宫颈癌相关基因单核苷酸多态性研究进展

宫颈癌是妇科常见的恶性肿瘤之一.与机体遗传背景相关的基因多态性,被认为是决定人乳头瘤病毒(human papilloma virus, HPV)感染后宫颈癌发病与否及预后的重要因素.单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)是指某基因中人群发生率超过1%的单碱基替换或缺失现象.本文就近年来与宫颈癌相关的单核苷酸多态性的研究进展综述如下.     

醛固酮合成酶基因单核苷酸多态性与心房颤动的关系

目的 探讨醛固酮合成酶(CVP11B2)基因的单核苷酸多态性与中国汉族人群非家族性心房颤动(房颤)的关系.方法 采用1:1配对的病例对照研究方法,选择297例住院房颤患者作为病例组,同时期、同病房的297例非房颤患者作为对照组.应用GenomeLab~(TM) SNPstream基因分型系统,对CYP11B2基因的两个标签单核苷酸多态位点(tSNPs-rs4545、rs3802228)进行多态性检测.结果 两位点多态性的分布均符合Hardy-Weinberg平衡.病例组患者左心房直径(LA)显著高于对照组(P<0.0001),两个tSNPs的基因型频率及等位基因频率分布在病例组和对照组的差异均无统计学意义,但在病例组3'端非编码区(3'UTR)的rs3802228位点中,具有GG基因型患者的LA显著高于其他型者.多元logistic回归模型在校正年龄、吸烟、BMI、高血压之后,未发现CYP11B2基因两位点基因多态性与房颤发病相关联.两个位点间也不存在连锁不平衡.结论 CYP11B2基因的rs4545tSNPs位点多态性可能与房颤无相关性,位于3'端非编码区的rs3802228tSNPs位点可能与心房结构重构有关.     

β防御素1基因单核苷酸多态性与呼吸机相关性肺炎易感性及预后的相关性研究

目的 探讨β防御素1(HBDI)基因第一外显子5′非编码区(-52A/G、-44C/G、-20A/G)的单核苷酸多态性与呼吸机相关性肺炎(VAP)易感性和转归的相关性.方法 130例术后并发VAP的患者,设为VAP组;80例术后未并发VAP的患者,设为对照组;基因组DNA提取后,采用聚合酶链反应(PCR)扩增DNA片段及DNA直接测序的方法,测定HBD1基因第一外显子5′非编码区(-52A/G、一44C/G、-20A/G)单核苷酸多态性的基因型.结果 5′非编码区一52A/G、-44C/G、-20A/G位点均检测到3种基因型,VAP组患者HBD1基因-44C/G位点C和G等位基因的携带频率分别为81.5％和18.5％,而在对照组分别为90.6％和9.4％,两者比较差异有统计学意义(P＜0.05),VAP组中,死亡组-44C/G位点C和G等位基因的携带频率,分别为60.0％、40.0％,而在存活组分别为84.1％、15.9％,两者比较差异有统计学意义(P＜0.05),其余两个位点的基因型频率和等位基因频率,在VAP组、对照组及死亡组、存活组之间差异无统计学意义.结论 HBD1基因-44C/G位点单核苷酸多态性与VAP的易感性和转归相关,G等位基因为VAP易感和死亡的预警指标.     

醛固酮合成酶基因单核苷酸多态性与心房颤动的关系

目的 探讨醛固酮合成酶(CVP11B2)基因的单核苷酸多态性与中国汉族人群非家族性心房颤动(房颤)的关系.方法 采用1:1配对的病例对照研究方法,选择297例住院房颤患者作为病例组,同时期、同病房的297例非房颤患者作为对照组.应用GenomeLabTM SNPstream基因分型系统,对CYP11B2基因的两个标签单核苷酸多态位点(tSNPs-rs4545、rs3802228)进行多态性检测.结果 两位点多态性的分布均符合Hardy-Weinberg平衡.病例组患者左心房直径(LA)显著高于对照组(P<0.0001),两个tSNPs的基因型频率及等位基因频率分布在病例组和对照组的差异均无统计学意义,但在病例组3'端非编码区(3'UTR)的rs3802228位点中,具有GG基因型患者的LA显著高于其他型者.多元logistic回归模型在校正年龄、吸烟、BMI、高血压之后,未发现CYP11B2基因两位点基因多态性与房颤发病相关联.两个位点间也不存在连锁不平衡.结论 CYP11B2基因的rs4545tSNPs位点多态性可能与房颤无相关性,位于3'端非编码区的rs3802228tSNPs位点可能与心房结构重构有关.     

凋亡相关基因FAS-1377和FAS-670及其配体FASL-844位点基因多态性与中国汉族煤工尘肺的关系

目的探讨FAS／FASL基因多态性在煤工尘肺患者发病遗传易感性中的作用及其与煤工尘肺纤维化程度的联系。方法选择340例汉族煤工尘肺为观察对象，312例汉族煤尘接触者为对照组，应用多聚酶链反应-限制片段多态性（PCR—RFLP）技术检测FAS-1377G〉A、FAS-670A〉G位点及FASL-844T〉C位点的基因多态性。结果煤工尘肺组FAS．1377、FAS-670及FASL-844各基因及等位基因分布频率与对照组比较，差异无统计学意义（乃0．05）。以接尘工龄／〉25年为对照，工龄〈25年的煤工尘肺患者FAS-1377GA／AA型者发生尘肺的危险性是GG型的1．463倍（P=0．098，95％CI：0．932～2．298）；FAS-670AG型发生尘肺的危险性是GG型者的1．494倍（P=0．098，95％C／：0．928～2．404）：FASL-844TT型和TC型发生尘肺的危险性分别是CC型的5,455倍（P=0．039，95％CI：1,088-27．358）及1,338倍（P=0．098，95％CI：0．852-2．101）。接尘工龄〈25年FASL-844基因分布频率和工龄≥25年比较，差异有统计学意义（P〈0．05），FASL-844Tr型发生煤工尘肺的危险性是CC／TC型的4．810倍（P=O．054，95％CI：0．971-23．833）；接尘工龄≥25年为对照，工龄〈25年组FASL-844TT／CT＋FAS-1377GA型发生煤工尘肺的危险性是FASL-844CC＋FAS-1377GG型的1．810倍；FASL-844TT／CT＋FAS．670AG型是FASL-844CC＋FAS-670AA型的2．117倍；FASL-8TT／CT＋FAS-1377GA／AA＋FAS-670AG／GG型发生煤工尘肺的危险性是FASL-844CC＋FAS-1377GG＋FAS-670AA型的2．043倍。结论FAS．1377G〉A、FAS-670A〉G及FASL-844T〉C3个位点的基因多态性在中国汉族煤工尘肺发病的遗传易感性中不起主要作用，但这3个多态性位点及位点的联合作用对病变的发展有影响。     

应用高分辨率熔解曲线检测MTHFR和MTRR基因多态性

目的 探讨高分辨率熔解曲线(HRM)对单核苷酸多态性位点(SNP)检测的准确性,为新生儿出生缺陷相关基因多态性的快速检测与治疗提供参考.方法 收集正常血样,抽取血液DNA并定量.设计亚甲基四氢叶酸还原酶(MTH-FR)两个SNP位点c.677 C＞T和c.1298 A＞C和甲硫氨酸合成酶还原酶(MTRR)的一个SNP位点c.66 A ＞G的特异性HRM引物,利用HRM法对其进行检测,然后取部分样本测序,比较检测结果,并进行HWE检验.结果 经HRM法,96例未知基因型的样本中,MTHFR c.677 C＞T位点检测61例为C/C型,31例为C/T型,4例为T/T型;MTHFR c.1298 A＞C位点检测出50例为A/A型,30例为A/C型,16例为C/C型;对MTRR c.66 A＞G位点检测出51例为A/A型,40例为A/G型,均与测序结果一致.结论 HRM可快速准确且高通量地检测新生儿出生缺陷相关基因多态性,是一种简便和准确的可应用于临床的检测方法.     

广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性关系分析

目的探讨广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性的关系。方法随机抽取广州番禺区汉族人群中120例2型糖尿病患者为研究组,120例健康正常人为对照组。采集两组研究对象的DNA,通过PCR-RFLP,对两组研究对象的Preproghrelin基因rs96217位点的基因型及组间基因型等进行对比分析。结果研究组120例样本中,90例CC,基因型频率为0.750;26例AC,基因型频率为0.217;4例AA,基因型频率为0.033。对照组120例样本中,99例CC,基因型频率为0.825;21例AC,基因型频率为0.175;0例AA,基因型频率为0.00%。组间基因型与等位基因频率对比,结果无统计学差异(P﹥0.05)。结论广州番禺区汉族人群2型糖尿病与Preproghrelin基因rs96217位点单核苷酸多态性之间无统计学差异,但2型糖尿病患者存在AA基因型,健康正常人未显示,应在今后进行更为深入的研究。     

基因单核苷酸多态性与宫颈癌关系研究进展

宫颈癌在发展中国家有很高的发病率及死亡率,宫颈癌仍然是女性第二高发肿瘤,其发病率仅次于乳腺癌,死亡率仅次于胃癌。越来越多的研究表明,宫颈癌是人乳头瘤病毒(HPV)感染引起的^[1], HPV感染可以认为是宫颈癌发生发展的重要环境因素, 但只有一少部分持续感染HPV的患者, 这表明 HPV感染并不足以导致肿瘤的发生, 其中激素、性伴 侣个数、怀孕的年龄以及遗传背景等在宫颈癌的发病中可能 起重要作用^[2]。     

广东省汉族人群RXRA基因rs11185660位点单核苷酸多态性与2型糖尿病遗传易感性关系

目的了解广东省汉族人群RXRA基因rs11185660位点的单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病(T2DM遗传易感性的关系,为中国汉族人群T2DM发病的分子机制提供科学依据。方法采用病例对照研究方法,对2011年11月—2013年10月在广东省10家医院内分泌科招募的1 092例20～70岁T2DM患者和同期在医院体检且按地区和年龄匹配的1 092名20～70岁健康人群进行问卷调查、体格检查和RXRA rs11185660位点基因型检测。结果病例组T2DM患者和对照组健康人群中RXRA rs11185660位点T、C等位基因频率分别为83.2%、16.8%和83.3%、16.7%,TT、TC、CC基因型频率分别为69.0%、28.4%、2.6%和68.8%、29.1%、2.1%,2组等位基因频率和基因型频率分布差异均无统计学意义(均P> 0.05);在调整年龄、体质指数、性别前后,病例组和对照组RXRA基因rs11185660位点共显性、显性、隐性和超显性遗传模型间差异均无统计学意义(均P> 0.05)。结论广东省汉族人群RXRA基因rs11185660位点SNP与T2DM...     

中国炭疽芽胞杆菌致死因子基因中单核苷酸多态性位点分析

目的分析中国炭疽芽胞杆菌致死因子基因中的单核苷酸多态性（SNP）位点特征.方法选择18株炭疽芽胞杆菌,采用PCR方法扩增炭疽芽胞杆菌致死因子基因、测序,并进行SNP位点分析.结果实验中所用中国炭疽芽胞杆菌致死因子基因中第895位核苷酸均为G,与国外菌株不同.中国不同地区（包括新疆、广西、北京、内蒙古等地区）、不同年代和不同来源（包括土壤、牛、羊、骡、狗、患者等）分离的菌株,具有相同的SNP位点特征.结论致死因子基因中第895位核苷酸均为G的SNP位点特征很可能是中国炭疽芽胞杆菌的共同特征.     

单核苷酸多态性检测技术在2型糖尿病遗传易感性研究中的应用

单核苷酸多态性(single nucleotide olymorphisms,SNPs)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,作为第三代遗传标志,SNPs检测对疾病相关基因的生物学基础性研究,针对个体的用药设计和治疗以及有关人类进化和演化的人类学研究都有重要意义。SNPs检测方法多种多样,该文对2型糖尿病相关的SNPs基因多态性检测方法进行了介绍,按照检测的基本原理划分为酶学方法和物理方法,并对相关的应用做了较详细的回顾和分析。     

与克罗恩病临床表型相关的单核苷酸多态性及其研究进展

炎症性肠病（IBD）主要包括溃疡性结肠炎和克罗恩病,近年来其发病呈上升趋势。炎症性肠病的发病机制尚不明确,研究证实遗传因素在其中起着重要作用,基因的单核苷酸多态性与IBD疾病易感性及临床表型相关,本文将对与克罗恩病临床表型相关的主要的单核苷酸多态性作一综述。     

应用CRS-RFLP技术检测hOGG1c.326位点的单核苷酸多态性

目的 探讨创造酶切位点的限制性片段长度多态检测技术(CRS-RFLP)检测单核苷酸多态性的方法及其应用。方法 应用CRS-RFLP检测技术,检测hOGG1c．326位点的单核苷酸多态性,并与未引入错配位点时的限制性片段长度多态检测结果进行比较。结果 CRS-RFLP的检测结果与未引入错配位点时的限制性片段长度多态的检测结果一致。结论 CRS-RFLP检测技术适用于已知单核苷酸多态位点的检测,具有较好的应用前景。     

DNA损伤结合蛋白2基因单核苷酸多态性相关的肺癌发病风险模型

[目的]研究DNA损伤结合蛋白2基因（DDB2基因）单核苷酸多态性位点rs3781620等位基因（nt23314 C〉G）多态与肺癌易感性的关系，并建立环境-遗传因素的肺癌发病风险模型。[方法]运用病例-对照研究，选择湖北省各地区医院经病理诊断确诊的原发性肺癌患者216例为病例组，社区人群448人为对照组，以Taqman探针基因分型的方法进行基因分型，采用多因素非条件Logistic回归后退法筛选肺癌相关危险因素并计算人群归因危险度百分比，绘制受试者工作特征曲线（ROC）。[结果]社区对照人群中DDB2基因的C和G两种等位基因分布频率分别为66．6％和33．4％。多因素分析结果表明与携带DDB2基因单核苷酸多态性位点rs3781620等位基因的野生型纯合子CC基因型者相比，携带CG或GG基因型的研究对象患肺癌危险度为OR=1．634（95％CI：1．104～2．420）；年长者（〉60岁）发生肺癌的危险度为OR=1．641（95％CI：1．110～2．426）；一级亲属家族有肿瘤史的危险度为OR=2．972（95％CI：1．452～6．084）；轻度和重度吸烟者分别为OR=1．649（95％CI：0．962～2．826）、OR=6．351（95％CI：3．978～10．139）；饮酒为OR=1．559（95％CI：1．034～2．349）；体育锻炼为OR=O．568（95％CI：0．383～0．844）。以上各因素的人群归因危险度百分比分别为11．27％、13．34％、7．16％、9．67％、44．90％、8．71％和-11．67％。Logistic回归模型ROC曲线下面积为0．786（95％CI：0．748-0．823）。[结论]遗传和环境因素在肺癌发病中起作用：一级亲属肿瘤家族史、DDB2基因单核苷酸多态性位点rs3781620 CG或GG基因型与肺癌易感性有关；不良的生活方式（吸烟、饮酒和缺乏锻炼）可增加肺癌的危险性。该模型对肺癌发病风险的评估能力中等。     

脑卒中患者ABCA1基因单核苷酸多态性检测的意义

脑卒中是一种严重威胁人类,特别是50岁以上中老年健康的常见脑血管疾病。研究血脂调节基因将对脑卒中的防治有重要意义。ABCA1基因在调节血浆HDL及细胞内胆固醇水平起关键作用,其单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)对其功能有不同的影响。     

多重PCR-RFLP检测XRCC1基因两位点多态性

目的 探讨多重聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(多重PCR-RFLP)技术在单核苷酸多态性检测中的应用.方法 应用多重聚合酶链反应(Multiplex)(多重PCR)原理设计人类X射线交错互补修复基因1(XRCC1基因)194、399位点引物,通过PCR-RFLP技术判断XRCC1基因2个SNP位点多态性.结果 设计的两对引物可同时PCR扩增分别含2个多态位点的DNA片段,MspI限制性内切酶酶切可判断2位点多态性,PCR和酶切效果均较好.结论 多重PCR-RFLP技术可应用于单核苷酸多态位点的检测,并节省时间和费用,提高检测效率.     

安徽汉族人群PDCD1基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮易感性分析

目的探讨程序性细胞死亡基因（PDCD1）单核苷酸多态性（SNP）对安徽籍汉族人群系统性红斑狼疮（SLE）患者易感性的影响。方法利用病例对照研究方法，收集122例SLE确诊患者和143名正常对照的血标本，用酚-氯仿-蛋白酶K提取法提取基因组DNA，用DNA单向测序法进行SNP因子检测和筛查。结果PDCD1基因7809位点的基因型全部为G／G型，PDCD1基因7872位点存在C和T2种多态性，PDCD1基因8162位点存在G和A2种多态性，在两组中分布差异有统计学意义（x^2=8．55，x^2=11．85，P〈0．05）。PDCD1基因7872位点，病例组C／C、C／T、T／T基因型频率分别为36．1％、41．8％、22．1％，对照组分别为51．7％、35．0％、13．3％，两组间基因型分布差异有统计学意义（0=7．411，P〈0．05）；PDCD1基因8162位点病例组G／G、G／A、A／A基因型频率分别为50．1％、20．3％、28．6％，对照组分别为57．6％、20．8％、22．6％，两组间等位基因型分布差异有统计学意义（x^2=7．547，P〈0．05）。PDCD1-7872杂合型、PDCD1-8162杂合型可能具有阻止汉族人发生SLE的作用（OR=0．583，OR=0．485）。结论安徽籍汉族人群PDCD1基因7809位点不呈现SNP，7872和8162位点SNP与SLE的易感性相关。     

载脂蛋白H单核苷酸基因多态性与冠心病及其脂代谢的相关性

[目的]探讨载脂蛋白H(apoH)单核苷酸基因多态性(SNP)与山东地区非亲属汉族人冠心病以及脂代谢的关系。[方法]采用PCR-单链构象多态性分析技术,测定195例冠心病和181例健康对照组的apoH基因3号外显子G341A(Ser88Asn)和8号外显子G1025C(Try316Ser)位点的SNP。[结果]山东地区汉族人外显子3G341A(Ser88Asn)和外显子8G1025C(Try316Ser)存在多态性;冠心病患者G1025C(Try316Ser)SNP改变具有统计学意义,GC基因和C等位基因频率明显高于对照组(P﹤0.05);而G341A(Ser88Asn)基因型和等位基因频率在冠心病与对照组之间比较时差异无统计学意义(P﹥0.05);GAD组G1025C(Try316Ser)基因GC型与GG型比较,GC型组甘油三酯(TG)和低密度脂蛋白-胆固醇(LDL-C)水平升高具有统计学意义(均为P﹤0.05),但G341A(Ser88Asn)基因分型在冠心病组中TG和HDL-C水平的差异无统计学意义(P﹥0.05)。[结论]apoH G1025C(Try316Ser)GC基因和C等位基因可能是山东地区汉族人冠心病的遗传危险因素;该基因位点SNP对TG和LDL-C水平的改变也有意义;未观察到G341A(Ser88Asn)基因位点SNP对冠心病影响,而该位点基因分型对LDL-C水平变化也有一定的意义。     

SLC22A12基因rs1529909和rs7929627位点多态性与高尿酸血症的相关性

目的探讨宁夏银川市居民SLC22A12基因rs1529909和rs7929627位点多态性与高尿酸血症的相关性。方法回顾性收集2014年4—11月在宁夏银川市某体检机构进行健康体检的365例确诊高尿酸血症患者资料,采用1∶1配对病例对照研究,按年龄(!5岁)、性别、民族进行匹配,选择同时间在该机构体检的365例血尿酸水平正常者作为对照。对研究对象进行问卷调查、体格检查、收集空腹静脉血进行生化检测和基因多态性检测。采用配对t检验进行两样本均数比较;条件Logistic回归分析高尿酸血症的影响因素;MDR软件分析两位点交互作用对高尿酸血症的影响。结果病例组体质指数、血尿酸、肌酐、总胆固醇、甘油三酯均值高于对照组(P<0.05)。rs1529909位点等位基因频率在男性病例组与对照组之间的差异有统计学意义(χ~2=4.887,P=0.027);rs7929627位点各基因型频率在回族病例组和对照组中的差异有统计学意义(χ~2=14.906,P=0.002),在男性病例组和对照组中的差异有统计学意义(χ~2=9.749,P=0.021)。交互作用分析结果显示,高危与低危基因型在两组之间的分布有统计学意义(χ~2=8.338,P=0.004),高危基因型发生高尿酸血症的风险是低危基因型的1.536倍(OR=1.536,95%CI 1.147~2.057)。结论rs1529909位点和rs7929627位点与男性高尿酸血症的发生均有关联;rs7929627位点与回族高尿酸血症的发生有关;rs1529909与rs7929627位点对于高尿酸血症的影响可能存在明显的拮抗作用。     

转化生长因子-β1基因单核苷酸多态性与乙型肝炎后肝硬化的相关性研究

目的探讨转化生长因子-β1(TGF-β1)基因单核苷酸多态性(SNPs)及其单倍型与乙型肝炎后肝硬化易感性之间的关系。方法以115例乙型肝炎后肝硬化患者和150例健康对照者为研究对象,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和DNA测序的方法对TGF-β1基因-509C/T、869T/C(Leu10Pro)单核苷酸多态性进行基因分型,用SHEsis软件分析TGF-β1基因的连锁不平衡及单倍型频率。结果 TGF-β1基因869T/C(Leu10Pro)多态性在乙型肝炎后肝硬化组和正常人群中的分布差异无统计学意义,而TGF-β1基因-509C/T多态性在两组人群中的分布差异有统计学意义(P0.05),等位基因频率的相对风险分析发现,T等位基因携带者患乙型肝炎后肝硬化的风险是C等位基因的1.603倍(OR=1.603,95%CI:1.116～2.064);联合基因型分析发现,TGF-β1基因-509C/T、869T/C单核苷酸多态性存在着强烈的连锁不平衡(|D′|=0.891),与-509C/869T单倍型携带者比较,-509T/869C单倍型携带者显著增加了乙型肝炎后肝硬化的发病风险(OR=1.643,95%CI:1.183～2.310)。结论 TGF-β1基因-509C/T多态性和-509T/869C单倍型与乙型肝炎后肝硬化的发病具有相关性,其中T等位基因可能是乙型肝炎后肝硬化的遗传易感基因。