PCR反向膜杂交技术检测临床标本中结核分枝杆菌

目的 探讨结核分枝杆菌（TB）PCR反向膜杂交技术的临床应用价值。方法 采用该技术对本院300例确诊结核的或高度怀疑为结核分枝杆菌感染的病人标本、60例非结核住院病人标本进行检测,同时用培养镜检法、常规PCR法作对照试验。结果 PCR反向膜杂交法检出TB菌176例、阳性率（58．7％）,比培养镜检法47例（15．7％）、常规PCR法156例（52．0％）检出率高,而对60例证实无结核分枝杆菌的标本、几种方法检测均为阴性。结论 该技术能快速、敏感和高度特异地检测临床标本中的TB菌。     

膜反向斑点杂交技术检测结核分枝杆菌耐乙胺丁醇基因型

目的应用膜反向斑点杂交技术快速检测结核分枝杆菌对乙胺丁醇（EMB）耐药性。方法设计与合成用于检测结核分枝杆菌耐EMB基因embB的寡核苷酸探针，点于硝酸纤维素膜上，与结核分枝杆菌临床分离株生物素标记的聚合酶链反应（PCR）产物进行反向斑点杂交，并与PCR-直接测序（PCR—DS）结果比较。结果27株结核分枝杆菌临床分离株中，14株敏感株膜反向斑点杂交结果与标准株完全相同；13株耐乙胺丁醇临床分离株检测到embB基因突变。均为306位密码子ATG→GTG、ATG→CTG、ATG→ATA、ATG→ATT和ATG→ATC突变．该突变与直接测序结果完全一致。结论膜反向斑点杂交技术可能成为检测部分结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药基因型简便、快速的方法。     

结核分枝杆菌耐药基因检测

目的：研究结核分枝杆菌耐药的分子机制，建立快速检测耐药基因型的分子药敏试验方法。方法：通过聚合酶链反应、ＰＣＲ－单链构象多态性、ＰＣＲ－限制性片段长度多态性分析ＭＴ临床分离株的ｒｐｏＢ、ｒｐｓＬ、ＫａｔＧ基因和ｉｎｈＡ调节序列。结果：ＰＣＲ分析耐药基因的敏感性为１－１０ｐｇＤＮＡ；除ｒｐｏＢ经物ＰＣＲ扩增为属特异性外，余耐药基因引物ＰＣＲ扩增都具有较高的种特异性。与传统药敏试验方法相比，ＰＣＲ与Ｐ     

PCR反向膜杂交技术检测临床标本中结核分枝杆菌的临床意义

目的 探讨聚合酶链反应（PCR）反向膜杂交技术检测临床标本中结算分枝杆菌（TB）DNA的价值。方法 用PCR反向膜杂交技术检测522例结核及60例非结核患者临床标本中TB－DNA,同时用培养、抗酸染色涂片及常规PCR法作对照。结果 PCR反向膜杂交法阳性率为80．6％（556／690）,培养为18．1％（125／690）,镜检为13．9（96／690）,常规PCR为59．6％（411／690）,PCR反向膜杂交法与常规法比较（P＜0．001）,差异具显著意义。PCR反向膜杂交法阳性检出率高于常规PCR,差异具显著意义（P＜0．001）;该技术假阳性为零。结论 PCR反向膜杂交技术检测临床标本中TB－DNA具有快速、高度特异性和敏感性,可为结核病的临床早期诊断提供一种新的病原学诊断手段。     

反向斑点杂交技术检测结核分枝杆菌3种耐药相关基因

目的:观察膜反向斑点杂交技术快速检测结核分枝杆菌(MTB)对异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)耐药性的效果.方法:用ropB、katG、inhA、rpsL基因的寡核苷酸探针与结核分枝杆菌PCR产物进行反向斑点杂交,并将结果与绝对浓度法药敏试验结果进行比较.结果:INH、RFP和SM的耐药基因检测灵敏度分...     

结核分枝杆菌的耐药机制研究

近年来,分枝杆菌耐药的现象越来越严重,耐药结核分枝杆菌也逐渐增多,所以一旦感染了结核病就会非常难治.目前对于结核病的治疗主要依靠化学药物,但是由于抗结核药物的治疗不规范,病人体内的结核菌对多种抗结核药物发生耐药性,从而形成了耐药结核病.所以深入结核分枝杆菌耐药机制研究以及在此基础上建立适合临床应用的快速耐药检测方法,对...     

多重PCR法检测结核分枝杆菌耐药基因研究

目的:建立多重PCR法快速检测结核分枝杆菌耐药基因。方法:采用多重聚合酶链反应(PCR)同时扩增46株结核分枝杆菌临床分离株、48株北京标准菌株、40例耐药及40例非耐药的结核分枝杆菌临床分离菌株的inhA、katG、rpoB、IS1081等基因并采用测序的方法进行验证。结果:所有耐药样本基因(包括利福平、异烟肼耐药基因)及野生型菌株均被成功扩增。结论:应用多重PCR技术可同时快速检测结核分枝杆菌耐药基因。     

279株结核分枝杆菌耐药情况分析

目的：了解目前云南省结核病耐药情况,为临床治疗及制定策略提供依据．方法采用世界卫生组织推荐的比例法对临床分离的结核分枝杆菌菌株进行INH、RFP、EMB、SM 4种一线抗结核药物的药敏试验．结果301株分枝杆菌分离株中279株（92.7%）为结核杆菌复合群,结核分枝杆菌的总体耐药率为31.5%（88/279）,其中初始耐药率为27.3%,获得性耐药率为44.3%;结核杆菌对INH、RFP、EMB和SM的耐药率分别为19.7%、10.8%、12.9%和19.0%,耐多药率为9.3%．总体耐药情况与云南省既往数据以及全国水平基本持平．结论结核病控制工作任重道远．应及早发现耐药结核病患者并给予规律治疗,同时应把耐药趋势的追踪和耐药监测作为结核病防治规划的重要组成部分并定期观察．     

372株流动人口结核分枝杆菌耐药结果分析

目的掌握廊坊市流动人口结核病细菌学耐药水平及其治疗效果。方法以廊坊市2009-2013年流动人口结核病耐药监测中经鉴定为结核分枝杆菌的372例病人为研究对象,采用比例法测定病人对异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素、卡那霉素、氧氟沙星6种药物的敏感性。结果流动人口总耐药率为55.1%（205/372）,耐多药率为15.1%（56/372）,广泛耐药率为1.9%（7/372）;其中初治患者总耐药率为56.6%（176/311）,耐多药率为11.9%（37/311）,广泛耐药率为0.3%（1/311）;复治患者总耐药率为47.5%（29/61）,耐多药率为31.1%（19/61）,广泛耐药率为9.8%（6/61）。结论廊坊市流动人口结核病耐药率较高,耐药控制工作不容忽视。     

结核分枝杆菌复合群及耐药基因突变检测试剂盒诊断结核分枝杆菌耐药效果研究

目的 评价结核分枝杆菌复合群及耐药基因突变检测试剂盒（GenoType MTBDRplus VER2.0,简称MTBDRplus 2.0）检测利福平和异烟肼耐药的灵敏度和特异度等效能指标,为提高结核分枝杆菌耐药性检测水平提供依据。方法 收集2022年1—12月云南省32个县（市、区）级结核病定点治疗医院分离培养的阳性菌株,经MTBDRplus 2.0检出结核分枝杆菌880株,进行最低抑菌浓度（minimum inhibitory concentration,MIC）法药敏试验检测。结果 以MIC法为金标准,MTBDRplus 2.0检测异烟肼耐药的灵敏度为67.69%,特异度为98.40%,阳性预测值为77.19%,阴性预测值为97.45%,MTBDRplus 2.0和MIC法检测异烟肼耐药结果一致性中等,Kappa为0.701(P<0.001);检测利福平耐药的灵敏度为87.80%,特异度为99.40%,阳性预测值为87.80%,阴性预测值为99.40%,MTBDRplus 2.0和MIC法检测利福平耐药结果一致性较好,Kappa为0.872(P<0.001)。MTBDR...     

利用寡核苷酸芯片快速检测结核分枝杆菌利福平耐药rpoB基因突变

目的:开发快速检测结核分枝杆菌利福平耐药rpoB寡核苷酸突变的基因芯片。方法:根据结核杆菌rpoB基因序列设计探针和引物并制备基因芯片,从临床痰标本中提取结核菌的基因组DNA,PCR扩增含有rpoB基因突变位点的特异DNA片段,荧光标记后与芯片上的特异性寡核苷酸探针进行杂交,同时与DNA测序法比较。结果:22株临床痰标本有18株可用寡核苷酸芯片检测出来,正确率可达82%;患者痰液中少量DNA足够进行芯片检测,无须细菌培养。结论:利用寡核苷酸芯片检测结核菌对利福平的耐药性具有较高的准确性和敏感性,可以应用于临床耐药性诊断。     

深圳地区结核临床分离菌基因突变与耐药的关系

目的研究深圳地区结核分枝杆菌临床分离株的基因突变与利福平（RFP）、异烟肼（INH）、链霉素（SM）和乙胺丁醇（EMB）耐药之间的关系。方法采用反向斑点杂交技术（RDBHA）对182株结核分枝杆菌临床分离株的rpoB、katG、inhA、rpsL和embB基因突变位点进行检测,并采用L-J比例法检测这些分离株对RFP、INH、SM、EMB的耐药性。结果 182株临床分离株中,总的基因突变率为34.62%（63/182）,其中rpoB基因突变率最高,达24.17%（44/182）。多重耐药结核菌（MDR-TB）占17.03%（31/182）。以L-J比例法作为金标准,采用RDBHA技术检测分别与RFP、INH、SM、EMB耐药相关的rpoB、katG/inhA、rpsL、embB基因突变,其灵敏度分别为88.89%、67.50%、81.82%和64.29%,特异度分别为97.08%、94.37%、97.99%和92.86%。结论深圳地区结核分离株ropB基因突变最普遍,S531L位点是其突变率最高的位点。深圳地区结核分枝杆菌对4个一线抗痨药物耐药现象均较严重,反向斑点杂交技术（RDBHA）可快速检测结核分枝杆菌耐药基因突变,能给临床提供快速用药指导。     

耐异烟肼结核分枝杆菌及其katG、inhA基因的突变

目的 探讨耐异烟肼结核分枝杆菌及其katG与inhA基因突变的特征,为临床选择抗结核药物治疗提供实验室参考。方法 回顾性分析2015年1月1日-2017年1月1日在上海交通大学附属同仁医院海南分院的260例患者标本,对213例进行结核分枝杆菌分离培养,对47例进行博奥芯片法检测,再对213例培养所得菌株进行博奥芯片检测,对博奥芯片检测的47例痰标本进行结核分枝杆菌分离培养;对101株结核分杆菌进行katG与inhA基因检测。结果 培养法和博奥芯片结核分枝杆菌检出率分别为36.6%（78/213）和48.9%（23/47）;培养法和博奥芯片耐多药结核分枝杆菌检出率分别为41.0%（32/78）和47.8%（11/23）;博奥芯片法和比例法耐异烟肼符合率98.7%(77/78);男性结核分枝杆菌阳性率45.9%高于女性阳性率29.2%;检测katG基因和inhA基因,3个基因区域都发生突变,突变发生率大小依次为katG315（AGC→ACC）密码子(32株,54.2%)、katG315（AGC→AAC）密码子(16株,27.1%)、inhA-15（C→T）(10株,16.9%)。24株(23.8%,24/101)对异烟肼无突变但对利福平发生突变;43株也同时耐利福平(42.6%,43/101)。突变频率较高的突变位点是315,突变频率为81.4%(48/59),1株(1.7%,1/59)为双位点联合突变且突变频率最低。结论 结核分枝杆菌katG和inhA基因突变与耐INH相关,这为临床及时准确诊断、及早使用抗结核药物联合治疗提供了帮助。     

91株耐利福平结核分枝杆菌的rpoB基因突变分析

目的分析利福平耐药结核菌株rpoB基因突变特点,探讨DNA序列分析在药敏测定中的意义。方法对101株结核分枝杆菌临床分离株rpoB基因的PCR产物进行测序分析,观察其rpoB基因突变的规律。结果 101株临床分离株中,耐利福平91株,经DNA序列分析有85.71%(78/91)菌株存在rpoB基因突变的突变,主要集中在531位(44.87%)和526位(28.21%),未检测到发生缺失或插入碱基突变的菌株,10株敏感株均无突变。结论 rpoB基因核心突变区发生突变是结核分枝杆菌对利福平耐药的主要原因,其中531位丝氨酸和526位组氨酸是最常见的突变位点。     

结核分枝杆菌链霉素耐药基因突变特征分析

目的 了解广东地区链霉素耐药结核分枝杆菌rpsL、rrs基因突变特征。方法 对137株链霉素耐药、166株链霉素敏感的结核分枝杆菌临床分离株应用聚合酶链式反应技术（PCR）扩增rpsL、rrs基因片段,并进行测序、分析比对。结果 137株链霉素耐药菌株中, 118株存在rrs或者rpsL基因突变,突变率86.13%;其中92株存在rpsL基因突变（突变率为67.15%）,主要分布在43位氨基酸（70株）与88位氨基酸（20株）,其中43位氨基酸突变类型为K→R（AAG→AGG,49.64%）和K→T（AAG→ACG,1.46%）,88位氨基酸突变类型为K→R（AAG→AGG,13.14%）、K→T（AAG→ACG,0.73%）和K→Q（AAG→CAG,0.73%）,并有2株存在39、43位氨基酸的联合突变,即T→T（ACC→ACT）联合K→T（AAG→ACG）突变（1.46%）; 47株存在rrs基因突变（突变率为34.31%）,包括8种核苷酸突变,主要分布在1401位A→G（13.14%）、514位A→C（8.76%）、517位C→T（6.57%）,2株存在514、1401位核苷酸A→C;A→G的联合突变;15株存在rpsL与rrs基因的同时突变;166株链霉素敏感菌株中,7株存在rpsL基因突变,13株存在rrs基因突变。结论 广东地区链霉素耐药结核分枝杆菌株的rpsL、rrs基因突变具有其自身特点,存在地域差异。     

结核分支杆菌rpoB基因套式PCR在利福平耐药和结核病辅助诊断中的应用

目的 分析耐利福平的结核分支杆菌(Mtb)rpoB基因突变状况。方法 对38株耐利福平Mtb菌株的rpoB基因突变高频区域进行套式PCR扩增,并进一步全自动测序。结果 38株耐利福平Mtb中有36株存在突变(包含5个密码子11种形式的突变),突变率94．7％。结论 Mtb xpoB基因的突变与利福平耐药高度关联,rpoB基因套式PCR及测序能快速、正确鉴别耐利福平菌株。     

Rapid Detection of Rifampin-resistant Clinical Isolates of Mycobacterium tuberculosis by Reverse Dot Blot Hybridization

Objective A PCR-reverse dot blot hybridization (RDBH) assay was developed for rapid detection of rpoB gene mutations in‘hot mutation region’ of Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis).
Methods 12 oligonucleotide probes based on the wild-type and mutant genotype rpoB sequences of M. tuberculosis were designed to screen the most frequent wild-type and mutant genotypes for diagnosing RIF resistance. 300 M. tuberculosis clinical isolates were detected by RDBH, conventional drug-susceptibility testing (DST) and DNA sequencing to evaluate the RDBH assay.
Results The sensitivity and specificity of the RDBH assay were 91.2%(165/181) and 98.3%(117/119), respectively, as compared to DST. When compared with DNA sequencing, the accuracy, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV) of the RDBH assay were 97.7%(293/300), 98.2%(164/167), and 97.0%(129/133), respectively. Furthermore, the results indicated that the most common mutations were in codons 531 (48.6%), 526 (25.4%), 516 (8.8%), and 511 (6.6%), and the combinative mutation rate was 15 (8.3%). One and two strains of insertion and deletion were found among all strains, respectively.
Conclusion Our findings demonstrate that the RDBH assay is a rapid, simple and sensitive method for diagnosing RIF-resistant tuberculosis.     

特异性寡核苷酸探针反向杂交在mtDNA点突变检测中的应用研究

目的：建立一种快捷、有效的mtDNA点突变检测体系。方法：线粒体病患者15例，根据临床表现分为3组，线粒体脑肌病伴高乳酸血症、卒中样发作（MELAS）组7例，单纯型线粒体肌病组4例，慢性进行性眼外肌麻痹（CPEO）组4例。用苯酚／氯仿法提取外周全血DNA，采用PCR／ASO反向杂交技术。用PCR扩增mtDNA的突变“热区”——tRNA^Leu（UUR）基因，在下游引物的5’端标记上地高辛，与点在尼龙膜上的5对寡核苷酸（AS0）探针：A3243／A3243G（野生型／突变型）、T3271／T3271C、G3460／G3460A、T3291／T3291C、C3256／C3256T进行反向杂交，根据杂交显色信号，确定有无突变。同时利用PCR／RFLP方法加以验证。结果：MELAS组中有A3243G点突变3例，但没有其他4个位点的突变。单纯型线粒体肌病组和CPEO组均未发现以上5个位点的突变。PCR/ASO反向杂交法与PCR／RFLP法结果一致。结论：PCR/ASO反向杂交技术，适用于已知mtDNA点突变的检测，具有敏感、节时、节省费用的特点。尤其适用于大批量标本的筛选。     

结核分枝杆菌MPT64诊断抗原基因的克隆及生物信息学分析

目的获得结核分枝杆菌MPT64诊断抗原基因,进行DNA测序、序列特性生物学特性分析,为研究结核病诊断抗原侯选基因奠定基础。方法以结核菌标准菌株H37Rv为模板,通过PCR技术扩增出结核分枝杆菌MPT64抗原基因,将其重组到pGEM-T载体后进行序列测定和生物信息学分析。结果成功扩增出结核分枝杆菌MPT64抗原基因,测序表明该片段由699bp组成,与已发表基因核苷酸序列相比,同源性为98%,推导编码氨基酸序列同源性为98%。结论经DNA测序证实,扩增出的片段确为MPT64,该片段阅读框完整。     

小鼠结核分枝杆菌耐药模型的建立与评价

目的建立小鼠结核分枝杆菌耐利福平株静脉感染小鼠模型。方法 30只BALB/c雌性小鼠经尾静脉感染结核分枝杆菌耐利福平株每只106CFU,观察小鼠一般状况,并分别在感染后6周、10周、14周处死小鼠,进行脾、肺组织病理切片、抗酸染色、计脏器荷菌数。结果感染后小鼠体重呈逐渐上升趋势,脏器病理变化随时间推移由急性炎症逐渐转为慢性炎症反应,抗酸染色均为阳性,脏器荷菌数与感染剂量相对应,并至少可持续14周。结论成功建立了小鼠结核分枝杆菌耐利福平株静脉感染动物模型,为其进一步用于结核病防治研究奠定了一定的基础。