重症肌无力患者免疫相关基因差异表达的基因芯片研究

目的:使用基因芯片技术研究重症肌无力(MG)患者外周血单个核细胞免疫相关基因的差异表达。方法:采用BIOSTAR Human-6-V3型人类全长基因cDNA表达谱芯片筛选30例初次发病MG患者差异表达的免疫相关基因,酶联免疫吸附法(ELISA)检测患者外周血IL-6、TNF-α的水平,对MG患者病情按许贤豪绝对评分法进行评分,并比较其临床意义。结果:158条差异表达免疫相关基因中,表达上调的基因76条(Ratio值2.0倍以上),表达下调的基因82条(Ratio值0.5倍以下),差异表达的免疫相关基因主要涉及细胞因子及其受体、趋化因子及其受体、细胞黏附分子、白细胞分化抗原、免疫转录调节分子、天然免疫分子等,细胞因子中IL-6、TNF-αmRNA表达水平显著上调,与MG患者血清IL-6、TNF-α水平检测结果一致,血清IL-6、TNF-α水平与MG临床绝对评分呈正相关。结论:人类全基因芯片技术可以快速、高通量筛选出MG患者差异表达的免疫相关基因,结果证实多个免疫基因参与了MG发病过程,为进一步阐明MG发病的免疫机制及治疗提供新的思路。     

骨质疏松免疫相关标志物的生物信息学分析及其鉴定

目的 鉴定骨质疏松中与免疫相关的失调机制及潜在的诊断预测标志物。方法 从GSE35958和GSE56815数据集中下载骨质疏松和对照人群的基因表达谱数据。通过筛选差异表达基因(DEG)和免疫学数据库和分析门户(ImmPort)数据库比较获得免疫相关DEG。利用Clusterprofiler软件包对免疫相关DEG进行富集分析。采用检索相互作用基因/蛋白质的搜索工具STRING数据库构建蛋白相互作用网络并鉴定网络内连接度最大的前10个基因作为候选基因。随后利用受试者工作特征(ROC)曲线,logistic回归和列线图评价候选基因的诊断预测作用。最后,PCR和Western blot法检测这些基因在骨质疏松症患者骨髓组织的差异表达。结果 通过交集分析获得138个免疫相关DEG。富集分析结果提示这些基因参与免疫炎症等生物学功能,以及T细胞受体、丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)、大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(Ras)、破骨细胞分化和B细胞受体等信号通路。另外,在候选基因中,在骨质疏松中上调表达的血管内皮生长因子A(VEGFA)和表皮生长因子受体(EGFR),以及下调表达的蛋白激酶B1(AKT1)、 S...     

基于WGCNA构建食管鳞癌免疫相关基因预后模型北大核心CSCD

目的:采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选食管鳞癌(ESCC)预后相关免疫相关基因(IRG),构建预后模型,为ESCC患者预后预测提供依据。方法:从TCGA数据库下载81例ESCC及11例正常食管组织的全转录组数据及对应样本临床数据,筛选差异表达IRGs。采用WGCNA、单因素Cox回归和多因素Cox回归分析构建ESCC预后模型,绘制受试者工作特征曲线(ROC)及Kaplan-Meier(K-M)曲线评价模型,单因素Cox回归和多因素Cox回归分析评价模型是否可成为独立预测因子。结果:筛选出545个差异表达IRGs,其中383个上调,162个下调。单因素Cox回归分析得到6个预后相关IRGs,多因素Cox回归分析得到4个预后相关IRGs(SLC40A1、IGHA2、STC2、NR2F2)用于构建预后风险模型。K-M曲线显示,高风险组患者总生存期(OS)显著低于低风险组(P<0.01)。多因素Cox回归分析表明,预后风险模型可作为一个独立预后因素(HR=1.133,P<0.01)。结论:本模型具有较高的准确性,可作为ESCC患者预后的独立预测因子。     

肝癌相关基因差异表达分析

为了研究肝癌发生和发展的分子机理，用cDNA Microarray技术比较肝癌(HCC)和癌旁组织（nonHCC)基因差异表达情况，并选择4个差异表达基因用RT－PCR验证。在1176个肿瘤相关基因中，491个在HCC中表达，345个在nonHCC中表达。HCC中表达上调的基因172个，表达下调的基因89个，RT－PCR结果与cDNA Microarray的结果基本一致。差异表达最多的基因是与细胞信号传导和细胞分裂相关的基因。肝癌中生长因子及其受体相关基因表达上调，Ras-Raf-MAPK信号传导途径活化，与细胞周期相关基因的异常表达加速了细胞分裂进程。所有这些变化与肝癌的发生和发展密切相关。     

免疫相关基因在同一膀胱癌亚克隆细胞株中的差异表达

目的:筛选和鉴定同一膀胱癌亚克隆细胞株中差异表达的与BCG免疫相关的基因。方法:以已建立的两株同一来源、不同生物学表型的膀胱移行细胞癌细胞系BLX和BLS211为材料,采用抑制性削减杂交技术(SSH)筛选差异表达的基因片段。结果:在BLX细胞中获得9个高表达的基因,在BLS211细胞中获得15个高表达的基因。BLX细胞中有3个基因,即与卡介苗(BCG)免疫治疗相关的基因BCG诱导的膜蛋白(BIGM103)基因、纤维连接蛋白(FN)基因和补体因子B(BF)基因;BLS211细胞中有8个基因均为新的表达序列标签(EST),已被GenBank登录(登录号为DY50570813,DY2304478)。结论:SSH技术筛选表明,BIGM103等免疫相关基因的不同,可能与不同膀胱癌细胞对BCG免疫治疗的差异性有关;新的EST的获得,为进一步克隆全长、研究基因的功能创造了条件。     

基于生物信息学筛选并分析与浸润性乳腺癌免疫浸润有关的预后基因北大核心CSCD

目的:筛选并分析浸润性乳腺癌(BRCA)发生发展过程中与免疫浸润有关的预后基因,为进一步寻找BRCA潜在的预后生物标志物及治疗靶点奠定基础。方法:从TCGA数据库下载BRCA患者的mRNA表达信息数据和临床数据,并进行预处理,ESTIMATE网站获取患者的免疫/基质评分;分析免疫/基质评分与临床病理分期TNM系统间及与总生存率间的关系。按照评分中位数分别将患者分为高免疫评分组和低免疫评分组,基质评分分组同上,利用R软件分别筛选差异表达基因(DEGs),并取交集;对上步取交集的DEGs进行GO和KEGG富集分析;通过Cytoscape软件构建蛋白互作(PPI)网络,并筛选出枢纽基因。利用GSEA分析肿瘤免疫相关基因富集的主要通路;运用GEPIA2.0数据库分析枢纽基因在肿瘤与癌旁组织的表达情况及与总生存期的关系。结果:筛选出1 244个与BRCA免疫浸润相关的DEGs,富集分析表明这些基因主要参与信号转导、免疫反应、炎症反应等生物学过程;GSEA富集分析表明这些基因主要参与趋化因子信号通路、TOLL样受体信号通路、JAKSTAT信号通路及T细胞受体信号通路等。PPI网络筛选出CD19、IL-2、PTPRC、CD28、IL-6、CD40LG和CCR7共7个枢纽基因;GEPIA2.0数据库分析结果显示IL-2、CD40LG和CCR7与患者总生存率显著相关。结论:筛选出IL-2、CD40LG及CCR7基因与BRCA免疫浸润密切相关,并具有预后价值,为进一步预测BRCA患者预后的生物标志物及治疗靶点奠定基础。     

调节性B细胞与免疫相关性疾病的关系北大核心CSCD

近些年来,人们发现B细胞除具有产生各种抗体、发挥体液调节作用之外,还存在一种类似于调节性T细胞（regulatory T cell,Treg）的、可以调节免疫应答的细胞亚群--调节性 B 细胞（ regulatory B cell, Breg ）。最近研究表明,与 Treg 的亚型（ Tr1、Tr3、T FoxP3＋）相对应, Breg 亦具有 Br1、Br3、B FoxP3＋亚型［1］。 Breg通过产生抑制性细胞因子（白细胞介素-10, IL-10;转化生长因子-β, TGF-β）或分泌抑制性抗体影响其他免疫细胞,在免疫调节中发挥作用［2］。 Breg与免疫耐受、自身免疫性疾病、过敏性疾病、肿瘤、感染等具有重要关系,本文将对Breg与免疫相关性疾病的关系做一综述。     

腹膜透析相关腹膜炎的防治

腹膜炎是腹膜透析患者常见并发症,其发生、发展常影响患者预后,严重者可导致拔管退出腹膜透析治疗,甚至死亡。而防治腹膜炎的关键是预防腹膜炎的发生,医护人员应加强腹膜透析患者的自我管理,重视其培训、宣教及随访,同时定期进行营养状态评估。对已经发生腹膜炎的患者,应及时留取标本送检、及时诊断、及时治疗,待药敏结果回报后及时调整抗菌药物。对于难治性腹膜炎、真菌性腹膜炎及复发性腹膜炎,应果断拔管,最大程度保护腹膜功能。     

生物信息学分析导致类风湿关节炎性别差异的关键基因与信号通路北大核心CSCD

目的:通过生物信息技术分析探讨类风湿关节炎(RA)发病机制中性别间生物学差异的关键基因和通路。方法:从GEO数据库中获取GSE55457、GSE55584、GSE12021中正常男女性滑膜样本和RA男女性患者滑膜样本的基因表达数据,将数据整合并使用R软件对差异表达基因(DEGs)进行鉴定。使用在线工具DAVID数据库对DEGs进行GO分析和KEGG分析。使用Cytoscape 3.6.0构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),并进行模块分析。结果:男性组高表达基因416个,低表达基因336个,女性组高表达基因744个,低表达基因309个。在男性RA发病中,IL-6、MYC、EGFR、FOS和JUN被认为是关键基因;在女性RA发病中,IL-6、ALB、PTPRC、CXCL8和CCR5被认为是关键基因。结论:生物信息学分析筛选出的差异基因分别参与男性和女性RA疾病进展的不同机制,为RA发病机制的探究提供了理论依据。     

居家腹膜透析相关性腹膜炎的调查分析

目的 分析居家腹膜透析患者腹腔感染的相关因素.方法 采用电话随访、门诊随访、到患者家中随访相结合的方法来收集资料进行讨论分析.结果 39例腹膜透析患者中发生腹腔感染10人.主要原因:患者及家属缺乏腹透相关知识、无菌概念不强操作不正规、居家腹膜透析环境不符,周边及家中有宠物寄养等.结论 需要通过加强普及腹透知识,加强无菌操作,创造良好的居家腹透环境以有效减少腹透感染的发生.     

腹膜透析相关感染性腹膜炎病因分析及护理对策

目的观察腹膜透析相关感染性腹膜炎的病因分析及护理对策。方法回顾分析44例腹膜透析相关感染性腹膜炎的发病原因及治疗结果。结果41例细菌性腹膜炎患者继续PD治疗。3例真菌性腹膜炎患者拔出腹透管,改为血液透析治疗。结论腹膜透析相关感染性腹膜炎受各种因素影响,加强透析前后患者的培训是减少腹膜炎发生的重要措施。     

湖北地区2501例腹膜透析资料分析

目的:分析湖北地区2 501例腹膜透析(PD)患者的临床特点、透析质量和结局。方法:通过中国血液净化病例登记系统(CNRDS)获取湖北地区截至2016年底共2 501例PD患者资料,分析其年龄、地区分布、原发病、血压及实验室指标血肌酐、血尿素氮、全段甲状旁腺素(iPTH)等水平,同时对PD透程、透析剂量(PDV)、腹膜平衡试验(PET)类型、透析充分性指标及结局进行横断面研究。结果:湖北地区PD患者以41—70岁较多(P0.01),大部分患者集中在武汉市(62.81%),明显多于全省其它地市(P0.01)。PD患者原发病中原发性肾小球肾炎占比高于高血压肾损害和糖尿病肾病等(P0.01);患者透前血尿素氮、血肌酐和iPTH显著升高(P0.01)。2303例患者透程≤48个月,198例48个月;PDV≤8L/天2 353例,8L/天148例;PET类型中高于和低于平均转运者1 942例,高转运(H)和低转运(L)者559例(均P0.01),从而获得较好PD充分性和临床结局。62.42%PD患者每周尿素清除指数(Kt/V)1.7,66.13%PD患者每周肌酐清除率(Ccr)50L/1.73m~2,截至2016年底,继续维持PD者占91.80%,死亡病例占比仅3.68%(均P0.01)。结论:采用PD,对于以原发性肾小球疾病为主导致的尿毒症患者通过不同处方提高透析质量和透析充分性,可有效保护残存肾功能,提高患者生存质量。     

腹膜透析中物质跨腹膜转运的数学模型

腹膜是生物半透膜。我们综述了腹膜透析过程中溶质和水跨腹膜转运的几种数学模型，包括膜模型、三孔模型、扩展三孔模型、分布模型。它们分别从不同方面揭示了腹膜的物质转运机理。重点介绍了三孔模型。     

腹膜透析患者抗生素脑病危险因素分析

目的:分析腹膜透析患者使用抗生素出现抗生素脑病的危险因素。方法:回顾性分析本院2004-01—2018-01收治的64例维持性腹膜透析(CAPD)患者的临床资料,其中发生抗生素脑病患者10例,作为观察组,其余54例未发生抗生素脑病,从中随机选取15例作为对照组。比较两组间性别、年龄、平均CAPD时间、血液透析转为腹膜透析例数、血压(BP)、矫正钙、血磷、血浆白蛋白、标准蛋白分解率(nPCR)、血红蛋白(Hb)、血肌酐(Scr)、残存肾功能(GFR)、腹膜清除率、每周腹膜总肌酐清除率、每周腹膜总尿素清除指数、应用β-内酰胺类抗生素例数、抗生素使用时间等的分布差异,将差异有统计学意义的指标,经二分类Logistic回归分析引起抗生素脑病的可能因素。结果:抗生素脑病发生率为15.63%(10/64)。上述18个指标中年龄、平均CAPD时间、由血透转为腹透例数、收缩压、舒张压、GFR、每周总肌酐清除率、每周总尿素清除指数、应用β-内酰胺类抗生素例数、应用β抗生素时间3天等10个指标具有组间差异(P0.05或P0.01);将此10个指标纳入Logistic回归模型,分析发现除血压、每周腹膜总肌酐清除率和每周腹膜总尿素清除指数外其余各项指标均为腹膜透析患者发生抗生素脑病的独立危险因素(P0.05或P0.01)。结论:腹膜透析患者抗生素脑病发生率较高,影响因素较多,临床应重视管理,防范风险。     

基于生物信息学探索系统性硬化病相关肺动脉高压免疫相关基因及免疫细胞浸润分析北大核心CSCD

目的:通过生物信息学分析鉴定系统性硬化病相关肺动脉高压(SSc-PAH)免疫相关基因(IRGs),并深入探讨免疫细胞浸润在SSc-PAH中的作用。方法:从GEO数据库下载数据集GSE22356,使用R软件对其进行差异表达基因(DEGs)分析。通过ImmPort数据库下载人类免疫基因数据集,与DEGs取交集得到差异免疫相关基因(DEIRGs),对DEIRGs进行GO和KEGG富集分析。通过Cytoscape软件构建DEIRGs的蛋白互作(PPI)网络,根据Degree值筛选枢纽免疫基因。CIBERSORT算法评估SSc和SSc-PAH患者血液组织免疫细胞浸润。对枢纽免疫基因与浸润性免疫细胞进行相关性分析。结果:共得到56个DEIRGs。功能富集表明DEIRGs在信号转导、免疫应答、趋化作用中具有重要意义。根据PPI网络及Degree值得到枢纽免疫基因FCGR3B、CD28、LYN、LCK。免疫细胞浸润结果显示,与SSc相比,SSc-PAH患者血液组织中单核细胞、嗜中性粒细胞比例升高,而初始CD4 T细胞、未活化的CD4记忆性T细胞、γδ T细胞比例降低。相关性分析结果显示,CD28、LCK与γδ T细胞呈正相关,与单核细胞呈负相关。FCGR3B与中性粒细胞呈正相关,与初始CD4 T细胞呈负相关,LYN与单核细胞呈正相关,与γδ T细胞呈负相关。结论:枢纽免疫基因和免疫细胞浸润差异在SSc-PAH发生发展中起重要作用。     

腹膜透析技术的发展现状

由于本身的特点尤其是技术上的不断进步,腹膜透析技术在肾功能衰竭的治疗中得到更加广泛的应用。本文介绍了近年来腹膜透析的研究重点及其发展方向。     

腹膜黏液性肿瘤的临床病理分析北大核心CSCD

目的分析腹膜黏液性肿瘤的临床病理特征及其与预后的关系。方法按照2010年WHO消化系统肿瘤分类标准对首都医科大学附属北京世纪坛医院病理科2012至2017年52例曾诊断为＂腹膜黏液性肿瘤＂的病例重新分级。观察其原发部位、神经侵犯、钙盐沉积、印戒细胞等病理特征,分析其与预后的关系。对所有病例进行CK7、CK20和CDX2的免疫组织化学染色,对来源不明的病例加染雌激素受体、孕激素受体和p16。结果52例腹膜黏液性肿瘤中,男性29例,女性23例;平均年龄52.0岁。阑尾原发者32例,其他部位20例。低级别组织学形态23例（其中无细胞型1例）,高级别组织学形态29例。伴印戒细胞者15例,伴神经侵犯者12例,伴钙盐沉积者9例。伴神经侵犯者预后明显较差（P＝0.025）,有印戒细胞者更易伴神经侵犯（P〈0.01）。性别、年龄、原发部位、肿瘤级别等与预后无明显相关性。 结论腹膜黏液性肿瘤的原发部位中神经侵犯现象不罕见,且意味着预后不良。     

基于生物信息学构建宫颈鳞癌预后相关的免疫基因风险模型

目的:寻找宫颈鳞状细胞癌(CSCC)特异性免疫相关基因(IRGs),为患者预后预测及个性化治疗提供依据.方法:基于TCGA和GTEx数据集,分析268例CSCC患者IRGs差异表达及潜在分子机制.采用多因素COX回归筛选预后相关IRGs,根据风险模型将患者分为高、低风险组,并验证模型有效性和生存期(OS).结果:CSC...     

腹膜透析患者的依从性与腹膜透析并发症的关系调查研究

目的：了解腹膜透析患者对腹膜透析相关培训的依从性,探讨患者依从性与腹膜透析相关并发症的关系,为降低腹膜透析的并发症,改善腹膜透析患者的预后性提供参考依据。方法采用自行设计的调查表对60例透析超过半年的腹膜透析患者进行调查,分析患者依从性与腹膜透析相关并发症的关系。结果通过系统的腹膜透析透析前培训,患者能配备透析相关设备,但操作过程存在不规范行为,尤其以年纪大、合并基础疾病患者明显。腹膜透析相关并发症与患者依从性存在负相关关系。结论腹膜透析患者依从性与其并发症的发生有关,提高患者对透析培训的依从性,有助改善患者透析预后。     

应用基因芯片技术对Graves病免疫相关基因的研究

应用基因芯片技术研究Graves病 (GD )和正常成人甲状腺组织免疫相关基因的差异表达。分别用Cy5和Cy3两种不同的荧光染料通过逆转录反应将GD组和对照组甲状腺组织的mRNA分别标记成探针 ,并与载有一组靶基因的基因表达谱芯片进行杂交。通过扫描荧光强度 ,计算机软件分析 ,寻找两组差异表达基因。GD组和正常对照组之间共筛选出 80条差异表达基因 ,其中表达增加的基因有 31条 (2 0倍以上 ) ,表达降低的基因有 4 9条 (0 5倍以下 )。基因表达谱芯片筛选GD与正常成人甲状腺组织差异表达基因具有样品用量少、高速度、高敏感、高通量等特性。通过筛选所得差异基因提示GD的发病涉及细胞因子、受体信号转导等多个方面 ,为进一步阐明GD的发病机制提供新线索。