基于网络药理学和分子对接探讨八珍汤治疗乳腺癌的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨八珍汤防治乳腺癌的分子机制。方法 利用数据平台筛选八珍汤活性成分,利用数据库筛选乳腺癌相关靶点。以软件构建“药物-化合物-靶点”网络,并用分子对接验证有效成分与靶点亲和力。结果 筛选出八珍汤有效成分2 336个,潜在靶点211个。分子对接结果显示活性成分槲皮素、柚皮素、山柰酚与关键靶点ATK1、CASP3具有良好亲和力。结论 初步明确八珍汤治疗乳腺癌的作用机制是通过山柰酚、槲皮素、柚皮素等活性成分作用于AKT1、CASP3等关键靶点。     

苦参黄酮类化合物中GLUT4转运蛋白激动剂的虚拟筛选

目的 采用分子对接技术虚拟筛选苦参黄酮类化合物中葡萄糖转运蛋白4（GLUT4）转运蛋白激动剂。方法 搜集现已分离鉴定的128个苦参黄酮类化合物组成配体数据库,检索RCSB PDB数据库中葡萄糖转运蛋白4蛋白晶体结构并确定本研究用优势构象,以蛋白优势结构对应DrugBank中已上市的小分子药物平均打分为阈值,应用Discovery Studio 2.5（DS2.5）软件的CDOCKER模块进行分子对接。结果 虚拟筛选出打分高于阈值且排名前10%的化合物共12个并归纳了苦参黄酮作用靶点的主要活性位点,初步揭示了苦参黄酮抗糖尿病的作用机制。结论 基于分子对接的虚拟筛选可推断苦参黄酮化合物中促进GLUT4转运蛋白激动的有效成分,为进一步构效关系研究及研发基于新靶点的抗糖尿病类药物提供了一定的参考。     

基于计算机分子模拟技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂

目的采用分子对接技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂。方法研究时间为2021年1月至9月。基于过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)的PDB晶型结构(PDB Code:6md4), 构建虚拟靶标模型, 以天然产物数据库中的1 680个化合物为配体筛选对象, 以6md4原配体分子为对照。首先采用SYBYL软件对天然小分子化合物进行虚拟筛选, 随后对排名前20位的化合物进行高精度分子对接, 最后再使用PyMol软件分析结合稳定的化合物。结果根据评分结果并结合冲突、极性和相似度, 最终筛选出橙皮苷等20个小分子PPARγ激动剂, 其中橙皮苷能够与PPARγSer289、His323、Tyr327等多个氨基酸形成氢键, 结合良好。结论从天然产物中筛选出潜在的PPARγ激动剂, 为发现新型抗糖尿病的先导化合物或膳食补充剂提供基础。     

基于实验筛选和网络药理学研究二咖啡酰奎宁酸抗过敏性鼻炎的作用机制

目的 筛选黑沙蒿中有抗肥大细胞脱颗粒的二咖啡酰奎宁酸类化合物（dicaffeoylquinic acid，DCQAs），并结合网络药理学方法对活性化合物抗过敏性鼻炎作用机制进行探索。方法 通过检测细胞生存率、β-氨基己糖苷酶释放率及中性红染色建立C48/80诱导P815细胞脱颗粒的最佳方案；检测β-氨基己糖苷酶释放率筛选DCQAs；通过STITCH、Swiss、TCMID、TCMSP及GeneCards数据库收集活性化合物靶点、过敏性鼻炎和肥大细胞脱颗粒的相关靶点，获得共同有效靶点；应用String数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建化合物-潜在有效靶点的网络图；利用DAVID数据库对有效靶点进行GO （Gene Ontology）功能富集分析和KEGG （Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）通路富集分析。结果 6种DCQAs中，仅有3，5-DCQA和4，5-DCQA可显著减少肥大细胞脱颗粒；通过筛选发现18个潜在有效靶点，其中整合素β-1（integrin β-1，ITGB1）、中性粒细胞弹性蛋白酶（neutrophil elastase，ELANE）、72 kDa IV型胶原酶（72 kDa type IV collagenase，MMP2）、原癌基因酪氨酸蛋白激酶（proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src，SRC）以及caspase-3可能是中心节点；GO和KEGG分析显示活性DCQAs通过白细胞跨内皮转移信号通路、GnRH信号通路和肿瘤信号通路等参与MAPK正向调节、细胞外基质分解和整合素介导的信号通路等生物学过程。结论 3，5-DCQA和4，5-DCQA为黑沙蒿提取物抗过敏性鼻炎的潜在活性化合物，通过多靶点-多途径发挥作用，为黑沙蒿提取物治疗过敏性鼻炎提供科学依据。     

镰形棘豆总黄酮抗肾癌分子作用机制的网络药理学初探

目的 利用网络药理学和分子对接方法研究镰形棘豆总黄酮(TFOF)抗肾癌的分子机制。方法 通过SEAdatabase、SwissTarget Prediction和TargetNet数据库预测TFOF的相关靶点。从DisGeNET、NCBI、GeneCards、OMIM和GeneCLip3数据库收集与肾癌相关的靶点,通过靶点映射确定活性化合物作用于炎症的靶点。利用Cytoscape3.7.2软件,构建药物-化合物-疾病-靶点蛋白互作网络图。借助Omicshare和Metascape开放平台对交集靶点进行GO及KEGG富集分析。检测活性化合物对TNF-α诱导特殊转染的人胚胎肾293细胞(HEK-293细胞)中NF-κB抑制率的影响,以验证其抗肿瘤活性。通过Autodock软件对核心化合物和核心靶点进行分子对接验证。结果 靶点映射确定了460个镰形棘豆黄酮类化合物与炎症的共同靶点,其中,关键靶点8个(包括AKT1、TNF、SRC、VEGFA、EGFR等)。KEGG富集结果显示：TFOF的抗炎机制主要为调控cAMP信号通路、癌症中的微小RNA、VEGF信号通路等。分子对接显示核心成分与核心靶点...     

野菊花中黄酮类成分抗炎活性的虚拟筛选

目的 前期研究及文献报道均表明野菊花黄酮类成分有明显抗炎活性,但其药效物质基础和作用机制尚未明确。该研究应用分子对接技术虚拟筛选野菊花黄酮抗炎活性的药效物质。方法 搜集现已分离鉴定的34个野菊花黄酮类化合物组成配体数据库,选择IκB激酶β（IKK-β）、P38、环氧合酶 2 （COX-2）、肿瘤坏死因子（TNF）等4个与抗炎活性密切相关的靶点组成受体数据库,应用Discovery Studio 3.0 (DS3.0)软件进行分子对接。结果 通过分子对接虚拟筛选,筛选出打分总分高于阈值的黄酮类化合物共11个。结论 对比分析了原配体与野菊花黄酮作用于各靶点的主要活性位点,初步推断了野菊花黄酮抗炎活性的作用机制,为研发抗炎制剂类药物提供了一定的参考。     

基于网络药理学和分子对接探究桂枝汤治疗新冠肺炎合并变应性鼻炎的有效成分和分子靶点

目的探究桂枝汤治疗COVID-19合并变应性鼻炎的有效成分和分子靶点。方法从TCMSP、GeneCards数据库中筛选与桂枝汤、变应性鼻炎、COVID-19相关的潜在靶点。通过Draw Venn Diagram网站、String数据库、Cytoscape软件得到药物和疾病的共有靶点,生成PPI网络及“中药-活性成分-靶点”网络,并根据度值筛选核心靶点及关键成分。运用Metascape、KEGG数据库进行GO和KEGG富集分析。利用分子对接证实核心靶点与关键成分之间的亲和力。结果共筛选出127个桂枝汤的有效成分,其中有108个成分可与52个共有靶点结合并发挥治疗作用。共有靶点主要富集在1523个GO条目及145条KEGG通路中。分子对接证实核心靶点能自发地与关键成分结合。结论桂枝汤主要通过黄酮类、植物甾醇类、酚类等活性成分与共有靶点(IL-6、TNF、MAPK3等)的结合,来参与病毒、免疫、炎症相关信号通路和生物细胞过程的调节,最终达到治疗COVID-19与变应性鼻炎的目的。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨渴络欣治疗糖尿病肾病活性成分及作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接方法,探讨渴络欣治疗糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)的关键活性成分及分子机制。方法 通过中药系统药理分析平台获得渴络欣活性成分及对应靶点。通过GeneCards、OMIM数据库得到DN相关疾病靶点,筛选得到DN药物靶点。运用Cytoscape软件绘制活性成分-靶点网络图和蛋白质-蛋白质相互作用网络图,对作用靶点进行基因本体论及京都基因和基因组数据库功能富集分析。通过Autodock Vina软件对以上筛选得到的渴络欣主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果 渴络欣可通过57种活性成分作用于97个靶基因以发挥对DN的治疗作用,主要活性成分有9种,可通过影响氧化应激、炎症反应、缺氧应答、代谢调节及细胞凋亡等,调控信号通路参与到治疗过程中。分子对接结果显示槲皮素、木犀草素及毛蕊异黄酮对关键靶点的亲和力最强,可能为渴络欣中的核心作用分子。结论 渴络欣治疗DN的潜在作用机制为多靶点、多通路,其中槲皮素、木犀草素及毛蕊异黄酮可能为渴络欣中的核心作用分子。     

藏药三果汤治疗糖尿病作用机制的网络药理学与分子对接技术分析

目的 基于网络药理学及分子对接对三果汤治疗糖尿病靶点及通路进行分析，并通过分子对接进行验证，为基础研究及临床用药提供科学依据。方法 通过中药系统药理学数据库与分子平台（TCMSP）、有机小分子生物活性数据库（PubChem）及文献查阅筛选三果汤中诃子、毛诃子、余甘子的活性成分及作用靶点，使用Genecard数据库、DRUGBANK数据库筛选糖尿病相关靶点，构建“药物-成分-靶点-疾病”网络，取药物疾病靶点交集，使用STRING构建蛋白PPI网络，运用Matescape数据库对交集靶点基因进行GO、KEGG富集分析。将筛选出的有效成分与靶点进行分子对接验证。结果 通过网络药理学收集三果汤及糖尿病靶点信息，采用GO富集分析和KEGG通路分析发现，三果汤和糖尿病共同作用靶点共269个，靶点作用最为突出的为AKT1、HAS2、MAP2、CDH1、PRKCG、PLAT，三果汤作用于糖尿病的通路主要在癌症通路、脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路。分子对接结果显示，鞣花酸和没食子酸对AKT1、HAS2、MAP2存在亲和力，鞣花酸对HAS2亲和力最好。结论 通过本研究中网络药理学分析及分子对接分析，三果汤中鞣花酸、没食子酸对AKT1、HAS2、MAP2通路靶点具有亲和力，为后续实验提供研究思路。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨玫瑰花黄酮治疗2型糖尿病的作用机制

目的 以网络药理学和分子对接技术作为分析方法,探究玫瑰花黄酮类成分在防治糖尿病中的作用机制。方法 采用TCMSP、GeneCards和DisGeNET数据库获取活性成分和疾病靶点,并绘制Venny图;使用Cytoscape 3.9.0软件制作靶标图;String构建PPI蛋白网络;DAVID进行GO和KEGG富集分析;SYBYL-X2.0和PYMOL进行分子对接验证及展示。结果 玫瑰花黄酮11个活性成分通过调控207个糖尿病相关的疾病靶点,产生了667对活性成分-靶点关系,其中山柰酚、槲皮素、芹菜素等成分通过调控Pathway in cancer、AGE-RAGE、PI3K-Akt等通路防治糖尿病;分子对接显示活性成分与糖尿病核心靶点具有较好的结合活性。结论 本研究系统揭示了玫瑰花黄酮防治糖尿病“活性成分-靶点”的复杂关系,为玫瑰花用于治疗2型糖尿病的作用机制提供了理论依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨六味地黄丸治疗糖尿病肾病的作用机制研究

目的 运用网络药理学和分子对接方法探讨六味地黄丸治疗糖尿病肾病（diabetic nephropathy，DN））的作用机制。方法 通过检索多个数据库及查阅文献筛选出六味地黄丸活性成分和对应靶点，借助Genecard、OMIM和Drugbank数据库收集DN作用靶点并通过Venny 2.1软件筛选出药物-疾病共同作用靶点。随后，利用STRING和Cytoscape软件分析和构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并使用CytoNCA插件进行拓扑分析刷选出核心靶点。然后，利用ClueGO插件进行GO （GO Ontology）功能富集分析和KEGG-（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）通路分析。最后，使用AutoDock软件通过分子对接验证活性化合物与核心靶点的结合能力。结果 六味地黄丸40个活性成分通过调控128个DN相关靶点，尤其是通过调控28个核心靶点，参与调控体内基因转录、细胞凋亡和增殖、信号转导、炎症反应及蛋白质磷酸化等生物学过程，干预肿瘤、AGE-RAGE、IL-17、MAPK、HIF-1、Toll样受体等信号通路发挥治疗DN的作用。分子对接验证了5种活性化合物与其作用的关键靶点具有可靠的亲和力。结论 推测六味地黄丸治疗DN具有多成分-多靶点-多途径的特点，为进一步研究六味地黄丸治疗DN的分子机制提供了新思路和新方向。     

基于网络药理-分子对接方法研究翅果菊抗抑郁的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接方法研究翅果菊抗抑郁作用的活性成分和作用机制。方法 对翅果菊活性成分采用网络药理学方法筛选其作用靶点,并进行富集分析和代谢通路分析,结合分子对接技术进行对接验证。结果 在翅果菊18个活性成分中筛选得到2个活性成分,1个作用靶点和7条作用通路,莴苣苷B和guaianolide I均与γ-氨基丁酸受体亚单位β-3(GABRB3)的11个蛋白受体有良好的结合能力。结论本研究从分子网络层面为翅果菊抗抑郁作用的活性成分和作用机制的深入研究提供了依据和思路。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨肾炎康复片治疗IgA肾病的作用机制

目的 应用网络药理学和分子对接技术,探讨肾炎康复片治疗IgA肾病的作用机制。方法 通过数据库筛选肾炎康复片的主要活性成分,进行靶点预测。收集IgA肾病相关靶点,并与肾炎康复片活性成分靶点基因交集,选取共同靶点。构建蛋白质-蛋白质互作网络图和药物-活性成分-共同靶点网络图筛选出药物主要活性成分。通过MetaScape数据库进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因百科全书（KEGG）通路富集分析并构建主要活性成分-靶点-信号通路网络图。选取关键成分和核心靶点,使用Pymol、MGLTools、AutoDock等软件做分子对接。结果 肾炎康复片的活性化合物共有182个,涵盖310个作用靶点,IgA肾病相关疾病靶点有1190个。筛选出共同靶点119个,主要涉及肿瘤坏死因子（TNF）、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶（PI3K/Akt）、白细胞介素17(IL-17)、细胞衰老、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）等信号通路。网络分析和分子对接结果提示肾炎康复片中关键成分豆甾醇、β-谷甾醇可能通过作用于核心靶点B细胞淋巴瘤-2基因（BCL2）、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、胱天蛋白酶3(CASP3)发...     

基于网络药理学、分子对接和化学信息学方法探索益肺健脾方治疗肺纤维化的物质基础

目的 运用网络药理学、分子对接以及化学信息学方法探索益肺健脾方治疗肺纤维化的分子机制和物质基础。方法 TCMSP、TCMID数据库下载益肺健脾方11味中药化合物。利用SwissTargetPrediction预测化合物潜在靶点，运用Cytoscape构建化合物-靶点网络。TTD、Drugbank筛选肺纤维化相关靶点，STRING分析靶点蛋白互相作用并进行GO分析和KEGG分析。进一步采用分子对接对化合物与肺纤维化关键靶点整合素αvβ6的亲和能力进行评估，对筛选得到活性较高的化合物进行化学信息学层次聚类分析。结果 益肺健脾方与肺纤维化共有靶点27个，PPI分析得到关键靶点6个，GO分析和KEGG分析得到GO条目336个、KEGG通路35条。分子对接获得了具有靶向αvβ6潜在亲和力的成分，eRo5规则和打分排名筛选30个化合进行化学信息学聚类分析，结果显示化合物Naphthol aS-bl phosphate、Tangshenoside IV_qt、（2R）-2-azaniumyl-3-（1H-indol-3-yl）propanoate、（3S）-3-azaniumyl-4-hydroxy-4-oxobutanoate、[（2R）-2-Formyloxy-3-phosphonooxypropyl]formate所代表的骨架结构具有潜在抑制肺纤维化活性，主要相互作用为氢键和疏水相互作用。结论 本研究为中医药抗新冠病毒引起肺纤维化的治疗和相关医方的研究提供基于生物信息学、网络药理学、分子对接、化学信息学的系统研究方法。     

基于分子对接技术靶向PPARγ的降糖药物虚拟筛选

目的:筛选出特异性靶向PPARγ的配体,为降糖药物的研发提供思路.方法:以核受体PPARγ配体结合区域的晶体结构作为靶点,运用Schrodinger分子对接技术虚拟筛选Drugbank中老药分子化合物,结合打分值以及化合物与靶蛋白受体的相互作用模式优化筛选结果,获得具有降糖潜在活性的小分子化合物.结果:经过SP和XP两...     

整合UPLC-QTOF-MS分子网络与网络药理学探究龙葵化学成分及抗肺癌作用机制

目的 采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱(UPLC-QTOF-MS)整合分子网络技术对龙葵全草的化学成分进行快速分析与鉴定,利用网络药理学技术初步探究其治疗肺癌的作用机制。方法 运用UPLC-QTOF-MS,分别在正负离子模式下进行质谱检测与分析,定性龙葵全草中化学成分。同时将二级质谱图转换格式后上传到GNPS网站构建分子网络,对其化学成分进行分析。综合2种方法的定性分析结果结合网络药理学和分子对接,分析龙葵治疗肺癌过程中起主要作用的靶点及通路。结果 质谱分析和GNPS分别鉴定和匹配出41个和54个化合物,其中相交11个化合物,共鉴定出84个化合物。综合上述结果筛选出有效活性成分7个,对应不重复靶点298个,疾病靶点1 294个,相交靶点66个,富集分析得到28条信号通路、20个生物学过程、16个细胞组分、17个分子功能。分子对接结果显示核心靶点与核心成分均有较强的亲和力。结论 运用UPLC-QTOF-MS/MS整合分子网络技术可快速、全面、系统地分析鉴定龙葵全草中的化学成分;网络药理学及分子对接结果为龙葵临床用药和药理研究提供了科学依据。     

基于计算机模拟的丹参中黄酮类化合物抗肿瘤活性筛选

目的 运用计算机辅助药物设计对丹参中黄酮的抗肿瘤活性进行虚拟筛选。方法 于2021年12月至2022年3月,使用Sybyl软件的Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score函数分值判断配体分子结合能力,筛选活性化合物;根据Lipinski五法则,使用Discovery Studio 2019 Client的Filter by Lipinski模块进行类药性预筛选评估;并进行ADMET（吸收,分布,代谢,排泄,毒性）预测;将筛选出的最优化合物与靶点蛋白进行Biacore体外结合测试,利用分子对接预测化合物与靶点蛋白的相互作用模式。结果 二氢丹参酮Ⅰ、新隐丹参酮和丹参酮Ⅵ与肿瘤靶点蛋白结合函数分值>7,并表现合理的类药性质,即具有较高的结合能力和良好的类药活性,二氢丹参酮Ⅰ最优。分子对接显示,二氢丹参酮Ⅰ与ADP-核糖基化因子样2受体的氨基酸残基精氨酸61(ARG61)以氢键结合。结论 筛选出丹参中黄酮类化合物二氢丹参酮Ⅰ表现很强的类药性,与ADP-核糖基化因子样2受体结合响应值高。     

基于网络药理学和分子对接技术的热毒宁注射液抗SARS、MERS和COVID-19的潜在共性作用机制与活性成分研究

目的 采用网络药理学与分子对接技术探讨热毒宁注射液抗严重急性呼吸综合征（SARS）、中东呼吸综合征（MERS）和新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的潜在共性作用机制与活性成分。方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）数据库检索热毒宁注射液中青蒿、金银花、栀子的主要化学成分及其作用靶点。运用UniProt数据库查询相关靶点对应的基因，通过Cytoscape 3.8.2构建中药材-化合物-靶点（基因）网络；在GeneCards数据库中搜集“COVID-19”“SARS”和“MERS”相关靶点，通过Venny 2.1.0数据库映射筛选出3种冠状病毒感染疾病的共有靶点；将SARS、MERS和COVID-19的共有靶点与热毒宁注射液化合物靶点进行交集筛选出共同靶点作为研究靶点；将共同靶点导入STRING数据库获取数据后，使用Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的网络图；利用R语言进行基因本体论（GO）生物学功能富集分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析，绘制柱状图及气泡图进行可视化分析，并构建成分-靶点-通路网络图；选取成分-靶点-通路网络中关键化合物与重要靶点蛋白及新型冠状病毒（SARS-CoV-2）3CL水解酶、血管紧张素转化酶II（ACE2）进行分子对接。结果 热毒宁注射液筛选得到31个活性化合物中，207个相应作用靶点；SARS相关靶点2 453个，MERS相关靶点805个，COVID-19相关靶点2 571个，3种疾病共有靶点786个，与热毒宁注射液的共同靶点11个，分别为HSPA5、CRP、MAPK1、HMOX1、TGFB1、HSP90AA1、TP53、DPP4、CXCL10、PLAT、PRKACA。GO功能富集分析得到生物进程（BP） 995个，分子功能（MF） 71种，细胞组分（CC）31种。KEGG通路富集分析筛选得到99条信号通路（P＜0.05），主要涉及前列腺癌、流体剪切应力和动脉粥样硬化、肝细胞癌、癌症中的蛋白多糖、脂质与动脉粥样硬化、人类T细胞白血病病毒1型感染、MAPK信号通路等。分子对接结果显示热毒宁注射液中槲皮素、木犀草素、山柰酚3种核心活性黄酮类化合物与关键靶点MAPK1、PRKACA、HSP90AA1具有很好的亲和力，并且3种活性化合物与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2结合能较推荐化学药小。结论 热毒宁注射液对SARS、MERS和COVID-19 3种疾病具有潜在共性作用，该作用可能与活性化合物槲皮素、木犀草素、山柰酚等作用于MAPK1、PRKACA、HSP90AA1等靶点，调节多种信号通路发挥抑制炎症风暴、调节免疫功能、抗病毒等作用有关。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芩治疗糖尿病心肌病的作用机制

目的 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨黄芩抗糖尿病心肌病的活性成分及潜在的作用机制,为后续开展实验研究提供生物信息学基础。方法 通过TCMSP数据库及Swiss Target Prediction数据搜集黄芩活性成分与靶点;采用GeneCards、OMIM数据库查找糖尿病心肌病相关靶点;利用Venny 2.1.0获取药物和糖尿病心肌病的交集靶点;借助String平台和Cytoscape 3.9.0软件拓扑分析并筛选出核心成分及靶点;利用DAVID数据库进行黄芩治疗糖尿病心肌病靶点基因本体（GO）分析和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;采用AutoDock 1.5.7和PyMOL 2.4.1软件进行分子对接及可视化作图。结果 共筛选出36个黄芩活性成分,与糖尿病心肌病的151个交集靶点。GO富集分析得到775条生物过程,167条分子功能,86条细胞组分;KEGG通路分析得到169条,其中晚期糖基化终末产物及其受体（AGE-RAGE）、磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）-蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）、肿瘤坏死因子（TNF）、低氧诱导因子-1(HIF-1)是较...     

基于网络药理学和分子对接技术探究清热药治疗COVID-19的活性成分及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术挖掘《新型冠状病毒肺炎诊疗方案（试行第七版）》中具有清热功效的中药治疗COVID-19的共有活性成分及作用机制。方法：通过TCMSP数据库及BATMAN-TCM数据库检索清热药的化学成分和作用靶点;通过UniProt数据库检索靶点对应基因,运用Cytoscape Version 3.7.2软件绘制药物-化合物-靶点网络;利用STRING数据库绘制靶点间作用关系网络;通过DAVID数据库进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析;利用Autodock软件对筛选出的活性成分及抗病毒化药和SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2进行分子对接。结果：药物-化合物-靶点网络共有401个节点（15个药物节点,120个化合物节点,266个靶点节点）;GO条目1 422个（P<0.05）;KEGG通路富集筛选共得到61条通路（P<0.05）;分子对接结果显示脱水淫羊藿素、木犀草素、槲皮素等关键化合物具有与抗病毒化药相近或更好的亲和力。结论：清热药通过与ACE2结合调控多条通路、与病毒特定部位的结合阻断病毒入侵及抑制炎症因子风暴等方面达到治疗COVID-19的作用。