BACE1基因RNA干扰质粒的构建及干扰效果的鉴定

目的构建BACE1基因干扰质粒,并研究其在neuro．2a细胞中的表达,为以其为靶点的基因治疗提供稳定转染的质粒。方法选择人、小鼠和大鼠的BACE1基因共有序列为干扰靶点,设计3组连接有GFP的干扰质粒,将构建好的质粒转染nellro-2a细胞,通过RealtimeRT—PCR及Western—blotting的方法分别在RNA及蛋白质水平上检测BACE1的表达,以分析其干扰的效率。结果经酶切及测序证实,插入的DNA片段序列与设计序列完全一致。与空质粒对照组相比,3个干扰靶点对BACE1基因的表达均有不同程度的抑制作用。其中pYr-1．1-siBACE1在mRNA水平及蛋白质水平干扰效果均最好。结论成功构建了BACE1基因的干扰质粒pYr-1．1-siBACE1,并能有效抑制neuro．2a细胞内源性BACE1基因表达,为靶向BACE1基因的治疗提供了有力的工具。     

HMGN2基因干扰质粒构建及干扰效率测定

目的：构建HMGN2基因的干扰质粒,为深入研究HMGN2基因在信号通路中的作用提供有效手段。方法：根据文献选择两个HMGN2基因的干扰位点,合成两个干扰片段定向克隆到psilencer-4．1的干扰载体并测序验证。将干扰质粒转染至A549细胞,并通过检测RT-PCR产物量以获得干扰效率。结果：RT—PCR产物检测结果显示干扰质粒psilencer-4．1-HMGN2—2干扰效率最高,其HMGN2表达量降低了70％左右。结论：成功构建了对HMGN2基因具有显著干扰效率的psilencer-4．1-HMGN2干扰质粒,为进一步研究HMGN2基因的功能打下了基础。     

RNA干扰抑制BUB1基因表达对染色体分离的影响

目的：研究 BUB1基因表达调控对染色体分离的影响。方法：用定量 RT-PCR 比较 RNA 干扰前后的胚胎细胞内源性基因 BUB1的 mRNA 水平,同时对染色体数目异常率进行比较分析。结果：干扰后 BUB1基因 mRNA 拷贝数/GAPDH 基因 mRNA 拷贝数的均值为干扰前的21．80%,染色体数目异常率均值由干扰前 5．02%上升到29．61%。经统计分析,RNA 干扰前后 BUB1基因 mRNA 水平和染色体数目异常率有显著差异。结论：BUB1基因表达的降低会导致染色体分离的异常,本研究为染色体分离相关蛋白功能研究建立了新的研究手段和实验评价体系。     

一种高效表达小干扰RNA载体的构建研究

目的：用mir30前体骨架来构建高效表达小干扰RNA载体。方法：通过基因合成的方法，将mir30前体骨架进行全长基因合成，并在合成的mir30前体骨架中引入合适的酶切位点用于外源发夹DNA的克隆，然后将之克隆到含U6启动子的表达载体中。将针对绿色荧光蛋白（green fluorescent protein，GFP）的小干扰RNA克隆到以上表达载体中，通过转染及Western blot来检测新的小干扰RNA表达载体的基因沉默效率。结果：同目前常用的含polⅢ的小干扰RNA表达载体相比较，用mir30前体骨架表达针对GFP的小干扰RNA的表达载体可以明显抑制GFP的表达。结论：用mir30前体骨架构建的小干扰RNA表达载体可高效表达外源小干扰RNA。     

RNA干扰抑制基质细胞衍生因子-1基因的表达

目的通过RNA干扰来抑制骨髓基质细胞衍生因子-1(SDF-1)的表达。方法利用脂质体介导人SDF-1特异性小片段双链RNA(siRNA)的表达质粒转染培养的人骨髓基质细胞,G418筛选阳性克隆。RT-PCR和ELISA法检测培养细胞SDF-1 mRNA和上清液SDF-1蛋白。以转染随机变更siRNA碱基序列的表达质粒和未转染的来源相同的骨髓基质细胞作为对照。结果较未转染和转染随机变更siRNA碱基序列表达质粒的骨髓基质细胞,转染SDF-1特异性siRNA表达质粒的骨髓基质细胞SDF-1 mRNA和SDF-1蛋白明显降低。结论用SDF-1特异性siRNA的表达质粒转染骨髓基质细胞,抑制了SDF-1基因表达。     

Hax1基因及其特异性小干扰RNA对人胚肾293细胞凋亡的影响

目的构建Hax1基因特异性小干扰RNA(sihax),检测sihax对Hax1基因的表达抑制,在293细胞中研究Hax1和Hax1siRNAs对细胞凋亡的影响。方法设计Hax1siRNA序列构建真核表达载体并转染到293细胞,倒置荧光显微镜下观察、流式细胞仪、AnnexinV-EGFP/PI双染法及RT-PCR检测靶基因Hax1的表达,以及293细胞的凋亡。结果成功构建了Hax1siRNA干扰质粒pBS/U6-sihaxA和pBS/U6-sihaxB,并且sihaxB对Hax1抑制效应明显强于sihaxA。过量表达Hax1可显著抑制293细胞的早期凋亡比例。用sihaxA和sihaxB抑制内源性Hax1表达,可使晚期细胞凋亡比例从对照的9.03%±0.473%分别增加到10.8%±0.513%(P<0.05)和16.6%±0.858%(P<0.01)。与此同时,sihaxB还可使早期细胞凋亡比例由37.3%±0.5%降低到32%±1.77%(P<0.01)。结论 Hax1siRNA对靶基因Hax1的抑制作用与靶序列的保守性有一定相关性。Hax1基因在细胞中参与凋亡相关的多种调节过程。本研究为进一步探讨Hax1...     

clock基因干扰质粒的构建及干扰效率测定

目的：构建clock基因的干扰质粒，为深入研究clock基因在信号转导通路中的作用提供有效手段。方法：采用M-folder生物软件选择2个clock基因干扰位点，并根据3个干扰片段及一个阴性对照片段，定向克隆到pGenesil-1干扰载体并测序验证。将干扰质粒及对照质粒分别转染至NIH3T3细胞，并通过检测RT-PCR产物量以获得干扰效率。结果：RT-PCR产物捡测结果显示干扰质粒pGenesil-1／clock-Ⅱ干扰效率最高，其clock表达量降低了74％，而pGenesil-1／clock-Ⅰ干扰组clock表达量只降低了2％。结论：成功构建了对clock基因具有显著干扰效率的pGenesil-1／clock-Ⅱ干扰质粒，为进一步研究clock基因的功能奠定了基础。     

ATF-2基因RNA干扰表达载体的构建及鉴定

目的:构建活化转录因子2(ATF-2)基因RNA干扰的真核表达载体,观察其对HepG2肝癌细胞株增殖及凋亡的影响。方法:根据ATF-2 mRNA序列,合成两条寡聚DNA片段,退火后克隆入质粒载体PBA-siU6,DNA测序鉴定重组质粒PBA-siATF-2。脂质体介导质粒转染HepG2细胞。Westernblot法检测ATF-2蛋白表达;MTT方法检测细胞增殖率,流式细胞术(FCM)检测细胞凋亡率。结果:ATF-2基因RNA干扰载体经测序分析证实插入64 bp序列正确无误;Westernblot法显示干扰组细胞内ATF-2蛋白表达量明显降低;ATF-2基因的下调导致HepG2细胞增殖阻滞和凋亡发生。结论:成功构建了ATF-2基因RNAi真核表达载体,下调HepG2细胞ATF-2基因表达,抑制细胞增殖,诱导细胞凋亡。     

携带DREAM基因小分子干扰RNA重组质粒的构建

背景：DREAM是一种多功能蛋白,在细胞中不同位置与不同靶蛋白结合,体外细胞培养和动物实验均证明DREAM参与了许多疾病的发病机制。 目的：构建携带DREAM基因的小分子干扰RNA重组质粒。 方法：设计并合成shRNA对应的两条互补的寡核苷酸链,pDC316-EGFP-U6质粒经BamHⅠ和HindⅢ双酶切与退火后的寡核苷酸连接,转化感受态E.coli DH5α,获得阳性克隆进行PCR和测序鉴定。 结果与结论：经PCR、酶切及测序证实,重组质粒pDC316-EGFP-DREAM-shRNA-U6片段大小为473 bp,其中插入的片断序列和位点与预期完全一致,说明pDC316-EGFP-DREAM-shRNA-U6重组质粒构建成功。     

MSTN基因siRNA表达载体的构建和鉴定

目的 构建能沉默MSTN基因的小干扰RNA表达载体,并鉴定它沉默肌母细胞MSTN基因的效率.方法 合成3对发夹小干扰RNA模板寡核苷酸链,退火后插入pSilencer载体,构建成可沉默MSTN基因的小干扰RNA表达载体,通过酶切和测序鉴定构建的小干扰RNA表达载体.将小干扰RNA表达载体转染肌母细胞,用实时荧光定量RT-PCR和Western印迹检测转染的肌母细胞myostatin的表达水平.结果 酶切和测序证实3个小干扰RNA表达载体构建正确,实时荧光定量RT-PCR显示所构建的3个小干扰RNA表达载体对肌母细胞MSTN基因的干扰率分别为43.6 %、47.7 %和81.6 %,它们的干扰效果被Western印迹所证实.结论 干扰率为81.6 %的小干扰RNA表达载体为构建成功的小干扰RNA表达载体,它可用作MSTN基因的功能研究和肌病治疗的分子研究.     

PYK2靶向短发夹RNA干扰重组体的构建及鉴定

目的:本研究利用RNA干扰技术，以PYK2为靶基因，设计构建重组体，并对重组体进行鉴定，为下一步探索心肌纤维化机制的新途径奠定基础。方法:设计有小发夹结构的8条DNA序列，经退火成互补4对双链，再克隆到载体PAVU6＋27中构建重组体，转化入JM109菌株，提取质粒进行酶切鉴定、测序分析。结果:酶切鉴定和测序分析均提示PYK2靶向RNA干扰重组体的构建成功。结论:PYK2靶向RNA干扰重组体的成功构建，为下一步利用该重组体沉默心脏成纤维细胞中PYK2基因的表达，探索心肌纤维化机制打下基础。     

小干扰RNA对大鼠OX40基因表达的沉默作用

目的:研究靶向大鼠OX40基因的二聚体小干扰RNA(siRNA-OX40) 对靶基因表达的沉默作用.方法:建立并筛选稳定表达OX40基因的293T转染细胞株,用脂质体转染法将体外合成的siRNA-OX40转染上述细胞株,采用实时荧光定量PCR检测靶基因OX40 mRNA表达情况.结果:用不同浓度的siRNA-OX40转染细胞48小时,10 nmol/L浓度对293T细胞靶基因表达的抑制作用最强 [抑制率(68.3±8.7)%],1 nmol/L浓度仍有一定的抑制作用[(37.2±4.8)%];25、10 nmol/L siRNA转染293T细胞后,均在24小时内起效[(21.4±3.2)%,(26.8±3.8)%],抑制作用至少能维持72小时[(61.7±8.4)%,(39.6±5.6)%].结论:siRNA-OX40对293T细胞外源性靶基因表达有较强的特异性沉默作用,siRNA在24小时内起效,48～72小时达高峰,抑制作用至少能维持72小时.本研究结果为下一步在动物或临床进行siRNA干扰试验提供了实验依据.     

RNA干扰抑制小鼠OX40基因表达的实验研究

目的研究靶向小鼠OX40基因的二聚体小干扰RNA(siRNA-OX40)对靶基因表达的沉默作用。方法建立并筛选稳定表达OX40基因的293T转染细胞株,用脂质体转染法将体外合成的siRNA-OX40转染上述细胞株,采用实时荧光定量PCR检测靶基因OX40 mRNA表达情况。结果用不同浓度的siRNA-OX40转染细胞48h,10nmol/L浓度对293T细胞靶基因表达的抑制作用最强(抑制率76.4%),1nmol/L浓度仍有一定的抑制作用(39.4%);25、10nmol/L siRNA转染293T细胞后,均在24h内起效(24.9%,20.5%),抑制作用至少能维持72h(74.4%,38.8%)。结论siRNA-OX40对293T细胞外源性靶基因表达有较强的特异性沉默作用,siRNA在24h内起效,48～72h达高峰,抑制作用至少能维持72h。本研究结果为下一步在动物或临床进行siRNA干扰试验提供了实验依据。     

胰高糖素样肽-1基因荧光真核表达载体的构建及鉴定

胰高糖素样肽-1（glucagon-like peptide-1,GLP-1）是近年来人们广泛关注的治疗糖尿病的最有前景的候选药物。pEYFP-N1是一系列绿色荧光蛋白（green fluorescent protein,GFP）的衍生蛋白之一,本实验构建了绿色荧光蛋白融合GLP-1基因的表达载体。该载体为糖尿病的进一步研究奠定了实验基础。     

钙粘附蛋白N-cadherin基因RNAi质粒载体的构建与鉴定

目的:构建有效的小鼠神经型钙粘附蛋白(N-cadherin)基因RNA干扰质粒载体。方法:在小鼠基因库中选择3个靶序列并设计合成相应3对寡核苷酸序列,同时合成1对阴性对照寡核苷酸序列,然后将以上4对寡核苷酸序列退火后连入pSilencerTM 3.1-H1 hygro质粒并分别命名为pSicad1、pSicad2、pSicad3、pSi-control。酶切和测序鉴定后,将以上重组质粒转染MN9D细胞,用Western Blot和半定量RT-PCR方法检测N-cadherin基因mR-NA和蛋白的表达水平。结果:酶切和测序证实目的寡核苷酸片段已被准确克隆到pSilencerTM 3.1-H1 hygro质粒,与对照组相比,pSicad2和pSicad3转染MN9D细胞后,N-cadherin mRNA和蛋白水平的表达均受到明显抑制,其中N-cadherin蛋白水平在pSicad3组下降50%(P0.01)。结论:结果表明已成功构建了小鼠N-cadherin基因RNAi质粒载体,为N-cadherin功能研究奠定了基础。     

靶向髓样细胞表达的激发受体1基因短发夹RNA真核质粒表达载体的构建及筛选

目的 构建编码髓样细胞表达的激发受体1(TREM-1)基因短发夹RNA(shRNA)真核质粒表达载体,并筛选出基因沉默效果最明显的shRNA质粒表达载体.方法 针对TREM-1的靶位点设计含shRNA的靶序列,分别构建pGCsi-TREM-1 shRNA1和pGCsi-TREM-1 shRNA2的质粒表达载体和pGCsi-NegshRNA阴性质粒表达载体,通过酶切及测序进行鉴定.鉴定后以脂质体包裹转染肺泡上皮A549细胞,分为未转染对照组(A组)、转染空质粒载体pGCsi对照组(B组)、转染阴性shRNA质粒表达载体pGCsi-NegshRNA对照组(C组)、转染TREM-1 shRNA1质粒表达载体组(D组)和转染TREM-1shRNA2质粒表达载体组(E组),48 h后观察转染细胞绿色荧光蛋白表达效果.转染24、48、72 h后,以A组为对照采用MTT法测定B、C、D、E组细胞的存活率.转染48 h后,通过荧光定量PCR检测各组TREM-1 mRNA的表达水平并与转染前相比较.结果 经酶切和测序鉴定证实,目的 TREM-1基因shRNA1和shRNA2片段已被克隆到pGCsi载体中.荧光显微镜下,B、C、D、E组A549细胞有明显的绿色荧光蛋白表达.各时间点B、C、D、E组细胞存活率均达90%以上.A、B、C 3组转染前后TREM-1mRNA的表达水平差异无统计学意义,D、E组转染的重组质粒均能有效抑制A549细胞的TREM-1mRNA的表达([(1.945±0.252)×105比(1.010±0.194)×105,(1.933±0.216)×105比(1.202±0.171)×105,均P＜0.05],抑制率分别为48.07%和37.82%.结论 成功构建了靶向TREM-1基因的shRNA质粒表达载体,可有效抑制细胞中TREM-1目的 基因的表达,为后续脓毒症的基因治疗提供了依据.     

小干扰RNA对人乳头状瘤病毒6bE7基因表达的沉默作用

目的研究靶向人乳头状瘤病毒HPV-6b型E7基因的二聚体小干扰RNA(siRNA- HPV-6bE7)对靶基因表达的沉默作用。方法建立并筛选稳定表达HPV-6bE7基因的B16和293T转染细胞株,用脂质体转染法将体外合成的siRNA-HPV-6bE7转染上述细胞株,采用实时荧光定量PCR分析靶基因HPV-6bE7的mRNA表达情况。结果用不同浓度的siRNA-HPV-6bE7转染细胞48 h,50 nmol/L浓度对B16细胞中靶基因表达的抑制作用最强(抑制率87.05%),1nmol/L抑制作用较低(9.14%);而在293T细胞,10nmol/L的siRNA对靶基因表达的抑制效应最大(78.87%),1nmol/L仍有一定抑制作用(46.92%)。50 nmol/L siRNA-HPV-6bE7转染B16细胞后,靶基因的mRNA表达在24 h内开始受抑制(32.47%),48h作用最强(74.72%),96h作用很低(8.91%);25nmol/L和10nmol/L的siRNA转染293T细胞后,均在24h内起效(26.66%、20.31%),抑制作用至少能维持72h(65.93%、35.23%)。结论siRNA-HPV-6bE7对B16和293T细胞外源性靶基因表达均有较强的特异性沉默作用,在不同细胞株达到最大抑制效应的siRNA浓度不同,但时效曲线的变化趋势基本一致,siRNA均在24h内起效,48～72h达到高峰,抑制作用至少能维持72h。本研究结果为下一步在动物或临床进行siRNA干扰试验提供了实验依据。     

pHBAd-MCMV-GFP-NCAM1真核表达质粒的构建和鉴定

目的将目的基因NCAM1与质粒载体p HBAd-MCMV-GFP进行连接,得到重组质粒p HBAd-MCMV-GFPNCAM1。方法对目的基因和质粒载体分别用内切酶Not I和Nsil进行双酶切,产物回收后进行连接、转化,得到重组质粒p HBAd-MCMV-GFP-NCAM1。转化后的菌液进行PCR阳性克隆鉴定,并对阳性样本进行测序。结果首先对NCAM1进行扩增,从实验结果看符合预期效果,在双酶切、连接和转化实验后,对构建完成的重组质粒进行鉴定,PCR阳性克隆鉴定结果显示重组质粒构建成功,NCAM1已连接进入重组质粒中,测序的结果进一步印证阳性鉴定结果。结论带有目的基因NCAM1的重组质粒构建成功。