过氧化物还原酶4在胃癌中的表达及其意义的生物信息学研究

目的：通过生物信息学途径探究过氧化物还原酶4(peroxiredoxin 4,PRDX4)在胃癌（gastric cancer, GC）中的表达及其意义,并通过免疫组织化学检测63例GC患者肿瘤组织中PRDX4的表达情况。方法：从Ualcan数据库获取正常胃组织及原发性胃癌组织PRDX4表达数据,在LinkedOmics中检索PRDX4的共表达基因,并通过GO富集分析、KEGG通路分析确定这些基因参与的生物学过程及功能,利用STRING数据库分析相关基因编码蛋白的互作网络。最后利用GEPIA数据库分析PRDX4表达与胃癌患者预后的关系;纳入2022年1月至2022年10月在成都医学院第一附属医院就诊的63例GC患者,通过MaxVision法对GC肿瘤组织及其周围正常组织进行PRDX4表达情况的免疫组化染色并观察结果。结果：Ualcan数据库显示,与周围正常胃组织相比,PRDX4在GC组织中高度表达（P <0.05）,但尚未发现其表达与性别、肿瘤分化程度、肿瘤大小和淋巴结转移有关联。同时检索出PRDX4共表达基因主要与生物调节、代谢过程、刺激反应等分子生物学过程存在紧密联系,并与E...     

Claudin-4在胃癌中的表达及临床病理意义

目的探讨Claudin-4在胃癌中的表达及其临床病理意义。方法收集福建医科大学附属厦门第一医院2007年9月至2009年9月部分胃癌手术标本共68例。其中20例分别制成石蜡切片和留取新鲜冰冻标本,分别应用免疫组织化学染色方法和实时定量PCR方法检测该20例胃癌标本中Claudin-4蛋白和mRNA在胃癌组织、正常胃组织中的表达情况。另48例胃癌手术标本仅制成石蜡切片,采用免疫组织化学染色方法检测Claudin-4蛋白在胃癌组织中的表达情况。分析Clau-din-4表达情况与胃癌分化、浸润、转移和组织分型间的相关性。结果胃癌组织中Claudin-4的表达显著高于正常胃上皮组织（P〈0.05）;Claudin-4在Lauren分型肠型胃癌和BorrmannⅠ型、Ⅱ型胃癌组织中的表达分别显著高于弥漫型胃癌和BorrmannⅢ型、Ⅳ型胃癌（P〈0.05）;Claudin-4的表达与胃癌分化相关,胃癌分化越好,Claudin-4表达越高（P〈0.05）。结论 Claudin-4与胃癌的发生、发展及胃癌的生物学行为密切相关,并可能成为预测胃癌生物学行为的重要指标。     

抑癌基因RASSF1A mRNA在胃癌中的表达及临床意义

目的:检测抑癌基因RASSF1A mRNA在胃癌中的表达情况,探讨RASSF1A在胃癌发生发展中的作用及临床意义。方法:采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)分别检测40例胃癌及40例配对的癌旁组织(距癌2 cm)和40例配对远离胃癌的手术切缘正常组织(距癌5cm以上)RASSF1A mRNA的表达水平。结果:RASSF1A mRNA在胃癌中表达的阳性率(35%)显著低于癌旁组织(87.5%)和正常组织(100%)(P均<0.05),癌旁组织明显低于正常组织(P<0.05),且早期胃癌RASSF1A mRNA表达明显高于进展期胃癌(P<0.05)。结论:在原发性胃癌组织中,RASSF1A mRNA表达明显缺失或低下,且与胃癌临床分期显著相关。     

抑癌基因RASSF1A mRNA在胃癌中的表达及临床意义

目的：检测抑癌基因RASSF1A mRNA在胃癌中的表达情况,探讨RASSF1A在胃癌发生发展中的作用及临床意义。方法：采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）分别检测40例胃癌及40例配对的癌旁组织（距癌2 cm）和40例配对远离胃癌的手术切缘正常组织（距癌5cm以上）RASSF1A mRNA的表达水平。结果：RASSF1A mRNA在胃癌中表达的阳性率（35%）显著低于癌旁组织（87.5%）和正常组织（100%）（P均〈0.05）,癌旁组织明显低于正常组织（P〈0.05）,且早期胃癌RASSF1A mRNA表达明显高于进展期胃癌（P〈0.05）。结论：在原发性胃癌组织中,RASSF1A mRNA表达明显缺失或低下,且与胃癌临床分期显著相关。     

微小RNA-133b在胃癌中的表达及意义

目的 研究miR-133b在胃癌细胞、正常胃黏膜上皮永生化细胞、胃癌组织及相应癌旁组织中的表达,探讨miRNA对胃癌发生发展的调控作用。方法 培养7种胃癌细胞株及正常胃黏膜上皮细胞,并收集56例胃癌患者癌组织及相应癌旁组织,提取细胞及组织中总的Small RNA,采用real-timePCR法检测miR-133b在胃癌细胞及组织中的表达,分析miR-133b的表达与细胞分化程度、临床病理特征的关系。结果 miR-133b在胃癌细胞及组织中均表达下调,差异具有统计学意义。miR-133b的低表达与细胞分化程度、TNM分期及有无淋巴结转移显著相关。结论 miR-133b在胃癌细胞及胃癌组织中的表达明显下调,可能作为抑癌基因参与胃癌的发生、发展。     

乳腺癌中VEGF基因mRNA的表达及其与临床病理因素的关系

目的探讨乳腺癌组织中血管内皮生长因子（vascular endothelial growth factor,VEGF）mRNA表达情况及其与临床病理因素及其他分子指标的关系。方法应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应检测48例乳腺癌组织,20例乳腺纤维腺瘤组织VEGF mRNA的表达,并以免疫组化SABC法检测VEGF蛋白在乳腺癌、乳腺纤维腺瘤组织中的表达,分析其与乳腺癌中HER-2,ER,PR蛋白表达的关系。结果经实时荧光定量RT-PCR法检测,VEGF121mRNA、VEGF165mRNA在乳腺癌组织,乳腺纤维腺瘤组织中的2-ΔCt值分别为：0.5733±0.1764、0.310±0.098,0.2961±0.0845、0.2657±0.0342。乳腺癌组织的VEGF mRNA阳性表达率均显著高于乳腺纤维腺瘤组织（P〈0.05）,但与患者的年龄、淋巴结转移、肿块大小、组织学分级、pTNM分期等临床病理因素无关（P〉0.05）。HER-2在乳腺癌和纤维腺瘤中表达分别为18.8%0、%,差异具有显著性（P〈0.05）。Spearman等级相关分析表明VEGF与HER-2,ER,PR表达不相关（P〉0.05）。HER-2与雌激素受体、孕激素受体的表达呈负相关（γ=-0.335,P=0.005;γ=-0.300,P=0.012）。结论 VEGF在乳腺癌中高表达,但与ER,PR表达不相关。HER-2可作为判断乳腺癌预后的1个重要参考指标。     

TSAP6在胃癌组织中的表达及预后分析

目的:探讨抑癌基因激活途径-6(tumor suppressor-activated pathway 6,TSAP6)在胃癌中的表达及临床意义。方法:应用实时荧光定量PCR(Real time PCR)、Western blot和免疫组化方法检测128例胃癌组织及其癌旁组织中TSAP6表达情况,并对临床病理资料和预后因素进行分析比较。结果:单因素分析显示:TSAP6的表达与胃癌患者的远处转移、合并其他脏器转移、淋巴结转移及手术方式密切相关(P<0.05),而与性别、年龄、肿瘤大小、肿瘤数目、既往史、家族史和病理分型无关。在Kaplan-Meier生存分析、Logistic回归分析及Cox回归模型中,TSAP6是胃癌预后的独立因素。结论:TSAP6低表达水平的胃癌患者预后差,并对肿瘤发生、发展起重要作用。     

肝癌患者血清中lncRNA HOTAIR表达与临床病理特征的相关性及诊断价值

目的 分析血清长链非编码RNA HOX转录反义RNA(IncRNA HOTAIR)在肝癌患者中的表达与临床诊断意义。方法 选取100例肝癌患者为研究对象,并将其纳入肝癌组,另选取同期收治的80例肝硬化患者纳入肝硬化组,同时选取同期行体检的75例健康体检者纳入对照组。采集3组5 ml静脉血,以实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测对比3组血清IncRNA HOTAIR相对表达量。同时,收集肝癌患者的年龄、性别等一般资料,分析血清IncRNA HOTAIR与其临床病理特征的关系;另外绘制受试者工作曲线(ROC),分析血清IncRNA HOTAIR在肝癌中的诊断效能。结果 肝癌组的IncRNA HOTAIR相对表达量[(2.53±0.58)]高于肝硬化组[(0.81±0.25)]与对照组[(0.20±0.05)],差异有统计学意义(P<0.05)。IncRNA HOTAIR表达与肝癌患者的TNM分期、血管侵犯、肝外转移有关,差异有统计学意义(P<0.05);IncRNA HOTAIR表达与患者的年龄、性别、肿瘤数目无关,差异无统计学意义(P>0.05)。ROC结...     

哺乳类雷帕霉素靶蛋白在白血病患者中表达的意义

目的 研究白血病细胞中哺乳类雷帕霉素靶蛋白(mTOR)表达情况.方法 采用实时荧光定量PCR检测白血病患者的mTOR mRNA表达情况.结果白血病患者中新近诊断组及复发组mTOR mRNA表达水平明显高于健康对照组和完全缓解组.未缓解组mTOR mRNA表达水平明显高于健康对照组.与新近诊断组和复发组差异无统计学意义.结论 mTOR mRNA表达水平的增高与白血病的发生密切相关.     

FAF1 mRNA在人胃癌组织中的表达及其临床意义

目的:分析FAF1 mRNA的表达水平与胃癌临床指标的关系。方法:用荧光实时定量聚合酶链反应(Real time PCR)技术定量检测40例胃癌患者癌组织、癌旁组织及正常组织中FAF1 mRNA的表达情况。结果:FAF1 mRNA在癌组织中的表达水平(0.27±0.12)明显低于癌旁(0.40±0.06)和正常组织(0.48±0.08)(P<0.01)。FAF1 mRNA在胃癌中的表达水平与癌细胞分化程度、远处转移有关,而与年龄、性别、浸润深度、临床分期、有无淋巴结转移及肿瘤大小无关。结论:FAF1可能与胃癌的发生与发展有关。FAF1异常表达在胃癌细胞分化过程中可能发挥重要作用。     

FAF1 mRNA在人胃癌组织中的表达及其临床意义

目的:分析FAF1mRNA的表达水平与胃癌临床指标的关系.方法:用荧光实时定量聚合酶链反应(Real time PCR)技术定量检测40例胃癌患者癌组织、癌旁组织及正常组织中FAF1mRNA的表达情况.结果:FAF1mRNA在癌组织中的表达水平(0.27±0.12)明显低于癌旁(0.40±0.06)和正常组织(0.48±0.08)(P＜0.01).FAF1mRNA在胃癌中的表达水平与癌细胞分化程度、远处转移有关,而与年龄、性别、浸润深度、临床分期、有无淋巴结转移及肿瘤大小无关.结论:FAF1可能与胃癌的发生与发展有关.FAF1异常表达在胃癌细胞分化过程中可能发挥重要作用.     

癌基因iASPP在胃癌中的表达及临床意义

目的:研究iASPP(inhibitor member of the ASPP family)在胃癌中的表达及其与临床病理特征的关系。方法:用RT-PCR方法检测iASPP mRNA在60例胃癌及对应的癌旁组织中的表达,并研究其与临床病理特征的关系。结果:胃癌组织中iASPP阳性表达率明显高于癌旁组织(P<0.05),胃癌组织中iASPP表达水平(0.503±0.336)明显高于癌旁组织(0.205±0.108)。胃癌中iASPP的高表达同肿瘤分化程度和肿瘤浸润深度以及患者无瘤生存时间有关(P<0.05)。结论:iASPP与胃癌的发生发展有关,影响胃癌的分化及患者预后,有望成为胃癌治疗的新靶点。     

癌基因iASPP在胃癌中的表达及临床意义

目的：研究iASPP（inhibitor member of the ASPP family）在胃癌中的表达及其与临床病理特征的关系。方法：用RT-PCR方法检测iASPP mRNA在60例胃癌及对应的癌旁组织中的表达,并研究其与临床病理特征的关系。结果：胃癌组织中iASPP阳性表达率明显高于癌旁组织（P〈0.05）,胃癌组织中iASPP表达水平（0.503±0.336）明显高于癌旁组织（0.205±0.108）。胃癌中iASPP的高表达同肿瘤分化程度和肿瘤浸润深度以及患者无瘤生存时间有关（P〈0.05）。结论：iASPP与胃癌的发生发展有关,影响胃癌的分化及患者预后,有望成为胃癌治疗的新靶点。     

Syndecan-1和HPA-1 mRNA在胃癌组织中的表达及其与胃癌侵袭转移的关系

背景与目的：Syndecan-1和HPA-1（乙酰肝素酶-1）可能参与多种恶性肿瘤的侵袭转移,但关于两者与胃癌的关系较少报道。本研究旨在探讨Syndecan-1mRNA和HPA-1mRNA在胃癌组织中的表达及两者与胃癌侵袭转移的关系。方法：采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）分别检测了58例胃癌及58例配对的癌旁组织（距癌2cm）和58例配对远离胃癌的手术切缘正常组织（距癌5cm以上）Syndecan-1和HPA-1的mRNA的表达水平,分析探讨两者与胃癌临床病理特征和胃癌侵袭转移的关系。结果：HPA-1mRNA在胃癌中表达的阳性率（86.2%）显著高于癌旁组织（27.6%）和正常组织（5.2%）（P均〈0.001）,癌旁组织明显高于正常组织（P均〈0.05）。Syndecan-1mRNA在正常组织中表达的阳性率（98.3%）显著高于癌旁组织（25.9%）和胃癌组（5.2%）（P均〈0.001）,癌旁组织中明显高于胃癌组织（P均〈0.05）。Syndecan-1的表达减弱和HPA-1的表达增强与肿瘤的分化程度、浸润深度、淋巴结转移、远处转移及TNM分期显著相关（P〈0.05）。Syndecan-1mRNA的表达与HPA-1mRNA的表达呈负相关。结论：Syndecan-1mRNA在正常胃组织中呈高表达,HPA-1mRNA在胃癌组织中呈高表达,且Syndecan-1的表达减弱与HPA-1的表达增强可促进胃癌的侵袭转移。联合检测Syndecan-1mRNA及HPA-1mRNA对于指导胃癌临床治疗及判断预后有重要价值。     

人端粒酶逆转录酶mRNA在胃癌组织中的定量表达及其与胃癌预后的关系

目的 探讨人端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA在胃癌组织中的表达,及其与胃癌生物学行为和根治术后患者预后的关系.方法 应用荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测89例胃癌根治性切除术后患者的肿瘤组织和阴性切缘组织中hTERT mRNA的表达量,对hTERT mRNA表达量与患者的临床病理参数(年龄、性别、肿瘤大小、肿瘤部位、病理类型、组织分化程度、浸润深度、淋巴结转移情况、pTNM分期及生存期)进行单因素分析,采用Cox模型进行胃癌患者生存的多因素分析.结果 hTERT mRNA在阴性切缘组织中的表达量为11.37±2.15,在胃癌组织中的表达量为16.98±3.56,差异有统计学意义(P<0.05).胃癌组织中hTERT mRNA的表达量与组织学分级、浸润深度、pTNM分期及淋巴结转移呈正相关(P<0.05),与胃癌患者的生存期呈负相关(P<0.01).结论 胃癌组织中hTERT mRNA高表达表明胃癌恶性程度较高且病期较晚,检测胃癌组织中hTERTmRNA的表达水平有助于对胃癌患者的预后做出更准确的判断.胃癌组织中hTERT mRNA的表达量、肿瘤浸润深度和pTNM分期是影响胃癌患者预后的重要因素.

Abstract：

Objective By quantitative detection of telomerase expression, we investigated the relationship between telomerase expression and malignant behavior and prognosis in gastric carcinoma.Methods A real-time quantitative RT-PCR (RQ-PCR) was used to quantify the hTERT mRNA copy numbers in 89 samples of gastric carcinoma and corresponding non-cancerous tissues.The clinicopathological data of enrolled patients such as age, sex, tumor size, tumor site, pathologic type, histodifferentiation,infiltration depth, lymph node metastasis, stage and survival were obtained, and were made one factor analysis of variance and COX regression prognostic analysis with those above mentioned markers.Follow-up was completed as of February 28, 2010.The median follow-up was 24 months.Results hTERT from gastric carcinomas and corresponding non-cancerous tissues was 16.98 ± 3.56 and 11.37 ± 2.15, respectively (P<0.05 ),the telomerase activity in gastric cancer was significantly higher than that in non-cancerous tissue ( P < O.05 ).Telomerase activity showed a positive correlation with depth of invasion, tumor differentiation and nodal metastasis ( P < 0.01 ), and negative correlation with survival.Conclusions Gastric cancer with high hTERT mRNA expression indicates a more malignant potential.Detection of hTERT mRNA in gastric cancer may be useful in a better understanding of invasion, metastasis, as well as prognosis of gastric cancer and provide a more efficient therapy.The quantitative expression of hTERT mRNA, infiltration depth and pTNM stage are significant afactors affecting the prognosis of patients with gastric carcinoma.     

哺乳类雷帕霉素靶蛋白在白血病患者中表达的意义

 目的　研究白血病细胞中哺乳类雷帕霉素靶蛋白（mTOR）表达情况。方法　采用实时荧光定量PCR检测白血病患者的mTOR mRNA表达情况。结果　白血病患者中新近诊断组及复发组mTOR mRNA表达水平明显高于健康对照组和完全缓解组。未缓解组mTOR mRNA表达水平明显高于健康对照组,与新近诊断组和复发组差异无统计学意义。结论　mTOR mRNA表达水平的增高与白血病的发生密切相关。     

CD147和Annexin Ⅱ在正常人体组织中的表达分布

目的：检测CD147和Annexin Ⅱ在20种正常组织中的表达量,探讨两者分布情况及相关性.方法：Realtime RT-PCR检测CD147和Annexin Ⅱ的mRNA表达水平,并以β-actin为内参进行定量标准化.结果：CD147和Annexin Ⅱ在20种组织中均有表达,尤以肺和胎盘中表达量高,两基因的表达差异有一定相关性.结论：采用Realtime RT-PCR方法成功的获得了CD147和Annexin Ⅱ在正常人体组织中的表达分布.     

乳腺癌组织中Id1基因mRNA的表达及其与临床病理的关系

Id1基因;乳腺癌;实时荧光定量逆转录聚合酶链反应     

miR-214在胃癌患者外周血中的表达及其临床意义

目的探讨miR-214在胃癌中的表达及临床意义。方法采用实时荧光定量PCR法,检测40例胃癌患者癌组织及癌旁组织中miR-214的差异表达;同时检测血浆miR-214在56例胃癌患者及40例正常组织中的表达。结果miR-214在胃癌组织中的表达水平明显高于癌旁组织;与正常组织比较,胃癌患者中的血浆miR-214表达明显增高;血浆miR-214表达与患者性别、年龄无关,与疾病分期及生存期密切相关,差异具有统计学意义(P<0.05);Cox回归分析发现疾病分期、miR-214的表达可作为独立的预后因子(P<0.05)。结论循环miR-214表达与胃癌肿瘤分期和生存时间相关,检测循环miR-214可能作为评估胃癌患者临床预后的靶基因。     

S100A9在宫颈鳞状细胞癌中的表达

的：探讨S100A9在宫颈鳞状细胞癌组织中的表达.方法：采用实时定量RT-PCR的方法检测12例宫颈鳞状细胞癌组织及10例正常宫颈组织中S100A9 mRNA的表达水平.结果：S100A9 mRNA在宫颈鳞状细胞癌组织中的相对表达量为2.72±2.50,在正常宫颈组织中的相对表达量为8.34±2.94,差异具有统计学意义（P〈0.01）.结论：S100A9在宫颈鳞状细胞癌组织中表达下调,可能是宫颈鳞状细胞癌变过程中具有抑癌作用的基因.