肿瘤多药耐药基因与表达的分子生物学研究进展

随着抗癌药的广泛应用，肿瘤耐药性问题逐渐引起重视。肿瘤细胞的耐药是肿瘤化疗的主要障碍，造成肿瘤治疗困难和复发。耐药细胞一旦对一种天然药物耐受，对其它多种结构不同作用方式也不同的抗肿瘤药物产生交叉耐药，即多药耐药（ｍｕｌｔｉｄｒｕｇｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ...     

地塞米松和苯妥英钠对癫痫大鼠脑内的GFAP和Fos表达的抑制作用

目的：探讨糖皮质激素（GC）的抗痫效应和抗痫机制。方法：动物行为学观察和免疫细胞化学染色。结果：戊四氮（PTZ）可诱发癫痫大发作,如诺在注入PTZ前30min先注入地塞米松或苯妥英钠（DPH）能减轻或抑制大鼠癫痫发作症状。免疫细胞化学染色结果表明,PTZ致痫组大鼠大脑皮质、海马回、齿状有大量肥大的胶质原纤维酸性蛋白（GFAP）阳性的星形胶质细胞。GC或DPH抗痫组GFAP免疫反应明显减弱,阳性细胞数量减少,突起短而少,Fos蛋白在PTZ组大鼠致痫后1－1．5h有大量表达,而在上述两抗痫组显著少于PTZ致痫组。结论：1．通过与苯妥英钠（传统抗痫药）的抗痫效果相比较,进一步证明糖皮质激素具有抗痫效应。2．糖皮质激素的抗痫机制可能与抑制星形胶质细胞的活动有关。3．Fos蛋白表达的变化与癫痫活动有直接关系。     

激素耐药型与激素敏感型肾病综合征差异表达基因分析

分析;定量PCR验证芯片的基因差异表达结果.结果 与正常对照组相比较,与SRNS组和SSNS组相关的差异基因共157条;聚类分析显示SSNS组与对照组基因表达差异较小,SRNS组与前两者差异明显;功能分析发现与SRNS组相关的差异表达基因主要参与细胞核内生物学活动和细胞信号转导.结论 不同临床和病理类型原发性肾病综合征涉及多个不同的差异基因和生物学途径,其中HLA-DRB4和CLNS1A基因可能在不同类型原发性肾病综合征发病机制中发挥重要作用.     

大鼠中枢神经系统肾母细胞瘤过度表达基因mRNA神经元的发育 …

研究大鼠ＣＮＳ肾母细胞瘤过度表达基因（ｎｏｖ）ｍＲＮＡ神经元的发育。方法原位杂交组织化学和逆转录ＰＣＲ。结果Ｐ０－Ｐ４；原位杂交方法最早检测到ｎｏｖｍＲＮＡ神经元是Ｐ０，Ｐ０－Ｐ４阳性信号均较弱，分布于脑桥和脊髓等。     

多药耐药相关基因 HV126的电子克隆及在化疗前后白血病细胞中的表达

目的探讨白血病细胞多药耐药发生的分子机理，寻找新的多药耐药相关基因。方法以HL-60细胞为“驱动方”，以多药耐药细胞系HL-60／VCR为“实验方”，建立人白血病多药耐药细胞系HL-60／VCR抑制消减杂交文库，利用基因芯片技术从中筛选出一条在野生型HL-60细胞中基本不表达，而在HL-60／VCR耐药细胞中呈低丰度差异表达的新表达序列标记序列。用表达序列标记拼接的同源基因克隆法得到人类新基因HV126序列，再利用生物信息学数据库和软件对其进行功能的预测和分析。最后针对推导序列开放阅读框设计引物，逆转录-聚合酶链反应检测推导HV126基因序列在临床白血病患者化疗前后白血病细胞中的表达。结果HV1126的cDNA序列长1991bp，编码365个氨基酸，其编码蛋白序列局部与新近发现的在细胞凋亡与炎症反应中起重要作用的蛋白基序“PYRIN”存在约43％的相似性。逆转录-聚合酶链反应结果提示该基因与白血病细胞受化疗药物的作用和耐药存在联系。结论HV126可能是与白血病细胞耐药相关的一条新基因，有必要对该基因进行进一步的实验室克隆与功能研究。     

胃癌高表达cDNA片段W41的克隆及组织表达谱分析

目的：从人胃癌组织中克隆新的相关易感基因。方法：利用cDNA末端快速扩增PCR技术得到了扩增片段，将其克隆、核苷酸序列分析，并将序列在GenBank进行同源性比较。利用Northern杂交、多组织Northern及基因表达系列分析了所得基因片段的组织表达谱。结果：获得1条533bp带有poly(A)尾的cDNA片段，可见加尾信号AATAAA，与GenBank基因数据库同源比较，该序列未见与任何已知基因同源，登录GenBank(登录号为AF325202）。该序列在胃癌组织的表达强度高于对应正常组织，多组织Northern及基因表达系列分析表明该序列在多种肿瘤组织中高表达，在正常组织中表达减弱。结论：得到了1条与胃癌可能相关的新的cDNA序列。     

cDNA微矩技术用于脓毒症小鼠肺组织中差异性表达基因的检测

目的本文在小鼠盲肠结扎一穿孔引起的混合感染性脓毒症模型上,首次采用了cDNA微矩阵(基因芯片)检测技术,研究脓毒症中肺组织在脓毒症后早期(6h)和晚期(12h)的基因表达的改变,以期从基因水平上揭示脓毒症性急性肺损伤的发病机制并为进一步寻找其新的防治手段打下基础.方法(1)小鼠混合感染性脓毒症的构建以小鼠CLP,构建混合感染性脓毒症模型.(2)CLP后肺组织中差异性表达基因的检测小鼠分为脓毒症组(A组)及假手术对照组(B组)分别于CLP后6h、12h摘取全肺,-70℃保存待测;检测采用上海联合基因公司提供的含2304个小鼠cDNA克隆杂交点的MCEG20S型基因芯片;各组不同时点的肺组织标本经RNA提取、mRNA纯化后,经逆转录反应分别合成标记以Cy5(A组)或Cy3(B组)荧光素的cDNA探针;各时点的A、B两组探针混合后分别与上述基因芯片杂交,经严格洗脱后用ScanArray5000型激光共聚焦扫描仪以两种不同波长分别对芯片进行扫描,得到芯片的荧光信号强度数据;以Image3.0软件分析各时点两组间的荧光值之比(R).R＞2.0为表达上调,R＜0.5为表达下调.结果(1)CLP后小鼠肺组织均出现典型的急性肺损伤的病理改变.24h生存率为40%;48h的生存率为7.5%;72h的生存率为5%.(2)在CLP后6h和12h,共筛选出80个与假手术对照组相比出现差异性表达的已知功能基因,其中表达上调和下调者各40个;CLP后6h有23个已知基因出现差异性表达,其中上调者12个,下调者11个;CLP后12h,有75个已知基因出现差异性表达,其中表达上调者39个,下调者36个;(3)对以上差异性表达基因按其功能予以聚类分析,发现脓毒症引起的急性肺损伤涉及到肺组织中一系列功能基因的表达改变,其中包括免疫相关基因、急时相反应与热休克反应相关基因、抗氧化反应基因、细胞骨架相关基因以及多种细胞代谢和信息传递相关基因.它们对脓毒症的病理生理的演变,可能起了重要的作用.(4)通过对本试验所发现的差异性表达的基因的生物信息学分析,遴选出了具有进一步研究价值或潜在治疗作用的基因.结论脓毒症中,一系列与炎性反应和细胞免疫相关的基因表达增高.同时热休克反应、抗氧化反应以及与细胞能量代谢和骨架结构相关的基因表达抑制,这可能是脓毒症病理生理改变进行性加重的原因.利用基因芯片技术可高效率、大规模地检测脓毒症、AL和MODS时基因表达的改变,高通量筛选与脓毒症发生和发展相关的基因,有利于从分子水平上澄清脓毒症的病理生理机制,比较不同的干预治疗效果,寻找新的治疗目标和治疗药物.     

参脉注射液对缺血性脑损伤大鼠海马c-fos蛋白表达的影响

为了从分子水平探讨缺血性脑损伤的病理生理改变和参脉注射液的保护作用，我们将30只雄性Wistar大鼠随机分为对照组，缺血组和治疗组，采用免疫组织化学方法观察了缺血性脑损伤时大鼠海马神经元c-fos基因的表达及参脉注射液的保护作用，结果显示，缺血性脑损伤时大鼠海马内神经元c-fos基因的表达明显增多（P＜0．05），而用参脉注射液后明显减少（P＜0．05），提示参脉注射液可减少缺血性脑损伤大鼠海马神经元c-fos基因的表达，从而对缺血性脑损伤具有一定的保护作用。     

外源性硫化氢保护实验性癫痫持续状态大鼠海马神经元作用的研究

目的:为研究外源性硫化氢(H_2S)对实验性癫痫持续状态(status of epilepticus,SE)大鼠海马神经元的保护作用,我们用供体Na HS对氯化锂-匹罗卡品所致幼鼠SE海马神经元的影响,并对SE引起的脑损伤进行靶点干预。方法:用氯化锂-匹罗卡品建立大鼠SE模型,并分为正常+Na HS组,癫痫组,癫痫+Na HS组和癫痫+羟胺组,另设正常组(对照组),每组6只。用比色法测定血浆和海马H_2S浓度,用Real-Time PCR检测海马胱硫醚-β合酶(CBS)基因mRNA表达,用HE染色和Nissl染色观察海马神经元形态。结果:癫痫组血浆和海马组织H_2S浓度和CBS mRNA表达明显低于正常组(P0.01),癫痫+Na HS组血浆和海马组织H_2S浓度和CBS mRNA表达明显高于癫痫组(P0.01),癫痫+羟胺组血浆和海马组织H_2S浓度和CBS mRNA表达显著低于癫痫组(P0.05)。HE染色显示,癫痫组海马CA3区锥体细胞明显减少,细胞层次紊乱,形态不规则;尼氏染色显示,癫痫组海马CA3区尼氏体明显减少,锥体细胞排列紊乱;与癫痫组比较,癫痫+Na HS组海马尼氏体缺失和锥体细胞排列紊乱明显改善。结论:外源性H_2S对实验性癫痫持续状态大鼠海马组织CBS mRNA表达具有上调作用,并提高血浆和海马组织H_2S含量。同时,外源性H_2S对实验性癫痫大鼠海马组织神经元具有保护作用。     

应用mRNA差异显示技术筛选大鼠小脑颗粒神经元凋亡模型中差异表达基因

目的： 应用mRNA差异显示技术对大鼠小脑颗粒神经元凋亡模型中差异表达基因进行筛选，克隆以及鉴定。方法: 大鼠小脑颗粒神经元的分离和原代培养；对大鼠小脑颗粒神经元凋亡逆转模型进行荧光mRNA差异显示逆转录PCR（FDDRT-PCR,fluorescent differential display RT-PCR）；EST片段亚克隆入pGEM-T EasyTM，克隆后测序并进行序列同源性检索；反Northern杂交重鉴定与筛选。结果: 通过DDRT-PCR获得164 个在小脑颗粒神经元凋亡模型中差异表达的ESTs；对其中的17个ESTs进行了克隆并测序；通过反Northern杂交的初步筛选初步鉴定出5个阳性片段。结论: 阳性差异表达EST的筛选、克隆以及鉴定为神经元凋亡与保护分子机制研究奠定基础。     

基因芯片研究与衰老相关免疫基因的表达

目的:利用基因表达谱芯片,研究免疫相关基因在衰老过程中表达水平的改变。方法:分别提取20只20月龄SD大鼠和20只4月龄SD大鼠的脾脏mRNA,并通过逆转录制备成杂交探针;老年大鼠用Cy5d-UTP标记,青年大鼠用Cy3 d-UTP标记。将两种探针等量混合后与包含416个免疫相关基因的cDNA芯片进行杂交。通过扫描仪扫描芯片荧光信号和计算机分析,比较老年组和青年组大鼠脾脏的基因表达水平的差异。同步检测老年组大鼠和青年组大鼠的心、肝、肾和血液中的与自由基相关的生化指标。结果:生化指标检测证实20月龄老年大鼠与4月龄青年大鼠清除自由基的能力有显著的差异,说明其生理机能有显著差异,适用于芯片的研究。而芯片结果显示在所研究与免疫相关的基因中,13个基因在老年大鼠脾脏中表达下调,其中包括参与应激和免疫应答的基因,部分参与细胞增殖、分化的调节基因和参与DNA/RNA修复基因;只有1个基因,即编码良性肿瘤淀粉酶的基因在老年大鼠脾脏中表达特异增高。结论:运用基因表达谱芯片可以帮助我们了解免疫系统在衰老过程中的变化,深入理解衰老的发生和发展机制。     

基因芯片技术检测子宫内膜异位症相关细胞因子及其受体基因的表达谱

目的:研究与子宫内膜异位症(EM)发生和发展相关的细胞因子(CK)基因的表达,进一步阐明子宫内膜异位症的发病机制。方法:应用含有1200条基因的基因芯片,用同位素探针标记,探讨EM组织与正常子宫组织相关CK基因的表达谱。结果:在3例EM组织与3例正常的子宫内膜组织中,共筛选出差异表达基因119条,其中CK及CKR基因表达上调15条,包括IL1、IL2、IL6、IL8、VEGFR、TGF、EGF、FGF和EPOR等。结论:表达差异基因有助于揭示EM发生发展的分子机制,基因表达谱芯片能有效地筛选EM相关的CK及CKR基因,为了解疾病发生机制提供了高效、准确的研究工具。     

用基因芯片研究人肺癌转移相关基因

目的 自制肿瘤转移相关基因芯片研究人肺癌高、低转移细胞系PG和PAa间以及肺癌、淋巴结转移癌与正常肺组织间的基因表达谱差异，筛选与肺癌转移相关的特异基因。方法 提取2种肺癌细胞系、人肺癌、淋巴结转移癌及周围正常肺组织的mRNA后逆转录标记cDNA探针，与自制的含399个肿瘤转移相关基因的微阵列膜杂交，QuantArray软件分析杂交信号强度获得差异表达基因。结果 正常肺组织与肺原发癌的基因表达谱有显著差异。淋巴结转移癌组织与PG高转移细胞系表达基因行聚类分析，共同表达且最具统计学意义的基因有64个，包括上调基因27个，下调基因37个。结论 多基因参与肺癌的转移过程，肺转移癌与高转移细胞系共同差异表达的基因可能与肺癌的高转移特性密切相关。     

胃癌基因表达谱的cDNA微阵列与聚类分析

目的 分析胃癌与非肿瘤胃组织中基因表达特征，探讨其生物学意义。方法 提取18例进展期胃癌患者术前未行治疗的新鲜肿瘤和非肿瘤胃组织总RNA，逆转录标记cy5和cy3制备cDNA探针，与148个基因组成的cDNA微阵列杂交，应用平均联接等级聚类和微阵列数据显著差异分析(significance analysis of microarrays，SAM)方法分析146个符合入选条件基因的实验数据。结果 胃癌与非肿瘤胃组织各被聚为一类，胃癌和非肿瘤胃组织又分别聚为两个亚类。基因在两种组织表达有3个特征，明显基因表达差异表现在特征B和特征C．特征B基因在胃癌组织呈低表达或不表达，特征C基因在胃癌组织呈高表达。在特征A，T2-S2亚类与T1和T2-S1亚类的基因表达存在差异性，然而13例患者的配对胃癌与非肿瘤胃组织有相似基因表达。结合SAM分析，从特征B和特征C分别检出19个和12个在两种组织间呈差异性表达基因。结论 cDNA微阵列实验结果客观地反映了胃癌和非肿瘤胃组织的基因表达特征，可以将胃癌与非肿瘤胃组织各聚为一类．胃癌组织之间基因表达既有相似性，又有异质性，反映了胃癌基因表达变异的复杂性．应用cDNA微阵列技术研究胃癌基因差异性表达特征，有助于阐明胃癌发生、发展的分子基础，为胃癌早期诊断和预后评估的生物标记物研究提供科学依据．     

基因表达谱芯片在白血病耐药相关基因研究中的应用

目的探讨基因表达谱芯片技术在白血病耐药相关基因研究中的应用.方法首先采用荧光定量基因扩增技术检测了72例白血病患者的MDR1基因的表达,并利用含有4096条人类全长基因的cDNA表达谱芯片对其中3例MDR1基因高表达并表现为临床高度耐药的耐药实验组病例及3例MDR1基因低表达且未表现临床耐药的非耐药对照组病例的白血病耐药相关基因进行了研究. 结果基因表达谱分析两次重复实验结果显示总共有150条靶基因(约3.66%)在与以耐药组及非耐药组细胞RNA为模板合成的双探针杂交时表现出较大的差异.结论运用基因芯片对白血病耐药基因表达谱进行分析,能够筛选出白血病耐药相关基因.     

Downregulation of apoptosis revealed by laser microdissection and cDNA microarray analysis of related genes in rat liver preneoplastic lesions

Regulation of cell proliferation and apoptosis plays a key role in tumor development. To elucidate mechanisms underlying hepatocarcinogenesis, patterns of gene expression, including apoptosis-related genes, were compared between glutathione S-transferase placental form (GST-P)-positive preneoplastic foci and surrounding tissue in the rat. Lesions were induced with a single intraperitoneal injection of diethylnitrosamine (DEN, 200mg/kgbw) and then 100ppm 2-acetylaminofluorene (2-AAF)-containing diet combined with two-thirds partial hepatectomy. Frozen sections of the livers were applied for immunohistochemical staining of GST-P, and both positive foci and surrounding negative areas were harvested by laser microdissection. Total RNAs were extracted and amplified with T7 polymerase to allow gene expression analysis by cDNA microarray assays. In the GST-P-positive foci, altered levels were observed for many genes, mostly related to metabolism or catalysis, with increased expression of testosterone-repressive prostate message-2 (TRPM-2), which is reported to act as a protective factor against apoptosis, and decreased expression of thymus-expressed acidic protein (TEAP), which is considered to promote apoptosis. The results indicate that rat liver preneoplastic lesions might be protected against apoptosis and that the approach adopted is useful for clarification of mechanisms underlying hepatocarcinogenesis.     

人骨髓间充质干细胞基因表达谱的芯片分析

目的：探讨骨髓间充质干细胞（MSCs）作为组织工程种子细胞的分子遗传学基础和临床应用价值。方法：通过密度梯度离心法和贴壁筛选法的联合应用，分离人骨髓间充质干细胞，流式细胞仪分析细胞同源性，UNIQ-10柱式Trizol总RNA抽提法获取足量的RNA，用于MSCs基因表达谱的分析研究。结果：流式细胞仪检测表明了所分离hMSCs的高度同源性，基因表达谱芯片分析首次揭示了MSCs表达多种间充质细胞和非间充质细胞的特异性mRNA，如脂肪细胞、成软骨细胞、成骨细胞、成肌细胞、造血支持基质、神经元、神经胶质细胞和上皮／内皮细胞等。结论：hMSCs具有高度可塑性和广泛分化潜能，是以干细胞工程为代表的现代组织工程的重要细胞来源。