食管鳞癌中p16基因启动子区甲基化及其表达

 目的探讨食管鳞癌（ESCC）p16基因甲基化的状况及其表达与食管鳞癌临床病理特征之间的关系。方法采用甲基化特异性PCR方法（MSP）分别检测75例食管癌组织、癌旁组织和切缘组织p16基因启动子区域CpG岛甲基化状态。采用Envision免疫组化法检测食管癌组织及癌旁组织的p16蛋白的表达。结果75例标本中，食管癌组织、癌旁组织和切缘细织p16基因甲基化率分别为41．3％（31／75）、13．3％（10／75）和6．67％（5／75）。癌组织和癌旁组织P16蛋白的阳性表达率分别为29．3％（22／75）和56．7％0（17／30）。31例癌组织p16基因甲基化阳性标本中有2例（6．4％）检测到P16蛋白的表达，而44例癌组织p16基因甲基化阴性标本中有20例（45．5％）检测到P16蛋白的表达。食管癌组织p16基因甲基化率显著高于癌旁组织和切缘组织（P〈0.01），P16蛋白表达与p16基因甲基化呈负相关。p16基因启动子区甲基化与食管癌的组织学分级、肿瘤部位无明显相关，与临床分期、淋巴转移密切相关。结论p16基因甲基化在食管癌发生发展中起着重要作用，食管鳞癌的分期和淋巴结转移与p16基因甲基化之间有密切关系。     

肝细胞癌p16基因甲基化及其对mRNA表达的影响

目的:探讨肝细胞癌p16基因甲基化状态和对mRNA表达的影响。方法:采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)法和逆转录聚合酶链反应技术(RT-PCR)分别检测了25例肝细胞癌及其相应的癌旁组织p16基因甲基化和mRNA表达状况。结果:25例肝细胞癌组织中检出13例甲基化,甲基化率为52.0%,相应的癌旁组织有6例甲基化,甲基化率为24.0%;25例肝细胞癌组织中,mRNA表达10例(表达率40.0%),相应的癌旁组织其mRNA表达19例(表达率76.0%),肝细胞癌组织和癌旁组织的甲基化率及mRNA表达,两者之间差异有显著性。结论:p16基因甲基化是肝细胞癌频发事件,p16基因甲基化导致mRNA表达缺失,p16基因甲基化检测可作为肝细胞癌分子诊断标志。     

抑癌基因SLC5A8在食管癌组织及血浆中的甲基化状态分析

目的:探讨食管癌组织中抑癌基因SLC5A8的甲基化状态和表达情况,以及食管癌术前和术后血浆中SLC5A8基因的甲基化状态.方法:采用甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)法检测45例食管癌、癌旁、切缘组织及30例食管癌术前、术后血浆中SLC5A8基因的甲基化状态.RT-PCR法检测组织中SLC5A8基因表达情况.结果:45例食管癌、癌旁及切缘组织中SLC5A8基因的甲基化率分别为68.8%、11.1%和4.4%,癌组织的甲基化阳性率显著高于癌旁及切缘组织(P＜0.01).RT-PCR检测结果显示,31例SLC5A8甲基化阳性的食管癌标本中仅有2例SLC5A8基因阳性表达,14例甲基化阴性的标本中有10例检测到基因表达,差异具统计学意义(P＜0.001).30例术前、术后血浆中SLC5A8基因的甲基化率分别为43.3%及16.7%,差异有统计学意义(P＜0.05).结论:SLC5A8基因甲基化是食管癌发生的重要早期分子事件.血浆中SLC5A8基因甲基化检测可作为术前诊断的重要参考指标,并有可能成为监测治疗反应与判断预后的一项生物学指标.     

胃癌组织中p16基因甲基化与其蛋白表达的相关性及临床意义

目的:探讨胃癌组织中p16基因甲基化与其蛋白表达的相关性及临床意义.方法:应用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)和免疫组织化学法分别检测28例胃癌和相应癌旁组织中p16基因启动子区CpG岛甲基化和p16蛋白的表达情况,并分析其与临床病理参数间的关系.结果:胃癌组织中p16基因甲基化率明显高于其相应的癌旁组织(P＜0.01),并与胃癌的分化程度、浸润深度及淋巴结转移有关(P＜0.05);p16蛋白在胃癌组织中的阳性表达率显著低于相应的癌旁组织(P＜0.01);胃癌组织中p16基因甲基化与p16蛋白的表达之间呈负相关(r=-0.544,P=0.003).结论:p16基因启动子区甲基化导致的基因沉默可能与胃癌的发生和发展密切相关.     

肝癌患者p16基因甲基化与DNMTs表达相关性分析

目的:研究p16基因启动子区域异常甲基化所导致的基因表达异常在肝癌形成过程中的作用,探讨p16基因甲基化与DNMTs(DNMT1、DNMT2、DNMT3A和DNMT3B)表达之间的相关性。方法:检测肝癌患者癌组织、癌旁组织和肝硬化组织中p16基因的异常甲基化状态及p16、DNMTs基因mRNA的表达水平;采用甲基化特异性PCR技术检测甲基化状态,荧光定量技术检测mRNA的表达。结果:p16基因在肝癌组织、肝硬化组织和癌旁组织中的甲基化率分别为70.5%(31/44)、37.1%(13/35)和9.1%(4/44),肝癌组织和肝硬化组织中的甲基化改变与癌旁组织比较差异有统计学意义,P<0.01。31例甲基化阳性组织中17例p16基因表达降低或缺失,13例甲基化阴性组织中2例基因表达降低或缺失,甲基化阳性与阴性的p16基因表达水平存在明显差异。癌组织和肝硬化组织中4种DNMT mRNA水平均高于相应癌旁组织。其中DNMT1、DNMT3A和DNMT3BmRNA的表达水平差异有统计学意义,DNMT1:P值分别为0.009和0.020;DNMT3A:P值分别为0.005和0.010;DNMT3B:P值分别为0.039和0.036。DNMT2mRNA的表达水平虽然高于相应癌旁组织,但差异无统计学意义,P值分别为0.120和0.350。DNMT1、DNMT 3A和DNMT3B的表达与p16甲基化有相关性,P值分别为0.013、0.025和0.041。结论:p16基因甲基化是肝癌的早期、频发事件,其改变是其基因表达下降甚至失活的重要原因。DNMTs活性的改变可能促进p16基因的异常甲基化。     

慢性乙型肝炎病毒感染与p16INK4A基因启动子甲基化关系的研究

目的探讨慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染对p16INK4A基因启动子甲基化的影响及其在HBV相关肝细胞癌(HCC)形成中的作用。方法选取23例HBV相关HCC癌及癌旁组织、25例慢性乙型肝炎肝穿刺组织,采用甲基化特异性PCR(MSP)检测p16INK4A基因启动子的甲基化状态;免疫组化EnVision二步法测定肝组织内HBsAg、HBcAg、HBeAg和HBx蛋白的表达;荧光实时定量PCR检测肝组织HBV DNA含量;PCR扩增和直接测序检测HBV x基因变异。结果癌组织p16INK4A基因启动子甲基化阳性率(47.83%)明显高于癌旁组织(17.39%),慢性乙型肝炎患者p16INK4A基因启动子甲基化阳性率(36.00%)与癌组织、癌旁组织差异无统计学意义。在癌旁组织和慢性乙型肝炎, p16INK4A基因启动子甲基化者HBx蛋白表达中位数分别为3.000和0.250,明显高于非甲基化者(0.500和0.000),但在癌组织中,HBx蛋白的表达与p16INK4A基因启动子甲基化状态无关。HBsAg、HBcAg、组织HBV DNA含量和x基因突变均与p16INK4A基因启动子甲基化状态无关。结论在癌前病变中,p16INK4A基因启动子甲基化与HBx蛋白高表达有关,HBx蛋白可能通过诱导p16INK4A基因启动子甲基化而使该抑癌基因失活,在HBV相关HCC形成中起重要作用。     

食管癌组织与外周血RASSF 1A甲基化的检测及其临床意义

目的:通过对食管癌组织及同一患者对应的术前外周血中RASSF1A基因甲基化的检测,加深食管癌变分子机制的了解并为食管癌早期诊断和高危人群预警提供候选指标.方法:采用甲基化特异性PCR方法,分别检测来自食管癌高发区的30例食管癌患者血浆、肿瘤组织及癌旁正常组织中RASSF1A基因启动子甲基化状况.结果:食管癌组织RASSF1A甲基化阳性率为40%(12/30),而这12例癌组织甲基化阳性的患者其外周血甲基化阳性共7例,癌组织和外周血RASSF1A甲基化阳性一致率为58%(7/12),18例癌组织甲基化阴性的患者其外周血也均为阴性,阴性一致率为100%(18/18).癌旁正常食管组织甲基化率为13%(4/30),明显低于癌组织(40%,12/30),P<0.05.7例外周血甲基化阳性的患者中,淋巴结转移阳性5例(55%,5/9),阴性2例(10%,2/21),两者差异有统计学意义,P<0.05.低分化鳞癌的RASSF1A甲基化阳性率(83%,5/6)明显高于中分化鳞癌(24%,5/21),P<0.05.结论:外周血RASSF1A甲基化可以反映同一个体食管鳞癌组织中RASSF1A基因甲基化的状态,可能是高危人群筛查重要候选分子标志之一.     

SRY-box 17基因在食管鳞状细胞癌中异常甲基化及表达的研究

目的:检测食管磷癌(esophageal squamous cell cancer,ESCC)细胞株及组织标本中Wnt通路相关因子SRY-box 17基因的甲基化状态及表达情况,探讨其与食管鳞癌发生的相关性.方法:分别采用甲基化特异性-PCR(methylation specific-PCR,MSP)和RT-PCR的方法检测食管癌细胞株TE1、TE13及109例食管鳞癌及相应癌旁非肿瘤组织中SRY-box 17基因的甲基化状态及mRNA表达情况,并分析其与Wnit通路中心因子β-catenin蛋白表达的关系.结果:在食管癌细胞株TE1和TE13中,SRY-box 17基因mRNA均呈阴性或弱阳性表达,用甲基化抑制剂5-氮-2’-脱氧胞苷(5-aza-2’-deoxycytidine,5-Aza-dC)处理后,其mRNA全部恢复阳性表达;MSP检测结果显示,在食管癌细胞株中SRY-box 17基因均呈高甲基化状态;在食管癌组织标本中,SRY-box17基因的甲基率为89.0％ (97/109),明显高于癌旁组织的53.2％ (58/109)(P＜0.01);癌组织中SRY-box 17基因的甲基化率在Ⅲ和Ⅳ期肿瘤患者中明显高于Ⅰ和Ⅱ期患者(P＜0.05),而该基因的甲基化率与肿瘤患者的组织学分级无相关性;在癌组织中该SRY-box17mRNA的阳性表达率为28.4％(31/109),明显低于癌旁组织(P＜0.01).其mRNA表达的缺失率及通路中心因子β-catenin蛋白的异质表达率均与该基因的甲基化状态有相关性(P＜0.05).结论:食管鳞癌组织及细胞株中SRY-box 17基因均呈高甲基化状态,该基因的高甲基化可能是引起mRNA表达下调的重要机制之一,并可能通过Wnt/β-catenin信号转导通路的激活在食管癌的发生、发展中具有重要作用;对该基因的甲基化检测可能对食管癌的预后判断有一定的临床指导意义.     

4．1B蛋白在食管鳞状细胞癌中的异常表达及其分子机制

目的: 研究4.1B蛋白在食管鳞状细胞癌组织中的表达及异常表达的分子机制.方法: 采用免疫组织化学法检测110例石蜡包埋食管鳞状细胞癌及癌旁组织中4.1B蛋白的表达水平.随机选取其中29例,应用微卫星PCR技术检测4.1B等位基因的杂合子丢失情况.应用甲基化特异PCR技术检测33例新鲜食管鳞状细胞癌手术标本的4.1B基因启动子区域的甲基化状态.结果: 食管鳞状细胞癌组织中4.1B蛋白的阳性表达率为60.9%(67/110),癌旁正常组织的阳性表达率为94.5%(104/110),2组之间差异有统计学意义(X2=35.945,P<0.01).食管鳞状细胞癌高、中、低分化组的阳性表达率分别为74.4%(29/39)、61.8%(21/34)和45.9%(17/37),3组之间差异有统计学意义(X2=6.453,P<0.05).在20.7%(6/29)的食管鳞状细胞癌组织中,分别于D18S481、D18S62和D18S391这3个微卫星位点检测到4.1B等位基因的杂合子缺失.在33例新鲜手术标本中,有69.7%(23/33)的食管鳞状细胞癌组织检测出4.1B基因启动子区域的甲基化.结论: 4.1B蛋白在食管鳞癌组织中的阳性表达率明显低于癌旁正常组织,食管鳞状细胞癌的分化程度与其表达量呈正相关;启动子区域的异常甲基化可能是4.1B蛋白阴性表达的重要原因.     

食管鳞癌中hMLH1、E-cadherin、p16^INK4a基因启动子甲基化及其意义

背景与目的:目前认为抑癌基因启动子甲基化导致转录抑制是恶性肿瘤发生的重要机制之一,hgLH1、E-cadherin及p16INK4a基因在多种恶性肿瘤中都已被证实存在较高频率的甲基化.本研究通过检测食管鳞癌组织及癌旁组织中hMLH1、E-cadherin,p16INK4a基因启动子甲基化的发生情况,探讨hMLH1、E-cadherin、p16INK4a基因启动子甲基化在食管鳞癌发生发展中的作用.方法:采用酚-氯仿法提取105例食管鳞癌组织及癌旁组织的基因组DNA,应用甲基化特异性PCR对所提DNA进行hMLH1、E-cadherin、p16INK4a基因甲基化检测.采用EnVison免疫组织化学二步法对癌组织中上述3种基因蛋白表达进行检测.结果:癌组织中E-cadherin、hMLH1、p16INK4a基因启动子甲基化的阳性率分别为57.1%(60/105)、20.9%(22/105)和50.5%(53/105),而癌旁食管组织中相应的3个基因的甲基化率分别为10.5%(11/105)、1.9%(2/105)和7.6%(8/105),均显著低于癌组织.E-cadherin(P=0.021)及p16INK4a(P=0.026)基因甲基化与蛋白表达缺失密切相关,而hMLH1基因甲基化与蛋白表达无显著相关性.E-cadherin基因启动子甲基化与淋巴结转移有关(P=0.016),p16INK4a基因启动子甲基化与低分化癌有关性(P=0.024).hMLH1基因甲基化与各项临床病理特征均无关.结论:食管鳞癌中p16INK4a基因启动子甲基化与相应蛋白表达缺失密切相关,且在低分化癌中更多见;E-cadherin基因启动子甲基化与相应蛋白质表达缺失有相关性,并且有淋巴结转移多见的显著特征,这2个基因的甲基化位点与食管鳞癌密切相关.hMLH1基因甲基化可能并不直接参与食管鳞癌的发生、发展.     

非小细胞肺癌INK4a和ARF基因甲基化与其蛋白共表达关系的探讨

目的:分析INK4a和ARF基因启动子甲基化与其蛋白共表达之间的关系.方法:选择前期实验中p14ARF和p16INK4a蛋白共表达阴性的非小细胞肺癌(NSCLC)患者35例,共表达阳性的NSCLC患者20例作为研究对象,分别称为(p14 p16)阴性组和(p14 p16)阳性组.运用甲基化特异性PCR(MSP)方法对两组患者癌组织INK4a和ARF基因启动子的甲基化状态进行检测.结果:(p14 p16)阴性组有18例发生INK4a基因甲基化,(p14 p16)阳性组有2例发生INK4a基因甲基化,两组差异有显著意义(P＜0.01).(p14 p16)阴性组有8例发生ARF基因启动子甲基化,(p14 p16)阳性组有2例发生ARF基因启动子甲基化,两组差异无显著意义(P＞0.05).INK4a和ARF基因异常申基化相互之间无显著相关性(P＞0.05).结论:NSCLC患者肺癌组织INK4a基因甲基化是导致p16INK4a蛋白表达阴性的重要机制;INK4a和ARF基因甲基化可能是相对独立的事件.     

Hypermethylation of tumor suppressor genes (p16INK4A, p14ARF and APC) in adenocarcinomas of the upper gastrointestinal tract

Aberrant promoter methylation is an important mechanism for gene silencing. In the present study, 50 Barrett's esophagus-associated esophageal adenocarcinomas (ADC), 50 cardiac ADC and 50 gastric ADC were investigated by means of methylation-specific real-time PCR for hypermethylation in the tumor suppressor genes APC, p16(INk4A) and p14(ARF). Additionally, expression of p16(INK4A) protein in the carcinomas was assessed using immunohistochemistry. Marked differences in hypermethylation were found between esophageal, cardiac and gastric ADC in the APC gene (78% vs. 32% vs. 84%) and in the p16(INK4A) gene (54% vs. 36% vs. 10%). Hypermethylation of p14(ARF) was absent from esophageal ADC and present infrequently in cardiac (2%) and gastric ADC (10%). Complete loss of p16(INK4A) protein expression was detectable in 45% of all tumors and was significantly associated with hypermethylation of the p16(INK4A) gene (p<0.0001, chi(2)-test). Our results suggest that hypermethylation of p16(INK4A) and APC are frequent findings in esophageal, cardiac and gastric ADC. Additionally, the data point to a tumor specific methylation pattern in upper gastrointestinal ADC.     

Expression of tumor suppressor gene p16(INK4) products in primary gastric cancer

Recent studies have shown that the cyclin-dependent kinase (CDK) inhibitor p27(Kip1) represents an indicator for patients' outcome in several human malignancies including gastric cancer. However, the clinicopathologic value of another class of CDK inhibitor, p16(INK4), has not been determined. In a retrospective study, we examined the expression of p16(INK4) by immunohistochemical assay of 80 samples of primary gastric cancers and their adjacent nonneoplastic mucosas. Less than 10% of non-tumor gastric mucosal cells were p16(INK4) positive, whereas the expression of p16(INK4) in gastric cancer cells varied widely from 0 to 100% (mean, 24.5%). The expression of p16(INK4) was not seen in 11.3% (9/80) of the cancer cases, but in 65% (52/80) this protein was even overexpressed when compared with the nonneoplastic mucosa. A clinicopathologic survey indicated that a low or no expression of p16(INK4) was associated with poorly differentiated carcinoma (p = 0.0133), but the level of expression did not correlate with other parameters including patients' prognosis or with the expression of the pRb protein. In an effort to explore the underlying mechanism for the p16(INK4)-negative cases, a prospective study was also performed on 20 cases of gastric cancer to compare the level of the p16(INK4) protein with the methylation status of the p16(INK4) promoter. Gastric cancer tissues with methylation expressed significantly lower levels of the p16(INK4) protein (p = 0.0013) and two of them lacked p16(INK4) expression altogether, whereas all the cancer tissues without methylation expressed it. These findings suggest that the p16(INK4) protein may be associated with differentiation of gastric cancer tissues and that methylation of the p16(INK4) promoter may, in part, account for the loss of p16(INK4) expression.     

p16(INK4a) Promoter hypermethylation of non-tumorous tissue adjacent to gastric cancer is correlated with glandular atrophy and chronic inflammation

The p16(INK4a) tumor suppressor gene can be inactivated by promoter region hypermethylation in many tumor types including gastric cancers. However, p16(INK4a) promoter hypermethylation in the surrounding non-tumorous tissues of gastric cancers has not been studied in detail. We therefore examined 46 gastric cancers, corresponding adjacent non-tumorous tissue samples and 8 gastric tissue samples of chronic gastritis by performing methylation-specific polymerase chain reaction, and we analyzed p16(INK4a) protein expression using immunohistochemistry and Western blot. p16(INK4a) promoter hypermethylation was observed in 43% of gastric cancers and 59% of adjacent non-tumorous tissues; however, none of the samples retrieved from the chronic gastritis patients displayed p16(INK4a) promoter hypermethylation. Gastric cancers showed an inverse correlation between vascular invasion and p16(INK4a) promoter hypermethylation, and adjacent non-tumorous tissues displayed a close association among the grade of chronic inflammation, presence of glandular atrophy and p16(INK4a) promoter hypermethylation. p16(INK4a) expression was markedly decreased in samples with p16(INK4a) promoter hypermethylation when compared with samples without p16(INK4a) promoter hypermethylation. These results suggest that p16(INK4a) promoter hypermethylation is an early and frequent event in gastric carcinogenesis and may serve as a new prognostic biomarker for the risk of gastric cancers.     

新疆哈萨克族和汉族食管癌患者FHIT基因甲基化及其与预后的关系

目的：探讨和比较新疆哈萨克族和汉族食管癌患者FHIT基因甲基化状态及其与食管癌发生及预后之间的关系。方法：采用甲基化特异性PCR法（methvlation-specific polymerase chain reaction,MSF）测定哈、汉两民族共71例食管癌及癌旁组织标本FHIT基因启动子区甲基化状况,建立Cox回归模型分析临床病理指标及FHIT基因甲基化水平等因素与预后的关系。结果：36例哈族食管癌患者癌组织和癌旁组织的FHIT基因启动子甲基化率分别为58.3%和19.4%,35例汉族食管癌患者癌组织和癌旁组织的FHIT基因启动子甲基化率分别为51.4%和14.3%,两民族癌组织FHIT基因的甲基化率均明显高于癌旁组织（P〈0.01）;哈、汉民族食管癌患者癌组织之间、癌旁组织之间FHIT基因启动子甲基化率无显著性差异（P〉0.05）。预后因素分析表明肿瘤浸润程度、TNM分期、淋巴结转移区域数是影响哈、汉民族食管癌预后的独立危险因素,女性性别是保护因素。结论：FHIT基因启动子区甲基化状态与新疆哈族、汉族食管癌的发生有密切的关系,但可能与食管癌预后无关。     

食管鳞癌抑癌基因甲基化表达的相关性分析

[目的]研究食管鳞癌肿瘤组织及外周血多基因甲基化状态,以及不同基因甲基化的相关性。[方法]应用real-time MSP技术对76例食管鳞癌患者肿瘤组织、配对的癌旁正常组织、术前外周血中APC、RARβ2、CDH1、p16INK4α、RASSF1A抑癌基因的甲基化状态进行检测。随机选取60名年龄配对的健康志愿者外周血浆DNA作对照。[结果]肿瘤组织APC、RARβ2、CDH1、p16INK4α、RASSF1A的甲基化率显著高于对应癌旁正常组织（P=0.000）。术前外周血中这5种基因的甲基化率显著高于健康对照组（P=0.000）。RARβ2、CDH1、p16INK4α、RASSF1A甲基化有显著性相关,APC与这4个基因甲基化无相关性。[结论]食管癌患者癌组织及外周血抑癌基因APC、RARβ2、CDH1、p16INK4α、RASSF1A高甲基化,RARβ2、CDH1、p16INK4α、RASSF1A甲基化有显著相关性。     

河南林州地区贲门癌和癌旁组织中p16基因启动子甲基化及蛋白表达

目的探讨贲门癌变过程中p16基因启动子区甲基化和p16蛋白表达变化特征和规律及其相互关系。方法采用甲基化特异PCR（MSP）及免疫组化方法,检测林州地区32例贲门癌患者癌组织、癌旁不典型增生组织和正常组织p16基因启动子区甲基化状态及蛋白表达情况。结果p16基因在癌组织中表达缺失18例（56%）,不典型增生组织中表达缺失8例（73%）;26例（81%）癌组织、7例（64%）不典型增生组织和18例（67%）正常组织发生了p16基因启动子区的甲基化。贲门癌组织中p16基因甲基化与表达缺失一致率为56%。差异无统计学意义,P〉0.05。结论p16蛋白表达缺失可能是贲门癌变过程中的重要分子事件,p16基因启动子区甲基化可能是导致其蛋白表达缺失的机制之一。     

Hypermethylation of E-cadherin gene is frequent and independent of p16INK4A methylation in non-small cell lung cancer: potential prognostic implication

E-cadherin gene is often termed a 'metastasis suppressor' gene and inactivation of this gene through promoter methylation occurs in various epithelial cancer. This study assessed the methylation status of p16INK4a and E-cadherin genes, correlated with clinical characteristics in lung cancer patients. Forty-five patients with non-small cell lung cancer (NSCLC) were evaluated for methylation status of p16INK4a and E-cadherin genes by using the methylation-specific PCR. E-cadherin expression in tumor samples was examined by immunohistochemistry. Overall duration of survival in different subsets of NSCLC with or without p16INK4a or E-cad methylation at diagnosis was compared by using the Kaplan-Meier method and log-rank test. We found the hypermethylation of p16INK4a gene in 38% (17/45) of our subjects. While the E-cadherin gene was hypermethylated in 62% (28/45) related with reduced E-cadherin expression, and methylation status of both p16INK4a and E-cadherin genes seemed to be independent. Seventy-six percent (34/45) of NSCLC patients had an abnormal methylation pattern in at least one gene. Although there was no difference in overall survival of patients between methylated p16INK4a and unmethylated p16INK4a, NSCLS patients with hypermethylation of both genes (concordant pattern) had a significantly good prognosis. In contrast, NSCLC patients with hypermethylated p16INK4a but un-methylated E-cadherin gene (discordant pattern) had a significantly poor prognosis. E-cadherin and p16INK4a are commonly methylated in NSCLC and the methylation pattern of p16INK4a and E-cadherin genes may have prognostic value for the outcome of NSCLC patients.