维吾尔族肺腺癌患者的EGFR基因突变分析

背景与目的 表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)是一种跨细胞膜糖蛋白,属于受体型酪氨酸激酶家族.以吉非替尼为代表的EGFR酪氨酸激酶抑制剂对于EGFR突变的肺癌患者显示出良好的治疗效果,然而EGFR的突变率在不同民族和不同种族的人群中表现出较大差异.本研究旨在分析维吾尔族中肺腺癌患者肿瘤组织的EGFR基因突变情况,同时比较维吾尔族与汉族肺腺癌患者肿瘤组织EGFR基因突变率的差异性.方法 收集临床肺腺癌患者石蜡包埋组织标本138例,包括68例维吾尔族和70例汉族肺腺癌的样本,采用ARMS(amplification refractory mutation system,ARMS)PCR扩增方法检测EGFR基因外显子18、19、20及21的突变,x2分析对比维吾尔族和汉族肺腺癌EGFR基因突变差异.结果 138例肺腺癌患者中有43例EGFR基因突变,总突变率为31.2％,其中维吾尔族突变11例,突变率为16.2％,汉族突变32例,突变率为45.7％,维吾尔族肺腺癌EGFR突变率与汉族肺腺癌EGFR突变率比较有明显差异(P＜0.001),突变以外显子19-del和L858R为主要突变点.结论 维吾尔族中肺腺癌EGFR基因突变率为16.2％,汉族中EGFR基因突变率为45.7％,维吾尔族肺腺癌EGFR突变率明显低于我国汉族EGFR基因突变.     

非小细胞肺癌十基因突变联合检测分析

目的：探讨运用扩增阻滞突变系统(Amplification Refractory Mutation System, ARMS)法检测EGFR、ALK、ROS1、RET、KRAS、NRAS、PIK3CA、BRAF、HER2和MET十基因在非小细胞肺癌的突变情况,分析其与临床病理的关系,探索十基因突变联合检测的临床应用价值。方法：收集2019年5月至2019年10月在四川省肿瘤医院病理确诊为非小细胞肺癌患者406例,其中石蜡包埋样本400例,细胞涂片6例,采取柱提法提取DNA和RNA,突变检测采用ARMS法。结果：非小细胞肺癌十基因联合检测的总突变频率为73.2%（297/406）,各驱动基因突变分布为：EGFR：51.0%（207/406)、KRAS：9.6%（39/406）、ALK融合：6.2%（25/406)、ROS1融合：2.5%（10/406）、RET融合 ：2.2%（9/406）、NRAS：0.2%（1/406）、PIK3CA：2.2% （9/406）、BRAF：1.0% （4/406）、HER2：2.2% （9/406）、MET 14外显子跳跃：0.7% （3/406）。肺腺癌EGFR突变频率高于肺鳞癌;女性患者EGFR与HER2 20ins突变频率高于男性,男性患者KRAS突变频率高于女性;年龄低于60岁的患者ROS1突变频率高于60岁以上的患者。十基因突变率在原发灶和转移灶之间无差异,冰冻后样本突变检出率高于其他类型样本。另外在30例样本中检出双突变,突变类型为18种,突变率达到7.4%;57%的双突变样本来源于初诊患者,没有观察到独特的组织病理特征。双突变患者在年龄和病理组织学分型上与单突变患者无差异,但易发生于女性患者。结论：ARMS法非小细胞肺癌十基因联合检测可一次获得更多基因突变信息,为分子靶向用药提供更加全面的指导信息,对于临床取材量少标本意义重大,多基因联合检测提供的共突变信息能够更全面地指导临床治疗。     

非小细胞肺癌中EGFR和K-ras基因突变检测

目的:探讨不同类型非小细胞肺癌的EGFR和K-ras基因突变情况及其与肺癌相关临床病理特征的关系。方法:用厦门艾德ADxARMS试剂盒进行98例非小细胞肺癌患者肿瘤组织中EGFR（18,19,20,21外显子）基因和K-ras（12,13,61密码子）基因突变的检测。所有患者均未接受过吉非替尼的治疗。结果:98例样本中31例发生了EGFR基因突变,突变率为31.6%（31/98）,其中15例为19外显子缺失,13例为21 L858R外显子点突变,3例为20外显子突变,1例为18外显子突变。其中1例既有19外显子缺失突变,又有20外显子突变。腺癌中EGFR基因突变率较鳞癌、腺鳞癌、大细胞癌高。女性患者EGFR基因突变率较男性高。不吸烟患者EGFR基因突变率较吸烟患者高。低分化腺癌患者EGFR基因突变率较中、高分化患者高。21例发生了K-ras基因突变（21.4%）,其中12、13、61密码子均发现突变。突变率腺癌较鳞癌、腺鳞癌、大细胞癌高,与是否吸烟、患者性别、分化程度均无相关性。结论:非小细胞肺癌患者EGFR基因突变检出率较高,K-ras基因突变率较低,且两者不存在同时突变,EGFR基因突变与肺癌组织学类型、分化程度、性别等相关。K-ras基因突变与组织学类型相关。     

430例中国非小细胞肺癌患者EGFR、KRAS、BRAF和PIK3CA基因突变状态及其临床意义

目的： 探讨非小细胞肺癌（non-small cell lung cancers,NSCLC）患者表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor, EGFR）信号通路中EGFR、Kirsten鼠肉瘤病毒癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog, KRAS)、B-Raf原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(B-Raf proto oncogene serine/threonine protein kinase,BRAF)和磷脂酰肌醇-3-激酶α亚单位(phosphatidylinositol -4,5- bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha,PI3KCA)基因的突变状态及其临床意义,为酪氨酸酶抑制剂（tyrasin kimase inhibitor, TKI)临床用药与科学研究提供依据。方法：采用SurPlex-xTAG70plex液相芯片技术平台检测中国430例NSCLC患者的福尔马林固定石蜡包埋(formalin fixed paraffin embedded, FFPE)组织中EGFR、KRAS、BRAF和PIK3CA基因的突变状态,分析基因的突变率及其与临床病理特征的关系。结果： EGFR、KRAS、BRAF和PIK3CA的突变率分别为41.2%,79%,0.7%和3.7%。EGFR外显子19、21在女性患者中的突变率明显高于男性（P<0.01）, 在肺腺癌患者中的突变率明显高于其他类型肺癌（P<0.01）,在无吸烟史患者中的突变率高于有吸烟史的患者（P<0.01）。相反地,KRAS突变在男性患者中的突变率高于女性（P<0.05）,在肺腺癌中的突变率高于肺鳞癌（P<0.005）,有吸烟史患者的突变率高于无吸烟史患者（P<0.01）。在肺腺癌患者中PIK3CA的突变率明显低于其他类型肺癌（P<0.01）。结论： EGFR和KRAS基因突变率与性别、组织学类型及吸烟史密切相关。在检测中发现EGFR和KRAS双突变,此外PIK3CA突变并非与EGFR和KRAS突变互斥。     

非小细胞肺癌驱动基因检测及其与临床病理特征的相关性

目的:探讨非小细胞肺癌(NSCLC)驱动基因的变化情况及其与临床病理特征的相关性。方法:回顾性分析我院2016年01月至2020年07月NSCLC患者607例临床及病理学特征资料,采用扩增阻滞突变系统(ARMS)荧光PCR法检测EGFR突变,RT-PCR法检测ALK、ROS1基因融合,荧光原位杂交法（FISH）检测MET基因扩增。结果:607例NSCLC组织中325例(53.5%,325/607)检测到基因改变,分别为EGFR突变（45.5%,276/607）、ALK融合（5.1%,31/607）、ROS1融合（1.3%,8/607）和MET扩增（2.8%,17/607）,EGFR双位点突变15例（2.5%,15/607）,双驱动基因改变7例（1.2%,7/607）,其中EGFR突变与ALK融合阳性共存3例,EGFR突变与ROS1融合阳性共存2例,EGFR突变与MET扩增阳性共存2例。EGFR在女性、非吸烟、腺癌患者中突变率更高（P＜0.05）,EGFR突变更容易发生在以贴壁为主型、腺泡为主型、乳头为主型、微乳头为主型腺癌中（P＜0.05）;ALK融合多见于女性、年轻、非吸烟、实性为主型的腺癌患者（P＜0.05）;MET基因扩增在老年男性患者中发生率更高（P＜0.05）。结论:在NSCLC中EGFR突变率较高,驱动基因联合突变不容忽视,基因分型对临床治疗具有重要指导意义。     

新疆维吾尔族与汉族NSCLC患者血清EGFR基因突变及临床特征分析

目的 表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)抑制剂对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)EGFR基因突变患者有很好的疗效,因此EGFR基因突变状态对治疗方案的选择意义重大.新疆作为多民族聚集地,维吾尔族和汉族在基因、遗传方面存在差异,本研究主要探讨新疆地区汉族及维吾尔族初诊NSCLC患者血清EGFR突变差异及其与临床特征的关系.方法 选取2015-05-01-2016-08-30石河子大学医学院第一附属医院(65例)和喀什地区第一人民医院(51例)初次诊治的非小细胞肺癌患者116例,其中汉族70例,维吾尔族46例.采用二代测序法对患者进行血清EGFR突变检测,统计两组突变差异并分析其临床特征.结果 汉族NSCLC血清EGFR突变率27.1%(19/70),维吾尔族NSCLC血清EGFR突变率8.7%(4/46),差异有统计学意义,χ2=5.942,P=0.015.汉族腺癌突变率36.5%(19/52)高于维吾尔族腺癌突变率13.3%(4/30),差异有统计学意义,χ2=5.076,P=0.024.两者突变均以19、21外显子突变为主,差异无统计学意义,P=0.406.临床特征比较,汉族中女性、腺癌、不吸烟患者突变率较高,差异有统计学意义,P<0.05.维吾尔族中腺癌突变率较高,其它如年龄、临床分期、淋巴结转移情况等在汉族或维吾尔族中差异无统计学意义,P>0.05.Logistic多因素分析显示,种族是EGFR基因突变的独立影响因素,P<0.05,95%CI为0.145~1.599.而性别、年龄、是否吸烟和临床分析对EGFR突变影响不显著.结论 新疆维吾尔族和汉族血清EGFR突变与种族有关,与外显子类型、临床特征无明显关联.     

肺癌驱动基因及其靶向治疗药物

随着肿瘤分子生物学的发展,针对肺癌驱动基因的分子靶向治疗已成为晚期肺癌不可或缺的一部分。目前最成功的例子就是针对表皮生长因子受体（EGFR）和间变性淋巴瘤激酶（ALK）的靶向治疗。现在越来越多的肺癌驱动基因突变已被发现,包括ROS1基因融合、成纤维细胞生长因子1扩增、KRAS、BRAF和PIK3 CA基因突变等。明确这些基因突变的频率及临床意义,对指导肺癌的临床治疗有着重要的意义。     

非小细胞肺癌BRAF突变及靶向治疗的研究进展

鼠类肉瘤病毒癌基因同源物B1（BRAF）基因是非小细胞肺癌（NSCLC）的驱动基因之一,在NSCLC中突变率为0.5％～4.9％,其中V600E突变类型占到一半以上。BRAF突变多见于女性、肺腺癌患者,亚裔人群中突变率相对较低。BRAF突变可与其他基因突变,如EGFR、K-Ras突变共存,但其临床意义尚不清楚。全球NSCLC患者数量庞大,尽管BRAF突变率在NSCLC中较低,低突变率基因及其靶向治疗的研究仍然相当重要。目前BRAF抑制剂治疗NSCLC正在临床试验中。本文就NSCLC中BRAF突变及靶向治疗的研究进展进行综述。     

靶向高通量测序在非小细胞肺癌中的临床应用

  目的  对8种与非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）个性化治疗高度相关的驱动基因进行检测,分析基因变异与临床病理特征的关系。  方法  收集天津医科大学肿瘤医院2016年6月至2017年8月212例NSCLC患者样本,对EGFR、KRAS、BRAF、ALK、MET、ERBB2、ROS1、RET 8种基因进行高通量测序。  结果  8种基因中EGFR基因变异率高达52.8%,其次为KRAS（8.5%）、ALK（8.0%）、ERBB2（6.1%）、MET（3.8%）、BRAF（1.4%）、RET（0.9%）、ROS1（0.9%）,75%样本检出至少1个驱动基因变异,驱动基因变异间呈现强烈互斥。最常见的EGFR突变为19外显子缺失和L858R突变,EGFR T790M突变与前面两个突变位点伴随出现。19外显子缺失患者携带非EGFR T790M突变比例低于L858R突变患者携带非EGFR T790M突变比例（P=0.04）。15.2%EGFR突变伴EGFR扩增,携带EGFR扩增且EGFR突变率 > 40%患者比例高于无EGFR扩增且EGFR突变率 > 40%患者（P < 0.01）。女性、不吸烟、腺癌患者易发生EGFR特别是EGFR敏感突变（P < 0.01）。肺腺癌（P=0.013）、临床分期晚（P=0.048）、淋巴结转移（P=0.027）患者携带EGFR扩增比例高。男性（P=0.009）、左侧肺癌（P=0.048）,吸烟患者（P=0.037）KRAS突变发生率较高。携带非KRAS突变、ALK融合的患者更年轻（P=0.005,P=0.031）,而携带KRAS突变患者年龄较高（P=0.055）。  结论  高通量测序可同时高效检测NSCLC患者中8种与靶向治疗相关驱动基因的变异谱,为临床医生的个体化诊疗提供参考,以多基因为基础的高通量测序为NSCLC诊疗提供更多的可能性。      

HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变的临床意义

目的:探讨应用HRM方法检测肺腺癌患者癌性胸水上清液EGFR基因突变状况及EGFR酪氨酸激酶受体抑制剂治疗的可行性。方法:收集43例肺腺癌患者癌性胸水上清液标本,提取DNA,应用HRM方法检测EGFR基因第18、19、20、21外显子突变状况。统计分析HRM方法与基因测序法检测EGFR突变率的差异。结果:43例肺腺癌患者癌性胸水上清液中,HRM法检测EGFR基因突变共17例,总突变率为39.53%,其中第19外显子突变14例,第21外显子突变3例。基因测序结果显示:EGFR突变14例,总突变率为32.56%,均为第19外显子突变。HRM方法检测第21外显子突变阳性的患者其基因测序结果均为阴性。这可能与HRM方法检测的灵敏度优于测序方法有关。两者突变率差异无统计学意义（P>0.05）。结论:对难以获取组织标本的肺腺癌患者而言,应用HRM方法检测其癌性胸水上清液,是了解其EGFR基因突变状况的可靠途径,对临床筛查靶向治疗药物具有一定的参考价值。     

558例维吾尔族肺癌患者的临床病理特征及预后分析

目的 分析新疆本地维吾尔族肺癌患者的临床病理特征,了解该民族肺癌的分布特点及差异。方法 收集新疆医科大学附属肿瘤医院2005年1月1日至2014年12月31日就诊的558例维吾尔族肺癌患者,对患者的临床分期、病理类型、驱动基因等临床资料进行对比分析及随访。结果 男女比例1.37:1,女性和城市维吾尔族肿瘤患者中腺癌最多,而男性、有吸烟史和乡镇患者中鳞癌和小细胞肺癌居多;小细胞肺癌患者3年生存率最低,腺癌最高;21.8%（65/298）患者存在EGFR基因突变,多见于不吸烟、腺癌、女性患者;6.9%（11/159）患者存在EML4-AL基因融合,多表达于腺癌、不吸烟或既往有吸烟史,同时无EGFR突变患者;Ⅳ期EGFR基因突变患者与EGFR野生型患者总生存期（OS）差异无统计学意义（P=0.597）。Ⅳ期EML4-ALK基因融合患者与EML4-ALK基因未融合患者总生存期差异无统计学意义（P=0.941）。结论 维吾尔族肺癌患者在临床特征、病理类型、流行病学分布及驱动基因方面有其特点。病理类型和分期是影响维吾尔族NSCLC患者预后的独立因素。     

非小细胞肺癌ROS1突变与EGFR突变及临床病理特征的关系

目的 探讨非小细胞肺癌（NSCLC）中ROS1融合突变与表皮生长因子受体（EGFR）突变及临床病理特征的关系。方法 采用实时荧光定量PCR（QPCR）检测2014年12月至2017年12月收治的3487例中国西北地区NSCLC患者ROS1基因的突变情况，同时采用ARMS法检测ROS1基因突变患者的EGFR基因突变情况，分析ROS1和EGFR共突变患者的临床病理特征。结果 3487例NSCLC患者中，ROS1基因突变54例（1.5％）。ROS1基因突变与年龄、性别、吸烟史、病理类型和临床分期有关（P＜0.05）。54例ROS1融合基因突变患者中有3例（5.6％）同时存在EGFR基因突变，其中19外显子缺失突变（19-del）2例，L858R突变1例。3例ROS1突变均为突变体2型（R2）。结论 中国西北地区NSCLC患者ROS1融合基因突变率为1.5％，与EGFR基因突变可以共存。     

山东地区非小细胞肺癌分子靶向治疗驱动基因表达情况及临床特征分析

背景与目的分子生物学靶向治疗已逐渐成为非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer, NSCLC）的一个重要治疗手段,本研究通过分析山东地区NSCLC多种驱动基因表达情况及临床病理特征,为筛选分子靶向治疗目标人群提供理论依据。方法采用荧光探针PCR法检测表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor, EGFR）、棘皮动物微管相关蛋白4-间变性淋巴瘤激酶（echinoderm microtubule-associated protein-like 4-anaplastic lymphoma kinase, EML4-ALK）、肉瘤致癌因子-受体酪氨酸激酶（ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase, ROS1）、鼠类肉瘤病毒癌基因（Kirsten rat sarcoma viral oncgene, KARS）基因表达情况,回顾性分析阳性病例的临床病理特征。结果 EGFR基因突变阳性率为36.70%,主要为19、21外显子突变,突变人群主要为女性、腺癌、不吸烟患者,组间差异有统计学意义。EML4-ALK融合基因重排阳性率为9.37%。人群特征主要为60岁以下不吸烟人群,组间差异有统计学意义,基因突变与病理类型和性别间无明显差异。ROS1融合基因重排阳性率为3.67%,均为60岁以下患者,组间差异有统计学意义。23份病例标本开展KRAS基因检测,阳性标本数2例,阳性率为8.70%。2份阳性标本均为60岁以上病例,男女各占1例,病理类型均为腺癌,均无吸烟史。此外,未发现有两种基因同时突变的病例。结论 EGFR、EML4-ALK、ROS1、KARS基因在NSCLC患者中存在较高的突变率,且具有不同的人群特征,在选择靶向治疗人群中具有重要意义。     

超声引导下肺肿块粗针活检在NSCLC患者EGFR 基因突变检测中的价值

目的探究超声引导下肺肿块粗针活检在非小细胞肺癌(NSCLC)患者表皮生长因子受体(EGFR)基因突变检测中的价值。方法回顾性分析96例NSCLC患者临床资料。96例NSCLC患者均采用超声引导下肺肿块粗针活检,分析穿刺成功率及EGFR基因突变检测结果。结果 96例患者均采用16G粗针活检,并顺利完成穿刺活检,取材满意率100.00%;96例患者病理均确诊为NSCLC,其中腺癌、鳞癌、腺鳞癌、肉瘤样癌各有77例、6例、8例、5例。穿刺术后有1例患者出现咯血,采用止血药物治疗后缓解;2例患者出现针道少许渗血,但未做特殊处理,观察1～2 h后无不适反应。96例NSCLC患者中检测EGFR基因突变有44例,突变率为45.83%(44/96),其中20例为外显子19突变;16例为外显子21突变,4例为外显子20突变,4例为外显子20、21均突变。结论超声引导下肺肿块粗针活检有利于准确诊断NSCLC并检测EGFR基因突变情况,是一种安全有效的取材手段,具有临床应用安全、简便且易于推广等优势,可为临床分子靶向药物的治疗提供确切依据。     

非小细胞肺癌胸腔积液与配对肿瘤组织中EGFR基因突变检测的比较

目的:探讨非小细胞肺癌胸腔积液与配对肿瘤组织标本中EGFR基因突变检测结果的一致性,评价胸腔积液标本检测EGFR基因突变的应用价值.方法:收集非小细胞肺癌患者胸腔积液与配对肿瘤组织样本72例,采用ARMS方法,检测样本中EGFR基因第18~21外显子突变情况.结果:细胞学样本和组织学样本中EGFR基因突变阳性率分别为48.61%和51.39%,两者差异无统计学意义(P>0.05),二者一致率为92.11%,不一致率为7.89%.结论:二者的一致率较高,恶性胸水可以作为无法获得肿瘤组织的晚期非小细胞肺癌EGFR基因检测的有效样本.