一类罕见H_2S阴性山夫登堡沙门菌腹泻株的研究

目的:研究一类罕见H2S阴性山夫登堡沙门菌腹泻菌株遗传克隆特征。方法:收集、分析本地区参加全球沙门菌监测(GSS)腹泻病例中分离的山夫登堡沙门菌生化、编码SPI-1毒力岛基因(hilA、invA)和耐药特征;应用Riboprinter(RP)DNA指纹图谱系统比较表型典型与不典型菌株的核糖体型;通过PluseNet China数据库中同型菌株的脉冲凝胶电泳(PFGE)图谱聚类比较分子型谱。结果:2006年卢湾区GSS监测病例分离4株山夫登堡沙门菌中有2株属于H2S阴性和SPI-1毒力岛缺失的表型变异菌株。RP分型证实发生变异的山夫登堡沙门菌与典型菌株间分属2个不同的克隆。PluseNet China数据库将包括卢湾区4株山夫登堡沙门菌在内共36株山夫登堡腹泻株共分18种PFGE带型。卢湾区的2株表型变异株分属4型和5型,2株典型菌株分属11型和23型。聚类分析显示表型变异株的克隆在遗传相似度上高于典型株。结论:分子溯源证实SPI-1毒力岛缺失的山夫登堡沙门菌变异菌株与典型菌株同样具有引发局部暴发的致病性,2006年卢湾区分离的H2S阴性山夫登堡沙门菌变种腹泻株与2002年深圳市的1例食物中毒案例分离的2株SPI-1毒力岛缺失株存在同源性。     

沙门菌毒力岛1缺失山夫登堡沙门菌的特性

目的 研究沙门菌毒力岛1( SPI-1)缺失山夫登堡沙门菌的特性。方法 于2006年从上海10例腹泻患者粪便中分离得到10株山夫登堡沙门菌,运用脉冲场凝胶电泳(PFGE)、PCR、毒力基因测序及细胞侵袭试验对其进行分子分型、侵袭基因及细胞侵袭能力检测,并与2002年深圳分离株( C02013)进行比较。结果 10...     

张家港市15株山夫登堡沙门菌的分子分型和耐药性

目的 对张家港市健康体检中分离得到的山夫登堡沙门菌进行相关性和耐药性分析,为张家港市沙门菌菌型库的建立积累数据。方法 对检测中得到的15株山夫登堡沙门菌菌株采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行分子分型,利用PulseNet China网络中的BioNumerics2.6.6软件对图谱进行分析;用全自动细菌生化鉴定仪进行18种抗生素敏感性分析。结果 15株山夫登堡沙门菌分9种带型,其中有6株高度同源,相似度达93.94 %;15株山夫登堡沙门菌的药物敏感性结果完全一致,对阿米卡星、头孢唑啉、头孢替坦、庆大霉素和妥布霉素耐药,其他均敏感。结论 张家港市的山夫登堡沙门菌条带呈多样性,同时存在优势带型。不同型的菌株耐药种类相同,且有多重耐药趋势。     

2008 - 2014年北京市山夫登堡沙门菌耐药性及分子流行病学特征分析

目的 分析北京市2008 - 2014年山夫登堡沙门菌临床分离株的分子流行病学特征。方法 对从腹泻病例分离到的91株山夫登堡沙门菌进行药敏试验、脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型及多位点序列分型（MLST）。结果 2011 -2012年山夫登堡沙门菌在北京地区高水平流行,占所有分离株的87.9%,2008 - 2010年,2013 - 2104年各年份高度散发,病例主要集中在20～59岁成人组,5 - 6月为发病高峰;所有菌株对萘啶酸有较高耐药性（76.9%）,对磺胺异噁唑（53.9%）和链霉素（49.5%）中度耐药,对其他抗菌药物均较敏感;PFGE分型将91株腹泻株分成23种型别,形成三大克隆群,引起2011 - 2012年暴发流行的64株菌形成绝对优势克隆株;42株菌的MLST分型结果显示包括暴发流行在内的绝大多数菌株属于常见型ST14,5株散发菌株为新型ST1923。结论 北京市山夫登堡沙门菌具有明显的克隆株优势带型,引起2011 - 2012年的本地流行,对抗生素敏感性较高。     

上海市肠炎沙门菌流行特征和分子分型研究

[目的]分析上海市2006—2007年肠炎沙门菌菌株,了解上海市肠炎沙门菌分子流行病学特征。[方法]回顾2002—2007年肠炎沙门菌食品株来源并与肠炎沙门菌腹泻株作耐药性比较;对2006—2007年全球沙门菌监测(GSS)病例和食品分离的肠炎沙门菌进行表型验证、药敏试验和脉冲凝胶电泳(PFGE)分析。[结果]2006—2007年肠炎沙门菌在本市非伤寒沙门菌病例中列首位,而80%的食品株源自禽及禽肉制品,食品株的抗生素耐药性高于腹泻株。2007年肠炎沙门菌腹泻株的耐药谱和2006年有较大差异。包括13株食品株在内共76株肠炎菌株可分为21种PFGE带型,遗传同源性接近80%,优势带型依次为3型(34株)、1型(12株)、2型(5株)和5型(5株),除2型外均发现有与腹泻株同型的食源株。2006和2007年的PFGE 1/2型病例分别为4例和12例。[结论]上海市肠炎沙门菌病例与食用污染的鸡肉等禽类制品有密切关系,PFGE 3型肠炎沙门菌是目前上海市肠炎沙门菌流行株的优势菌型,2007年发现由鹅肝传播的1/2型肠炎沙门菌可能是3型的变异株并有取代之成为流行菌株的趋势。开展对腹泻病例和食物链的综合监测和以实验室为主的实时分子分型检测能快速预警肠炎沙门菌散在爆发和追溯污染源。     

一起山夫登堡沙门菌食物中毒的检测与溯源

目的查明一起食物中毒事件的病原,并对其进行溯源分析。方法对4份患者样本和8份食品留样进行病原菌的分离、培养和鉴定,对分离株进行药敏实验和脉冲场凝胶电泳分子分型。结果 4份患者样本和1份食品留样中检出山夫登堡沙门菌,5株分离菌株均对磺胺甲恶唑耐药,其PFGE图谱相似性系数为100.0%。结论本起食源性疾病暴发疫情是由进食被山夫登堡沙门菌污染的食品所致。     

上海市鼠伤寒沙门菌流行特征及分子分型研究

[目的]研究上海市2006—2007年鼠伤寒沙门菌腹泻病例株的分子流行病学特征。[方法]追溯2002—2007年食品中分离的鼠伤寒沙门菌来源,比较鼠伤寒沙门菌食源株与腹泻株的抗生素耐药性;对全球沙门菌监测(GSS)病例和食品中分离的鼠伤寒沙门菌进行血清、耐药表型和脉冲凝胶电泳(PFGE)分子分型。[结果]经培养确认的鼠伤寒沙门菌腹泻病例数,在2006—2007年本市非伤寒沙门菌型病例构成中仅次于肠炎沙门菌,食品菌株多源于禽(64.4%)和畜肉制品(17.8%),其多重耐药菌株显著高于腹泻株(P0.05)。PFGE将7株食品株和44株腹泻株分为23种带型,优势型为1型(8株)、2型(6株)、29型(4株)、49型(8株)和6型(4株),与食源菌株完全匹配的仅有49型、6型共7个病例(15.9%,7/44)。PFGE-1型腹泻株在2006和2007年分别为2例和6例,2型分别为4例和2例。[结论]上海市鼠伤寒沙门菌腹泻病例存在高度散发和分散爆发的流行特征,没有与本地食品菌株相匹配的优势克隆型分别是PFGE 2型和1型,与市售生鲜类肉食品污染株之间的遗传同源性低。推测传染源可能由输入性传染源对食品等媒介形成二次污染所致。建议加强流行病学调查,以揭示潜在的传染源和传播途径。     

2011—2013年北京某城区感染性腹泻患者致病菌检测分析

目的分析北京某城区2011—2013年感染性腹泻患者致病菌分布及脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱特征,为感染溯源提供依据。方法收集2011年1月—2013年12月该区域肠道门诊感染性腹泻患者粪便标本1 179份,对其培养分离的致病菌进行血清分型及PFGE分析。结果 1 179份标本,共培养肠道病原菌330株,其中检出居前4位的肠道致病菌依次为志贺菌属93株(28.18%)、沙门菌属69株(20.91%)、副溶血性弧菌44株(13.33%)及致泻性大肠埃希菌11株(3.33%)。18株宋内志贺菌PFGE分为8个型别,聚类相似度接近88%;69株沙门菌属细菌分为18个血清型,共41种PFGE型别,其中山夫登堡沙门菌和肠炎沙门菌具有明显的优势带型;23株副溶血性弧菌PFGE型别较为分散。结论 3年间感染性腹泻患者致病菌的血清型和PFGE带型分布较为广泛,应注意沙门菌属和志贺菌属细菌的PFGE优势菌型,警惕其引发的感染性腹泻暴发流行。     

沙门菌毒力岛基因在不同血清型沙门菌中的分布特点

目的研究沙门菌毒力岛1(SPI-1)和3(SPI-3)部分基因在不同血清型和分离株中的分布特点,分析其与毒力进化的关系。方法采用变性高效液相色谱(DHPLC)法对分属于6个不同血清型的40株沙门菌毒力岛1上和3上的20个基因进行检测。结果鼠伤寒沙门菌、鸡伤寒沙门菌和肠炎沙门菌的20个基因全部为阳性;猪霍乱沙门菌和山夫顿堡沙门菌缺失SPI-3的sugR和rhu M基因。同一血清型、不同年代和不同地区的沙门菌分离株,其毒力岛基因分布完全相同。结论沙门菌毒力岛基因在不同血清型沙门菌中的变异,说明沙门菌的毒力岛是分阶段进化而来;同一血清型不同菌株的相似性,又说明其毒力基因的相对稳定性。     

沙门菌脉冲场凝胶电泳分型与血清型的对应关系

目的分析沙门菌脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)与血清分型之间的对应关系.方法选择中国细菌性传染病分子分型实验室监测网络PulseNet China沙门菌监测数据中鼠伤寒(Typhimurium)、肠炎(Enteritidis)、德尔卑(Derby)、阿贡纳(Agona)及山夫登堡(Senftenberg)前五位常见血清型菌株共1230株,进行PFGE聚类分析,以血清分型作为参照进行比对.确定这5种血清型PFGE优势带型的共有条带.结果1230株菌株中,1149株经PFGE预测的血清型与实际血清型一致,PFGE预测血清型的准确率为93.4%.5种血清型经PFGE预测的血清型阳性预测值多在90.0%以上、阴性预测值均在95.0%以上.结论PFGE聚类对5种常见血清型沙门菌血清分型具有较好的提示及验证作用.     

上海市奉贤区服务行业从业人员肠道致病菌检测结果分析

目的了解和分析上海市奉贤区2004-2008年饮食服务和公共场所从业人员肠道致病菌携带情况及菌型分布。方法对从业人员肛拭标本进行肠道菌检测及血清分型鉴定。结果共检测标本154 097份,检出阳性菌株545份,总检出率0．35％。其中检出沙门菌537株,志贺菌8株。537株沙门菌经生化及血清学鉴定分为6个血清群46个血清型。其中E群占的比例为38．79％。最常见的血清型依次为伦敦,山夫登堡,德比。结论奉贤区饮食服务和公共场所从业人员沙门菌检出率较高,应加强健康检查,及时调离阳性者。     

一起沙门菌爆发的菌株鉴定和分子溯源研究

[目的]1起沙门菌爆发的菌株鉴定和分子溯源研究。[方法]收集2007年上海市黄浦区1起食源性沙门菌爆发病例的菌株,使用3种不同产地沙门菌分型血清进行菌株比对鉴定,测试菌株耐药性并对部分菌株进行多位点基因序列分型(MLST)。通过Pluse Net China非伤寒沙门菌数据库聚类分析上海市与重庆市爆发菌株的脉冲凝胶电泳(PFGE)图谱。[结果]发生在上海市黄浦区某工地爆发的1起食源性菌株,经血清学和MLST鉴定为汤卜逊沙门菌ST26型;菌株对6种抗生素(四环素、阿莫西林/克拉维酸、氨苄西林、氯霉素、萘啶酸、磺胺异恶唑)的耐药率均为100%。2007年重庆市报告多起食源性爆发案例中的C群沙门菌,经鉴定亦为汤卜逊沙门菌ST26型,与上海市的菌株间存在高度遗传同源性。[结论]兰州生物制品研究所和泰国S&A的沙门菌分型血清的H因子"c"和"k"间存在交叉凝集。2007年上海市黄浦区发生的食源性爆发病例可能为输入性汤卜逊沙门菌ST26型的多重耐药克隆株引起。     

Outbreak of healthcare-associated infection and colonization with multidrug-resistant Salmonella enterica serovar Senftenberg in Florida.

BACKGROUND: In July 1999, a rare strain of multidrug-resistant Salmonella enterica serovar Senftenberg was isolated from the sputum of a trauma patient. Over a 6-year period (1999-2005) in northeast Florida, this Salmonella serovar spread to 66 other patients in 16 different healthcare facilities as a result of frequent transfers of patients among institutions. To our knowledge, this is the first outbreak of healthcare-associated infection and colonization with a fluoroquinolone-resistant strain of S. Senftenberg in the United States. OBJECTIVES: To investigate an outbreak of infection and colonization with an unusual strain of S. Senftenberg and assist with infection control measures. DESIGN: A case series, outbreak investigation, and microbiological study of all samples positive for S. Senftenberg on culture. SETTING: Cases of S. Senftenberg infection and colonization occurred in hospitals and long-term care facilities in 2 counties in northeast Florida. RESULTS: The affected patients were mostly elderly persons with multiple medical conditions. They were frequently transferred between healthcare facilities. This Salmonella serovar was capable of long-term colonization of chronically ill patients. All S. Senftenberg isolates tested shared a similar pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) pattern. CONCLUSION: A prolonged outbreak of infection and colonization with multidrug-resistant S. Senftenberg was identified in several healthcare facilities throughout the Jacksonville, Florida, area and became established when infection control measures failed. The bacterial agent was capable of long-term colonization in chronically ill patients. Because the dispersal pattern of this strain suggested a breakdown of infection control practices, a multipronged intervention approach was undertaken that included intense education of personnel in the different institutions, interinstitutional cooperation, and transfer paperwork notification.     

Antimicrobial resistance and phage types of human and non-human Salmonella enterica isolates in Ireland, 1998-2003

Between 1998 and 2003, 5,161 isolates (3,182 human) of Salmonella enterica were received by the National Salmonella Reference Laboratory of Ireland. Serotyping, antimicrobial susceptibility testing and phage typing were performed by standard methods. The number of isolates of S. enterica serovar Typhimurium decreased from 579 (80%) in 1998 to 208 (19%) in 2003, while S. enterica serovar Enteritidis increased from 59 (8%) in 1998 to 219 (20%) in 2003. Definitive (DT) phage types 104 and DT104b accounted for a declining proportion of all Salmonella Typhimurium isolates (from n = 523 [90%] in 1998 to 126 [60%] in 2003). Numbers of Salmonella Enteritidis phage type 4 declined from 50 (85%) in 1998 to 59 (27%) in 2003. Twenty-eight isolates of typhoidal Salmonella were received with a history of recent travel in 17 cases. Resistance to multiple (four or more) antimicrobial agents was related to serotype and, where applicable, phage type, and was common in Salmonella Typhimurium. Salmonella Typhimurium predominated among isolates from cattle and pigs (n = 213 [58%]), while Salmonella Livingstone (n = 327) and S. Kentucky (n = 227) were predominant in isolates from poultry (total n = 554 [43%]). This paper discusses trends, and their implications, in Irish salmonella isolates since the establishment of the Reference Laboratory.     

2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的分子型别分析

目的研究2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的型别,了解本地菌株分子流行病学特征。方法对66株肠道沙门菌临床分离株进行血清分型和多位点序列分型(MLST)。对其中主要血清型:鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎沙门菌菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果分布于21个血清型的66株沙门菌分成26个ST型别。发现一株纽波特沙门菌为新型ST1690。菌株血清型与MLST型别数据库中所对应的血清型符合率为100.00%。9株甲型副伤寒沙门菌的PFGE带型完全一致(P7型),与先前杭州流行菌株有差异(P1-P6型)。6株肠炎沙门菌分成4个PFGE型,型间最小相似性为92.70%。13株鼠伤寒沙门菌分为11个PFGE型,型间最小相似性为71.70%。7株萨雷甲尼沙门菌分成4个PFGE型别,型间最小相似性为91.00%。结论近年杭州腹泻病人中流行的肠道沙门菌菌株主要血清型为鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎等。甲型副伤寒沙门菌菌株在杭州出现了新PFGE型别。MLST数据可以对沙门菌血清学鉴定提供一定的帮助。