利用复杂性状遗传CC小鼠资源群体剖析复杂性状机理

正复杂性状是由多基因控制的多因素疾病性状。包括体重、血液化学、免疫细胞以及宿主对传染病和慢性病的易感性等。近年来,人们投入了大量的资金和精力来研究这些性状产生的宿主遗传因素。由于多种因素的限制,这些复杂疾病的研究很难在人类上直接开展。而由于鼠科与人类间存在大量的同源基因,使得在鼠模型中所筛选到的相关数量性状基因座位(QTL)及候选基因适用于人类复杂疾病的研究。这样一旦在鼠类中找到相关QTL或候     

小鼠脊髓腰膨大横截面积数量性状基因座研究

应用具有87个标记位点的(A／J)／(C57BL／6J)F2群体的分子遗传图谱对控制小鼠脊髓腰膨大横截面积的效量性状基因座(Quantitative Trait Loci，QTL)进行区间作图。共定位了2个QTL：DXMit140和D15Mit26,并估算了每个QTL的加性效应和贡献率。     

小鼠脊髓腰膨大截面积QTL研究

目的 :小鼠脊髓腰膨大截面积性状进行数量性状基因座 (Quantitativetraitlocus ,QTL)的分析定位。方法 :应用近交系小鼠A/J和C5 7BL/6J以及其F1、F2代为材料 ,测定脊髓腰膨大截面积 ,利用分布于小鼠全基因组的 87对引物 ,PCR法进行F2代小鼠基因组扫描分析。结果 :9个QTL与脊髓腰膨大截面积相关 ,分别位于 4,8,13 ,14 ,15 ,16,17和X染色体上。其中 7个QTL的性状变异解释率 (10 % )。对照我们以前的结果 ,3个腰膨大QTL与脊髓重和颈膨大QTL均重叠 ;3个与脊髓重QTL重叠 ;3个单独与腰膨大相关。D15Mit15 8位点显示出最大的性状变异解释率 (15 % ) ,与脊髓重最大的性状变异解释率 (2 4% )的位点相吻合。结论 :研究结果说明控制小鼠脊髓发育最主要位点位于 15号染色体D15Mit15 8附近。本研究为小鼠脊髓发育QTL的精细定位、进行位置克隆以最终确认控制基因打下了基础     

新西兰狼疮鼠抗染色质抗体易感基因染色体定位研究

目的确定新西兰小鼠自身抗染色质抗体的遗传易感基因染色体定位.方法建立新西兰黑色品系(NZB)与新西兰白色品系(NZW)F1×NZB回交小鼠模型.采用覆盖小鼠19条染色体的微卫星遗传标记及数量性状位点(QTL)分析进行基因定位.结果确定了自身抗染色质抗体产生的两个遗传易感基因,一个位于NZW小鼠第9染色体中段30厘摩临近;另一个易感基因位于NZW小鼠第17染色体近中心端19厘摩处(Lods值＞3).结论(NZB×NZW)F1小鼠自身抗染色质抗体的产生受多基因调控,候选易感基因不仅来自于NZB,也来自于NZW.     

猪资源家系中肉质性状基因定位和遗传效应分析

目的 研究和探讨猪肉质性状主基因的定位方法及定位区间。方法 以3头英系大白公猪和7头梅山母猪建立F2资源家系，随机选留屠宰147头F2代个体，获得肉质性状表型数据。对家系内所有个体1、2、3、4、6和7号染色体上的48个微卫星位点进行PCR扩增、判定基因型。利用线性模型最小二乘法对内质性状进行数量性状位点(QTL)区间定位，利用置换法确定显著性阈值。结果 猪4号染色体(SSC4)上肌内脂肪QTL接近染色体显著水平，达到建议水平。SSC2、6和7上定位了肌肉含水量QTL，达到染色体显著水平(P＜0．05或P＜0．01)。肌肉含水量QTL均有印迹效应，梅山和大白猪各有增效基因。结论 QTL定位时，不同的资源群体，定位的结果有差异。     

小鼠15号染色体上脊髓重数量性状基因座的精细定位

目的以前的研究结果表明,控制小鼠脊髓重的一个数量性状基因座(QTL)位于15号染色体D15Mit158附近,跨度约30cM。为分离和确认脊髓重相关基因,本文对该QTL区域进行了精细定位。方法以高级互交系小鼠A/J×C57BL/6J(F4)为研究对象,选择脊髓重偏向两极的个体,在D15Mit158位点附近作高密度局部基因组扫描,用Map Manager QTX19软件对脊髓重与基因型进行连锁不平衡分析。结果在15号染色体D15Mit107附近出现了一个很强的连锁峰,LRS值为17.3(P=1.8×10-4),变异解释率为27%,LOD值达到3.75,可以认定为一主效QTL。该QTL跨度范围为3.2cM。另一个提示可能具有连锁关系的QTL位点在D15Mit28附近,LRS值为7.6(P=0.02),变异解释率为13%,跨度范围为5.0cM。结论控制小鼠脊髓重的D15Mit158区域实际上含有两个QTL,其中一个主效QTL位于15号染色体上宽约3.2cM的D15Mit107位点附近;另一个可能的QTL位于宽约5.0cM的D15Mit28附近。     

花果数量性状在地黄种质资源鉴定中的应用价值

目的 考察花果数量性状在地黄种质资源鉴定中的应用价值。方法 选用7个典型的栽培品种，在相同条件下栽培，于花期和果期测量11个性状的大小，并对测量数据进行统计学处理。结果 发现所选性状在品种间存在显著差异。在花冠和花萼长宽方面，邢疙瘩和千层叶与其他品种区别显著，邢疙瘩表现为宽而短，而千层叶则最为短小，经对17类在分析发现，千层叶珉春他品种相距最远；北京1号与小黑英最为接近，二者与七顶葵比较相似，另外，还发现部分花果数量性状之间存在一定的相关关系。结论 花果数量性状在地黄种质资源鉴定中具有较大的应用价值，同时也揭示了地黄种质资源的遗传多样性。     

医学遗传学中的多基因遗传

多基因遗传的教学,传统观念都是与单基因遗传对比,前者称为数量性状遗传,后者称为质量性状遗传,并且各自有其典型的变异分布图,数量性状的变异是连续的,质量性状的变异是不连续的,本文对这种传统观念提出商榷,阐释了几个要害问题,并建议将群体遗传学的部分相关内容与多基因遗传的内容合并,命名为数量遗传.     

实验动物选择指数的制订

通过事例介绍了如何通过性状的遗传力、遗传相关、表型相关,育种加权值等参数制订实验动物多个数量性状的选择指数,并重点讨论选择指数的方差和标准差;在一定选择条件下,指数选择的期望反应;指数选择时单个性状的期望改进。     

复杂性状遗传CC小鼠与精准医学研究

生物组学技术在生物学、医学上的转化应用,为精准的个体化预防、诊断、治疗提供了关键性的技术体系,精准医学模式应运而生。实验动物学研究是疾病发病机制研究转化到临床不可或缺的手段。为应对目前严重危害人类疾病的复杂性、多样性特点,2002年国际复杂性状联盟(Complex Trait Consortium,CTC)倡议研发建立新的小鼠遗传资源库;通过不同纯系小鼠品系间的杂交创建小鼠复杂性状遗传资源库(Collaborative Cross mice,CC小鼠)。随着原始亲本小鼠(founder)选定、杂交品系的繁殖,CC小鼠在检测小鼠表型、疾病易感性、疾病发生发展及预后与遗传因素的关系方面进行了系列的尝试。文中将就CC小鼠在疾病发生发展及药物评价个体化研究中的应用做一简要介绍。     

表型(证候)可塑性与数量性状位点研究

证候的基因组学研究是“后基因组时代”研究中医证候的热点之一 ,其中重点与难点是表型(证候 )的可塑性与数量形状位点之间复杂的关系问题。结合该领域的研究 ,对表型 (证候 )与数量性状位点从概念、研究进展到两者之间存在的复杂关系等方面进行了概述 ,并提出该领域的研究是阐明证候时空特异性的可能方向     

The Collaborative Cross mouse genetic reference population designed for dissecting complex traits

Complex traits are multifactorial traits controlled by polygenic host factors. These trait-related phenotypic characteristics and performance including body weight, blood chemistry, immune cell profiles, as well host susceptibility to infectious and chronic diseases. In recent years, tremendous efforts were invested aiming to map the host genetic factors attribute to these traits and subsequently clone the gene/s underlying these loci. In parallel to human studies, a number of mouse models and approaches were developed aimed to enhance the mapping process and the gene cloning. These include of using resources such as F2, backcross, advanced intercross lines, outbred populations, consomic, congenic and recombinant inbred lines (RIL). The constraints of these approaches were the limited resolution mapping of genomic regions of the quantitative trait loci (QTL) associated with the trait of interests, and the limited genetic diversity observed in the parental founders. To overcome these limitations, a new genetically highly diverse recombinant inbred lines of mouse population was established, namely the Collaborative Cross (CC), created from full reciprocal mating of 8 divergent strains of mice:A/J, C57BL/6J, 129S1/SvImJ, NOD/LtJ, NZO/HiLtJ, CAST/Ei, PWK/PhJ, and WSB/EiJ. By intercrossing these eight founders to generate the different CC lines, the genetic makeup of the newly developed resource is completely different from the eight parental lines, and will show heterosis, which subsequently will response differently comparing with their original founders. Finally, our results suggest that it is not essential to defining the phenotypic response of the eight parental lines, prior of assessing the CC lines, because it is believed that genetic interaction of the new genetic makeup of the new lines will reveal new phenotypic response, which completely different from the parental lines.In this report, we present to the community the power of the CC for dissecting variety of complex traits including host susceptibility to infectious and chronic diseases as well body performance traits. Based on our results from a variety of studies, we recommend to the community, that the best strategy of using this population is to aim of phenotyping about 50 and more of CC lines, with limited number of biological replicates (3-4 mice per line), and subsequently using the publicly available high dense genotype information of the CC lines as well the sequence database of the eight founders, it will be possible performing QTL mapping to a unprecedented precision genomic regions less than 1 MB, subsequently lead to identify potential strong candidate genes. These achievements are believed cannot be obtained with any other currently available mouse resource populations.     

REML法和MCMC法在数量性状核心家系遗传方差分量模型中参数估计的比较

目的 比较限制性最大似然估计(REML)和马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法在数量性状遗传方差分量模型中参数估计的偏差和精度。方法 计算机模拟50个数量性状核心家系数据集，运用SAS软件中的PROC MIXED程序和WinBUGS软件进行参数估计，比较不同样本含量时两法参数估计结果。结果 在本试验参数指定条件下，对固定效应参数，两法估计的相对偏差低于2％；对随机效应，估计偏差较高。小样本时，MCMC法估计结果比REML法更接近真值。结论 在模拟数量性状方差分量模型时，大样本家系资料可根据实际情况选用两法；小样本家系资料，MCMC法可得到比REML法更稳健的估计，推荐使用。     

aVR导联的临床价值及新进展

在常规12导联心电图检查中，多年来aVR导联临床上未被重视，似乎成为没有诊断价值的导联。但是近年来，这一观念也逐渐在发生改变，aVR导联的作用开始凸显。本文就aVR导联的临床价值及新进展进行综述。     

特异区段替换小鼠性发育表型的研究

【摘要】 目的 了解性发育相关数量性状基因座（ Quantitative Trait Locus,QTL）（DXMit68-rs29053133）在近交系小鼠A/J 和C3H/HeJ (C3H)中是否存在影响表型的序列差异,以帮助对候选基因进行筛选。方法 利用A/J 和C3H/HeJ (C3H)构建了针对该区段的特异区段替换系小鼠,并对其雌鼠的性发育相关性状进行研究。结果 A/J 和C3H/HeJ在这一QTL中染色体的序列差异,没有引起相关性状的明显差异。结论 研究结果显示,A/J 和C3H/HeJ小鼠中该QTL区段中存在序列差异的基因并不是引起性发育表型产生差异的候选基因。     

地中海贫血孕妇sTfR与SF检测的临床意义

目的探讨地中海贫血孕妇血清中血清转铁蛋白受体与血清铁蛋白检测的临床意义。方法采用化学发光法检测40例地中海贫血孕妇和32例健康孕妇血清中可溶性转铁蛋白受体与血清铁蛋白水平。结果正常孕妇组和地中海贫血孕妇组血清转铁蛋白受体之间有显著性差异，血清铁蛋白无显著差异，而α-地贫组和β-地贫组间两者差异皆无显著性。结论血清转铁蛋白受体水平的增高与血清铁蛋白水平的降低可诊断地中海贫血孕妇缺铁的情况。     

多巴胺D1受体基因与精神分裂症患者症状数量性状的关联分析

目的 探讨多巴胺D1受体基因(DRD1)与精神分裂症患者症状数量性状的关联.方法 2006年1月至2007年12月在上海交通大学医学院附属精神卫生中心收集211例精神分裂症患者和247名健康对照者的临床资料及外周静脉血并提取DNA,采用TaqMan荧光探针SNP基因分型技术对DRD1基因的5个标签单核苷酸多态性(rs4532、rs5326、rs2168631、rs6882300及rs267418)进行检查,使用阳性和阴性症状量表(PANSS)评定患者疾病表型的数量性状.结果 患者组与对照组间DRD1基因5个标签SNP的基因型及等位基因频率分布的差异无统计学意义(Ps＞0.05);rs4532-rs5326之间存在连锁不平衡(D'=0.84);单体型分析显示各单体型分布频率差异在病例组与对照组间差异无统计学意义(Ps＞0.05);携带rs4532G等位基因患者的阴性症状分显著高于不携带G等位基因患者[GG±GA型(20.3±3.3)分,AA型(18.2±3.9)分,P＜0.01].结论 DRD1基因rs4532位点可能与精神分裂症阴性症状的数量性状存在关联.

Abstract：

Objective To explore the relationship between dopamine D1 receptor gene (DRD1)and symptom quantitative trait of schizophrenia. Methods Peripheral blood samples were collected from 211 schizophrenics and 247 healthy controls at our center. Five tag SNPs (single nucleotide polymorphisms) (rs4532, rs5326, rs2168631, rs6882300 & rs267418) within DRD1 gene were genotyped by TaqMan SNP genotyping assay. The positive and negative syndrome scale (PANSS) was used to quantify the phenotypes of schizophrenia. Results No significant differences existed in the frequencies of genotypes and alleles of DRD1 gene between the schizophrenics and normal controls ( Ps ＞ 0.05 ); strong linkage disequilibrium was observed between rs4532 and rs5326 ( D'= 0.84 ); no significant difference of haplotypic distribution was identified between the patients and controls ( Ps ＞ 0. 05 ); the patients with rs4532G allele had a higher negative subscale score than those without G allele (20.3 ± 3.3 vs 18.2 ± 3.9, P ＜ 0. 01 ). Conclusion The rs4532 within DRD1 gene may be associated with negative symptom quantitative trait in schizophrenia.     

慢性病量化行为干预模式在社区卫生服务中的应用研究

目的探索慢性病量化行为干预模式在社区卫生服务慢性非传染性疾病防治中的作用。方法应用“知己能量监测仪”和“知己生活方式疾病综合防治系统软件”对62例患有慢性病的社区居民进行饮食、运动量化干预管理,根据患者的病情制定适宜的运动量和摄入量,同时对其不良嗜好或习惯予以纠正,对心理问题予以疏导。结果通过量化行为干预,提高了慢性病患者的健康意识,有效运动量平均增加99·7kcal,膳食结构不合理者减少了21·7%,达到了治疗性生活方式调整的目的。经强化管理期,巩固期追访,血压、空腹血糖、餐后血糖、糖化血红蛋白间差异均有显著性意义(P<0·05)。结论慢性病量化行为干预模式具有科学化、个性化、数字化的特点,患者易掌握、执行,医生便于监测,是社区卫生服务对慢性病防控的突破点,也是促进社区卫生服务可持续发展的方法和途径。     

荧光定量PCR方法检测脑脊液中结核菌DNA的临床意义

目的探讨应用荧光定量PCR方法检测脑脊液中结核菌DNA(TB-DNA)对结核性脑膜炎的临床意义。方法采用荧光定量PCR方法对68例结核性脑膜炎患者及32例非结核性脑膜炎患者的脑脊液标本进行检测,并与涂片、培养法比较。结果荧光定量PCR方法的敏感性显著高于涂片及培养,阳性率分别为57.4%、2.9%、8.9%(P<0.001)。结论荧光定量PCR方法可以通过标准品制定标准曲线,根据标准曲线可换算出标本中原始的靶DNA值,同时具有较高的特异性和敏感性,对结核性脑膜炎的诊断具有重要的临床指导意义。