长链非编码 RNA AFAP1－AS1在乳腺癌中的表达及临床意义

目的：探讨长链非编码 RNA（long non －coding RNA,lncRNA）肌动蛋白纤维相关蛋白1－反义 RNA1（actinfilament －associated protein 1－antisense RNA1,AFAP1－AS1）在乳腺癌肿瘤组织中的表达情况及其临床意义。方法：采用荧光定量 PCR 方法检测76例乳腺癌组织及其对应癌旁组织中 AFAP1－AS1的表达情况。选取表达差异最大的5对组织,结合核浆分离的方法,检测 AFAP1－AS1在乳腺癌细胞中的表达位置。分析AFAP1－AS1表达与乳腺癌主要临床病理特征及患者生存曲线的相关性。通过 siRNA 干扰 AFAP1－AS1在乳腺癌细胞 SKBR －3、MCF －7中的表达,MTT 法检测其表达对乳腺癌细胞增殖的影响。结果：AFAP1－AS1在乳腺癌组织中的表达水平相较癌旁组织明显下调（P ＜0．05）,并且这一表达差异主要发生在细胞质。沉默AFAP1－AS1的表达会促进乳腺癌细胞增殖。同时,AFAP1－AS1在乳腺癌组织中的表达差异与临床分期和淋巴结转移有关（P ＜0．05）,且与患者生存率也明显相关（P ＜0．05）。结论：lncRNA AFAP1－AS1在乳腺癌组织中表达下调,影响乳腺癌细胞增殖,可能与乳腺癌的发生和发展有关,可能成为新的乳腺癌分子标志物。     

长链非编码RNA AFAP1-AS1 在胃癌组织中的表达及其临床意义

目的:探讨长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)肌动蛋白纤维相关蛋白-1反义RNA1(actin filament-associated protein 1-antisense RNA1,AFAP1-AS1 RNA1)在胃癌组织中的表达情况及其临床意义.方法:采用Real-time PCR方法检测2010年1月至2014年12月宜昌市第二人民医院及三峡大学仁和医院手术切除的274例胃癌组织及相应癌旁正常胃组织中AFAP1-AS1的表达,并分析AFAP1-AS1表达量与临床及病理特征的关系.结果:AFAP1-AS1在胃癌组织比癌旁正常组织显著高表达(P＜0.01).AFAP1-AS1在早期胃癌组织中平均表达量明显低于进展期胃癌(P＜0.01).在不同病理类型胃癌中,AFAP1-AS1的表达量没有差异(P＞0.05).AFAP1-AS1表达量和胃癌淋巴侵袭或远处转移密切相关,在伴有淋巴结侵袭或远处转移的胃癌组织中,AFAP1-AS1明显高表达(P＜0.01).结论:AFAP1-AS1可能是胃癌发生发展的一个重要因素;有望成为新的胃癌预后标志物,用于胃癌的临床诊断和预后判断.     

长链非编码RNA在结肠癌中的表达研究

目的 探讨长链非编码RNA（lncRNA）在结肠癌中的表达情况。方法 从公共数据平台Gene Expression Omnibus（GEO）下载结肠癌外显子芯片数据集GSE31737,包含40对结肠癌及癌旁组织。对外显子芯片探针进行重排,筛选出在基因水平特异性匹配lncRNA的探针。用Affymetrix Power Tools分析获得lncRNA表达谱,用LIMMA分析在结肠癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA。结果 共有136 053个探针特异性匹配9294个lncRNA,约包含了Ensembl数据库中76％的lncRNA。分析GSE31737发现,与癌旁组织相比,结肠癌组织中共有87个lncRNA差异表达,其中50个高表达,37个低表达。结肠癌与癌旁组织表达值倍数变化＞1.5倍的基因共37个。结论 lncRNA表达在结肠癌组织中发生明显变化,有可能成为结肠癌的分子诊断和基因治疗的新靶点。     

长链非编码RNA DSCAM-AS1在宫颈癌中的表达及临床意义

目的:检测长链非编码RNA DSCAM-AS1（long noncoding RNA DSCAM antisense RNA 1，lncRNA DSCAM-AS1）在宫颈癌（cervical cancer，CC）中的表达，探讨lncRNA DSCAM-AS1与CC临床病理特征及预后间的关系。方法:RT-PCR检测CC组织及配对癌旁组织以及CC细胞中lncRNA DSCAM-AS1的表达；利用单因素方差分析lncRNA DSCAM-AS1与CC患者临床病理特征之间的关系；利用生存曲线分析lncRNA DSCAM-AS1与CC患者术后5年生存率的关系；利用Cox风险比例模型分析lncRNA DSCAM-AS1与CC患者预后的关系。结果:lncRNA DSCAM-AS1在CC组织和细胞中均呈过表达；lncRNA DSCAM-AS1的表达与CC的TNM分期相关（P<0.05）；lncRNA DSCAM-AS1高表达的CC患者术后5年生存率低于低表达的患者，lncRNA DSCAM-AS1高表达是CC患者预后的独立危险因素。结论:lncRNA DSCAM-AS1在CC中表达升高，并与CC患者生存及预后密切相关。     

长链非编码RNA CASC9在胃癌组织中的表达及其临床意义

目的:检测长链非编码RNA CASC9（cancer susceptibility candidate 9）在胃癌组织和细胞中的表达,探讨CASC9与胃癌患者临床病理特征及预后的关系。方法:利用RT-PCR检测胃癌组织、细胞及配对癌旁组织、正常胃黏膜细胞中CASC9的表达;利用单因素方差分析CASC9与胃癌患者临床病理特征之间的关系;利用生存曲线分析CASC9与胃癌患者术后5年生存率的关系;利用COX风险比例模型分析CASC9与胃癌患者预后的关系。结果:CASC9在胃癌组织、细胞中表达水平高于癌旁组织和正常胃黏膜细胞;CASC9的表达与胃癌的Bormann分型及TNM分期相关（P＜0.05）;CASC9高表达的胃癌患者术后5年生存率低于低表达的患者,CASC9高表达是胃癌患者独立的预后因素。结论:CASC9在胃癌中表达升高,并与胃癌患者生存及预后密切相关。     

长链非编码RNA AFAP1-AS1在实体肿瘤中的作用与分子机制

长链非编码RNA（LncRNA）是一种长度超过200个核苷酸的内源RNA。大量研究表明,LncRNA可参与多种生物过程,如转录激活和干扰、细胞分化、增殖、迁移、侵袭和凋亡。近年来许多研究表明LncRNA在人类癌症中作为致癌基因或肿瘤抑制基因发挥着重要作用。大量新研究表明LncRNA肌动蛋白丝相关蛋白1反义RNA1（AFAP1-AS1）参与了多种恶性肿瘤的发生发展。已证实AFAP1-AS1的失调表达与肿瘤发生和肿瘤进展相关;AFAP1-AS1可能成为肿瘤诊断和肿瘤治疗靶点的新型潜在分子生物标志物。在本篇综述中,我们总结了现阶段关于AFAP1-AS1在人类肿瘤发生和发展过程中的生物学功能和分子机制的研究问题。     

长链非编码RNA FOXD3-AS1在部分肿瘤细胞中的表达及分子机制

长链非编码RNA（LncRNAs）是一组长度大于200个核苷酸的非编码RNA。因为缺少明显的开放阅读框,LncRNAs的蛋白质编码能力非常有限或无编码能力,但越来越多的研究报道表明,LncRNAs在肿瘤的复杂调控网络中有很大的作用,如肿瘤的增殖、侵袭等。LncRNA叉头盒D3反义RNA1(FOXD3-AS1),由4个外显子组成,位于FOXD3启动子上游染色体1p31.3处。LncRNA FOXD3-AS1最近被发现在各种恶性肿瘤中表现出异常的表达,包括结直肠癌、乳腺癌、胶质瘤、神经母细胞瘤、甲状腺癌等多种恶性肿瘤中均有异常表达,其调控的作用可能与肿瘤患者的生存和预后有关,在本文中,我们总结了目前关于LncRNA FOXD3-AS1在肿瘤进展中的生物学功能和分子机制。     

基于癌症基因组图谱数据分析筛选结肠癌预后相关长链非编码RNA

目的:通过分析癌症基因组图谱（TCGA）数据库中有关结肠癌的转录组测序数据,筛选结肠癌预后相关长链非编码RNA（lncRNA）,寻找新的lncRNA结肠癌分子标志物。方法:下载TCGA数据库中结肠癌转录组测序数据及结肠癌患者临床资料,利用R语言进行数据整理。采用edgeR包筛选差异表达lncRNA,采用单因素Cox回归模型对差异表达lncRNA进行生存分析。提取与这些lncRNA共表达的编码基因,行京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析。结果:差异表达分析共筛选出227个在肿瘤各TNM分期中均异常表达的lncRNA,其中表达上调169个,表达下调58个。生存分析鉴定出15个差异表达lncRNA与预后显著相关（P<0.05）,其中2个为保护因素,13个为危险因素。KEGG分析发现,这些预后相关lncRNA 的共表达基因主要富集在核糖体生物合成、mRNA监视通路等。结论:通过挖掘TCGA结肠癌数据集,发现了一些具有预后意义的异常表达lncRNA,为后续深入研究其功能奠定了基础,这些lncRNA有望成为新的结肠癌诊断或治疗分子标志物。     

长链非编码RNA PCBP1-AS1在乳腺癌组织中的表达及临床意义

目的:研究多聚胞嘧啶结合蛋白1反义长链非编码RNA（lncRNA PCBP1-AS1）在乳腺癌组织中的表达及临床意义。方法:选取2013年5月至2016年4月在本院进行手术治疗的105例乳腺癌患者作为研究对象,将切除的癌组织作为试验组,同时取同一患者的癌旁（距肿瘤边缘＞2 cm）组织作为对照组。用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）检测lncRNA PCBP1-AS1表达情况;分析lncRNA PCBP1-AS1与乳腺癌病理参数关系;分析lncRNA PCBP1-AS1表达情况对乳腺癌患者生存情况的影响;Cox回归分析影响乳腺癌的预后因素。结果:试验组lncRNA PCBP1-AS1表达明显低于对照组（P<0.05）;乳腺癌患者癌组织中lncRNA PCBP1-AS1表达水平与患者年龄、肿瘤直径、绝经情况和病理类型相关性不明显（P>0.05）,与淋巴结转移和TNM分期有关（P<0.05）;绘制乳腺癌患者术后36个月生存曲线,lncRNA PCBP1-AS1高表达患者的总生存率明显高于低表达患者（P<0.05）;对lncRNA PCBP1-AS1表达、淋巴结转移和TNM分期进行Cox回归分析,显示lncRNA PCBP1-AS1表达是影响乳腺癌患者预后的独立保护因素,TNM分期是影响乳腺癌患者预后的独立危险因素。结论:乳腺癌患者癌组织中lncRNA PCBP1-AS1呈低表达,其表达水平与淋巴结转移和TNM分期有关,lncRNA PCBP1-AS1表达是乳腺癌预后独立保护因素,可作为乳腺癌预后判断指标之一,有望成为乳腺癌治疗的潜在靶点。     

长链非编码RNA ZFAS1在鼻咽癌组织中的表达及临床意义

目的 探讨长链非编码RNA ZFAS1在鼻咽癌组织中的表达及其临床意义。方法 收集2014年1月至2016年12月鼻咽癌组织标本及配对癌旁组织94例,采用实时荧光定量聚合酶链反应（QPCR）检测癌组织及癌旁组织中ZFAS1的表达情况,分析ZFAS1表达与鼻咽癌临床病理特征（年龄、T分期、N分期、TNM分期、颅底侵犯、颅神经麻痹及EB病毒VCA IgA水平）的关系,采用受试者工作特征曲线（ROC）评价组织ZFAS1水平在鼻咽癌早期诊断中的效能。结果 94例鼻咽癌组织中ZFAS1的表达水平为5.388±0.446,中位数和四分位数间距为3.933（2.107,7.339）;癌旁组织的ZFAS1表达水平为1.091±0.045,中位数和四分位数间距为1.092（0.799,1.297）。鼻咽癌组织的ZFAS1表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义（P＜0.05）。ZFAS1表达与T分期、N分期、TNM分期、EB病毒VCA-IgA滴度及颅底侵犯有关（P＜0.05）;与颅神经麻痹和年龄无关（P＞0.05）。组织ZFAS1水平诊断鼻咽癌的曲线下面积为0.924（95％CI：0.882～0.965）,最佳截断值为3.472,该截断值的灵敏度和特异度分别为83.4％和77.0％。结论 ZFAS1在鼻咽癌中高表达,且与临床分期、颅底侵犯及EB病毒感染有关,对鼻咽癌的早期诊断有较好价值,可用于鼻咽癌的辅助诊断和病情评估。     

lncRNA ALMS1-IT1在结肠癌组织中的表达及其临床意义

目的:探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)ALMS1-IT1在结肠癌组织中的表达及其临床意义,并探索其对结肠癌细胞增殖和侵袭的影响。方法:应用GEPIA平台分析TCGA数据库中ALMS1-IT1在结肠癌与正常组织中的表达水平及其与患者预后的相关性。通过实时荧光定量PCR（real-time quantitative PCR,RT-qPCR）检测ALMS1-IT1在结肠癌及癌旁组织中的表达并分析其与临床病理特征的相关性。pcDNA3.1-ALMS1-IT1和ALMS1-IT1 siRNA分别转染HCT116细胞,RT-qPCR检测转染效率,CCK-8、EdU和Transwell小室检测HCT116细胞增殖和侵袭能力。结果:TCGA数据提示,ALMS1-IT1在结肠癌组织中表达显著高于正常组织,我们的数据也证实ALMS1-IT1在结肠癌组织中显著高表达。TCGA数据生存分析发现ALMS1-IT1高表达的结肠癌患者总生存率和无病生存率均显著降低。干扰ALMS1-IT1显著抑制HCT116细胞增殖和侵袭,而过表达ALMS1-IT1则明显增强结肠癌细胞增殖和侵袭。结论:ALMS1-IT1在结肠癌组织中表达上调,其高表达提示患者预后不良,ALMS1-IT1通过促进结肠癌细胞增殖和侵袭发挥癌基因功能。     

长链非编码RNA HOXA-AS3在结肠癌组织中的表达及与临床预后的关系

目的:观察长链非编码RNA HOXA-AS3(lncRNA HOXA-AS3)在结肠癌组织中的表达并探究其与临床预后的关系.方法:选取2012年01月至2014年02月本院外科行手术治疗的94例结肠癌患者癌变及癌旁结肠组织冻存标本,采用实时定量PCR(RT-qPCR)法检测癌组织和癌旁组织中lncRNA HOXA-AS...