我国部分产生志贺毒素肠出血性大肠埃希菌O157：H7脉冲电场凝胶电泳分型

目的 探讨我国部分地区产生志贺毒素的肠出血性大肠埃希菌（EHEC）O157：H7菌株的分布，流行以及分型情况。方法 用脉冲电场凝胶电泳（PFGE）方法进行分型，辅以药物敏感性试验对51株产生志贺毒素的EHECO157：H7菌株进行研究。结果 根据细菌染色体DNA的XbaI酶切图谱，可将从江苏省徐州市等地分离的51株产生志贺毒素的EHECO157：H7菌株分成8个PFGE型别（PFGE1-PFGE8），宁夏菌株为PFGE1型和2型，徐州菌株有6个PFGE型，1986-1988年的分离菌株属于PFGE7型，1999、2000年病人分离株的优势型别分别是PFGE5型与3型，1999年爆发性流行期间从患者分离的5株菌属于PFGE5型，从家畜家禽的粪便，食品，蔬菜等标本分离的19株菌，可以分为PFGE3-6等4个型别，其中，PFGE5型占优势（10株菌）。结论 爆发性流行的发生与携带病原菌的家畜家禽粪便污染的食品，蔬菜等有关，从我国部分地区分离的EHECO157：H7菌株的PFGE型别有地区性差异。     

四川省大肠杆菌O157:H7分子流行病学、耐药性及对消毒剂抗性研究

目的研究从四川省分离的大肠杆菌O157：H7菌株流行病学特征。方法用多重PCR测定67株大肠杆菌O157：H7的sit、eaeA、hly毒力基因；对不同来源的大肠杆菌O157：H7进行质粒和PFGE分型；测定67株大肠杆菌O157：H7的耐药性和对消毒剂的抗力。结果62．7％的株菌（42／67）携带有毒力基因，毒力图谱类型主要为slt1＋slt2＋eaeA＋hly。67株菌共有6种质粒谱型和7种PFGE谱型。64．2％（43／67）的菌株分别对7种不同的抗生素耐药，其中有23、35、34株菌分别对氨苄青霉素、四环素和SMZ耐药。不同来源的大肠杆菌O157：H7抗性谱不同，80．6％（54／67）的菌株对酒精和季铵盐产生了抗性，所有菌株对洗必泰敏感。结论四川省不同来源的大肠杆菌O157：H7带毒率相似，但毒力基因谱型不完全相同。细菌有较高的耐药性。菌株对常用消毒剂有很高的抗性，在消毒灭菌时需要用较大剂量的消毒剂才能将其杀灭。不同来源的大肠杆菌O157：H7耐药性、质粒和PFGE谱型有一定的相似性，提示菌株可能在人、动物、食品以及外环境之间相互传播并存在流行的可能。     

出血性大肠杆菌O157∶H7的脉冲场凝胶电泳分型方法研究

目的应用脉冲场凝胶电泳技术(PFGE)对肠出血性大肠杆菌O157:H7进行基因分型,了解不同来源分离株的相关性。方法选择在广西食品污染物检测地区食品样本中分离到的7株出血性大肠杆菌O157:H7,采用琼脂糖包埋胶块法制备基因组DNA,以XbaⅠ限制性内切酶进行酶切,选定脉冲电泳参数进行脉冲场凝胶电泳,照相记录结果;Nei的公式计算相似性和遗传距离,并用PHYLIP程序非加权成对算术平均法聚类分析。结果PFGE可生成14~18条清晰条带的分离株DNA指纹图谱,由聚类分析树状图可将7株分离株分为6个基因群。结论广西不同地区食品分离O157:H7血清型菌株存在多个分子亚型,提示不是一个克隆株,研究发现脉冲场凝胶电泳分型技术重复性高,在分子流行病学研究中有较大的应用前景。     

上海地区分离的大肠埃希菌O157的分子分型研究

目的对2006年-2014年在上海地区分离的大肠埃希菌O157进行分子分型研究。方法通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)技术的联合应用,对来自中国上海地区的16株大肠埃希菌O157分离株和4株标准株进行分子分型研究。结果 PFGE方法可将20株菌株分为12种型别,分辨力为0.921 1。其中14株O157:H7菌株处于同一聚类,其与6株O157:H?菌株为不相关菌株。MLST方法可将20株菌株分为6种ST型,分辨力为0.726 3。7个管家基因的核苷酸多态性范围为0.000 784~0.009 449。其中14株O157:H7菌株分为ST2966型和ST11型,属于同一克隆群。6株O157:H?分离株分为4种ST型,包括3种新的ST型,且与本研究中的O157:H7菌株间的管家基因型别相差至少6个。结论上海地区从动物和患者粪便中分离的大肠埃希菌O157:H7分离株间的遗传谱系接近,与本实验研究中的大肠埃希菌O157:H?菌株间亲缘关系较远。需加强对上海地区大肠埃希菌O157的病原学监测,并进一步比较2种分型技术对大肠埃希菌O157的分型效果。     

2009年四川省副溶血性弧菌血清型、致病力及分子分型研究

目的 了解四川地区2009年副溶血弧菌食物中毒疫情分离株和监测食品样品分离菌株菌型分布、致病力及分子分型特征,为四川地区副溶血性弧菌疾病防治提供科学依据.方法 采用血清玻片凝集试验对2009年从食物中毒疫情和常规监测食品中分离的副溶血孤菌菌株进行血清分型、应用PCR方法进行耐热直接溶血素基因(tdh)和耐热直接溶血素相关基因(trh)的检测、小鼠腹腔注射进行致病力实验和进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析等.结果 40株菌分属于5个血清群,疫情分离株分属于O3和O4群,监测分离株主要为O1群占43.75％ (7/16),其中2起疫情分离到多个血清型的菌株;所有菌株trh基因均为阴性,其中20株携带tdh毒力基因,携带tdh毒力基因和不携带tdh、tlh毒力基因的菌株均有致病力.40株菌通过PFGE分型,共得到29个带型,同一疫情分离株具有多个PFGE型别..结论 四川省食品分离株和暴发疫情无太多联系,食品分离株血清型和PFGE型别呈多样性.对于从同一起暴发疫情中检出的不同血清型和不同PFGE型别的副溶血性弧菌需要确认各菌株与暴发的关系.     

济源市三例O157:H7大肠杆菌感染的追踪调查

目的 探讨腹泻病人携带大肠杆菌O157：H7的机率，观察带菌时间及预后，方法 采用流行病学监测方法发现病人，通过病人粪便mEC肉汤增菌14个小时，用胶体金免疫标记卡筛选，免疫磁珠法集菌，CHROMAGAR－O157：H7显色培养基分离，rfbO157、rfbO111、hlyA、stx1、stx2、exeA引物PCR扩增等方法进行病源菌分离，毒力因子鉴定。结果 从30例腹泻病人中分离出的4株O157：H7菌株，PCR rfbO157扩增均为阳性。其中二株具有stx2、hlyA、eaeA毒力基因，二株为O157：H7不产毒株，结论 O157：H7大肠菌是引起腹泻的重要病原体。     

四川省大肠杆菌O157∶H7分子流行病学、耐药性及对消毒剂抗性研究

目的研究从四川省分离的大肠杆菌O157∶H7菌株流行病学特征。方法用多重PCR测定67株大肠杆菌O157∶H7的slt、eaeA、hly毒力基因;对不同来源的大肠杆菌O157∶H7进行质粒和PFGE分型;测定67株大肠杆菌O157∶H7的耐药性和对消毒剂的抗力。结果62.7%的株菌(42/67)携带有毒力基因,毒力图谱类型主要为slt1+slt2+eaeA+hly。67株菌共有6种质粒谱型和7种PFGE谱型。64.2%(43/67)的菌株分别对7种不同的抗生素耐药,其中有23、35、34株菌分别对氨苄青霉素、四环素和SMZ耐药。不同来源的大肠杆菌O157∶H7抗性谱不同,80.6%(54/67)的菌株对酒精和季铵盐产生了抗性,所有菌株对洗必泰敏感。结论四川省不同来源的大肠杆菌O157∶H7带毒率相似,但毒力基因谱型不完全相同。细菌有较高的耐药性。菌株对常用消毒剂有很高的抗性,在消毒灭菌时需要用较大剂量的消毒剂才能将其杀灭。不同来源的大肠杆菌O157∶H7耐药性、质粒和PFGE谱型有一定的相似性,提示菌株可能在人、动物、食品以及外环境之间相互传播并存在流行的可能。     

1997-2010年宁夏回族自治区小肠结肠炎耶尔森菌致病性的基因特征

目的 了解宁夏回族自治区小肠结肠炎耶尔森菌主要毒力基因分布情况和致病性小肠结肠炎耶尔森菌分子分型特征。方法 于1997-2010年在宁夏回族自治区共分离得到283株小肠结肠炎耶尔森菌,用PCR法分析其黏附侵袭位点基因(ail)、耐热肠毒素A基因（ystA）、ystB、黏附素基因（yadA）、毒力活化因子基因（virF）;应用限制性内切酶Not Ⅰ酶切致病性小肠结肠炎耶尔森菌染色体DNA进行脉冲场凝胶电泳(PFGE),利用BioNumerics软件进行聚类分析。结果 209株O∶3、O∶9血清型小肠结肠炎耶尔森菌中ail、ystA、yadA、virF毒力基因阳性,ystB为阴性的占97.6％( 204/209);O∶8血清型和未开展血清分型的菌株5种毒力基因全部阴性;11株O∶5血清型有9株5种毒力基因全部阴性。将致病性菌株进行PFGE分型,根据染色体DNA的Not Ⅰ酶切图谱,将29株O∶3血清型分成12个PFGE带型,包含5株以上的优势PFGE带型有2种。180株O∶9血清型菌株分成13个PFGE带型,包含10株以上的优势PFGE带型有4种,各自是从同一地区猪与家鼠、猪与犬、猪与野兔分离。结论 宁夏地区O∶3、O∶9血清型小肠结肠炎耶尔森菌具有致病性,O∶3逐步成为如今的优势血清型;O∶5、O∶8与血清未分型的菌株无致病性。     

对流行地区的E.coli O157：H7病原学分析及研究

目的：对流行地区O157：H7进行病原学分析。方法：PCR方法对O157：H7菌株毒力基因谱检测比较，同时用PFGE和RAPD方法对O157：H7菌株的同源性分析比较。结果：流行地区分离的O157：H7菌株，100％携带Hly,eaeA基因，95．35％携带SLT2基因，11．63％携带SLT1基因，PFGE图谱表明流行地区分离的O157：H7菌株与日本分离的O157：H7菌株有明显差异，为不相关菌株；与国内标准菌株882364为近似型（相似，但不相同），流行地区病人分离菌株与外环境家畜家禽类便与昆虫肠道分离菌的PFGE图谱完全相同，结论：携带O157：H7菌株的家畜家禽可能是导致疫情发生的传染源。PFGE用于O157：H7病原学分析，对流行病学研究有重要意义，但不适宜基层，RAPD方法用于O157：H7病原学分析，技术简便，省时。     

艾伯特埃希菌PFGE分子分型及其数据库的建立

目的建立艾伯特埃希菌PFGE分子分型方法,分析不同来源艾伯特埃希菌间的同源关系,并建立其PFGE分型数据库。方法参考非O157大肠埃希菌PFGE分型方法,对从自贡、泸县地区分离的63株艾伯特埃希菌和1株艾伯特埃希菌参考菌株LMG20976进行PFGE分析,利用Bio Numerics 7.5软件分析PFGE图谱并建立数据库,并对分型结果与样本来源、类型、ST型、intimin亚型等进行关联性分析。结果 64株艾伯特埃希菌分型效果明显,被分为46种PFGE带型,分别命名为EASX01001~EASX01046,相似度为55%~100%,包含9种克隆群(≥2种带型形成克隆群),同种带型超过2株的带型共有8种。结论非O157大肠埃希菌PFGE分型方法适用于艾伯特埃希菌分型研究,比MLST技术具有更高的分辨能力,通过图谱分析发现艾伯特埃希菌具有遗传多样性的特点。同时,建立的数据库为深入了解艾伯特埃希菌的分子流行病学特征提供科学依据。     

大肠埃希菌O157:H7分离株MLVA分子分型

目的了解国内大肠埃希菌O157:H7菌株的分子流行特征。方法采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法对1999-2002年江苏、河南、安徽、山东、云南等地的大肠埃希菌O157:H7分离株135株进行分子分型,选取7个可变数目串联重复序列(VNTR)位点,应用PCR技术及毛细管电泳方法,检测分离株DNA多态性,使用BioNumerics软件进行聚类分析。结果 135株大肠埃希菌O157:H7可分为3个群(A群、B群、C群)38个MLVA型别,其中A群占20.7%(28/135)、B群占23.7%(32/135)、C群占55.6%(75/135);MLVA型别存在一定地域性,同一暴发来源的菌株具有相同MLVA型别。结论大肠埃希菌O157:H7国内分离株存在丰富的基因多态性;MLVA方法具有较高分子分型能力,可以在溯源和流行病学调查中发挥重要作用。     

福建省O157大肠杆菌调查

目的 探索Ｏ１５７大肠杆菌在福建省人兽及食物中的存在情况,并了解这些检出菌的生物学特性。方法 １９９７～１９９８年选莆田、福州等地检查腹泻患粪便、畜食粪便标本及肉类标本２７２５份,以血清学方法检测Ｏ１５７大肠杆菌。结果 先从猪、鸽、牛、鸡、鸭等动物及腹泻中检出７６株Ｏ１５７大肠杆菌。据血清学及动力试验结果分类,３３株Ｏ１５７：Ｈ７,２１株Ｏ１５７：ＮＭ,２２株Ｏ１５７：Ｈ？,其中以猪检出率最高     

2007年浙江省衢州地区动物中产志贺毒素大肠埃希菌O157:H7感染状况

目的:了解2007年浙江省衢州地区产志贺毒素大肠埃希菌O157:H7在动物中的分布情况及其耐药性、PFGE分型及毒力基因携带状况。方法:按全国O157:H7监测方案于5~10月份肠道传染病高发季节,在衢州地区采集各种动物粪便/肛拭,用免疫磁珠富集后进行O157:H7分离培养、鉴定,可疑菌株以PCR法检测O、H抗原及志贺样毒素(SLT1和SLT2)、粘附抹平因子(eaeA)及溶血素(hly)4种毒力基因。用脉冲场凝胶电泳(pulse field gel electrophoresis,PFGE)方法进行同源性分析,同时选择14种抗生素进行药敏试验,分析分离所得菌株的耐药状况。结果:共监测动物粪便标本300份,分离得产志贺毒素大肠埃希菌O157:H7菌株16株,分离率为5.33%。16株O157:H7菌株,毒力基因Hly、eaeA、SLT2均阳性,SLT1均阴性。脉冲场凝胶电泳分型显示,16株O157:H7菌株可分2个PFGE基因型,型间差异较小。耐药性分析显示这些菌株对红霉素、利福平的耐药率最高,达100.0%,对其他受试抗生素均敏感。结论:该地区动物中产志贺毒素大肠埃希菌O157:H7带菌率较高,所分离菌株主要携带SLT2基因,因此推测该地区存在发生产志贺毒素大肠埃希菌O157:H7感染暴发或流行的潜在危险,需增加对动物源性O157:H7的监测力度。     

A one year study of Escherichia coli O157 in raw beef and lamb products

Between April 1996 and March 1997 we examined 5093 samples of raw beef and lamb products for the presence of E. coli O157. Samples were purchased from 81 small butchers' shops in south Yorkshire. In March 1997 we also examined five samples of dried mint for the presence of E. coli O157. Strains of E. coli O157 were isolated by enrichment culture in modified buffered peptone water followed by immunomagnetic separation and culture of magnetic beads onto cefixime tellurite sorbitol MacConkey agar. Strains were characterized by phage typing, toxin genotyping and plasmid analysis. Strains of E. coli O157 were isolated from 72 (1.4%) of 5093 samples; it was isolated from 36 (1.1%) of 3216 samples of beef products and from 29 (2.9%) samples of lamb products. The highest prevalence was found in lamb sausages and lamb burgers where E. coli O157 was isolated from 3 (4.1%) of 73 and 18 (3.7%) of 484 samples respectively. Strains of E. coli O157 were isolated most frequently during early summer. Strains of E. coli O157 were also isolated from 2 of 5 samples of dried mint although we did not determine how the mint had become contaminated. All isolates of E. coli O157 were Verocytotoxin-producing as determined by both Vero cell assay and DNA hybridization for the genes encoding Verocytotoxin and all were positive for the eaeA gene. A combination of phage typing, toxin genotyping and plasmid profile subdivided the 72 strains of E. coli isolated into 20 different subtypes, of which 18 were indistinguishable from strains isolated previously from cattle and sheep; of these 18 strains, 8 were indistinguishable from strains isolated from human cases of infection during the study period.     

Characterization and epidemiologic subtyping of Shiga toxin-producing Escherichia coli strains isolated from hemolytic uremic syndrome and diarrhea cases in Argentina

Argentina has a high incidence of hemolytic uremic syndrome (HUS); 12.2 cases per 100,000 children younger than 5 years old were reported in 2002. Shiga toxin (Stx)-producing Escherichia coli (STEC) is the primary etiologic agent of HUS, and STEC O157 is the predominant serogroup isolated. The main objective of the present work was to establish the phenotypic and genotypic characteristics of the STEC strains in general isolated from Argentine children during a prospective study and the clonal relatedness of STEC O157:H7 strains using subtyping techniques. One hundred and three STEC strains isolated from 99 children were included. The phenotypic and genotypic features were established, and a polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCRRFLP) was performed to determine stx2 variants. The clonal relatedness of E. coli O157 isolates was established by phage typing and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). The 103 STEC strains belonged to 18 different serotypes, and 59% were of serotype O157:H7. Stx2 was identified in 90.3%, and stx1 in 9.7%. Among the 61 STEC O157 strains, 93.4% harbored the stx2/stx2vh-a genes; PT4 (39.3%) and PT2 (29.5%) were the predominant phage types. Using PFGE with the enzyme XbaI, a total of 41 patterns with at least 80% similarity were identified, and seven clusters with identical profiles were established. Some of the clusters were further split by PFGE using BlnI as the second enzyme. Isolates with indistinguishable PFGE patterns were with one exception also indistinguishable by phage typing and stx genotyping. These findings confirmed that some isolates were genetically related. However, no epidemiological linkages were identified. STEC strains with different genotypes and belonging to diverse serotypes were isolated in Argentina. Some STEC O157 strains could not be distinguished by applying subtyping techniques such as PFGE and phage typing.     

Molecular typing methods to investigate transmission of Escherichia coli O157:H7 from cattle to humans.

The utility of phage typing, pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), and plasmid profile analysis was compared, to differentiate between Canadian Escherichia coli O157:H7 strains of human (n = 27) and cattle (n = 24) origin. The diversity indices for phage typing, plasmid analysis and PFGE were 0.85, 0.69 and 0.93, respectively. PFGE and phage typing were also applied to study the role of direct transmission of E. coli O157:H7 from cattle to humans on isolates collected from two separate farm outbreaks. PFGE showed that more than one E. coli O157:H7 strain with varying PFGE DNA subtype profiles, may be responsible for an outbreak, and that more than one E. coli O157:H7 subtype may be circulating on a particular farm at any one time. To our knowledge, this is one of the first reports where PFGE typing was used to verify the direct transmission of E. coli O157:H7 from cattle to humans.     

中国部分地区大肠埃希菌O157的分子分型及变异研究

目的了解出血性大肠埃希菌（EHEC）O157的分子流行特征和遗传变异关系并完善EHECO157：H7感染性腹泻监测制度。方法采用聚合酶链反应分析毒力基因的分布情况；用脉冲场凝胶电泳技术对1988-2005年部分地区分离到的249株EHECO157：H7（其中产志贺毒素的245株，不产志贺毒素的4株）和51株O157非H7进行分子流行病学分析。结果stx2基因在我国的EHECO157：H7菌株中有着很高的分布率，部分菌株携带stx2基因变种。300株O157共分为161种带型，其中51株O157非H7菌株共有42种带型，4株O157：H7非产毒株分别为4种带型，245株EHECO157：H7共有115种带型。结论EHECO157间的基因变异较大；产stx2原毒素的菌株和5衄2毒素发生变异的菌株带型相差较大。部分菌株之间存在着一定的交叉，说明虽然这两大类菌株有其特有的流行克隆系，但是它们的克隆系之间亲缘关系较近。     

肠道致病菌暴发事件中分子分型技术的应用

目的探讨建立快速敏感的肠道病原菌的诊断分型方法。方法2002年7月用脉冲场电泳胶（PFGE）与噬菌体分型实验方法对发生在日本静冈县的4起暴发事件中29株宋内志贺菌（Shigella.sonnei）分离株与1999年口本静冈县某区现场分离的12株肠出血性大肠埃希菌（enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC）O157：H7菌株进行分型。结果4起事件中Shigetta．sonnei的PFGE结果显示,同起事件的DNA条带几乎一致;2起EHEC O157：H7暴发事件中,同起事件的PFGE条纹几乎一致,而3株散发菌株的PFGE条纹各异;12株EHEC O157：H7噬菌体分型结果也显示了比较好的分型力。结论PFGE具有分型能力强、重复性好等特点,能直观地判断肠道致病菌的亲缘关系,及时查明暴发流行的传染源,从而有效控制疫情的蔓延。     

Clonal diversity of Shiga toxin-producing Escherichia coli O103:H2/H(-) in Germany.

Shiga toxin producing Escherichia coli O103:H2/H(-) belong to the third most frequently isolated EHEC serotypes in Germany following isolates of O157:H7/H(-) and O26:H11/H(-). A total of 145 respective E. coli 103 isolates from single cases of diarrhoea and haemolytic uremic syndrome (HUS) in 1997-2000 were characterised by a range of molecular subtyping methods (PFGE, P-gene profiling, ribotyping, electrotyping) and phage typing in order to analyse their genetic relatedness and the practicability for new epidemiological tracing back. All isolates cluster into a distinct EHEC subgroup and reveal a high clonal diversity together with a considerable stability. Since strains of this serotype rank up to the third most frequently isolated EHEC in Germany a large population of this serotype, and therefore, a great supply of such strains may exist in this country.