 中国汉族人群高分辨水平HLA-A、B、Cw、DRB1,DQB1等位基因频率及分布特点,对非亲缘造血干细胞移植供者检索有重要参考价值;并为中华骨髓库数据入库和利用提供遗传学依据.

Abstract：

Objective To analyze the allele frequencies and polymorphism of human leukocyte antigens (HLA) -A, B, Cw, DRB1 and DQB1 between donors-recipients on high-resolution typing; and to analyze the matching and mismatching proportion between donors and recipients. Methods HLA highresolution types were determined by sequence based typing (SBT), sequence specific oligonucleotide probe (SSOP) and sequence specific primer (SSP) on 2540 unrelated Chinese Han individuals including 1168 recipients and 1372 donors, then statistical analyses were carried out. Results Forty-four HLA-A alleles were detected, and among them the frequencies of A * 1101, A * 2402, A * 0201, A * 0207, A * 3303, A *0206 and A * 3001 exceeded 0.05, and accounted for 80.4%. Eighty-one HLA-B alleles were detected, and frequencies of B * 4001, B * 4601, B * 5801, B * 1302 and B * 5101 exceeded 0. 05, and accounted for 43. 0% of total. There were 44 HLA- Cw alleles, among them the frequencies of Cw * 0702, Cw * 0102,Cw * 0304, Cw * 0801, Cw * 0602, Cw * 0303, Cw * 0302 and Cw * 0401 exceeded 0.05, and were 80.3 %of total. There were 61 HLA-DRB1 alleles, the frequencies of DRB1 * 0901, DRB1 * 1501, DRB1 * 1202,DRB1 * 0803, DRB1 * 0701, DRB1 * 0405, DRB1 * 0301 and DRB1 * 1101 exceeded 0. 05, and were 70. 1% of total. Finally, 22 HLA-DQB1 alleles were detected, the frequencies of DQB1 * 0301, DQB1 *0303, DQB1 * 0601, DQB1 * 0602, DQB1 * 0202, DQB1 * 0302, DQB1 * 0401, DQB1 * 0502 and DQB1 *0201 exceeded 0. 05, and they were 87.4% of total. All the five loci were of heterozygote deficiency. The HLA-A, B and DRB1 loci conformed to Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) (P＞0. 05); but HLA-Cw and HLA-DQB1 loci did not (P＜0.05). Except several particular genotypes, all the five loci conformed to HWE. After comparing data between donors and recipients, only 22.4% of recipients found HLA matched donors (10/10); 24. 6% of recipients found single HLA allele mismatched donors (9/10); 26. 3% of recipients had two HLA alleles mismatched donors (8/10). Conclusion The characteristics of allele frequencies and polymorphism of HLA-A, B, Cw, DRB1 and DQB1 on high-resolution typing in Chinese Han population is valuable for donor searching in unrelated hematopoietic stem cell transplantation, and it provides genetic basis for donor registry and usage of donor resource for Chinese Marrow Donor Program.     

HLA-A、HLA-B、DRB1等位基因多态性与中国北方汉族肺癌患者遗传易感相关性的研究

目的探讨中国北方汉族人中HLA-A、B、DRB1等位基因与肺癌遗传易感性间的关系。方法采用测序分型技术(sequence-based typing,SBT)技术,对无血缘关系的籍贯为中国北方的140名肺癌患者及483名健康志愿者的HLA-A、B、DRB1基因进行检测。arlequin软件(ver2.000)及SPSS软件进行统计分析。结果 A*2601、B*1518、B*3802、DRB1*0401、DRB1*0402、DRB1*1201在肺癌病人中频率显著性高于正常对照,P值分别为0.021、0.001、0.015、0.021、0.010和0.046,OR值分别为3.513、3.842、2.715、3.512、13.986、1.828;HLA-DRB1*1001、DRB1*1302在肺癌病人中频率显著性低于正常对照,P值分别为0.017和0.014,OR值分别为0.135和0.122。单倍型HLA-A*0207-B*4601-DRB1*0901、HLA-A*0206-B*5101在肺癌病人中频率显著性高于正常对照,P值分别为0.034和0.006,OR值分别为2.348和3.969;单倍型HLA-A*110...     

山东地区汉族人群中HLA-A、-B、-DRB1等位基因与原因不明卵巢早衰相关性研究

目的探讨HLA-A,-B和-DRB1位点等位基因多态性与原因不明卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)的相关性。方法利用毛细管电泳测序技术(Capillary Electrophoresis),对36例汉族原因不明POF患者进行HLA-A,-B,-DRB1基因分型,并以865例山东健康汉族个体造血干细胞分型资料作为对照,分析HLA等位基因频率在两组中的分布差异。结果 POF组中HLA-A*33、HLA-B*07、HLA-B*52和HLA-B*55等位基因频率显著高于对照组(P<0.05)。HLA-A*33的等位基因频率POF组为19.44%,而正常对照组为10.17%,RR=2.18;HLA-B*07的等位基因频率POF组为12.50%,而正常对照组为5.32%,RR=2.65;HLA-B*52的等位基因频率POF组为11.11%,而正常对照组为4.10%,RR=3.06;HLA-B*55的等位基因频率POF组为5.56%,而正常对照组为1.50%,RR=4.23。结论山东汉族人群中HLA-A*33、HLA-B*07、HLA-B*52和HLA-B*55等位基因可能是POF的易感基因。     

青海土族人群HLA-A、B、DRB1基因多态性分析

目的:分析青海土族人群人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA)A、B、DRB1的基因多态性特点。方法:应用聚合酶链反应-直接测序分型(Polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR-SBT)法对土族人群中47名健康无血缘关系的个体进行HLA-A、B、DRB1基因座高分辨分型。并将青海土族人群的HLA-DRB1基因与国内其它少数民族人群进行比较。结果:检出HLA-A、B、DRB1的基因型数和等位基因数分别为34、41、42和17、28、30。这3个基因座分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。且HLA-DRB1基因座等位基因频率分布与蒙古族有相似之处,表现在基因频率较高的DRB1*04,DRB1*07,DRB1*09,DRB1*12等位基因。结论:青海土族人群具有独特的HLA-A、B、DRB1基因频率分布特征,且青海土族HLA-DRB1等位基因频率分布与蒙古族有相似之处。     

人类白细胞抗原DRB1等位基因与乙肝后肝硬化遗传易感性的研究

目的 研究人类白细胞抗原(human leucocyte antigen，HLA)-DRBl等位基因多态性与湖北汉族乙肝后肝硬化遗传异感性的关系，为寻找乙肝后肝硬化的易感基因或抗病基因提供线索。方法 应用聚合酶链反应-序列特异性引物技术对106例湖北汉族乙肝后肝硬化患者和108名正常健康对照者进行了HLA-DRBl等位基因检测，并结合临床资料进行比较分析。结果 乙肝后肝硬化组HLA-DRBl*1201／1202等位基因频率明显升高(20．28％vs6．01％，RR＝4．9878，P＜0．001)，HLA-DRBl*1501／1502等位基因频率明显下降(16．67％vs6．6％，RR＝0．3043，P＜0．05)，其他等位基因在两组之间差异无显著性。结论 HLA-DRBl*1201／1202等位基因可能是湖北地区汉族人群乙肝后肝硬化的易感基因，HLA-DRB1*1501／1502则为抵抗基因。     

儿童急性淋巴细胞白血病患者HLA-A,B,DRB1等位基因多态性研究

目的　研究北方汉族人群儿童急性淋巴细胞性白血病 (ALL)患者与HLA A ,B ,DRB1等位基因多态性的遗传关联。方法　采用聚合酶链反应 序列特异性寡核苷酸探针 (PCR SSO)方法 ,对 197例北方汉族儿童ALL患者和 5 84 1例健康脐带血样本HLA A ,B ,DRB1等位基因多态性进行研究。结果　在HLA A ,B ,DRB1等位基因中 ,儿童ALL患者的A11(18.5 3% ,χ2 =8.5 9,P <0 .0 1,RR =1.4 7,EF =0 .0 6 35 )和A2 4 (19.2 9% ,χ2 =11.6 5 ,P <0 .0 1,RR =1.5 6 ,EF =0 .0 738) ;B4 0(18% ,χ2 =1199.6 2 ,P <0 .0 0 1,RR =5 3.2 3,EF =0 .18) ,B15 (30 % ,χ2 =15 9.17,P <0 .0 0 1,RR =9.6 89,EF =0 .0 14 ) ,B5 6 (1.5 % ,χ2 =16 .17,P <0 .0 0 1,RR =5 .92 ,EF =0 .0 774 ) ,B6 7(2 .5 % ,χ2 =5 .93,P <0 .0 1,RR =2 .74 ,EF =0 .0 774 ) ,和B2 7(3.75 % ,χ2 =4 .96 ,P <0 .0 1,RR =1.81,EF =0 .0 774 ) ;DR9(18.2 1% ,χ2 =16 .0 7,P <0 .0 0 1,RR =1.74 ,EF =0 .0 774 ) ,DR12(14 .13% ,χ2 =7.12 ,P <0 .0 1,RR =1.5 2 3,EF =0 .0 4 9) ,DR14 (7.88% ,χ2 =5 .194 ,P <0 .0 5 ,RR =1.5 74 ,EF =0 .0 2 87) ,和DR16 (4.89% ,χ2 =8.5 2 7,P <0 .0 1,RR =2 .0 6 5 ,EF =0 .0 2 5 )等基因的基因频率都显著高于正常人群     

广州地区献血人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性的研究

目的:研究广州地区献血人群HLA-A、B、DRB1等位基因多态性的分布特征。方法:应用序列特异引物-聚合酶链反应(polymerase chain reaction-sequence-specific primer,PCR-SSP)高分辨试剂分型,对广州地区1691名无血缘关系的健康人群HLA-A、B、DRB1进行基因分型。结果:检出HLA-A、B、DRB1等位基因分别有37、76、43种,经统计分析这3个基因座分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05),A*02:07-B*46:01-DRB1*09:01(4.293%)和A*33:03-B*58:01-DRB1*03:01(3.284%)单体型是广州地区献血人群最常见单体型。结论:广州地区献血人群HLA-A、B、DRB1基因座单体型分布具有高度的遗传多态性且有其自身分布特点。研究获得的HLA-A、B、DRB1基因座单体型分布数据及相关遗传参数资料,为HLA在人类学、免疫遗传学、法医学和其它的组织器官移植方面的应用和科学研究提供和积累了基础资料。     

黑龙江地区人群HLA-A、B、DRB1 高分辨等位基因及单体型多态性研究

目的:研究中国造血干细胞捐献者资料库黑龙江分库无关捐献者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因和单体型频率分布特征。方法:采用PCR-测序分型技术(SBT)对13 670名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库黑龙江分库造血干细胞捐献者进行HLA-A、B、DRB1高分辨基因分型,利用计数法和最大似然性原理方法分别计算HLA-A、B、DRB1等位基因及单体型频率。结果:共观察到286个HLA等位基因,其中频率0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A*02∶01、A*24∶02、A*11∶01、DR*07∶01、DR*09∶01、DR*15∶01。1 087条A-B单体型中,22条单体型的频率高于0.01,267条单体型呈现显著的正连锁不平衡(ALD0,HF≥1.09×10-4,χ23.84),12条表现为强连锁不平衡(RLD0.80);1 329条B-DRB1单体型中,19条单体型的频率高于0.01,357条单体型呈现显著的正连锁不平衡,18条表现为强连锁不平衡(RLD0.80);4 428条A-BDRB1单体型中,1 348条单体型有意义(频率≥1.09×10-4),17条单体型频率高于0.005。结论:获得黑龙江地区人群HLAA、B、DRB1高分辨等位基因频率和单体型分布数据及相关遗传参数,等位基因和单体型的分布特征接近北方汉族人群,但具有其自身分布特征。     

西藏门巴族人群HLA-A、B和DRB1基因座多态性

目的 分析西藏门巴族HLA-A、B和DRB1 3个基因座的遗传特征，并研究其民族起源。方法应用序列特异性寡核苷酸探针反向斑点杂交技术对西藏自治区门巴族居住区47名门巴族无关个体HLA-A、B和DRB1基因座进行分型。对门巴族和我国其他11个群体(民族)的HLA-DRB1基因频率采用Neighbor-Joining(NJ)方法进行聚类分析。结果 在西藏门巴族人群中HLA-A基因座共检出23个等位基因，其中HLA-A*1101，A*2402，A*02011，A*0206基因最常见；HLA-B基因座共检出39个等位基因，其中HLA-B*3802，B*4001，B*4002，B*51011基因最常见；HLA-DRB1基因座共检出33个等位基因，其中HLA-DRB1*12021，DRB1*0403，DRB1*0701，DRB1*1201基因最常见，频率最高的等位基因分别是HLA-A*1101(0．2128)，HLA-B*3802(0．1064)和HLA-DRB1*12021(0．0851)。结论 西藏门巴族人群HLA基因座具有高度遗传多态性，聚类分析门巴族与西藏藏族遗传关系较近。     

HLA-A, -B及-DRB1等位基因的多态性与白血病易感性的关联

目的:探讨甘肃汉族人群中白血病的易感性与HLA基因多态性之间的关联。方法:采用序列特异性寡核苷酸探针杂交技术(PCR-SSO),对57例白血病患者和45例健康对照组进行HLA-A、-B及-DRB1基因分型。结果:在等位基因HLA-A、-B及-DRB1中,白血病患者的HLA-A01、-B38及-DR15基因的基因频率高于正常对照组(P<0.05),而HLA-A11及-DR03基因的基因频率明显下降(P<0.05)。结论:甘肃省汉族人群基因HLA-A01、-B38及-DR15对白血病具有遗传易感作用;而基因HLA-A11和-DR03对白血病具有遗传拮抗作用。     

HLA-A, B, Cw, DRB1, DQB1 and DPB1 alleles and haplotypes in the genetically homogenous Irish population

The frequencies of human leucocyte antigen (HLA) class I and II alleles and haplotypes of 250 Irish unrelated bone marrow donors were determined by high resolution polymerase chain reaction (PCR), using a combination of reverse line blot hybridization and PCR with sequence-specific primers. Phylogenetic analyses indicate that this Irish population is closely related to British, North-western European, American and Australian Caucasian populations. These observations are consistent with recognized historical, geographical, cultural, ethnic and linguistic relationships between these populations and suggest that Irish haematopoietic stem cell transplant recipients have a greater likelihood of finding a phenotypically matched donor within registries based on these populations. HLA-A, B, Cw, DRB1, DQB1 and DPB1 analysis confirms that this young homogenous population is characterized by features of a North-western European anthropological type with limited influence of additional ethnic haplotypes.