急性白血病zo-1基因启动子区甲基化状态研究

本研究探讨健康人和急性白血病(AL)不同时期患者zo-1基因启动子区甲基化状态差异。采用硫化测序特异性PCR(BS-PCR)方法对白血病细胞系、AL患者及健康人骨髓标本进行zo-1基因启动子区甲基化状况检测。结果显示:在健康人骨髓中呈低甲基化状态(1.9%),初治、复发和完全缓解的AL患者骨髓中zo-1基因呈高甲基化状态,甲基化率分别为93.2%、66.9%及16.4%,明显高于健康人,差异均有统计学意义(p0.05)。结论:与健康人相比,急性白血病患者骨髓细胞zo-1基因呈高甲基化状态,且AL不同时期的患者中zo-1基因都发生了不同程度的甲基化改变,对zo-1基因甲基化状态的分析有助于监测AL患者疾病的进展。     

ZO-1基因甲基化在MDS进展中的意义

目的:探讨ZO-1基因甲基化在骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndrome,MDS)向急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)转化中的临床意义,为MDS患者的预后评估进一步提供理论依据。方法:采用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MS-PCR)方法检测ZO-1基因在正常对照者骨髓标本(normal control,NC)、MDS、AML患者骨髓标本中的甲基化状态。运用亚硫酸氢盐侧序PCR(bisulfite sequencing PCR,BSP)方法检测1例MDS系列标本ZO-1基因在其MDS-RA、MDS-RAEB、AML阶段的甲基化状态。结果:ZO-1基因在NC、MDS、AML患者标本中的甲基化阳性率存在明显差异(P=0.000),在NC组未发现甲基化阳性,在AM L组阳性率最高(65.0%)。MDS/AML患者ZO-1基因甲基化阳性组髓系原始细胞比例更高(P=0.000)。1例MDS患者系列标本显示,随着疾病进展,在MDS-RA、MDS-RAEB、AML阶段中,甲基化位点阳性频率存在明显差异(P=0.000),在AML阶段阳性频率最高(64.65%)。结论:ZO-1基因启动子区高甲基化发生于MDS/AML患者中,随着恶性克隆增生,ZO-1基因甲基化阳性率及甲基化位点阳性频率越来越高,在一定程度上预示着MDS疾病进展,进一步提示ZO-1基因甲基化水平可成为监测MDS患者急性白血病转化的新指标。     

Zo-1与id4基因异常甲基化在多发性骨髓瘤中的临床意义

多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)是浆细胞恶性增殖性疾病,常规化疗不能治愈,为探讨zo-1、id4基因异常甲基化在MM诊断、预后、微小残留病检测及治疗中基因标志作用的临床意义,采用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific PCR,MS-PCR)方法检测MM细胞系U266、H929及IM9(B淋巴母细胞,MM患者骨髓来源)中zo-1、id4基因的甲基化状况;应用MS-PCR方法分析20例MM患者及6例健康供者骨髓标本zo-1、id4基因启动子区甲基化状况。结果显示:zo-1、id4基因在MM细胞系中均为甲基化阳性(完全甲基化或部分甲基化);zo-1、id4基因在5例健康人标本中均呈完全非甲基化状态;MM患者骨髓中zo-1、id4基因甲基化阳性率分别是50%和85%,二者阳性覆盖率高达95%,二者均阳性的标本阳性率为40%,明显高于健康人(0%),差异均有统计学意义(p0.05);MM患者不同重链及不同轻链间甲基化阳性率没有统计学差异;MM患者是否具有B组症状并不影响患者的甲基化阳性率,这可能与标本数量有关。结论:MM患者中zo-1、id4基因甲基化状态发生改变并具有特异性,可能是MM新的基因标记。     

25例白血病患者TES基因启动子区甲基化状态的研究

目的研究白血病患者骨髓中Testin蛋白(TES)基因启动子区甲基化状态,探讨TES基因与白血病的关系。方法以13例原发急性髓系白血病和12例急性淋巴系白血病患者的骨髓标本为研究对象,以15例健康者骨髓标本作对照,采用焦磷酸甲基化测序(BSP)方法检测骨髓中TES基因启动子的甲基化水平,分析健康者与白血病患者之间甲基化状态,以及不同类型白血病之间TES基因启动子区甲基化状态是否存在差异。结果 25例白血病患者骨髓标本中共有21例TES基因启动子区高甲基化,阳性率为84.0%。15例健康者骨髓标本均未检测到TES基因启动子区甲基化。12例急性淋巴系白血病患者骨髓标本中TES基因启动子区甲基化率为83.3%;13例原发急性髓系白血病患者骨髓标本中TES基因启动子区甲基化率为84.6%,二者差异无统计学意义(P0.05)。结论 TES基因启动子区甲基化检测可能成为白血病诊断的生物标志物之一。     

急性髓系白血病BCL2L10基因启动子区异常甲基化定量研究

目的:定量研究急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)中BCL2L10基因启动子区异常甲基化状态,探讨其与AML的临床关系.方法:应用焦磷酸测序法,对62例原发AML患者的骨髓进行BCL2L10基因启动区甲基化水平的定量检测,并以10例缺铁性贫血和巨幼细胞性贫血的骨髓标本及10例健康人外周血标本作为对照.结果:62例AML中32例标本BCL2L10基因启动区高甲基化,阳性率为51.6％,而20例对照组中1例标本BCL2L10基因启动区高甲基化,阳性率为5.0％;BCL2L10基因在AML患者中的高甲基化阳性率显著高于对照组(P＜ 0.01);BCL2L10基因的甲基化状态与AML患者的年龄、性别及临床分型间均未出现显著相关性(P＞0.05).结论:BCL2L10基因启动子区异常甲基化在AML中普遍存在,其可能是引起AML的分子机制之一.     

急性髓系白血病患者dapk基因启动子甲基化改变的研究

本研究旨在分析中国人群急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者死亡相关蛋白激酶(deathassociated protein kinase,DAPK)基因启动子的甲基化状况及其临床相关性。应用甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)技术对112例AML患者骨髓标本dapk基因甲基化状态进行检测。结果表明:13例对照组均未发生dapk基因启动子甲基化,而112例AML患者中82例(73.2%)发生dapk基因甲基化,dapk基因甲基化改变与患者的性别、年龄、白细胞、血红蛋白、血小板计数、AML分型以及染色体异常等结果均无相关性(p0.05)。结论:dapk基因甲基化是AML中的一个常见分子事件。     

部分恶性血液病患者红细胞A、H抗原表达与基因启动子CpG岛甲基化研究

目的 研究急性髓系细胞性白血病(AML)与骨髓增生异常综合征(MDS)患者红细胞A、H抗原表达与基因启动子CpG岛甲基化的相关性.方法 应用流式细胞技术检测红细胞表面A、H抗原表达,并应用甲基化特异性PCR(MS-PCR)测定ABO基因启动子CpG岛甲基化.结果 AML与MDS组红细胞表面A抗原阳性表达率和A抗原平均荧...     

急性白血病死亡相关蛋白激酶基因表达及启动子区甲基化状态研究简

本研究通过对急性白血病病人及体外肿瘤细胞株的DNA甲基化及基因表达的实验,探讨死亡相关蛋白激酶（death-associated protein kinase,DAPK）基因在急性白血病中的表达情况及其启动子区域甲基化的状态,并分析两者之间的相关程度.应用RT-PCR检测DAPK基因在白血病细胞及正常骨髓细胞中的表达;用巢式甲基化特异性PCR（n-MSP）法检测急性白血病患者及细胞株DAPK基因启动子甲基化状况;从第二轮巢式MSP扩增出的随机产物中挑选2个随机引物,交予专业机构克隆后进行序列分析.结果表明：DAPK基因在10例正常对照者骨髓标本中均有表达,DAPKmRNA在急性白血病病人骨髓标本中表达平均值为0.61 ±0.40,低于正常对照者,差异有显著性（P＜0.05）,其中52.94％（9/17例）的急性淋巴细胞白血病病人骨髓标本DAPKmRNA表达降低或缺失,急性髓系白血病病人数据为41.18％ （42/102）;细胞株U-937显示基因表达正常,HL-60表达缺失;102例急性髓系白血病病人骨髓标本中33例存在DAPK启动子区甲基化,甲基化率为32.4％（33/102）;17例急性淋巴细胞白血病病人骨髓标本中8例存在DAPK启动子区甲基化,甲基化率为47％ （8/17）;7例正常人骨髓标本DAPK启动子区均为非甲基化;细胞株U-937 DAPK启动子区非甲基化,HL-60 DAPK启动子区甲基化.ALL组与AML组患者骨髓细胞DAPKmRNA表达与其启动子甲基化均呈显著负相关（ALL组r=-0.855,P＜0.05;AML组r=-0.343,P＜0.05）,提示两者有密切的关联.结论：急性白血病患者中DAPK基因启动区甲基化与其mRNA的异常表达或失表达有关.     

急性髓系白血病患者SFRP2基因甲基化的检测及临床意义

目的检测分泌型卷曲相关蛋白2(SFRP2)基因在急性髓系白血病(AML)患者中的甲基化状态,探讨SFRP2基因启动子区甲基化状态与AML发生的关系。方法收集了99例AML患者的骨髓或外周血样本,匹配以70例门诊普通患者的外周血作为对照。采用甲基化特异性PCR(MSP)方法对所有研究样本进行SFRP2基因启动子区甲基化状况检测。结果 99例AML患者中有27例检测到SFRP2基因的甲基化,甲基化率为27.3%;而正常对照组中未检出SFRP2基因的甲基化;两者比较差异有统计学意义(P<0.001)。SFRP2基因的甲基化状态与AML的年龄、性别、临床分型及样本来源(骨髓/外周血)间均未见显著关系(P>0.05)。结论 SFRP2基因启动子区的甲基化与AML的发生有相关性,可能是引起AML的分子机制之一。外周血中的SFRP2基因的甲基化可望作为一项新的分子标记物应用于AML的临床早期检测。     

急性髓系白血病SFRP4基因启动子区异常甲基化研究

目的研究急性髓系白血病中SFRP4基因启动子区的异常甲基化状态,探讨其与急性髓系白血病发生的关系。方法应用甲基化特异性PCR法对99例急性髓系白血病患者的骨髓或外周血进行SFRP4基因启动子区甲基化状况检测,并以70例门诊普通患者的外周血作为对照。结果 99例急性髓系白血病患者中有17例SFRP4基因的启动子区发生了甲基化,甲基化率为17.2%;而正常对照组中未检出SFRP4基因启动子区的甲基化。SFRP4基因在急性髓系白血病患者中的甲基化率极显著的高于正常对照(P<0.001)。SFRP4基因的甲基化状态与急性髓系白血病患者的年龄、性别及临床分型间均未出现显著相关性(P>0.05)。结论 SFRP4基因启动子区的异常甲基化与急性髓系白血病的发生有相关性,SFRP4基因的甲基化可能是引起急性髓系白血病的分子机制之一。     

MS-FLAG, a novel real-time signal generation method for methylation-specific PCR

BACKGROUND: Aberrant promoter methylation is a major mechanism for silencing tumor suppressor genes in cancer. Detection of hypermethylation is used as a molecular marker for early cancer diagnosis, as a prognostic index, or to define therapeutic targets for reversion of aberrant methylation. We report on a novel signal generation technology for real-time PCR to detect gene promoter methylation. METHODS: FLAG (fluorescent amplicon generation) is a homogeneous signal generation technology based on the exceptionally thermostable endonuclease PspGI. FLAG provides real-time signal generation during PCR by PspGI-mediated cleavage of quenched fluorophores at the 5' end of double-stranded PCR products. Methylation-specific PCR (MSP) applied on bisulfite-treated DNA was adapted to a real-time format (methylation-specific FLAG; MS-FLAG) for quantifying methylation in the promoter of CDKN2A (p16), GATA5, and RASSF1. We validated MS-FLAG on plasmids and genomic DNA with known methylation status and applied it to detection of methylation in a limited number of clinical samples. We also conducted bisulfite sequencing on these samples. RESULTS: Real-time PCR results obtained via MS-FLAG agreed with results obtained via conventional, gel-based MSP. The new technology showed high specificity, sensitivity (2-3 plasmid copies), and selectivity (0.01% of methylated DNA) on control samples. It enabled correct prediction of the methylation status of all 3 gene promoters in 21 lung adenocarcinoma samples, as confirmed by bisulfite sequencing. We also developed a multiplex MS-FLAG assay for GATA5 and RASSF1 promoters. CONCLUSION: MS-FLAG provides a new, quantitative, high-throughput method for detecting gene promoter methylation and is a convenient alternative to agarose gel-based MSP for screening methylation. In addition to methylation, FLAG-based real-time signal generation may have broad applications in DNA diagnostics.     

Ephb4启动子区域甲基化与肺腺癌的关系

目的研究肺腺癌患者外周血中Ephb4启动子区域甲基化状态,发现Ephb4甲基化与肺腺癌之间的关系。方法采用甲基化特异性PCR（MSP）方法检测肺腺癌样本、及对照正常人血样本中Ephb4基因启动子区甲基化表型状态。结果证明Ephb4基因启动子区域在肺腺癌血样本中呈现高甲基化状态23．8％,正常人血样本中为O％。结论Ephb4基因启动子区域呈现高甲基化状态,表明Ephb4基因可能是肺腺癌的发生的早期事件,在肺腺癌的发生发展过程中起重要作用。     

白血病中FHIT基因的异常表达和缺失

FHIT基因位于染色体 3p14 .2 ,实验室的研究证实FHIT基因具有抑癌基因活性。FHIT基因异常表达或表达缺失出现在多种实体肿瘤和造血系统恶性疾病。为了探讨白血病细胞中FHIT基因的异常表达及意义 ,采用巢式RT PCR法对急性髓性白血病 (AML)、急性淋巴细胞白血病 (ALL)、慢性粒细胞白血病 (CML)以及骨髓增生异常综合症 (MDS)、慢性淋巴细胞白血病 (CLL)、骨髓瘤 (MM )等不同类型白血病患者FHIT基因转录本进行检测 ,并对FHIT基因转录本进行序列测定。 98份血液系统恶性疾病患者的骨髓或外周血标本中AML 38例 ,ALL16例 ,CML 34例 ,其它恶性血液病 10例。全部患者经骨髓细胞形态检查 ,诊断符合FAB诊断标准。肝素抗凝骨髓或外周血 2 - 3ml,分离单个核细胞 ,取 5× 10 7个细胞 ,用RTIZOL 试剂一步法提取细胞总RNA ,行PCR扩增 ,琼脂糖凝胶电泳分析PCR产物。回收目的片段 ,克隆到PGEM T载体 ,进行序列测定。结果表明 :在 5 5 / 98(5 6 % )的被检测病例有FHIT基因的异常表达 ,在AML、ALL和CML异常表达的发生率分别为 2 2 / 38(5 8% ) ,9/ 16(5 6 % )和 19/ 34(5 6 % )。正常骨髓或外周血标本未见有FHIT基因的异常表达。 4 3/ 98(44 % )的患者表达正常转录本 (Ⅰ型 ) ,4 0 / 98(41% )的患者同时表达正常转录本和异常     

血清 GSTP1基因甲基化定量分析在肝细胞癌的早期诊断价值

目的：建立实时荧光定量甲基化方法研究肝细胞癌（HCC）患者外周血血清中游离谷胱甘肽-硫-转移酶P1基因（GSTP1）启动子区域甲基化状态,探讨其是否可作为HCC早期诊断的指标。方法收集95例血清标本,包括40例HCC、30例肝硬化和25例健康体检者,采用实时荧光定量甲基化特异性聚合酶链反应（PCR）技术对血清中GSTP1基因的甲基化水平进行定量分析,应用接受者操作特性（ROC）曲线评估其诊断价值。结果肝癌患者血清中GSTP1基因甲基化定量水平明显高于健康对照组,差异有统计学意义（P＜0．05）。ROC曲线分析表明通过GSTP1基因甲基化定量分析能够高效区分肝癌和肝硬化及健康者（AUC＝0．8641）,以甲基化率2％作为诊断HCC的临界值,其诊断特异度为87．5％,敏感度达69．6％;联合检测血清GSTP1基因甲基化和血清AFP可将HCC检出率提高至75％。结论实时荧光定量甲基化方法可精确定量血清中GSTP1基因甲基化水平,在HCC的早期诊断中有一定的应用价值。     

抑癌基因APC启动子甲基化检测及其在肺癌诊断中的应用

目的　建立抑癌基因APC启动子部位甲基化的检测方法 ,并对肺癌临床样品进行初步检测研究。方法 :对肺癌组织提取的DNA及转甲基后的脐带血DNA进行化学修饰 ,以甲基化特异性引物进行基因扩增 (methylationspecificPCR ,MSP)和甲基化序列分析 (methylationsequencing ,MS)。结果 :经转甲基的人脐带血DNA样品MSP检测为阳性 ,其序列与预期相符 ,未经转甲基样品为阴性。 17例肺癌患者的肿瘤及其正常肺组织APC甲基化检测阳性率分别为 4 7% (8/ 17)和 18% (3/ 17) ,1例肺部良性肿瘤及其正常肺组织的检测结果均为阴性 ;对MSP检测为阴性的 9例肺癌患者肿瘤及其正常肺组织进行MS检测分析 ,有 4例APC启动子部位存在CpG甲基化。结论 :利用MSP和MS两种甲基化检测分析手段 ,对 17例临床确诊肺癌组织的检测总阳性率可达 71% (12 / 17)。MSP操作简便 ,价格低廉 ,可适合于大规模肿瘤患者样本的筛查 ;而对于MSP检测为阴性的临床样品 ,可以利用MS进行进一步的确认 ,为临床肺癌诊断提供更准确的信息。     

急性髓性白血病中hMLH1基因启动子区甲基化与表达水平检测及意义

目的检测急性髓性白血病（acute myeloid leukaemia,AML）细胞hMLH1基因启动子甲基化状态及转录水平,探讨其与AML发生发展的关系。方法运用甲基特异性PCR和Real-Time PCR法检测62例AML患者外周血有核细胞中hM-LH1基因启动子甲基化状态及其转录水平,分析白血病细胞hMLH1基因启动子区甲基化与临床资料的关系。结果 62例急性髓性白血病hMLH1基因启动子甲基化频率为14.52%（9/62）,甲基化白血病细胞与非甲基化白血病细胞hMLH1 mRNA的相对含量分别是0.51±0.19和0.87±0.24,两者的hMLH1转录水平有明显差异（P〈0.05）;AML细胞中hMLH1基因启动子甲基化与患者性别及FAB分型无明显相关性,与发病年龄及难治/复发显著相关。结论在AML中hMLH1基因转录水平受基因启动子甲基化调控,且hMLH1基因甲基化差异与白血病发生及进展恶化显著相关。     

Id4基因甲基化在急性白血病微量残留病检测中的意义

目的探讨Id4基因甲基化作为检测急性白血病（AL）微量残留病变指标的可行性.方法采用甲基化特异性聚合酶链反应（MS-PCR）技术对细胞系中不同比例的白血病细胞以及正常人、初诊和完全缓解期的AL患者骨髓进行Id4基因甲基化状态检测.结果MS-PCR方法可在低于1%白血病细胞中检测到Id4基因甲基化.Id4基因在正常骨髓中呈完全性非甲基化状态,初治急性髓系白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL）患者中甲基化比例分别为84%和86%.Id4基因在完全缓解的ALL患者中甲基化比例达60.9%,高于完全缓解状态的AML患者.Id4基因甲基化检测阳性的14例ALL患者中有8例在12个月内复发,而甲基化检测阴性的9例ALL患者仅有1例复发.Id4基因呈甲基化状态的8例AML患者中有5例在12个月内复发,而Id4基因呈非甲基化的20例AML患者中12个月内仅有2例复发.结论MS-PCR检测Id4基因甲基化有可能作为AL微量残留病的检测方法.     

In-tube DNA methylation profiling by fluorescence melting curve analysis.

BACKGROUND: Most PCR assays for detection of 5-methylcytosine in genomic DNA entail a two-step procedure, comprising initial PCR amplification and subsequent product analysis in separate operations that usually require manual transfer. These methods generally provide information about methylation of only a few CpG dinucleotides within the target sequence. METHODS: An in-tube methylation assay is described that integrates amplification of bisulfite-treated DNA and melting analysis by using a thermal cycler coupled to a fluorometer (LightCycler). DNA melting curves were acquired by measuring the fluorescence of a double-stranded DNA-binding dye (SYBR Green I) during a linear temperature transition. RESULTS: Analysis of a region comprising 11 CpG sites at the SNRPN promoter CpG island showed that the melting temperature (T(m)) differed by approximately 3 degrees C between unmethylated and fully methylated alleles. This assay could easily distinguish patients with Prader-Willi syndrome or Angelman syndrome from individuals without these conditions. Melting curve analysis also allowed resolution of methylation "mosaicism" at the p15(Ink4b) promoter in bone marrow samples from patients with acute myeloid leukemia (AML). AML samples representing pools of heterogeneously methylated p15(Ink4b) alleles showed broadened melting peaks with overall T(m)s between those of the unmethylated and fully methylated alleles. CONCLUSIONS: Integration of PCR and fluorescence melting analysis may be useful for simple and cost-effective detection of aberrant methylation patterns.