维生素D受体基因FokI多态性与前列腺癌易感性的Meta分析

目的:定量分析维生素D受体基因(VDR)单核苷酸多态性位点FokI(rs2228570)的多态性与前列腺癌易感性的关系。方法:检索Pubmed,EMBase,CBM,CNKI,VIP,万方数据平台从建库到2011年5月的文献,对符合本实验纳入标准和排除标准的随机对照临床研究,运用RevMan5.0.0软件进行Meta分析,Stata11.0软件进行Begg’s检验。结果:共纳入10篇文献,累积样本量为8360例,其中病例组3749例,对照组4611例。定量合成分析未见VDR FokI位点的多态性与前列腺癌易感性有显著关联(等位基因F对f:OR=1.00,95%CI=0.94~1.06,P=0.96;基因型FF/Ff对ff:OR=1.04,95%CI=0.93~1.51,P=0.48;基因型FF对Ff/ff:OR=0.97,95%CI=0.89~1.06,P=0.53)。以印度人群为对象的一篇研究提示等位基因F是前列腺癌的危险因素,但Begg’s检验显示该研究存在较大的发表偏倚。对全体人群按人种进行亚组分析,均未得到VDR FokI位点的多态性与前列腺癌易感性显著性相关(等位基因F对f:白种人OR=0.91,95%CI=0.88~1.02,P=0.17;黄种人OR=1.09,95%CI=0.95~1.24,P=0.22;印度人OR=1.91,95%CI=1.30~2.81,P=0.0009)。结论:VDR FokI位点等位基因F可能为欧美高加索人前列腺癌的保护因素。     

维生素D受体基因多态性与2型糖尿病易感性的研究

目的研究维生素D受体(VDR)基因多态性在中国汉族人群中的分布情况,并探讨VDR基因多态性与2型糖尿病的相关性.方法采用PCR-限制性片段长度多态性方法(RFLP),比较正常中国汉族人群和2型糖尿病患者之间VDR基因多态性等位基因频率和基因型频率的差异.结果 VDR基因FokI酶切位点各基因型在2型糖尿病组和正常对照组中的分布差异具有显著统计学意义(χ^2=9.993,P=0.007).两组间等位基因频率总体分布差异有显著性(χ^2=7.698,P=0.006).DM组等位基因f和基因型ff频率明显高于N组,等位基因f与2型糖尿病呈明显正关联(RR=3.9,P＜0.05).结论中国汉族人群中VDR基因多态性与2型糖尿病相关联,等位基因f是2型糖尿病的易感基因.     

维生素D受体基因多态性与维生素D缺乏性佝偻病易感性的研究(摘要)

目的：维生素D缺乏性佝偻病可导致儿童生长迟缓、骨骼发育障碍和低钙血症，已经明确环境因素是引起维生素D缺乏性佝偻病的主要因素，但对于某些儿童是否存在对佝偻病的遗传易感性目前还不清楚，通过研究维生素D受体（VDR）基因多态性与维生素D缺乏性佝偻病易感性的相关性，探讨维生素D缺乏性佝偻病的遗传易感因素。     

维生素D受体基因多态性与1型糖尿病易感性的meta分析

目的:探讨维生素D受体(VDR)基因多态性与1型糖尿病(T1D)易感性的关系?方法:通过检索 PubMed?Web of Science?WanFang等数据库中获得有关VDR基因多态性与T1D易感性病例-对照关联研究的文献,计算相关基因位点的OR值和95%的可信区间(CI)?结果:共纳入37篇,研究间有异质性,采用随机效应模型合并,BsmⅠ和ApaⅠ多态性是T1D的易感基因(B vs b:OR=1.10,95%CI:1.04~1.18,P=0.003,AA vs aa:OR=1.24,95%CI:1.05~1.48,P=0.012),而FokⅠ和TaqⅠ多态性与T1D的易感性无关?按种族区域进行亚组分析发现,BsmⅠ多态性是东亚和拉丁美洲T1D的易感基因(B vs b分别为:OR =1.52,95%CI:1.33~1.74,P < 0.01;OR 1.51,95%CI:1.25~1.82,P < 0.001),ApaⅠ 多态性是东亚T1D易感基因(AA vs aa:OR= 1.99,95%CI:1.20~3.29,P=0.007)?结论:BsmⅠ和ApaⅠ多态性是东亚T1D的易感基因,且BsmⅠ有可能是拉丁美洲T1D的易感基因,而FokⅠ和TaqⅠ多态性与T1D易感性无关?     

维生素D受体基因多态性与宁夏结核病遗传易感性的关联性研究

目的探讨维生素D受体(VDR)基因多态性与宁夏结核病发病的关系。方法采用以医院为基础的病例对照研究设计,选择108例临床确诊的结核病患者,平均年龄为(33.29±9.86)岁,另选择与其年龄相匹配的154例健康人群作为对照,平均年龄为(36.79±10.95)岁,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)法检测VDR-FokⅠ多态性位点的基因型,计算基因型频率、等位基因频率及比值比(OR)。结果VDR-FokⅠ-FF、Ff和ff基因型在病例组中的分布频率分别为31.5%、50%和18.5%,在对照组中的分布频率分别为24.7%、61%和14.3%。以FokⅠ-ff为参照组,FokⅠ-FF和Ff与之相比,在病例组和对照组间的分布无统计学意义(P>0.05)。结论VDR基因-FokⅠ位点多态性与宁夏人群结核发病无显著的关联性。     

维生素D受体基因多态性与煤工尘肺易感性关系的研究

目的:探讨湖北地区维生素D受体(VDR)基因多态性位点与煤工尘肺(CWP)易感性的关系。方法:采用PCR产物直接测序法,对340例CWP患者(CWP组)和312例对照者的VDR基因的4个SNP位点(FokⅠ、BsmⅠ、ApaⅠ和TaqⅠ)的多态性进行分析,并分析VDR各位点等位基因、基因型和单体型与CWP易感性的相关性。结果:VDR基因各位点等位基因与基因型在CWP组和对照组中的分布差异均无统计学意义(均P>0.05),且各位点在超显性、显性、隐性三种遗传模式下与CWP易感性相关性无统计学意义(均P>0.05)。VDR基因位点FokⅠ-BsmⅠ-ApaⅠ-TaqⅠ单体型TAGT与降低CWP风险存在强关联(OR=0.158,95%CI=0.046～0.541,P<0.01)。结论:VDR基因TAGT单体型可能与中国湖北地区汉族人群CWP易感性显著相关。     

维生素D受体基因多态性与骨质疏松症

【目的】了解广州地区汉族人群中维生素D受体 (VDR)基因型的分布 ,探讨VDR基因多态性与骨质疏松症的关系。【方法】应用PCR RFLP等技术 ,对广州地区汉族人群中VDR基因型的分布及其与骨质疏松症的易感性进行分析。【结果】VDR基因多态性在人群中的分布有种族差异 ,广州地区汉族人群中‘B、A、t’等位基因的出现频率较低 ,原发性骨质疏松组及 2型糖尿病并骨质疏松组中‘A’等位基因在股骨与高骨密度相关。【结论】本研究人群中VDR基因型尚不能作为预测骨质疏松发生的危险性指标     

维生素D受体基因多态性与骨质疏松症

[目的]了解广州地区汉族人群中维生素D受体（VDR）基因型的分布，探讨VDR基因多态性与骨质疏松症的关系。[方法]应用PCR-RFLP等技术。对广州地区汉族人群中VDR基因型的分布及其与骨质疏松症的易感性进行分析。[结果]VDR基因多态性在人群中的分布有种族差异。广州地区汉族人群中‘B、A、t’等位基因的出现频率较低，原发性骨质疏松组及2型糖尿病并骨质疏松组中‘A’等位基因在股骨与高骨密度相关，[结论]本研究人群中VDR基因型尚不能作为预测骨质疏松发生的危险性指标。     

维生素D受体基因Bsm1多态性与非小细胞肺癌易感性的关系

目的探讨维生素D受体基因Bsm1位点多态性与非小细胞肺癌遗传易感性的关系。方法采用聚合酶链限制性片段长度多态性技术,对140例非小细胞肺癌患者和132例健康对照者的维生素D受体基因Bsm1位点多态性进行分析。结果维生素D受体基因Bsml酶切位点基因型和等位基因的频率在非小细胞肺癌和正常人二组之间的差异无统计学意义。结论维生素D受体基因Bsml酶切位点的多态性可能与非小细胞肺癌的遗传易感性无关。     

北京地区汉族人维生素D受体基因多态性分布

维生素D受体（VDR）基因是骨代谢遗传基础的候选基因之一。采用聚合酶链反应及限制性内切酶酶切技术和Southern杂交技术,对北京地区223名无血缘关系的健康汉族成人的VDR基因型进行分析。结果发现,中国人VDR基因多态性的分布频率以b、a、T等位基因为多,分别占95％、75％和95％,明显不同于高加索人种,与日本人也有一定差别,而与朝鲜人较为相似。     

Association between gene polymorphisms of vitamin D receptor and pulmonary tuberculosis susceptibility:a meta-analysis

Background:The vitamin D receptor(VDR) gene is a primary candidate gene for tuberculosis susceptibility,but results of previous studies are somewhat contradictory and underpowered.Thus,it is essential to further explore the association between VDR gene polymorphisms and risk of pulmonary tuberculosis(PTB).Methods:A systematic review and meta-analysis about the association between FokI,TaqI,ApaI and BsmI polymorphisms and PTB susceptibility was conducted.Statistical Package for Social Science(Version 13.0) a...     

中国汉族人群PAX1基因多态性与先天性脊柱侧凸遗传易感性的关联研究

目的 通过候选基因PAX1上单核苷酸多态性(SNP)位点的筛查,探索PAX1与中国汉族人群先天性脊柱测凸(CS)及其不同临床表型之间的关联.方法 采用病例-对照研究,127例中国汉族CS患者;127例对照为性别、年龄、民族与病例相匹配的非脊柱侧凸患者.用QIAamp DNABlood Mini Kit法提取外周血样本的全基因组DNA,根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,应用Haploview 4.0软件选取PAX1的标签SNPs.根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型.对所有样本应用SNPstreamUHT Genotyping系统对所选SNP位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview 4.0软件分析对照组SNP位点间是否存在连锁不平衡.结果 共筛选SNP1(rs17861031)和SNP2(rs6047590)两个位点,其基因型分布在病例和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡.两位点间不存在连锁不平衡.病例/对照组中等位基因频率分别为:SNP1A=37(15%)/37(15%)、SNP1G=217(85%)/217(85%),SNP2A=28(11%)/25(10%)、SNP2T=226(89%)/229(90%);基因型频率分别为:SNP1AA=2(2%)/2(2%)、SNP1AG=33(26%)/33(26%)、SNP1GG=92(72%)/92(72%),SNP2AA=2(2%)/2(2%)、SNP2AT=24(19%)/21(17)、SNP2TT=101(80%)/104(82%),差异均无统计学意义(P>0.05).在进一步与CS临床表型的关联分析中没有发现阳性位点.结论 在中国汉族人群中,PAX1基因可能不是引起CS及其不同临床表型的主要因素.     

TLR4基因多态性与中国汉族儿童结核病易感性的关联研究

目的：探讨TLR4的基因多态性与中国汉族儿童结核易感性的关系。方法收集348名汉族儿童结核病患者,并按照发病部位和严重程度分为肺内结核病、肺外结核病、重症结核病和非重症结核病亚组,以同期查体的389名儿童作为对照,采用病例对照研究,应用高通量MassARRAY技术对于TLR4基因的SNP位点进行基因分型研究。结果研究显示结核组和对照组TLR4基因rs1399431位点基因频率存在差异;rs1399431、rs1927907和rs11536889的基因型频率在亚组间的分布差异具有统计学意义。在显性模式下,rs1927907的A等位基因和rs1399431的T等位基因和正常组比较对于肺外结核病(Prs1927907=0．042和Prs1399431=0．012)具有保护作用;而rs1399431的T等位基因和非重症结核病比较,对于重症TB(Prs1399431=0．012)具有保护作用;在隐性遗传模式下rs11536889的C等位基因和正常组比较对于重症结核病(Prs1399431=0．024)具有易感作用。结论结果提示TLR4基因在结核病易感性方面,特别是结核病亚组之间具有一定作用。     

TLR4基因多态性与中国汉族儿童结核病易感性的关联研究

目的 探讨TLR4的基因多态性与中国汉族儿童结核易感性的关系. 方法 收集348名汉族儿童结核病患者,并按照发病部位和严重程度分为肺内结核病、肺外结核病、重症结核病和非重症结核病亚组,以同期查体的389名儿童作为对照,采用病例对照研究,应用高通量MassARRAY技术对于TLR4基因的SNP位点进行基因分型研究. 结果 研究显示结核组和对照组TLR4基因rs1399431位点基因频率存在差异;rs1399431、rs1927907和rs11536889的基因型频率在亚组间的分布差异具有统计学意义.在显性模式下,rs1927907的A等位基因和rs1399431的T等位基因和正常组比较对于肺外结核病(Prs19277907 =0.042和P=1399431 =0.012)具有保护作用;而rs1399431的T等位基因和非重症结核病比较,对于重症TB(Prs1399431=0.012)具有保护作用;在隐性遗传模式下rs11536889的C等位基因和正常组比较对于重症结核病(Prs1399431=0.024)具有易感作用. 结论 结果提示TLR4基因在结核病易感性方面,特别是结核病亚组之间具有一定作用.     

中国汉族人群SIM2基因多态性与先天性脊柱侧凸遗传易感性的关联研究

目的 通过候选基因SIM2上功能性单核苷酸多态性(SNP)位点的筛查,探索SIM2与中国汉族人群先天性脊柱侧凸(CS)及其不同临床表型之间的关联.方法 采用病例一对照研究:127例中国汉族CS患者;127例对照为性别、年龄、民族与病例相匹配的非脊柱侧凸患者.用QIAampDNABlood Mini Kit法提取外周血样本的全基因组DNA,根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,选取SIM2的主要功能SNPs.根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型.对所有样本应用SNPstreamUHT Genotyping系统对所选SNP位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview 4.1软件分析对照组SNP位点间是否存在连锁不平衡.结果 共筛选SNP1(rs2073601)、SNP2(rs2073417)和SNP3(rs2051397)3个位点,病例/对照组中等位基因频率分别为:SNP1A=13(5%)/15(6%)、SNP1C=241(95%)/239(94%),SNP2A=49(19%)/44(17%)、SNP2G=205(81%)/210(83%),SNP3C=68(27%)/58(23%)、SNP3T=186(73%)/196(77%);基因型频率分别为:SNP1AC=13(10%)/15(12%)、SNP1CC=114(90%)/112(88%),SNP2AG=49(39%)/44(35%)、SNP2GG=78(61%)/83(65%),SNP3CC=10(8%)/5(4%)、SNP3CT=48(38%)/48(38%)、SNP3TT=69(54%)/74(58%),差异均无统计学意义(均P＞0.05).SNP2和SNP3间存在连锁不平衡,但单倍体型关联分析未见阳性结果.进一步与CS临床表型的关联分析中没有发现阳性位点.结论 在中国汉族人群中,SIM2基因遗传变异可能不是引起CS及其不同临床表型的主要因素,有待于进一步研究.     

维生素D受体和降钙素受体基因多态性与新疆地区汉族女性人群骨密度的相关性

目的 研究维生素D受体(VDR)和降钙素受体(CTR)基因多态性与新疆地区汉族女性人群骨密度(BMD)的关系,探讨原发性骨质疏松症发病的遗传易感因素.方法 采用聚合酶链反应 (PCR-RFLP)限制性片段长度多态性技术,对336例新疆地区汉族女性人群的VDR和CTR基因进行多态性分析,双能X线吸收法测定受试者L2~4、Ward′s三角、大粗隆、股骨干4个部位的BMD值,比较不同基因型各部位BMD值的差异.结果 (1)336例受试者VDR、CTR受体基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg定律,90例骨质疏松组与246例非骨质疏松组VDR与CTR基因型分布频率差异无统计学意义(P>0.05).(2)年龄与不同部位BMD值之间呈负相关(P<0.05),体质指数与BMD值之间呈正相关(P<0.05),在将年龄和体质指数进行校正后发现非骨质疏松组中CTR CT基因型在Ward′s三角的BMD值高于CC基因型(P<0.05);VDR Bb基因型在L2~4、Ward′s三角部位BMD均低于bb型(P<0.05), Bb基因型的BMD值在大粗隆、股骨干部位较bb型有降低趋势(P>0.05);VDR-CTR复合基因CCBb型的BMD值最低.结论 年龄与BMD值变化密切相关;体质指数是新疆汉族女性非骨质疏松的保护性因素,适当增加体重对防治骨质疏松有积极的意义;VDR Bb基因型与BMD降低密切相关;VDR-CTR复合基因CCBb型可作为预测新疆地区女性发生骨质疏松危险性的遗传学标志.     

肿瘤坏死因子诱导蛋白3基因多态性与变应性鼻炎遗传易感性研究

目的：研究肿瘤坏死因子诱导蛋白3（tumor necrosis factor alpha-inducible protein 3,TNFAIP3）基因多态性与变应性鼻炎（allergic rhinitis,AR）易感性之间的关系。方法：收集430例AR患者和480例正常对照的血标本,进行病例对照研究。运用限制性片段长度多态性聚合酶链反应和直接测序的方法对从抗凝血中提取的DNA样本中TNFAIP3基因的4个多态位点（rs5029928,rs9494885,rs610604,rs7753873）进行基因分型。结果：病例组和对照组TNFAIP3基因的4个多态性位点基因分型均符合哈迪温伯格平衡。位点rs9494885的等位基因和基因型频率在病例组和对照组中存在统计学差异。AR组TT基因型频率（PC=7.51×10-12）和T等位基因（PC=3.79×10-12）与对照组相比明显升高,CT基因型频率（PC=3.30×10-11）和C等位基因（PC=3.79×10-12）与对照组相比明显降低。此外,CACA单体型频率在AR患者中明显降低（PC=3.29×10-10）,TCCA单体型在AR患者中明显升高（PC=2.18×10-3）。结论：AR的遗传易感性与TNFAIP3基因多态性有明显相关性,且TNFAIP3的rs9494885位点多态性与AR的易感性密切相关。     

中国汉族人群WNT3A基因多态性与先天性脊柱侧凸遗传易感性的关系

目的 探索WNT3A基因与中国汉族人群先天性脊柱侧凸(CS)及其不同临床表型之间的关联.方法 采用病例对照研究127例中国汉族CS患者;所有病例对照为性别、年龄、民族与病例相匹配的非脊柱侧凸患者.用QIAamp DNABlood Mini Kit法提取外周血样本的全基因组DNA,根据国际人类基因组单体型图计划提供的基因型数据,选取WNT3A的主要功能性单核苷酸多态性(SNP).根据椎体畸形特点、畸形部位、畸形受累程度、有无合并肋骨畸形和椎管内畸形将病例组进一步分为不同临床表型.对所有样本应用SNPstreamUHT Genotyping系统对所选SNP位点进行基因型鉴定;进一步进行基于基因型/等位基因频率的关联分析,并用Haploview 4.1软件分析对照组SNP位点间是否存在连锁不平衡.结果 共筛选SNP1(rs964941)和SNP2(rs752107)2个位点,病例/对照组中等位基因频率分别为:SNP1C=127(50%)/115(45%)、SNP1t=127(50%)/139(55%),SNP2C=197(78%)/200(79%)、SNP2t=57(22%)/54(21%);基因型频率分别为:SNP1CC=35(28%)/25(20%)、SNP1Ct=57(45%)/65(51%),SNP1Tt=35(28%)/37(29%),SNP2CC=73(57%)/81(64%)、SNP2Ct=51(40%)/38(30%)、SNP2Tt=3(2%)/8(6%),差异均无统计学意义(P＞0.05).SNP1和SNP2间不存在连锁不平衡.进一步与CS临床表型的关联分析中没有发现阳性位点.结论 在中国汉族人群中,WNT3A基因遗传变异可能不是引起CS及其不同临床表型的主要因素.

Abstract：

Objective To investigate whether the polymorphisms of WNT3A gene are associated with congenital scoliosis (CS) and its various clinical phenotypes in a Chinese Han population.Methods A total of 127 CS patients admitted into PUMC were enrolled into this case-control study between October 2005 and September 2007.There were 55 boys and 72 girls with a mean age of 12.90 years old.Another 127 scoliosis-free control subjects at the same hospital during the same study period were frequency-matched with regards to age (+3 years) and gender.Genomic DNA was extracted by QIAamp DNA Blood Mini Kit from peripheral blood leukocytes of each subject who had signed informed consent.Based on the genotypic data from the International HapMap project,the main functional single nucleotide polymorphisms (SNPs) were initially selected.The patients in the case group were classified into different clinical phenotypes according to vertebral defect type,location of deformity,extent of developmental disruption,combined rib malformations and neural canal deformity.The genotying of all selected SNPs was performed by SNPstream technology (Beckman Coulter SNPstream).All data of SNPs with polymorphism were processed by the association analysis based on a single SNP and between phenotypes and SNPs.And the pairwise linkage disequilibrium was calculated in the control population by Haploview 4.1 software.Results The SNP1 (rs964941) and SNP2(rs752107) of WNT3A were genotyped.There was no linkage disequilibrium between two SNPs.No association was observed between SNP1 and SNP2 genotypes or allele polymorphisms and risk of CS and various clinical phenotypes (P ＞ 0.05).Conclusions The genetic variants of WNT3A gene may not be associated with the susceptibility to CS and various clinical phenotypes of CS in Chinese Han population.     

维生素D受体基因多态性与中国汉族人群泌尿系结石易感性的相关性研究

目的：探讨中国汉族人群中维生素D受体(vitamin D receptor, VDR)基因ApaI(rs7975232)、BsmI(rs1544410)、TaqI(rs731236)、FokI(rs2228570)多态性与尿石症的关系。方法：尿石症患者212例和对照组250例纳入本研究。采用聚合酶链式反应限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)方法分析了VDR基因的4个多态性位点。结果：所有多态性位点在病例组与对照组中均符合遗传平衡定律。两组中BsmI和FokI位点多态性与中国汉族人群尿石症易感性相关。携带BsmIb等位基因者,其尿钙排泄水平明显升高。结论：BsmI和FokI位点基因多态性与中国汉族人群尿石症的发生相关,BsmI的b等位基因与尿石症患者的高尿钙排泄有关。