荧光定量聚合酶链反应检测血清中HBV-DNA

目的 :研究荧光定量聚合酶链反应 (FQ PCR)检测HBV DNA对辨别病毒复制的临床意义。方法 :采用FQ PCR和ELISA方法 ,检测 79例患者血清HBV DNA拷贝数和免疫学血清指标。结果 :2 6例HBsAg、HBeAg、抗 HBc均阳性的标本 ,HBV DNA也全部阳性 ,平均拷贝数为 2 .7× 10 5/mL。 8例HBsAg、HBeAg阳性的标本 ,HBV DNA也全部阳性 ,平均拷贝数为5 .2× 10 4/mL。 2 1例HBsAg、抗 HBe、抗 HBc均阳性的标本HBV DNA阳性率为 6 6 .7% ,平均拷贝数为 3.1× 10 4/mL。 9例HBsAg阳性的标本HBV DNA阳性率为 11%。平均拷贝数为1.4× 10 3 /mL。结论 :荧光定量聚合酶链反应检测HBV DNA可以更加准确地判断HBV的感染和复制情况。     

荧光定量聚合酶链反应技术在检测CT及UU中的应用

沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis, CT)和解脲支原体(Ureaplasma urealyticum, UU)作为非淋菌性尿道炎(NGU)的主要病原体,在世界范围内,其流行和传播呈逐年上升趋势,在欧美等国家己超过了淋球菌,居于性传播疾病之首.如美国CT及UU引起的NGU发病数是淋菌性尿道炎(GU)的二倍[J].我国1993-1994年全国性病监测点报道,NGU的感染率仅次于淋病、尖锐湿疣,占第3位[2].而金氏报道,南京市1996年NGU的发病率为20.67%,己升至该地区性病发病率的第二位[3].CT及UU感染者一般临床症状不典型,且潜伏期也较长,因此易为临床所忽视,对CT和UU的诊断,主要依据实验室检测.本文应用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)技术,对682例疑为CT及UU感染的患者,进行了病原体基因的定量测定,就目前CT和UU的检验现状,作者还进行了简要评价,现报告如下.     

荧光定量聚合酶链反应检测慢性乙肝患者HBV DNA的意义

目的探讨荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)检测慢性乙肝患者血清乙型肝炎病毒(HBV)脱氧核糖核苷酸(DNA)的临床意义。方法回顾性分析248例慢性乙肝患者的资料,均采用FQ-PCR技术检测血清HBV DNA,检测乙肝病毒标志物(HBV-M)并对比不同HBV-M患者血清HBV DNA水平;对比不同病情患者血清HBV DNA水平;对比不同HBV DNA表达患者外周血T淋巴细胞亚群水平及异常率,分析患者血清HBV DNA水平与外周血T淋巴细胞亚群水平的关系。结果不同HBV-M患者血清HBV DNA水平对比:HBsAg+HBeAg+HBcAb>HBsAg+HBeAg>HBsAg+HBsAb+HBcAb>HBsAg+HBeAb>HBsAb+HBeAb+HBcAb>HBcAb/HBsAb+HBeAb/HBeAb+HBcAb,除HBcAb、HBsAb+HBeAb、HBeAb+HBcAb血清HBV DNA水平差异无统计学意义(P>0.05),其余每2样本比较差异均有统计学意义(P<0.05);不同病情患者血清HBV DNA水平对比:重度病情患者>中度病情患者>轻度病情患者(P<0.05);不同HBV DNA表达患者CD3+、CD4+、CD4+/CD8+对比,HBV DNA阴性患者>低拷贝患者>高拷贝患者(P<0.05),CD3+、CD4+、CD4+/CD8+异常率对比,HBV DNA阴性患者<低拷贝患者<高拷贝患者(P<0.01);本组患者血清HBV DNA水平与外周血CD3+、CD4+、CD4+/CD8+均呈负相关(r=-0.789、-0.812、-0.706,P=0.012、0.007、0.001)。结论在慢性乙肝患者中FQ-PCR检测血清HBV DNA水平与HBV-M、病情和外周血T淋巴细胞亚群水平均有密切关系。     

荧光定量聚合酶链反应检测乙型肝炎病毒DNA

目的 建立检测HBV病毒DNA的荧光定量PCR法（FQ-PCR）,并与运用常规凝胶电泳技术观察特异扩增带检测的结果加以比较。方法 合成扩增HBV DNA314bp特异保守序列的1对引物及1条带2个荧光基团的寡核苷酸探针。用PE-5700型定量PCR仪完成PCR反应及产物的荧光定量检测。同是PCR产物经琼脂糖凝胶电泳,EB染色,UVP（凝胶成像仪）检出有314bp带者为阳性或弱阳性。结果 建立了检测HBVDNA的荧光定量PCR技术,用已知HBV阳性模板不同拷贝数的标准溶液测得标准曲线Ct,原始拷贝数在10^5/ml以上者为阳性,用定量及定性PCR2种方法检测698例血清标本的结果表明：用FQ-PCR技术共检测出204例为阳性,阳性率29.2%;用定量及定性PCR2种方法检测698例血清标本的结果表明：用FQ-PCR技术共检测出204例为阳性,阳性率29.2%;用定性PCR观察到193例有阳性特异带,阳性检出率为27.65%。没有发现用定性PCR检测为阳性而用FQ-PCR检测为阴性者。结论 FQ-PCR检测HBVDNA较普通定性PCR技术具有操作简便,灵敏度更高、减少发生污染可导致假阳性结果的可能性及自动化程度高等优点,值得在临床检验中推广应用。     

荧光定量聚合酶链反应检测宫颈炎患者沙眼衣原体感染的临床应用

目的了解宫颈炎患者沙眼衣原体的感染状况。方法采用荧光定量聚合酶链反应技术,对426例宫颈炎患者沙眼衣原体的感染状况进行了检测。结果在上述426例宫颈炎患者中检测出沙眼衣原体阳性标本60例,阳性率为14.08%(60/426)。结论在宫颈炎患者中沙眼衣原体有较高的感染率。     

实时荧光定量反转录聚合酶链反应检测HLA-DRα基因mRNA表达

目的 建立实时荧光定量反转录聚合酶链反应（RT-PCR）法检测HLA-DRα基因mRNA表达。方法应用T-A克隆技术构建含HLA-DRα基因的载体作为标准模板,采用荧光Taqman方法及探针标记技术,建立实时荧光定量RT-PCR方法,制备标准曲线,检测牛膝多糖（ABPS）诱导人外周血单核细胞的HLA-DRα mRNA表达水平变化,并与半定量RT-PCR检测结果进行比较。结果实时荧光定量RT-PCR检测ABPS诱导人外周血单核细胞实验组HLA-DRα mRNA表达明显升高,而无ABPS诱导人外周血单核细胞对照组HLA-DRα mRNA表达没有改变,且半定量RT-PCR结果显示HLA-DRα出现类似的变化趋势。结论所建立的实时荧光定量RT-PCR用于检测HLA-DRα mRNA表达,结果用拷贝数表示,比半定量RT-PCR更灵敏、准确。     

荧光定量聚合酶链反应检测精液中沙眼衣原体

用荧光定量聚合酶链法对126名男性不育患者和60名正常生育男性的精液进行了沙眼衣原体检测,男性不育组阳性率为19.8%,生育组阳性率为5.0%,两组比较有显著差异。     

荧光定量聚合酶链反应检测人乳头瘤病毒6/11型

目的 了解女性阴道炎患者人乳头瘤病毒6／11型（HPV6／11）的感染情况。方法 用荧光定量聚合酶链反应（FQ－PCR）技术检测129例门诊患者阴道分泌物中HPV6／11的病毒拷贝数。结果 共检出HPV6／11阳笥者47例,阳性率为36．43％;拷贝数在10^5以上者39例,占阳性者中的82．98％;40岁以上年龄组阳性率高且病毒复制量均在10^5以上。结论 中老年阴道炎患者就诊晚,感染重。FQ－PCR检测HPV敏感、快速、准确,特别是其定量特点对临床很有意义。     

荧光定量聚合酶链反应在小儿人巨细胞病毒感染检测中应用

目的探讨荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)在小儿人巨细胞病毒(HCMV)感染检测中的临床应用价值。方法选择2012年1月至2013年10月在武汉市妇女儿童医疗保健中心就诊的疑似HCMV感染患儿血清或尿液标本,其中血清标本454例,尿液标本1 001例,患儿男女比为1 005∶394,年龄1天~3岁。用FQ-PCR检测疑似HCMV感染患儿血清和尿液中的HCMV-DNA,比较两种标本的阳性率。结果 1 001例尿液标本的HCMV-DNA阳性率为46.35%(464/1 001),显著高于血清标本的阳性率5.95%(27/454);56例血清和尿液标本HCMV-DNA进行配对检测,其中血清检测阴性的52例中有23例尿液检测为阳性,而血清检测阳性的4例尿液检测均为阳性。结论应用FQ-PCR检测患儿HCMV-DNA,采用尿液标本可提高阳性检出率。     

聚合酶链反应检测乙型肝炎患者肾组织中的HBV DNA

应用巢式聚合酶链反应（ＰＣＲ）技术对１１例乙型肝炎患者石蜡包埋的肾、肝组织中的ＨＢＶＤＮＡ进行了检测，并与其免疫组化及原位杂交结果作了比较。二组引物检测的结果表明：在肝组织中均有ＨＢＶ的感染，其中５例存有ＨＢＶ的复制；倚组织中ＨＢＶＤＮＡ的检出率为８／１１（７２．７％），未检测出有ＨＢＶ的复制，包括２例有膜性肾炎和膜增生性肾炎病变的病例。ＨＢＶ可以感染肾组织但并不在肾组织中复制。这一实验结果较为支持乙型肝炎患者肾脏出现的病变可能系沉积于肾小球内的免疫复合物介导损伤的结果。     

实时定量PCR检测HBV核酸载量测量不确定度的构成分析

 目的 研究实时荧光定量PCR用于乙型肝炎病毒（HBV）核酸载量检测时的测量不确定度构成。 方法 采用实时荧光定量PCR检测乙型肝炎患者血清标本中HBV核酸载量，收集检测过程中的各类数据，计算以下6种来源的测量不确定度，对该方法的测量不确定度构成进行评估。⑴标本浓缩的不确定度（uenrich）；⑵核酸提取的不确定度（uex）；⑶扩增反应体系的不确定度（upcr）；⑷热循环仪的不确定度（uins）；⑸数据处理的不确定度（uana）；⑹加样枪的不确定度（upip）。其中热循环仪的不确定度检测样本数为7份，其他各种不确定度检测的样本数为10份。 结果 核酸浓度为5.610E+07拷贝/ml的标本，其浓缩过程来源的相对不确定度达0.437；核酸提取来源的浓度真值无偏估计在6.585E+03、9.067E+04、7.223E+06拷贝/ml样本的相对不确定度分别为0.249、0.173、0.140；热循环仪和数据分析来源的相对不确定度分别为0.020和不大于0.050。 结论 标本制备过程中的浓缩和DNA提取步骤所带来的不确定度是实时荧光定量PCR检测HBV核酸载量测量不确定度的主要分量，因此标本制备处理的方法与标准操作程序能否有效地提取核酸并去除PCR反应的抑制物对于该项检测十分关键；起始模板浓度与测量不确定度相关，低浓度的样本显示出更大的相对不确定度。     

荧光定量PCR检测沙眼衣原体及临床应用

目的：用荧光定量聚合酶链反应（FQ－PCR）检测沙眼衣原体的含量,探讨FQ－PCR在衣原体性尿道炎诊断中的价值。方法：应用荧光探针标记引物的荧光定量聚合酶链反应对172例疑为沙眼衣原体感染患者标本进行检测,并与常规PCR（电泳－EB染色）进行比较。结果：FQ－PCR阳性率为19．8％,常规PCR法为20．9％,两法符合率为63．9％。女性宫颈分泌物标本FQ－PCR阳性为29．2％,常规PCR法为16．7％;男性分泌物FQ－PCR阳性率为16．9％,常规PCR法为13．8％。FQ－PCR特异性较常规PCR法高。结论;FQ－PCR在扩增中实时在线检测,并选择理想的标准曲线做出较精确的临值分析,具有较高的特异性和敏感性,对病原体的诊断有一定的临床意义。     

反转录酶活性检测实时荧光定量PCR方法的建立

目的在传统产物增强性反转录酶（PERT）活性检测方法基础上建立检测反转录酶活性的实时荧光定量PCR方法。方法以噬菌体MS2RNA为模板,设计、合成引物和探针,并分别以连续10倍倍比稀释的AMV反转录酶（1×10-1～1×10-9U/μl）标准品催化体外反转录反应合成相应cDNA。采用实时荧光定量PCR法检测底物cDNA模板量,并获得相应的PCR荧光值曲线,分析AMV反转录酶的相对活性。同时应用传统PERT方法对cDNA进行扩增,测定该方法的灵敏度。结果将AMV反转录酶标准品连续10倍倍比稀释后催化反转录反应,实时荧光定量PCR分析所得的反转录产物cDNA,结果得到与理论值完全相符合的PCR标准荧光值曲线;定量分析结果显示,浓度为1×10-2～1×10-8U/μl的AMV反转录酶均可得到相应的荧光值。不同稀释度的AMV反转录酶,经传统PERT方法扩增后,结果显示浓度为1×10-3～1×10-7U/μl的AMV反转录酶均可见大小为112bp的阳性条带,检测灵敏度达到1×10-7U/μl。结论成功建立了基于实时荧光定量PCR技术的检测反转录酶活性的新方法,实验操作简单,具有高精确性和无污染性,为生物制品外来污染尤其是反转录病毒污染的检测提供了参考指标。     

慢性乙肝患者HBV核心基因一组单核苷酸多态性与血清HBV DNA水平的相关性研究

目的 研究慢性乙肝患者HBV核心基因的单核苷酸多态性(SNP)与血清HBV DNA水平的相关关系.方法 采用PCR-RFLP和限制性内切酶Tsp509I榆测HBV核心基因的SNP,采用双脱氧终止法对核心基因进行序列测定,实时荧光PCR技术用于HBVDNA水平的定量检测.结果 慢性乙肝人群中发现5种典型的PCR-RFLP图谱,分别是RFLP-C、RFLP-D、RFLP-E、RFLP-G和RFLP-C/G,各种RFLP图谱的分布频率依次为61.5%、2.6%、9.6%、16.7%和9.6%.A165T、A336C、A336T、T337C和T385C等5种SNP与RFLP图谱的变化有关,但是只有SNP A336C和A336T会导致HBcAg第83位的Glu被Asp所替代.RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组(P=0.02)和RFLP-C/G组(P=0 006),而且RFLP-C/G组患者血清ALT的阳性率显著低于RFLP-C、RFLP-E和RFLP-G组;当HBeAg阳性时,RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组(P=0.015)和RFLP-C/G组(P=0.008).结论 本研究中使用的PCR-RFLP能够用于检测核心基因的SNP,RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组和RFLP-C/G组,可能与Glu83 Asp突变有关.

Abstract：

Objective To investigate the relation between a set of single nucleotide polymorphisms (SNP) in core gene of HBV in chronic hepatitis B patients and HBV DNA levels. Methods PCR restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP) assay and restriction enzyme Tsp509I were adopted to determine HBV SNP in HBV core gene. Nucleotide sequences of core gene were determined using the dideoxy chain termination method. HBV DNA levels were quantitated with real-time PCR. Results Five typical RFLP patterns, RFLP-C, RFLP-D, RFLP-E, RFLP-G and RFLP-C/G mixture were found and the distribution of HBV RFLP patterns was as follows: C, 61. 5% ; D, 2. 6% ; E, 9.6%; G, 16.7%; C/G mixture, 9.6%. Five SNPs, A165T, A336C, A336T, T337C and T385C, were found to be associated with RFLP patterns change and only SNP A336C or A336T caused the substitution of Glu-83 with Asp in HBcAg. The serum HBV DNA levels in RFLP-C group were higher than that in RFLP-G (P =0. 02) and RFLP-C/G group(P = 0. 006) , respectively, furthermore, the positive rate of serum ALT in RFLP-C/G group was lower than that in RFLP-C, RFLP-E and RFLP-G group, respectively. Under the condition of HBeAg-positive, the serum HBV DNA levels in RFLP-C group were higher than that in RFLP-G (P = 0. 015) and RFLP-C/G group(P =0.008) , respectively. Conclusion PCR-RFLP used in this study can be adopted to determine HBV SNPs, not genotypes in Chinese patients with chronic hepatitis B. The serum HBV DNA level in RFLP-C group higher than that in RFLP-G or RFLP-C/G group maybe associated with amino acid mutation, Glu83 Asp.     

实时荧光定量PCR测定胸腺近期输出功能方法的建立和应用

目的建立一种准确、快速的检测胸腺输出功能的方法。方法根据TCRδ基因序列,设计引物和探针,建立实时荧光定量PCR检测T细胞受体重排切除环(TRECs)的方法;并用于检测正常人及慢乙肝PBMCs中TRECs的含量。结果建立了测定TRECs含量的实时荧光定量PCR方法,产物与预计长度相符,序列正确;最低可扩增出5copies的模板;重复五次,Ct值的变异系数为1.06%。正常人21~45岁组的TRECs含量为(7767.4±2369.5)copies/106 PBMCs,16~20岁组为(28374.4±7820.4)copies/106 PBMCs,21~45岁慢乙肝组(6480.9±2031.2)copies/106 PBMCs,正常人21~45岁组分别与16~20岁组、同龄慢乙肝组比较差异均有统计学意义,P<0.05。结论实时荧光定量PCR检测TRECs的方法特异性强,灵敏度高,重复性好。正常人21~45岁组的胸腺输出功能低于16~21岁组,慢乙肝组低于同龄正常人。     

定量聚合酶链反应检测肝病患者血清中乙型肝炎病毒 …

目的 了解肝病患者血清乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）ＤＮＡ的含量，以便观察临床抗病毒治疗效果及血清ＨＢＶ ＤＮＡ水平与病情及预后的关系。方法 应用荧光素标记的半巢式引物在扩增中能量转移的定量聚合酶 链反应（ＱＰＣＲ），对６３例肝功能异常的肝病患者血清进行ＨＢＶ ＤＮＡ含量测定，并与普通ＰＣＲ及酶联免疫吸附试验（ＥＬＩＳＡ）进行比较。结果 ＱＰＣＲ阳性率为８２。５４％，普通ＰＣＲ法为７１．４３％，ＥＬＩＳＡ     

高灵敏度乙肝HBV DNA检测在乙肝诊疗中的应用及临床意义

目的探讨高灵敏度乙肝HBV DNA检测在乙肝诊疗中的应用及临床意义。方法收集23例普通荧光定量PCR(常规)检测HBV DNA为阴性患者的血清,采用高灵敏度乙肝HBV DNA检测,将检测数据进行整理,与其临床实验室资料相结合,进行综合分析,归纳总结。结果23例国产乙肝荧光定量 PCR检测均为阴性患者,使用高灵敏度乙肝HBV DNA检测结果为13例阳性（最低检测限20IU/mL）,阴性10例,阳性检出率为56.52%,显然高灵敏度乙肝 HBV DNA检测的灵敏度高于常规检测方法。结论高灵敏度乙肝HBV DNA检测,其检测敏感性远高于常规检测方法,能检测到体内低水平的 HBV DNA,结合患者其他实验室资料及用药史综合分析,对乙型肝炎诊断和治疗具有重要的指导意义。     

不同慢性肝病患者血清中乙型肝炎病毒DNA定量检测及其临床意义

目的探讨乙型肝炎病毒ＤＮＡ含量的临床意义。了解乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）免疫标志不同状态的慢性肝病患者血清ＨＢＶＤＮＡ浓度及其临床意义。方法应用建立的竞争性聚合酶链反应（ＰＣＲ）方法定量检测慢性肝炎（ＣＨ）５１例、肝硬化（ＬＣ）３６例、原发性肝癌（ＰＨＣ）３８例的血清ＨＢＶＤＮＡ浓度。结果ＨＢＶＤＮＡ阳性的ＣＨ患者血清ＨＢＶＤＮＡ浓度为４．３６ｌｏｇ１０ＨＢＶＤＮＡ拷贝５０μｌ（下同），ＬＣ为４．５５，ＰＨＣ为４．４３，三组间无显著性差异（Ｐ＞０．０５）；血清ＨＢＶ五项免疫标志均阴性或抗－ＨＢｓ阳性的慢性肝病患者中，有３７．５％患者存在低水平ＨＢＶ复制；ＨＢｅＡｇ阳性患者的ＨＢＶＤＮＡ浓度总体上明显高于抗－ＨＢｅ阳性组，但其中部分患者的ＨＢＶＤＮＡ浓度也很高。结论提示ＨＢＶ的复制状态与慢性肝病的病期无明显关系；在抗－ＨＢｅ阳性的患者中存在个体差异，故不能仅依据抗－ＨＢｅ阳转来判断ＨＢＶ复制减少或停止。