单细胞测序技术在精原干细胞研究中的应用进展

男性不育症正受到越来越多的关注,但其发生、发展的分子机制尚不明确,诊断、检测和治疗手段仍不完善。精原干细胞作为维持男性生育能力的基础,在男性不育症的发生和发展中起到决定性的作用。传统的测序技术是对大量的混合细胞进行分析,无法观察到各种类型细胞之间的区别,还会掩盖SSC这类重要且稀少细胞的独有特征。单细胞测序技术能够对单个细胞进行无偏倚、高通量和高分辨率的分析,为探究SSC在单细胞水平的变化提供了新的手段,同时也为发现新的生物学标志物和潜在靶点,促进男性不育症的个性化诊疗提供了新途径。     

单细胞测序技术在肿瘤中的研究进展

肿瘤异质性是恶性肿瘤的特征之一,单细胞测序技术是在单个细胞水平上进行全基因组、转录组以及表观遗传学测序,从而为肿瘤异质群体的细胞亚群分类提供依据,进而有效揭示肿瘤细胞内有关遗传、转录和表观遗传水平复杂性改变的过程。本文介绍测序技术的进展、单细胞测序技术方法以及单细胞测序技术在具体肿瘤中的应用进展,并对其发展前景进行了展望。     

单细胞多组学技术和应用

单细胞多组学（Single-cell multi-omics）是指结合多种不同的生物学技术,对单个细胞进行多方面的分析和研究,从而获得更全面、更准确的单细胞数据。该技术包括单细胞基因组学、单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、单细胞表观组学等。单细胞多组学技术的发展为我们提供了一种更加精确理解生物体内复杂的细胞类型和功能的方式,尤其是对于异质性细胞群体中少数的特殊细胞类型如干细胞或罕见癌细胞,具有非常重要的应用价值。通过融合不同技术的信息,单细胞多组学可以更准确地描述单个细胞在多个生命事件和过程中的状态和变化,为生命科学的研究提供更加全面和深入的视角。本文系统概述了目前代表性单细胞多组学技术的发展现状,总结了其在生物学研究中的重要应用和巨大潜力。     

单细胞测序技术在非小细胞肺癌研究中的应用进展

多项研究指出多样的肿瘤微环境影响着肺癌治疗反应性及耐药性,因此亟待我们去描述并定义这些微环境特征。单细胞测序技术通过识别不同的细胞亚群,剖析肿瘤微环境中的信号传递,以及表征细胞基因组突变和拷贝数异常,为我们更深入理解肿瘤生物学开辟了新的途径。应用单细胞测序技术可深入研究非小细胞肺癌的肿瘤微环境,进而指导临床治疗和预防肿瘤复发等。本文将综述单细胞测序技术在非小细胞肺癌研究领域应用的最新进展。     

单细胞RNA测序在干细胞生物学中的应用研究进展

细胞间的变异或异质性是干细胞群的基本和内在特征。传统的组学分析是在混合细胞群体上进行,导致这些差异被掩盖。近年来,单细胞基因组、表观基因组、转录组测序等技术发展迅速,为全面解析细胞异质性和识别不同表型细胞类型提供了强有利工具。这些方法应用于不同类型的干细胞,包括多能干细胞和组织特异性干细胞,在干细胞领域取得了令人兴奋的新发现。本文综述了单细胞组学测序技术的最新进展,并对单细胞组学测序的方法和应用进行了展望。     

单细胞测序在干细胞生物学中的应用研究进展

细胞间的变异或异质性是干细胞群的基本和内在特征。传统的组学分析在混合细胞群体上进行,导致这些差异被掩盖。近年来,单细胞基因组、表观基因组、转录组测序等技术发展迅速,为全面解析细胞异质性和识别不同表型细胞类型提供了强有力的工具。这些方法应用于不同类型的干细胞,包括多能干细胞和组织特异性干细胞,取得了令人兴奋的新发现。本文综述了单细胞组学测序技术的最新进展,并对单细胞组学测序的方法和应用前景进行了展望。     

单细胞RNA测序技术在非小细胞肺癌研究中的应用

肺癌是世界范围内死亡率最高的癌症，其中以非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer，NSCLC)最为常见。以CAR-T 细胞治疗、免疫检查点阻断为代表的肿瘤免疫治疗，成为肺癌免疫治疗研究领域的前沿热点，但由于肿瘤免疫抑制性微环境、 肿瘤特异性抗原的缺乏以及耐药性等不良因素的影响，其临床治疗效果仍不理想，亟需探究肺癌相关新的分子靶点和分子机制。单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing，scRNA-seq)技术是在单细胞水平对转录组进行高通量测序的一项新技术， 可以研究单个细胞内的基因表达情况，从而了解细胞的功能和状态。利用该技术有望深入了解肺癌的发生发展机制，发现新的肺癌治疗靶点，揭示肺癌耐药性产生的分子机制，进一步完善对患者的预后和风险评估，促进肺癌精准医学的发展。本文对 scRNA-seq在NSCLC中的应用和研究进展进行综述。     

单细胞测序技术在妇科恶性肿瘤研究中的应用

妇科恶性肿瘤包括宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌等,具有高度的异质性,一旦进入晚期,预后往往不良。单细胞测序技术的出现和发展为在单个细胞水平上探究肿瘤发生发展的机制,鉴定稀有细胞,绘制细胞谱系,指导肿瘤靶向精准治疗和预测患者预后等提供了更好的平台。本文就单细胞测序技术的兴起与发展及其在妇科恶性肿瘤研究中的应用进行综述。     

单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用

肿瘤是具有高度复杂性的整体,理解肿瘤免疫微环境的组成和功能是指导有效肿瘤免疫治疗的前提。单细胞RNA测序可以在单细胞分辨率水平上检测细胞的转录水平,描述其功能状态,加深对肿瘤免疫微环境中各细胞类群组成和功能的理解。本文总结了近年来单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用。     

单细胞转录组测序在哮喘研究中应用的研究进展

 哮喘是一种异质性疾病，传统转录组测序方法获得的是同一基因在所有细胞中的平均表达水平，不能完全揭示异质性哮喘的发病机制及药物疗效。单细胞转录组测序（single-cell RNA sequencing，scRNA-seq）是在单细胞水平对全转录组进行扩增与测序的一项新技术，能够获得每个细胞的mRNA表达信息，发现不同的细胞亚群及相关信息，揭示细胞间基因表达的异质性及鉴定稀有细胞类型，为深入研究和理解哮喘发病机制提供了新的技术手段。本文对scRNA-seq技术在哮喘研究中的应用做一概述，以期为深入研究哮喘这一异质性疾病的发病机制提供新的视角和研究思路。     

直接测序法检测结肠癌患者K-ras基因的灵敏度及其临床价值分析

目的 探讨结肠癌患者应用直接测序法测定K-ras 基因的灵敏度及其临床价值。方法 选取我院2016 年2 月~2017 年4 月收治的结肠癌患者80 例，随机分为研究组和对照组两组，研究组患者通过直接测序法、对照组患者通过sanger 测序法检测患者体内的K-ras 基因突变情况，分析K-ras 基因突变率与患者肿瘤大小、肿瘤部位、患者年龄等一般资料之间的相关性。结果 研究组患者测定K-ras 基因突变的灵敏度明显高于对照组（P<0.05），肿瘤直径在5 cm 以上患者的K-ras 基因突变率明显低于直径在5 cm 以下的患者（P<0.05）研究组检出率与患者肿瘤部位及分化程度、患者年龄等存在相关性。结论 应用直接测序法检测结肠癌患者K-ras 基因的突变情况具有较高的灵敏度，直接测序法的检出率与患者的肿瘤大小、肿瘤分化程度以及患者的年龄等存在较强的相关性，对于临床上结肠癌等恶性肿瘤疾病的诊断具有较强的应用价值，值得临床上广泛推荐使用。     

循环肿瘤细胞在肝癌中应用的研究进展

肝癌是最常见的恶性肿瘤之一,发病率高,死亡率高.术后复发及转移率高严重影响了肿瘤切除或肝移植治疗效果.循环肿瘤细胞是存在于外周血中的少量恶性细胞,起源于原发肿瘤或转移灶.新技术的发展使分离和鉴定循环肿瘤细胞成为可能.循环肿瘤细胞检测已被认为是一个可靠的预后指标.该文就循环肿瘤细胞在肝癌应用中的检测方法、分子标记物和临床意义的研究进展作一综述.     

单细胞转录组测序在黑色素瘤中的研究进展

黑色素瘤是成人第五大常见的恶性肿瘤,亚洲人与其他有色人种的黑色素瘤存在明显差异,其发生发展机制复杂,具有高度侵袭性、转移性和致死性,预后差。因此,加强该病基础研究尤为重要。单细胞转录组测序作为近年来快速发展的新技术,以其特有的优势,如探索细胞亚群的异质性、鉴定稀有细胞、使用算法揭示不同组织细胞的分化轨迹等,极大地推动了包括黑色素瘤在内的肿瘤学研究发展。本文将就目前黑色素瘤单细胞转录组测序研究中,在肿瘤异质性、肿瘤微环境和细胞互作、免疫逃逸与治疗抵抗方面的研究进展做一综述。     

肿瘤干细胞与肝癌关系的相关研究进展

肿瘤干细胞学说对肿瘤起源的传统理论提出了质疑,并已获得较多的证据支持,正逐渐被人们所接受。肿瘤干细胞学说为恶性肿瘤的基础研究及临床治疗指明了一个新的方向。原发性肝癌在我国的发病率较高,且呈上升趋势。近年来研究发现,肝癌细胞中存在着一群具有特异性的肿瘤细胞,称为肝癌干细胞,其发现促使人们对原有的关于肝癌形成、发展及治疗理论进行重新审视。该文试从干细胞的概念、肿瘤干细胞学说的形成及其生物学特性、肝癌干细胞的来源及表面标志物的研究进展等方面作一综述。     

抗大肠癌噬菌体人单链抗体的初步鉴定及序列分析

目的 :对抗大肠癌细胞的单克隆噬菌体单链抗体进行初步鉴定和测序分析。方法 :采用细胞ELISA ,免疫组化 ,DNA序列测定和计算机分析方法 ,对 5个单克隆噬菌体抗体 (CH2 73,CH2 0 5 ,CH2 0 9,CHA12 ,CH72 3)进行初步鉴定和序列分析。结果 :5个抗体均对人大肠癌细胞、人胚肾上皮细胞和其它某些人肿瘤细胞反应 ,也与人正常肝细胞有弱阳性反应 ,但不与鼠源性的癌细胞和正常细胞反应。细胞免疫组化进一步证实了ELISA结果的正确性。大肠癌免疫组化对大肠癌组织有特异性的结合反应 ,而不与正常大肠组织反应。测序结果为CH2 73ScFv全长 732bp ;V ,D ,J分别属于VH3 30 D1 2 6 JH3 linker V1 13 JL2 ,GenBank序号为AY0 2 8777和AY0 2 8996 ;CH2 0 5全长 36 6bp ,V ,D ,J分别VH1 4 6 D6 13 JH3,GenBank序号为AF35 936 5 ;CH2 0 9,CHA12和CH72 3的ScFv基因完全相同 ,全长 72 3bp ,其VH DH JH与CH2 73ScFv基因中的VH DH JH 完全一致 ,V ,D ,J分别属于VH3 30 D1 2 6 JH3 linker L2 Jκ2 ,GenBank序号为AF36 3774。结论 :噬菌体抗体具有结合人大肠癌组织和细胞的活性 ,为进一步开发临床应用人源抗肿瘤抗体和小分子抗体片段奠定基础     

肿瘤干细胞与前列腺癌相关研究进展

肿瘤干细胞学说是近些年来新发展起来的一个学说,该学说认为肿瘤起源于肿瘤干细胞,是一种干细胞疾病,肿瘤组织中存在的一小部分具有干细胞性质的肿瘤干细胞,它们具有无限的自我更新和多向分化潜能和高度增殖能力,是肿瘤形成和发展的关键。有越来越多的证据表明CSC与多种实体肿瘤,如乳腺癌、脑肿瘤以及前列腺癌等密切相关。CSC学说在向传统观点提出挑战的同时,也为肿瘤的治疗带来了新的希望。     

适用于单细胞RNA测序的半月板细胞提取方法的优化

目的 优化半月板细胞提取的方法,缩短细胞提取时间,稳定地获取细胞数量多和细胞活率高的细胞悬液,使获得的细胞悬液悬液适用于单细胞RNA测序。方法 比较细胞悬液的细胞数量及细胞活率评价不同细胞提取方法的有效性,细胞提取方法包括传统半月板细胞提取法（短时间消化和长时间消化）和优化提取法;通过分析单细胞RNA测序数据集评价优化提取法获取的细胞悬液的稳定性;通过比较优化提取法获得的单细胞RNA测序数据集与公开的半月板单细胞RNA测序数据集,分析优化提取法的可靠性。结果 在3次重复实验中,优化提取法获得细胞数量最多的细胞悬液,细胞数量超过105,且细胞活率最高,平均达80%。通过分析单细胞RNA测序数据发现每个样本中80%以上细胞的线粒体基因含量少于20%。CD34+,MCAM+细胞以及COL1A1+胞均存在每个单细胞RNA测序数据集中。在比较基于优化提取法单细胞RNA测序数据集与公开的半月板单细胞RNA测序数据集时发现,优化提取法也能捕获COL3A1+细胞,COL1A1+细胞,MYLK+细胞,BMP2+细胞,CD93+细胞和CDK1+细胞。结论 优化细胞提取方法能稳定地获得适用于10×Genomics平台的单细胞RNA测序技术的单细胞悬液。     

Clear cell papillary renal cell carcinoma – An indolent subtype of renal tumor

Background

Clear cell papillary renal cell carcinoma (CCPRCC) is a new but rare tumor entity as listed in the World Health Organization 2016 renal tumor classification. Around 360 cases have been reported in the English literature to date, and only one tumor with sarcomatoid change was reported to develop distant metastasis. In the present study, we aim to review the clinical course and analyze the treatment outcome of CCPRCC in our institution.

凋亡抑制基因survivin与卵巢癌的研究新进展

卵巢癌是女性生殖器官最常见的恶性肿瘤之一,其发病率高而存活率低,对女性的健康造成极大的威胁.尽管目前采用手术、化疗、放疗等治疗手段使卵巢癌的存活率有了很大提高,但晚期患者即使经过系统治疗达完全缓解,仍有很高的复发率.而耐药又是治疗失败的主要原因.Survivin是迄今发现的最强的凋亡抑制基因,其高表达使肿瘤细胞对多种化疗药物的耐受性增加,并介导肿瘤多药耐药的形成.鉴于survivin在卵巢癌细胞周期调控、凋亡与血管形成中的发挥着重要作用,探索各种新的分子生物学技术和基因治疗方法,阻断survivin表达而拮抗其抑制细胞凋亡的能力,降低细胞凋亡的阈值,恢复肿瘤细胞对化疗药物的敏感性,进而使卵巢癌获得根治成为可能,从而避免卵巢癌细胞耐药和转移扩散给病人带来的痛苦,具有深刻的指导意义.